République Algérienne Démocratique et Populaire

Ministère de la Santé

Réseau Algérien de Surveillance de la Résistance des

Bactéries aux Antibiotiques (AARN)

Surveillance de la résistance des

bactéries aux antibiotiques

20ème Rapport d’évaluation

(de janvier à décembre 2019)

Edition 2021

[Link]
Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Membres fondateurs
Pr. [Link] (Institut Pasteur – Dely Ibrahim – Alger)
Pr. [Link] (CHU Frantz Fanon - Blida)
Pr. [Link] MAAMAR (Institut Pasteur – Dely Ibrahim – Alger)
Feu Dr. [Link]
Dr. [Link] (INSP - Alger)
Pr. A. BENSLIMANI (EHS Dr Maouche – Alger)
Dr. A. ABOUN (Institut Pasteur – Kouba – Alger)

Comité organisateur
Pr. [Link] (Institut Pasteur – Dely Ibrahim – Alger)
Pr. [Link] MAAMAR (Institut Pasteur – Dely Ibrahim – Alger)
Dr. [Link] (INSP - Alger)
Pr. A. BENSLIMANI (EHS Dr Maouche – Alger)
Dr. H. AMMARI (CHU Béni Messous – Alger)
Pr. M. N. OUAR KORICHI (EHS CPMC – Alger)
Pr. S. MAHRANE (CHU Nafissa - Hamoud Alger)

Comité de rédaction
Pr. K. RAHAL (Institut Pasteur – Dely Ibrahim – Alger)
Pr. [Link] MAAMAR (Institut Pasteur – Dely Ibrahim – Alger)
Dr. M.F.K. MISSOUM (INSP – Alger)
Pr. A. BENSLIMANI (EHS Dr Maouche – Alger)
Dr. H. AMMARI (CHU Béni Messous – Alger)
Pr. M. N. OUAR KORICHI (EHS CPMC – Alger)
Pr. S. MAHRANE (CHU Nafissa – Hamoud- Alger)

Corrigé par
Pr. K. RAHAL (Institut Pasteur – Dely Ibrahim – Alger)
Pr. A. BENSLIMANI (EHS Dr Maouche – Alger)
Pr. H. TALI MAAMAR (Institut Pasteur – Dely Ibrahim – Alger)
Pr. S. MAHRANE (CHU Nafissa – Hamoud- Alger)
Pr. M. N. OUAR KORICHI (EHS CPMC – Alger)
Dr. H. AMMARI (CHU Béni Messous – Alger)
Dr. S. BOUHERAOUA (Institut Pasteur – Dely Ibrahim – Alger)

Participation technique
Mme. R. HADDOU / Evaluation externe de la qualité (Institut Pasteur – Dely Ibrahim – Alger)
Mr C. MAHIEDDINE / Informatique (Institut Pasteur – Dely Ibrahim – Alger)

Secrétariat
Mlle H. SAKHI (Institut Pasteur – Dely Ibrahim – Alger)
Remerciements
Mlle Y. Ammari pour avoir vérifié les calculs.

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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Liste des abréviations

QUINOLONES
β-LACTAMINES
Pénicilline PEN Acide nalidixique NAL
Oxacilline OXA Ofloxacine OFX
Ampicilline AMP Ciprofloxacine CIP
Amoxicilline AMX Lévofloxacine LVX
Amoxicilline +[Link] AMC Gemifloxacine GEM
Ticarcilline TIC
Ticarcilline +[Link] TCC
NITROFURANTOINES
Pipéracilline PIP
Céfalexine LEX Furanes NIT
Céfazoline CZO
Céfalotine CEF
Céfoxitine FOX AUTRES
Céfotaxime CTX FUS
Acide fusidique
Ceftriaxone CRO RIF
Rifampicine
Ceftazidime CAZ FOS
Fosfomycine
Aztréonam ATM
Imipénème IPM
Ertapénème ERT Autres abréviations

AMINOSIDES American Type Culture Collection ATCC

Gentamicine GEN β-lactamase Negative Ampicillin Resistant BLNAR
[Link] Résistant à la Méticilline SARM
Gentamicine Haut niveau GEH
Streptomycine Haut niveau STH Bactéries Multi-Résistantes BMR
Kanamycine KAN β-lactamase à Spectre Etendu BLSE
Amikacine AMK Céphalosporines de 3èmeGénération C3G
Tobramycine TOB Pénicillinase PASE
Nétilmicine NET Ceftazidime Résistant CAZ R
Imipénème Résistant IPM R
CYCLINES Ciprofloxacine Résistant CIP R
Tétracycline Enterococcus spp. Résistant à la Vancomycine ERV
TCY
Doxycycline Mc Farland MF
DOX
Clinical and Laboratory Standards Institute CLSI
MACROLIDES Entérobactéries productrices de BLSE EBLSE
Erythromycine ERY Entérobactéries productrices de carbapénèmase EPC
Azithromycine AZM Pneumocoque de sensibilité diminuée à la PSDP
pénicilline
Clindamycine CLI
Colistine Résistant CS R
Pristinamycine PRI S. aureus de sensibilité intermédiaire à la VISA
Spiramycine SPI vancomycine
Quinupristine-Dalfopristine QDF S. aureus de sensibilité intermédiaire aux GISA
PHENICOLES glycopeptides
Oto Rhino Laryngologie ORL
Chloramphénicol CHL Algerian Antimicrobial Resistance Network AARN
POLYPEPTIDES
Colistine COL

GLYCOPEPTIDES
Vancomycine VAN
Teicoplanine TEC

SULFAMIDES ET ASSOCIES
Triméthoprime+ sulfaméthoxazole SXT

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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Liste et abréviations des laboratoires médicaux

Centre hospitalo-universitaire d’Annaba CHU Annaba
Centre hospitalo-universitaire de Bab El Oued CHU Bab El Oued
Centre hospitalo-universitaire de Batna CHU Batna
Centre hospitalo-universitaire de Béni-Messous-laboratoire central CHU Béni-Messous- laboratoire central
Centre hospitalo-universitaire de Blida CHU Blida
Centre hospitalo-universitaire de Constantine CHU Constantine
Centre hospitalo-universitaire d’Hussein Dey CHU Hussein Dey
Centre hospitalo-universitaire Mustapha Bacha CHU Mustapha Bacha
Centre hospitalo-universitaire d’Oran CHU Oran
Centre hospitalo-universitaire de Sétif CHU Sétif
Centre hospitalo-universitaire de Tizi Ouzou CHU Tizi Ouzou
Etablissement hospitalier universitaire d’Oran EHU Oran
Etablissement Public et Hospitalier de Birtraria EPH Birtraria
Etablissement Public et Hospitalier de Bologhine EPH Bologhine
Etablissement Public et Hospitalier de Boufarik EPH Boufarik
Etablissement Hospitalier Spécialisé Centre Pierre et Marie Curie EHS CPMC
Etablissement Hospitalier Spécialisé Salim Zemirli EHS Zemirli
Etablissement Hospitalier Spécialisé El Hadi Flici EHS El Hadi Flici
Etablissement Hospitalier Spécialisé Dr Maouche EHS Maouche

Hôpital Central de l’Armée HCA

Hôpital Militaire Universitaire Spécialisé de Staouéli HMUS Staouéli

Hôpital Militaire Régional Universitaire d’Oran HMRU Oran

Institut National de Santé publique INSP

Laboratoire de Bactériologie Médicale et de Surveillance de la IPA- Dely Ibrahim

Résistance aux Antibiotiques Institut Pasteur d’Algérie- Dely Ibrahim

Etablissement public et hospitalier Rouiba – Alger EPH Rouiba

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 Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Liste des tableaux

Tab. 1 Liste des antibiotiques à tester par souche de référence 32

Tab. 2 Laboratoires ayant effectué moins de 30 tests de CQ par souche de référence 34

Tab. 3 Nombre et pourcentage des différentes espèces bactériennes isolées des hémocultures par laboratoire (N=2806, année 2019) 37

Tab. 4 Nombre et pourcentage de Klebsiella pneumoniae résistantes (R + I) aux antibiotiques isolées d’hémocultures (année 2019) 39

Tab. 5 Nombre et pourcentage des Escherichia coli résistants (R + I) aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année 2019) 40

Tab. 6 Nombre de Proteus mirabilis résistants (R + I) aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année 2019) 41

Tab. 7 Nombre et pourcentage d’Enterobacter cloacae résistants (R + I) aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année 2019) 42

Tab. 8 Nombre et pourcentage de Staphylococcus aureus résistants (R + I) aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année 2019) 43

Tab. 9 Nombre et pourcentage de Pseudomonas aeruginosa résistants (R + I) aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année 2019) 44

Tab. 10 Répartition des BMR dans les hémocultures (N=1527, année 2019) 45

Tab. 11 Nombre et pourcentage de BMR par espèce bactérienne isolées dans les hémocultures (année 2019) 47

Tab. 12 Nombre des isolats bactériens á partir du LCR (année 2019) 50

Tab. 13 Répartition des isolats de N. meningitidis par sérogroupe (année 2019) 51

Tab. 14 Répartition des souches de [Link] par sérogroupe et par tranche d’âge (Résultats du réseau, année 2019) 51

Tab. 15 Répartition des souches de [Link] par sérogroupe et par tranche d’âge (Résultats de l’IPA, année 2019) 52

Tab. 16 Nombre de N. meningitidis sensibles et résistants aux antibiotiques (Résultats du réseau, année 2019) 53

Tab. 17 Nombre de N. meningitidis sensibles et résistants aux antibiotiques (Résultats de l’IPA, année 2019) 53

Tab. 18 Répartition des souches de S. pneumoniae par tranche d’âge dans le LCR (année 2019) 54

Tab. 19 Nombre et pourcentage* de résistance et de sensibilité de S. pneumoniae aux antibiotiques dans le LCR (année 2019) 55

Tab. 20 Distribution des valeurs de CMI vis-à-vis de la pénicilline G pour S. pneumoniae dans le LCR (année 2019) 55

Tab. 21 Nombre de CMI déterminées par laboratoire pour S. pneumoniae isolé à partir de LCR (année 2019) 56

Tab. 22 Sérotypes de [Link] dans le LCR (données de l’IPA, année 2019) 57

Répartition des bactéries (autres que N. meningitidis, S. pneumoniae , H. influenzae, [Link] et [Link])
Tab. 23 58
isolées de LCR (année 2019)

Tab. 24 Nombre des isolats de [Link] (LCR exclu) par laboratoires (année 2019) 60

Tab. 25 Répartition des souches de [Link] par type de prélèvement (LCR exclu) (année 2019) 61

Tab. 26 Répartition par tranches d’âges des souches de [Link] isolés à partir des prélèvements autres que le LCR (année 2019) 62

Nombre et pourcentage de résistance et de sensibilité de [Link] aux antibiotiques dans les prélèvements autres que le
Tab. 27 63
LCR (année 2019)

5
[Link]
 Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Distribution des valeurs de CMI vis-à-vis de la pénicilline G pour S. pneumoniae dans les prélèvements autres que le LCR (année
Tab. 28 64
2019)

Tab. 29 Nombre de CMI déterminées par laboratoire pour S. pneumoniae isolé à partir des prélèvements autres que le LCR (année 2019) 65

Tab. 30 Sérotypes de [Link] isolés à partir de prélèvements autres que le LCR (données de l’IPA, année 2019) 66

Tab. 31 Nombre et pourcentage de souches bactériennes isolées des coprocultures (N=152, année 2019) 68

Tab. 32 Nombre de salmonelles isolées à partir des différents prélèvements en milieu hospitalier et externe (N=141, année 2019) 69

Tab. 33 Nombre et pourcentage de Salmonella spp. résistantes (R + I) aux antibiotiques (année 2019) 70

Tab. 34 Nombre et pourcentage de Salmonella spp. digestives résistantes (R + I) aux antibiotiques (année 2019) 71

Tab. 35 Nombre et pourcentage de Salmonella spp. extra-digestives résistantes (R + I) aux antibiotiques (année 2019) 71

Tab. 36 Nombre et pourcentage des différents sérovars de salmonelles (données du réseau, N=141, année 2019) 72

Nombre et pourcentage des différents sérovars de salmonelles confirmées au laboratoire des entérobactéries et autres bactéries
Tab. 37 73
apparentées (IPA, N=75, année 2019)

Nombre et pourcentage de résistance aux antibiotiques des différents sérovars de salmonelles isolés des patients externes et
Tab. 38 74
hospitalisés (données du réseau, année 2019)

Tab. 39 Répartition des bactéries isolées des urines par espèce bactérienne chez les patients hospitalisés (N=4401, année 2019) 77

Tab. 40 Répartition des bactéries isolées des urines par espèce bactérienne chez les patients externes (N=4176, année 2019) 79

Tab. 41 Nombre et pourcentage des [Link] (R+I) isolés des urines (année 2019) 81

Tab. 42 Nombre et pourcentage d’Escherichia coli résistants (R + I) aux antibiotiques (année 2019) 85

Tab. 43 Nombre et pourcentage de Klebsiella pneumoniae résistantes (R + I) aux antibiotiques (année 2019) 86

Tab. 44 Nombre et pourcentage d’Enterobacter cloacae résistants (R + I) aux antibiotiques (année 2019) 87

Tab. 45 Nombre et pourcentage de Serratia marcescens résistantes (R + I) aux antibiotiques (année 2019) 88

Tab. 46 Nombre et pourcentage de Proteus mirabilis résistants (R + I) aux antibiotiques (année 2019) 89

Tab. 47 Nombre et pourcentage de Pseudomonas aeruginosa résistants (R+I) aux antibiotiques (année 2019) 90

Tab. 48 Nombre et pourcentage d’Acinetobacter spp. résistants (R + I) aux antibiotiques (année 2019) 91

Tab. 49 Nombre et pourcentage de Staphylococcus aureus résistants (R+ I) aux antibiotiques (année 2019) 92

Tab. 50 Nombre et pourcentage des SASM résistants (R+ I) aux antibiotiques (année 2019) 93

Tab. 51 Nombre et pourcentage des SARM résistants (R+ I) aux antibiotiques (année 2019) 94

Tab. 52 Nombre et pourcentage d’Enterococcus faecalis résistants (R + I) aux antibiotiques (année 2019) 95

Tab. 53 Nombre et pourcentage d’Enterococcus faecium résistants (R + I) aux antibiotiques (année 2019) 96

6
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Liste des figures

Fig. 1 Pourcentage des différentes espèces bactériennes isolées à partir des hémocultures (N=2806, année 2019) 38
Pourcentage des Klebsiella pneumoniae résistantes (R+I) aux antibiotiques isolées d’hémocultures (année
Fig. 2 39
2019)
Fig. 3 Pourcentage des Escherichia coli résistants (R+I) aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année 2019) 40

