COURS DE BIOCHIMIE
STRUCTURALE
1ère ANNEE
Pr. A. NAAMANE
Chef de Laboratoire de Chimie-Biochimie
PREMIERE PARTIE
LES GLUCIDES
CHAPITRE I
CARACTERES GENERAUX DES
GLUCIDES
I- DEFINITION
Définition « chimique » : « hydrates de carbone »
Formule générale (CH2O)n ou Cn (H2O)n
Rapport C : H : O = 1: 2 :1
Mais tous les glucides ne sont pas conformes à cette formule
Parfois, autres atomes (N, P, S) et fonctions (acides ou basiques)
Définition courante : les sucres
Le glucide de cuisine : saccharose (sucrose en anglais)
Saccharose = glucose + fructose : 2 sucres simples
Le plus important en biologie médicale:
- Source d’énergie
- Précurseur et produits de tous les oses simples
GLUCIDES
Définition actuelle:
Molécules organiques caractérisées par:
- Chaîne carbonée avec des fonctions
alcool primaire et secondaire
- Fonction aldéhyde ou cétone
- Parfois une fonction alcool secondaire qui
a été substituée par:
.une fonction acide
.une fonction amine
.un groupement hydrocarboné (R) ou –O-R
.un hydrogène (H)
O
C CH2OH
H
(H ou R ou NH 2 ou SO3H )
II- CLASSIFICATION
GLUCIDES
OSES OSIDES
Molécules simples Molécules composées
non hydrolysables hydrolysables
Holosides oses
Aldéhyde = aldose
Hétérosides
Cétone = cétose
oses + aglycone
III- INTERET DES GLUCIDES
1°/ ROLE ENERGETIQUE
1g glucose = 4 Kcal
Glycogène = réserve de glucose(Foie, Muscle)
2°/ ROLE STRUCTURAL
Membrane cellulaire renferme des glucides
combinés à des protéines = Glycoprotéines
IV- ORIGINE ET BESOINS EN GLUCIDES
*Origine
ALIMENTAIRE METABOLIQUE
Légumes NEOGLUCOGENESE :
Fruits composés non glucidiques:
Produits sucrés: -AA. Glucoformateurs:
Limonades, sirop,.. Gly,Ala,Val,Sér,Thr,
Cys,Asp,Glu,Pro et Arg
-Glycérol,Lactate,Pyruvate
-Intermédiaires du cycle
de KREBS
* Besoins
- 300 g/j au repos:
.150g/j Cerveau
. 50g/j GR
. 50g/j Muscle
. 50g/j Organes( Rein,….)
Un adulte sain (70Kg) au repos a un besoin
énergétique de 2400Kcal
50% fournis par les glucides
35% les lipides
15% les protides
A l’effort les besoins augmentent
Varient en selon plusieurs facteurs:
.Sexe: F = 2200 Kcal
H = 2400 Kcal
.Activité: Travail intense = 3400 à 3800Kcal
Travail très intense= 4000 à 5500Kcal
.Age: E = 1400 à 2000Kcal
A = 2200 à 3000Kcal
Vieillard = diminuer la ration de 30%
Le climat:
Climat très froid augmenter la
ration 5000 kcal/j
•La ration alimentaire doit couvrir nos besoins
énergétiques sans les dépasser.
