ACIDES NUCLEIQUES
Dr Najah Fatou Coly Gueye
SIO
UFR Santé Thiès
OBJECTIFS
• Reproduire la structure des principales bases puriques et pyrimidiques
• Citer les différents éléments d’un nucléoside et nucléotide en définissant
le mode de liaison
• Décrire les fonctions biologiques des nucléotides
• Décrire la structure primaire des acides nucléiques
• Décrire les principales caractéristiques de la molécule d’ADN
• Citer les différents types d’ARN
• Donner le rôle des différents types d’ARN
• Citer les principales différences entre l’ADN et l’ARN
• Citer les différentes applications dérivant de l’études des acides
nucléiques
PLAN
I. INTRODUCTION
II. ACIDES DESOXYRIBONUCLEIQUE (ADN)
II-1 Structure primaire
II-2 Structure secondaire
II-3 Caractéristiques de l’ADN
II-4 Propriétés physico-chimiques
III. ACIDES RIBONUCLEIQUES
III-1 Structure primaire
III-2 Structure secondaire
III-3 Différentes classes d’ARN
III- 4 Propriétés physico-chimiques
IV. INTERETS ETUDES ACIDES NUCLEIQUES
I. GENERALITES
• Acides nucléiques
üMacromolécules formées par polymérisation de nucléotides (polynucléotides).
üCondensation par des liaisons phosphodiesters.
üMolécules impliquées:
- l’OH en C’3 du 1er nucléotide et
→ chaîne polynucléotidique.
- l’OH de l’acide phosphorique du nucléotide suivant
I. GENERALITES
• Les nucléosides et les nucléotides sont les constituants fondamentaux
des acides nucléiques (ARN et ADN).
• Nucléoside = hétéroside formé d’ ose (ribose ou 2’désoxyribose) et de
base purique ou pyrimidique, unis par une liaison N-glycosidique.
• Nucléotide = nucléoside phosphorylé
I. GENERALITES
1. BASES 4
N3 5
2 6
1
N
Noyau pyrimidique
NH 2
O O
4
N3
4 H 4 CH3
H N3 5
N3
5 5
2 6 O
2 6 2 6
O 1 N
1
O
N
H N1
H
H
Thymine = 5-méthyl-uracile
Cytosine = 2-oxy-4-amino-pyrimidine
Uracile = 2,4-dioxy-pyrimidine = 2,4-dioxy-5-méthyl-
pyrimidine
I. GENERALITES
1. BASES 6 N
7
N1 5
2 4
9
3
N
N H
PURINE
•Deux bases principales
• Adénine = 6 amino-purine
• Guanine = 2 amino 6 oxy-purine
I. GENERALITES
•Ce sont des pentoses
2. SUCRES (oses) •II s'agit :
- du ribose (sous forme β-D ribofuranose) : constitutif de
qStructure l'ARN
- du désoxyribose (sous forme β-D 2-désoxy ribofuranose) :
HOH2C 5’ o OH constitutif de l'ADN
HOH2C 5’ o OH
4’ 1’
4’ 1’
3’ 2’
HO OH 3’ 2’
HO H
β-D- RIBOFURANOSE β-D- 2’-DESOXYRIBOFURANOSE
I. GENERALITES
3. Acide phosphorique H3PO4
• Trois fonctions acides
• Une seule est libre
O
||
HO - P – OH
|
OH
I. GENERALITES
Base azotée
N1 du noyau pyrimidine
N9 du noyau purine
HOH2C 5’ o
4’ 1’
3’ 2’ Liaison β-N-osidique
I. GENERALITES
NH2
• Les principaux ribonucléosides sont :
Cytosine 4
N3 5
Adénine + D - ribose ==> Adénosine 2 1 6
O
Guanine + D - ribose ==> Guanosine N
Cytosine + D - ribose ==> Cytidine
Uracile + D - ribose ==> Uridine HOH2C 5’ o
4’ 1’
• Adénine + 2’D-désoxyribose ==> Désoxy-adénosine
3’ 2’
• Guanine + 2’D-désoxyribose ==> Désoxy-guanosine
HO OH
I. GENERALITES
Ø Les principaux ribonucléotides sont : NH2
Adénine : Adénosine 5’ monophosphate ou AMP
4
N3 5
Guanine :Guanosine 5’ monophosphate ou GMP
2 1 6
Cytosine :Cytidine 5’ monophosphate ou CMP O
N
Uracile :Uridine 5’ monophosphate ou UMP OH
O P OH2C5’ o
OH
4’ 1’
Cytidine 5’monophosphate
3’ 2’
CMP
HO OH
I. GENERALITES
• On distingue 2 types d'acides nucléiques selon la nature des pentoses:
ADN ou ARN.
