Maladies gastro-duodénales d’origine bactérienne
1. Définition
Les maladies gastro-duodenales d’origine bacterienne regroupent des
affections comme la gastrite, les ulceres gastroduodenaux, et des
complications graves comme le cancer gastrique ou le lymphome du MALT.
L’agent principal est Helicobacter pylori, une bacterie spiralee qui colonise la
muqueuse gastrique.
2. Symptômes
• Symptomes communs : Douleur epigastrique (brulures,
crampes), ballonnements, eructations, nausees, vomissements.
• Complications : Vomissements de sang (hematemese), selles
noires (melena), perforation gastrique.
3. Méthodes de diagnostic
a) Phase pré-analytique
Conditions à respecter avant la biopsie :
1. Jeune prealable :
• Le patient doit etre a jeun pendant 6 a 8 heures avant l’endoscopie pour
eviter la presence de residus alimentaires dans l’estomac.
2. Arret des medicaments :
• Les antibiotiques doivent etre arretes au moins 4 semaines avant le
test, car ils peuvent eliminer ou reduire la charge bacterienne.
• Les inhibiteurs de la pompe a protons (IPP) (ex. omeprazole) doivent
etre suspendus 2 semaines avant le prelevement pour eviter une diminution
de la charge bacterienne et un faux negatif.
3. Absence d’hemorragie digestive :
• L’endoscopie est plus difficile a interpreter en cas d’hemorragie active.
4. Site de prelevement :
• Les biopsies sont prelevees au niveau de l’antre gastrique et du corps
gastrique pour maximiser la detection de la bacterie, car H. pylori peut se
localiser de maniere inegale.
1. Prélèvements biologiques
• Biopsies gastriques via fibroscopie : Prelevements pour analyses
histologiques, culture bacterienne et tests biochimiques.
• Selles : Pour la recherche d’antigenes ou analyse PCR.
• Sang : Tests serologiques pour detecter des anticorps anti-H.pylori.
2. Transport des échantillons
• Biopsies placees dans un milieu de transport specifique (ex. Stuart ou
Amies) et conservees a 4 °C.
Résultat attendu à cette étape : Les echantillons doivent etre en bon etat,
sans contamination ni degradation, pour garantir des analyses fiables.
b) Phase analytique
b-1)Méthodes non invasives (ne nécessitant pas d’endoscopie)
:
• Test respiratoire a l’uree marquee : Le patient ingere de l’uree marquee
au carbone (13C ou 14C). Si H. pylori est present, l’urease qu’il produit
degrade l’uree en dioxyde de carbone, detectable dans l’haleine.
• Serologie : Recherche d’anticorps specifiques contre H. pylori dans le
sang. Utile pour detecter une infection passee ou actuelle.
• Recherche d’antigenes dans les selles : Detection des antigenes de H.
pylori dans les echantillons fecaux.
b-2)Méthodes invasives (nécessitant une endoscopie) :
• Biopsie gastrique : Prelevement de tissu au niveau de l’estomac ou du
duodenum.
• Examen histologique : Observation directe de la bacterie en utilisant
des colorations speciales comme la coloration de Giemsa ou Warthin-Starry.
• Test rapide a l’urease : H. pylori produit une grande quantite d’urease.
Un echantillon de biopsie est place dans un milieu contenant de l’uree et un
indicateur de pH : un changement de couleur indique la presence de la
bacterie.
• Culture bacterienne : La bacterie peut etre isolee et cultivee dans des
conditions specifiques (microaerophiles).
c) Identification bactérienne :
L’identification d’H. pylori se fait grace a differentes techniques cliniques et
de laboratoire :
Présentation générale de Helicobacter pylori
Morphologie et caractéristiques :
• Classification : Bacterie Gram-negative, microaerophile (a besoin de
faibles concentrations d’oxygene).
• Forme : Spirale ou helicoïdale, ce qui lui permet de se deplacer
facilement dans le mucus gastrique.
• Flagelles : Presence de plusieurs flagelles (4 a 6) pour sa motilite
rapide.
• Taille : Environ 2 a 3 micrometres de long.
Habitat :
H. pylori colonise principalement la muqueuse de l’estomac humain. Elle est
adaptee aux conditions hostiles de l’estomac (acidite elevee) grace a :
• La production d’urease : Cette enzyme degrade l’uree en ammoniac,
neutralisant localement l’acidite gastrique.
• Sa capacite a adherer aux cellules epitheliales de l’estomac grace a des
proteines specifiques.
1. Observation microscopique directe
• But : Observer directement la morphologie de H. pylori.
• Matériel :
-Lames, lamelles.
-Colorants specifiques (Giemsa ou Warthin-Starry).