Fig. 4 Pourcentage des Enterobacter cloacae résistants (R+I) aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année 2019) 42
Pourcentage des Staphylococcus aureus résistants (R+I) aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année
Fig. 5 43
2019)
Pourcentage des Pseudomonas aeruginosa résistants (R+I) aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année
Fig. 6 44
2019)
Fig. 7 Répartition des BMR dans les hémocultures (N=1527, année 2019) 46

Fig. 8 Pourcentage des BMR dans les hémocultures (année 2019) 48

Pourcentage des bactéries (autres que N. meningitidis, S. pneumoniae, H. influenzae,
Fig. 9 58
[Link] et [Link]) isolées du LCR (N=307, année 2019)
Répartition des souches de [Link] par type de prélèvement (LCR exclu) (Résultats
Fig. 10 61
du réseau, année 2019)
Répartition des souches de [Link] par catégories d’âges dans les prélèvements autres que le LCR
Fig. 11 62
(Résultats du réseau, année 2019)
Pourcentage de résistance et de sensibilité de [Link] aux antibiotiques dans les prélèvements
Fig. 12 64
autres que le LCR (Résultats du réseau, année 2019)
Fig. 13 Nombre des souches bactériennes isolées des coprocultures (N=152, année 2019) 69

Nombre de salmonelles isolées à partir des différents types d’infections en milieu hospitalier et externe
Fig. 14 70
(N=141, année 2019)

Fig. 15 Nombre des différents sérovars de salmonelles (données du réseau, N=141, année 2019) 72

Nombre des différents sérovars de salmonelles confirmés au laboratoire des entérobactéries et autres
Fig. 16 73
bactéries apparentées (IPA, N=75, année 2019)
Fig. 17 Pourcentage de souches isolées dans les urines chez les patients hospitalisés (N=4401, année 2019) 78

Fig. 18 Pourcentage de souches isolées dans les urines chez les patients externes (N=4176, année 2019) 80
Pourcentage de résistance aux antibiotiques (R+I) des E. coli isolés des urines chez les patients externes
Fig. 19 82
(année 2019)
Pourcentage de résistance aux antibiotiques (R+I) des E. coli isolés des urines chez les patients hospitalisés
Fig. 20 82
(année 2019)
Fig. 21 Pourcentage de résistance (R+I) d’Escherichia coli aux antibiotiques (année 2019) 85

Fig. 22 Pourcentage de résistance (R+I) de Klebsiella pneumoniae aux antibiotiques (année 2019) 86

Fig. 23 Pourcentage de résistance (R+I) d’Enterobacter cloacae aux antibiotiques (année 2019) 87

Fig. 24 Pourcentage de résistance (R+I) de Serratia marcescens aux antibiotiques (année 2019) 88

Fig. 25 Pourcentage de résistance (R+I) de Proteus mirabilis aux antibiotiques (année 2019) 89

Fig. 26 Pourcentage de résistance de Pseudomonas aeruginosa aux antibiotiques (année 2019) 90

Fig. 27 Pourcentage de résistance (R+I) d’Acinetobacter spp. aux antibiotiques (année 2019) 91

Fig. 28 Pourcentage de résistance (R+I) de Staphylococcus aureus aux antibiotiques (année 2019) 92

Fig. 29 Pourcentage des SASM résistants (R+I) aux antibiotiques (année 2019) 93

Fig. 30 Pourcentage des SARM résistants (R+I) aux antibiotiques (année 2019) 94

Fig. 31 Pourcentage de résistance (R+I) d’Enterococcus faecalis aux antibiotiques (année 2019) 95

Fig. 32 Pourcentage de résistance (R+I) d’ Enterococcus faecium aux antibiotiques (année 2019) 96

7
[Link]
 Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

LISTE DES MEMBRES DU RESEAU AARN

Coordinateur du réseau : Pr K. RAHAL
Médicaux :

Chef de Service ou Coordinateur entre le

responsable de Tél. Fax
Noms et adresses de la structure service et le réseau
laboratoire
Institut Pasteur d’Algérie - Laboratoire de
Pr TALI-MAAMAR
01 bactériologie médicale et de surveillance de la BOUHERAOUA Selma 023 36 75 36 023 36 75 36
Hassiba
résistance aux antibiotiques - Alger

CHU Mustapha Bacha – Alger - Service de

02 Pr AMHIS Wahiba DJENNANE Fazia 021 23 57 87 021 23 57 87
microbiologie

03 CHU Alger Ouest Beni Messous - Alger - Pr YALA Djamel TOUATI Djamila 021 93 12 88 021 93 12 88
Laboratoire central
04 CHU Bab El Oued – Alger - Laboratoire central Pr MAKLOUF Mohamed HANNI Amina 021 96 02 42 021 96 02 42

05 EHS Pierre et Marie Curie – Alger - Laboratoire Pr OUAR KORICHI BELLOUT Zohra 021 23 76 92 021 23 76 92
central Mounira
EHS Dr M.A. Maouche El Biar – Alger - Service
06 Pr BENSLIMANI Akila REZGUI Sonia 023 18 20 16 023 18 20 16
de Biologie Clinique

EHS El Hadi Flici – Bab El Oued – Alger - Dr CHERGUELAINE

07 MECHOUET Faiza 021 97 94 07(LD) 021 97 94 07
Laboratoire central Khaled
Institut National de Santé Publique - Alger - MISSOUM Mohamed
08 Département Soutien Technique - Laboratoire de Dr HAMMADI Djamila 023 18 74 56 021 91 27 37
Fawzi Karim
microbiologie

8
[Link]
 Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Pr AIT BELKACEM 021 49 56 16 021 49 56 16

09 CHU Hussein Dey - Alger - Laboratoire Central MAHRANE Sadjia
Habiba 021 49 56 56 / 59 021 23 28 04

EPH Djilali Belkhanchir (Ex Birtraria) - Alger - 021 90 00 10 ST

10 Pr RAAF Nabil OUSSADOU Latifa 021 90 00 23
Laboratoire central
021 90 00 23 LD
Hôpital Central de l‘armée. - Alger. Laboratoire 021 54 54 54 (st)
11 Pr ZEROUKI Ali HENNICHE Fatma Zohra 021 54 52 38
de microbiologie
021 54 53 62
CHU Benbadis - Constantine- Service de 031 94 64 99 (L.D)
12 Pr BENLABED Kadour BENTCHOUALA Chafia 031 88 64 99
microbiologie
031 88 78 30
13 CHU Benflis Touhami Batna - Laboratoire de Pr BEN MEHIDI BEN MEHIDI Messaoud 033 30 83 26 (LD) 033 30 83 26
microbiologie Messaoud

14 EPH Boufarik – Blida - Laboratoire central Dr LASSAS Karima SABABOU Karima 025 47 14 10 (P156) 025 47 14 11

15 CHU Saadna Mohamed Abdenour - Sétif - Pr SAHLI Farida SAHLI Farida 036 54 40 15 036 54 40 17
Laboratoire de bactériologie

16 CHU d’Oran Laboratoire central Dr ZOUAGUI Souad ZOUAGUI Souad 041 41 22 59 041 41 34 14

17 CHU Dorban – Annaba - Laboratoire central Pr NEDJAI Sabrina DJAHMI Nassima 038 42 58 04 038 42 58 04

18 CHU de Tizi-Ouzou - Laboratoire de Dr BOUBRIT Fella CHERIFI Lynda 026 21 13 16 026 21 71 04

microbiologie et de parasitologie

19 Pr CHERIFI Mohamed BENREDOUANE Mounia 021 95 95 51 021 95 95 51 (Labo)

EPH Bologhine - Alger - Laboratoire central 021 95 81 75 (DG)

9
[Link]
 Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

EHU 1er Novembre1954 – Oran - Service de Dr DALI YAHIA Radia BOUOKKAZ Fatima 041 70 51 27 (LD) 041 70 51 27
20 microbiologie

21 Hôpital militaire universitaire d'Oran - Laboratoire Dr BENMAHDI Lahcene BENMAHDI Lahcene 041 58 71 97 041 24 78 82
de microbiologie 041 24 69 61

Hôpital militaire universitaire spécialisé de

22 Pr BENSGHEIR Soufiane BOUKORCHI khelifa 021 39 36 63 021 39 10 10
Staoueli - Alger - Laboratoire central

23 EHS Salim Zemirli - Alger - Laboratoire central Dr DENIA Mohamed HAMIDI Moufida 023 97 14 05 023 97 14 05
Fatih

24 CHU Blida Hôpital Frantz Fanon - Laboratoire Pr CHEKIRI TALBI Mey AZROU Sihem 025 40 49 69 025 40 49 69
central

25 EPH de Rouiba - Alger - Laboratoire central Pr DJENOUHAT Kamal BAGHDADI Imène 023 86 04 40 023 86 04 40

10
[Link]
Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Sommaire

Pages
Préambule 12
Evaluation externe de la qualité 14
Méthodologie 26
Contrôle de qualité de l’antibiogramme 30
Profils de sensibilité et de résistance des bactéries isolées
35
d’hémocultures
Profils de sensibilité et de résistance des bactéries isolées du liquide
49
céphalo-rachidien
Profil de sensibilité et de résistance de S. pneumoniae isolé à partir
59
d’autres prélèvements (LCR exclu)
Profils de sensibilité et de résistance des principales bactéries
67
entériques isolées des coprocultures
Profils de sensibilité et de résistance des bactéries isolées des urines 75
Etat de la résistance aux antibiotiques et surveillance des bactéries
83
multi-résistantes (BMR)

11
[Link]
Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

PREAMBULE
Le fascicule d’évaluation 2019 n’est pas un bon cru, en raison du fait que
l’analyse a été faite par les membres du réseau sur fichiers Whonet alors que
d’habitude le point focal chargé du suivi de la résistance bactérienne à
l’échelon national envoyait aux membres du réseau un questionnaire, qu’ils
étaient chargés de remplir. Ce sont les participants qui avaient choisi ce type
de saisie sur fichiers Whonet. Ce ne fut donc pas une bonne expérience que
nous ne renouvellerons plus. Nous reviendrons au questionnaire.

Vu que les autorités sanitaires de notre pays se sont inscrites dans le système
mondial de surveillance de la résistance bactériennes aux antibiotiques, intitulé
« GLASS » (Global Antimicrobial Resistance Surveillance System), la saisie de
nos données dans ce système global se fera à partir de 2021. Ainsi les données
algériennes sur la résistance aux antibiotiques deviendront visibles au niveau
de la base de données de l’OMS, et ce à l’instar de nombreux pays.

Les prélèvements des voies respiratoires basses, du liquide pleural, des

prélèvements ORL, du liquide synovial, du liquide de dialyse péritonéale, du
liquide d’ascite et des pus abdominaux n’ont pas été exploités dans notre
rapport en raison de résultats négatifs ou non probants. Désormais, nous
traiterons particulièrement, les germes isolés des prélèvements suivants traités
par plusieurs réseaux dans le monde : LCR, hémocultures, urines et
coprocultures.
Les 21 et 22 octobre 2019, les membres du réseau ont participé à un atelier de
mise à niveau sur le logiciel WHONET pour la collecte et l’analyse des données
de la surveillance de la résistance bactérienne aux antibiotiques, atelier dirigé
par le Dr John Stelling initiateur de ce logiciel invité par l’OMS Algérie et par
l’Institut Pasteur d’Algérie.

Pr [Link]
Coordinatrice du réseau

12
[Link]
Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

IPA- CHU Mustapha- HCA- CHU BEO- CHU Béni-Messous - EHS Maouche- INSP- CHU
[Link]- EPH Birtraria- EHS CPMC- EHS El Hadi Flici- EPH Bologhine- HMUS Staouéli –
EHS Zemirli – EPH Rouiba

CHU Tizi Ouzou

CHU Annaba
CHU Blida- EPH Boufarik –

CHU Oran- HMUR Oran CHU Constantine

EHU ORAN CHU Sétif

CHU Batna

Situation géographique des laboratoires médicaux membres du réseau AARN (année 2019)

IPA Institut Pasteur d’Algérie INSP Institut National de Santé Publique

CHU Centre Hospitalo-Universitaire CPMC Centre Pierre et Marie Curie
HCA Hôpital Central de l’Armée HMUS Hôpital Militaire Universitaire Spécialisé
EHS Etablissement Hospitalier Spécialisé HMUR Hôpital Militaire Universitaire Régional
EPH Etablissement Public Hospitalier EHU Etablissement Hospitalo-Universitaire

13
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Evaluation externe de la qualité

Pr K. Rahal et Dr S. Bouheraoua

14
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

- Nous avons informé les membres du réseau que 03 souches lyophilisées

bactériennes concernant l’évaluation externe de la qualité étaient mises à leur
disposition et qu’ils devaient venir les réceptionner.
 La tranche de distribution des souches selon le jour de déplacement des
membres du réseau s’est étalée du 01/12/2020 au 15/12/2020.
 La réception des résultats par le laboratoire s’est étalée du 31/12/2020 au
10/03/2021.

- Le nombre total de laboratoires concernés est de 26.

Le laboratoire du CHU de Sétif n’a ni réceptionné les souches, ni donné par
conséquent de résultat.

- Trois laboratoires nouvellement membres du réseau ont participé à l’évaluation

externe de la qualité sans avoir encore envoyé de données. Ils participeront
pleinement en 2020-2021.

