Évaluation de l’évolution du caractère multirésistant des
Bacilles Gram Négatif isolés chez les Patients à Toxi-Labo de
Janvier à Juin 2024
Sous la Direction de :
Dr Victorien T. DOUGNON
Sommaire
I- Titre
II- Synthèse bibliographique
III- Objectifs
IV- Méthodologie
V- Collecte des données et analyse des échantillons
VI- Analyse et traitement des données
VII- Résultats attendus
VIII- Chronogramme
IX- Budget de l’étude
X- Références
I. Titre Évaluation de l’évolution du caractère multirésistant des Bacilles
Gram Négatif isolés chez les Patients à Toxi-Labo de Janvier à Juin
2024
II. Synthèse bibliographique
Les bactéries multirésistantes (BMR) sont décrites comme étant « des
bactéries présentant de nombreuses résistances par comparaison au
phénotype sauvage de l’espèce auxquelles elles appartiennent ». Cela
implique que la qualification d’une souche en tant que BMR résulte
nécessairement de l’acquisition par celle-ci de systèmes de résistance. En
effet, le plus souvent ces souches conjuguent divers systèmes de
résistance à une ou même plusieurs familles d’antibiotiques.
Les antibiotiques ont donc constitué une découverte thérapeutique
importante pour la santé humaine. Leur utilisation a permis de diminuer
le taux de mortalité et de morbidité mondiale depuis longtemps.
Cependant, le mauvais usage de ces agents antimicrobiens et leur
utilisation accrue ont eu pour conséquence de faire apparaître certaines
formes de résistances des souches microbiennes contrebalançant les
effets des antibiotiques. Les bactéries pathogènes, grâce à leur flexibilité
et plasticité génétique, sont capables de mettre en place un programme
de résistance spécifique contre un antibiotique particulier. En effet,
certaines souches arrivent à rétablir une Multirésistance vis-à-vis de
plusieurs antibiotiques à la fois donnant lieu à ce qu’on appelle les
bactéries multirésistantes aux antibiotiques (multidrugs resistantes ou
MDR). Parmi ces bacilles, on trouve des espèces cliniquement
importantes comme Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae,
Pseudomonas aeruginosa, et Acinetobacter baumannii. Ces bactéries
peuvent causer une gamme d'infections, allant des infections urinaires et
respiratoires aux septicémies sévères, souvent associées à des taux de
morbidité et de mortalité élevés.
III. Objectifs
Objectifs général
Il s’agira de mettre l’accent sur les espèces des bacilles Gram Négatifs qui ont
un risque élevé de développer un caractère multirésistant afin de pouvoir
anticipé l’usage des antibiotiques sur ces espèces.
Objectifs Spécifiques
OS1 : Déterminer la prévalence du profil de multiresistance des espèces des
bacilles gram Négatifs isolés à Toxi-labo de Janvier à Juin 2024.
OS2 Expliquer pour chaque espèce de bacille Gram négatif le risque de
développer un caractère multirésistant à travers les mécanismes de résistance.
Activités à réaliser pour l’objectif spécifique 1
1. Déterminer la Prévalence des types d’échantillons dans lesquels l’on a
isole les Bacilles Gram Négatifs obtenus de Janvier à juin 2024
2. Vérifier le sexe et l’âge de chaque patient
3. Déterminer la prévalence des espèces des Bacilles Gram Négatifs isoles à
Toxi-labo de Janvier au Juin 2024
Activités à réaliser pour l’objectif spécifique 2
1. Déterminer pour chaque genre de Bacille Gram Négatif la prévalence des
espèces multirésistantes
2. Déterminer le risque d’apparition du caractère multirésistant pour
chaque espèce donnée
VI. Methodologie
4.1Cadre d’étude
4.1.1. Cadre institutionnel
L’Ecole Polytechnique d’Abomey- Calavi (EPAC), ex Collège Polytechnique
Universitaire (CPU) a été créé en février 1977. C’est un établissement
universitaire public à caractère scientifique. Elle est basée dans la formation
professionnelle et la promotion de la recherche scientifique et technologique.
Elle est constituée de deux secteurs que sont : le secteur industriel et le secteur
biologique. Elle dispose également de plusieurs laboratoires et aussi des unités
d’applications qui offrent des prestations de services au public et qui
constituent des plateaux de renforcement d’aptitudes pratiques. Nous avions
reçu notre formation dans le secteur biologique plus précisément dans le
département de Génie de Biologie Humaine(GBH).
4.1.2 Cadre technique et cadre de manipulation
Le laboratoire « TOXI-LABO » est un laboratoire privé d’analyses biomédicales
de Cotonou. Il a été fondé vers 1989 par Feu Docteur ADEBO Falilou Docteur en
Pharmacie et en Toxicologie. Il est actuellement dirigé par le Général
Professeur ABDOULAYE Idrissou. Il est le Directeur. Il est situé dans le septième
arrondissement de Cotonou au quartier Maro-millitaire, rue 204. Le laboratoire
est situé à l’angle droit de la rue faisant face à la rue de Benin Royal Hôtel juste
au niveau de l’entreprise BÂTIMAT.
