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Liaisons chimiques pour kinésithérapie

Ce document est un support pédagogique pour un cours de chimie, abordant les liaisons chimiques, leur formation, et les différents types de liaisons, notamment covalentes, ioniques et polaires. Il explique également les concepts d'électronégativité, de polarité des molécules, et les règles de Lewis pour la représentation des liaisons. Enfin, il mentionne les exceptions à la règle de l'octet et les formes de résonance dans certaines molécules.

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Liaisons chimiques pour kinésithérapie

Ce document est un support pédagogique pour un cours de chimie, abordant les liaisons chimiques, leur formation, et les différents types de liaisons, notamment covalentes, ioniques et polaires. Il explique également les concepts d'électronégativité, de polarité des molécules, et les règles de Lewis pour la représentation des liaisons. Enfin, il mentionne les exceptions à la règle de l'octet et les formes de résonance dans certaines molécules.

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Avertissement

Ce fichier informatique sert de support didactique au cours de chimie de


Serge Clément en 1ère année de Bachelier en kinésithérapie de l’HELB-
Prigogine.

Son usage est donc exclusivement réservé à des fins pédagogiques et


limité à la présentation du cours et à l’étude des étudiants. En aucun
cas il ne peut être reproduit, traduit, adapté ou modifié, même
partiellement, par quelque procédé que ce soit ou être utilisé à des fins
commerciales. (Article 1er de la loi du 30 juin 1994). Le contrevenant
s’expose à des sanctions civiles et/ou pénales.

L’iconographie est partiellement tirée des ouvrages repris en


bibliographie. (Utilisation du droit de citation à titre pédagogique).

CHAPITRE 5 : Liaisons chimiques

Dans la nature on rencontre très peu de substances constituées d’atomes


non liés (Ar, He)

Presque toutes les substances sont des composés de différents atomes


liés les uns aux autres.

Selon le type d’association des atomes, la matière se présentera sous


diverses formes : solide cristallin ou amorphe, liquide ou gaz

Exemple carbone graphite et diamant

1
Interactions entre deux atomes

Forces de répulsion des nuages électroniques


Défavorables
à la liaison Forces de répulsion
p des deux noyaux
y

Favorable à la Forces d’attraction entre des électrons d’un atome et le


liaison noyau de l’autre atome

Lorsque
q deux atomes se rapprochent
pp :

1: attraction

2: lorsque les noyaux sont très proches : répulsion

Entre les deux, il existe une distance d’équilibre : oscillation autour de


cette distance

Liaison covalente
Ep (KJ/mol) Variation de l’énergie du système dihydrogène

en fonction de la distance des deux noyaux

Energie de liaison
-436
0,074 distances (nm)

répulsion attirance pas d’interaction


d interaction
liaison
covalente H2
liaison

rupture
H2 H H

2
Energie de liaison

Pour écarter les atomes de leur distance d’équilibre, il faut fournir

de l’énergie pour vaincre la force d’attraction

L’énergie de liaison correspond à :

-la différence d’énergie entre deux atomes séparés et ces mêmes


atomes liés

-l’énergie
l’é i qu’il
’il ffautt fournir
f i pour casser une liaison
li i

Types de liaisons chimiques

Liaison covalente :

partage égal d’électrons entres atomes

Les électrons de valence des deux atomes sont surtout situés dans

l’espace qui séparent les deux atomes

Ces électrons sont attirés simultanément par les deux noyaux

él t
électron

H H H H

électron

3
Types de liaisons chimiques

Liaison covalente polaire :

Partage inégal d’électrons entres atomes sans transfert d’électrons

Les électrons de valence des deux atomes sont situés dans l’espace

qui sépare les deux atomes mais plus proches d’un des deux atomes

Ces électrons sont attirés par les deux noyaux mais plus par l’un d’eux

électron

H F H F

électron

Types de liaisons chimiques

Liaison covalente coordinative :

Partage inégal de deux électrons fournis par un des deux atomes

Un des atomes (le donneur) fournit les deux électrons de liaison

qui sont alors partagés par les deux atomes

accepteur donneur

H+ Cl- H Cl

électrons

4
Types de liaisons chimiques

Liaison ionique :