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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

I) DIAGNOSTIC BACTERIOLOGIQUE PRECIS DE LA SOUCHE QCE / I 22 :

QCE / I 22 Bacteroides fragilis
• Réponses exactes : 2 7.69 %
• Réponses inexactes : 14
• Pas de réponse : 10

II) IDENTIFICATION, LECTURE ET INTERPRETATION DE L’ANTIBIOGRAMME DE

QCE / A 41 :

QCE / A41 : Escherichia coli Colistine Résistant

Antibiogramme :
Ampicilline : R
Amoxicilline + Ac. clavulanique : S
Aztreonam : S
Céfazoline : S
Céfoxitine : S
Céfotaxime : S
Ertapénème : S
Méropénème : S
Colistine : R
Gentamicine : R
Amikacine : S
Acide nalidixique : R
Ciprofloxacine : R
Chloramphénicol : R
Cotrimoxazole : R
Fosfomycine : S
Nitrofurantoïne : S

Colistine R : CMI en milieu liquide : 8µg/ml

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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

a) Identification de la souche :
• Réponses correctes : 25 96.15 %
• Réponse incorrecte : 1

b) Liste des antibiotiques testés en conformité avec la liste proposée dans le

fascicule standardisation 2020 :
• Liste conforme : 10 38.46 %
• Liste non conforme : 16

c) Résultats des antibiogrammes sur 10 antibiogrammes ayant une liste

d’antibiotiques conforme.
• Antibiogrammes exacts : 1 10 %
• Antibiogrammes non conformes : 9

d) Mécanisme de résistance décelé par 12 laboratoires ayant déterminé la CMI

de la colistine.
CMI en milieu de Mueller Hinton liquide : 8µg/ml

• Résultat correct : 9 75 %
• Résultat incorrect : 3

17
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

III) IDENTIFICATION, LECTURE ET INTERPRETATION DE L’ANTIBIOGRAMME

DE QCE / A 42

QCE / A 42 : Enterococcus gallinarum

Antibiogramme :
Ampicilline : S CMI 1 µg/ml
(disque, ou CMI, ou E test)

Gentamicine 120 µg : S
Streptomycine 300 µg : R
Erythromycine : R
Quinupristine/Dalfopristine : S
Furanes : S
Teicoplanine : R
Vancomycine : R
Ciprofloxacine : S
Lévofloxacine : S
Rifampicine : R
Fosfomycine : I
Chloramphénicol : S
Tigécycline : S CMI 0,25 µg/ml

Vancomycine128 µg/ml VAN C

Teicoplanine 32 µg/ml

a) Identification de la souche
 Réponses correctes : 12 46,15%
 Réponses incomplètes : 3
 Réponses incorrectes : 11

b) Liste des antibiotiques testés en conformité avec la liste proposée dans le

fascicule standardisation 2020.
• Liste conforme : 6 50%
• Liste non conforme : 6

18
[Link]
Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

c) Résultats des antibiogrammes sur les 6 antibiogrammes ayant une liste

d’antibiotiques conforme.
• Lecture correcte : 3 50%
• Lecture incorrecte : 3

d) Mécanisme de résistance aux glycopeptides sur 12 réponses correctes en ce

qui concerne l’identification.

• Réponse correcte : 1 8.33 %

• Réponses incorrectes : 11

Conclusion :
En raison du fait qu’il y a des discordances entre les interprétations des
antibiogrammes des différents laboratoires et celles des antibiogrammes du
laboratoire de référence, nous concluons que la meilleure technique d’évaluation de la
sensibilité aux antibiotiques est la CMI, plus précise.
De plus la détermination de la CMI permet aux cliniciens d’adapter les posologies des
antibiotiques prescrits pour le traitement des patients.

19
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Correction de l’évaluation
externe de la qualité

20
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Contrôle de qualité externe

Identification : Souche N° QCE / I 22

1- DIAGNOSTIC BACTERIOLOGIQUE PRECIS

Bacteroides fragilis

2- Précisez les examens directs effectués.

Coloration de Gram : Bacille à Gram négatif

3- Précisez les milieux de culture utilisés.

- Culture positive sur colombia au sang frais en anaérobiose

- Culture négative sur colombia au sang frais en atmosphère aérobie

4- Galerie d’identification

Catalase (+) Oxydase (-)

Galerie : Api 20A

Profil : 46544240

21
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Contrôle de qualité externe

Antibiogramme : Souche QCE / N° A41

Nom / Prénom :

Laboratoire :

Technique utilisée : Diffusion ; inoculum 0,5 MF ; ensemencement par écouvillon.

Fournisseur du milieu M.H. : OXOID.

Fournisseur des disques d’antibiotiques : OXOID, BIORAD.

Interprétation (break-points : CLSI, EUCAST, ...) : CLSI 2020 (M100-S30).

Identification de la souche envoyée : Escherichia coli

Antibiotiques Charge  (mm) Interprétation CMI µg/ml

Ampicilline 10 µg 6 R

Amoxicilline + Acide clavulanique 20 µg + 10 µg 18 S

Aztréonam 30 µg 35 S

Céfazoline 30 µg 24 S

Céfoxitine 30 µg 22 S

Céfotaxime 30 µg 35 S

Imipénème 10 µg 30 S

Ertapénème 10 µg 34 S

Méropénème 10 µg 33 S

Amikacine 30 µg 24 S

Gentamicine 10 µg 12 R

22
[Link]
Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Acide nalidixique 30 µg 6 R

Ciprofloxacine 5 µg 6 R

Colistine / / R 8

Chloramphénicol 30 µg 6 R

Furanes 300 µg 29 S

Triméthoprime/Sulfaméthoxazole 1.25+23.75 µg 6 R

Fosfomycine 200 µg 30 S

Autres tests Résultats

CMI liquide pour la colistine CMI (colistine) = 8 mg/l

Souche de référence : ATCC E. Coli 25922 = 2 mg/l

Commentaire : Escherichia coli résistant à la colistine.

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[Link]
Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Contrôle de qualité externe

Antibiogramme : Souche QCE / N° A42

Nom / Prénom :

Laboratoire :

Technique utilisée : Diffusion ; inoculum 0,5 MF ; ensemencement par écouvillon.

Fournisseur du milieu M.H. : OXOID.

Fournisseur des disques d’antibiotiques : OXOID, BIORAD.

Interprétation (break-points : CLSI, EUCAST, ...) : CLSI 2020 (M100-S30).

Identification de la souche envoyée : Enterococcus gallinarum

Antibiotiques Charge  (mm) Interprétation CMI µg/ml

Ampicilline 10 µg / S 1

Gentamicine 120 µg 26 S

Streptomycine 300 µg 6 R

Erythromycine 15 µg 6 R

Quinupristin/Dalfopristin 15 µg 20 S

Nitrofurantoïne 300 µg 30 S

Tétracycline 30 µg 6 R

Vancomycine 30 µg 6 R 128

Teicoplanine 30 µg 15 R 32

Ciprofloxacine 5 µg 23 S

Lévofloxacine 5 µg 23 S

Rifampicine 5 µg 13 R

24
[Link]
Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Fosfomycine 200 µg 14 I

Chloramphénicol 30 µg 30 S

Tigécycline / / S 0.25

Autres tests Résultat :

PCR gène VAN PCR VAN C positive

Commentaire : Enterococcus gallinarum présente une résistance naturelle à la vancomycine.

25
[Link]
Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Méthodologie

Dr H. Ammari, Dr M.F.K. Missoum

et Pr A. Benslimani

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[Link]
Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

1. Contrôle de qualité de l’antibiogramme

L’analyse des résultats du contrôle de qualité (CQ) de l’antibiogramme a été faite à

partir des fichiers Whonet envoyés par les différents laboratoires membres du réseau,
en utilisant le logiciel WHONET 5.6.

La validation des données de l’antibiogramme a été faite à travers l’analyse des

résultats obtenus avec les souches de référence E. coli ATCC 25922, S. aureus ATCC
25923 et P. aeruginosa ATCC 27853

La période d’étude s’est étalée du 01 janvier au 31 décembre 2019.

a. Critères d’inclusion : tous les laboratoires ayant envoyé leurs fichiers dans les délais
impartis ont été inclus dans l’analyse.

b. Critères d’exclusion :

- contrôle de qualité interne (CQ) insuffisant (nombre total de tests < 30 par souche
ATCC et par molécule antibiotique correspondante).

- pourcentage de conformité insuffisant (<80%). Nous rappelons que les tests de CQ

sont considérés comme conformes lorsque les diamètres obtenus sont compris dans
l’intervalle des diamètres critiques plus ou moins 2 mm.

- antibiotiques ou des charges d’antibiotiques autres que ceux prévus dans les
recommandations du fascicule de standardisation.

2. Etiologies bactériennes

Afin d’éviter les erreurs de transcription, l’étude des étiologies bactériennes a été faite
par les différents membres du comité de rédaction directement à partir des fichiers
Whonet des différents laboratoires membres du réseau ayant remis leurs fichiers dans
les délais.

27
[Link]
Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

3. Etude de la sensibilité et de la résistance aux antibiotiques

De même que pour les étiologies bactériennes, et pour les mêmes raisons,
l’exploitation des données de sensibilité aux antibiotiques des différentes espèces
bactériennes a été faite par les membres du comité de rédaction directement à partir
des fichiers Whonet des différents laboratoires membres du réseau ayant remis leurs
fichiers dans les délais.

a. critères d’inclusion : tous les laboratoires ayant envoyé leurs fichiers dans les délais
impartis et ayant obtenu des CQ satisfaisants (voir paragraphe contrôle de qualité de
l’antibiogramme) ont été inclus dans l’analyse.

b. critères d’exclusion : ont été exclues des analyses les données des laboratoires
n’ayant pas fourni des CQ satisfaisants (voir paragraphe contrôle de qualité de
l’antibiogramme) ou n’ayant pas testé les molécules antibiotiques recommandées pour
chaque groupe de bactéries dans le fascicule de standardisation.

4. Etude des bactéries multi-résistantes (BMR)

a. critères d’inclusion : tous les laboratoires ayant envoyé leurs fichiers dans les délais
impartis ont été inclus dans l’analyse.

b. critères d’exclusion :

- entérobactéries BLSE+ : les données ont été exclues de l’analyse lorsque le

laboratoire participant avait obtenu un CQ non satisfaisant (<30 tests ou > 30 tests
mais pourcentage de conformité < 80%) avec E. coli ATCC 25922 vis-à-vis de CTX
et/ou AMC.

- entérobactéries résistantes ou intermédiaires à l’IPM : les données ont été exclues

de l’analyse lorsque le laboratoire participant avait obtenu un CQ non satisfaisant (<30
tests ou > 30 tests mais pourcentage de conformité < 80%) avec E. coli ATCC 25922
vis-à-vis de IPM.

28
[Link]
Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

- SARM : les données ont été exclues de l’analyse lorsque le laboratoire participant
avait obtenu un CQ non satisfaisant (<30 tests ou > 30 tests mais pourcentage de
conformité < 80%) avec S. aureus ATCC 25923 vis-à-vis de FOX.

- Acinetobacter spp. IPM R : les données ont été exclues de l’analyse lorsque le
laboratoire participant avait obtenu un CQ non satisfaisant (<30 tests ou > 30 tests
mais pourcentage de conformité < 80%) avec P. aeruginosa ATCC 27853 vis-à-vis de
IPM.

- P .aeruginosa IPM R, P. aeruginosa CAZ R et P. aeruginosa CIP R : les données ont

été exclues de l’analyse lorsque le laboratoire participant avait obtenu un CQ non
satisfaisant (<30 tests ou > 30 tests mais pourcentage de conformité < 80%) avec P.
aeruginosa ATCC 27853 vis-à-vis de IPM, CAZ et CIP.

- Enterococcus faecalis et Enterococcus faecium résistants ou intermédiaires à la

vancomycine: les données ont été exclues de l’analyse lorsque le laboratoire
participant avait obtenu un CQ non satisfaisant (<30 tests ou > 30 tests mais
pourcentage de conformité < 80%) avec S. aureus ATCC 25923 vis-à-vis de VAN.

29
[Link]
Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Contrôle de qualité de l’antibiogramme

Dr M.F.K. Missoum, Dr H. Ammari et Pr H. Tali Maamar

30
[Link]
Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Le contrôle de qualité interne permet d’assurer l'évaluation continue de la

reproductibilité des résultats, de garantir la performance des réactifs et du personnel
technique, ainsi seul garant de la fiabilité des résultats des tests de sensibilité aux
antibiotiques.

La validation des résultats de l’année 2019, comme pour l’année précédente, a été
conditionnée de manière consensuelle par l’obligation faite pour chaque laboratoire
membre d’effectuer au moins 30 tests de CQ pour voir ses résultats retenus pour
l’analyse.

Nous notons que, comme pour l’année précédente, plusieurs laboratoires ont effectué
moins de 30 tests de CQ par souche ATCC, leurs résultats des tests de sensibilité vis-
à-vis des souches de référence ou des molécules correspondantes n’ont donc pas été
validés et donc non retenus pour l’analyse de cette année.

Egalement, comme pour l’année précédente la majorité des molécules n’ont pas été
retenues, non du fait de diamètres non conformes (la majorité des tests de CQ
effectués par l’ensemble des laboratoires membres sont conformes à quelques
exceptions près) mais plutôt du fait du nombre insuffisant de tests de CQ (< 30 tests).

1 - Liste des antibiotiques à tester par souche de référence

Le contrôle de qualité interne pour les laboratoires médicaux a porté sur les molécules
répertoriées dans le tableau (1).

31
[Link]
 Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab1 : Liste des antibiotiques à tester par souche de référence

[Link] S. aureus [Link] [Link] H. influenzae

ATCC 25922 ATCC 25923 ATCC 27853 ATCC 49619 ATCC 49247
Ampicilline (10µg) Pénicilline G (10UI) Ticarcilline (75µg) Oxacilline (1µg) Ampicilline (10µg)
Amoxicilline+ Céfoxitine (30µg) Amoxicilline + Acide
Ticarcilline + Acide clavulanique Erythromycine (15µg)
Acide clavulanique (20 µg +10µg) Kanamycine (30µg) clavulanique
(75µg/10µg) Clindamycine (2µg)
Céfazoline (30µg) Gentamicine (10µg) (20 µg +10µg)
Pipéracilline (100µg) Chloramphénicol (30µg)
Céfalotine (30µg) Amikacine (30µg) Céfotaxime (30µg)
Ceftazidime (30µg) Rifampicine (5µg)
Céfoxitine (30µg) Erythromycine (15µg) Tétracycline (30µg)
Céfotaxime (30µg) Clindamycine (2µg) Aztréonam (30µg) Triméthoprime + Azithromycine (15µg)
Ceftazidime (30µg) Pristinamycine (15µg) / Imipénème (10µg) Sulfaméthoxazole Acide nalidixique (30µg)
Aztréonam (30µg) Quinupristine-Dalfopristine (15µg) Amikacine (30µg) (1.25/23.75µg) Ciprofloxacine (5µg)
Imipénème (10µg) Ofloxacine (15µg) Vancomycine (30µg) Chloramphénicol (30µg)
Gentamicine (10µg)
Ertapénème (10µg) Ciprofloxacine (5µg) Triméthoprime +
Tobramycine (10µg) Lévofloxacine (5µg)
Gentamicine (10µg) Lévofloxacine (5µg) sulfaméthoxazole
Nétilmicine (30µg) Doxycycline (30µg)
Amikacine (30µg) Chloramphénicol (30µg) (1.25/23.75µg)
Pristinamycine (15µg) /
Acide nalidixique (30µg) Vancomycine (30µg) Ciprofloxacine (5µg) Rifampicine (5µg)
Ciprofloxacine (5µg) Teicoplanine (30µg) Quinupristine- Dalfopristine
Lévofloxacine (5µg)
Chloramphénicol (30µg) Rifampicine (5µg) (15µg)
Colistine (10µg)
Nitrofurantoïne (300µg) Triméthoprime Fosfomycine (50µg)
Triméthoprime +Sulfaméthoxazole (1.25/23.75µg) Gémifloxacine (5µg)
+Sulfaméthoxazole (1.25/23.75µg) Tétracycline (30µg)
Fosfomycine (200µg) Acide fusidique (10 µg)

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[Link]
Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

2 - Laboratoires non retenus pour l’analyse

Pour cette année (2019), sur l’ensemble des laboratoires médicaux membres du réseau
AARN répartis sur le territoire national, 20 laboratoires membres ont remis leurs résultats de
CQ, contre 21 laboratoires pour l’année précédente (2018).

