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2 - Structure Des Acides Nucléiques

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06/05/1444

L’ADN est constant pour tous les


membres d'une espèce donnée

Teneur en ADN par génome haploïde,


pour différents organismes

Espèces Kilobases/ génome haploïde


E. coli 4.5 x 103
Homme 3.0 x 106
Drosophile 1.7 x 105
Maïs 2.0 x 106
Souris 2.7 x 106

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B1102 - Génétique

Dr. Dana Zeineddine


Dr. Ali El Roz

Un acide nucléique est un polymère formé par


l’union covalente de nucléotides (monomères)

Un polymère est une molécule de masse moléculaire


élevée constituée de monomères unis les uns aux
autres par des liaisons covalentes

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Un nucléotide est composé de 3 parties:

- Un phosphate ou acide phosphorique


- Un sucre
- Une base azotée

Il existe deux types d’acides nucléiques :


l'acide désoxyribonucléique (ADN) et
l’acide ribonucléique (ARN).

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Les acides nucléiques sont présents dans


les cellules eucaryotes et procaryotes et
dans les virus.

Le sucre du nucléotide est un pentose (sucre à 5


carbones)

Dans l’ADN, le pentose est le 2 '-désoxyribose.

Dans l’ARN, le pentose est le ribose.

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La seule différence entre le 2’- désoxyribose et le ribose,


c’est que:

- En position 2’ du ribose, il y a un groupement hydroxyle


(-OH)

- Par contre, en position 2’ du désoxyribose, le


groupement hydroxyle (-OH) est remplacé par un
hydrogène (-H)

Le désoxyribose a un groupement (-OH) en moins


(d’où son nom désoxyribose)

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(DNA)

(RNA)

Il existe 2 groupes de bases azotées :


A- Les pyrimidines:
- comprennent la cytosine, la thymine et l’uracile.

- Une pyrimidine est formée d’un seul cycle.

B- Les purines:
- comprennent l’adénine et la guanine
- Une purine est formée de 2 cycles.

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Pyrimidines

Seulement
dans l’ADN

Seulement
dans l’ARN

Purines

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1 Que le sucre soit le ribose ou le désoxyribose, son


atome de carbone 1’ est relié à un azote d’une
purine ou d’une pyrimidine

C’est une liaison N- glycosidique (entre le


sucre et la base azotée)

2 Le groupe hydroxyle de l’atome de carbone 5’ est


esterifié par le groupe phosphoryle

ADN ARN

Adénine (A) Adénine (A)


Guanine (G) Guanine (G)

Thymine (T) Uracile (U)


Cytosine (C ) Cytosine (C )

Désoxyribose Ribose

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Liaison N-glycosidique

Les groupes –OH


du carbone 3’ et du
carbone 5’ sont esterifiés
Phosphate
Base

sucre

Estérification

C’est une réaction au cours de laquelle un


groupe alcool (- OH) est condensé à un groupe
acide carboxylique (-COOH) avec élimination
d'une molécule d'eau (H2O), ce qui forme une
liaison ester (- COO-).

R—COOH + R'—OH R—COO—R' + H2O

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Un nucléoside est une combinaison de


sucre et de base
Base

sucre

Les nucléosides contenant une purine se


terminent par “sine”: adénosine, par exemple
Les nucléosides contenant une
pyrimidine se terminent par “dine”: cytidine,
par exemple

Nomenclature

Bases Nucléosides Nucléotides

Adénine désoxyadénosine dAMP, dADP,dATP


Guanine déoxyguanosine dGMP, dGDP,dGTP
ADN Thymine désoxythymidine dTMP, dTDP,dTTP
Cytosine désoxycytidine dCMP, dCDP,dCTP

Adénine Adénosine AMP, ADP,ATP


Guanine Guanosine GMP, GDP, GTP
ARN
Uracile Uridine UMP, UDP,UTP
Cytosine Cytidine CMP, CDP, CTP

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Les nucléotides, porteurs de un, deux ou trois


groupes phosphoryle, sont des
nucléosides phosphate.