•Tout dépassement va favoriser :
- l’athérosclérose
- l’obésité
- le diabète
V- ETUDE DES GLUCIDES
A- LES OSES
1°) Nomenclature
a) Les aldoses Un carbone central
Rappels 4 substituants différents
X Carbone
chiral
109,5° =
Carbone
C Asymétrique
Y Z
W
Superposition
X impossible
X
C 2 formes distinctes
W Y
C
Z Distinguées par
Y Z la déviation de la
lumière polarisée
W
Formes
D (dextrogyre, +)
L (lévogyre, -)
Représentation 3-D Représentation plane
H O
C
CHO
H C OH
C
Projection CH2OH
H OH de
CH2OH Fischer
D- glycéraldéhyde
D- glycéraldéhyde
Dextrogyre, d, +
Dextrogyre, d, +
Composés actifs optiquement mais D+ et D-, L+ et L-
Pas d’équivalence entre le sens de la déviation lumière polarisée et séries D ou L
H O 1
C
2
H C* OH OU
3
CH2OH
Glycéraldéhyde (GA)
Filiation :
b) Les cétoses
CH2OH 1
C O OU 2
CH2OH 3
Dihydroxyacétone
Filiation :
D- Erythrulose
D- Ribulose D-Xylulose
D- Fructose
2°) Stucture des oses
a) Cyclisation d’un aldose
OH
H O 1
C H H C OH
O
H 2C
C
3
C
C
4
C
C
5
C
C D-Glucose
6
CH2OH
CH2OH
CH2OH
6 CH2OH
OH OH
5
4 O
4 1
C OH * (H, OH)
2
H2O
3 H
1C* 2 Anomères D-Glucopyranose
CH2OH
6
CH2OH
5
O OH
4 O
4
1
2
3 OH
β-D-Glucopyranose α-D-Glucopyranose
En solution, le glucose subit une mutarotation
α-D-Glucopyranose β-D-Glucopyranose
36% 63%
D-Glucose
0,1%
b) Cyclisation d’un cétose
1CH2OH 1CH2OH
H
2C O + O HO 2
C OH
H
3 3
C C
4 4
C C
5 5
C H C OH
6 6
CH2OH CH2OH
D- Fructose D- Fructose hydraté
CH2OH OH
6 O H OH
C 2C CH2OH
1
5
OH
4 3 CH2OH O
6
*
5
4
3 CH2OH
1
CH2OH 1CH2OH
6 O β-D-Fructofuranose
*
5
4
3
OH
α-D-Fructofuranose
3°) Propriétés des oses
a) Propriétés physiques
-trèssolubles dans l’eau
-saveur sucrée très variable
-présentent un pouvoir rotatoire
b) Propriétés chimiques
1-b) Propriétés de la fonction carbonyle
O
* Oxydation 1C
OH
O 2+ +
2e+2Cu 2Cu
1
CH2OH
D-Glucose Acide gluconique
CH2OH
* Réduction
O OH
+ Réducteur
CH2OH
D- Glucose
Sorbitol
* Addition d’un alcool R-OH R
O OH O O
+R OH
H2O
Hémiacétal
D-Glucose
2-b) Propriétés de la fonction alcool primaire(-CH2OH)
*Oxydation
CH2OH COOH
O O
α-D-glucose Acide α-D-Glucuronique
*Estérification
Par H3PO4 CH2-O-H2PO3
CH2OH O
O
Glucose-6-Phosphate
O
R C H
GLucose Estèrs organiques
3-b) Propriétés de la fonction alcool secondaires
*Substitution par une amine
CH2OH
CH2OH
O + R-NH2 O
1 1 Glucosa-
2
2 amine
R-OH NH2
OH
* Substitution par un etheroxyde
O
GLUCOSE + R-O-CH3
O-CH3
Etheroxyde
4°) Principaux oses et dérivés d’oses présentant
une importance biologique
Oses ou
Sourse Rôle Pathologie
dérivés d’oses
* Trioses
GA : Aldose G6P, GAP Glycolyse
DHA:Cétose Glucose
* Pentoses
D-Ribose Acides Nucléiques Structural Génétique
ARN,ATP,AMP
ADP, NADP
D-Désoxyribose Acides Nucléiques ADN Génétique
D-Arabinose Gomme arabique Glycoprotéine
D-Xylulose Intermédiaires de Intermédiaires
Voie métabolique Voie Pentoses Ph
* Hexoses
Fruit,Amidon, Principal ose Intolérance au
D- Glucose Utilisé par la cell Glucose-Diabète
Lactose,…….
