Plan :
- Rappels
- Réplication
- Transcription
- Traduction
- Mouvements cytotiques
- Transports
- Système Membranaire Interne (SMI)
- Canaux
HAV201V 1
Plan :
- Rappels
- Réplication - Généralités
- Initiation
- Transcription - Elongation
- Traduction - Terminaison
- Mouvements cytotiques
- Transports
- Système Membranaire Interne (SMI)
- Canaux
HAV201V 2
La transcription : généralités
HAV201V 3
La transcription : généralités
ARN ADN
Figure 6.6. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science
Structure de l’ARN :
Figure 6.5. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science - Simple brin
- Bases : C, A, U et G
Figure 6.4. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science
- Sucre : ribose
HAV201V 4
La transcription : généralités
L’ARN étant simple brin, il peut se replier en
structures spécifiques
Figure 6.7. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science ARNt ARNr
HAV201V 5
La transcription : généralités
La transcription permet la synthèse de trois principaux types d’ARN :
- ARN messagers (ARNm) à code les protéines
- ARN de transfert (ARNt) à essentiels à la synthèse des protéines : adaptateur entre
l’ARNm et les codons
- ARN ribosomiques (ARNr) à forment la structure de base du ribosome et catalyse la
synthèse des protéines
- Il existent aussi des petits ARN (ARNsno, ARNmi, ARNsi…)
HAV201V 6
La transcription : généralités
Figure 6.13. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science
- Seuls les régions correspondant à des gènes sont transcrites
- La transcription peut avoir comme brin matrice l’un ou l’autre des deux brins d’ADN
HAV201V 7
La transcription : généralités
Figure 6.3. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science
- L’expression n’est pas la même pour tous les gènes
- Elle est régulée selon le stade de développement, le type cellulaire, l’environnement...
HAV201V 8
La transcription : généralités
La régulation de l’expression des gènes se fait principalement au niveau des promoteurs
+1
(Régulation positive ou négative)
Le promoteur :
àRégion non transcrite de l’ADN (en amont du début de la région transcrite)
àLieu de fixation initiale de l’ARN polymérase
HAV201V 9
La transcription : généralités
Procaryote
Certaines séquences du promoteur
(surnommées « boîte ») ont une
importance particulière.
à séquences reconnues spécifiquement
Eucaryote
par différentes protéines appartenant au
complexe d’initiation
Figure 6.16. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science HAV201V 10
La transcription : généralités
Notion de séquence consensus :
à Une séquence consensus peut être déduites
de la fréquence d’observation des nucléotides
Figure 6.12. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science
HAV201V 11
La transcription : initiation
Chez les procaryotes:
à Le facteur sigma permet à l’ARN polymérase
de reconnaitre le promoteur
Différents facteurs sigma peuvent reconnaitre
différents promoteurs
Figure 17.10. Lewin’s genes XII. Ed. Lavoisier
HAV201V 12
La transcription : initiation
Chez les eucaryotes :
à L’ARN polymérase requiert
différents facteurs de
transcription
à Ouverture du double brin par
TFIIH grâce à l’hydrolyse de l’ATP
à TFIIH phosphoryle aussi la
Figure 6.15. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science polymérase au niveau de sa
queue (CTD) à changement de
conformation et libération de la
polymérase
HAV201V 13
La transcription : élongation
- L’ARN polymérase correspond à un
complexe protéique
- Elle polymérise l’ARN dans le sens 5’ à 3’
- Elle n’a pas besoin d’amorce
Figure 6.9. Biologie moléculaire de la cellule 6eme édition. Ed. Lavoisier
HAV201V 14
La transcription : élongation
ARN polymérase : holoenzyme
Figure 17.8. Lewin’s genes XII. Ed. Lavoisier
Figure 17.7. Lewin’s genes XII. Ed. Lavoisier
HAV201V 15
La transcription : élongation
Brin codant (ou sens)
ADN déroulé
ADN enroulé
