Method o Logie
Method o Logie
BOUAITI---Methodo 19/02/2020
Module
Chapitre [Link] recherche clinique en sciences de la santé.
Chapitre 2. Le sujet de recherche clinique.
Chapitre 3. la recherche bibliographique.
Méthodologie de la recherche
19/02/2020 2
Plan
Chapitre 1 I. Introduction
II. Définition de la recherche clinique
La recherche clinique en III. Les objectifs de la recherche clinique
sciences de la santé. IV. La démarche de recherche clinique
Pr EL ARBI BOUAITI V. Les acteurs de la recherche clinique
Faculté de médecine et de pharmacie - VI. Étapes de la recherche clinique
Rabat
19/02/2020 4
I. Introduction I. Introduction
Différents types de recherche
Quand on parle de « recherche clinique » on Recherche fondamentale
pense généralement à l'essai de nouveaux Études hors cliniques
médicaments : meilleure efficacité, meilleure
Recherche menée en vue de faire évoluer
tolérance, moindre toxicité, moindre coût ...
les connaissances plutôt que pour une application
pratique.
La recherche clinique ne se limite pas à cela,
Recherche appliquée
surtout dans les centres hospitalo-universitaires
où se côtoient plusieurs types de recherches Études chez l’homme
interventionnelles et observationnelles. Recherche réalisée en vue de résoudre des problèmes
pratiques.
19/02/2020 5 19/02/2020 6
1
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
I. Introduction Plan
19/02/2020 7 19/02/2020 8
19/02/2020 9 19/02/2020 10
2
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
19/02/2020 15 19/02/2020 16
Pas d’essais sur des critères cliniques mais uniquement Groupe Placebo 423 18 4%
19/02/2020 17 19/02/2020 18
3
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
19/02/2020 19 19/02/2020 20
(population).
19/02/2020 21 19/02/2020 22
4
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
2. Investigateur 3. Intervenants
19/02/2020 29 19/02/2020 30
5
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
19/02/2020 31 19/02/2020 32
I. Introduction
II. Définition de la recherche clinique
III. Les objectifs de la recherche clinique
IV. La démarche de recherche clinique
V. Les acteurs de la recherche clinique
VI. Étapes de la recherche clinique
19/02/2020 33 19/02/2020 34
19/02/2020 35 19/02/2020 36
6
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Plan
19/02/2020 38
Le point fondamental
19/02/2020 39 19/02/2020 40
7
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
• un problème diagnostique /
... thérapeutique soulevé par le
problème initial milieu professionnel
• une situation problématique que
• une lecture qui vous inspire
vous diagnostiquez
19/02/2020 43 19/02/2020 44
Deux sources
19/02/2020 45 19/02/2020 46
19/02/2020 47 19/02/2020 48
8
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
QUESTION(S) de RECHERCHE
Choix de l’étude
19/02/2020 53 19/02/2020 54
9
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
la maladie ?
Diagnostic : Les tests utilisés pour le diagnostic sont-ils fiables et
valides ?
Pronostic : Quelles sont les conséquences de la maladie?
• Pourquoi ? Rechercher la cause
Coût : Quel est le coût de la prise en charge d’un malade?
d’un phénomène
(étiologie)
19/02/2020 55 19/02/2020 56
19/02/2020 57 19/02/2020 58
19/02/2020 59 19/02/2020 60
10
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
19/02/2020 61 19/02/2020 62
Objectif
19/02/2020 63 19/02/2020 64
L’objectif d’un travail de recherche doit être La formulation d’un objectif doit obéir à
bien défini et écrit de façon très précise. certaines règles :
Un objectif mal défini ne pourra pas mener à On utilise un verbe actif à l’infinitif
une enquête bien construite.
De plus, cet objectif doit être pertinent et Faire références aux critères T.P.L
participer à l’amélioration des connaissances
scientifiques. Eviter de multiplier les objectifs
11
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
19/02/2020 69 19/02/2020 70
Lecture critique :
L’objectif de l’étude est de déterminer les facteurs
prédictifs épidémiologiques, cliniques et
biologiques de survenue d’une infection sous
biothérapie.
19/02/2020 71 19/02/2020 72
12
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
19/02/2020 73 19/02/2020 74
IV. Choix des critères de jugement IV. Choix des critères de jugement
(endpoints) (endpoints)
Le critère de jugement peut être très divers :
Un marqueur biologique,
Qualité de vie,
Un comportement (activité physique, observance
thérapeutique),
Un indicateur médico-économique (consommation
de produits de santé, hospitalisations en
urgence…).
Exemples
Evaluer l’obésité : IMC
19/02/2020 Poser le diagnostic du diabète : glycémie à jeun 75 19/02/2020 76
IV. Choix des critères de jugement IV. Choix des critères de jugement
(endpoints) (endpoints)
Le critère principal de jugement : Exemple 1 Exemple 2
limite le nombre de tests statistiques Critères de jugement • Score de sévérité de la • Mortalité totale
secondaires dyspepsie (Glasgow) • Mortalité coronarienne
• Score de qualité de vie • Mortalité
• Éradication de H. pylori cardiovasculaire
Les critères de jugement secondaires • Recours à un traitement • Infarctus mortel et non
antisecrétoire mortel
définir les analyses secondaires. • Infarctus non mortels
• AVC mortel et non mortel
• AVC non mortels
19/02/2020 77 19/02/2020 78
13
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
IV. Choix des critères de jugement VI. Choix des critères de jugement
(endpoints) (endpoints)
Le critère de jugement doit être:
cliniquement pertinent et admis par la communauté
scientifique internationale;
Pertinent : par rapport à la maladie, au traitement, …à la
question posée (l’objectif principal).
C’est le point majeur !
Exemple : Evaluer l’évolution de l’artériopathie des membres
inférieurs : le critère de jugement est la mesure du périmètre de
marche :
Augmentation significative de 20 m : Quel intérêt de passer de 200m à 220m.
Fréquence du succès : fréquence des patients retrouvant sous traitement un
périmètre de marche de 500m.
