République Algérienne Démocratique et Populaire
Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique
Université de Batna 2
Faculté des Sciences de la Nature et de la Vie
Département de Microbiologie et de Biochimie
Matière : Mycologie-Algologie-Virologie
Mycologie :
II. Classification
Année universitaire : 2024/2025
Licence microbiologie
Classification des champignons :
❖ De très nombreuses classifications ont vu le jour.
❖ En fonction de l’évolution des connaissances et l’utilisation récente des techniques de biologie
moléculaire la classification a connu plusieurs changements.
❖ Taxon est le terme général pour tout groupe taxonomique.
❖ Les différents taxons ont des terminaisons standard selon le Code international de nomenclature.
❖ Les critères retenus pour la classification des champignons sont principalement morphologiques à
savoir :
➢ Pigmentation
➢ Forme des hyphes.
➢ Présence ou absence des cloisons.
➢ Types des spores.
D’autres critères peuvent être pris en considération comme :
- Le mode de reproduction sexuée et asexuée.
- Les critères génétiques (analyse des séquences de l’ARNr 18S et certains gènes codant pour des protéines).
Classification des champignons :
L’analyse des séquences de l’ARNr 18S et de certains gènes codant pour des protéines a montré que les
Eumycota renferment quatre subdivisions reconnues comme des groupes séparés depuis un certain
temps : les Chytridiomycetes, les Zygomycota, les Ascomycota et les Basidiomycota.
D’autres subdivisions n’ont été proposées comme groupes séparés que récemment.
Classification des champignons :
Taxon Terminaison standard (suffixes)
Division mycota
Sous-division mycotina
Classe mycetes
Sous-classe mycetidae
Ordre ales
Famille aceae
Classification des champignons :
Les principales divisions de champignons
1- Chytridiomycota
2- Zygomycota
3- Ascomycota
4- Basidiomycota
5- Deutéromycota
Classification des champignons :
1- Chytridiomycetes : ou chitrides :
Le terme chytrid vient du terme grec chytridion, qui signifie petit pot, faisant référence
aux vaisseaux contenant des spores illustrés dans la figure 1. Ils se singularisent par la
formation de zoospores mobiles dont le flagelle sort du coté postérieur de la cellule.
La majorité sont saprophytes, se développant sur la matière végétale ou animale, l’eau
douce, la boue ou le sol, certains chytridiomycétes vivent dans le rumen des bovins.
Les formes parasites infectent les plantes, exemple: Synchytrium endobioticum qui
provoque la maladie de la verrue noire chez la pomme de terre. Comme elles peuvent infecter
les animaux aquatiques. Exemple: Batrachochytrium dendrobatidis, champignon
exclusivement aquatique qui provoque la chitridiomycose des amphibiens.
Plusieurs espèces sont capables de dégrader la cellulose et même la kératine facilitant
la dégradation de l’exosquelette des crustacés. Ne sont pas pathogènes pour l’homme.
Classification des champignons :
épiderme de la feuille
Figure 1 : chytrides sur une feuille morte immergée dans l'eau.
Classification des champignons :
1- Chytridiomycetes
Zygote diploïde (2n)
Sporange non sexuel
Zoospore diploïde (2n)
Figure 2 : cycle biologique du genre Allomyces.
Classification des champignons :
2- Zygomycota :
Les zygomycétes sont des champignons filamenteux dont les hyphes sont cénocytiques
(coenocytiques, non ségmentés) contenant de nombreux noyaux haploïdes. La plupart d’entre eux vivent sur
des matières végétales et animales en décomposition dans le sol. Quelques-uns sont des parasites de plantes,
d’insectes, d’autres animaux et de l’Homme.
- Exemple : les Mucorales agents des mucormycoses et les Entomophtorales, agent des
entomophthoromycoses.
Certaines espèces sont utiles comme Rhizopus oryzae utilisée dans la préparation du saké.
Les spores asexuées sont des sporangiospores et les spores sexuées sont des zygospores.
Classification des champignons :
2- Zygomycètes :
Figure 3 : cycle biologique de Rhizopus stolonifer .
