Introduction à la Biochimie des Lipides
Introduction à la Biochimie des Lipides
1- Caractères généraux
. 10-15% du poids sec de la matière vivante
. Structural
Membranes
UE2
. Médiateurs cellulaires
Transmission signaux
Obésité, athérosclérose, …
4. Notions générales sur les propriétés physicochimiques
H2 H2 H2 H2 H2 H2 H2 H2
C C C C C C C C COOH
H3C C C C C C C C C
H2 H2 H2 H2 H2 H2 H2 H2
Acide stéarique
Hydrocarbure octadécane
18 17 16 3 2 1
CH3 CH2 CH2 (CH2)12 CH2 CH2 COOH
b a
w 2 3 16 17 18
acide stéarique
- Position des doubles liaisons
18 10 9 1
CH3 (CH2)7 CH CH (CH2)7 COOH
w 9 10 18
C18:1;9
acide oléique
w9,C18:1
acide cis-9-octadécènoïque
D9, C18:1
C. Exemple d'acides gras naturels
- Représentation
COOH
H3C
acide palmitique
- Acides gras saturés et leur répartition naturelle
C4 : acide butyrique
C6 : acide caproïque En faible quantité dans certaines
C8 : acide caprylique graisses : beurre, les graisses d’origine végétale
C10 : acide caprique
C H3
C H3 Mono- ou polyéthylèniques
COOH
COOH
- 2, 3, 4, 5 ou 6 double liaisons
= CH-CH2-CH=
- cis
huiles de poissons
Acides diènoïques
18:2;9,12 / w6 Linoléique toutes cis -9,12-octadécadiènoïque
H3 C
COOH
Acides triènoïques
18:3;9,12,15 / w3 Linolénique toutes cis -9,12,15-octadécatriènoïque
H3C COOH
Acides tétraènoïques
20:4;5,8,11,14 / w6 Arachidonique toutes cis -5,8,11,14-eicosatétraènoïque
H3C
COOH
- 30 composés
- Cyclooxygénases
- Prostaglandines (PG) : PGE1, PGI2, …, dont les prostacyclines (2 cycles)
- Thromboxanes (Tx)
Acide acétylsalicylique
AINS
Acide arachidonique
Cyclooxygénases
Lipoxygénases
Prostaglandines
Thromboxanes
Leucotriènes, lipoxines…
D. Propriétés
D.1. Propriétés physiques
- Etat : point de fusion forces cohésives hydrophobes : saturées et longues
. Augmente avec le nombre d’atomes de carbone (<10C : liquides volatiles puis huileux)
. Diminue avec le taux d’insaturation
Série Tf
C18 Stéarique + 69°C
C18:1;9 Oléique + 16°C
C18:2;9,12 Linoléique - 5° C
C18:3;9,12,15 a-Linolénique - 11°C
Film lipidique
Micelles
+ Liposomes :
bicouches lipidiques sphériques enfermant les molécules d’eau.
D.2. Propriétés chimiques :
Addition quantitative
A. Le glycérol CH2 - OH
CH - OH
CH2 - OH
HO H
H3PO4 CH2 - OH
*
CH2 - O - PO3H2 Liquide incolore
Sirupeux
Acide L-glycérophosphorique Saveur sucrée
Plus dense mais soluble dans l’eau
B. Les glycérides
. Nombre
B.1. Définition et nomenclature . Position
. Nature
- Monoglycérides Pour information
CH2 - O - CO - R CH2 - OH
CH - OH CH - O - CO - R
CH2 - OH CH2 - OH
CH2 - O - CO - RR CH2 - O - CO - R
R
R’
CH - O - CO - R' CH - OH
CH2 - OH CH2 - CO
O - CO R'
- R’
- Triglycérides
CH2 - O - CO - RR CH2 - O - CO - R
CH - O - CO - RR CH - O - CO - R
R’
Lipase Lipase
TG DG MG
C.1. Structure
Acyl
Acyl
CH2 - OH
HO H Acyl
* O
CH2 - O - PO3H2 O- HX
O P
Acides gras O
L glycérol-3-phosphate
Alcool,
Phosphate amino-alcool
Glycérol
C.2. Classification des glycérophospholipides
X
- Glycérophosphatides simples
Acides phosphatidiques Hydrogène
Phosphatidylglycérols Glycérol
Inositophosphatides Myoinositol (PI)
- Glycérophosphatides azotés
Phosphatidylcholines Choline (PC)
Phosphatidyléthanolamines Ethanolamine (PE)
Phosphatidylsérines Sérine (PS)
C.3. Glycérophosphatides simples
C.3.1. Les acides phosphatidiques
Acyl
Acyl1
Glycérol
Hydrolyse H3PO4
Acyl
Acyl2
(insaturation) O 2 acides gras
O P O- H
O
1 4
OH
6 5
1
Myoinositol
Acyl1
Acyl1
Acyl1
Acyl1
Acyl2
Acyl2
O Acyl2
Acyl2
O P O
O OH
1 P Phospholipase Diacylglycérols
P
P
Exemple membrane cellules eucaryotes : P