3 - Laboratoires retenus pour l’analyse

CHU Mustapha Bacha INSP IPA Dely Ibrahim

CHU Béni Messous EHS EL Hadi Flici CHU Batna
CHU Bab El Oued CHU Hussein Dey CHU Blida
E.H.S. Dr Maouche HCA CHU Constantine
EHS CPMC EPH Bologhine CHU Oran
CHU Annaba * CHU Tizi ouzou EHU Oran
EHS Zemirli Clinique Hassiba Ben Bouali

* les résultats CQ pour [Link] ATCC 27853 n’ont pas été remis, en conséquence, les
résultats vis-à-vis de cette souche n’ont pas été retenus pour l’analyse.

4 - Résultats et remarques

Pour l’ensemble des laboratoires retenus pour l’analyse, de même que pour les résultats de
l’année précédente (2018), que ce soit pour E. coli ATCC 25922, S. aureus ATCC 25923 ou
pour P. aeruginosa ATCC 27853, les nombres de tests par molécule antibiotique sont toujours
sensiblement les mêmes vis-à-vis de chaque souche ATCC testée et ceci pour chaque
laboratoire. Nous avons également constaté la persistance des faits signalés l’année
précédente, à savoir :
 Le nombre de molécules exclues du fait de leur non-conformité est restreint.
 Pour un nombre non négligeable de laboratoires, l’envoi des fichiers CQ au de-là des
délais fixés.

 Un laboratoire membre n’a pas remis les résultats CQ pour P. aeruginosa ATCC
27853, en conséquence, ses résultats vis-à-vis de cette souche n’ont pas été retenus
pour l’analyse.

D’où la nécessité de la validation par le référent pour chaque laboratoire avant l’envoi des
données.
- Pour S. pneumoniae ATCC 49619, 06 laboratoires médicaux ont pratiqué des tests de CQ :

l’IPA Dely Ibrahim, CHU Mustapha Bacha, , CHU Blida, HCA, EHS El Kettar et EPH Boufarik.

Le nombre de laboratoires qui effectuent ces tests reste toujours insuffisant.

- Pour H. influenzae ATCC 49247, seul le laboratoire de l’IPA Dely Ibrahim a effectué des
tests de CQ vis à vis de cette souche de référence.

Pour cette souche, rappelons une nouvelle fois que des efforts doivent être fournis pour
améliorer les résultats (augmentation du nombre de tests, disponibilité du milieu HTM).

33
[Link]
Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tableau 2: Laboratoires ayant effectué moins de 30 tests de CQ par souche de

référence

S. aureus ATCC 25923 E. coli ATCC 25922 P. aeruginosa ATCC 27853

HCA X
CHU Batna X X X
CHU Annaba X X
CHU Tizi Ouzou X
EHU Bologhine X X X
CHU Hussein Dey X

5 - Recommandations

Nous rappelons que les anomalies doivent être signalées lors des évaluations annuelles. Il
faut saisir les données dans les fichiers mensuels au fur et à mesure, en même temps que les
données de l’antibiogramme.
Les recommandations des années précédentes restent de mise, à savoir :
 mettre en place un système de traçabilité pour l’identification du personnel
technique lors de la saisie afin de tester leur performance.
 responsabiliser un membre de l’équipe technique du laboratoire qui sera chargé
de veiller à la conservation et l’entretien des souches de référence.
 aliquoter les souches de référence selon la procédure recommandée.
 retirer de toutes les paillasses les souches de référence dont les résultats de
CQ ne sont pas satisfaisants.
 veiller à respecter la durée de validité de l’étalon Mc Farland et contrôler
régulièrement sa turbidité, vérifier également l’étalonnage des densitomètres.
 changer les souches de référence au début de chaque mois et travailler avec
des cultures de 18 h.
 conserver correctement les cartouches de disques d’antibiotiques.

 mesurer correctement les zones d’inhibition.

 tenir compte des diamètres d’inhibition.

 superviser les opérations de saisie des résultats de contrôle par le partenaire

membre du réseau.

Veiller à détecter en temps réel l’anomalie constatée au niveau d’un test de CQ

effectué, afin d’apporter une action corrective en tenant compte de l’algorithme
recommandé dans le fascicule de standardisation.

34
[Link]
Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Profils de sensibilité et de résistance des

bactéries isolées d’hémocultures
Pr. S. Mahrane
.

35
[Link]
Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

1-Introduction
Dans ce chapitre, nous nous sommes intéressées à l’analyse des données concernant les
espèces bactériennes isolées des hémocultures et leurs profils de sensibilité aux
antibiotiques. Ces données ont été collectées à partir des fichiers de saisie des laboratoires
concernant la période allant de janvier à décembre 2019.

2-Objectifs
-Déterminer les espèces bactériennes isolées des hémocultures.
-Déterminer le taux de résistance aux antibiotiques des bactéries isolées des hémocultures en
milieu hospitalier.
-Déterminer le taux des différents marqueurs de résistance (BMR) des bactéries isolées des
hémocultures.

3- Commentaires généraux :
- Le nombre total d’isolats en 2019 est de 2806. Ce nombre est comparable à celui de l’année
précédente avec 2852 isolats en 2018. Les espèces bactériennes les plus fréquemment
retrouvées sont les suivantes:
Staphylococcus epidermidis (19,39%), Staphylococcus aureus (15,5%) et Klebsiella
pneumoniae (14,79%).
- La non-conformité des contrôles de qualité de l’antibiogramme a causé une déperdition
importante dans les données transmises, réduisant ainsi le nombre d'isolats inclus dans
l’exploitation des données de sensibilité aux antibiotiques.
- Parmi les 2806 souches isolées des hémocultures, 1527 étaient des BMR soit 54,41%.
- Parmi les BMR rapportées en 2019, les entérobactéries résistantes aux céphalosporines de
3ème génération (EBLSE incluses), les EBLSE et les SARM sont les plus fréquentes avec des
taux de 38,63%, 33,8% et 12% respectivement. Les autres BMR sont signalées à des taux
inférieurs à 10%.
- Pour une meilleure approche étiologique, il aurait été souhaitable d’avoir le nombre global
d’hémocultures afin de définir le pourcentage de positivité des cultures.

36
[Link]
Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 3: Nombre et pourcentage des différentes espèces bactériennes isolées des

hémocultures (N= 2806, année 2019)

Espèces Nombre Pourcentage

S. epidermidis 544 19,39
S. aureus 435 15,5
K. pneumoniae 415 14,79
A. baumannii 330 11,76
E. coli 224 7,98
P. aeruginosa 200 7,13
E. cloacae 147 5,24
E. faecalis 99 3,53
S. marcescens 95 3,39
E. faecium 69 2,46
S. saprophyticus 60 2,14
P. mirabilis 51 1,82
Salmonella spp. 36 1,28
S. maltophilia 35 1,25
K. oxytoca 24 0,86
S. pneumoniae 21 0,75
S. agalactiae 9 0,32
H. influenzae non b 4 0,14
Shigella spp. 2 0,07
S. pyogenes 2 0,07
L. monocytogenes 2 0,07
N. meningitidis 1 0,04
M. catarrhalis 1 0,04
Total 2806 100

37
[Link]
 Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Espèces bactériennes

Pourcentages

Fig. 1 : Pourcentage des différentes espèces bactériennes isolés à partir des

hémocultures (N= 2806, année 2019)

38
[Link]
Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 4 : Nombre et pourcentage des Klebsiella pneumoniae

résistantes (R + I) aux antibiotiques isolées d’hémocultures (année 2019)

Antibiotiques Nombre Total Pourcentage

AMC 232 372 62,37
CZO* 277 358 77,37
FOX 62 344 18,02
CTX / CRO 310 404 76,73
CAZ 46 56 82,14
ATM 57 75 76,00
IPM 22 348 6,32
ERT 26 234 11,11
GEN 157 310 50,65
AMK 45 338 13,31
CHL 40 256 15,63
NIT 65 137 47,45
NAL 108 265 40,75
CIP 137 319 42,95
SXT 202 327 61,77
FOS 10 151 6,62

* : La résistance à la céfazoline est habituellement associée à celle de l’amoxicilline+acide

clavulanique. La différence observée pourrait être due à un problème de lecture (valeurs
critiques pour la céfazoline pour les souches isolées des hémocultures). Les taux rapportés
sont à prendre avec précaution.

Fig. 2: Pourcentage des Klebsiella pneumoniae résistantes (R + I) aux

antibiotiques isolées d’hémocultures (année 2019)

39
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 5: Nombre et pourcentage des Escherichia coli

résistants (R + I) aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année 2019)

Antibiotiques Nombre Total Pourcentage

AMP / AMX 131 138 94,92
AMC 114 186 61,29
CZO 101 177 57,06
FOX 29 168 17,26
CTX / CRO 89 208 42,78
CAZ 7 24 FE
ATM 2 15 FE
IPM 2 162 1,23
ERT 1 60 1,66
GEN 56 188 29,78
AMK 4 133 3
CHL 6 36 16,66
NIT 11 77 14,28
NAL 84 159 52,83
CIP 66 148 44,59
SXT 0 95 0
FOS (200) 110 165 66,66

Fig. 3 : Pourcentage des Escherichia coli résistantes (R + I) aux antibiotiques

isolés d’hémocultures (année 2019)

40
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 6: Nombre de Proteus mirabilis résistants (R + I) aux antibiotiques isolés

d’hémocultures (année 2019)

Antibiotiques Nombre Total Pourcentage

AMP / AMX 26 30 86,67
AMC 9 23 FE
CZO 10 22 FE
FOX 2 21 FE
CTX / CRO 11 24 FE
CAZ 1 4 FE
ATM 0 4 FE
IPM* 1 21 FE
ERT 0 18 FE
GEN 12 21 FE
AMK 1 18 FE
CHL 7 14 FE
NAL 10 12 FE
CIP 17 23 FE
SXT 17 21 FE
FOS (200) 2 10 FE

FE : Faible effectif
* Proteus mirabilis a une résistance naturelle de bas niveau à l’imipénème.

41
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 7: Nombre et pourcentage d’Enterobacter cloacae

résistants (R + I) aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année 2019)

Antibiotiques Nombre Total Pourcentage

CTX / CRO 49 112 43,75
CAZ 12 22 FE
ATM 9 19 FE
IPM 3 92 3,26
ERT 3 78 3,85
GEN 19 80 23,75
AMK 4 96 4,17
CHL 17 61 27,87
NIT 17 41 41,46
NAL 22 59 37,29
CIP 25 89 28,09
SXT 41 91 45,05
FOS 5 47 10,64

FE : Faible effectif

Fig. 4: Pourcentage d’Enterobacter cloacae résistants (R + I)

aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année 2019)

42
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 8 : Nombre et pourcentage de Staphylococcus aureus

résistants (R + I) aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année 2019)

Antibiotiques Nombre Total Pourcentage

PEN 279 301 92,69
OXA 192 415 46,27
KAN 123 298 41,28
GEN 47 316 14,87
AMK 46 294 15,65
ERY 119 378 31,48
CLI 43 334 12,87
PRI/QDF 2 72 2,8
VAN (CMI) 0 87 0,00
TEC 0 346 0,00
RIF 29 380 7,63
SXT 20 315 6,35
TCY 110 317 34,70
CHL 5 242 2,07
FUS 6 16 FE
OFX 58 285 20,35
CIP 51 211 24,17
LVX 52 241 21,58
FOS 0 5 FE

Fig. 5 : Pourcentage de Staphylococcus aureus résistants (R + I) aux

antibiotiques isolés d’hémocultures (année 2019)

43
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 9: Nombre et pourcentage de Pseudomonas aeruginosa

résistants (R + I) aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année 2019)

Antibiotiques Nombre Total Pourcentage

TIC 69 133 51,88
TCC 53 105 50,48
PIP 39 137 28,47
CAZ 19 140 13,57
ATM 25 103 24,27
IPM 16 126 12,70
GEN 9 105 8,57
TOB 14 138 10,14
NET 7 74 9,46
AMK 5 106 4,72
CIP 11 118 9,32
LVX 12 99 12,12
COL 2 114 1,75

Fig. 6 : Pourcentage de Pseudomonas aeruginosa résistants (R + I)

aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année 2019)

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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 10 : Répartition des BMR dans les hémocultures (N=1527, année 2019)

Marqueurs de résistance Nombre Pourcentage

Entérobactéries CTX R 590 38,63
EBLSE 515 33,8
SARM 183 12
ABRI 71 4,64
A. baumannii CIP R 59 3,9
Entérobactéries de sensibilité diminuée
54 3,53
aux carbapénèmes (Imipénème R+I)
P. aeruginosa IPM R 17 1,1
P. aeruginosa CAZ R 18 1,1
ERV 11 0,7
P. aeruginosa CIP R 8 0,54
A. baumannii BLSE 1 0,06
P. aeruginosa BLSE 0 0
VISA 0 0
GISA 0 0
Total 1527 100

Abréviations :

EBLSE : entérobactérie productrice de bêta-lactamase à spectre étendu, EPC : entérobactérie

résistante aux carbapénèmes, CTX R : céfotaxime résistant, CS R : colistine résistant, ABRI : A.
baumannii résistant à l’imipénème, CIP R : ciprofloxacine résistant, CAZ R : ceftazidime résistant,
HinPASE : Haemophilus influenzae producteur de pénicillinase, SARM : S. aureus résistant à la
méticilline, VISA : vancomycin intermediate S. aureus, GISA : glycopeptides intermediate S. aureus,
ERV : entérocoque résistant à la vancomycine, PSDP : pneumocoque de sensibilité diminuée aux
pénicillines, BLSE : bêta-lactamase à spectre étendu, IPMR : imipénème résistant.