Transfert d’électrons
d électrons entres atomes

Attraction électrostatique entre ions de charges opposées

Réaction entre un métal et un non-métal exemple Na et Cl

électron

Na Cl Na+ Cl-

Electronégativité

Capacité d’attraction d’un atome envers les électrons de liaison

H: 2,1
F :4,0
Forte

Faible
I : 2,5
Fr : 0,7

5
Electronégativité

Plus la différence d’électronégativité est grande plus la liaison a un


caractère ionique
Différence liaison
d’électronégativité
nulle (ΔE=0) Covalente non polaire

moyenne covalente polaire

importante (ΔE>2) ionique

=> Aucun composé n’a un caractère purement ionique

Si carctère ionique >50% : composé ionique (solides cristallins ioniques)

6
Electronégativité

Plus la différence d’électronégativité est grande plus la liaison a un


caractère ionique
Différence liaison Différence
d’électronégativité d’électronégativité
nulle H2 (0) Covalente non polaire Faible ou nulle H2 (ΔE≤0,4)

moyenne HF (0,1≤ ΔE ≤1,9) covalente polaire moyenne HF (0,4< ΔE <1,7)

importante NaCl (ΔE>2) ionique importante NaCl (ΔE≥1,7)

Polarité de la liaison et moment dipolaire

Lors des liaisons covalentes polaires, on observe l’apparition de


charges partielles (δ) sur les atomes

H F

δ+ δ-

moment dipolaire

Les molécules polaires présentent ce type de distribution électrique

7
Molécules polaires et apolaires

Polarité moment dipolaire


δ+ δ- H Cl molécule polaire
H Cl

δ- 2δ+ δ-
C C molécule apolaire

2δ-
O O O
molécule p
polaire
δ+ H H δ+ H H H H

Un molécule est polaire quand le barycentre des charges positives


n'est pas confondu avec le barycentre des charges négatives en
tenant compte de la position des atomes dans l'espace

Liaison covalente
Liaisons σ Par recouvrement axial des orbitales atomiques

Orbitale s Orbitale s recouvrement Orbitale σ


Z Z

Orbitale p Orbitale p recouvrement

Orbitale σ
Z Z Z

Orbitale p Orbitale s recouvrement Orbitale σ

8
Liaison covalente

Liaison π

Par recouvrement latéral des orbitales p, on forme des orbitales π

Z Z Z Z Z

Orbitale p Orbitale p recouvrement Orbitale π

Liaisons de plus de deux atomes


Méthane 109°3
H Tétraèdre
H C H
H

=> 4 liaisons identiques

Carbone 1s22s22p2 configuration fondamentale


Carbone 1s22s12p3 configuration de liaison

Formation de 4 orbitales identiques sp3 (orbitales issues de l’hybridation


des 2s et 2p)

9
Orbitales hybrides sp3

1s

sp3
sp3
sp3

1s 1s
sp3

1s

Orbitales hybrides

Orbitales sp3 H
H C H tétraèdre
109°28
H

Orbitales sp2
H
120° B Triangle équilatéral
H H

Orbitales sp
180°
H Be H droite

10
Liaisons doubles

p p
π
Sp2 Sp2 H H
Sp2 Sp2 C C Ethylène
σ H H
Sp2 Sp2
π

Carbone 1s22s22p2 configuration fondamentale


Carbone 1s22s12p3 configuration de liaison

3 orbitales sp2 = 3 électrons de valence utilisés pour des liaisons σ


Il reste 1 électron de valence utilisable pour une liaison π

Orbitales hybrides sp2


Liaison double

11
Liaison triple

π
π
Sp Sp σ Sp Sp H C C H Acétylène
π
π
Orbitales hybrides sp

π
π
σ
H C N
σ
π
π

Orbitales hybrides sp liaisons doubles successives

sp2

sp sp2

12
Modèle de Lewis de la liaison covalente

Principes de base :

-Seuls les électrons de valence vont influencer les liaisons que


fait un atome et la forme de la molécule

-Les atomes vont essayer d’obtenir une structure électronique similaire


à celle d’un gaz rare > règle de l’octet et règle du doublet

-Chaque liaison covalente nécessite deux électrons

-Les électrons de liaison (covalente) appartiennent aux deux atomes

Modèle très simple => il existe de nombreuses exceptions!