Classification des champignons :
3- Ascomycota :
Les ascomycètes ou mycètes à sacs, comprennent des moisissures à
hyphes segmentés et certaines levures.
Ils ont une importance écologique dans les milieux dulçaquicoles,
marins et terrestres parce qu’ils ont la capacité de dégrader de nombreux
composés organiques comme la lignine, la cellulose et le collagène.
Leurs spores asexuées sont habituellement des conidiospores, ou
conidies. Les spores sexuées sont des ascospores.
Beaucoup d’ascomycètes sont des parasites des végétaux supérieurs
comme Claviceps purpurea, parasite du seigle et d’autres graminées
provoquant l’ergotisme.
Classification des champignons :
3- Ascomycètes :
Figure 4 : cycle biologique de Talaromyces (un ascomycète)
Classification des champignons :
3- Ascomycètes
Figure 5 : cycle de développement sexué d’une levure.
Classification des champignons :
4- Basidiomycota :
Regroupe les basidiomycètes. Ce nom provient d’une structure cellulaire
caractéristique, connus sous le nom de champignons à chapeau ou à carpophore. Ils
possèdent des filaments cloisonnés. La plupart sont des saprophytes, capables de dégrader
plusieurs composés comme la cellulose et la lignine.
Certains sont des phytopathogènes comme Ustilago maydis qui infecte le maïs
(charbon du mais), d’autres sont pathogènes pour l’Homme et des animaux comme
Cryptococcus neoformans responsable de la cryptococcose. Cette espèce est caractérisée
par la présence d’une capsule jouant le rôle de facteur de virulence pour cet agent.
Classification des champignons :
Basidiomyètes :
Figure 6 : cycle biologique d’un basidiomycète.
Classification des champignons :
Deutéromycètes :
❖ Certains mycètes ont perdu leur mode de reproduction sexuée ou ce mode de
reproduction n’a pas été observé chez ces mycètes.
➢ Regroupent tous les champignons pour lesquels on ne connait pas la reproduction sexuée :
• Soit ont perdu la capacité de se reproduire via ce mode.
• Soit les conditions de culture ne permettent pas de l’obtenir.
C’est pour cette raison, leur classification est en constante évolution, dès l’observation d’un stade téléomorphe
chez un champignon, il sera reclassé dans le phylum adéquat en lui donnant un nouveau nom. Pour la
classification des champignons la forme sexuée dite parfaite est prioritaire.
* Exemple :
- La présence des têtes aspergillaires (reproduction asexuée : blastique phialidique) permet l’identification
d’Aspergillus nidulans (Deuteromycètes), la présence des asques en plus des cléistothèces chez cette espèce a
permis de la reclassifier parmi les Ascomycètes sous le nom Emericella nidulans (forme parfaite).
Références bibliographiques :
1- Chabasse, D. et al. (2002). Cahier de formation biologie moléculaire N°25. Les moisissures d'intérêt
médical. Laboratoire de Parasitologie-Mycologie du CHU d’Angers. Bioframa, p 159.
2- Guillaume, V. (2006). Mycologie: auto-évaluation, manipulations. De Boeck Université Bruxelles.
3- Koenig, H. (1995). Guide de mycologie médicale. Ellipses Marketing, p 284.
4- Maliehe,M., Ntoi,M.A., Lahiri,S., Folorunso,O.S., Ogundeji,A.O., Pohl,C.H. and Sebolai,O.M. (2020).
Environmental Factors That Contribute to the Maintenance of Cryptococcus neoformans Pathogenesis.
Microorganisms, 8:180.
5- Prescott, L. M., Willey, J. M., Sherwood, L. M., Woolverton, C. J. and Coyette, J. (2018) Microbiologie.
De Boeck supérieur. p 1120.
6- Roland, JC. El Maarouf- Bouteau, H. Bouteau, F. (2008). Atlas biologie végétale. 1. Organisation des
plantes sans fleurs, algues et champignons. Dunod, p 152.
7- Samanta, I. (2015) Veterinary Mycology. Springer India, p 179.
8- Tortora, G. J., B. R. Funke, L. Martin and C. L. Case. (2003). Introduction à la microbiologie, ERPI, p
945.
