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Examen de Biologie Moléculaire 2011 (1, 2)

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Examen de Biologie moléculaire 2011(1, 2), Faculté des Sciences-Semlalia,

Université Cadi Ayyad, Marrakech, Maroc. Durée 1 heure

Examen 1 (Corrections 1) -- Examen 2 (Corrections 2) --

Examen 1

- Partie QCM

Pour chacune des questions posées, une ou plusieurs réponses exactes sont
proposées. Sur le tableau de la feuille réponse, mettre une croix dans les cases
correspondant aux bonnes réponses.

1) Le génome des eucaryotes:


A. est toujours circulaire et bicaténaire
B. contient l'ensemble des gènes d'un organisme
C. présente une structure composée de 2 chaînes d'ADN orientées de
façon parallèle
D. est constitué uniquement de séquences uniques
E. est constitué majoritairement de séquences codantes

2) La réplication du DNA chez les eucaryotes:


A. est un processus rapide
B. intervient au cours de la phase G1 du cycle cellulaire
C. est dite semi conservative
D. copie les brins matrices en brins complémentaires
E. débute aux niveau de séquences particulières, appelées ORC,
riches en nucléotides A et G

3) Chez les procaryotes, la DNA polymérase III:


A. est localisée au coeur de la fourche de réplication
B. posséde une activité d'autocorrection
C. polymérise l'ADN dans le sens 3' -> 5'
D. intervient dans le remplacement de l'amorce RNA
E. est fixée à l'ADN par les protéines SSB (single strand DNA binding)

4) Pourquoi y a-t-il une différence entre la synthèse du brin


avancé et celle du brin retardé des molécules de DNA ?
A. les origines de réplication ne se trouvent quà l'extrémité 5' des
molécules de DNA
B. les hélicases et les protéines fixatrices de l'ADN monocaténaire
(SSB) en sont responsables
C. la DNA polymérase ne peut ajouter de nouveaux mucléotides qu'à
l'extrémité 3' du brin en cours de synthèse
D. la DNA ligase ne peut fonctionner que dans le sens 5'->3'
E. la DNA polymérase ne peut fonctionner que sur un brin de DNA à la
fois

5) La transposition diffère des autres mécanismes de


recombinaison génétique parce qu'elle:
A. ne survient que chez les bactéries
B. déplace des gènes entre régions homologues du DNA
C. ne survient que chez les eucaryotes
D. disperse le DNA du transposon sur de nouveaux loci du génome
E. se passe sans que jamais la séquence à transposer n'apparaisse
sous une forme libre et individualisée

6) La grande diversité des anticorps du système immunitaire chez


les mammifères est en grande partie due:
A. au mécanisme de conversion génétique
par correction d'hétéroduplex
B. à un taux très élevé de mutations au niveau des gènes du système
immunitaire
C. à la grande diversité au niveau de la structure physiologique de la
'superfamille des gènes de l'immunité'
D. à la recombinaison spécifique du site au cours de la différenciation
des cellules germinales
E. aux diverses combinaisons entre les chaînes polypeptidiques qui
constituent chaque anticorps

7) Les scientifiques ont trouvé le moyen d'assembler un


bactériophage à partir de la coque protéique (capside) du phage
T2 et le DNA du phage T4. Si on permettait à ce phage composite
d'infecter une bactérie, les phages produits dans la cellule hôte
auraient :
A. les protéines de T2 et le DNA de T4
B. les protéines de T4 et le DNA de T2
C. un mélange du DNA et des protéines des deux phages
D. les protéines et le DNA de T2
E. les protéines et le DNA de T4

- Partie Problèmes

Problème 1: Le fragment d'ADN présenté ci dessous, est


bicaténaire à chaque extrémité, mais simple brin en son milieu. Le
sens du brin supérieur est indiqué sur la figure.