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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Fig. 7: Répartition des BMR dans les hémocultures (N=1527, année 2019)

Abréviations :
EBLSE : entérobactérie productrice de bêta-lactamase à spectre étendu, EPC :
entérobactérie résistante aux carbapénèmes, CTX R : céfotaxime résistant, ABRI : A.
baumannii résistant à l’imipénème, CIP R : ciprofloxacine résistant, CAZ R : ceftazidime
résistant, SARM : S. aureus résistant à la méticilline, VISA : vancomycin intermediate S.
aureus, GISA : glycopeptides intermediate S. aureus, ERV : entérocoque résistant à la
vancomycine, BLSE : bêta-lactamase à spectre étendu.

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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 11 : Nombre et pourcentage de BMR par espèce bactérienne isolées dans

les hémocultures (année 2019)

Marqueurs de résistance Nombre Pourcentage

ABRI 71/146 48,63

A. baumannii CIP R 59/146 40,41

SARM 183/460 39,78

Entérobactéries CTX R 590/1515 38,94

EBLSE 515/1515 33,99
P. aeruginosa CAZ R 18/155 11,61
P. aeruginosa IPM R 17/155 10,97

ERV 11/136 8,09

P. aeruginosa CIP R 8/155 5,16
Entérobactéries de sensibilité diminuée au
54/1515 3,56
carbapénèmes (Imipénème R+I)
A. baumannii BLSE 1/146 0,68
P. aeruginosa BLSE 0/155 0

VISA 0/460 0
GISA 0/460 0

Abréviations :
EBLSE : entérobactérie productrice de bêta-lactamase à spectre étendu, EPC : entérobactérie
résistante aux carbapénèmes, CTX R : céfotaxime résistant, CS R : colistine résistant, ABRI : A.
baumannii résistant à l’imipénème, CIP R : ciprofloxacine résistant, CAZ R : ceftazidime résistant,
HinPASE : Haemophilus influenzae producteur de pénicillinase, SARM : S. aureus résistant à la
méticilline, VISA : vancomycin intermediate S. aureus, GISA : glycopeptides intermediate S. aureus,
ERV : entérocoque résistant à la vancomycine, PSDP : pneumocoque de sensibilité diminuée aux
pénicillines, BLSE : bêta-lactamase à spectre étendu, IPMR : imipénème résistant.

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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Fig. 8 : Pourcentage des BMR dans les hémocultures (année 2019)

Abréviations :
EBLSE : entérobactérie productrice de bêta-lactamase à spectre étendu, EPC :
entérobactérie résistante aux carbapénèmes, CTX R : céfotaxime résistant, ABRI : A.
baumannii résistant à l’imipénème, CIP R : ciprofloxacine résistant, CAZ R : ceftazidime
résistant, SARM : S. aureus résistant à la méticilline, VISA : vancomycin intermediate S.
aureus, GISA : glycopeptides intermediate S. aureus, ERV : entérocoque résistant à la
vancomycine, BLSE : bêta-lactamase à spectre étendu

48
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Profils de sensibilité et de résistance des

bactéries isolées du liquide céphalo-rachidien

Dr. H. Ammari et Pr. H. Tali Maamar

49
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Introduction

- Dans ce chapitre nous nous sommes intéressées à l’analyse des données

concernant les espèces bactériennes isolées du LCR et leurs profils de sensibilité
aux antibiotiques.
- Nous présenterons dans un premier temps les trois principales espèces bactériennes
responsables de méningites communautaires : Neisseria meningitidis, Streptococcus
pneumoniae et H. influenzae, dans un deuxième temps les autres étiologies
bactériennes.
Tab. 12 : Nombre des isolats bactériens à partir de LCR (année 2019)

L. monocytogenes
H. influenzae non
Espèces

S. pneumoniae

H. influenzae b
N. meningitidis

S. agalactiae
b/non typé
Laboratoires

CHU Mustapha Bacha 0 0 0 0 0 1

CHU Béni-Messous 0 0 0 0 0 2
CHU Bab El Oued 0 2 0 0 0 1
EHS El Hadi Flici 7 16 0 0 0 2
CHU Hussein Dey 3 1 0 0 0 7
HCA 0 1 0 0 0 0

CHU Constantine 1 2 0 0 0 0
CHU Batna 0 5 1 0 0 0
CHU Blida 1 2 0 0 0 0
CHU Oran 0 2 0 0 0 0
CHU Annaba 0 0 0 0 1 1
CHU Tizi Ouzou 0 5 0 1 0 1
EHU Oran 0 3 0 0 0 0
EHS Zemirli 0 3 0 0 0 0
EPH Boufarik 2 9 0 0 0 0
Total 14 51 1 1 1 15
IPA* 6 19 0 0 2 0
Total général 20 70 1 1 3 15

* L‘IPA étant un laboratoire de référence, ses résultats sont présentés séparément.

50
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab.13 : Répartition des isolats de N. meningitidis par sérogroupe (année 2019)

Non
Sérogroupe A B C W Y Total
précisé
Réseau 0 1 0 10 1 2 14
IPA 0 1 0 0 5 0 6
Total 0 2 0 10 6 2 20

Tab. 14: Répartition des souches de N. meningitidis par sérogroupe et par tranches
d’âges (Résultats du réseau, année 2019)

Sérogroupe Non
A B C W Y précisé Total
Age

0-23 mois 0 0 0 0 1 1 2

24- 59 mois 0 0 0 0 0 0 0

5 ans-15 ans 0 0 0 2 0 0 2

16 ans – 20 ans 0 0 0 0 0 0 0

21 ans- 25 ans 0 0 0 1 0 0 1

26 ans- 30 ans 0 0 0 0 0 0 0

31 ans - 35 ans 0 1 0 2 0 0 3

36 ans - 40 ans 0 0 0 1 0 0 1

41 ans – 45 ans 0 0 0 0 0 0 0

46 ans - 55 ans 0 0 0 1 0 0 1

56 ans - 65 ans 0 0 0 0 0 0 0

>65 ans 0 0 0 0 0 0 0

Non précisé 0 0 0 3 0 1 4

TOTAL 0 1 0 10 1 2 14

51
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 15: Répartition des souches de N. meningitidis par sérogroupe et par tranches
d’âges (Résultats de l’IPA, année 2019)

Sérogroupe

Age A B C W Y Total

0-23 mois 0 0 0 0 1 1

24- 59 mois 0 0 0 0 0 0

5 ans-15 ans 0 0 0 0 0 0

16 ans – 20 ans 0 0 0 0 0 0

21 ans- 25 ans 0 0 0 0 1 1

26 ans- 30 ans 0 0 0 0 0 0

31 ans - 35 ans 0 0 0 0 0 0

36 ans - 40 ans 0 0 0 0 1 1

41 ans – 45 ans 0 0 0 0 0 0

46 ans - 55 ans 0 0 0 0 0 0

56 ans - 65 ans 0 0 0 0 0 0

>65 ans 0 0 0 0 0 0

Non précisé 0 1 0 0 2 3

TOTAL 0 1 0 0 5 6

52
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 16 : Nombre de Neisseria meningitidis sensibles et résistants aux

antibiotique (Résultats du réseau, année 2019)

Antibiotique Résistant Intermédiaire Sensible

PEN (CMI) 0/1 1/1 0/1

AMP (CMI) 0/1 0/1 1/1
CTX 2/5 0/5 3/5
CRO 0/1 0/1 1/1
CHL 0/3 0/3 3/3
RIF 0/4 0/4 4/4
CIP 1/3 0/3 2/3
AZM 0/3 0/3 3/3

Nous constatons le faible nombre d’ATCC communiqué par les membres du réseau.

Abréviations : PEN (pénicilline), AMP (ampicilline), CTX (céfotaxime), CRO (céftriaxone), CHL
(chloramphénicol), RIF (rifampicine), CIP (ciprofloxacine), AZM (azithromycine).

Tab. 17 : Nombre de N. meningitidis sensibles et résistants aux antibiotiques

(Résultats de l’IPA, année 2019)

Antibiotique Résistant Intermédiaire Sensible

PEN (CMI) 0/6 4/6 2/6

AMP (CMI) 0/6 3/6 3/6
CTX / CRO 0/6 0/6 6/6
CHL(CMI) 0/6 0/6 6/6
RIF (CMI) 0/6 0/6 6/6
CIP (CMI) 0/6 0/6 6/6
AZM (CMI) NT NT NT

Abréviations : PEN (pénicilline), AMP (ampicilline), CTX (céfotaxime), CRO (céftriaxone), CHL
(chloramphénicol), RIF (rifampicine), CIP (ciprofloxacine), AZM (azithromycine).

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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 18: Répartition des souches de S. pneumoniae par tranches d’âges dans le LCR
(année 2019)

Nombre de souches
Age
Réseau IPA

0-23 mois 5 2

24- 59 mois 1 1

5 ans-15 ans 8 2

16 ans – 20 ans 4 1

21 ans- 25 ans 0 1

26 ans- 30 ans 0 0

31 ans - 35 ans 2 0

36 ans - 40 ans 4 0

41 ans – 45 ans 3 0

46 ans - 55 ans 3 3

56 ans - 65 ans 2 3

>65 ans 5 2

Non précisé 14 4

TOTAL 51 19

54
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 19 : Nombre et pourcentage* de résistance et de sensibilité

de S. pneumoniae aux antibiotiques dans le LCR (année 2019)

Réseau IPA
Antibiotiques R I S R I S
24/33 0/33 7/33
PEN (CMI) 14/19 0/19 5/19
(72,7%) (0%) (27,3%)
5/34 28/34
CTX (CMI) 1/34 (3%) 3/19 3/19 13/19
(14,7%) (82,3%)
1/30 5/30
IPM (CMI) 24/30 (80%) 2/19 3/19 14/19
(3,3%) (16,7%)
9/34 1/34
ERY 24/34 (80%) 8/19 0/19 11/19
(17%) (3%)
7/40 0/40 33/40
CLI 8/19 0/19 11/19
(17,5%) (0%) (82,5%)
QDA 0/3 0/3 3/3 NT NT NT
0/32
CHL 1/32 (3%) 31/32 (97%) 0/19 0/19 19/19
(0%)
1/34
RIF 0/34 (0%) 33/34 (97%) 0/19 0/19 19/19
(3%)
SXT 3/22 2/22 17/22 NT NT NT
0/44 44/44
VAN 0/44 (0%) 0/19 0/19 19/19
(0%) (100%)
LVX 0/25 0/25 25/25 0/19 0/19 19/19
DOX 0/10 0/10 10/10 0/19 0/19 19/19
FOS (50µg) 0/1 0/1 1/1 NT NT NT
GEM NT NT NT NT NT NT

Abréviations : PEN (pénicilline), CTX (céfotaxime), IPM (imipénème), ERY (érythromycine), CLI
(clindamycine), QDA (quinupristine- dalfopristine), CHL (chloramphénicol), RIF (rifampicine), SXT
(cotrimoxazole), VAN (vancomycine), LVX (lévofloxacine), DOX (doxycycline), FOS (fosfomycine),
GEM (gémifloxacine), CMI (concentration minimale inhibitrice), R (résistant), I (intermédiaire), S
(sensible), NT (non testé).

* Les pourcentages ne sont pas calculés pour des effectifs inférieurs à 30.

NT : non testé

Tab. 20: Distribution des valeurs de CMI vis-à-vis de la Pénicilline G

pour S. pneumoniae dans le LCR (année 2019)

Nombre de souches
CMI (mg/L)
Réseau IPA
≤ 0,016 4 4
[0,032 - 0,125 [ 7 1
[0,125 - 0,25 [ 5 3
[0,25 - 0,5 [ 6 4
[0,5 – 1 [ 1 4
[1 – 2 [ 6 1
[2 – 4 [ 3 2
[4 – 8 [ 1 0
[8 – 16 [ 0 0
≥ 16 0 0
Total 33 19

55
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 21: Nombre de CMI déterminées par laboratoire pour S. pneumoniae

isolé à partir de LCR (année 2019)

Laboratoires Nombre de souches Nombre de CMI

isolées Pénicilline G Céfotaxime Imipénème
CHU Bab El Oued 2 0 0 0
EHS El Hadi Flici 16 16 16 14
CHU Hussein Dey 1 0 1 1
HCA 1 1 1 1
CHU Constantine 2 0 0 0
CHU Batna 5 2 3 2
CHU Blida 2 0 0 2
CHU Oran 2 2 1 2
CHU Tizi Ouzou 5 0 0 0
EHS Zemirli 3 3 3 1
EHU Oran 3 3 3 3
EPH Boufarik 9 6 6 4
Total 51 33 34 30

IPA 19 19 19 19

TOTAL GENERAL 70 52 53 49

56
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 22: Sérotypes de S. pneumoniae dans le LCR (Données de l’IPA, année 2019)

Sérotype Nombre de souches

Type 3 1
Type 9V 2
Type 4 1
Type 15A 1
Type 15F 1
Type 17F 1
Type 19C 1
Type 19F 2
Type 19A 1
Type 14 1
Type 18C 1
Type 23F 1
Type 20 1
Type 22F 1
Type 33F 1
Type 34 1
Type 38 1
Total 19

Remarque : Les sérotypes vaccinaux couverts par les vaccins conjugués sont en
gras dans le tableau.

57
[Link]/aarn
 Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 23: Répartition des bactéries (autres que N. meningitidis, S.

pneumoniae, H. influenzae, S. agalactiae et L. monocytogenes) isolées de
LCR (année 2019)

Espèces Nombre Pourcentage

K. pneumoniae 52 17
K. oxytoca 1 0,3
E. coli 28 9
Salmonella spp. 11 3,5
E. cloacae 21 7
S. marcescens 6 2
P. aeruginosa 79 26
A. baumannii 51 16,5
S. aureus 27 8,7
S. epidermidis 19 6
E. faecalis 5 1,6
E. faecium 6 2
S. pyogenes 1 0,4
Totaux 307 100
Espèces bactériennes

Pourcentage

Fig. 9: Pourcentages des bactéries (autres que N. meningitidis, S.

pneumoniae, H. influenzae, S. agalactiae et L. monocytogenes)
isolées du LCR (N= 307, année 2019)

58
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Profils de sensibilité et de résistance de

S. pneumoniae isolé à partir d’autres
prélèvements (LCR exclu)

Dr. H. Ammari et Pr. H. Tali Maamar

59
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Introduction

Ce chapitre s’intéresse à Streptococcus pneumoniae isolé d’autres prélèvements que le

LCR. Nous rapportons les différents types de prélèvements retrouvés ainsi que les
sensibilités et les résistances globales aux antibiotiques testés (données de l’antibiogramme
par méthode de diffusion et CMI).

Nous notons le faible nombre de souches sérotypées.