Phosphatidylinositol 4,5 biphosphate P
a) Phosphatidylcholines ou lécithines
- Structure + CH 3
HO -CH2 - CH 2 - N - CH 3 Choline
CH 3
+ CH3
CH3 - CO - O CH
- 2 - CH2 - N - CH
CH33
CH3 Base forte (pK = 13,9)
Très hydrosoluble
Acétylcholine
Sels en milieu acide
Transmission nerveuse
Pour mémoire
Réserve de méthyles
Acyl (saturé)
Acyl1
Acyl2
Acyl
(insaturé)
O
+ CH3
O P O -CH2 - CH2 - N - CH
CH33
O CH3
- Phosphatidylcholines
- Rôles biologiques
. Caractère amphotère
. Dégradation enzymatique
Phospholipase A1
Phospholipase A2 CH2 - O - CO - R
R
R’ - CO - O - CH - OH Phospholipase D
O
CH2 - OH- P - O - X
Phospholipase C OH
Acyl 1
Acyl Acyl 1
Acyl
(saturé) (saturé)
Acyl
Acyl2 Acyl2
Acyl
(insaturé) O (insaturé) O NH2
O P O -CH2 - CH2 - NH
NH2 2 O P O -CH2 - CH
O O COOH
Phosphatidyléthanolamines Phosphatidylsérines
Tissus nerveux
Très acides : PS > PE > PC
Lysocéphalines hémolytiques : propriétés détergentes (tous les lysophospholipides)
- Composés impliqués dans les processus inflammatoires :
Phospholipides
Phospholipase A2
Cyclooxygénases
Lipoxygénases
Prostaglandines
Thromboxanes
Leucotriènes, lipoxines…
- Composés impliqués dans les processus inflammatoires :
-> cibles des molécules pharmacologiques :
Corticoïdes Phospholipides
Phospholipase A2
Cyclooxygénases
Lipoxygénases
Prostaglandines
Thromboxanes
Leucotriènes, lipoxines…
1- LES ACIDES GRAS Classification
2- LES GLYCEROLIPIDES : esters de glycérol
A. Le glycérol
B. Les glycérides
C. Les glycérophospholipides
A. Définition
. Sphingosine : aminodiol à 18 C avec une insaturation
. Liaison amide
. Tissu nerveux (sphingolipidoses)
CH2 OH
OH
NH2
Sphingosine
1,3 dihydroxy 2 amino D4 octodécène
B. Classification Saponification impossible
car liaison amide !
X = Ose(s)
Glycosphingolipides
X =H
Céramides
C. Les céramides = acylsphingosine
R'R - CO
CO -- NH - CH
CH2 - OOH
-H
RR'- CO
- CO-- NH - CH O CH
+ 3
. Céramide + ose(s)
. Tous tissus et surtout tissus nerveux
. Feuillet externe membrane plasmique
. Hexoses, hexosamines, acides sialiques : classification
. Très hétérogène
. Nature et nombre d’oses : cérébromonosides, -diosides, …
. Glycolipides neutres (ou sulfatés)
. Acide gras à longues chaînes (C22:0, C24:0, C24:1)
Exemple des cérébromonosides
Galactosylcéramide
CH3 - (CH2 )12 - CH = CH - CH - OH
Ose = b D Galactose
R - CO - NH - CH
R' Tissus nerveux
R = C24
CH2 - O - XOse Sulfatides (myélines) :
Esters sulfuriques
en 3 et 6 du gal
Glucosylcéramide
Ose = b D Glucose
Autres tissus, peau
E.2. Les gangliosides
. Glucosylcéramide + acide(s) sialique(s) (charge négative)
. Acides sialiques = substitutions de l’acide neuraminique
. Acide gras : acide stéarique
. Nomenclature : G, M, indice (mono-, di-, tri-, tétra-, penta-)
Pour information :
GM3 CH3 - (CH2 )12 - CH = CH - CH - OH
RR'- -CO
CO -- NH - CH
Glc - Gal
CH2 - O - X
NeuAc
Sphingomyélines
Amphiphile
Cérami Amphotère
Céramid de
e
Céramide
Ganglio-
sides
Cérami
Céramide de
Céramide
Sphingosine Céramide
Amphiphile Amphiphile
Polaire
Céramide
Cérébrosides
1- LES ACIDES GRAS Classification
2- LES GLYCEROLIPIDES : esters de glycérol
A. Le glycérol
B. Les glycérides
C. Les glycérophospholipides
Pour information :
O O
O
O O
O O P
O P P OH OH P OH
OH OH
OH
O
O O
O P P OH
OH
Géranylpyrophosphate (C10) OH
A. Les carbures isopréniques et leurs dérivés
A.1 Les caroténoïdes
Dérivés aliphatiques ou alicycliques de polymères de l’isoprène
- Double liaisons conjuguées
- 8 isoprènes -> 40C
- Liposolubles
- Origine végétale
