La mitochondrie : structure et fonctions

Origine :

L’origine de la mitochondrie reposerait sur la théorie endosymbiotique.

Selon laquelle, la première mitochondrie serai apparue il y a plus de 1,5 milliards
d’années à partir d’une protéobactérie endocytée.
Une cellule eucaryote ancestrale aurai endocyté une cellule procaryote aérobie.
La cellule procaryote endocytée est hétérotrophe, c’est ce qui constitue les
mitochondries d’aujourd’hui.

L'endosymbiose = forme de symbiose entre deux organismes

vivants, où l'un est contenu par l'autre, à bénéfices réciproques.
L'organisme interne est appelé un endosymbiote ou endosymbionte.

Aérobie = qui a besoin et qui utilise l’oxygène pour fonctionner.

Hétérotrophie = propriété d'un organisme qui se nourrit de

substances organiques, qui ne peut effectuer lui-même la
synthèse de ses éléments constituants.
Une cellule hétérotrophe utilise le glucose, les lipides, les protéines…

Dans les années 1960, Lynn Margulis a proposé une théorie révolutionnaire sur l'évolution
appelée la théorie endosymbiotique. Selon elle, certaines structures des cellules
eucaryotes (comme les mitochondries et les chloroplastes) proviennent d'une ancienne
symbiose entre des cellules simples (procaryotes).
Voici l'idée clé :

 Margulis a observé que les mitochondries et les chloroplastes avaient des

caractéristiques semblables à des bactéries (taille, structure de l'ADN, mode de
reproduction).
 Elle a donc suggéré que ces organites étaient autrefois des bactéries
indépendantes qui ont été ingérées par une cellule plus grande.
 Au lieu d’être digérées, ces bactéries ont formé une relation symbiotique avec la
cellule hôte, devenant des parties intégrantes de celle-ci.

Cette idée a transformé notre compréhension de l'évolution des cellules complexes et a

été largement acceptée après avoir reçu plus de preuves dans les décennies suivantes.
Donc voici les caractéristiques de la mitochondrie selon la théorie
endosymbiotique :
- Les mitochondries ont leur propre ADN
- Leur ADN est circulaire bicaténaire
- La composition de leur membrane est proche de celle des bactéries
procaryotes
- Elles ont leur propre système de traduction et de transcription
- Elles possèdent leurs propres ribosomes
- Elles ont leur propre ARN de transfert

La cyanobactérie aurai donné à la cellule eucaryote les chloroplastes.

1) L’ultra structure de la mitochondrie

C’est un organite qui a des fonctions particulières.

La mitochondrie possède 2 membranes qui servent de délimitation, elles sont
dites concentriques :
- Une membrane externe qui est continue et qui sépare les mitochondries
du cytosol.
- Une membrane interne dans la matrice mitochondriale externe
Elle présente des plies perpendiculaires à la membrane externe, ce sont des
invaginations.
Ces invaginations forment les crètes mitochondriales.
Les crètes augmentent de 5 à 10 fois la surface totale de la membrane interne
par rapport à la membrane externe.
C’est un ensemble à compartiments fermés, il n’y a pas de trou.
Les membranes sont séparées par l’espace inter membranaire.
En dedans, on a la matrice mitochondriale, c’est équivalent au cytosol.

2) A. la membrane mitochondriale externe

Sa composition est équivalent à celle de la membrane plasmique.

C’est une bi couche phospholipidique.
On retrouve du cholestérol.
50% de la masse des mitochondries est causé par la masse des lipides.
La membrane mitochondriale externe a une membrane semblable à celle des
bactéries.
On y retrouve beaucoup de protéines :
- TOM
Elle est translocase et permet l’import des protéines en provenance du cytosol
vers la membrane externe
- Les enzymes
L’adrénaline
- Les protéines dynamiques mitochondriales
- La porine

B. L’espace inter membranaire des mitochondries

La porine :
Elle a une structure en tonneau et délimite un canal en fonction du gradient de
concentration.
Les molécules de plus de 5 kDA peuvent passer.
On y trouve de l’ATP, de l’ADP, de la NAD et du pyruvate.
C’est un transport passif avec une diffusion facilitée.
La composition de l’espace inter membranaire est équivalente à du cytosol.
On trouve une composition ionique à partir de concentration en potassium et en
sodium.
On trouve également des protéines rédox :
- La superoxyde dismutase
Elle détoxifie les espèces oxydées
On a également des protéines de signalisation cellulaire :
- AIF ( pour l’apoptose )
- Cytochrome C ( elle permet à la chaine respiratoire de faire l’apoptose )
- Kinase ( avec l’ATP, elle crée la phosphorylation )
Il existe aussi la créatine kinase qui met en réserve de l’énergie utile lors des
efforts physiques.
- OPA1
Pour la morphologie des mitochondries, elle forme également les crètes et les
mécanismes de fusion.
Il existe aussi des protéines pour les mécanismes de fer et la synthèse de l’hème.