Tab. 24 : Nombre des isolats de S. pneumoniae (LCR exclu) par laboratoire

(année 2019)

Nombre de souches
Laboratoires
de S. pneumoniae
CHU Mustapha Bacha 6
CHU Béni-Messous 14
CHU Bab El Oued 1
EHS El Hadi Flici 5
EHS CPMC 2
EHS Dr Maouche 1
CHU Hussein Dey 9
CHU Tizi Ouzou 1
HCA 10
CHU Constantine 6
CHU Batna 6
CHU Blida 15
CHU Annaba 10
EPH Bologhine 26
EPH Boufarik 2
CHU Oran 2
EHS Zemirli 3
Total 119
IPA* 12
Total général 131

* L’IPA étant laboratoire de référence, ses résultats sont présentés séparément.

60
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 25: Répartition des souches de S. pneumoniae par type de prélèvement (LCR
exclu) (année 2019)

Nombre de souches
Type de prélèvement
Réseau IPA
Oreille 10 0
Naso-pharyngé 4 1
Expectoration 20 4
Bronchique 13 0
Aspiration trachéale 5 0
Prélèvement distal protégé 5 0
Liquide pleural 9 0
Hémoculture 20 5
Suppurations 17 1
Autres 11 1
Non précisé 5 0
Total 119 12
Nombre

Prélèvements

Fig. 10: Répartition des souches de S. pneumoniae par type de prélèvement

(LCR exclu) (Résultats du réseau, année 2019)

Autres : Liquide abdominal, bile, liquide de dialyse péritonéale, prélèvement de gorge,

prélèvement buccal, kyste, pus cérébral, cathéter, urine

61
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 26: Répartition par tranches d’âges des souches de S. pneumoniae

isolées à partir des prélèvements autres que le LCR (année 2019)

Nombre de souches
Age
Réseau IPA
0-23 mois 14 1

24- 59 mois 5 0

5 ans-15 ans 22 1

16 ans – 20 ans 3 0

21 ans- 25 ans 1 0

26 ans- 30 ans 2 0

31 ans - 35 ans 1 0

36 ans - 40 ans 3 1

41 ans – 45 ans 2 0

46 ans - 55 ans 7 2

56 ans - 65 ans 11 4

>65 ans 9 1

Non précisé 39 2

TOTAL 119 12

Fig. 11: Répartition des souches de S. pneumoniae par catégories d’âges dans
les prélèvements autres que le LCR (Résultats du réseau, année 2019)

62
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 27 : Nombre et pourcentage* de résistance et de sensibilité de

[Link] aux antibiotiques dans les prélèvements autres que le LCR
(année 2019)

Réseau IPA
Antibiotiques R I S R I S

PEN (CMI)
16/66 29/66 21/66
Orale (24,2%) (44%) (31,8%) 2/12 9/12 1/12

Parentérale 8/66 2/66 56/66 0/12 1/12 11/12

(12%) (3%) (85%)
6/58 5/58 47/58
AMX (CMI) 0/12 1/12 11/12
(10,3%) (8,6%) (81,1%)
7/81 4/81 70/81
CTX (CMI) 0/12 1/12 11/12
(8,6%) (5%) (86,4%)
IPM (CMI) 5/27 3/27 19/27 1/12 2/12 9/12
52/91 4/91 35/91
ERY 10/12 0/12 2/12
(57,1%) (4,4%) (38,5%)
40/83 2/83 41/83
CLI 7/12 0/12 5/12
(48,2%) (2,4%) (49,4%)
QDA 7/26 4/26 15/26 NT NT NT
6/74 0/74 68/74
CHL 1/12 0/12 11/12
(8,1%) (0%) (91,9%)
3/82 1/82 78/82
RIF 0/12 0/12 12/12
(3,6%) (1,2%) (95,2%)
45/88 1/88 42/88
SXT 3/12 0/12 9/12
(51,1%) (1,1%) (47,8%)
0/105 0/105 105/105
VAN 0/12 0/12 12/12
(0%) (0%) (100%)
0/87 0/87 87/87
LVX 0/12 0/12 12/12
(0%) (0%) (100%)
2/54 7/54 45/54
DOX 6/12 2/12 4/12
(3,7%) (13%) (83,3%)
FOS (50µg) 2/8 0/8 6/8 NT NT NT
GEM 1/8 1/8 6/8 0/12 0/12 12/12

Abréviations :PEN (pénicilline), AMX (amoxicilline), CTX (céfotaxime), IPM (imipénème), ERY
(érythromycine), CLI (clindamycine), QDA (quinupristine- dalfopristine), CHL (chloramphénicol), RIF
(rifampicine), SXT (cotrimoxazole), VAN (vancomycine), LVX (lévofloxacine), DOX (doxycycline), FOS
(fosfomycine), GEM (gémifloxacine), CMI (concentration minimale inhibitrice), R (résistant), I
(intermédiaire), S (sensible), NT (non testé).
* Les pourcentages ne sont pas calculés pour des effectifs inférieurs à 30.

63
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

P
o
u
r
c
e
n
t
a
g
e

Antibiotiques

Fig. 12 : Pourcentages de résistance et de sensibilité de S. pneumoniae aux

antibiotiques dans les prélèvements autres que le LCR (résultats du réseau,
année 2019)

Abréviations : PEN (pénicilline), AMX (amoxicilline), CTX (céfotaxime), IPM (imipénème), ERY (érythromycine), CLI
(clindamycine), CHL (chloramphénicol), RIF (rifampicine), SXT (cotrimoxazole), VAN (vancomycine), LVX (lévofloxacine), DOX
(doxycycline), CMI (concentration minimale inhibitrice), R (résistant), I (intermédiaire), S (sensible).

Tab. 28: Distribution des valeurs de CMI vis-à-vis de la Pénicilline G

pour S. pneumoniae dans les prélèvements autres que le LCR (année 2019)

Nombre de souches
CMI (mg/L)
Réseau IPA
≤ 0,016 13 0
[0,032 - 0,125 [ 8 1
[0,125 - 0,25 [ 8 3
[0,25 - 0,5 [ 6 4
[0,5 – 1 [ 4 0
[1 – 2 [ 15 2
[2 – 4 [ 3 1
[4 – 8 [ 3 1
[8 – 16 [ 4 0
≥ 16 2 0
Total 66 12

64
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 29: Nombre de CMI déterminées par laboratoire pour S. pneumoniae

isolé à partir des prélèvements autres que le LCR (année 2019)
Nombre de Nombre de CMI déterminées
Laboratoires
souches
isolées Pénicilline G Amoxicilline Céfotaxime Imipénème
CHU Mustapha Bacha 6 0 0 0 0
CHU Béni Messous 14 13 13 13 2
CHU Bab El Oued 1 0 0 0 0
EHS El Hadi Flici 5 5 0 5 3
EHS CPMC 2 0 0 1 0
EHS Dr Maouche 1 1 1 1 1
CHU Hussein Dey 9 0 5 8 6
CHU Tizi Ouzou 1 0 0 0 0
HCA 10 10 9 10 8
CHU Constantine 6 0 0 0 0
CHU Batna 6 1 0 2 2
CHU Blida 15 1 3 10 1
CHU Annaba 10 5 1 1 2
EPH Bologhine 26 25 24 26 0
EPH Boufarik 2 0 0 0 0
CHU Oran 2 2 2 2 2
EHS Zemirli 3 3 0 2 0
66 58 81 27
Total 119
(55,4%) (48,7%) (68%) (22,7%)

IPA 12 12 12 12 12

TOTAL GENERAL 131 78 70 93 39

65
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 30: Sérotypes de S. pneumoniae isolé à partir de prélèvements autres que

le LCR (Données de l’IPA, année 2019)

Sérotype Nombre de souches

Type 9V 1
Type 14 1
Type 19A 2
Type 19F 1
Type 11A 1
ND 6
Total 12

ND : Non déterminé.

Les sérotypes vaccinaux couverts par les vaccins conjugués sont en gras dans le
tableau.

66
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Profils de sensibilité et de résistance des bactéries

isolées des coprocultures

Pr. M. N. KORICHI- OUAR

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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Ce chapitre regroupe l’ensemble des données adressées par les laboratoires membres du
réseau AARN ayant validé leurs CQ durant l’année 2019 .Les données concernent les
étiologies responsables des gastro-entérites bactériennes ,la résistance des salmonelles aux
antibiotiques et les sérotypes les plus fréquemment isolés.

Nos objectifs sont les suivants :

1. établir un taux global de résistance aux antibiotiques des salmonelles isolées en milieu
hospitalier ou en pratique de ville.
2. établir un taux global de résistance aux antibiotiques des salmonelles isolées des
prélèvements digestifs et extra- digestifs.
3. déterminer les étiologies des gastro-entérites bactériennes des patients hospitalisés et
externes.
4. déterminer les étiologies des gastro-entérites bactériennes des patients hospitalisés et
externes.
5. établir les sérotypes des salmonelles circulantes en Algérie.
6. établir le taux de résistance aux antibiotiques des salmonelles en fonction des sérotypes.

Nous relevons :

 la saisie incomplète de données par certains membres du réseau.

 après analyse des données, nous notons la présence de 2 salmonelle Para
Typhoïde A .Malheureusement, après avoir contacté les deux laboratoires, ces deux
souches s’avèrent être des salmonelles non typhoïdiques.
 une très mauvaise saisie des données par les laboratoires (il manque le type de
prélèvement et même certains antibiogrammes …)

 un nombre très réduit d’isolement de Campylobacter spp (CHU Mustapha

uniquement)
 une augmentation du nombre des shigelles en communautaire et en hospitalier.
 sont rapportés 2 cas de patients hospitalisés présentant probablement une diarrhée
post antibiothérapie due à P. aeruginosa.
 les cas de gastro-entérites à E. coli n’ont pas été recensés, car les sérotypes
correspondants n’ont pas été précisés.

Tab. 31 : Nombre et pourcentage de souches bactériennes isolées des coprocultures

(N=152, année 2019)

Hospitalisés Externes Totaux

Nombre % Nombre % Nombre %

Salmonella spp.
111 73.02 30 19.73 141 92.76

Campylobacter spp.
1 0.65 1 0.65 2 1.31

Shigella spp.
5 3.28 2 1.31 7 4.60

Pseudomonas 2 1.31 0 0 2 1.31

aeruginosa
Totaux
119 78.28 33 21.71 152 100

68
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Fig. 13 : Nombre des souches bactériennes isolées des coprocultures (N=152, année
2019)

Données sur les salmonelles

Un total de dix (10) laboratoires du réseau AARN a validé leurs CQ. Ces derniers ont isolé
141 souches de salmonelles, 77 souches à partir des selles et 64 souches de prélèvements
extra-digestifs.

Les 77 souches d’origine digestive sont essentiellement d’origine hospitalière avec 55

souches, contre 22 souches d’origine extra hospitalière.

Les 64 souches de salmonelles isolées des prélèvements extra digestifs sont aussi
majoritairement d’origine hospitalière avec 56 souches et 8 souches uniquement pour les
prélèvements extra hospitaliers. Les souches extradigestives ont été isolées à partir des
prélèvements suivants : hémoculture (n = 27), urine (n = 8), LCR (n =2) , liquide pleural (n
=3), pus/abcès (n = 17), prélèvement vaginal (n =2), cornée (n =2), prothèse (n=1) , deux
salmonelles dont le prélèvement n’a pas été mentionné.

Tab.32 : Nombre de salmonelles isolées à partir des différents prélèvements en milieu

hospitalier et externe (N=141, année 2019)
Prélèvemen
Pus /Abcès

Inconnue
Prothèse
t vaginal
Liquide

Cornée
pleural

selles
Sang

Total
urine

LCR

Hospitalis 2
26 6 2 2 13 55 2 1 2 111
és
Externes 1 2 0 1 4 22 0 0 0 0 30
Total 27 8 2 3 17 77 2 2 1 2 141

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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Fig. 14 : Nombre de salmonelles isolées à partir de différents types d’infections en

milieu hospitalier et externe (N=141, année 2019)

Tab. 33 : Nombre et pourcentage de Salmonella spp. Résistantes (R + I) aux

antibiotiques (année 2019)

Antibiotiques Hospitalisés Externes TOTAL

Nombre Total % Nombre Total % Nombre Total %
48 95 50,52 12 25 FE 60 120 50,00
AMP / AMX
36 97 37,11 8 24 FE 44 121 36,36
AMC
40 89 44,94 8 21 FE 48 110 43,63
CZO
12 80 15,00 2 14 FE 14 94 14,89
FOX
9 110 08,18 0 22 FE 9 132 06,81
CTX / CRO
0 102 0 0 21 0 0 123 0
IPM
11 82 13,41 3 16 FE 14 98 14,28
GEN
16 83 19,27 4 20 FE 20 103 19,41
AMK
15 68 22,05 0 17 0 15 85 17,64
CHL
29 54 53,70 2 13 FE 31 67 46,26
NIT
64 73 87,67 13 16 FE 77 89 86,51
NAL
42 71 59,15 9 16 FE 51 87 58,62
CIP
16 80 20,00 2 19 FE 18 99 18,18
SXT

FE : faible effectif

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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 34 : Nombre et pourcentage de Salmonella spp. digestives résistante (R + I) aux

antibiotiques (année 2019)

Antibiotiques Hospitalisés Externes TOTAL

Nombre Total % Nombre Total % Nombre Total %
AMP / AMX 29 51 56,86 6 17 FE 35 68 51,47
AMC 14 51 27,45 4 16 FE 18 67 26,86
CZO 25 45 55,55 5 14 FE 30 59 50,84
FOX 5 42 11,90 2 9 FE 7 51 13,72
CTX / CRO 7 54 12,96 0 15 FE 7 69 10,14

IPM 0 53 0 0 14 0 0 67 0
GEN 8 41 19,51 0 10 FE 8 51 15,68

AMK 10 44 22.72 4 14 FE 14 58 24,13

CHL 8 41 19,51 0 12 0 8 53 15,09
NIT 18 34 52,94 2 8 FE 20 42 47,61

NAL 35 40 87,50 9 10 FE 44 50 88,00

CIP 23 40 57,50 5 10 FE 28 50 56,00
SXT 14 45 31.11 2 13 FE 16 58 27,58
FE : faible effectif
Tab. 35 : Nombre et pourcentage de Salmonella spp. extra digestives résistantes (R +
I) aux antibiotiques (année 2019)

Antibiotiques Hospitalisés Externes TOTAL

Nombre Total % Nombre Total % Nombre Total %
19 44 43 ,18 6 8 FE 25 52 48,07
AMP / AMX
AMC 22 46 47,82 4 8 FE 26 54 48,14
15 44 34,09 3 7 FE 18 51 35,29
CZO
7 38 18,42 0 5 FE 7 43 16,27
FOX
2 56 03,57 0 7 FE 2 63 03,17
CTX / CRO
0 49 0 0 7 FE 0 56 0
IPM
3 41 07,31 3 6 FE 6 47 12,76
GEN
6 39 15,38 0 6 FE 6 45 13,33
AMK
7 27 FE 0 5 FE 7 32 21,87
CHL
NIT 11 20 FE 0 5 FE 11 25 FE
29 33 87,87 4 6 FE 33 39 84,61
NAL
19 31 61.29 4 6 FE 23 37 62,16
CIP
2 35 05,71 0 6 FE 2 41 04,87
SXT
FE : faible effectif

Un total de neuf (9) souches de salmonelles non typhoïdiques sont productrices de BLSE,
quatre souches de Salmonella Heidelberg , trois souches de Salmonella Kentucky , une
souche de Salmonella Enteritidis et une Salmonella non typée. Aucune souche de
salmonelle non typhoïdique résistante à l’imipénème n’a été signalé en 2019.

