BUT1 GB BMB – R1.05 CM Microbiologie – F.
Lourdais GB1 – Année 21/22
Chapitre II : Nutrition bactérienne
INTRODUCTION
• Définition des nutriments
• Rôles des nutriments
• Étude de la nutrition bactérienne
I – LA COUVERTURE DES BESOINS NUTRITIFS
1) La couverture des besoins nutritifs élementaires
1.1) Le carbone
1.2) L’azote
1.3) Le soufre
1.4) Le phosphore
1.5) L’oxygène et l’hydrogène
1.6) Les autres éléments chimiques
2) La couverture des besoins nutritifs energétiques
3) La couverture des besoins nutritifs spécifiques
II - LES BESOINS EN EAU
III – LES MILIEUX DE CULTURE AU LABORATOIRE
IV – LES FACTEURS PHYSICO-CHIMIQUES ENVIRONNEMENTAUX
1) La température
2) L'atmosphère d'incubation
3) Le pH
4) L'activité de l'eau et pression osmotique
5) La concentration en substrats
INTRODUCTION
Définition des nutriments :
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Rôles des nutriments :
Document 1 : Les éléments chimiques du monde vivant
BILAN Étude de la Nutrition bactérienne
- Analyse des besoins nutritifs = analyse des besoins élémentaires constitutifs et fonctionnels, les besoins énergétiques
et les besoins spécifiques nécessaires au fonctionnement et à la croissance de la bactérie
- Analyse des facteurs physico-chimiques environnementaux susceptibles d’influencer le fonctionnement et la
croissance de la bactérie dans son milieu de vie
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I – LA COUVERTURE DES BESOINS NUTRITIFS
1) La couverture des besoins nutritifs élementaires
1.1) Le carbone
Rôle
Sources - Les types trophiques par rapport à la source de carbone
CO2 de l'air ou des sels de carbonate Les bactéries sont capables de se développer dans un milieu contenant une
Bactéries …………………….......... source de carbone minérale (CO 2 , HCO3- ...) Elles sont donc capables de
fabriquer toute leur matière organique à partir de cette seule source
minérale.
Molécules organiques Les bactéries utilisent des composés carbonés néo-formés très variés
Bactéries …………………. (polysaccharides, oses, alcools, acides organiques, protéines…) pour
fabriquer leur propre matière organique.
Les bactéries autotrophes se développent plus rapidement sur des milieux contenant des sources de carbone
organiques car elles y puisent les molécules déjà synthétisées.
Les bactéries hétérotrophes ont un équipement enzymatique moins complet que les autotrophes.
Les bactéries qui nous entourent sont en très grande majorité des bactéries hétérotrophes.
1.2) L’azote
Rôle
Sources
Sources minérales - N2 : phénomène rare réservé aux fixateurs symbiotiques (rhizobium associé aux
légumineuses) et à quelques bactéries du sol = fixateurs libres (certains Clostridium,
Azotobacter).
- NO3- et NO2- (nitrates et nitrites) : Nitrosomonas, Nitrobacter
- NH3 (ammoniac) ou NH4+ (ion ammonium) : cas le plus fréquent car pratiquement toutes
les bactéries sont capables d’assimiler l’azote sous forme d’ammonium/ammoniac
Sources organiques acides aminés, (peptides, protéines)
Document 2 :
Assimilation de l’azote
par les bactéries
1.3) Le soufre
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Rôle
Sources
Sources minérales Les micro-organismes pour la plupart utilisent des formes minérales comme source de
soufre : le sulfate (SO42-), le sulfite (SO32-), le thiosulfate (S2O32-),
Source organique D’autres exigent une source organique de soufre comme un acide aminé soufré (ex : la
cystéine)
1.4) Le phosphore
Rôle
Sources
Sources minérales Les micro-organismes utilisent le phosphate inorganique (PO43-) comme source de
phosphore.
1.5) L'oxygène et l'hydrogène
Rôle structure de toutes les molécules organiques et certaines molécules inorganiques
Sources
Sources organiques les molécules organiques
et minérales des molécules inorganiques
certains ions
1.6) Les autres éléments chimiques
Rôle Rôles variés dans la physiologie bactérienne:
- activité de plusieurs enzymes
- transports actifs
- thermorésistance de la spore
....
Sources
Sources minérales Sels et ions
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2) La couverture des besoins nutritifs énergétiques
Rôles Fonctionnement cellulaire :
- échanges membranaires (transports actifs)
- mobilité bactérienne
- synthèse des molécules (anabolisme)
…..
Sources - Les types trophiques par rapport à la source d’énergie
Energie lumineuse
Bactéries ………………………. Les bactéries produisent de l'ATP en utilisant les photons de la lumière
comme source d'énergie (photosynthèse)
Bactéries .................................. Une espèce chimique donneur d'électrons est nécessiare :
L'espèce chimique est une molécule inorganique (ex : Cyanobactéries,
bactéries sulfureuses vertes (Chlorobacteriaceae) et pourpres
(Thiorodaceae))
Bactéries .................................. L'espèce chimique est une molécule organique (ex: bactéries non sulfureuses
vertes et pourpres)
Energie chimique Les bactéries produisent de l’ATP par oxydation de molécules :
Bactéries………………………
Bactéries………………………… si la molécule est inorganique (composés minéraux)
Bactéries………………………… si la molécule est organique
Les bactéries qui nous entourent (bactéries pathogènes pour l’homme et l’animal, bactéries responsables de
l’altération des aliments, la plupart des bactéries saprophytes du sol et de l’eau) sont en très grande majorité des
........................................................