- Classification : . Lycopène
. Carotènes (C40H56)
. Xanthophylles (-OH, -COOH, -CO, …)
1
16
16’
1’
Lycopène
Cyclisations possibles => b-carotène
A.2 Les vitamines A ou rétinol
ou vitamine antixérophtalmique ou axérophtol
- Solide jaune, huileux
- Vitamine liposoluble
- Règne animal : esters dans lait, beurre, j. d’œuf, huile foie de poissons
- Végétaux : bcarotène
- Troubles cutanés, ophtalmiques et croissance
16
16’
1 x b carotène
bcarotène dioxygénase et
Provitamine A rétinaldéhyde réductase intestinales
Carotte +++
Corps jaune ovaire,
jaune œuf, CH2 OH
peau, plasma
18 17
11
19 C D
1 19C
10 14
A B Noyau stéroïde
5 + hydroxyle(s) : Stérols
B.2 Stéréoisomérie des stérols
- forme chaise
- A/B : cis ou trans
- B/C et C/D : trans
Substituant Substituant
au-dessus au-dessous
plan du cycle plan du cycle
a.1 Structure
Noyau stéroïde
27C
C D
A B
HO
- Structure :
Membranes cellulaires eucaryotes
Lipoprotéines plasmatiques
Etat fluide Etat rigide
Phospholipides
Cholestérol rigidifie
- Précurseur stéroïdes
- Pathologie cardiovasculaire
B.4 Les dérivés des stérols
COOH
OH
a. Les acides biliaires
- Catabolisme cholestérol
HO OH
- Synthèse hépatique
- Structure :
. Noyau stéroïde
. Chaîne latérale 5C avec -COOH
. OH en 3, forme a +/- OH en 7/12, forme a
OH HO OH
HO
7a deshydroxylation
(bactéries)
- Secondaires :
COOH COOH
OH OH
OH HO OH
HO
ergostérol 7-déhydrocholestérol
- Structure :
. Ouverture cycle B
. 3 double liaisons conjuguées
Lumière UV
Activations
hépatique
puis rénale
- Structure :
Prégnénolone (C21)
Progestérone (C21)
Oestrogènes (C18)
c.1. Hormones stéroïdes en C21 : prégnane
- La progestérone -CO-CH3
. Structure : Progestérone
* Cétone en 3
* Double liaison 4-5 dans cycle A
- Les hormones cortico-surrénaliennes
-CO-CH2OH
Chaîne a cétolique en 17
. Oxygènes en 3 et 11
. Double liaison 4-5 dans cycle A
Cortisol Aldostérone
Glucocorticoïdes Minéralocorticoïdes
Métabolisme glucidique Métabolisme eau et électrolytes
(stimule la néoglucogenèse) (action rénale +++)
c.2. Hormones stéroïdes en C19 : androstane
OH
Testostérone
OO
OH
OH O
OH
HO HO
Oestradiol Oestrone
a tocophérol
CH3
Unité
- Koagulation isoprénique
n = 6-9 Vitamine K2
Noyau naphtoquinone
Noyau hydroxyquinone
Lipides
Carbures Quinones à
Acides gras Glycérolipides Sphingolipides isopréniques Stéroïdes chaînes
(vit A, * isopréniques
dolichols)
Glycérophospho- Acides
Insaturés lipides (simples Sphingomyélines biliaires
Vitamines K
ou azotés)
Spéciaux, Vitamines D
eicosanoïdes Glycosphingolipides
(cérébrosides,
gangliosides)
Hormones stéroïdes
(prégnane, androstane,
œstrane)
*Molécules les plus apolaires
Sera vu en TD
Carotènes Lipides
+++ -
POLARITE DES LIPIDES
Triglycérides apolaires
Esters de cholestérol Lipides sans fonction polaire libre
Glycérophospholipides
Lipides
Sphingophospholipides - +/- amphiphiles
Glycosphingolipides
Lipides avec fonction(s) polaire(s) libre(s) + grande partie apolaire
Sels biliaires
Sels d’acides gras - + Lipides polaires,
+ Acides gras ≤ 6 C hydrosolubles
Lysolécithines
Lipides avec fonction(s) polaire(s) libre(s) > courte partie apolaire
Sera vu en TD
. Liaisons covalentes
Localisation
Protéine
Ancre
GPI
Thy-1 interactions
Signalisation
+++
Prényl
Myristoyl +
Palmitoyl
+ interactions
ioniques Protéine Ras
. Triglycérides (TG)
. Phospholipides (PL)
Apo(lipo)protéines
amphiphiles
Cholestérol non estérifié (CL)
Cœur hydrophobe :
. Echanges perpétuels
Lipoprotéine
lipases
VLDL
Foie
LDL
Tissus
périphériques
adipeux Lipases
hormonosensibles HDL +++