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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Six sérotypes différents ont été retrouvés dans les données des laboratoires du réseau
AARN. Les sérotypes les plus fréquents sont : S. Enteritidis (n= 38), S. Typhimurium (n=11),
S. Kentucky (n=7), [Link] ( n=5), S. Choleraesuis ( n=3), [Link] (n=1), à noter
que 76 Salmonelles non typhoïdique n’ont pas été typées.

Nous notons qu’aucune souche de Salmonella Typhi, ni de Salmonella ParaTyphi A ou B

n’a été isolée par les laboratoires du réseau durant l’année 2019.

Tab. 36 : Nombre et pourcentage des différents sérovars de salmonelles (données

du réseau, N=141, année 2019)

Sérotype Nombre Pourcentage

S. Enteritidis 38 26,95
S. Typhimurium 11 7,8
S. Kentucky 7 4,96
S. Heidelberg 5 3,55
S. Choleraesuis 3 2,13
S. Montevideo 1 0,71
Salmonella sp 76 53,9
Total 141 100

Nous notons un grand problème de saisie des données dans le logiciel Whonet par les
responsables du réseau dans les différentes structures hospitalières.

Fig. 15 : Nombre des différents sérovars de salmonelles (données du réseau, N=141,

année 2019)

72
[Link]/aarn
Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 37 : Nombre et pourcentage des différents sérovars de salmonelles confirmés

au laboratoire des entérobactéries et autres bactéries apparentées (IPA, N=75, année
2019)

Sérovars Nombre Pourcentage

S. Enteritidis 33 44,00
S. Kentucky 12 16,00
S. Typhimurium 11 14,66
S. Bredeney 06 08,00
S. Virchow 03 04,00
S. Corvallis 03 04,00
S. Hadar 02 02,66
S. Kedougou 02 02,66
S. Heidelberg 01 01,33
S. Virginia 01 01,33
S. Bovismorbificans 01 01,33
Total 75 100

Fig. 16 : Nombre des différents sérovars de salmonelles confirmés au laboratoire

des entérobactéries et autres bactéries apparentées (IPA, N=75, année 2019)

Il serait souhaitable de typer les souches de salmonelles au niveau du laboratoire de

référence IPA -Entérobactéries –IPA- Dely Ibrahim, afin de connaître les sérotypes circulant
en Algérie.

73
[Link]/aarn
Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 38 : Nombre et pourcentage de résistance aux antibiotiques des différents sérovars de salmonelles isolées des patients externes et
hospitalisés (données du réseau, année 2019)

Salmonelles non
S. Montevideo S. Choleraesuis serotypées TOTAL
Antibiotiques S. Enteritidis S. Kentucky S. Typhimurium S. Heidelberg
Nombre Pourcentage
0/1 2/3 28/58
AMP ou AMX 11/36 7/7 8/10 4/5 60/120 50,00

0/1 1/3 22/58

AMC 5/37 4/7 8/11 4/5 44/122 36,06

HN 2/2 26/58
CZO 5/29 6/7 5/9 4/5 48/110 43,63

0/1 1/1 8/46

FOX 1/25 0/6 4/10 0/5 14/94 14,89

0/1 0/3 1/71

CTX ou CRO 1/35 3/7 0/11 4/5 9/133 06,76

0/1 0/1 0/64

IPM 0/36 0/7 0/10 0/5 0/124 0

HN 0/1 5/45
GEN 1/34 5/5 0/9 3/5 14/99 14,14

HN 2/2 14/48
AMK 0/34 0/5 1/9 3/5 20/103 19,41

HN 2/2 6/34
CHL 1/30 3/7 5/7 0/5 17/85 20,00

HN 1/1 19/35
NIT 9/14 0/6 2/6 0/5 31/67 46,26

HN HN 32/40
NAL 29/30 5/5 7/9 5/5 78/89 87,64

HN HN 17/37
CIP 18/31 5/5 7/9 5/5 52/87 59,77

0/1 0/2 10/40

SXT 1/34 2/6 2/11 3/5 18/99 18,18

HN 0/1 0/12
FOS 0 0/3 0/1 0/1 0/18 FE

FE : faible effectif HN : CQ hors norme

74
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Profils de sensibilité et de résistance des bactéries

isolées des urines
Pr. S. Mahrane

75
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Dans ce chapitre, nous nous sommes intéressées à l’analyse des données de sensibilité aux
antibiotiques des principales espèces bactériennes isolées des prélèvements d’urine pour
l’année 2019.
Nous avons abordé dans l’ordre :
1- la répartition des germes isolés, par espèce bactérienne, des prélèvements d’urine (dans
un contexte d’infection urinaire).
2- la sensibilité aux antibiotiques des souches d’Escherichia coli isolées des prélèvements
d’urine.

Commentaires

Les données sur la répartition des BMR n’ont pas pu être exploitées, nous avons constaté
une discordance entre la résistance au céfotaxime et le nombre de BLSE saisi.

Les données de résistance et de sensibilité à la colistine n’ont pas été exploitées par
absence de données de CMI de la colistine.

76
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 Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 39 : Répartition des bactéries isolées des urines par espèce bactérienne chez les
patients hospitalisés (N= 4401, année 2019)

Groupes bactériens Espèces bactériennes Nombre Pourcentage

E. coli 2127 48,32

K. pneumoniae 739 16,79
P. mirabilis 217 4,93
E. cloacae 179 4,06
Entérobactéries
(N=3353, 76,2%) K. oxytoca 47 1,06
S. marcescens 27 0,61
Salmonella spp. 17 0,38
Bacilles à Gram négatif P. aeruginosa 362 8,22
oxydatifs A. baumannii 200 4,54
(N=564, 12,81%) S. maltophilia 2 0,04
Staphylocoques S. aureus 78 1,77
(N=133, 3%) S. saprophyticus 32 0,72
S. epidermidis 23 0,52

Streptocoques S. agalactiae 66 1,49

(N=66, 1,5%)
Enterocoques E. faecalis 189 4,29
(N=285, 6,5%) E. faecium 96 2,18
Total 4401 100

77
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Fig. 17 : Pourcentage de souches isolées dans les urines chez les patients
hospitalisés (N=4401, année 2019).

78
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 40 : Répartition des bactéries isolées des urines par espèce bactérienne chez les
patients externes (N= 4176, année 2019)

Groupe de
Espèces bactériennes Nombre Pourcentage
bactéries
E. coli 2646 63,37

K. pneumoniae 626 15

P. mirabilis 161 3,85

Entérobactéries K. oxytoca 34 0,81

(N=3603, 86,28% )
E. cloacae 122 2,92

S. marcescens 11 0,27

Salmonella spp. 3 0,07

Bacilles à Gram P. aeruginosa 99 2,38

négatif oxydatifs
A. baumannii 24 0,58
(N=123, 2,95%)
S. aureus 91 2,18

Staphylocoques S. saprophyticus 53 1,27

(N=161, 3,86%)
S. epidermidis 17 0,4

Streptocoques 2,84
S. agalactiae 119
(N=119, 2,85%)

E. faecium 15 0,35
Enterocoques
(N=170, 4,06%) E. faecalis 155 3,71

Total 4176 100

79
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Fig. 18 : Pourcentage de souches isolées dans les urines chez les patients externes
(N=4176, année 2019)

80
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 41 : Nombre et pourcentage d’[Link] (R+I) isolés des urines (année 2019)

Hospitalisés Externes TOTAL

Antibiotiques
Nombre Total % Nombre Total % Nombre Total %
AMP / AMX 849 1037 81,87 1212 1615 75,05 2061 2652 77,71
AMC 445 937 47,49 613 1394 43,97 1058 2331 45,39
CZO 294 1184 24,83 210 1631 12,88 504 2815 17,90
FOX 41 702 5,84 25 676 3,70 66 1378 4,79
CTX / CRO 225 1190 18,91 143 1704 8,39 368 2894 12,72
CAZ 47 198 23,74 27 224 12,05 74 422 17,54
ATM 42 256 16,41 27 437 6,18 69 693 9,96
IPM 4 889 0,45 9 1295 0,69 13 2184 0,60
ERT 6 618 0,97 1 553 0,18 7 1171 0,60
GEN 124 678 18,29 91 1153 7,89 215 1831 11,74
AMK 46 1071 4,30 17 1585 1,07 63 2656 2,37
CHL 41 396 10,35 25 443 5,64 66 839 7,87
NIT 68 543 12,52 56 807 6,94 124 1350 9,19
NAL 258 643 40,12 357 1224 29,17 615 1867 32,94
CIP 223 796 28,02 231 1327 17,41 454 2123 21,38
COL (CMI) - - - - - - - - -
SXT 502 951 52,79 502 1295 38,76 1004 2246 44,70
FOS (200) 6 496 1,21 14 1163 1,20 20 1659 1,21

Remarque : les données de résistance et de sensibilité à la colistine n’ont pas été exploitées
par manque de résultats de CMI

81
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Fig. 19 : Pourcentage de résistance aux antibiotiques (R+I) des E. coli isolés des
urines chez les patients externes (année 2019).

Fig. 20 : Pourcentage de résistance aux antibiotiques (R+I) des E. coli isolés des
urines chez les patients hospitalisés (année 2019).

82
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Etat de la résistance aux antibiotiques et

surveillance des bactéries multi-résistantes (BMR)

Pr. S. MAHRANE et Pr. H. TALI MAAMAR

83
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Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Dans ce chapitre sont traités les résultats de l’analyse des données compilées, de
résistances aux antibiotiques des bactéries d’intérêt nosocomial, collectées par les
laboratoires-membres du réseau AARN durant l’année 2019

Objectif
Etablir un taux global de résistance aux antibiotiques (habituellement prescrits en
milieu hospitalier et/ou en pratique de ville) des bactéries isolées chez les malades
hospitalisés et chez les patients extra-hospitaliers.

Commentaires :
Nous n’avons pas pu évaluer la place des BMR au sein de chacune des espèces
bactériennes vues :
 la discordance retrouvée lors de l’exploitation des données de résistance au
céfotaxime et le taux de BLSE
 les données de résistance et de sensibilité à la colistine n’ont pas été
exploitées par absence de données de CMI de la colistine

84
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 Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 42 : Nombre et pourcentage d’Escherichia coli résistants (R + I) aux

antibiotiques (année 2019)

Antibiotiques Hospitalisés Externes TOTAL

Nombre Total % Nombre Total % Nombre Total %

AMP / AMX 2212 2607 84,85 1654 2125 77,84 3866 4732 81,70
AMC 1451 2732 53,11 779 1867 41,72 2230 4599 48,49
CZO 1428 3183 44,86 819 2372 34,53 2247 5555 40,45
FOX 230 2597 8,86 48 1307 3,67 278 3904 7,12
CTX / CRO 879 3795 23,16 315 2966 10,62 1194 6761 17,66
CAZ 129 745 17,32 40 460 8,70 169 1205 14,02
ATM 33 220 15,00 19 161 11,80 52 381 13,65
IPM 21 2387 0,88 30 1607 1,87 51 3994 1,28
ERT 17 1380 1,23 1 690 0,14 18 2070 0,87
GEN 441 2409 18,31 141 1357 10,39 582 3766 15,45
AMK 38 2078 1,83 19 2130 0,89 57 4208 1,35
CHL 31 222 13,96 32 307 10,42 63 529 11,91
NIT 90 929 9,69 43 760 5,66 133 1689 7,87
NAL 890 1981 44,93 470 1418 33,15 1360 3399 40,01
CIP 629 2086 30,15 478 1990 24,02 1107 4076 27,16
SXT 1329 2226 59,70 679 1467 46,28 2008 3693 54,37
FOS (200) 26 1091 2,38 13 646 2,01 39 1737 2,25
Pourcentages

Antibiotiques

Fig. 21 : Pourcentage de résistance (R+I) d’Escherichia coli aux antibiotiques

(année 2019)

85
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 Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 43 : Nombre et pourcentage de Klebsiella pneumoniae résistantes (R + I) aux

antibiotiques (année 2019)

Antibiotiques Hospitalisés Externes TOTAL

Nombre Total % Nombre Total % Nombre Total %
AMC 930 1455 63,92 216 456 47,37 1146 1911 59,97
CZO 1051 1577 66,65 237 575 41,22 1288 2152 59,85
FOX 193 1444 13,37 29 324 8,95 222 1768 12,56
CTX / CRO 1149 1937 59,32 251 776 32,35 1400 2713 51,60
CAZ 265 430 61,63 30 83 36,14 295 513 57,50
ATM 95 201 47,26 22 62 35,48 117 263 44,49
IPM 58 1295 4,48 1 378 0,26 59 1673 3,53
ERT 26 607 4,28 7 136 5,15 33 743 4,44
GEN 655 1557 42,07 91 407 22,36 746 1964 37,98
AMK 97 1294 7,50 12 645 1,86 109 1939 5,62
CHL 23 170 13,53 16 101 15,84 39 271 14,39
NIT 385 648 59,41 119 202 58,91 504 850 59,29
NAL 534 1328 40,21 108 374 28,88 642 1702 37,72
CIP 504 1302 38,71 124 601 20,63 628 1903 33,00
SXT 851 1350 63,04 168 386 43,52 1019 1736 58,70
FOS 106 733 14,46 19 167 11,38 125 900 13,89
Pourcentages

Antibiotiques

Fig. 22 : Pourcentage de résistance (R+I) de Klebsiella pneumoniae aux antibiotiques

(année 2019)

86
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 Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 44 : Nombre et pourcentage d’Enterobacter cloacae résistants (R + I) aux

antibiotiques (année 2019).