C. La matrice mitochondriale

On y trouve des enzymes pour le catabolisme : le cycle de Krebs.

L’ensemble des réactions pour l’acétyle co-enzyme A : la beta oxydation des
lipides.
Les réactions enzymatiques coupent les lipides pour former l’acétyle co-enzyme
A.
C’est un ensemble d’anti-oxydant.
On trouve de l’ADN mitochondriale.
Mais aussi des ribosomes, de l’ARN de transfert, des polymérases ( pour la
synthèse de l’ARN ).

L’ADN mitochondrial :

Ce sont des molécules circulaires bi caténaire.

Elle fait environ 16,6 kbases.
Elle va de la matrice vers la membrane mitochondriale interne.
On trouve plusieurs dizaines de copies dans une seule mitochondrie.
Si on a 500 mitochondries, on se retrouve avec près de 5000 gènes de
mitochondries, cet ADN sera plus présent que l’ADN nucléaire.
Elle ne possède pas d’histones, comme le chromosome bactérien mais possède
des protéines pour former la structure nucléoïde.
On ne trouve pas d’intron.

Un intron = portions de gènes copiés dans l'ARN, puis éliminées,

sans fonction apparente.

Elle est sensible aux mutations car :

- Pas d’histone pour la protéger
- Ensemble de réparation moins efficace
- Complexe générateur d’espèces réactives à l’oxygène, c’est toxique pour
l’ADN
L’hétéroplasme = désigne la coexistence de mitochondries
normales et mutées au sein d'une même cellule ou d'un même
tissu.

Dans une même mitochondrie, on peut donc retrouver des qualités de copies
différentes.
Elle code 13 protéines qui sont utiles pour la composition de la mitochondrie.
L’ADN mitochondrial code 22 ARN de transfert et 2 ARN ribosomiques en plus.
Elle découle d’une transmission maternelle stricte.

D. La membrane mitochondriale interne

Elle a une composition lipidique particulière :

- Pas de cholestérol
- Présence de cardiolipides
Les cardio lipides représentent :
- 20% du total
- Ils n’ont pas de fluidité
- Ils sont imperméables aux H+
Ce sont 4 acides gras doubles phospholipides.
Ils facilitent l’activité enzymatique de la chaine respiratoire.
On trouve également des protéines :
- On a 1 protéine pour 15 lipides
- C’est 70% de la membrane mitochondriale interne
- On a des protéines en chaine au niveau des crètes
- On a des protéines de transport sélectif pour les ions et les petites
molécules

La chaine respiratoire fait passer les protons de la matrice vers l’espace inter
mitochondrial.
La membrane est imperméable aux protons grâce aux cardiolipides.

On a de l’ATPase dans la membrane interne sous forme de sphères pédonculées.

Le pyruvate mitochondrial est un transporteur.
L’ANT nucléotide à adénine fait des échanges de l’espace inter membranaire vers
la membrane interne grâce à :
- TIM ( translocase de la membrane interne )
- Protéines de découplage ( UCP )

3) La phosphorylation oxydative

Elle met en jeu 4 complexes, numérotés de 1 à 4.

Ils sont associés à l’oxydation des co enzymes réduites.
Ils transportent les électrons via des protéines intermédiaire ( UQ ; cytochrome
C)
Un débat est en cours pour savoir, s’il existe un 5 e complexe pour l’ATPase.

a) Le besoin des co enzymes réduites NADH2, FADH2

Le glucose arrive dans les muscles grâce à des transporteurs, le GLUT4 en

particulier.
En fonction du gradient de concentration on va dégrader ou non le glucose dans
le cytosol via la glycolyse.
Dans la matrice mitochondriales on retrouve du pyruvate, et du lactate ( stocker
ici pour les sports anaérobies ).
On a des acides gras qui sont transportés via notamment CD36 dans les cellules
puis dans la matrice mitochondriale.
La déca oxydation dégrade les acides gras.
Le cycle de Krebs forme les co enzyme gras.

b) La chaine de potentiel rédox

Les co enzymes gras nécessitent d’être réduits.

NADH = NAD+ ( réduction ) pour former ensuite une molécule d’eau.
En suivant la chaine de potentiel rédox, on peut avoir un sens de réaction.
La réduction se fait du plus électronégatif vers le plus électropositif ( soit NADH+
et O ).
On a besoin d’intermédiaires pour avoir l’autorisation d’oxyder ou de réduire.
On résonne par couple rédox.

Les électrons donnés forment une molécule oxydée = la réduction.

Les électrons gagnés forment une molécule réduite = l’oxydation.

On part toujours d’un potentiel rédox faible.

