Microbiologie
virologie
parasitologie
mycologie
Présenté par:SEMMANI
PEPM
Objectif General:
Au terme de cet enseignement,
l’apprenant doit être capable de
définir et de classer les différents
agents infectieux.
Plan de travail:
01 02 03
Définition Classifications Moyens de
défense de
l’organisme contre
l’infection
Définition:
Microbiologie dans le
dictionnaire français
Nom féminin singulier; science
qui étudie les micro-organismes
La microbiologie est une sous-discipline
de la biologie basée sur l'étude des
micro-organismes.
Les micro-organismes constituent un
groupe extrêmement diversifié
d'organismes microscopiques,
unicellulaires et répartis dans les trois
domaines du vivant (bactérie, archée
et eucaryote). Ils se distinguent les uns
des autres par leur forme, leur taille et
leur mode de vie.
La microbiologie médicale est une branche de
la médecine s'attelant à
la recherche des microbes(microbiologie) dans
les prélèvements d'origine humaine dans le but
de diagnostiquer
des pathologies infectieuses associées.
Elle est dans certains pays une
spécialité médicale à part entière
(associée le plus souvent à
l'infectiologie) et dans d'autres une
sous-spécialité de la biologie
médicale.
Elle se subdivise en :
bactériologie médicale
mycologie médicale
parasitologie médicale (la parasitologie médicale
n'est incluse que pour partie dans la microbiologie
médicale étant donné la taille de certains
parasites.)
virologie médicale (les virus n'étant pas toujours
considérés comme de véritables êtres vivants,
certains auteurs les excluent du monde des
microbes.)
Classificatios des
microbiologies:
L'analyse de l'anatomie des différents micro-
organismes recensés a permis de les classer en
deux grands groupes : les procaryotes (munis
d'un proto-noyau) et les eucaryotes (possédant
un vrai noyau)
(eucaryotes )
(procaryotes )
(eucaryotes )
L'unité fonctionnelle
des protistes supérieurs est une
cellule qui possède un vrai noyau
entouré d'une membrane nucléaire.
(procaryotes )
Ils sont caractérisés par l'absence de vrai
noyau. L'unité fonctionnelle des protistes
inférieurs est une cellule qui possède un
chromosome unique. Ce chromosome n'est
pas séparé du cytoplasme par une
membrane nucléaire
La bactériologie
Définition et
classifications
bactériologie dans le dictionnaire français
Nom féminin ; Discipline consacrée à l'étude
des bactéries.
Définition:
peptidoglycane
Terre
terrestre
peau
Chez l'Homme, il a été calculé que
1012 bactéries colonisent la peau,
1010 bactéries colonisent la bouche et
1014 bactéries habitent dans l'intestin, ce qui
fait qu'il y a dix fois plus de cellules
bactériennes que de cellules humaines dans
le corps humain.
La plupart de ces bactéries sont inoffensives ou
bénéfiques pour l’organisme.
choléra
syphilis peste anthrax tuberculose
Classifications des bactéries:
1. Formes :
Noms scientifiques :
2. Classification selon le métabolisme :
3. Classification selon la réaction de Gram :
4. Classification selon la respiration :
5. Classification selon le type de nutrition :
6. Classification phylogénétique :
7. Classification en fonction des maladies
qu’elles provoquent:
En résumé,
Merci pour votre attention
virologie
Présenté par:SEMMANI
PEPM
Plan de cours:
1-la définition des virus
2-la structure des virus
3-les différences entre virus
nus et virus à enveloppe,
4-les critères de
classification des virus
5-les étapes du cycle de
réplication des virus.
I. 1-Définition:
• La virologie est une discipline particulière de
la microbiologie.
• Elle à pour but d’étudier les virus.
• C’est un microorganisme totalement
différents des bactéries ou des autre
microorganismes.
Est un agent infectieux de petite taille:
20-300nm.
Agent invisible avec microscope optique.
Reproduction par réplication du génome: il n’ya
pas de croissance ni de fission (division
cellulaire ) de virus.
Il est défini par sa taille de
l’ordre du nanomètre visible en
microscopie électronique.
c’est une entité biologique
nécessitant un hôte (parasitisme
intracellulaire absolu)
acaryote, à l’extérieur de l’hôte, il est
incapable d’effectuer le moindre
métabolisme.
Il n’est pas considérés comme un
organisme vivant, à la limite
entre le non vivant et le vivant.
Qu’est-ce qu’un virus ?
La définition des virus « Les Jupiter is the
biggest one
virus sont les virus » Mercury
André is the
Lwoff
(1953-1959) smallest planet
Mars is a cold
place
• Le parasitisme intracellulaire obligatoire :
Nécessite la machinerie enzymatique des
cellules pour se reproduire.
• acaryote : particule dépourvue de noyau,
d’organites et de métabolisme.
• Le virus ne possède pas:
- enzymes du métabolisme
énergétique
- Machinerie de traduction.
Quelle est la taille des virus ?
• La taille des virus est très variable.
• Les plus petits ont un diamètre de l’ordre de
20 à 30 nm (virus de la poliomyélite : 20 nm).