Hospitalisés Externes TOTAL

Antibiotiques
Nombre Total % Nombre Total % Nombre Total %
CTX / CRO 105 236 44,49 20 78 25,64 125 314 39,81
CAZ 30 48 62,50 8 13 FE 38 61 62,30
ATM 8 32 25,00 0 16 FE 8 48 16,67
IPM 7 187 3,74 3 48 6,25 10 235 4,26
ERT 8 89 8,99 4 25 FE 12 114 10,53
GEN 38 149 25,50 4 51 7,84 42 200 21,00
AMK 10 208 4,81 3 68 4,41 13 276 4,71
CHL 27 103 26,21 8 29 FE 35 132 26,52
NIT 28 67 41,79 9 17 FE 37 84 44,05
NAL 41 117 35,04 13 47 27,66 54 164 32,93
CIP 47 172 27,33 11 62 17,74 58 234 24,79
SXT 80 196 40,82 17 54 31,48 97 250 38,80
FOS 3 76 3,95 0 25 FE 3 101 2,97

FE : faible effectif
Pourcentages

Antibiotiques

Fig. 23 : Pourcentage de résistance (R+I) d’Enterobacter cloacae aux

antibiotiques (année 2019)

aux antibiotiques

87
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 Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 45 : Nombre et pourcentage de Serratia marcescens résistantes (R + I) aux

antibiotiques (année 2019)

Antibiotiques Hospitalisés Externes TOTAL

Nombre Total % Nombre Total % Nombre Total %
FOX 71 144 49,31 4 6 FE 75 150 50,00

CTX / CRO 79 212 37,26 6 30 20,00 85 242 35,12

CAZ 8 32 25,00 1 3 FE 9 35 25,71

ATM 29 63 46,03 0 6 29 69 42,03

FE

IPM 3 198 1,52 0 21 3 219 1,37

FE

ERT 0 100 0,00 0 7 0 107 0,00

FE
GEN 47 139 33,81 3 21 50 160 31,25
FE
AMK 15 180 8,33 0 29 15 209 7,18
FE

CHL 13 127 10,24 1 14 14 141 9,93

FE
NAL 26 119 21,85 2 15 FE 28 134 20,90

CIP 42 160 26,25 2 26 44 186 23,66

FE
SXT 64 187 34,22 4 22 FE 68 209 32,54

FOS 1 45 2,22 1 8 12,50 2 53 3,77

FE : faible effectif
Pourcentages

Fig. 24 : Pourcentage de résistance (R+I) de Serratia marcescens aux antibiotiques

(année 2019)

aux antibiotiques 88
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 Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 46 : Nombre et pourcentage de Proteus mirabilis résistants (R + I) aux

antibiotiques (année 2019)

Antibiotiques Hospitalisés Externes TOTAL

Nombre Total % Nombre Total % Nombre Total %
AMP / AMX 202 283 71,38 88 139 63,31 290 422 68,72
AMC 73 226 32,30 34 122 27,87 107 348 30,75
CZO 77 287 26,83 20 137 14,60 97 424 22,88
FOX 12 149 8,05 0 28 FE 12 177 6,78
CTX / CRO 42 299 14,05 6 148 4,05 48 447 10,74
CAZ 5 52 9,62 3 28 FE 8 80 10,00
ATM 3 91 3,30 3 65 4,62 6 156 3,85
IPM* 13 251 5,18 3 112 2,68 16 363 4,41
ERT 0 134 0,00 0 45 0,00 0 179 0,00
GEN 40 191 20,94 13 113 11,50 53 304 17,43
AMK 14 248 5,65 3 131 2,29 17 379 4,49
CHL 53 132 40,15 17 62 27,42 70 194 36,08
NAL 64 131 48,85 41 96 42,71 105 227 46,26
CIP 68 208 32,69 27 132 20,45 95 340 27,94
SXT 135 250 54,00 45 111 40,54 180 361 49,86
FOS (200) 10 107 9,35 3 68 4,41 13 175 7,43

* P. mirabilis présent une résistance naturelle de bas niveau aux carbapénèmes

Pourcentages

Antibiotiques

Fig. 25 : Pourcentage de résistance (R+I) de Proteus mirabilis aux antibiotiques

(année 2019)

aux antibiotiques 89
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 Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 47 : Nombre et Pourcentage de Pseudomonas aeruginosa résistants (R + I)

aux antibiotiques (année 2019).

Antibiotiques Hospitalisés Externes TOTAL

Nombre Total % Nombre Total % Nombre Total %
TIC 525 823 63,79 157 257 61,09 682 1080 63,15
TCC 491 776 63,27 131 238 55,04 622 1014 61,34
PIP 256 907 28,22 56 270 20,74 312 1177 26,51
CAZ 162 887 18,26 28 271 10,33 190 1158 16,41
ATM 44 374 11,76 17 133 12,78 61 507 12,03
IPM 155 798 19,42 21 234 8,97 176 1032 17,05
GEN 92 524 17,56 25 161 15,53 117 685 17,08
TOB 120 852 14,08 15 264 5,68 135 1116 12,10
NET 117 733 15,96 25 252 9,92 142 985 14,42
AMK 75 766 9,79 15 235 6,38 90 1001 8,99
CIP 97 611 15,88 29 189 15,34 126 800 15,75
LVX 94 569 16,52 26 177 14,69 120 746 16,09

Remarque : la sensibilité à la fosfomycine devrait être évaluée par la détermination de la CMI

Pourcentages

Antibiotiques

Fig. 26 : Pourcentage de résistance (R+I) de Pseudomonas aeruginosa aux

antibiotiques (année 2019)

aux antibiotiques

90
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 Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 48 : Nombre et pourcentage d’Acinetobacter spp. résistants (R + I) aux

antibiotiques (année 2019)

Antibiotiques Hospitalisés Externes TOTAL

Nombre Total % Nombre Total % Nombre Total %
TIC 301 355 84,79 37 49 75,51 338 404 83,66
TCC 293 342 85,67 33 44 75,00 326 386 84,46
PIP 347 378 91,80 42 49 85,71 389 427 91,10
CAZ 330 383 86,16 35 45 77,78 365 428 85,28
IPM 254 349 72,78 28 40 70,00 282 389 72,49
GEN 186 238 78,15 20 36 55,56 206 274 75,18
TOB 196 359 54,60 24 51 47,06 220 410 53,66
NET (CMI) - - - 0 20 FE 0 20 FE
AMK 233 356 65,45 23 44 52,27 256 400 64,00
CIP 228 266 85,71 26 37 70,27 254 303 83,83
LVX 182 225 80,89 13 19 FE 195 244 79,92
DOX 132 191 69,11 13 25 FE 145 216 67,13
SXT 225 292 77,05 17 26 FE 242 318 76,10

FE : faible effectif
Pourcentages

Antibiotiques

Fig. 27 : Pourcentage de résistance (R+I) d’Acinetobacter spp. aux antibiotiques

(année 2019)

91
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 Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 49 : Nombre et pourcentage de Staphylococcus aureus résistants (R+ I) aux

antibiotiques (année 2019)

Antibiotiques Hospitalisés Externes TOTAL

Nombre Total % Nombre Total % Nombre Total %
PEN 1537 1575 97,59 507 521 97,31 2044 2096 97,52
OXA 778 1967 39,55 176 614 28,66 954 2581 36,96
KAN 574 1444 39,75 161 510 31,57 735 1954 37,62
GEN 386 1744 22,13 43 516 8,33 429 2260 18,98
AMK 249 1091 22,82 105 488 21,52 354 1579 22,42
ERY 674 2092 32,22 116 532 21,80 790 2624 30,11
CLI 158 1076 14,68 43 454 9,47 201 1530 13,14
PRI/QDF 77 1266 6,08 9 266 3,4 86 1532 5,6
VAN (CMI) 0 1363 0 0 479 0 0 1842 0
TEC 0 1623 0 0 592 0 0 2215 0
RIF 108 1240 8,71 16 429 3,73 124 1669 7,43
SXT 189 1194 15,83 23 378 6,08 212 1572 13,49
TCY 229 568 40,32 48 187 25,67 277 755 36,69
CHL 15 585 2,56 12 354 3,39 27 939 2,88
FUS 647 1553 41,66 223 553 40,33 870 2106 41,31
OFX 184 863 21,32 32 323 9,91 216 1186 18,21
CIP 203 610 33,28 31 202 15,35 234 812 28,82
LVX 91 481 18,92 22 222 9,91 113 703 16,07
Pourcentages

Antibiotiques

Fig. 28 : Pourcentage de résistance (R+I) de Staphylococcus aureus aux

antibiotiques (année 2019)
92
aux antibiotiques [Link]/aarn
 Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 50 : Nombre et pourcentage des SASM résistants (R + I) aux antibiotiques

(année 2019).

Antibiotiques Hospitalisés Externes TOTAL

Nombre Total % Nombre Total % Nombre Total %
PEN 865 901 96,00 335 346 96,82 1200 1247 96,23
OXA 0 1166 0,00 0 422 0,00 0 1588 0
KAN 170 845 20,12 51 324 15,74 221 1169 18,91
GEN 39 974 4,00 10 338 2,96 49 1312 3,73
AMK 79 656 12,04 37 329 11,25 116 985 11,78
ERY 293 1212 24,17 48 345 13,91 341 1557 21,90
CLI 48 649 7,40 18 301 5,98 66 950 6,95
PRI/QDF 28 746 3,75 7 155 4,5 35 901 3,9
VAN (CMI) 0 796 0,00 0 313 0,00 0 1109 0
TEC 0 985 0,00 0 371 0,00 0 1356 0
RIF 17 782 2,17 8 313 2,56 25 1095 2,28
SXT 37 666 5,56 11 247 4,45 48 913 5,26
TCY 69 315 21,90 21 119 17,65 90 434 20,74
CHL 7 407 1,72 5 254 1,97 12 661 1,82
FUS 215 923 23,29 100 360 27,78 315 1283 24,55
OFX 26 527 4,93 6 213 2,82 32 740 4,32
CIP 74 398 18,59 11 146 7,53 85 544 15,63
LVX 8 297 2,69 7 159 4,40 15 456 3,29
Pourcentages

Antibiotiques

Fig. 29 : Pourcentage des SASM résistants (R + I) aux antibiotiques (année 2019).

aux antibiotiques

93
[Link]/aarn
 Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 51 : Nombre et pourcentage des SARM résistants (R + I) aux antibiotiques

(année 2019).

Antibiotiques Hospitalisés Externes TOTAL

Nombre Total % Nombre Total % Nombre Total %
PEN 605 605 100,00 133 133 100,00 738 738 100
OXA 756 756 100,00 167 167 100,00 923 923 100
KAN 311 461 67,46 100 129 77,52 411 590 69,66
GEN 329 681 48,31 32 130 24,62 361 811 44,51
AMK 190 421 45,13 66 127 51,97 256 548 46,72
ERY 400 774 51,68 59 134 44,03 459 908 50,55
CLI 104 378 27,51 25 113 22,12 129 491 26,27
PRI/QDF 36 428 8,41 3 65 4,61 39 493 7,9
VAN (CMI) 0 510 0,00 0 125 0,00 0 635 0
TEC 0 555 0,00 0 146 0,00 0 701 0
RIF 89 440 20,23 14 111 12,61 103 551 18,69
SXT 154 462 33,33 11 92 11,96 165 554 29,78
TCY 166 263 63,12 28 78 35,90 194 341 56,89
CHL 8 204 3,92 7 77 9,09 15 281 5,34
FUS 401 623 64,37 103 147 70,07 504 770 65,45
OFX 157 291 53,95 26 76 34,21 183 367 49,86
CIP 135 226 59,73 21 47 44,68 156 273 57,14
LVX 82 160 51,25 17 49 34,69 99 209 47,37
Pourcentages

Antibiotiques

Fig. 30 : Pourcentage de résistance (R+I) des SARM aux antibiotiques (année 2019)

94
[Link]/aarn
 Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 52 : Nombre et pourcentage d’Enterococcus faecalis résistants (R + I) aux

antibiotiques (année 2019).

Antibiotiques Hospitalisés Externes TOTAL

Nombre Total % Nombre Total % Nombre Total %
AMP 21 205 10,24 1 45 2,22 22 250 8,80
GEH 33 189 17,46 1 38 2,63 34 227 14,98
STH 33 110 30,00 5 17 FE 38 127 29,92
ERY 135 172 78,49 21 40 52,50 156 212 73,58
NIT 2 57 3,51 0 18 FE 2 75 2,67
TCY 109 132 82,58 21 31 67,74 130 163 79,75
VAN 2 211 0,95 0 53 0,00 2 264 0,76
TEC 0 163 0,00 0 43 0,00 0 206 0,00
CIP 46 65 70,77 3 23 FE 49 88 55,68
LVX 49 163 30,06 5 33 15,15 54 196 27,55
RIF 103 185 55,68 28 46 60,87 131 231 56,71
FOS (200) 1 33 3,03 0 17 FE 1 50 2,00
CHL 7 110 6,36 6 33 18,18 13 143 9,09

FE : Faible effectif
Pourcentages

Antibiotiques

Fig. 31 : Pourcentage de résistance (R+I) d’Enterococcus faecalis aux antibiotiques

(année 2019)

95
[Link]/aarn
 Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 20ème Rapport d’évaluation 2019

Tab. 53 : Nombre et pourcentage d’Enterococcus faecium résistants (R + I) aux

antibiotiques (année 2019).

Antibiotiques Hospitalisés Externes TOTAL

Nombre Total % Nombre Total % Nombre Total %
a 64 73 87,67 4 8 FE 68 81 83,95
GEH 39 67 58,21 2 8 FE 41 75 54,67
STH 20 48 41,67 3 5 FE 23 53 43,40
ERY 51 53 96,23 5 7 FE 56 60 93,33
NIT 3 19 FE 2 4 FE 5 23 FE
TCY 29 52 55,77 6 8 FE 35 60 58,33
VAN 16 84 19,05 1 10 FE 17 94 18,09
TEC 6 53 11,32 1 8 FE 7 61 11,48
CIP 26 28 FE 3 3 FE 29 31 93,55
LVX 43 59 72,88 5 7 FE 48 66 73
RIF 48 62 77,42 4 7 FE 52 69 75,36
FOS (200) 2 17 FE 0 3 FE 2 20 FE
QDF 19 29 FE 2 2 FE 21 31 68
CHL 8 54 14,81 0 7 FE 8 61 13,11

FE : Faible effectif
Pourcentages

Antibiotiques

Fig. 32 : Pourcentage de résistance (R+I) d’ Enterococcus faecium aux

antibiotiques (année 2019)

96
[Link]/aarn