Brin matrice (ou anti-sens) 3’ Ajout d’un nucléotide complémentaire
en 3’ (liaison covalente)
Brin d’ARN créé Région hybride ADN/ARN
5’
HAV201V 16
La transcription : élongation
Figure 6.9. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science
HAV201V 17
La transcription : terminaison
Chez les procaryotes, il existe deux types de terminaison
Terminaison Rho indépendante :
Terminaison Rho
dépendante :
Chez les eucaryotes, la terminaison de la transcription est en
général couplée avec la polyadénylation en 3' des ARNm. 18
La transcription chez les procaryotes à résumé
Figure 6.11. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science 19
La transcription chez les eucaryotes : résumé
[Link] 20
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes
Procaryotes Eucaryotes
Polymérisation 5’ à 3’
Production d’ARNm, ARNt et ARNr
Régulation (procaryotes : temporelle / eucaryotes : spatio-temporelle)
1 ARN polymérase 3 ARN polymérases
Cytoplasme Noyau
ARN polycistroniques ARN monocistroniques
Absence de modifications post- Présence de modifications post-
transcriptionnelles des ARNm transcriptionnelles des ARNm
HAV201V 21
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes
- ARN polymérase I (nucléole) à transcription des
gènes des ARNr 5,8S, 18S et 28S
- ARN polymérase II (nucléoplasme) à transcription
des gènes codant les protéines
- ARN polymérase III (nucléoplasme) à transcription
des gènes codant les ARNt et les ARNr 5S
HAV201V 22
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes
Procaryotes Eucaryotes
Polymérisation 5’ à 3’
Production d’ARNm, ARNt et ARNr
Régulation (procaryotes : temporelle / eucaryotes : spatio-temporelle)
1 ARN polymérase 3 ARN polymérases
Cytoplasme Noyau
ARN polycistroniques ARN monocistroniques
Absence de modifications post- Présence de modifications post-
transcriptionnelles des ARNm transcriptionnelles des ARNm
HAV201V 23
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes
à Chez les eucaryotes, la transcription a lieu dans le noyau.
à Plus précisément, la synthèse des ARNr (sauf 5S) a lieu dans le nucléole
Une Zone Granuleuse: ADNr + ARNr + Protéines ribosomiques
Une Zone Fibrillaire : ADNr + ARNr
ZG
ZF
HAV201V 24
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes
Procaryotes Eucaryotes
Polymérisation 5’ à 3’
Production d’ARNm, ARNt et ARNr
Régulation (procaryotes : temporelle / eucaryotes : spatio-temporelle)
1 ARN polymérase 3 ARN polymérases
Cytoplasme Noyau
ARN polycistroniques ARN monocistroniques
Absence de modifications post- Présence de modifications post-
transcriptionnelles des ARNm transcriptionnelles des ARNm
HAV201V 25
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes
Notion d’opéron
Figure 6.21. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science
HAV201V 26
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes
Procaryotes Eucaryotes
Polymérisation 5’ à 3’
Production d’ARNm, ARNt et ARNr
Régulation (procaryotes : temporelle / eucaryotes : spatio-temporelle)
1 ARN polymérase 3 ARN polymérases
Cytoplasme Noyau
ARN polycistroniques ARN monocistroniques
Absence de modifications post- Présence de modifications post-
transcriptionnelles des ARNm transcriptionnelles des ARNm
HAV201V 27
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes
d’un gène …
à un messager …
à une protéine…
En français : translation = traduction
HAV201V 28
La transcription : comparaison… eucaryotes/procaryotes
À la notion d’unité trancriptionnelle…
… Introns & Exons
… Splicing = Epissage
Modifications
aux extrémités de l’ARNm:
Coiffe 5’ (7mG)
Polyadénylation 3’
HAV201V 29
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes
HAV201V 30
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes
Coiffe Queue poly A
- Le signal de polyadénylation est
reconnu par une endonucléase qui clive
en aval, au niveau du site d’adénylation.
- Une poly(A) polymérase ajoute ensuite
la queue poly(A).
