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Programme CM
Chapitre I – Les micro-organismes parmi nous
Chapitre II – Nutrition bactérienne
Chapitre III – Structures et fonctions de la cellule bactérienne
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Chapitre I
LES MICRO-ORGANISMES PARMI NOUS
Introduction
I – Le monde microbien
1) La place des micro-organismes dans le monde vivant
2) Les caractéristiques fondamentales des micro-organismes
II - Les principaux groupes de micro-organismes
1) Les micro-algues
2) Les mycètes
3) Les protozoaires
4) Les bactéries
III – Bref historique de la microbiologie
1) Les micro-organismes sont impliqués dans la vie de l’homme dès l’antiquité
2) Les 1ères observations microscopiques datent de la fin du 17ième siècle
3) L’âge d’or de la microbiologie
4) La microbiologie aujourd’hui
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Introduction
Microbiologie (1878)
Science qui étudie
les organismes vivants, non visibles à l’œil nu (pour la plupart)
et
les relations qu’ils établissent entre eux et avec leur
environnement
Micro-organismes - Germes - Flore microbienne
Microbes - Microbiote – Agents biologiques
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I – LE MONDE MICROBIEN
1) La place des micro-organismes dans le monde vivant
Evolution des critères de classification ⇒ évolution de la classification
Document 1 : Place des micro-organismes dans le monde vivant
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Document 2 : Classification de Woese ⇒ arbre du vivant
Q1 – Tous les domaines contiennent des micro-organismes ? Vrai - Faux
Classification phylogénique
I – LE MONDE MICROBIEN
1) La place des micro-organismes dans le monde vivant
2) Les caractéristiques fondamentales des micro-organismes
- apparition des mO : 3,5 milliards d’années
- processus d’évolution biologique
- très grande diversité de mO - réservoir inexploré
estimation 6 à 60 millions d’espèces de mO
2 millions espèces décrites
- potentiel métabolique élevé ; forte adaptabilité aux écosystèmes
- potentiel reproductif élevé ; forte colonisation des milieux
⇒ abondance et omniprésence dans tous les écosystèmes même les plus extrêmes
1 g de terre fertile : 10 9 bactéries, 150.106 mycètes, 10.103 protozoaires
flore intestinale : environ 10 14 germes
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Organisation cellulaire
Cellule procayote les bactéries et
les archées
Cellule eucaryote
les micromycètes,
les protozoaires ,
les micro-algues
les virus
Acaryote
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Document 3 : Comparaison cellule procaryote / cellule eucaryote
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Document 4 : Structure des virus
Génome viral (ADN ou ARN)
Capside (assemblage de protéines)
Enveloppe (bicouche de phospholipides + spicule)
Enzymes
Éléments facultatifs
Virus nu / Virus enveloppé
Parasite obligatoire
- infection de cellule eucaryote
- infection de bactérie ⇒ bactériophage
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Document 5 : Structure d’un bactériophage
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II – LES PRINCIPAUX GROUPES DES MICRO-ORGANISMES
Document 6 : Les types trophiques = les types nutritionnels
Source de carbone
- Organisme Autotrophe est un organisme capable de synthétiser sa propre matière
organique à partir de matière minérale = organisme capable d’utiliser une source de carbone
minérale (ex : CO2 HCO3-) pour synthétiser ses propres molécules organiques.
- Organisme Hétérotrophe utilise des composés carbonés organiques pour synthétiser sa
propre matière organique composant la cellule
Source d’énergie
- Organisme Phototrophe fabrique de l’énergie cellulaire (ATP) en utilisant l’énergie
lumineuse
- Organisme Chimiotrophe produit de l’énergie par oxydation de molécules organiques et
inorganiques.