• Acides désoxyribonucléiques (ADN) sont présents essentiellement dans
le noyau des cellules eucaryotes
• ARN retrouvés dans cytoplasme chez les virus, les bactéries, les plantes,
les animaux et l’homme.
• Fonctions:
üSupport de l'information génétique (ADN).
üMoyen d'expression de cette information (ARN).
II. ACIDE DESOXYRIBONUCLEIQUE (ADN)
I.1 Structure primaire
• Comportent:
- β D 2’-désoxyribofuranose
- acide phosphorique
- quatre bases fondamentales
deux bases puriques : A, G
deux bases pyrimidiques : C, T
• Pas d’uracile dans la molécule de DNA
II. ACIDE DESOXYRIBONUCLEIQUE (ADN)
I.1 Structure primaire
II. ACIDE DESOXYRIBONUCLEIQUE (ADN)
I.1 Structure primaire
• Formé d’une double chaîne nucléotidique (2
brins)
• Les nucléotides sont hybridés deux à deux sur
toute la longueur.
• Les bases azotées liées par les liaisons
hydrogènes sont tournées vers l’intérieur
• Les riboses et les acides phosphoriques, sont
tournés vers l’extérieur.
II. ACIDE DESOXYRIBONUCLEIQUE (ADN)
I.2 Structure secondaire
→ conformation hélicoïdale de l’ADN
Watson et Crick (1953)
II. ACIDE DESOXYRIBONUCLEIQUE (ADN)
NB: Nomenclature
• Représentation des acides nucléiques de 5’ → 3’
• ARN : pA : le P estérifie le 5’ OH
- Ap : le P estérifie le 3’ OH
- pApU : → le premier P estérifie le 5’ OH de A et le deuxième P
estérifie à la fois le 3’ OH de A et le 5’OH de U
• ADN : même convention sauf mettre d (pour désoxyribose) devant
et les bases T à la place de U.
II. ACIDE DESOXYRIBONUCLEIQUE (ADN)
I.3 Caractéristiques de l’ADN
Ø Complémentarité des bases
ØDeux chaînes polydésoxyribonucléotidiques unies par des liaisons
hydrogènes entre bases puriques et pyrimidiques ⇒ stabilité de la
molécule d’ADN
Ø Dans une molécule de DNA il y a autant de A que de T et de G que de C.
Ø La somme des bases puriques est toujours égale à la somme des bases
pyrimidiques d’où
A+ G/ T + C =1
Ø Bases sont complémentaires et forment des paires de bases (pb)
II. ACIDE DESOXYRIBONUCLEIQUE (ADN)
ØAppariement des bases se fait entre
- A et T avec 2 liaisons hydrogènes
- G et C avec 3 liaisons hydrogènes
II. ACIDE DESOXYRIBONUCLEIQUE (ADN)
I.3 Caractéristiques de l’ADN
Ø Antiparallélisme des deux chaînes
• Les orientations des 2 brins sont
opposés :brins sont antiparallèles
• l’extrémité 5’ de l’une est du côté
de l’extrémité 3’ de l’autre et vice
versa.
• La lecture de chaque brin se fait
dans le sens 5’ → 3’
• On écrit de 5' au 3' :
§ Extrémité 5' : phosphate
§ Extrémité 3' : –OH libre
II. ACIDE DESOXYRIBONUCLEIQUE (ADN)
I.3 Caractéristiques de l’ADN
Ø Conformation hélicoïdale
• La double hélice représente la
structure secondaire de l'ADN
• Les 2 chaines de DNA
présentent dans l’espace une
configuration hélicoïdale .
• S’enroulent autour d’un axe
central imaginaire en formant
une double hélice de 2 nm de
diamètre .