Lorsqu’un électron est capté, le complexe 1 est réduit.
On part de NADH2 pour finir à la formation des molécules d’H2O.
Dans les complexes on trouve certains ions, certaines molécules pour les
électrons ( le cytochrome ).
On a le groupement hème :
On des molécules colorées, avec un atome de fer au centre qui permet le
transport des électons.
C’est le couple rédox Fe2+ / Fe3+.
On a aussi des protéines avec à leur centre du fer et du soufre.
Ou encore des protéines à cuivre ( Cu = Cu2+ + e- )
Ou bien des flave protéines ( FMN, FAD, FADH2, FMNH2 ).

c) Les complexes de la chaine respiratoire

Le complexe 1 :
Il prend en charge les électrons avec NADH+.
Il a la forme d’un L grâce aux sous unités ( formées avec 45 protéines ).
On trouve de NADH-UQ réductase.
Il donne des électrons aux co enzymes Q.
Grâce à l’énergie des électrons, on a le passage de 4 protons de la matrice
mitochondriale vers l’espace inter mitochondrial.

Le complexe 2 :
On y trouve de l’oxyde FADH2.
Le succinate déshydrogénase se dégrade en fumarate.
La FAD transporte les électrons.
On trouve 3 centres fer/soufre.
On n’a pas de passage de protons.
Il envoie les électrons au niveau de co enzymes Q.

Le complexe 3 :
 UQH2-cytochrome C oxydoréductase
On a ici 11 polypeptides :
- 3 sous unités U rédox ( cytochrome B, C1, centre fer/soufre ) qui prennent
en charge les électrons.
Le cytochrome C récupère les électrons dans l’espace inter mitochondriale pour
les envoyer vers le feuillet externe de la membrane interne.
On a une translocation de 4H+.

Le complexe 4 :
Cytochrome C oxydase.
On trouve la cytochrome A, A3, cuivre A, B.
Le cytochrome C structure l’hème avec le fer à son centre qui amène les
électrons.
A ce niveau, l’oxygène capte les électrons et de l’hydrogène pour former de
l’eau.
On utilise alors l’oxygène capté par la mitochondrie.

Les complexes sont rapprochés pour pouvoir travailler ensemble.

On a une organisation en super complexe, c’est le respirasome.
Les H+ donne de l’acidité aux solutions.

Le gradient chimique ( pH 7 EIM, pH 8 matrice ),

Le gradient électrique ( différents potentiels possibles )
forment ensemble le gradient électrochimique = force proton motrice.

d) La production d’ATP

L’ATPase représente 15% des protéines.

Ce sont des sphères pédonculées associées par dimères.
On a un mouvement de rotation fait par un rotor.
Dans la matrice, on trouve le stator qui est fixe.
Les protons permettent la rotation.
L’espace inter membranaire mitochondrial les stocke.
La formation de l’ATP se fait au niveau du stator.

e) Le bilan de la phosphorylation oxydative

On a besoin de 3H+ pour former de l’ATP.

Avec 10H+, on peut former 3 mol d’ATP par l’oxydation de la NADH.
Avec 6H+, on peut former 2 mol d’ATP par l’oxydation de la FADH2.
Le complexe 5 peut synthétiser et dégrader l’ATP en faisant passer les protons à
travers la membrane pour un maintien de l’équilibre électrochimique.

4) La thermogénèse

La thermogénèse = production de la chaleur physiologique.

La chaleur est produite grâce à la chaine de respiration.

Les UCPI ( ce sont des protéines ) passent les protons de façon découplée, ce qui
n’engendre pas la production d’énergie sous forme d’ATP.
Les nouveaux nés ont des tissus adipeux bruns en grand nombre, ces tissus ont
des gouttelettes lipidiques qui brulent la graisse pour augmenter les réactions
exodermiques pour produire plus de chaleur.

5) Génération d’espèces réactives à l’oxygène

Ce sont des molécules toxiques.

Les modifications se font post-traductionnel.
Ces molécules réactives sont générées au niveau des complexes 1 et 3 de la
chaine respiratoire.
Elles transportent les électrons de façon imparfaite, ce qui entraine des réactions
précosses.
Ce sont des superoxydes O2-.
Ces superoxydes vont réagir avec les bio molécules ce qui entrainent :
- mutations dans l’ADN.
- l’apoptose.
- péroxydation lipidique.

Les mitochondries et le cytosol ont un système anti-oxydant :

- SOD ( manganèse, cuivre, zinc )
- Catalase ( ensemble de détoxification )

Les mitochondries ne sont pas des organites isolés, on parle donc de population
mitochondriale.
Voici les voix qui contrôlent ces populations :
- Biogènes
- Dynamiques
- Autophagie, mitophagie

Le biogène :
C’est un ensemble de processus qui aboutissent à la
croissance des quantités de mitochondries et à la division des
mitochondries pré existantes.
Cela augmente la densité mitochondriales ( synthèse + réplication ).
Le noyau contribue à ce mécanisme, c’est un facteur de transcription pour
l’ARNm lors de la traduction.
Lorsque la masse est suffisante, on a une nouvelle génération de mitochondries
qui arrive.

La dynamique :
Elle traite de la fusion ou de la fission.
L’OPA1 sert pour la fusion dans la membrane interne tout comme la mitofusine.
La DRP1 et FIS1 servent pour la fission de la membrane externe via l’hydrolyse
de l’ATP dans le cytosol.

8) les pathologies