MASTER
BIOINFORMATIQUE
Parcours
BioInformatique, Modélisation et Statistique (BIMS)
Compétences Complémentaires en Bioinformatique Biostatistique
pour la Biologie et les sciences Biomédicales (CCB4)
Formation accessible en :
FORMATION INITIALE FORMATION EN ALTERNANCE ENSEIGNEMENT FORMATION CONTINUE
Contrat de professionnalisation Partiellement à distance Demandeurs d’emploi
Contrat d’apprentissage Salariés
Campus Mont-Saint-Aignan
sciences-techniques.univ-rouen.fr
Devenez Ingénieur(e) Bioinformaticien(ne) Les diplômés sont formés à relever les défis du Big
Poursuivez en Thèse Data en biologie à partir de données de nature
très différentes (données moléculaires telles que
avec le parcours BIMS séquences génomiques et transcriptomiques, don-
en alternance et apprentissage nées protéomiques et métabolomiques, structures
BioInformatique Modélisation et Statistique protéiques, données cliniques, textes scientifiques
Diplômant en 2 ans ½ etc.) dont l’exploitation seul ou par des méthodes
Stage M1 de 4 mois + Alternance 1 an ½ en M2 d’intégration permet d’explorer la complexité du
+ (non obligatoire) Stage international vivant, de l’échelle moléculaire jusqu’à l’organisme.
post-apprentissage de 4 mois
Le programme d'enseignement d'environ 1200h de
Accessible à Bac +3 haut niveau à la fois généraliste, fondamentale et
technologique, combiné à au moins 22 mois d’ex-
Le parcours BIMS vise à former des ingénieur.es périence professionnelle, assure la maitrise de tous
bioinformaticien.nes et data scientist capables de les aspects des métiers du domaine, une insertion
combiner l’Informatique, les Statistiques et les mé- exceptionnelle le plus souvent immédiate et l’adap-
thodes de l’Intelligence Artificielle pour gérer, trai- tation nécessaire à un marché de l’emploi très de-
ter, analyser et modéliser de grandes quantités de mandeur et évolutif.
données du vivant, pour la recherche en Biologie, la L'évaluation est réalisée en contrôle continu inté-
Médecine et les applications Biotechnologiques et gral sous format variés, dont nombreux travaux en
Pharmaceutiques. équipe.
M1
450h pour acquérir compétences et autonomie dans des laboratoires de recherche en biologie,
pour la « gestion et l'analyse de données massives bioinformatique ou des plateformes technologiques
en biologie ». Le stage de longue durée et rémunéré de service, dans le secteur public ou privé en France
de 4 à 6 mois offre une première immersion ou à l'international.
professionnelle directe au cœur du domaine,
S1 BIMS S2 BIMS
Programmation 1 Systèmes et réseaux informatiques
• 50h (5 CE) • 24 h (2 CE)
Langages : Python - Technologies web 1 Sciences des données 1
Modélisation Statistique et mathématiques • 90 h (8 CE)
• 40h (4 CE) Système de Gestion de Bases de Données 1,
Modélisation statistique - Algèbre linéaire Analyse de données et exploration avec R 1,
Analyse bioinformatique en sciences omiques 1 Analyse de données et calcul scientifique
avec Python (Machine Learning)
• 45h (5 CE)
Analyse de données NGS et annotation 1, Analyse bioinformatique en sciences omiques 2
Analyse de données en protéomique 1 • 24h (4 CE)
Génomique Transcriptomique Environnement professionnel 2
• 40 h (4 CE) • 22 h (2 CE)
Veille et communication scientifique,
Évolution des génomes et phylogénie Ingénierie logicielle 1 : bonnes pratiques de
• 30h (3 CE) développement (pratiques FAIR)
Variabilité génétique et santé Stage
• 20h (3 CE) • 4 mois ou plus (14 CE)
UE à choix 1re immersion sous convention de stage avec
• 40h (3 CE) gratification en France ou à l'international
Métabolome Protéome Fluxome, avec possibilités de bourses de mobilité.
Ou Biologie structurale
Environnement professionnel 1
• 30h (3 CE)
Anglais, Métiers de la bioinformatique
M2
600h pour étudier de façon approfondie tous les 2e immersion professionnelle longue, l'alternance
aspects des compétences requises pour les carrières sous contrat de travail durant 17 mois est gage d'un
en bioinformatique à l’ère de l’intelligence apprentissage en phase avec les métiers.
artificielle, allant du traitement et de l'analyse des
données à l'innovation logicielle.