19/02/2020 79 19/02/2020 80
IV. Choix des critères de jugement IV. Choix des critères de jugement
(endpoints) (endpoints)
Le critère de jugement doit être: Le critère de jugement doit être:
Méthodologiquement acceptable : répétable : même résultat si la mesure est
clair : tous les médecins peuvent comprendre la même répétée par la même personne dans les
chose; mêmes conditions;
de mesure aisée : obtenu, si possible facilement,
chez tous les sujets; reproductible: même résultat si la mesure est
validé: reconnu par la communauté scientifique; répétée par deux personnes différentes dans
éthique les mêmes conditions;
19/02/2020 81 19/02/2020 82
VI. Choix des critères de jugement IV. Choix des critères de jugement
(endpoints) (endpoints)
Parmi les différentes formes que peut revêtir un critère Mesure des critères de jugement
de jugement, on préfèrera lorsque c’est possible :
Les outils de mesure du critère de jugement
conditionnent l’intérêt des résultats.
un critère objectif (mesuré, comme l’IMC ou
l’albuminémie) à un critère subjectif (apprécié, comme On distingue deux types de mesure :
l’appétit ou la douleur) ; Mesure objective : dosages, mensurations,
radiographies…
un critère quantitatif à un critère qualitatif ; Mesure subjective: appréciation de la douleur par
questionnaire….
un critère unique, constitué par une seule mesure,
plutôt que composite (combinaison de paramètres,
scores...).
19/02/2020 83 19/02/2020 84
14
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
IV. Choix des critères de jugement VI. Choix des critères de jugement
(endpoints) (endpoints)
La qualité d’un critère de jugement et de
l’outil pour le mesurer est déterminante.
Une intervention efficace pourrait à tort ne
pas être démontrée par le choix
d’un mauvais critère de jugement.
ou d’un outil de mesure pas assez sensible.
La recherche biographique ++++
19/02/2020 87 19/02/2020 88
19/02/2020 89 19/02/2020 90
15
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
19/02/2020 91 19/02/2020 92
19/02/2020 93 19/02/2020 94
19/02/2020 95 19/02/2020 96
16
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
19/02/2020 97 19/02/2020 98
Date de dernières
nouvelles
DDN
Date d’origine (DO) : Date à laquelle le sujet est considéré comme entrant dans
l’étude.
Date de point (DP) : Date à laquelle l’étude se termine (fin du recueil de données)
Date de dernières nouvelles (DDN) : lors d’un décès ou d’un perdu de vue
Variables Ordinales
Variables
Continues
quantitatives
Discrètes
Variables
censurées
19/02/2020 101 19/02/2020 102
17
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Plan
Chapitre 3. I. Introduction
II. La recherche bibiographique
La recherche bibliographique III. Trouver les bons « mots clés »
IV. Les sources d’information
Pr EL ARBI BOUAITI V. Méthodes de la recherche bibliographique
Faculté de médecine et de pharmacie - VI. Les étapes de la recherche bibliographique
Rabat
[Link] gestion bibliographique
19/02/2020 104
I. Introduction I. Introduction
18
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
III. Trouver les bons « mots clés » III. Trouver les bons « mots clés »
anticoagulants
Pour définir la liste des mots clés : locorégionale
Combien ? Pourquoi ?
La méthode QQQOCP
19
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
III. Trouver les bons « mots clés » III. Trouver les bons « mots clés »
Synonymes
MEdical Subject Headings (MeSH):
Un principe : Faire simple ! Un thésaurus de mots-clés.
Un minimum de termes, le plus signifiants possibles Un outil incontournable dans le monde médical.
Les mots clés sont normalisés, hiérarchisés, et permettent de décrire le
Exemple : contenu des articles et interroger les bases de données (BDD).
Quels sont les examens disponibles pour le diagnostic du La recherche des mots-clés dans le MeSH
cancer du côlon ? Multiplie les chances de trouver les articles qui sont pertinents pour la
recherche
Et permet d’effectuer des recherches plus fines (gestion des
Question : synonymes).
Exemple :
Quelles sont les techniques actuelles de diagnostic du Cardiac arrest = heart arrest = cardiopulmonary arrest
cancer du sein?
Outils informatiques +++
19/02/2020 115 19/02/2020 116
III. Trouver les bons « mots clés » III. Trouver les bons « mots clés »
Journal des mots clès Outils terminologiques
Consigner les mots-clés dans un journal U.S. National Library of Medicine:
Exemple : Quels sont les impacts de la vaccination contre la
grippe de type A chez les enfants?
[Link]
Pubmed:
Vaccin Grippe A Enfants [Link]
Vaccine Grippe de type A Child
MeSH bilingue de l’INSERM:
Vaccinum Influenza A Children
[Link]
Influenza de type A Cette version bilingue est souvent utilisée comme outil de traduction, ainsi que
A-type influenza pour l'indexation et l'interrogation de bases de données en français.
Type A influenza Cismef : Catalogue et Index des Sites Médicaux
Flu A Francophones.
Flu type A [Link]/cismef/
A flu type
Pubmed: Pubmed:
[Link] [Link]
20
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
I. Introduction
II. La recherche bibiographique
III. Trouver les bons « mots clés »
IV. Les sources d’information
V. Méthodes de la recherche bibliographique
VI. Les étapes de la recherche bibliographique
[Link] gestion bibliographique
21
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
[Link]
[Link]
19/02/2020 127 19/02/2020 128
Medline :
Medical Literature Analysis and Retrieval System
Online
U.S. National Library of Medicine
Base de données bibliographiques (articles
uniquement)
[Link]
[Link]
22
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
ClinicalKey ClinicalKey
ScienceDirect ScienceDirect
Cochrane Cochrane
23
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
I. Introduction
II. La recherche bibiographique
III. Trouver les bons « mots clés »
IV. Les sources d’information
V. Méthodes de la recherche bibliographique
VI. Les étapes de la recherche bibliographique
[Link] gestion bibliographique
24
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
25
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
vaccin*
AND
("grippe A" OR "grippe de type A" OR "influenza A" OR "influenza de
type A" OR "A-type influenza" OR "type A influenza" OR "flu A" OR "flu
type A" OR
"A flu type" )
AND
(enfant* OR child*)
Recherche avancée
26
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Dumont A, Bessieres N, Benbassa A, et al. Dépistage du Baccino E. Médecine de la violence : Prise en charge
cancer du col utérin en milieu rural à Madagascar : des victimes et des agresseurs. Paris : Ed. Masson;
faisabilité , couverture et incidence. J Gynecol Obstet 2006.
