UNIVERSITE CADI AYYAD, FACULTE DES SCIENCES SEMLALIA
DEPARTEMENT DE BIOLOGIE
Examen de rattrapage 17 janvier 2019
S3-SV Biochimie Structurale
2 Heures
Correction de la partie Protéines - Lipides
Nom : N° de table Note/20
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Prénom : N° Apogée
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1) Répondre sans justifications de calculs : Quelle sera la longueur en paires de bases (pb) et en
mètre (m) d’un ADN bicaténaire forme B dont le poids moléculaire est de 1,7.109 daltons ? Quelle
sera sa composition en %(G+C) sachant que le rapport T/C=3 ?
Longueur en pb = Longueur en m = %(G+C) =
2) Parmi les 8 amorces suivantes, quelles sont les deux amorces qui permettent l’amplification par PCR du
segment d’ADN représenté ci-dessous ? Quelle sera la longueur totale de l’ADN amplifié ?
N°AMORCES :
1- 5’ GATTCAGGAGATTCACAC 3’
2- 5’ CTAAGTCCTCTAAGTGTG 3’
3- 5’ CACACTTAGAGGACTTAG 3’
4- 5’ TCGGTACAGCTATACAGG 3’
5- 5’ AGCCATGTCGATATGTCC 3’
6- 5’ GTGTGAATCTCCTGAATC 3’
7- 5’ CCTGTATAGCTGTACCGA 3’
8- 5’ GGACATATCGACATGGCT 3’
SEGMENT D’ADN :
5’ GATTCAGGAGATTCACAC----------------- 700 nucléotides -----------------TCGGTACAGCTATACAGG 3’
3’ CTAAGTCCTCTAAGTGTG----------------- 700 nucléotides -----------------AGCCATGTCGATATGTCC 5’
Amorces N° : Longueur de l’ADN =
3) Un mélange peptidique est constitué des oligopeptides suivants :
A : Ala-Asp B :Trp-Gly-Met C : Lys-Val
a- Dans quelle zone de pH (acide, basique ou neutre) se situent les pHi de ces 3 peptides ?
A : Acide B : Neutre C : Basique
b- Le mélange est soumis à une chromatographie sur résine échangeuse d’anions. Quel est
l’ordre d’élution lorsqu’on fait varier le pH de 12 à 1 ?
C, B, A : (on va des pH basiques vers les pH acides)
c- Ecrire la formule semi-développée du peptide A sachant que les chaines latérales sont :
–CH3 pour Ala et –CH3–COOH pour Asp.
Rouge : Ala, Bleu : Asp, Noir : liaison peptidique, vert : pKa
d- Déterminer le pHi de C sachant que les pK des aminoacides qui le constituent sont :
Lys : pK1 = 2,2 ; pK2 = 9,06 ; pKR = 10,54
Val : pK1 = 2,3 ; pK2 = 9,8
pHi = (9,06 + 10,54)/2 = 9,79 Schématiser le peptide par un trait portant les 3 fonctions
ionisables, écrire les équilibres de dissociation et faire la moyenne des 2 pK qui encadrent
la forme A(+/-)
4) Une protéine P contient 2% de méthionine en pourcentage pondéral.
5) Elle est mélangée à 2 protéines A et B de masses molaires (MM) respectives 8000 et 15000. Le
mélange est soumis à une chromatographie d’exclusion où P elle est éluée entre A et B.
Calculer sa MM minimale et sa MM réelle sachant que le PM du résidu Met est égal à 113.
MMmin = 5650 MMréelle = 11300
6) Déterminer la séquence du peptide P sachant que :
a- Sa composition globale est : Met, Cys, Arg, Tyr, Ser, et Val
b- Son traitement par les carboxypeptidases A et B libère Val.
c- La réaction récurrente d’Edman permet de libérer PTH-Cys, suivie de PTH-Ser
d- Son hydrolyse chymotrypsique libère un acide aminé libre et un hexapeptide
e- L’action du CNBr sur l’hexapeptide précedent donne 1 tripeptide et 2 dipeptides.
Cys-Ser-Met-Arg-Met-Tyr-Val
7) Représenter par la formule semi-développée ou par le squelette carboné l’acide gras
cis,cis di-insaturé de la famille ω6 à 18 atomes de carbone :
8) Donner la formule brute d’un acide gras à n atomes de carbone et x insaturations:
CnH(2n-2x)O2
9) Ecrire l’équation de la réaction d’addition d’iode sur l’acide gras précédent et établir
la relation entre l’indice d’iode, le nombre d’insaturations et le poids moléculaire :
On donne PM(I2) = 254
Voir exercice 8 du TD lipides
10) Représenter par la formule semi-développé le triglycéride homogène saturé dont
l’indice de saponification est de 357,5 :
On donne PMKOH = 56 ; PMH2O = 18 et PMGlycérol = 92
Voir exercice 7 du TD :
Déterminer d’abord le PM du TG (PM=470), ensuite déterminer le PM de l’AG.
Puis déterminer le nombre n d’atomes de C sachant que la formule brute est
CnH2nO2.
Ensuite écrire la formule semi développée du triglycéride
L’AG est l’acide caprilyque C8H16O2 (Nom systématique : acide octanoïque)
