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L’ADN est constant pour tous les
membres d'une espèce donnée
Teneur en ADN par génome haploïde,
pour différents organismes
Espèces Kilobases/ génome haploïde
E. coli 4.5 x 103
Homme 3.0 x 106
Drosophile 1.7 x 105
Maïs 2.0 x 106
Souris 2.7 x 106
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B1102 - Génétique
Dr. Dana Zeineddine
Dr. Ali El Roz
Un acide nucléique est un polymère formé par
l’union covalente de nucléotides (monomères)
Un polymère est une molécule de masse moléculaire
élevée constituée de monomères unis les uns aux
autres par des liaisons covalentes
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Un nucléotide est composé de 3 parties:
- Un phosphate ou acide phosphorique
- Un sucre
- Une base azotée
Il existe deux types d’acides nucléiques :
l'acide désoxyribonucléique (ADN) et
l’acide ribonucléique (ARN).
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Les acides nucléiques sont présents dans
les cellules eucaryotes et procaryotes et
dans les virus.
Le sucre du nucléotide est un pentose (sucre à 5
carbones)
Dans l’ADN, le pentose est le 2 '-désoxyribose.
Dans l’ARN, le pentose est le ribose.
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La seule différence entre le 2’- désoxyribose et le ribose,
c’est que:
- En position 2’ du ribose, il y a un groupement hydroxyle
(-OH)
- Par contre, en position 2’ du désoxyribose, le
groupement hydroxyle (-OH) est remplacé par un
hydrogène (-H)
Le désoxyribose a un groupement (-OH) en moins
(d’où son nom désoxyribose)
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(DNA)
(RNA)
Il existe 2 groupes de bases azotées :
A- Les pyrimidines:
- comprennent la cytosine, la thymine et l’uracile.
- Une pyrimidine est formée d’un seul cycle.
B- Les purines:
- comprennent l’adénine et la guanine
- Une purine est formée de 2 cycles.
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Pyrimidines
Seulement
dans l’ADN
Seulement
dans l’ARN
Purines
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1 Que le sucre soit le ribose ou le désoxyribose, son
atome de carbone 1’ est relié à un azote d’une
purine ou d’une pyrimidine
C’est une liaison N- glycosidique (entre le
sucre et la base azotée)
2 Le groupe hydroxyle de l’atome de carbone 5’ est
esterifié par le groupe phosphoryle
ADN ARN
Adénine (A) Adénine (A)
Guanine (G) Guanine (G)
Thymine (T) Uracile (U)
Cytosine (C ) Cytosine (C )
Désoxyribose Ribose
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Liaison N-glycosidique
Les groupes –OH
du carbone 3’ et du
carbone 5’ sont esterifiés
Phosphate
Base
sucre
Estérification
C’est une réaction au cours de laquelle un
groupe alcool (- OH) est condensé à un groupe
acide carboxylique (-COOH) avec élimination
d'une molécule d'eau (H2O), ce qui forme une
liaison ester (- COO-).
R—COOH + R'—OH R—COO—R' + H2O
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Un nucléoside est une combinaison de
sucre et de base
Base
sucre
Les nucléosides contenant une purine se
terminent par “sine”: adénosine, par exemple
Les nucléosides contenant une
pyrimidine se terminent par “dine”: cytidine,
par exemple
Nomenclature
Bases Nucléosides Nucléotides
Adénine désoxyadénosine dAMP, dADP,dATP
Guanine déoxyguanosine dGMP, dGDP,dGTP
ADN Thymine désoxythymidine dTMP, dTDP,dTTP
Cytosine désoxycytidine dCMP, dCDP,dCTP
Adénine Adénosine AMP, ADP,ATP
Guanine Guanosine GMP, GDP, GTP
ARN
Uracile Uridine UMP, UDP,UTP
Cytosine Cytidine CMP, CDP, CTP
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Les nucléotides, porteurs de un, deux ou trois
groupes phosphoryle, sont des
nucléosides phosphate.