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LES MICRO-ALGUES
Habitat : état libre en milieu aquatique
Scenedesmus
Caractéristiques cellulaires :
Eucaryote
En majorité Unicellulaire (5 à 30 mm)
En majorité Immobile
Paroi – composition / structure variée
Chloroplastes
Diatomée
Surirella (x400) Diatomée 13
LES MICRO-ALGUES
Type trophique :
Phototrophe
Euglena (x1000)
Autotrophe
Navicula (x400)
Diatomée
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LES MICRO-ALGUES
Implications dans la biosphère :
Productrice d’oxygène
1er élément des chaînes alimentaires
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LES MICRO-ALGUES
Implications dans la vie de l'homme
- production de métabolites (vitamines, acides gras,
enzymes, polysaccharides ...) utilisés dans les secteurs
de l’agro-alimentaire, la cosmétologie, l’agriculture –
compléments alimentaires (AGPI)
- biocarburant
- traitement de polluants dans les eaux usées
(bioremédiation)
- production d’hydrogène
- piège à CO2
Rôle Pathogène ou Néfaste
- toxique pour la flore et la faune marine
- toxique pour l’homme (allergies respiratoires et
intoxications alimentaires)
- efflorescence de micro-algues
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LES MYCETES
Habitat : état saprophyte dans le sol humide
Caractéristiques cellulaires :
eucaryote
immobiles
Moisissure
paroi de chitine
unicellulaire --> les levures
pluricellulaire --> les moisissures
Type trophique : chimiotrophe ; hétérotrophe
Aspergillus niger
Gx400
Levure en bourgeonnement Gx1000
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LES MYCETES
Implication dans la biosphère Geotrichum
Penicillium roqueforti
Dégradation de la matière organique
Implication dans la vie de l'homme
Fabrication de nombreux aliments
Production de nombreuses substances d'intérêt (ex :
antibiotiques, enzymes)
Penicillium candidum
Rôle Pathogène ou Néfaste
maladies des végétaux (ex : le mildiou)
responsable de mycoses ou intoxications alimentaires chez
l’homme et l’animal
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Frottis vaginale x400 (mycose)
- fabrication de nombreux aliments
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Som Phak Tin Mou (plat Laos)
LES PROTOZOAIRES
Habitat : état libre en milieu aquatique (zooplancton) ; parfois à
l’état de parasite dans les tissus humains, animaux et végétaux.
Paramécie (x250)
Caractéristiques cellulaires :
Eucaryote
Opercularia
majorité unicellulaire
mobile (pseudopodes, cils, flagelles)
absence de paroi
Type trophique : chimiotrophe ; hétérotrophe
Filosa (Amibe) 20
LES PROTOZOAIRES
Implication dans la biosphère :
Chaînes alimentaires (zooplancton)
Trypanosoma brucei Mouche Tsé-Tsé
Implication dans la vie de l'homme
Rôle pathogène :
quelques maladies humaines et animales (parasite de l ’homme)
ex : le paludisme (Plasmodium) , la trypanosomiase (Trypanosome)
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Plasmodium falciparum Moustique Anophèle
LES BACTERIES
Caractéristiques cellulaires
- procaryote
- unicellulaire
- mobile (flagelle) ou immobile
- paroi constituée de peptidoglycane
Habitat Flore commensale
Tous les écosystèmes Flore saprophyte
Type trophique
- en majorité chimiotrophes
peu de bactéries photosynthétiques (ex : les cyanobactéries)
- en majorité hétérotrophes
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LES BACTÉRIES
Implication dans la biosphère
- 1er colonisateurs des écosystèmes
- 1er maillons des chaînes alimentaires
- cycles des éléments chimiques
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- Ex : cycle de l’azote
Fertilisation des sols et de l'eau
Dégradation des molécules organiques azotées
Cycle de
l'azote
Application : Culture d'un mélange de plantes limitant l'utilisation des engrais :
symbiose rhizobium/légumineuses et polyculture graminées/légumineuses
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LES BACTÉRIES
Implication dans la vie de l'homme
- Bactéries nuisibles - Bactéries utiles
Infections
Altérations des aliments
Microbiote intestinal
(1,5 kg/masse corporelle)
- Protection de l’individu
contre la colonisation par d'autres bactéries
aide à la mise en place du système immunitaire
maturation de l’épithélium intestinal
- Fonction métabolique
Production de vitamines (vitamine B et K)
Synthèse d'acides aminés et d'acides gras essentiels
Digestion de métabolites
- Déséquilibre flore intestinale
- obésité ?
- humeur ? 25
- réaction inflammatoire (maladie de Crohn) ?
III – BREF HISTORIQUE DE LA MICROBIOLOGIE
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