D- Fructose Fruit, Miel, Utilisé par la cell Intolérance au
Saccharose Fru Glu Fru; Fructosémie
D-Galactose Lactose Utilisé par la cell Galactosémie
Gal Glu
Osamines Dérivés de Glu, Mucopolysaccharides
Gal
Acide glucu- Dérivé de Glucose Solubilise
les déchés
ronique
B- LES OSIDES
1°) Définition de la liaison osidique
Addition de deux oses simples entre carbones portant des hydroxyles
Liaison O-osidique (O-glycosidique)
Condensation de deux alcools:
- liés aux carbones anomériques des deux oses
- ou 1 OH lié au carbone anomérique + 1 OH lié à un
autre carbone
H2O
H H H H
C + C C C
OH HO O
+H2O
Dénomination biochimique de dissacharide dépend:
-De la nature des oses
-Des anomères
-Du carbone porteur de l’hydroxyle engagé dans la
liaison sur le second ose
-Des formes cycliques
2°) Classification des osides
OSIDES
HETEROSIDES
HOLOSIDES
Par hydrolyse: Oses OSES
et/ou dérivés d’oses +
Aglycone
Polyosides
Oligosides
n < 12 Oses n > 12 Oses
Hétéro
Ex: n=2 Polyosides=
Homopolyosides=
-Maltose: Réducteur oses identiques oses et/ou
Dérivés d’oses
-Lactose: Réducteur
.Amidon .MPS
-Saccharose:Non réducteur .Glycogène .GAG
3°) Les holosides
a) Les oligosides
Maltose:
CH2OH CH2OH
6
6
5 5 H
H C O H 4H C O
H H
C1 C C1
4C OH H OH H
C2 O C3 C2 OH
OH C3
H OH H OH
D-Glucose D-Glucose
α-D-glucopyranosyl-(1->4)-α-D-glucopyrano se
Produit de dégradation des amidons
α(1->4) glucosidase
Lactose
Lactase
CH2OH CH2OH
6
6
5 5 OH
OH C O H C O
H 4C H
C C1 O OH H C1 Ose dont le
4 OH H
C2 H carbone anomérique
H C3 C2 H C3
est libre à droite
H OH H OH (extrémité réductrice)
D-Galactose D-Glucose
β-D-galactopyranosyl (1->4)-β-D-glucopyrano se
L’enzyme hydrolysant le disaccharide reconnaît:
-L’ose dont le carbone anomérique est engagé
- La nature de l’anomére (α ou β)
-Le type de liaison O-osidique (numéros des carbones liés)
Exemple: lactase = β(1->4)-galactosidase
Saccharose
D-Glucose
6
CH2OH
5 H
H C O
H
C1
4C OH H
OH C3 C2
H OH
O
D-Fructose
HOCH2 O
6
C C
5 H OH 2
1
H C C CH2OH
4 3
OH H
α-D-glucopyranosyl (1->2) β-D-fructofurano side
Les deux carbones anomériques sont engagés dans la liaison O-osidique
Saccharase = α (1->2)-glucosidase
β(2->1)-fructosidase
b) Les polyosides
Les homopolyosides
Linéaires
branchés
Exemples:
Amidon - Glycogène
Liaisons α(1->4)-glycopyranosyl
CH2OH 6
CH2OH Liaisons α(1->6)-
6
5 5 glycopyranosyl
H C O H H C O H
H H
C C1 4C C1
4 OH H OH H
OH C3 C2 O C3 C2
O
H OH H OH
CH2OH CH2OH
6 CH2OH CH2
6
CH2OH
6
6 6
5 5 5 5 H 5 H
H C O H H C O H H C O H H C O H C O
H H H H H
C C1 4C C1 4C C1 4C C1 4C C1
4 OH H OH H OH H OH H OH H
C3 C2 O C3 C2 O C3 C2 O C3 C2 O C3 C2
H OH H OH H OH H OH H OH
Liaisons α(1->4)-glycopyranosyl
Amidon = polymères d’α-D-glucose
= Amylose + Amylopéctine
- Amyloses: liaisons α(1->4), de quelques dizaines
à plusieurs milliers de résidus
(PM de 5 à 500 kDa).
