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Plan:: Rappels Réplication Traduction Mouvements Cytotiques Transports Système Membranaire Interne (SMI) Canaux

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Plan :

- Rappels
- Réplication
- Transcription
- Traduction
- Mouvements cytotiques
- Transports
- Système Membranaire Interne (SMI)
- Canaux

HAV201V 1
Plan :

- Rappels
- Réplication - Généralités
- Initiation
- Transcription - Elongation
- Traduction - Terminaison

- Mouvements cytotiques
- Transports
- Système Membranaire Interne (SMI)
- Canaux

HAV201V 2
La transcription : généralités

HAV201V 3
La transcription : généralités
ARN ADN

Figure 6.6. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science

Structure de l’ARN :
Figure 6.5. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science - Simple brin
- Bases : C, A, U et G
Figure 6.4. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science
- Sucre : ribose
HAV201V 4
La transcription : généralités

L’ARN étant simple brin, il peut se replier en


structures spécifiques

Figure 6.7. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science ARNt ARNr
HAV201V 5
La transcription : généralités
La transcription permet la synthèse de trois principaux types d’ARN :

- ARN messagers (ARNm) à code les protéines

- ARN de transfert (ARNt) à essentiels à la synthèse des protéines : adaptateur entre


l’ARNm et les codons

- ARN ribosomiques (ARNr) à forment la structure de base du ribosome et catalyse la


synthèse des protéines

- Il existent aussi des petits ARN (ARNsno, ARNmi, ARNsi…)

HAV201V 6
La transcription : généralités

Figure 6.13. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science

- Seuls les régions correspondant à des gènes sont transcrites

- La transcription peut avoir comme brin matrice l’un ou l’autre des deux brins d’ADN

HAV201V 7
La transcription : généralités

Figure 6.3. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science

- L’expression n’est pas la même pour tous les gènes


- Elle est régulée selon le stade de développement, le type cellulaire, l’environnement...
HAV201V 8
La transcription : généralités
La régulation de l’expression des gènes se fait principalement au niveau des promoteurs

+1

(Régulation positive ou négative)

Le promoteur :
àRégion non transcrite de l’ADN (en amont du début de la région transcrite)
àLieu de fixation initiale de l’ARN polymérase
HAV201V 9
La transcription : généralités
Procaryote

Certaines séquences du promoteur


(surnommées « boîte ») ont une
importance particulière.

à séquences reconnues spécifiquement


Eucaryote
par différentes protéines appartenant au
complexe d’initiation

Figure 6.16. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science HAV201V 10
La transcription : généralités

Notion de séquence consensus :

à Une séquence consensus peut être déduites


de la fréquence d’observation des nucléotides

Figure 6.12. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science
HAV201V 11
La transcription : initiation

Chez les procaryotes:

à Le facteur sigma permet à l’ARN polymérase


de reconnaitre le promoteur

Différents facteurs sigma peuvent reconnaitre


différents promoteurs

Figure 17.10. Lewin’s genes XII. Ed. Lavoisier


HAV201V 12
La transcription : initiation
Chez les eucaryotes :

à L’ARN polymérase requiert


différents facteurs de
transcription

à Ouverture du double brin par


TFIIH grâce à l’hydrolyse de l’ATP

à TFIIH phosphoryle aussi la


Figure 6.15. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science polymérase au niveau de sa
queue (CTD) à changement de
conformation et libération de la
polymérase
HAV201V 13
La transcription : élongation

- L’ARN polymérase correspond à un


complexe protéique

- Elle polymérise l’ARN dans le sens 5’ à 3’

- Elle n’a pas besoin d’amorce

Figure 6.9. Biologie moléculaire de la cellule 6eme édition. Ed. Lavoisier

HAV201V 14
La transcription : élongation

ARN polymérase : holoenzyme

Figure 17.8. Lewin’s genes XII. Ed. Lavoisier

Figure 17.7. Lewin’s genes XII. Ed. Lavoisier


HAV201V 15
La transcription : élongation

Brin codant (ou sens)


ADN déroulé
ADN enroulé

Brin matrice (ou anti-sens) 3’ Ajout d’un nucléotide complémentaire


en 3’ (liaison covalente)

Brin d’ARN créé Région hybride ADN/ARN

5’

HAV201V 16
La transcription : élongation

Figure 6.9. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science
HAV201V 17
La transcription : terminaison
Chez les procaryotes, il existe deux types de terminaison
Terminaison Rho indépendante :

Terminaison Rho
dépendante :

