Acides α amines
Les acides aminés sont le fondement de tous les processus vitaux, car ils sont absolument indispensables à l'intégralité des
processus métaboliques. Leur tâche principale consiste à assurer le transport optimal ainsi que le stockage optimisé de toutes les
substances nutritives (c.-à d. de l'eau, des lipides, des glucides, des protéines, des minéraux et des vitamines).
I. Définition et nomenclature des acides α amines
I.1. Définition
Un acide aminé est un acide carboxylique qui possède groupement amino ( –NH2 ).
On parle d’acide α aminé lorsque le groupement amino est en position 2
γ O
β α 1
R CH 2 CH 2 CH C
NH 2 OH
Il existe :
Des acides β aminés (groupement amino en position 3)
Des acides γ aminés (groupement amino en position 4)
I.2. Nomenclature
Les acides α-aminés ont nommés de la même façon que les l’acides carboxyliques. Le groupement -NH2 est appelé amino. Et
La plus part des acide α aminés portent des noms usuels :
CH3 CH COOH
CH3 CH CH2 CH COOH
NH2
CH3 NH2
acide 2 amino propanoique
acide 2 amino 4 méthylpentanoique
ou Alamine(Ala)
ou Leucine (Leu)
CH3
CH3 CH CH COOH
NH2 CH2 COOH
NH2
glucine (Glu)
acide 2 amino 3 méthylbutanoique
ou Valine (Val)
II. Propriétés chimiques
II.1. Décarboxylation
La décarboxylation des acides α-aminés conduisent à la formation des amines
Exemple
O
R CH C
Ni
OH 200 oC
R CH2 + CO2
NH2 NH2
II.2. Propriété acido-basique : caractère ampholyte
Une acide α aminé contient, à proximité l’un de l’autre :
− Un groupe carboxyle –COOH, acide, c'est-à-dire susceptible de donner un proton H+
− Un groupe amino –NH2, basique, c'est-à-dire susceptible d’accepter un proton H+.
Cette proximité facilite le transfert intramoléculaire du proton H+ du groupe –COOH vers le groupe –NH2 et permet
l’établissement d’un équilibre ente la forme non ionique et électriquement neutre de la molécule d’acide α aminé et sa forme
ionique, elle aussi électriquement neutre, mais porteuse de deux charges opposées :
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R CH COO H R CH CO O -
NH2 NH 3 +
L’ion double (ion bipolaire) ainsi formé est appelé amphion ou zwitterion.
Caractère basique de l’amphion
R CH COO- + H+ R CH COOH
N H 3+ N H 3+
A +_ A+
Le couple mis en jeu est / ± où l’amphion ± est une base conjuguée et le cation est l’acide conjugué encore appelé
acide double car il peut libérer le proton au niveau de la fonction acide carboxylique et au niveau de la fonction amine.
Caractère acide de l’amphion
R CH COO- R CH COO- + H
+
N H 3+ NH2
/
+_ A-
± ±
A
Le couple mis en jeu est : l’amphion joue le rôle d’acide conjuguée et l’anion le rôle de base encore appelé base
double.
Domaine de prédominance
En solution aqueuse les acides α aminés peuvent exister sous 4différentes formes : Ces quatre espèces coexistent en solution
Sous forme moléculaire NH2-CH2-COOH quelque soit le pH de la solution, mais toujours minoritaire en solution
Sous forme de cation NH3+-CH2-COOH, cette espèce est majoritaire si pH < pKa1 ( est négligeable)
Sous forme d’anion NH2-CH2-COO-, cette espèce est majoritaire si pH > pKa2 ( est négligeable)
Sous forme zwittérion NH3+-CH2-COO-, cette espèce est majoritaire si le pH de la solution est tel que pKa1 < pH > pKa2
catio n A + am p h io n A + - an io n A -
PH
P K a1 P K a2
Point isoélectrique
Pour chaque acide α aminé, il existe une valeur du pH pour laquelle le zwitterion (ou l'amphion) prédomine, donc où sa
=
concentration est maximale. Ce pH particulier, compris entre pKA1 et pKA2, est appelé point isoélectrique noté pHi. Ce pH est
aussi obtenu lorsque le cation et l’anion ont la même concentration. ( )
Le point isoélectrique est caractéristique de l'acide α aminé et sa valeur est donnée par :
+
=
Preuve
=
±
=> . =
= ±
1+ 2 = −#$% + 2 ' => '= + #$% =
& ()*+ ()*, &
& , &
En appliquant –log, on obtient si alors
1+ 2
log1=O et
'=
2
II.3. condensation entre molécules d’acide α amine
II.3.1 Liaison peptidique
La condensation entre deux molécules d’acide α aminés s’obtient en éliminant une molécule d’eau entre le groupe –NH2 de l’un
et le groupe carboxyle –COOH de l’autre selon l’équation :
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Acide α aminés TS
La molécule obtenue est un dipeptide. Le groupe fonctionnel d’amide monosubstitué (–CO-NH-) qui relie les deux chaines
carbonées est appelé liaison peptidique.
II.3.2. Polycondensation : les polypeptides
On obtient un polypeptide qui est caractérisé par la présence de plusieurs liaisons peptidiques. Comme les polypeptides, les
protéines sont des polyamides. Seulement les protéines ont des chaines beaucoup plus longues, sont des macromolécules. Leurs
masse moléculaire est supérieure à 10000g/mol.
II.3. 3. Réaction entre deux acides α aminés
Considérons un mélange équimolaire de deux acide α aminés, la condensation entre ces deux molécules peut se faire de
différentes manières et on obtient quatre dipeptides différents.
