II – La double spécificité des enzymes
Quel est le mode d’action des enzymes ?
TP enzyme glucosidase + logiciel de modélisation Libmol
et rastop (=Activité 1 – PARTIE 1 & 2)
La structure des enzymes induit la spécificité de substrat
Les enzymes sont des protéines possédant une structure 3D très particulière, elles possèdent un site actif.
Le site actif d’une enzyme doit, pour permettre la catalyse, avoir une conformation 3D bien précise. C’est cette
conformation qui explique la spécificité au substrat.
Le site actif est décomposé en 2 parties :
• une zone de fixation ;
• une zone catalytique.
Ce site est fragile et dépend du milieu, toutes modifications de
l’environnement entraînent l’absence du fonctionnement de
l’enzyme.
Schéma d’une enzyme
Le mode d’action des enzymes
Les étapes de la catalyse enzymatique
Les réactions catalysées par les enzymes peuvent être découpées en plusieurs étapes.
E : enzyme ; S : substrat ; P : produit ; ES : complexe enzyme-substrat.
Dans le cas de l’amylase : E : amylase - S : amidon - P : glucose.
1 : Formation d’un complexe enzyme-substrat, cette réaction est réversible, le
complexe peut se désunir avant que la réaction ne commence.
2 : Activation de la réaction, le substrat est transformé en produit.
3 : Libération du produit, le complexe enzyme / substrat est rompu.
Schéma du mode d’action d’une enzyme : spécificité de substrat et d’action
La spécificité
de réaction
BILAN
Une enzyme catalyse un seul type de réaction sur un seul type de molécule appelée
« substrat ». Il y a donc spécificité d’action et spécificité de substrat : on parle de
double spécificité.
Les enzymes sont des protéines constituées d’acides aminés. Elles possèdent donc une
structure tridimensionnelle dans laquelle on va observer un site actif complémentaire à
la forme substrat. Ce site actif se décline en un site de reconnaissance (fixation) et un site
de catalyse (réaction).
Dans le site de reconnaissance, il y a des acides aminés qui effectuent des liaisons faibles
avec le substrat stabilisant le complexe nommé ainsi complexe enzyme-substrat. Le site
actif de l’enzyme et le substrat sont alors complémentaires (tels une clé dans une
serrure), ils ajustent mutuellement leur forme respective permettant la fixation du
substrat. Ceci explique la spécificité des enzymes à un seul type de substrat.
Dans le site de catalyse, d’autres acides aminés situés sont responsables de la
transformation du substrat en produit. La nature des acides aminés en contact avec le
substrat explique la spécificité d’action.
Je sais faire :
- Un schéma précis d’une enzyme
- Un schéma rendant compte de la spécificité de substrat
- Un schéma rendant compte de la spécificité d’action