Hum Reprod 2017;46(4):327–32.
27
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
[Link]
19/02/2020 163
Plan I. Introduction
I. Introduction I. Introduction
28
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
I. Introduction I. Introduction
Les différents types d’études cliniques Les différents types d’études cliniques
Rétrospective : on utilise des données qui ont
déjà été recueillies (consultation de dossiers) ; Quantitative : le critère de jugement est quantitatif
Prospective : les données seront recueillies sur (valeurs continues) ;
les sujets après la mise en place de l’étude ;
Transversale : les données sont recueillies une Qualitative : le critère de jugement est qualitatif
seule fois ; (classes)
Longitudinale : les mêmes données sont
recueillies avant, (pendant) et après l’intervention.
II. Classification des études cliniques II. Classification des études cliniques
29
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
II. Classification des études cliniques II. Classification des études cliniques
Les recherches non interventionnelles ou observationnelle : Les recherches non interventionnelles ou observationnelle :
Visent à collecter des informations ou des données personnelles de santé sans Collections biologiques : réunion, à des fins scientifiques, de prélèvements biologiques
intervention directe sur la personne. effectués sur un groupe de personnes identifiées et sélectionnées en fonction des
Dans ce cas, aucune procédure supplémentaire de diagnostic ou de surveillance ne doit caractéristiques cliniques ou biologiques d’un ou plusieurs membres du groupe ainsi
être appliquée aux patients et des méthodes épidémiologiques sont utilisées pour que des dérivés de ces prélèvements
analyser les données recueillies. Observationnelle : suivi de cohorte - traitements, investigations, consultations de suivi
de la pratique courante
19/02/2020 175 Sur les données : aucune interférence avec le soin du malade
19/02/2020 176
II. Classification des études cliniques II. Classification des études cliniques
II. Classification des études cliniques II. Classification des études cliniques
Définition du schéma de l’étude Définition du schéma de l’étude
Les études de cohorte sont observationnelles
sur l’être humain et prospectives.
30
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
31
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
32
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
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Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
34
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
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Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
36
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
37
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
38
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
39
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Avantages Inconvénients
Particulièrement indiquées lors des Non adaptées aux maladies rares
expositions rares
Permettent d’examiner plusieurs Prospectives: longues et coûteuses
évènements
Temporalité établie entre exposition et Rétrospectives: nécessité de disposer de
évènement documents appropriés
Prospectives: limitation des biais de Validité des résultats dépendante de la
mesure de l’exposition et de la maladie qualité du Suivi
Mesures d’incidence dans chacun des
groupes
I. Introduction
II. Classification des études cliniques
III. Les études expérimentales
IV. Les études descriptives
V. Les études de cohortes
VI. Les études cas témoins
VII. Choix d’un type d’étude de recherche clinique
VIII. Les niveaux de preuves
VI. Les études cas témoins VI. Les études cas témoins
40
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
VI. Les études cas témoins VI. Les études cas témoins
Principe Principe
La planification d’une enquête cas-témoins commence Les cas et les témoins doivent être choisis dans la
par le choix de la population de l’étude dont seront issus même population.
les cas et les témoins: Les caractéristiques du groupe « témoin » doivent être
Les cas seront atteints de la pathologie étudiée et représentatifs, les plus proche possible du groupe « cas ».
pour l'exposition au facteur de risque, de l'ensemble des malades
ayant cette pathologie. La seule différence observable entre les groupes devrait
Le groupe témoin est construit pour servir de référence, ils sont être théoriquement l’absence de signes de la maladie.
représentatifs pour l'exposition au facteur de risque de la Le recueil d’information est toujours rétrospectif dans ce
population dont sont issus les cas. cas.
Les groupes sont ensuite comparés on utilisant des
méthodes statistiques.
VI. Les études cas témoins VI. Les études cas témoins
Déroulement
1. Identification de la population d’étude Principaux avantages et inconvénients des études cas - témoins
2. Groupe de sujets malades « cas »
3. Groupe de sujets indemnes « témoins» Avantages Inconvénients
Résultats rapides et coûts faibles Importance du recueil similaire de l’exposition
4. Choix de l’évènement d’intérêt (critère de jugement)
entre les cas et les témoins (biais)
5. Le recueil : rétrospective
Pas de perdus de vue Pas d’estimation d’incidence ni de prévalence
6. Période d’observation Pas d’estimation du RR
7. Mesure d’association Adapté aux évènements dont les Difficultés d’évaluer la relation temporelle
A la fin de la période d'observation, on dispose alors de toutes les périodes de latence sont longues (Exposition et maladie) (biais)
données utiles pour calculer les fréquences d’exposition et les (Exposition et maladie)
Odds ratio. Adapté aux évènements rares Recueil rétrospectif de l’exposition (biais)
Étude de plusieurs facteurs Non indiqué pour les expositions rares
étiologiques pour un seul Un seul évènement d’intérêt
évènement
VI. Les études cas témoins VI. Les études cas témoins
41
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Pour la pratique clinique, des recommandations validées Le tableau ci-dessous regroupe les niveaux de preuves les plus utilisés
suivant l’enquête utilisée.
sont habituellement élaborées soit à partir de résultats
d'études, soit à partir de consensus d'experts.
Le grade des recommandations est donc directement lié
aux niveaux de preuve des études ayant servi à leur
élaboration.
La pertinence des résultats, donc le niveau de preuve
d’une étude épidémiologique est évaluée selon la
méthodologie employée.
42
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Plan
Chapitre 5. I. Introduction
Méthodes d’échantillonnage II. Un peu de terminologie
III. Justification de l'échantillonnage
IV. Méthodes d'échantillonnage
Pr EL ARBI BOUAITI V. Représentativité
Faculté de médecine et de pharmacie - Rabat
VI. Limites des enquêtes par sondage
19/02/2020 254
I. Introduction I. Introduction
I. Introduction I. Introduction
Echantillonner:
c’est choisir une partie d’une population pour
représenter l’ensemble de la population
et l’échantillon doit refléter le plus exactement
possible l'image de la population.