III. LE GÉNOME NUCLÉAIRE
Ø Compaction de l’ADN dans le
noyau
Ø Dans le noyau, ADN n’est pas
nu mais associé à des protéines
(histones)
Ø Ensemble constitue
la chromatine
III. LE GÉNOME NUCLÉAIRE
• L’empaquetage de l’ADN met en jeu
plusieurs niveaux de repliement
• Double hélice d’ADN
• Nucléosome = structure de base de
100 A de diamètre: structure perlée
ou en chapelet
• Solénoide = superstructure de 300 A
de diamètre
• Boucles d’ADN superenroulé
• Chromosomes = forme la plus
compactée de la chromatine, visible
en métaphase
IV. ACIDE RIBONUCLEIQUE (ARN)
IV.1 Structure primaire
• Les acides ribonucléiques contiennent :
- D- ribofuranose
- L’acide phosphorique
- 04 bases fondamentales: puriques (A, G);
pyrrimidique (C, U)
-Une seule chaîne monocaténaire
• Pas de thymine dans ARN
IV. ACIDE RIBONUCLEIQUE (ARN)
IV.2 Structure secondaire
• Des appariements par liaisons hydrogène entre bases
complémentaires sont possibles A=U, G≡C
• A la suite de ces appariements, la chaîne de l’ARN peut se replier
sur de courtes distances donnant un aspect pseudo-hélicoidale.
IV. ACIDE RIBONUCLEIQUE (ARN)
IV.3 Différentes classes d’ARN
ØARN ribosomaux
• Représentent la majorité de l’ARN cellulaire (80%)
• Rôle essentiel dans la structure et le maintien de l’intégrité des
ribosomes en association avec les protéines ribosomales.
(S) Svedberg= Constante de sédimentation
Eucaryotes
•60S: ARN 5S, 5,8S,
80 S
28S
•40S: ARN 18S
IV. ACIDE RIBONUCLEIQUE (ARN)
IV.3 Différentes classes d’ARN
ØARN ribosomaux
Procaryotes:
• 50 S: ARN 5S, ARN 23S
• 30 S: ARN 16S
30 S
70 S
50 S
IV. ACIDE RIBONUCLEIQUE (ARN)
IV.3 Différentes classes d’ARN
Ø ARN de transfert
• Sont indispensables au transfert des AA au
cours de la biosynthèse des protéines
• Structure en forme de trèfle
RÔLE
• Apporte aux ribosomes les résidus d’AA qui
sont ajoutés à la chaîne protéique en
croissance lors de la traduction.
IV. ACIDE RIBONUCLEIQUE (ARN)
IV.3 Différentes classes d’ARN
ØRNA messager
• Produit de la transcription des gènes dont la
séquence des bases est complémentaire de celle
du DNA lui ayant donné naissance (antisens)
• Apporte au cytoplasme l’information génétique
contenue dans le génome vers les sites de
synthèse protéiques (traduction)
• RNA m existe en une seule chaîne organisée en
triplets de bases ou codons; de longueur variable
selon la protéine codée.
• Chaque codon ou triplet correspond à un AA.
IV. ACIDE RIBONUCLEIQUE (ARN)
IV.4 Synthèse des protéines
• La synthèse des protéines est l'acte par lequel une cellule assemble
une chaîne protéique en combinant des acides aminés isolés
présents dans son cytoplasme, guidé par l'information contenue
dans l'ADN.
• Elle se déroule en deux étapes au moins :
• la transcription de l'ADN en ARN messager et
• la traduction de l'ARN messager en une protéine.
V. APPLICATIONS
Ø Identification humaine par
empreintes digitales
• Empreintes digitales → le profil
génétique » de chaque
individu.
• Utilisée:
ü Criminalistique,
médecine légale
ü Recherches de filiation
(test de paternité).
Ø Phylogénie moléculaire
• Etude parenté entre
organismes vivants
V. APPLICATIONS
ØLes cibles médicamenteuses
Ex: Anticancéreuses ciblent la structure de l’ADN (intercalants fixe
ADN et bloque ADN polymérase)
ØDiagnostic moléculaire
• Techniques d’amplification génique (PCR), de séquençage de l’ADN
et de cytogénétique (caryotype) → diagnostique sure et rapide de
nombreuses pathologies
ØThérapie génique
• Soigner ou prévenir des maladies héréditaires ou non.
FIN