20 % des amidons environ
- Amylopectines:
Liaisons α(1->4) + liaisons α(1>6) tous les 20-30 résidus
(PM jusqu’à 1000 kDa).
80% des amidons environs
Insolubles à 37°C. Ils diffèrent suivant les
espèces végétales
Structure α-hélicoïdale
Digestibles par des α-glucosidases dans l’intestin
Réserve énergétique des cellules végétales
Glycogène
polymères d’α D-glucoses liés par des liaisons
α(1->4) et tous les 8-12 résidus des
branchements α(1->6)
Structure plus compacte que les amidons
Structure α hélicoïdale
Digestibles par des α glucosidases dans l’intestin
Réserve énergétique des cellules animales
Les hétéropolyosides
Association d’oses et dérivés d’oses
* LES GLYCOSAMINOGLYCANES (G.A.G)
Un G.A.G est un ensemble de disaccharides dont
l’un des monosaccharides est toujours:
soit N- Acétylglucosamine
soit N- Acétylgalactosamine
L’autre monosaccharide est un acide glucuronique
ou un ose.
Dans certains GAG un ou plusieurs groupements
OH (alcool primaire ou secondaire) peut être
estérifié par un sulfate ce qui donne une forte
Viscosité.
Structure générale
Liaison
O-osidique
Répétition
de dimères
O-Ser
protéine
O-Ser
Les G.A.G. se divisent en deux groupes:
-Ceux qui ne contiennent pas d’acide sulfurique
CH2OH
Acide hyaluronique 6
H 5 C4 de acide
C O O
- glucuronique
COO C H C1
6 4 H β 1->4
5 OH
H C O O C3 C2 H
H
4C OH H
C1 β 1->3 H NH
C1 de N-acétyl
O C3 C2 H C O
glucosamine
H OH CH3
Acide glucuronique N-acétyl-glucosamine
- 50000 sous unités/chaîne
- Composant fluide synovial (articulation, vitrée (œil),
tendons, cartilage
- Détruit par hyaluronidases des bactéries et parasites
- Ceux qui contiennent l’acide sulfurique
Chondroïtine sulfate -O SO
6CH2OH
3 5 C4 de acide
C O O
- glucuronique
C H
6COO H C1
4
H β 1->4
5 O C
H C O 3 C2 H
H
4C OH H
C1
β 1->3 H NH
C1 de N-acétyl C O
galactosamine O C C2 H
3
CH3
H OH
Acide glucuronique N-acétyl-galactosamine sulfatée
Kératane sulfate -
6CH2OSO3
H 5
C O O C3 du galactose
CH2OH
H C1β
6 C H
4 OH 1->3
5 O
OH C O C C2 H
H 3
4 C H
C1
β 1->4 H NH
H C C2 H
C1 de N-acétyl 3 C O
O
galactosamine H OH CH3
Galactose N-acétyl-glucosamine sulfatée
c) Les hétérosides
Association d’oses et de composés non glucidiques
Linéaires
branchés
* PROTEOGLYCANNES
Composants de la matrice extracellulaire (tissu conjonctif)
Structure générale
Liaison
O-osidique
(sérine, thréonine)
Répétition
de dimères
O-Ser
protéine
O-Ser
* LES GLYCOPROTEINES ET LES GLYCOLIPIDES
De nombreuses protéines membranaires et
certaines catégories de lipides membranaires
portent des oligosides qui leur sont attachés par
des liaisons covalentes en disposition plus
ou moins complexes pour former des:
- Glycoprotéines
- Glycolipides