Phosphate Adénine
Phosphate Phosphate
(g ) (b ) (a)
ribose
AMP: adénosine 5’-monophosphate
ADP: adénosine 5’-diphosphate
ATP: adénosine 5’-triphosphate
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Les nucléosides triphosphates sont les
substrats de la réaction de la synthèse d’un
acide nucléique.(un brin complémentaire)
Une fois que le nucléoside triphosphate
est ajouté à la séquence, les groupements
phosphate (b) et (g) sont éliminés.
Quand les nucléotides se polymérisent en acides
nucléiques, l’hydroxyle du carbone 3’ du sucre
d’un nucléotide forme une liaison ester avec le
groupement phosphate du nucléotide suivant.
Les nucléotides sont donc unis par des
liaisons phosphodiester
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pont
phosphodiester
La formation des liaisons phosphodiester entre les
désoxyribonucleotides est dite polymérisation.
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Un brin d’acide nucléique est donc un polymère
de phosphoryle- pentose dont les groupes latéraux
sont les bases puriques et pyrimidiques.
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Un brin d’acide nucléique a une orientation chimique:
L’extrémité de la chaîne avec un phosphate
libre est appelée extrémité 5’
L’autre extrémité 3’ de la chaîne porte un
groupe hydroxyle libre sur le carbone 3’
du sucre.
La synthèse de l’acide nucléique procède alors
de 5’ en 3’
Les lois d’Erwin Chargaff
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Entre 1949 et 1953, Erwin Chargaff et ses
collègues ont pu séparer les quatre bases
azotées provenant d’échantillons d’ADN
issus de différents organismes.
1 La somme des purines est égale à la
somme des pyrimidines.
A+G= C+T
Le rapport A+G/C+T
est égale à 1
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Nombre de (A) = Nombre de (T)
Nombre de (G) = Nombre de (C)
A/T=C/G=1
2 Le pourcentage (C+G) n’est pas égal à
celui de (A+T).
En effet, le rapport A+T / C+G
peut varier d'une espèce à l'autre.
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Les résultats de Chargaff ont été déterminants
dans l’élaboration du célèbre modèle de
structure de l’ADN publié par Watson et Crick
en 1953.
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Les analyses de Watson et Crick étaient basées
sur les études effectuées sur la forme B de la
double hélice d’ADN.
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L'ADN comporte 2 chaînes polynucléotidiques
(brins) séparées, enroulées l’une autour de l’autre
en forme d’hélice autour d’un axe.
1 Les 2 squelettes sucre- phosphoryle
(désoxyribophosphate) courent à la surface
de l’hélice double, les bases azotées sont
tournées vers l’intérieur.
Les bases azotées sont horizontales
et perpendiculaires à l’axe central.
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5’ 3’
3’ 5’
2 Dans une double hélice d’ADN, les 2 brins
sont complémentaires:
Les bases appartenant à des brins opposés,
s'apparient grâce à des liaisons H (hydrogène).
L’association des bases A/T est assurée par deux
liaisons hydrogène, alors que l’association C/G
en comporte trois.
T A G C
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3 Dans une double hélice d’ADN, les 2 brins
sont anti- parallèles:
Un brin est dans le sens 5'->3' alors que le
brin complémentaire est en sens 3'->5'.
4 Les paires de bases forment des plateaux
parallèles (l’hélice est un ensemble de
plateaux qui forment un escalier)
Il y a 10 paires de bases par tour d'hélice
(3.4 nm= 34 A°).
On a donc 3.4 A° entre 2 paires de bases consécutives.
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5 Le diamètre de l’hélice est de 2.37 nm
6 L’hélice d’ADN classique a la forme B (la forme
la plus commune):
C’est une hélice droite (à pas dextrogyre) qui
tourne dans le sens des aiguilles d’une montre.
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Petit sillon
Grand sillon
2.37 nm
7 L’hélice présente 2 sillons de largeur différente:
un grand sillon et un petit sillon.
Des interactions protéines –ADN peuvent
se passer dans le grand ou le petit sillon
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