a. Le groupement (P) du brin inférieur se trouve à l'extrêmité 5' ou 3'


du brin aquel il est lié ?
b. Comment les processus de réparation de l'ADN dans la cellule
compléteraient-ils le trou au niveau du brin inférieur ?
c. Le brin inférieur serait composé de combien de fragment(s) si le trou
était complété in vitro dans un tube ne contenant que des
désoxyribonucléotides triphosphates et une ADN polymérase ?
Problème 2: Vous étudier la réplication de l'ADN dans des cellules
placées en culture. Pour cela vous dsposez de cellules
synchronisées en début de phase S et de thymidine radioactive.
Vous placez les cellules dans un milieu de culture non radioactif
pendant 10 minutes. Vous placez ensuite les cellules dans un
milieu de culture contenant de la thymidine radioactive à une
forte concentration. Après 40 minutes d'incubation, vous éliminez
le milieu et vous placer les cellules dans un nouveau milieu qui
contient de la thymidine radioactive à une concentration cinq fois
plus faible. Les cellules sont laissées 20 minutes dans ce milieu,
puis l'ADN est extrait et analysé par autoradiographie. Le résultat
de l'autographie est donné dans la figure ci dessous:

a) Expliquez pourquoi on obtient des zones foncées et des zones plus


claires ?
B. Reproduire (dessiner) et légender la part du schéma qui correspond
à un seul oeil de réplication.
C. Commentez le résultat obtenu et indiquez la principale conclusion
que permet de tirer cette expérience.
D. Calculer la vitesse de la réplication en µm/min et en pb/sec.

Réponses brèves

Avertissement: Les éléments d'information ci joints ne peuvent constituer les


réponses définitives aux questions posées, considérant d'éventuels manques de
précisions que le Responsable de l'épreuve pourrait fournir sur place, suite à la
demande des étudiants.

1) Le génome des eucaryotes:


B. contient l'ensemble des gènes d'un organisme

2) La réplication du DNA chez les eucaryotes:


C. est dite semi conservative
D. copie les brins matrices en brins complémentaires

3) Chez les procaryotes, la DNA polymérase III:


A. est localisée au coeur de la fourche de réplication
B. posséde une activité d'autocorrection
Examen 2

I- Un fragment d'ADN bicaténaire a été isolé à partir d'E. coli. La


séquence suivante représente un des deux brins:

5' GTAGCCTACCCATAGG 3'

1) Un ARN messager est transcrit à partir de cet ADN en utilisant le brin


complémentaire comme brin matrice. Quelle sera la séquence
nucléotidique de cet ARN messager ?
2) Quel peptide obtiendrait-on si la traduction commençait précisément à
l'extrémité 5' de cet ARNm ? in vitro, aucun codon de départ n'est
nécessaire).
3)Décrire les événements, au niveau du ribosome, depuis l'arrivée de
l'ARNt Ala jusqu'à son départ.

II- Quelques acides aminés ont été enlevés à l'extrémité C-


terminale de la béta-lactamase de type sauvage. Comparer cette
séquence à celle d'un mutant pour lequel la phase de lecture a été
décalée d'un nucléotide (insertion ou délétion). On donne ci
dessous, les séquences en acides aminés à partir du résidu 263.

Sauvage: Asn-Met-Asp-Gly-Lys- ???


Mutant: Asn-Met-Ile-Trp-Glu-Ile-Cys-Val-Met-Lys-Asp-Stop

1) Quel type d'événement mutationnel a donné naissance au mutant ?


Justifier.
2) Déterminer le nombre d'acides aminés enlevés à l'extrémité C-
terminale de la béta-lactamase de type sauvage. En déterminer si
possible, la séquence C-terminale.

III- Les ARN extraits du cytoplasme de différents tissus sont


analysés par la technique du 'Northern' en utilisant comme sonde
un oligonucléotide marqué correspondant au premier exon du gène
de la calcitonine (hormone hypocalcémiante).

1) Interpréter l'expérience et les résultats obtenus en indiquant les


différentes hypothèses possibles.
2) Lorsque la même espérience est réalisée sur des ARN nucléaires de
thyroïde ou de cerveau, on observe des bandes très faibles et diffuses,
de plus haut poids moléculaire que ce qui a été observé avec les ARN
cytoplasmiques. A quoi correspondent-elles ?

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