Modèle qui ne s’applique pas aux liaisons ioniques!

Modèle de Lewis de la liaison covalente

Alcalins Halogènes Gaz Nobles

.H : He g du doublet 1ère p
règle période
:
:

. Li : F. : Ne : règle de l’octet 2ème période


:
::

. Na : Cl . : Ar : règle de l’octet 3ème période


:

très réactif très réactif inerte

13
Formation du chlore moléculaire
(configuration électronique analogue à celle de l’argon)

:
:

:
: Cl . + . Cl : : Cl : Cl : (Cl2)

:
:

:
:
:
:
: Cl Cl :

:
:
Formation de l’hydrogène moléculaire
(configuration électronique analogue à celle de l’hélium)

H. + . H H H (H2)

Formation du HCl
(configuration électronique de type gaz noble (hélium ou argon))
:

H . + . Cl : H Cl : (HCl)
:

Règles d’écriture des diagrammes de Lewis

1) calculer la somme des électrons de valence

2) Placer les atomes : carbone généralement au centre et hydrogène

toujours à l’extérieur. Lorsqu’il y a un atome seul, il est généralement

au centre

3) utiliser un doublet d’électrons pour chaque liaison

4) répartir les autres électrons entre les atomes de manière à ce que

l’hydrogène respecte la règle du doublet et les atomes de la deuxième

période la règle de l’octet

14
Exemple : H2O

1) Hydrogène : 1 électron de valence


Oxygène : 6 électrons de valence
Total : 8 électrons de valence à répartir dans la molécule

2) H O H 4 électrons impliqués dans 2 liaisons


:

3) H O H Respect de la règle du doublet et de l’octet


:

O les doublets électroniques non-liants repoussent


H les atomes d’hydrogène (RPEV)
H

Formule de Lewis de quelques molécules courantes

Liaisons simples
Méthane CH4 H
:

Chloroforme CHCl3 : Cl :
:

H C H
:

: Cl C Cl :
:
:

H H

Méthanol CH3OH H Ethane C2H6


H H
:

H C O H
H C C H
:

H
H H H H
Ethanol C2H5OH
:

H C C O H
:

H H

15
Liaisons multiples

Mise en commun de plusieurs paires d’électrons (2 ou 3 paires)

Azote moléculaire (N2)


yg
Oxygène moléculaire ((O2)
:N N:

Dioxyde de carbone CO2 Cyanure d’hydrogène


C H C N:

Ethylène (C2H4) Acétylène (C2H2)


H H H C C H
C C
H H

Diagramme de Lewis pour quelques molécules courantes

Ammoniac NH3 Ammonium NH4+

H H +

H N: H N H

H H

ion hydronium H3O+ ion hydroxyde (OH-)


+ y d’hydrogène
Peroxyde y g H 2 O2
-
:

H O H
:
:

H O: H O O H
:

:
:

16
Résonance : formes mésomères

Dans certains cas, il existe plusieurs diagrammes de Lewis possibles


pour une molécule

- -

N N Hybrides de résonance

:
:

Forme 1 Forme 2 Nitrite (NO2-)

Dans ce cas on considère que la formule réelle est une superposition des
formules de Lewis possibles

N
:

Représentation conjointe

Résonance: formes mésomères

Nitrate (NO3-) Nitrate (NO3-)

-
-
O O

N N
O O

une des
représentation
trois formes
conjointe
de résonance

17
Diagramme de Lewis de quelques molécules courantes

Carbonate (CO32-) Carbonate (CO32-)


2- 2-
O O

C C
une des
O O
trois formes
de résonance

Bicarbonate HCO3-
-
O Dioxyde de soufre SO2 Trioxyde de soufre (SO3)
O
C
O O S
H S
O O
:

Exceptions à la règle de l’octet

Dans la première période : respect de la règle du doublet

H respecte toujours le doublet

Dans la deuxième période : respect de la règle de l’octet sauf bore


et béryllium

C, O, N, F respectent toujours l’octet

Dans la troisième période : nombreuses exceptions (phosphore, soufre..)