3) La couverture des besoins nutritifs spécifiques
Les bactéries qui ont besoin de facteurs de croissance pour se développer sont dites …………………………..pour ces
composés. Les bactéries qui n’ont pas besoin de facteurs de croissance sont dites …………………………………
II – LES BESOINS EN EAU
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III – LES MILIEUX DE CULTURE AU LABORATOIRE
Au laboratoire, un milieu synthétique est utilisé pour l'étude des besoins nutritifs d'une espéce donnée. Pour
l'identification d'une bactérie à partir de colonies isolées, la plupart des milieux de culture utilisés sont des milieux
semi-synthétiques.
• Milieu synthétique / milieu semi-synthétique
Document 3 : Milieu synthétique minimum pour la culture de E.coli
Etude de la composition de ce milieu : les besoins nutrtifs sont-ils couverts?
Glucose 1g
K2HPO4 10.5 g
KH2PO4 3.5 g
NH4Cl 0.5 g
MgSO4,7H2O 0.05 g
FeSO4,7H2O 0.005 g
NaCl,2H2O 0.05 g
MnCl2, 4H2O 0.005 g
CaCl2 0.005 g
Eau distillée 1 litre
Les oligoélements sont apportés par l’eau osmosée, les constituants principaux des milieux de culture (impuretés), la
verrerie.
Quels sont les types trophiques = types nutritionnels pour E.coli?
Définition du milieu minimum :
Un milieu minimum est un milieu de culture n’apportant que les nutriments indispensables pour le développement
d’une bactérie donnée.
- Proteus vulgaris n’est pas capable de se développer sur le milieu de culture adapté pour E.coli. Par contre, il
pourra s’y développer si on ajoute de l’acide nicotinique. Proteus vulgaris est
donc ..................................................................................
La compostion du milieu minimum de Proteus vulgaris pourra être celle du milieu minimum de E.coli dans lequel a
été ajouté de l'acide nicotinique.
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Document 4 : Milieu semi-synthétique ordinaire pour la culture de E.coli
Composition (en g/l d’eau distillée) des constituants de la Gélose nutritive
Peptone 4,4
Extrait de viande 1,85
Extrait de levure 4,4
Chlorure de sodium 6,35
Agar 15
pH à 7,4 +/- 0,2
peptones / extrait de viande / extrait de levure
E.coli est une bactérie non exigeante car elle se développe sur ce milieu ordinaire en formant des colonies d'un
diamètre supérieure ou égal à 1 mm après 24h d'incubation à 37°C en aérobie.
IV – LES FACTEURS PHYSICO-CHIMIQUES ENVIRONNEMENTAUX
Les micro-organismes comme tous les êtres vivants sont affectés par des variations de constantes physiques
ou chimiques de leur environnement et, les bactéries en particulier, qui sont unicellulaires. Une compréhension de
l’influence du milieu permet de contrôler la croissance microbienne et de comprendre la distribution écologique des
micro-organismes.
1) La température
• Effet de la température
• Evolution de la vitesse de croissance en fonction de la température
Document 5 : Évolution de la vitesse de croissance en fonction de la température
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• Classification des micro-organismes en fonction de leur température optimale de croissance
Document 6 : Classification des micro-organismes en fonction de leur température optimale de croissance
Cette classification n’a pas de limites strictes et il peut exister des chevauchements d’un groupe à l’autre.
2) L'atmosphère d'incubation
• Comportement vis à vis de l'oxygène
Document 7 : Classification des micro-organismes en fonction du type respiratoire
Catégories Comportement vis à vis de l’O2 Exemples de micro-organismes
Type respiratoire
Utilisation obligatoire de O2 car l'O2 est le seul Pseudomonas
accepteur final d’électrons dans les processus de Micrococcus
réoxydation des coenzymes réduits au niveau de la Neisseria
chaîne respiratoire
Escherichia
………………………………………….. : O2 n’est Enterococcus
pas indispensable à la croissance mais celle-ci est Saccharomyces cerevisiae
meilleure en sa présence
Streptococcus
………………………………………………………
………………………………………………..:
tolère l’O2 mais ne l’utilise pas
Ne tolère pas une exposition prolongée à l’O2 car O2 Clostridium
est toxique pour le germe Bacteroïdes
Bifidobacterium
Germe capable de cultiver uniquement sous une Campylobacter
concentration en O2 inférieure (2 à 10%) à celle de certains Pseudomonas
l’air (20%)
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• Comportement vis à vis du CO2
3) Le pH
• Effet du pH
• Evolution de la vitesse de croissance en fonction du pH
Document 8 : Evolution de la vitesse de croissance en fonction du pH du milieu
• Classification des micro-organismes en fonction de leur température optimale de croissance
Document 9 : Classification des micro-organismes en fonction du pH optimal de croissance
Catégories pH de croissance Exemples de microorganismes
entre 0 et 5,5 Archéobactéries (Sulfolobus) (pH 1)
Bactéries lactiques (Lactobacillus) (pH 4-5)
Champignons (pH 3-6)
5,5 – 8,5 E.coli et autres germes d’intérêt médical
pH optimal environ 7
entre 8,5 et 11,5 Vibrio cholerae
4) Activité de l’eau et Pression osmotique
Activité de l’eau : aw (Activity of waters) : rapport de la pression de vapeur d’eau au dessus du milieu, sur celle de
l’eau pure à même température.
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5) Concentration en substrats
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