Échantillon
Population Caractéristiques
Caractéristiques Mais comment constituer un échantillon?
connues
inconnues
43
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
I. Introduction
Recensement / Echantillonnage
II. Un peu de terminologie
Recensement : Tous les sujets de la
population sont « examinés » III. Justification de l'échantillonnage
Echantillonnage : Une partie des sujets
de la population sont « examinés »
IV. Méthodes d'échantillonnage
Plusieurs échantillons peuvent être
constitués
V. Représentativité
L’échantillon en lui-même n’est pas
Population intéressant, ce sont les conclusions sur la
VI. Limites des enquêtes par sondage
population que l’on peut tirer de son
observation qui en font l’intérêt : Inférence
44
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
45
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Procéder à un tirage au sort des sujets dans la Le sondage permet de limiter la taille de
base : l’investigation
Programme informatique Avantages :
Tables de nombre au hasard On peut espérer un échantillon «représentatif »
puisque la méthode donne à chaque individu de la
population une chance égale.
Réduction des coûts d’investigation
Délai d’obtention des résultats plus rapide
TAS Limite :
il est nécessaire d’avoir une base de sondage fiable
Échantillon
Population
19/02/2020 273 19/02/2020 274
46
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
+3
Application : constituer un échantillon de taille
n=60 à partir de 300 malades consultants au service
des urgences.
47
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
V. Représentativité V. Représentativité
Pour qu'il soit possible d'étudier une population à partir Concrètement, cela signifie qu'on tire au sort les individus de
d'un échantillon, il faut que certaines contraintes soient l'échantillon parmi l'ensemble de la population.
respectées.: Le tirage au sort s'accompagne d'une incertitude, et la composition
de l'échantillon peut différer de celle de la population du fait du
l'échantillon doit être représentatif de la population étudiée hasard : ce phénomène est appelé fluctuation d'échantillonnage.
effectif suffisant.
La représentativité n’a de sens concret que vis-à-vis des Exemple : dans une population qui comprendrait 50% d'hommes, un
phénomènes qu'on veut étudier dans la population. tirage au sort peut théoriquement sélectionner un pourcentage
d'hommes quelconque compris entre 0 et 100% ; cependant, toutes
Un échantillon est représentatif de la population : toute
les valeurs n'ont pas la même probabilité d'apparaître, et on s'attend
personne appartenant à celle-ci puisse appartenir à à un pourcentage voisin de 50%, d'autant plus proche de ce chiffre
l'échantillon avec une probabilité connue. que l'échantillon est grand.
Plan
Chapitre 6. I.
II.
Introduction.
Principes.
Nombre de sujets nécessaires III.
IV.
Éléments du calcul du nombre de sujets nécessaire.
Les hypothèses à formuler pour le calcul du NSN de calcul.
(NSN) V. Le calcul du nombre de sujets nécessaire dans une étude
descriptive.
VI. Le calcul du nombre de sujets nécessaire dans une étude cohorte
Pr EL ARBI BOUAITI prospective.
Faculté de médecine et de pharmacie - Rabat VII. Le calcul du nombre de sujets nécessaire dans une étude cas-
témoins.
19/02/2020 288
48
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
I. Introduction I. Introduction
Les études cliniques ou épidémiologiques reposent sur Il est donc nécessaire de calculer un nombre de
le plus souvent sur l’observation d’un échantillon de sujets nécessaires afin d’assurer à l’étude une
sujets.
puissance statistique suffisante et de mettre en
Plus les échantillons aléatoires sont grands, plus on a de
évidence une différence.
chances de s’approcher des caractéristiques de la
population. Le nombre de sujet nécessaire est souvent un
De plus, en cas de répétition sur plusieurs échantillons, compromis entre
les observations fluctuent autour des vraies le degré de précision à atteindre
caractéristiques de la population. le budget de l’enquête
autres contraintes opérationnelles (le temps)
I. Introduction Plan
I. Introduction.
II. Principes.
III. Éléments du calcul du nombre de sujets nécessaire.
Combien de sujets dois-je inclure dans mon IV. Les hypothèses à formuler pour le calcul du NSN de calcul.
V. Le calcul du nombre de sujets nécessaire dans une étude
échantillon pour que mon inférence soit descriptive.
correcte (marge d’erreur prédéfinie et VI. Le calcul du nombre de sujets nécessaire dans une étude cohorte
prospective.
acceptable) ?
VII. Le calcul du nombre de sujets nécessaire dans une étude cas-
témoins.
Le nombre de sujets nécessaire est le plus petit effectif La définition des hypothèses de calcul du
théorique qui permettra de garantir l’observation d’une nombre de sujet nécessaire est primordiale
différence significative (moyennes, proportions, etc.).
pour des raisons
Pour calculer un nombre de sujets nécessaires, il faut au Éthiques :
préalable avoir défini un objectif principal associé à un Si vous surestimez l’effet attendu, vous allez avoir moins de sujets
critère de jugement principal. à inclure mais vous minimisez la puissance statistique et vos
chances de répondre à la question posée.
Les hypothèses du calcul du nombre de sujets
Si vous sous-estimez l’effet attendu, vous allez devoir inclure
nécessaires seront faîtes sur ce critère principal. beaucoup plus de patients, ce qui fragilise la faisabilité de votre
Il important de bien définir les hypothèses de calcul: la étude.
littérature. Financiers et logistiques
49
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Introduction.
Dans la pratique le calcul du NSN permet I.
II. Principes.
de vérifier si los objectifs peuvent être atteints III. Éléments du calcul du nombre de sujets nécessaire.
avec le critère de jugement retenu, IV. Les hypothèses à formuler pour le calcul du NSN de calcul.
Le calcul du nombre de sujets nécessaire dans une étude
éventuellement de s’orienter vers d’autres V.
descriptive.
critères, de changer les objectifs ou de VI. Le calcul du nombre de sujets nécessaire dans une étude cohorte
modifier le schéma d’étude. prospective.
VII. Le calcul du nombre de sujets nécessaire dans une étude cas-
témoins.
"ne rien voir" "n'existe pas" La puissance : Capacité d'un test à montrer une différence
Dépend:
• de la différence minimale d'intérêt D
• du nombre de sujets
• de la variance
• du risque alpha
50
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
51
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Exemple:
Facteur de risque de paludisme chez les enfants.
Critère de jugement : Parasitémie à P. falciparum.
Quelles sont les hypothèses à formuler ? Nombre de sujets nécessaires par groupe :
la différence attendue entre les moyennes du
groupe A et du groupe B,
la variabilité de la réponse (s2) fournie par les
études antérieures.
le risque alpha (5%),
la puissance (1-β, au minimum à 80%).