(possibilité d’utiliser les orbitales 3d pour faire des liaisons)

18
Exceptions à la règle de l’octet

:
: F:
BF3 B ne respecte pas la règle de l’octet
B
F
: F

:
BeCl2 : Cl Be Cl : Be ne respecte pas la règle de l’octet
:
:

:F:
F F
SF6 S S ne respecte pas la règle de l’octet

F F
: F:
:

Charges formelles

Lorsque plusieurs diagrammes de Lewis sont possibles, il est souvent


possible de choisir le plus probable:

Le diagramme de Lewis le plus probable est celui qui :

-minimise les charges formelles totales


-accorde des charges formelles négatives aux atomes les plus électronégatifs

Calcul de la charge formelle

Nombre d’électrons de valence – nombres d’électrons de valence attribués


à l’l’atome
t d
dans lla molécules
lé l

- électrons des doublets non-liants attribués à l’atome

- électrons de liaison attribués pour moitié à l’atome

19
Exceptions à la règle de l’octet

Phosphate PO43- Sulfate (SO42-)

3- O 2-
O

:
:

:O P O: :O S O
:

:
:

: O: : O:
:

Exemple du phosphate PO43- 32 él

3- 3- 3-
:

:O: O O
:

:
:
:

:O P O: :O P O: :O P O:
:
:

:
:
:
:

: O: : O: O
:
:

Charge formelle O Charge formelle O Charge formelle O


(liaisons simples) (liaisons simples)
6-6-½ (2)=-1
6-6-½ (2)=-1 6-6-½ (2)=-1
Charge formelle O Charge formelle O
(liaisons doubles) (liaisons doubles)
6-4-½ (4)= 0 6-4-½ (4)= 0

Charge formelle P Charge formelle P Charge formelle P


5- ½ (8)=1 5- ½ (10)=0 5- ½ (12)=-1

5 charges 3 charges 3 charges


formelles formelles formelles

20
Radicaux libres

Radical libre : molécule contenant un électron célibataire (non apparié)

> très grande réactivité

Dioxyde d’azote NO2

Monoxyde d’azote NO

N N N

.
.
résonance
Forme 1 Forme 2

Dioxyde de chlore ClO2


:

:
:
:

.O Cl O: :O Cl O.
:

:
:
:

:
Forme 1 Forme 2

Radicaux libres

Le métabolisme cellulaire normal produit des radicaux libres

Dans lles cellules,


D ll l lles radicaux
di lib
libres entraînent
t î t des
d dédégâts
ât iimportants
t t
en lésant l’ADN, les protéines et les lipides.

Ces altérations sont impliquées dans le développement de maladies


coronariennes et l’apparition de cancers

=> mécanismes de défenses (systèmes antioxydants) qui utilisent comme


cofacteur le sélénium,, les vitamines C et E

Tabac, alcool, plomb, aluminium augmentent la production de radicaux libres

21
Théorie RPEV (VSEPR)

Répulsion des Paires d’Electron de la couche de Valence

2 règles :

1) L’agencement spatial des atomes de la molécule correspond à une


répulsion minimale des paires d’électrons de valence

2) Les doublets non-liants exercent une répulsion supérieure aux


doublets liants

O
:

H O H
H H
:

104°

ThéorieRPEV
Théorie RPEVetetformes
formesdes
desmolécules
molécules

droite
CO2 120°
AX2
Bipyramide 90°
trigonale
120° PCl5
AX5

Triangle équilatéral SO
3 90°
AX3

109°3
90°

Octaèdre SF6

CCl4 AX6
Tétraèdre
AX4

22
Théorie RPEV et formes des molécules

Méthane CH4 Dichlorométhane CH2Cl2


H
H C H Cl
H H C Cl
109° H
AX4 Tétraèdre 109° AX4 Tétraèdre

Ammoniac NH3 Eau H2O

:
H O:
H N:
H
H
107° 104°
AX2E2 Angle
AX3E1 pyramide à base triangulaire

Théorie RPEV et formes des molécules


90°
AX5E1
pyramide
à base carrée 90°

120° 90°
90° AX4E2
AX4E1 bascule carré plan
90°

90°

120°
90°
90°

AX3E2 forme de T AX3E3 forme de T

23

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