HAV201V 31
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes
Le spliceosome est un large complexe de protéines et d'ARN qui catalyse l'élimination des introns
Lasso
32
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes
L’épissage alternatif permet
d’obtenir des protéines
différentes à partir d’un même
ARNm
à Avantage évolutif
(Hormone calciotrope) (Neurotransmetteur)
à inhibe la résorption osseuse à médiateurs de la douleur 33
Plan :
- Rappels
- Réplication
- Transcription
- Traduction
- Mouvements cytotiques
- Transports
- Système Membranaire Interne (SMI)
- Canaux
HAV201V 34
Plan :
- Rappels
- Réplication - Généralités
- Transcription - Initiation
- Elongation
- Traduction - Terminaison
- Mouvements cytotiques
- Transports
- Système Membranaire Interne (SMI)
- Canaux
HAV201V 35
La traduction : généralités
Le Ribosome: un Ribozyme
Une usine à protéines fonctionnant grâce à ses ARNr
RiboNucléoProtéines RNP
HAV201V 36
La traduction : généralités
Le ribosome catalyse la formation des liaisons peptidiques
HAV201V 37
La traduction : généralités
à traduire linéairement un alphabet à 4 lettres (codons)
en un alphabet à 20 lettres (aminoacides)
Notion de cadre de lecture
HAV201V 38
La traduction : généralités
Le code génétique:
64 codons pour 20 aa: le code est dégénéré
3 codons
non sens
codon
d’initiation
HAV201V 39
La traduction : généralités
Le Ribosome:
Une machinerie de synthèse des protéines
3 sites de fixation successifs pour l’ARNt
A: amino acide (accueil du nouvel aa-ARNt activé)
P: peptide (ARNt fixé à la protéine = couplage du nouvel aa)
E: exit (sortie=détachement de l’ARNt libéré de l’aa)
HAV201V 40
La traduction : initiation
- Assemblage de
l’ARNm avec la petite - Un ARNt chargé
sous unité du ribosome correspondant au
et l’ARNt chargé de la codon suivant entre
méthionine initiatrice en poche A
- Formation d’une
- Liaison de la grosse liaison peptidique par
sous unité du ribosome le ribosome
- cassure de la liaison
entre l’ARNt de la
Figure 6.70. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science poche P et le peptide
Initiation : seul moment où un aminoacide-ARNt entre en poche P
HAV201V 41
La traduction : élongation
- L’ARNt chargé entre
en poche A
- Ejection de l’ARNt
non chargé (via la
- Formation d’une poche E)
liaison peptidique par
le ribosome
- cassure de la liaison
entre l’ARNt de la - Un nouvel ARNt
poche P et le peptide chargé entre en
poche A
- Translocation du
ribsome
HAV201V 42
La traduction : terminaison
- UAG = codon stop
- Libération de l’ARNm
- Entrée d’un facteur
de terminaison en
poche A - Dissociation des sous-
unités du ribosome,
ARNm…
Figure 6.72. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science
- Les sous-unités des ribosomes retournent dans le pool commun.
- Les ARNt libres seront rechargés HAV201V 43
[Link]
HAV201V 44
La traduction : comparaison eucaryotes/procaryotes
Procaryotes Eucaryotes
Utilisation des ribosomes
Sens de production de la protéine : N-ter à C-ter
Ribosome 70S Ribosome 80S
Traduction co-transcriptionnelle Transcription et traduction découplées
Ribosomes libres Ribosomes libres ou associés au RE
HAV201V 45
Le Ribosome
HAV201V
S = Svedberg (prix Nobel, inventeur de l’ultracentrifugeuse): unité de mesure du taux de sédimentation 46
La traduction : comparaison eucaryotes/procaryotes
Procaryotes Eucaryotes
Utilisation des ribosomes
Sens de production de la protéine : N-ter à C-ter
Ribosome 70S Ribosome 80S
Traduction co-transcriptionnelle Transcription et traduction découplées
Ribosomes libres Ribosomes libres ou associés au RE
HAV201V 47
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes
Fin du gène ARN polymérase Ribosomes Début du gène
ARN
ADN
La transcription et la traduction ont lieu simultanément chez les procaryotes
HAV201V 48
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes
Chez les eucaryotes, suite à la
transcription, les ARN doivent sortir du
noyau avant d’être traduits
HAV201V 49
La traduction : comparaison eucaryotes/procaryotes
Procaryotes Eucaryotes
Utilisation des ribosomes
Sens de production de la protéine : N-ter à C-ter
Ribosome 70S Ribosome 80S
Traduction co-transcriptionnelle Transcription et traduction découplées
Ribosomes libres Ribosomes libres ou associés au RE
HAV201V 50
La traduction : comparaison eucaryotes/procaryotes
Synthèse par les ribosomes libres
HAV201V 51
La traduction : comparaison eucaryotes/procaryotes
Le Polysome:
plusieurs ribosomes traduisent
le même ARNm en même temps
HAV201V 52
La traduction : comparaison eucaryotes/procaryotes
Synthèse par les ribosomes associés au RER
HAV201V 53
La traduction : comparaison eucaryotes/procaryotes
HAV201V 54
La traduction : comparaison eucaryotes/procaryotes
p el S1
Rap
Synthèse et adressage des protéines
55