52
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Sites internet:
[Link]
[Link] [Link]
53
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Exemple :
Si vous souhaitez évaluer l’efficacité d’un
nouveau traitement sur la mortalité par rapport au
traitement de référence.
Dans la littérature, vous avez pu trouver les
hypothèses suivantes :
5% de décès avec le traitement de référence et 2% avec
le nouveau traitement.
Pour un risque alpha à 5% et une puissance à
80%, il est nécessaire d’inclure 585 patients par
groupe soit un total de 1170 patients.
19/02/2020 319 19/02/2020 320
Exemple :
Si vous souhaitez évaluer l’efficacité d’un nouveau traitement sur
la pression artérielle systolique par rapport au traitement de
référence.
Dans la littérature, vous avez pu trouver les hypothèses
suivantes : la pression artérielle systolique moyenne est de 150.2
± 40.6 mmHg (40.6 est l’écart-type) avec le traitement de
référence et de 140.5 mmHg avec le nouveau traitement avec un
écart-type identique.
Pour un risque alpha à 5% et une puissance à 80%, il est
nécessaire d’inclure 276 patients par groupe soit un total de 552
patients.
54
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
V. Le calcul du NSN dans une étude VI. Le calcul du NSN dans une étude
descriptive cohorte prospective
Plusieurs cas de figure sont possibles :
Aucun calcul n’est réalisé, seul un calendrier
d’inclusions est fourni : justifier alors comment les
objectifs seront atteints et la taille de l’étude choisie.
Le calcul du nombre de sujets est basé sur une
différence minimale attendue :
Il faut alors estimer le ratio attendu entre le nombre de patients
présentant le facteur de risque par rapport aux patients ne présentant
pas le facteur de risque,
Risque relatif,
Le risque , le risque et la puissance
VI. Le calcul du NSN dans une étude VII. Le calcul du NSN dans une étude
cohorte prospective cas-témoins
Préciser si on souhaite inclure 1 cas + 1
témoin (1 :1), 1 cas + 2 témoins (1 :2), …
pour déterminer le nombre total de sujets.
Définir le risque , le risque , la puissance,
la différence minimum attendue entre les
groupes.
VII. Le calcul du NSN dans une étude VII. Le calcul du NSN dans une étude
cas-témoins cas-témoins
55
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Conclusion
Chapitre 7.
Nombre de sujets
nécessaire pour qu'un test statistique puisse
Méthodes d'analyse d'une
avoir la puissance suffisante étude descriptive.
pour montrer un effet minimum Pr EL ARBI BOUAITI
Faculté de médecine et de pharmacie -
Rabat
19/02/2020 331
56
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Le nombre d'individus étant généralement grand, une telle série brute est 283
103
Achoura
Lekheila
ex_bo_gz
flamme
même jour
dans la semaine
F
F
35
36
2 009
2 006
Tiflet
Mauritanie
93
27
0
0
2
2
difficilement lisible et interprétable. Il est indispensable de la résumer. 296 Amina liq_chd après une semaine F 36 2 010 Agadir 21 0 2
57
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
…. ….
Total 150
19/02/2020 345 19/02/2020 346
58
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
59
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Moyenne arithmétique
Médiane
Mode
60
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Médiane Médiane
exemples
9 patients hospitalisés dans un service de
médecine. Leurs durées de séjour (en jours)
sont les suivantes :
61
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Médiane Médiane
exemples exemples
Médiane d’un nombre impair de données Médiane d’un nombre pair de données
10, 12, 18, 20, 25 10, 12, 18, 20, 25, 45
Ranger les valeurs en ordre ascendant : 10, 12, Ranger les valeurs en ordre ascendant : 10, 12,
18, 20, 25 18, 20, 25, 45
Déterminer le point central de la série : (5 valeurs Déterminer le point central de la série (6
+1)/ 2 = 3. valeurs+1)/2 = 7/2 = 3,5.
La médiane est donc la valeur en 3ème position La médiane est la valeur à mi-chemin entre le
dans la série 3ème et le 4ème chiffre : Le 3ème chiffre est 18 et le
La 3ème valeur est 18. 4ème est 20.
La médiane équivaut donc à 18. La médiane est (18+20)/2 = 19.
Moyenne arithmétique
Série de valeurs: Moyenne Médiane
10, 12, 18, 20, 25
17 18
Médiane
10, 12, 18, 20, 45 21 18
Mode Mode
La valeur que l’on observe le plus La valeur que l’on observe le plus
fréquemment dans une série de valeurs. fréquemment dans une série de valeurs.
La valeur dominante La valeur dominante
Exemple 1 : Le mode des valeurs 10, 12, 12, Exemple 2 : La série 10, 12, 12, 12, 18, 18,
12, 18, 18, 20, 25, 35 est 12 18, 20, 25, 35 à 2 modes, 12 et 18
Une distribution est bimodale :
Échantillon: deux populations différentes
62
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
80 150 0.4
100 0.3
40
ddp
50 0.2
0
0.1
0
45 98 150 203 256 309 361 414 467 519 572 2.1 3.3 4.6 5.8 7.0 8.3 9.5 10.8 12.0 13.3 14.5
Créatinine (µmol/l) Glycémie (mmol/l)
0.0
-4 -2 0 2 4
19/02/2020 373 19/02/2020 18 22 23 25 27 374
20
18 Médiane 4 10
16
14
Moyenne Moyenne Total 100
12
10
%
8
6
4
Déterminer la moyenne, la médiane et le mode?