Phosphate Adénine
Phosphate Phosphate
(g ) (b ) (a)

ribose

AMP: adénosine 5’-monophosphate

ADP: adénosine 5’-diphosphate

ATP: adénosine 5’-triphosphate

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Les nucléosides triphosphates sont les


substrats de la réaction de la synthèse d’un
acide nucléique.(un brin complémentaire)

Une fois que le nucléoside triphosphate


est ajouté à la séquence, les groupements
phosphate (b) et (g) sont éliminés.

Quand les nucléotides se polymérisent en acides


nucléiques, l’hydroxyle du carbone 3’ du sucre
d’un nucléotide forme une liaison ester avec le
groupement phosphate du nucléotide suivant.

Les nucléotides sont donc unis par des


liaisons phosphodiester

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pont
phosphodiester

La formation des liaisons phosphodiester entre les


désoxyribonucleotides est dite polymérisation.

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Un brin d’acide nucléique est donc un polymère


de phosphoryle- pentose dont les groupes latéraux
sont les bases puriques et pyrimidiques.

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Un brin d’acide nucléique a une orientation chimique:

L’extrémité de la chaîne avec un phosphate


libre est appelée extrémité 5’

L’autre extrémité 3’ de la chaîne porte un


groupe hydroxyle libre sur le carbone 3’
du sucre.

La synthèse de l’acide nucléique procède alors


de 5’ en 3’

Les lois d’Erwin Chargaff

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Entre 1949 et 1953, Erwin Chargaff et ses


collègues ont pu séparer les quatre bases
azotées provenant d’échantillons d’ADN
issus de différents organismes.

1 La somme des purines est égale à la


somme des pyrimidines.

A+G= C+T

Le rapport A+G/C+T
est égale à 1

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Nombre de (A) = Nombre de (T)

Nombre de (G) = Nombre de (C)

A/T=C/G=1

2 Le pourcentage (C+G) n’est pas égal à


celui de (A+T).

En effet, le rapport A+T / C+G


peut varier d'une espèce à l'autre.

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Les résultats de Chargaff ont été déterminants


dans l’élaboration du célèbre modèle de
structure de l’ADN publié par Watson et Crick
en 1953.

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Les analyses de Watson et Crick étaient basées


sur les études effectuées sur la forme B de la
double hélice d’ADN.

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L'ADN comporte 2 chaînes polynucléotidiques


(brins) séparées, enroulées l’une autour de l’autre
en forme d’hélice autour d’un axe.

1 Les 2 squelettes sucre- phosphoryle


(désoxyribophosphate) courent à la surface
de l’hélice double, les bases azotées sont
tournées vers l’intérieur.

Les bases azotées sont horizontales


et perpendiculaires à l’axe central.

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5’ 3’

3’ 5’

2 Dans une double hélice d’ADN, les 2 brins


sont complémentaires:
Les bases appartenant à des brins opposés,
s'apparient grâce à des liaisons H (hydrogène).

L’association des bases A/T est assurée par deux


liaisons hydrogène, alors que l’association C/G
en comporte trois.

T A G C

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3 Dans une double hélice d’ADN, les 2 brins


sont anti- parallèles:
Un brin est dans le sens 5'->3' alors que le
brin complémentaire est en sens 3'->5'.

4 Les paires de bases forment des plateaux


parallèles (l’hélice est un ensemble de
plateaux qui forment un escalier)

Il y a 10 paires de bases par tour d'hélice


(3.4 nm= 34 A°).

On a donc 3.4 A° entre 2 paires de bases consécutives.

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5 Le diamètre de l’hélice est de 2.37 nm

6 L’hélice d’ADN classique a la forme B (la forme


la plus commune):

C’est une hélice droite (à pas dextrogyre) qui


tourne dans le sens des aiguilles d’une montre.

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Petit sillon

Grand sillon

2.37 nm

7 L’hélice présente 2 sillons de largeur différente:


un grand sillon et un petit sillon.

Des interactions protéines –ADN peuvent


se passer dans le grand ou le petit sillon

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