Les Acides Nucléiques
Les Acides Nucléiques
1 . Introduction générale
• ADN - ARN- macromolécules –5à 15% du poids—conservation-mat génétique-Information—tous les Ҫ -microbes -
virus – str universelle - unités nucléotides ---polynucléotides - hdrolyse - 3 composés fond:
• 1) base azoté 2) pentose 3) ac phosphorique
• Autres rôles métabolisme – Energie (ATP)- CoEnz (NAD+ et FAD)
• 2. Les bases azotés
Adenine : A
6-aminopurine
Guanine G
2-amino-6-hydroxypurine
les bases pyrimidiques
• Cytosine C
• 2-Hydro-4-aminopyrimidine
• Uracile U
• 2,4-dihydroxypyrimidine
• Thymidine T
• 5-méthyl-uracile
Les bases pyriques A et G
2. Les nucléosides
Base purique ou pyrimidique + ribose ou désoxyribose
N9 base purique; N1 base pyrimidique ; avec C1
du ribose ou désoxy-2-ribose β
Nucléoside Adénosine
Nucléoside désoxythymidine
2.1. nomenclature
• Base Ribonucléoside Désoxyribonucléoside
• Adénine Adénosine Désoxyadénosine
• Guanine Guanosine Désoxyguanosine
• Cytosine Cytidine Désoxycytidine
• Thymine ----------- Désoxythymidine
3. Les nucléotides
Esters phosphorique de nucléosides qui donne –Ribonucléotides ou désoxyribonucléotides
Succivement en 2’, 3’ et ou 5’ et pour les désoxy en 3’ et ou 5’ donnant des isomères
AMP cyclique est un nucléotide ou le phosphore estérifie 2 OH 3’ et 5’ en m^me temps
Nomenclature
Nucléotide = nucléoside + P
Nucléosides mono-di-tri-phosphates isomères 5’,2’ ou 3’
Adénine AMP : Adénosine 5’ Phosphate
ADP : Adénosine 5’ di Phosphate
ATP : Adénosine 5’ triphosphate (sauf thymine)
dAMP désoxy adénisine 5’P
dADP désoxy ---- di P
dATP désoxy tri P
Idem Guanine, Cytosine, Uracile et Thymine (uracile pas de désoxy)
Les constituants ARN : ATP, GTP, CTP et UTP et analogues
Les constituants ADN: dATP, dAGTP, dCTP et dTTP et analogues
MM moyenne d’un nucléotide 310 g/mole
Autres nucléotides. UDPG, AMPc, GMPc, FAD, NAD, PAPS et CDP-choline
4. Structure des Acides Nucléiques
4.1. Les Acides Ribonucléiques ARN
Constituants, AMP,GMP,CMP,et UMP liaison 3’ et 5’ phosphodiester
Str primaire : 5’ p-U-A-C-G- p3’ avec 5’ terminal et ------------------------------ 3’ terminal
• Structure spatiale des ARN
• Str spatiale : str hélicoïdale, appareiment A=U et G_=C et str hazard sens 5’ ---3’
•
Différentes types d’ARN codant ou non : - ARN ribosoamux : de 100 à 5000 b
(associés à des prot 50S, 80S etc)
- ARN de transfert : de 75 à 90 b feuille de trèfle
- ARN messagers : fonction du gène transcrit de 100 à 1000 durée de vie brève
4.2. Les Acides désoxyribonucléiques ADN
Constituants, dAMP, dGMP, dCMP,et dTMP liaison 3’ et 5’ phosphodiester pas de OH 2’
Str primaire : 5’ p-T-A-C-G- p3’ avec 5’ terminal et ------------------------------ 3’ terminal
• Autant de A et T car A = T
• Autant de G et C car G=C
• Structure spatiale des ADN
• Watson et Crick (1954), double hélice-bicaténaire-hélicoïdale –complémentaire-
hybridation-antiparalléle
• propriétés des enzymes de restriction
• Endo, exo nucléase- très spécifique-exonucléase : phosphodiestérase de venin de
serpent liaison P et C3’ du ribose attaque l’extrémité 3’ et libère le nucléoside
monophosphate 5’.
• Exemple Hind III enz tres sp du site AAGCTT coupe entre A et A des 2 cotés
• TTCGAA
TD Acides nucléiques. Exercice
•
Pour une cellule de Mammifères, le poids moléculaire de l'ADN nucléaire natif est de
9.10 daltons.
•a-Quelle est la longueur en pb et en mètre de cet ADN (conformation B de W et C)?
•b- La composition en bases de cet ADN montre un rapport A/G=4. Donner le
pourcentage de chaque base pour cet ADN
•c-Connaissant la Tm du poly-d-AT (69,3°C) et du poly-d-CG (110°C), quelle sera La Tm
de cet ADN, dans les mêmes conditions expérimentales?
•Corrigées Acides nucléiques.
•
•Rappel : Masse molaire des nucléotides : AMP = 313 ;GMP = 329 ;UMP = 290 ;TMP =
304 ;CMP = 289
•Pour un ADN on prend (en général) une masse molaire moyenne de 300
•dans un tour d’hélice dans conformation B on a 10 pb un pas = 3.4 nm
•Distance entre 2 nucléotide 0.34 nm
•910/300 = 3 10 nb de nucléotides soit 1,5 10 pb
•1,5 10pb X 0.34 10 m = 0.5 m
•a-: Longueur de l'ADN = 1,5. 10 pb = 0,51 m;
b-: %C = %G = 10%et %A = %T = 40%.
c-: Tm = 77,44°C