2
0
1 2 3 4 5 6 7 8 9 2 4 6 8 10
Notes
19/02/2020 PSA (ng/l) 375 19/02/2020 376
La variance
Paramètres de dispersion Dispersion
Écart-type
63
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Ce sont des valeurs (Q1, Q2, Q3) qui séparent Le premier quartile ou le quartile inférieur Q1
l’échantillon en 4 parties qui contiennent le = 25 % des valeurs sont inférieures à Q1 et
même nombre de données. 75 % lui sont supérieures
64
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Étendue La variance :
La moyenne des carrés des écarts à la moyenne
Les quartiles La somme des carrés des écarts à la moyenne
divisée par le nombre d'observations
La variance
∑𝑛𝑖 (𝑥𝑖 − 𝑚)2
𝒔𝟐 =
Écart-type 𝑛−1
Dispersion, Étalement, Variabilité des Valeurs
La variance La variance
méthode de calcul
x1 Calculer la moyenne m
x12 x3
x2
Calculer la différence entre chaque
observation et la moyenne (xi - m)
x11
m x4 Porter chacune de ces différences au carré
(xi - m)2
x10 x5 Additionner tous ces carrés et diviser la
x9
x8
x7 x6 somme des carrés par le nombre
d’observations moins 1 (n -1)
Représente l ’écart moyen des données de
l’échantillon par rapport à la moyenne
19/02/2020 387 19/02/2020 388
La variance La variance
exemple exemple
Calculer la variance s2 : 10, 12, 18, 20, 25, 35 Calculer la variance s2 : 10, 12, 18, 20, 25, 55
Calculer la moyenne : m=20 Calculer la moyenne : m=23,3
Observations xi 10 12 18 20 25 35 Observations xi 10 12 18 20 25 55
Différence à la moyenne Différence à la moyenne
-10 -8 -2 0 +5 +15 -13,3 -11,3 -5,3 -3,3 1,7 31,7
xi- 20 xi- 20
Carré de la différence à Carré de la différence à
100 64 4 0 25 225 177,8 128,4 28,4 11,1 2,8 1002,8
la moyenne la moyenne
83,6 VS 200,6
19/02/2020 389 19/02/2020 390
65
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Écart-type Écart-type
m
19/02/2020 19/02/2020 396
395
66
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Médiane et Quartile
95 % des individus entre µ-1,96σ et µ+1,96σ
Médiane = 50 (Q1=30; Q3=70)
95 % des sujets « normaux » de
Intervalle interquartile : intervalle [Q1 , Q3]
cette population ont une glycémie
comprise entre 0,72 et 1,00 g/L
19/02/2020 397 19/02/2020 398
67
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Un indicateur de liaison:
Le coefficient de corrélation linéaire Le coefficient de corrélation de Bravais-Pearson
Le coefficient de corrélation de Spearman
68
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
69
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
11 20 18 10 20 11 11 20 18 10 20 11
16 10 15 17 17 11 16 10 15 17 17 11
Calculer l’étendue E
11 12 12 11 20 13 E =20 – 10 = 10 11 12 12 11 20 13
Calculer l’étendue E
15 20 13 19 14 15 Intervalles de Classe (L): 15 20 13 19 14 15
E = maximale – minimale. 16 11 20 12 10 12 L = 10/6 =1,7 ≈2 16 11 20 12 10 12
Calculer l’Intervalles de
Classe (L):
18 10 13 16 16 13 Déterminer les classes: 18 10 13 16 16 13
1ère Classe = [10 – 12[
L=E/K
Déterminer les classes: 2ème Classe = [12 – 14[ Classe [10 – [12 – [14 – [16 – [18 – [20 –
1ère Classe = [min – mini+L[ Arrondir L selon précision 3ème Classe = [14 – 16[ 12[ 14[ 16[ 18[ 20[ 22[
2ème Classe = [min +L – min+2L[ voulue ⇒ diminution ou 4ème Classe = [16 – 18[ n 10 8 4 6 3 5
Dernière Classe =[maximale -L – maximale[ augmentation parfois de K de 1. 5ème Classe = [18 – 20[
6ème Classe = [20 – 22[
19/02/2020 419 19/02/2020 420
70
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
2. Tableaux 2. Tableaux
2. Tableaux 2. Tableaux
Variable 1
1ère modalité n1 p1
Variables quantitatives
2ème modalité n2 p2 Discrètes
… … … Continues Discrétisation
Variable 2
1ère modalité n1 p1
2ème modalité n2 p2 Deux variables ou plus
… …. …
….
Total n 100%
71
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
2. Tableaux 2. Tableaux
Exemple : V. qualitative Exemple : V. qualitative
2. Tableaux 2. Tableaux
Exemple : V. quantitative discrète Exemple : V. quantitative discrète
Distribution des foyers de la region de Rabat selon le nombre Distribution des foyers de la region de Rabat selon le nombre
d’enfants (n=1000) d’enfants (n=1000)
Nombre Fréquence Fréquence
Effectif (n) Fréquence Fréquence
d'enfants relative (%) cumulée (%) Nombre
Effectif (n)
0 129 12,9% 12,9% d'enfants relative (%) cumulée (%)
1 451 45,1% 58,0% 0 129 12,9% 12,9%
2 332 33,2% 91,2% Moins de 3
3 56 5,6% 96,8% enfants 839 83,9% 96,8%
4 21 2,1% 98,9% Entre 1 et 3 enfants
5 8 0,8% 99,7% Plus de 3 enfants 32 3,2% 100%
6 3 0,3% 100,0% Total 1000 100%
Total 1000 100%
19/02/2020 429 19/02/2020 430
2. Tableaux 2. Tableaux
Exemple : V. quantitative continues Exemple : V. quantitative continues
Une enquête épidémiologique a été réalisée pour étudier
l’âge des patients consultant dans un cabinet médical a Classe d'âge ni %
Rabat.
[14-16[ 15 12,50%
25,2 21,5 20,4 17,4 25,5
18,7 25,7 21,5 22,2 24,4
[16-18[ 20 16,67%
26,4 22,8 17,9 17,7 24,4
23,0 19,6 16,8 22,5 17,4
[18-20[ 35 29,17%
17,0 16,0 18,1 19,9 21,2
14,8 25,6 17,5 23,8 14,8
17,7 23,1 23,0 15,5 18,4
[20-22[ 15 12,50%
16,9 24,8 16,9 20,4 18,4
16,5 17,5 24,2 17,3 19,7
[22-24[ 10 8,33%
24,0 18,8 15,4 16,5 16,7
21,1 25,2 22,5 23,3 20,9
>24 25 20,83%
23,6 26,0 23,8 16,0 24,5
….
Total 120 100,00%
19/02/2020 431 19/02/2020 432
72
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
3. Graphiques 3. Graphiques
3. Graphiques 3. Graphiques
73
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
3. Graphiques 3. Graphiques
Types :
Histogramme
Polygone de fréquence
Diagramme en barres Types de
Diagramme en barres horizontales variables
Camembert
Histogramme Histogramme
Histogramme Histogramme
Exemples Étendue des classes
Effectif :
Distribution de l'âge chez 120 sujets
nombre
de sujet
adultes
80
Nombre
60 de barre
?!