Matériel
Matériel Biologique
Tous échantillons admis à Toxi-Labo pour un examen Cytobactériologique.
- Etude Cytobactériologique des urines ECBU
- Etude Cytobactériologique de Prélèvement Vaginal
- Etude Cytobactériologique du Prélèvement urétral
- Etude Cytobactériologique du Prélèvement de Pus
- Spermoculture
- Coproculture
- Etude Cytobactériologique du liquide Céphalo Rachidien
- Etude Cytobactériologique du liquide d’ascite
- Etude Cytobactériologique du liquide Pleural
- Etc…
Méthode d’étude
Type d’étude
Il s’agit d’une étude rétrospective de Janvier à Juin 2024
Critère d’inclusion
- Privilégier le dossier des échantillons qui ont été positifs à une
identification et à un antibiogramme
- Dossier des échantillons dont on isolé les Bacilles Gram Négatifs BGN.
Critère d’exclusion
Échantillons dont on a isole autres espèces que les bacilles Gram négatif.
Échantillons ayant subi une contamination ou une dégradation
Données incorrectes ou incomplètes concernant les tests de résistance.
Collecte des Données
Collecter des données des échantillons de BGN isolés de Janvier à juin 2024
Nombre d’échantillon supérieur ou égal à 100
Activités
Collecter dans la base de donnée de bactériologie les données des patients
<< Age, Sexe, Résultats>> dont on a isolé les Bacilles Gram Négatifs BGN.
Consulter le résultat de l’antibiogramme de ces différents échantillons pour
pouvoir déterminer le profil de résistance des bacilles Gram Négatifs isoles
Classifier les souches selon leur profil de résistance (sensible, résistante,
multirésistantes).
Méthodologie
Cette étude sera faite en 3 étapes distinctes :
Étape pré analytique
Étape Analytique
Étape Post analytique
Étape pré-analytique
1. Préparation du patient :
- Instructions spécifiques, comme éviter certains antibiotiques avant le
prélèvement.
2. Prélèvement de l'échantillon :
- Types d'échantillons : sang, urine, sécrétions, Sperme, etc.
- Techniques de prélèvement stériles pour éviter la contamination.
Étape analytique
1. Examen macroscopique :
- Observation de l'échantillon pour des caractéristiques visibles comme la
couleur, la consistance, l'odeur, etc.
2. Préparation et culture de l'échantillon :
- Ensemencement sur différents milieux de culture (géloses spécifiques selon
les bactéries recherchées).
- Incubation à des températures appropriées (généralement 35-37°C)
pendant une période définie.
3. Examen microscopique :
- Réalisation de frottis et colorations (par exemple, coloration de Gram) pour
observer la morphologie et la coloration des bactéries.
- Observation au microscope pour identifier la forme (cocci, bacilles, etc.) et la
disposition des bactéries (chaînes, amas, etc.).
4. Identification des bactéries :
- Tests biochimiques (tests de catalase, coagulase, fermentation des sucres,
etc.).
5. Antibiogramme :
- Détermination de la sensibilité des bactéries aux antibiotiques par diffusion
sur gélose ou de façon automatique ( VITEK).
- Lecture des résultats pour établir un profil de sensibilité.
Étape post-analytique
1. Interprétation des résultats :
- Analyse des cultures, des tests biochimiques, et des antibiogrammes.
- Corrélation avec les données cliniques du patient.
2. Rapport des résultats :
- Rédaction d'un rapport détaillé comprenant l'identification des bactéries et
les résultats de l'antibiogramme.
3. Conservation des échantillons et des données :
- Archivage des cultures et des données pour une éventuelle réanalyse.
- Stockage sécurisé des rapports et des résultats.
4. Communication des résultats au patient.
Après ces étapes de manipulation, nous examinerons les résultats disponibles
au niveaux du VITEK pour collecter les informations dont on a besoin et les
insérer dans un tableau Excel pour les études statistiques.
Résultats attendus
Identification de la prévalence de l’espèce des bacilles gram Négatifs
multirésistantes
Identifier le risque pour qu’une espèce de bacille Gram Négatif développe une
multiresistance
Conclusion
Les résultats de cette étude fourniront des informations cruciales sur
l’évolution de la multirésistance des BGN et aideront à orienter les stratégies
de traitement et de prévention des infections à BGN. Ces données pourront
également informer les politiques de gestion des antibiotiques et améliorer les
résultats cliniques pour les patients.
Ce plan d'étude vise à fournir une compréhension détaillée de l'évolution de la
multirésistance des BGN et à identifier les moyens de réduire l'incidence et
l'impact des infections résistantes
Elle nous permettra également de déterminer le risque pour qu’une espèce de
bacille gram négatif développe une multiresistance