Chez les eucaryotes, la terminaison de la transcription est en


général couplée avec la polyadénylation en 3' des ARNm. 18
La transcription chez les procaryotes à résumé

Figure 6.11. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science 19
La transcription chez les eucaryotes : résumé

[Link] 20
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes

Procaryotes Eucaryotes
Polymérisation 5’ à 3’
Production d’ARNm, ARNt et ARNr
Régulation (procaryotes : temporelle / eucaryotes : spatio-temporelle)
1 ARN polymérase 3 ARN polymérases
Cytoplasme Noyau
ARN polycistroniques ARN monocistroniques
Absence de modifications post- Présence de modifications post-
transcriptionnelles des ARNm transcriptionnelles des ARNm

HAV201V 21
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes

- ARN polymérase I (nucléole) à transcription des


gènes des ARNr 5,8S, 18S et 28S

- ARN polymérase II (nucléoplasme) à transcription


des gènes codant les protéines

- ARN polymérase III (nucléoplasme) à transcription


des gènes codant les ARNt et les ARNr 5S

HAV201V 22
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes

Procaryotes Eucaryotes
Polymérisation 5’ à 3’
Production d’ARNm, ARNt et ARNr
Régulation (procaryotes : temporelle / eucaryotes : spatio-temporelle)
1 ARN polymérase 3 ARN polymérases
Cytoplasme Noyau
ARN polycistroniques ARN monocistroniques
Absence de modifications post- Présence de modifications post-
transcriptionnelles des ARNm transcriptionnelles des ARNm

HAV201V 23
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes

à Chez les eucaryotes, la transcription a lieu dans le noyau.

à Plus précisément, la synthèse des ARNr (sauf 5S) a lieu dans le nucléole
Une Zone Granuleuse: ADNr + ARNr + Protéines ribosomiques
Une Zone Fibrillaire : ADNr + ARNr

ZG

ZF

HAV201V 24
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes

Procaryotes Eucaryotes
Polymérisation 5’ à 3’
Production d’ARNm, ARNt et ARNr
Régulation (procaryotes : temporelle / eucaryotes : spatio-temporelle)
1 ARN polymérase 3 ARN polymérases
Cytoplasme Noyau
ARN polycistroniques ARN monocistroniques
Absence de modifications post- Présence de modifications post-
transcriptionnelles des ARNm transcriptionnelles des ARNm

HAV201V 25
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes

Notion d’opéron

Figure 6.21. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science

HAV201V 26
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes

Procaryotes Eucaryotes
Polymérisation 5’ à 3’
Production d’ARNm, ARNt et ARNr
Régulation (procaryotes : temporelle / eucaryotes : spatio-temporelle)
1 ARN polymérase 3 ARN polymérases
Cytoplasme Noyau
ARN polycistroniques ARN monocistroniques
Absence de modifications post- Présence de modifications post-
transcriptionnelles des ARNm transcriptionnelles des ARNm

HAV201V 27
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes

d’un gène …

à un messager …

à une protéine…

En français : translation = traduction

HAV201V 28
La transcription : comparaison… eucaryotes/procaryotes
À la notion d’unité trancriptionnelle…

… Introns & Exons

… Splicing = Epissage
Modifications
aux extrémités de l’ARNm:

Coiffe 5’ (7mG)
Polyadénylation 3’

HAV201V 29
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes

HAV201V 30
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes
Coiffe Queue poly A

- Le signal de polyadénylation est


reconnu par une endonucléase qui clive
en aval, au niveau du site d’adénylation.

- Une poly(A) polymérase ajoute ensuite


la queue poly(A).

HAV201V 31
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes

Le spliceosome est un large complexe de protéines et d'ARN qui catalyse l'élimination des introns
Lasso

32
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes

L’épissage alternatif permet


d’obtenir des protéines
différentes à partir d’un même
ARNm
à Avantage évolutif

(Hormone calciotrope) (Neurotransmetteur)


à inhibe la résorption osseuse à médiateurs de la douleur 33
Plan :

- Rappels
- Réplication
- Transcription
- Traduction
- Mouvements cytotiques
- Transports
- Système Membranaire Interne (SMI)
- Canaux

HAV201V 34
Plan :

- Rappels
- Réplication - Généralités
- Transcription - Initiation
- Elongation
- Traduction - Terminaison
- Mouvements cytotiques
- Transports
- Système Membranaire Interne (SMI)
- Canaux

