Catabolisme protéines : la séquence des AA détermine la structure primaire, la configuration
spatiale détermine les structures secondaire et tertiaire, et l’association des chaines détermine la
structure quaternaire
Exogènes : par enzymes spécifiques du lieu de la liaison peptidique (endo/exo)
- Intra luminale : d’abord proenzymes inactifs sécrétés par estomac (pepsine), pancréas (trypsine,
chymotrypsine, élastase, carboxypeptidase), intestin grêle (aminopeptidase) vont s’activer et
cataboliser les prot en AA et peptides
- Membranaire : hydrolyse par les aminopeptidases de la bordure en brosse des peptides en AA et
di/tripeptides qui vont être absorbés par transporteurs actifs spécifiques
- Cytosol : hydrolyse des di/tripeptides en AA par peptidases
Endogènes : ATP dépendante lysosomal hépatique et cytosolique musculaire par protéasome qui
détruit les protéines liées à l’ubiquitine (protéine signal de mort)
Régulation métabolisme protéines :
- Insuline et catécholamines : ↗ protéosynthèse et ↘ protéolyse
- HG : anabolisante comme l’insuline ↗ protéosynthèse directement par IGF1
- Glucocorticoïdes et glucagon : effet catabolisant prédominant ↗ protéolyse ↘ traduction
Catabolisme AA : retrait de la f° aminé soit par double transamination ou par transamination +
désamination, puis recyclage squelette carboné par décarboxylation
Transamination : la plupart des AA sont transaminables sauf lysine, échange réversible NH2 entre AA
et un α-cétoacide (α-cétoglutarate), nécessite VitB6 (phosphate pyridoxal), double :
- 1ère : AA spécifique + α-cétoglutarate -> α-cétoacide + glutamate
- 2ème dans le foie par ASAT : glutamate + oxaloacétate -> α-cétoglutarate + aspartate
- 2ème dans le muscle/intestin par ALAT : glutamate + pyruvate -> α-cétoglutarate + alanine
Désamination : précédée par transamination
- Oxydative mitochondriale réversible du glutamate (coenzyme NAD pour dégrader ou NADP pour
synthèse) et libération NH3 toxique (ammoniac)
- Oxydation mitochondriale réversible des autres AA par L-amino-oxydases dans le foie (coenzyme
FMN) ou D-amino-oxydase dans le foie/rein (coenzyme FAD) avec libération NH3
- Non oxydative cytosolique de sérine/thréonine/histidine par déshydratase -> sérine donne pyruvate
et thréonine donne α-cétoglutarate avec libération NH3
Devenir du NH3 : après repas -> élimination par uréogenèse 4/5 (foie) et ammoniogenèse 1/5 (rein)
- Le foie reçoit la glutamine des muscles et de l’intestin transportée dans le plasma sous cette forme
(AA le plus abondant dans le sg avec acide glutamique qui est la forme ionisée du glutamate) -> une
fois arrivée au foie la glutamine s’hydrolyse pour donner glutamate et libérer NH3 -> entrée dans le
cycle de l’urée
- Dans les reins, la glutamine libère NH3 qui diffuse facilement dans la lumière tubulaire et s’ionise en
NH4+ (ammonium)
Catabolisme du radical carbone des AA : dans le foie, après départ du groupe α aminé, chaque AA
libère un α-cétoacide correspondant entrant dans la production d’énergie -> 14 AA glucoformateurs
purs (pyruvate ou intermédiaire Krebs) + 1 AA céto-formateur pur (CC ou précurseur, leucine) + 5
mixtes (isoleucine, lysine, phénylalanine, tryptophane, tyrosine)
Synthèse AA : 8 AA essentiels non synthétisés mais apportés par alimentation (leucine, isoleucine,
lysine, thréonine, tryptophane, valine, méthionine, phénylalanine) + 12 AA synthétisés :
- 2 à partir d’AA indispensables : tyrosine par hydroxylation phénylalanine et cystéine par méthionine
- 5 à partir d’intermédiaires métaboliques : histidine par 5P-ribose, sérine par 3P-glycérate, alanine
par pyruvate, aspartate par oxaloacétate, glutamate par α-cétoglutarate
- 5 à partir d’AA non indispensables : glycine par sérine, asparagine par aspartate,
glutamine/proline/arginine par glutamate
- AA polaires chargés positivement (favorisent solubilité) : histidine, arginine, lysine
- AA polaires chargés négativement (favorisent solubilité): aspartate, glutamate
- AA cycliques : proline (chaine imine), phénylalanine, tyrosine, tryptophane (aromatiques)
- Tyrosine -> catécholamines (adrénaline, noradrénaline, dopamine), thyroxine, mélanine
- Tryptophane -> mélatonine
- Cystéine -> CoA
- Seule la glycine n’a pas de carbone asymétrique -> glutathion
- Arginine porte 4 atome d’azote
- AA portant f° OH (peuvent être phosphorylés) : sérine, thréonine, tyrosine
Cycle de l’urée : exclusivement hépatique, donne l’urée non toxique hydrophile 15-30g/j
Phase mitochondriale :
- Synthèse P-carbamoyl à partir de CO2 + NH4+ + 2 ATP
- Transfère sur L-ornithine pour donner citrulline (peut être synthétisé dans l’intestin ou endothélium
à partir de l’arginine)
Phase cytosolique :
- Condensation avec aspartate en consommant 1 ATP pour donner arginosuccinate
- Clivage en L-arginine + fumarate
- Hydrolyse arginine en urée + L-ornithine et transport du fumarate dans la mitochondrie vers Krebs
Bilan : NH4+ + CO2 + aspartate + 3 ATP -> urée CO(NH2)2 + fumarate + 2ADP + 2 Pi + AMP + PPi
Régulation : allostérique activatrice par excès d’AA (post-prandial) et NH3 et par N-acétyl-glutamate
qui active la P-carbamoyl synthétase, hormonale inhibitrice de l’insuline qui pousse vers la
protéosynthèse