S3 BIMS (alternance 1 an) S4 BIMS (alternance 6 mois)
Programmation 2 Langage C et POO avec Python Sciences des données 3
• 40h (3 CE) • 60h (6 CE)
Algorithmique et structures de données Ontologie pour web sémantique,
• 70h (4 CE) Apprentissage profond avec Python
Modèles de Markov et de Markov cachés (deep learning)
• 40h (3 CE) Technologies web 2 :
Sciences des données 2 échanges et sécurités des données
• 84h (6 CE) • 30h (3 CE)
SGBD 2 : noSQL et optimisation, Environnement professionnel 4
Analyse de données et exploration avec R - 2, • 40h (3 CE)
Apprentissage automatique avec Python Anglais,
(machine learning) Insertion : réussir son entretien,
Analyse bioinformatique en sciences omiques 3 Systèmes dynamiques,
• 26h (3 CE) réseaux et intégration de données
Bioinformatique en génomique comparative • 70h (5 CE)
• 60h (4 CE) Modélisation et systèmes dynamiques en
Bioinformatique structurale et drug design biologie,
• 40h (3 CE) Réseaux, interactions et intégration de
Environnement professionnel 3 données
• 40h (2 CE) Mission professionnelle en alternance 2
Anglais, • Alternance 2
Communication scientifique, ou
Ingénierie logicielle : Développement RShiny • Alternance 2 et stage international
Mission professionnelle en alternance 1
• Contrat de 17mois (2 CE) 3e immersion professionnelle, le stage en post-al-
Rythme : des périodes de 2 semaines d’ensei- ternance pouvant aller jusqu’à 6 mois, encadrée
gnement à l’URN ou à distance alternant avec par une convention de stage et offrant des aides à
des périodes de 3 à 8 semaines au travail. la mobilité. Fortifier son dossier pour poursuivre en
thèse et franchir un cap supplémentaire très enri-
chissant personnellement et professionnellement.
Enrichissez vos compétences - Dynamisez votre carrière de Biologiste
avec le parcours CCB4
Compétences Complémentaires en Bioinformatique Biostatistique
pour la Biologie et les sciences Biomédicales
Diplômant en 1 an - Stage de 4 à 6 mois
Accessible à Bac +5
450h pour acquérir compétences et autonomie dans des laboratoires de recherche en biologie
pour la « gestion et l'analyse de données ou des plateformes technologiques de service,
massives en biologie ». Le stage de longue dans le secteur public ou privé en France ou à
durée et rémunéré de 4 à 6 mois offre un l'international.
tremplin professionnel au cœur du domaine,
INSERTION PROFESSIONNELLE CANDIDATURE
Les domaines d’applications et enjeux sont Critères et modalités :
multiples en matière de santé, agronomie Parcours BIMS :
ou environnement : recherche en biologie, M1 sur MonMaster, M2 sur e-candidat URN
médecine personnalisée et nouveaux traitements, Parcours CCB4 :
agriculture et biotechnologies alimentaires, sur-e-candidat URN
biodiversité, changement climatique et
préservation des écosystèmes.
Les diplômés du parcours BIMS s’insèrent comme 25 ans que nous formons
ingénieurs, en France ou à l'international, dans des
structures de recherche publics des universités les bioinformaticien.nes de demain
et grands organismes, des centres hospitaliers
et Centres de Lutte Contre le Cancer, en R&D du Intégrer le master de bioinformatique de l'URN c'est
secteur privé des bioindustries, biotechnologies, choisir :
des groupes pharmaceutiques (plus : consulter • un programme pluridisciplinaire unique en
https://www.sfbi.fr/). France en 2 ans 1/2 ou 3 ans, ambitieux et à la
Les diplomés du parcours CCB4, fort de leurs pointe, mais progressif et approfondi, sans
nouvelles compétences, s'insèrent comme cesse renouvelé adapté aux enjeux,
ingénieur ou selon leur parcours antérieur • un savoir-faire pédagogique et le bénéfice de
poursuivent en thèse, accèdent à des post- nombreux intervenants extérieurs,
doctorats en France ou à l'international, sur • la combinaison gagnante de l'alternance et de
des projets alliant expérimentations et analyses l'international, et aussi la participation à des
bioinformatiques. congrès de la recherche scientifique,
• 22 à 28 moins d'expérience professionnelle
partout en France et l'International
CONTACT CFCA • la gratuité et à l'inverse un salaire pour
apprendre grâce à l'apprentissage et les stages
rémunérés,
Centre de Formation Continue et par Alternance • un maillage de partenaires académiques et
Bâtiment Michel Serres, rue Thomas Becket privés prestigieux, historiques et renouvelés
76 821 Mont-Saint-Aignan Cedex pour vos immersions au coeur du métier dont
cfa-cfc.univ-rouen.fr un solide réseau d'alumni,
02 35 14 60 76 • un accompagnement et un suivi personnalisé
tout au long de la formation,
• un passeport pour une insertion d'exception,
[email protected] le plus souvent immédiate ou la poursuite en
[email protected] thèse.
CONTACT RESPONSABLES PÉDAGOGIQUES
Hélène Dauchel - Directrice de la mention http://masterbioinfo.univ-rouen.fr
Laboratoire LITIS EA 4108 – Équipe TIBS
Institut for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB)
M2 BIMS - Hélène Dauchel
[email protected]M2 CCB4 - Caroline Bérard
[email protected] [email protected] UNIVERSITÉ DE ROUEN NORMANDIE
UFR Sciences et Techniques
Novembre 2024
Place Émile Blondel - 76821 Mont-Saint-Aignan cedex
02 35 14 64 66
[email protected] helpetu.univ-rouen.fr