-Microscope optique (objectif x100 avec huile a immersion).
Étapes :
1. Fixer un fragment de biopsie sur une lame.
2. Appliquer le colorant (selon la methode choisie).
3. Observer au microscope.
Résultat attendu : Visualisation de bacteries spiralees ou en forme de
batonnets, specifiques a H. pylori.
• Si absence de bacteries : poursuivre les analyses pour confirmation
(tests biochimiques ou culture).
2. Mise en culture bactérienne
• But : Isoler et faire croïtre H. pylori.
• Materiel necessaire :
• Milieux de culture specifiques :
• Agar chocolat ou milieu Columbia enrichi en sang.
• Milieu selectif contenant des antibiotiques (ex. vancomycine pour
eliminer d’autres bacteries).
• Atmosphere microaerophile : Incubateur avec 5 % d’O₂, 10 % de CO₂.
Étapes :
1. Ensemencer une biopsie ou un echantillon sur le milieu de
culture a l’aide d’une anse sterile.
2. Incuber a 35-37°C pendant 3 a 7 jours.
Résultat attendu : Apparition de petites colonies translucides, brillantes et
non pigmentees.
• En cas d’absence de croissance : considerer d’autres causes
(mauvais transport, faible concentration bacterienne) et realiser des tests
moleculaires (PCR).
3. Tests biochimiques
1. Test rapide à l’uréase
• But : Detecter l’activite ureasique specifique de H. pylori.
• Materiel : Tube contenant de l’uree et un indicateur de pH (phenol
rouge).
• Étapes :
1. Placer un fragment de biopsie dans le tube d’urée.
2. Observer le changement de couleur dans les 24 heures.
• Résultat attendu : Changement de couleur du milieu (jaune →
rouge/rose), indiquant la production d’ammoniac par l’enzyme urease.
2. Catalase et oxydase
• Catalase : Bulles apres ajout de H₂O₂.
• Oxydase : Formation d’une coloration violette.
Résultat attendu : Ces tests doivent etre positifs pour confirmer la presence
de H. pylori.
c) Antibiogramme
1. Préparation
• Preparer une suspension bacterienne normalisee (equivalente a 0,5
McFarland).
• Inoculer un milieu Mueller-Hinton enrichi.
2. Application des disques d’antibiotiques
• Disques impregnes de clarithromycine, amoxicilline, metronidazole,
• Placer les disques a egale distance sur le milieu ensemence.
3. Incubation
• Incuber a 35-37°C pendant 24-48 heures dans une atmosphere
microaerophile.
4. Lecture des résultats
• Mesurer les zones d’inhibition autour des disques.
Résultat attendu :
• Sensible : Large zone d’inhibition.
• Resistant : Aucune ou petite zone d’inhibition.
Les resultats orientent le choix du traitement antibiotique.
4. Identification moléculaire (PCR)
• But : Detecter l’ADN specifique de H. pylori.
• Materiel :
• Echantillons d’ADN (issus de biopsies ou culture).
• Amorces specifiques pour un gene cible (ex. urease).
• Thermocycleur.
Étapes :
1. Extraire l’ADN des echantillons.
2. Amplifier les sequences cibles par PCR.
3. Verifier les produits d’amplification sur gel d’agarose.
Résultat attendu : Bande d’ADN specifique de la taille attendue (ex. 294 pb
pour le gene de l’urease).
• Si negatif : exclure H. pylori comme agent causal.
d) Phase post-analytique
• Integration des resultats (tests biochimiques, culture, antibiogramme)
pour confirmer ou exclure l’infection.
• Redaction d’un rapport detaille avec recommandations
therapeutiques.
4. Traitement
a) Therapie specifique pour H. pylori
1. Therapie triple :
• Omeprazole (IPP) + amoxicilline + clarithromycine pendant 10-14
jours.
2. Therapie quadritherapie (en cas de resistance) :
• Bismuth + metronidazole + tetracycline + IPP.
b) Suivi post-traitement
• Test respiratoire ou detection d’antigenes fecaux 4 a 6 semaines apres
traitement pour confirmer l’eradication.
Transmission :
• Mode de transmission :
• Oral-oral (salive, partage d’ustensiles).
• Fecal-oral (eau ou aliments contamines).
• L’infection est souvent acquise durant l’enfance, en particulier
dans les regions ou les conditions sanitaires sont precaires.
Conclusion
Chaque etape d’analyse, de l’observation microscopique jusqu’a
l’antibiogramme, permet de confirmer le role de H. pylori ou d’autres
bacteries dans les maladies gastro-duodenales et d’orienter un traitement
cible et efficace. Une prise en charge rigoureuse previent les complications
graves comme les ulceres ou le cancer gastrique.