40
20
0
Variable quantitative : Age (ans)
19/02/2020 443 19/02/2020 444
74
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
11 20 18 10 20 11 12 30,0% 27,8%
10
16 10 15 17 17 11 10 25,0% 22,2%
Calculer l’étendue E 8
E =20 – 10 = 10 11 12 12 11 20 13 8
6
20,0%
16,7%
13,9%
6 5 15,0%
30 15
10
20
5
10 0
0 <14 [14-16[ [16-18[ [18-20[ [20-22[ [22-24[ >24
<14 [14-16[ [16-18[ [18-20[ [20-22[ [22-24[ >24 Hommes Femmes
Variable quantitative : Age (ans) Variable quantitative : Age (ans)
19/02/2020 449 19/02/2020 450
75
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
76
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Camembert Camembert
(Pie chart) (Pie chart)
Type de variable : Camembert :
Cercle divisé en secteurs
Variable qualitative nominale Chaque secteur : une classe de la variable
La surface du secteur : proportionnelle à la
fréquence
Permet de bien visualiser la part relative
de chaque modalité. Nombre de secteurs : moyenne de 6
5,80%
33,40%
60,70%
77
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Variables :
Variables quantitatives
78
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
X
19/02/2020 471 19/02/2020 472
Nominales
Tableaux de fréquences
Graphiques :
Type des variables Diagramme en barres
Diagramme en barres horizontales
Camembert
79
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Mesurables
Variables
Continues Statistique descriptive
Variables
quantitatives
Discrètes Estimation par intervalle
Intervalle de confiance à 95%
Tableaux de fréquences
Graphiques :
Histogramme
Polygone de fréquence
Boîte à moustaches
19/02/2020 475
Inférence statistique
Échantillon
représentatif
Tirage au sort
Echantillon 1 : n1=4
170, 175, 180, 182
m=176,8
Echantillon 2 : n2=4
155, 170, 179, 186
m =172,5
Échantillonnage
Échantillon Echantillon 3 : n3=4
Population Observations 165, 174, 186, 190
Valeur théorique ou Valeur estimée Population
m =178,8
19/02/2020
vraie? 479 19/02/2020 480
80
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Fluctuation
Population d’échantillonnage
19/02/2020 481 19/02/2020 482
Inférence statistique
Estimation d’un pourcentage
P = pourcentage vrai de malades dans la
population
Échantillonnage
Échantillon
Population Observations
Valeur théorique ou vraie: P, μ, σ2, σ Valeur estimée : p0, m0, s2, s
19/02/2020 485 19/02/2020 486
81
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Autres expressions de s2 :
5%
Intervalle de confiance 5%
19/02/2020 489 19/02/2020 490
82
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Intervalle de confiance de μ = m0 ± i
mo + i - Fourchette
+i . Centrée sur mo
mo mo . i est la précision (la marge d'erreur)
- Risque d’erreur
-i
19/02/2020 mo - i 493 19/02/2020 494
7,8 7,8
m [ 49 - 1,96 ; 49 1,96 ]
400 400
19/02/2020 497 19/02/2020 498
83
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Intervalle de confiance de P = po ± i
po + i - Fourchette
+i . Centrée sur po
po po . i est la précision (la marge d'erreur)
- Risque d’erreur
-i
19/02/2020 po - i 501 19/02/2020 502
84
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Petits échantillons :
np et nq sont < 5
Tables
85
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
61% 79% p 0 (1 - p 0 ) p 0 (1 - p 0 )
<
50,4% 69,6%
p 0 + 1.96 ] p 0 - 1.96
placebo TTT A n n
p 0 (1 - p 0 ) p 0 (1 - p 0 ) p 0 (1 - p 0 ) p 0 (1 - p 0 )
[ p 0 - 1.96 - p 0 + 1.96 ] [ p 0 - 1.96 - p 0 + 1.96 ]
n n n n
𝑛
< 0,7 − 0,6
p 0 (1 - p 0 ) p 0 (1 - p 0 )
p 0 + 1.96 ] < p 0 - 1.96 1,86
n n
0,1 < 𝑛
0,6 + 1,96
0,6 ∗ 0,4
𝑛
< 0,7 − 1,96
0,7 ∗ 0,3
𝑛
<
, 2
,
n
19/02/2020 515 19/02/2020 516
86
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Conclusion
6. Intervalle de confiance
Échantillon : Inférence
comparaison de deux groupes
2. Quelle taille aurait dû avoir chacun des 2
groupes, pour pouvoir conclure à l'efficacité
du médicament, avec des fréquences
identiques?
Plan
Chapitre 8. I. Introduction
19/02/2020 520
I. Introduction I. Introduction
87
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Plan
Introduction
Utilité des tests statistiques en santé
II. ANALYSE BIVARIÉE Origine de la problématique
Principe des tests statistiques
LES TESTS STATISTIQUES La démarche dans les tests statistiques
MÉTHODES DE TESTS Risques d’erreur en statistique
Conditions d’application des tests
D’HYPOTHÈSES
19/02/2020 524
Introduction Introduction
88
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Tirage Tirage
au sort au sort
A=B A>B
Guérison Guérison Guérison Guérison
(30/100) (30/100) (40/100) (15/100)
89
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Échantillon
90
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Situations Introduction
Comparer un échantillon observé à une Utilité des tests statistiques en santé
population de référence Origine de la problématique
Comparer deux ou plusieurs échantillons entre Principe des tests statistiques
eux
La démarche dans les tests statistiques
Population Population Risques d’erreur en statistique
de référence
Échantillon
Conditions d’application des tests
Échantillon
Non rejet de H0 : μ1 = μ2
Rejet de H0 : μ1 ≠ μ2 Attention !!! Les hypothèses sont toujours posées à partir des populations et
non des échantillons
19/02/2020 Une démarche hypothético-déductive 543 19/02/2020 544
Etape 1 : Formuler les hypothèses Etape 2 : Déduire ce que devraient être les
observations si l’hypothèse nulle (H0) est vraie
Hypothèse H1 : Sous H0 :
Hypothèse alternative Paramètres Paramètres
=
C’est toujours ce que l’on cherche à montrer Population 1 Population 2
Sera retenue si H0 est rejetée μ1 = μ2
H1 bilatérale : μ1 ≠ μ2 Paramètres Paramètres
Échantillon 1 = Échantillon 2
Les paramètres sont différents
H1 unilatérale : μ1 > μ2 ou μ1 < μ2 m1 = m2
Un des paramètres est inférieur (ou supérieur) à l’autre.