CH3
O O
C HC C HGly - AlaOH
H2 N CH2 NH
OH
CH3
O O
CH3 HAla - GlyOH
O O H 2N CH C NH CH2 C
OH
H 2N CH2 C
+ H 2N HC C
CH3
O
CH3
+ H2O
OH OH O
Gly Ala H 2N CH C NH CH C
HAla - AlaOH
OH
O O
H 2N CH2 C NH CH2 C HGLy - GlyOH
OH
II.3.4 Synthèse d’un dipeptide
Pour Synthétiser un dipeptide donné (par exemple HGly-AlaOH) on doit respecter les étapes suivantes.
1er étape : blocage de la fonction –COOH de l’alanine en le transformant en ester
2eme étape : blocage de la fonction –NH2 de la glycine en le transformant en amide.
3eme étape : activation de la fonction – COOH de la glycine en le transformant en chlorure.
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Acide α aminés TS
4eme étape : formation de la liaison peptidique
5eme étape : hydrolyse libération des groupes bloqués
III. Stéréochimie des acides α amines
III.1. Carbone asymétrique
Un carbone asymétrique est un carbone lié à quatre atomes ou groupe d’atomes différents. Il est noté C*. A l’exception de la
glycine, toutes les molécules d’acides α aminés possèdent au moins un atome de carbone asymétrique.
Exemple :
H
CH3 C COOH
NH2
III.2. Enantiomères
III.2.1. Représentation en perspective : Convention de représentation
Dans l’espace les molécules sont représentées de telles sorte que certains atomes où groupements d’atomes sont soit dans le
plan, soit derrière le plan soit devant le plan. Nous reconnaissons les positions par la représentation conventionnée suivante :
COOH
H
dans le plan
C
devant le plan
derrière le plan H 3C NH 2
III.2.2. Définition énantiomères
On appelle énantiomères ou énantiomorphes ou antipôles optiques deux stéréo-isomères (molécules représentées dans l’espace)
images l’une de l’autre par rapport à un miroir plan. Les énantiomères sont non superposables.
COOH COOH
H H
C C
CH3
CH3 NH2 NH2
Stéréoisomére Stéréoisomére
Enantioméres
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III.3 Conformation et configuration
La configuration d’une molécule possédant un carbone asymétrique, est déterminée par la façon dont sont disposés les quatre
atomes ou groupes d’atomes liés au carbone asymétrique.
La configuration est différente de la conformation ; en effet pour passer d’une configuration à une autre, des rotations autours
des liaisons covalents ne suffisent pas. Il faut rompre des liaisons et échanger les positions des différents atomes liés au C*
II.4 Représentation de Fischer
Pour faire la représentation de Fischer on part de la représentation en perspective en respectant la convention suivante :
En mettant le groupe carboxyle - COOH et le groupe alkyle –R dans le plan ; de telle sorte que - COOH est placé en
haut et –R est placé en bas.
On se place entre les atomes ou groupe d’atome qui sont devant et derrière le plan en étant face au carbone asymétrique.
Et on projette la molécule dans un mur. Ces deux groupes (-COOH et –R) sont situés en arrière par rapport au plan contenant le
Exemple :
III.5. Nomenclature L et D
la nomenclature L et D dérive de la représentation de Fischer.
Une molécule est de configuration D lorsque le groupe amino –NH2 se projette à droite dans la représentation
de Fischer.
Une molécule est de configuration L lorsque le groupe amino –NH2 se projette à gauche dans la représentation de Fischer
COOH
COOH
H NH 2 H 2N H
CH 3
CH 3
(D) acide 2-aminopropanoïque
(L) acide 2-aminopropanoïque
III.6 Chiralité
Une molécule est dite chirale si elle possède un carbone asymétrique. Et le carbone asymétrique est appelé centre de chiralité.
Une molécule chirale n’est pas superposable à son image dans un miroir plan. Lorsque deux molécules sont des énantiomères
chacune d’elles est chirale.
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IV. Activité optique
Une molécule est optiquement active si elle fait tourner le plan de la lumière polarisé vers la gauche ou vers la droite. Une
molécule possédant un atome de carbone asymétrique est optiquement active. Si la molécule fait dévier le plan de la lumière vers
la gauche, elle est dite lévogyre et est notée (-) son pouvoir rotatoire est négatif. Si la
déviation est vers la droite, elle est dite dextrogyre et elle est notée (+) son pouvoir rotatoire
est positif.
Remarque :
− Il n’existe pas de relation entre la configuration L ou D d’un acide α aminé et son
caractère dextrogyre ou lévogyre. Exemple : la L-alanine est dextrogyre (+)
− Un mélange équimolaire (50%) de chacun des énantiomères est optiquement
inactif : c’est un mélange racémique.
Exercice d’application
On se propose d'étudier l'alanine CH3 ─ CHNH2 ─ COOH qui est un acide α-aminé.
Cet acide peut se présenter sous trois formes en solution aqueuse :
On donne : pKA1 = 2,35 et pKA2 = 9,87
a) i. Donner le nom général de chacune de ces trois formes.
ii. Donner la définition du pH-isoélectrique (pHi) et déterminer sa valeur.
iii. Définir, sous forme de diagramme, des domaines de prédominance et de coexistence de ces trois formes en fonction du pH de
la solution dans laquelle se trouve l'alanine.
b) Deux de ces trois formes sont en équilibre à pH = pKA1 = 2,35.
i. Ecrire l'équation de l'équilibre.
ii. Exprimer le pH en fonction de la concentration des deux formes et de pKA1.
c) Le pK2 du deuxième couple est égal à 9,87.
i. Ecrire l'équation d'équilibre.
ii. Exprimer le pH en fonction de la concentration et de pKA2.
d) On considère une solution d'alanine de concentration C = 0,1 mol.L−1.
Calculer les concentrations des trois formes :
i. lorsque pH = 2,60
ii. puis lorsque pH = 9,20.
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