• Les plus gros virus sont proches en taille de
cellules procaryotes (mimivirus : 700 nm et
virus d’Ebola : 1000 nm)
L’unité commune de mesure pour les virus
est le nanomètre.
2- La structure des virus:
● Quelles sont les éléments
constitutifs des virus ?
• Les virus ont une structure
beaucoup plus simple que
la cellule eucaryotes ou
procaryote.
• Ils sont composés de deux
ou trois éléments :
génome, capside et
enveloppe
Tous les virus doivent avoir un génome et une
capside.
L’enveloppe est présente chez certains virus
seulement.
ADN : acide désoxyribonucléique
ARN : acide ribonucléique
1. Le génome:
Un virus comporte toujours un génome
qui est soit de l’ADN soit de l’ARN
jamais les deux à la fois.
Le matériel génétique peut être :
• monocaténaire (à simple brin) ou
bicaténaire (à double brin),
• * de polarité positive ou négative,
• * circulaire ou linéaire, segmenté ou
non.
●Donc,
Le génome viral peut être: ARN monocaténaire
linéaire, ARN monocaténaire circulaire, ARN
bicaténaire, ADN monocaténaire linéaire,
ADN bicaténaire linéaire ou ADN bicaténaire
circulaire
La taille du génome diffère
considérablement pour les virus à
ADN (de 3 à 300 kpb),
Alors qu’elle est plus restreinte (de
7 à 30 kpb) pour les virus à ARN.
La kilo paires de base (kpb) est une
unité de mesure en biologie
moléculaire.
2. La capside:
Le génome est empaqueté dans une structure
protéique très stable, qui le protège, appelée
capside.
•CAPSIDE, d’un mot grec, capsa, signifiant boîte.
Nucléocapside = capside + génome.
•La capside est composée de protéines, de grande
stabilité, arrangées selon un motif précis et répété
(capsomères).
En plus du rôle de protection, la capside
confère aux virus nus le pouvoir antigénique et
le pouvoir d’attachement aux cellules hôtes
(structures antigéniques et sites d’attachement
au récepteur cellulaire à la surface de la
capside).
Les virus à capside hélicoïdale ont la forme de
filaments ou bâtonnets.
Micrographie électronique du virus d’Ebola.
Micrographie électronique du virus de la mosaïque du tabac
(VMT) (internet )
Micrographie électronique du virus de l’Herpes simplex (internet).
3. L’enveloppe:
L’enveloppe ou péplos (du mot grec signifiant
tunique ou manteau) est l’élément le plus
externe de certains virus qui recouvre la
capside. Selon la présence ou non d’une
enveloppe, on parle de virus enveloppés ou
nus.
Virus corona
La classification des virus:
La classification Baltimore est un système de
classification scientifique,
plus facile d’utilisation, basé sur :
- le type d'acide nucléique du génome virale (à
ADN ou à ARN, simple brin, double-brin)
- le mode d'expression dans la synthèse de
l’ARN messager viral,
- le procédé de réplication de l'ADN.
On distingue 07 classes de virus (classe I, II,
III ...à VII) résumés dans le tableau suivant.
Types de génome Groupes Exemples de virus
Virus à ADN double brin Groupe I Herpes virus,
phage
T4, phage λ
simple brin à polarité Groupe II
positive
Virus à ARN double brin Groupe III Reovirus
simple brin à polarité Groupe IV Coronavirus
positive
simple brin à polarité Groupe V Ebola, virus la
négative rougeole, des
oreillons, de la
grippe
Virus à transcription Rétrovirus à ARN Groupe VI HIV
inverse simple brin
polarité (+)
Il est à noté, que les cliniciens utilisent une
classification encore plus simple
basée sur trois critères sont (dans l'ordre) :
- la nature de l'acide nucléique du génome
(ADN ou ARN),
- la conformation de la capside,
- la présence ou l'absence d’enveloppe.
La multiplication des virus:
Le cycle viral peut être divisé en cinq étapes :
1. attachement du virus à la cellule hôte via un
récepteur.
2. pénétration puis décapsidation du virus et
libération de l‘acide nucléique viral dans le
cytoplasme de la cellule infectée ou injection
direct de l’acide nucléique viral.
3. synthèse des macromolécules : l’hôte va
fabriquer des ARNm, synthétiser des protéines
et copier en plusieurs exemplaires le génome
viral.
4. assemblage des éléments de structure
viraux.
5. libération des virions dans le milieu
extracellulaire.
résumé:
la classification des virus est difficile à
établir
la classification de lowff,horne et tournie établie
en 1962 appelée système L.H.T retient trois
critères:
1- la nature de l’acide nucléique.
2- la symétrie de la nucléocapside hélicoïdale ou
cubique.
3- la présence ou l’absence d’une enveloppe.
la classification de Baltimore:
classification par type de génome
07 classes de génomes chez les
virus.
=>Variétés non retrouvée chez les
eucaryotes , les bactéries ,les
archées => variétés des stratégies
de réplication et d’expression des
génomes.