HAV201V 35
La traduction : généralités
Le Ribosome: un Ribozyme
Une usine à protéines fonctionnant grâce à ses ARNr

RiboNucléoProtéines RNP

HAV201V 36
La traduction : généralités

Le ribosome catalyse la formation des liaisons peptidiques

HAV201V 37
La traduction : généralités

à traduire linéairement un alphabet à 4 lettres (codons)


en un alphabet à 20 lettres (aminoacides)
Notion de cadre de lecture

HAV201V 38
La traduction : généralités
Le code génétique:
64 codons pour 20 aa: le code est dégénéré

3 codons
non sens
codon
d’initiation

HAV201V 39
La traduction : généralités
Le Ribosome:
Une machinerie de synthèse des protéines
3 sites de fixation successifs pour l’ARNt

A: amino acide (accueil du nouvel aa-ARNt activé)


P: peptide (ARNt fixé à la protéine = couplage du nouvel aa)
E: exit (sortie=détachement de l’ARNt libéré de l’aa)

HAV201V 40
La traduction : initiation

- Assemblage de
l’ARNm avec la petite - Un ARNt chargé
sous unité du ribosome correspondant au
et l’ARNt chargé de la codon suivant entre
méthionine initiatrice en poche A

- Formation d’une
- Liaison de la grosse liaison peptidique par
sous unité du ribosome le ribosome
- cassure de la liaison
entre l’ARNt de la
Figure 6.70. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science poche P et le peptide

Initiation : seul moment où un aminoacide-ARNt entre en poche P


HAV201V 41
La traduction : élongation

- L’ARNt chargé entre


en poche A
- Ejection de l’ARNt
non chargé (via la
- Formation d’une poche E)
liaison peptidique par
le ribosome
- cassure de la liaison
entre l’ARNt de la - Un nouvel ARNt
poche P et le peptide chargé entre en
poche A

- Translocation du
ribsome

HAV201V 42
La traduction : terminaison

- UAG = codon stop


- Libération de l’ARNm

- Entrée d’un facteur


de terminaison en
poche A - Dissociation des sous-
unités du ribosome,
ARNm…
Figure 6.72. Molecular biology of the cell – 6th edition. Garland Science

- Les sous-unités des ribosomes retournent dans le pool commun.


- Les ARNt libres seront rechargés HAV201V 43
[Link]
HAV201V 44
La traduction : comparaison eucaryotes/procaryotes

Procaryotes Eucaryotes
Utilisation des ribosomes
Sens de production de la protéine : N-ter à C-ter
Ribosome 70S Ribosome 80S
Traduction co-transcriptionnelle Transcription et traduction découplées
Ribosomes libres Ribosomes libres ou associés au RE

HAV201V 45
Le Ribosome

HAV201V
S = Svedberg (prix Nobel, inventeur de l’ultracentrifugeuse): unité de mesure du taux de sédimentation 46
La traduction : comparaison eucaryotes/procaryotes

Procaryotes Eucaryotes
Utilisation des ribosomes
Sens de production de la protéine : N-ter à C-ter
Ribosome 70S Ribosome 80S
Traduction co-transcriptionnelle Transcription et traduction découplées
Ribosomes libres Ribosomes libres ou associés au RE

HAV201V 47
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes

Fin du gène ARN polymérase Ribosomes Début du gène


ARN

ADN

La transcription et la traduction ont lieu simultanément chez les procaryotes

HAV201V 48
La transcription : comparaison eucaryotes/procaryotes

Chez les eucaryotes, suite à la


transcription, les ARN doivent sortir du
noyau avant d’être traduits

HAV201V 49
La traduction : comparaison eucaryotes/procaryotes

Procaryotes Eucaryotes
Utilisation des ribosomes
Sens de production de la protéine : N-ter à C-ter
Ribosome 70S Ribosome 80S
Traduction co-transcriptionnelle Transcription et traduction découplées
Ribosomes libres Ribosomes libres ou associés au RE

HAV201V 50
La traduction : comparaison eucaryotes/procaryotes
Synthèse par les ribosomes libres

HAV201V 51
La traduction : comparaison eucaryotes/procaryotes

Le Polysome:
plusieurs ribosomes traduisent
le même ARNm en même temps

HAV201V 52
La traduction : comparaison eucaryotes/procaryotes
Synthèse par les ribosomes associés au RER

HAV201V 53
La traduction : comparaison eucaryotes/procaryotes

HAV201V 54
La traduction : comparaison eucaryotes/procaryotes
p el S1
Rap

Synthèse et adressage des protéines


55

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