Fluctuation d’échantillonnage
Attention !!! Les hypothèses sont toujours posées à partir des populations et
m1 - m2 ≈ 0 m1-m2 : R
non des échantillons
19/02/2020 545 19/02/2020 546
91
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Classiquement : α =0.05
19/02/2020 551 19/02/2020 552
92
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Fausse absence
de différence Puissance : 1 - bêta : probabilité de mettre en
évidence une différence qui existe réellement
Vrai valeur Échantillon 2
19% 15%
93
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
p>0.05
Absence réelle
• La probabilité que la d'effet
différence observée soit Résultat
Différence Test
due au hasard est forte non significatif ?
Manque de
observée statistique • On ne rejette pas H0 au puissance
risque β de le faire à tort
Impossible de conclure
• Conclusion : On n’a pas Ne pas conclure à l’absence de différence
mis en évidence de «L’absence de preuve n’est pas la preuve de
différence statistiquement
significative entre les deux l’absence»
populations
19/02/2020 563 19/02/2020 564
94
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
15/09/2015
19/02/2020 565
565 19/02/2020 566
95
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
96
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Quels sont les facteurs indépendamment liés à l’événement ? Quels sont les facteurs indépendamment liés à l’événement ?
Charge virale
Ancienneté Mode de
de l ’infection contamination
TABAGISME
ANALYSES MULTIVARIÉES
Variable dépendante
Les analyses multivariées permettent de prendre Variable à expliqué
en compte les facteurs de confusion
Deux solutions
Stratification : 2 groupes
Tabagisme oui : test
≠
statistique entre la
consommation de café.
Tabagisme non : test Variables indépendantes
statistique entre la
consommation de café.
Variables explicatives
19/02/2020 581
97
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Sexe Sexe
Age Age Variables indépendantes
?S Variable dépendante?S ?S ?S
Variable à expliqué Variables explicatives
Quels sont les facteurs indépendamment liés à l’événement ? Quels sont les facteurs indépendamment liés à l’événement ?
- Couleur
-Ville Variables
Variables Nominales d’origine
-Taille
Continues -Poids
Variables
Variables quantitatives Régression
quantitatives -Nombre
Mesurables Mesurables linéaire
Discrètes
de (continue)
patients
19/02/2020 Pr. BOUAITI (ebouaiti@[Link]) 585 19/02/2020 Pr. BOUAITI (ebouaiti@[Link]) 586
Régressions :
98
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Lien Y = a + bx + e
Y = a + bx + e r: paramètre de la
(variation moyenne de la valeur
distribution de (X,Y) de Y pour une augmentation
d’une unité de X)
R2 : part de variation de
19/02/2020 589
Y expliquée par X
Ecart au
f (X) modèle
Prévision du modèle Le signe du coefficient nous indique le sens de
la relation.
99
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
-0,3 1,5
0,6
100
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Ecart au
MODELE : RECHERCHE DE f( ) LA PLUS APPROPRIEE. f (X) modèle
LINEAIRE, LOGARITHMIQUE, INVERSE,
Prévision du modèle
CUBIQUE, PUISSANCE, LOGISTIQUE, EXPONENTIELLE,…
101
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
102
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
La régression logistique
e xp(-1 0 + 0 ,1X)
0 ,5 E (Y) =
1 + e xp(-10 + 0 ,1 X)
Odds ratio
0 ,0
50 10 0 15 0
X
Les i sont des constantes inconnues à déterminer. Ils sont
calculés/estimés par des programmes.
618
103
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
104
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
105
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
QUESTIONS – 2 Réponse
Réponse QUESTIONS – 3
représentés par le
Hypothèse nulle (H0) : P1 = P2 tableau suivant.
Sexe
Femme 59 (47,6) 369 (47,9)
0,094
Variables Avec ISO Sans ISO p Variables Avec ISO Sans ISO p
n=124 n=770 n=124 n=770
Age (ans) 47,32±13,37 45,01±13,67 0,08 Age (ans) 47,32±13,37 45,01±13,67 0,08
Durée de séjour (jours) 16 (6-31) 10 (4-18,25) <0,001 En analyse multivariée, Durée de séjour (jours) 16 (6-31) 10 (4-18,25) <0,001
on cherche à déterminer
Sexe 0,094 Sexe 0,094
Femme 59 (47,6) 369 (47,9) les facteurs associés à la Femme 59 (47,6) 369 (47,9)
• Les variables Homme 401 (52,1) 65 (52,4)
survenue d’ISO. Homme 401 (52,1) 65 (52,4)
associées à i’ISO sont Immuno-dépression 22(17,7) 132(17,1) 0,870 Immuno-dépression 22(17,7) 132(17,1) 0,870
Cathétérisme vasculaire 59(47,6) 129(16,8) <0,001 Question 4: préciser Cathétérisme vasculaire 59(47,6) 129(16,8) <0,001
les variables avec un
L’événement dépendant
p-value < 0,05. Diabète 23 (18,5) 68 (9) 0,001 Diabète 23 (18,5) 68 (9) 0,001
Antibiotique avant l'infection 63 (50,8) 144 (19,1) <0,001 Et les événements Antibiotique avant l'infection 63 (50,8) 144 (19,1) <0,001
106
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Réponse QUESTION - 6
diabète, la préscription Cathétérisme vasculaire 59(47,6) 129(16,8) <0,001 Immuno-dépression 1,04 0,63 – 1,71 0,87
d’antibiotique avant la survenue
de l'infection et le type de la Diabète 23 (18,5) 68 (9) 0,001 Cathétérisme 4,51 3,02 – 6,72 <0,001 5,51 3,51-8,64 <0,001
chirurgie. Antibiotique avant l'infection 63 (50,8) 144 (19,1) <0,001 Question 6: Quelles Diabète 2,31 1,38-3,88 0,001 0,78 0,42-1,44 0,436
Réponse QUESTION - 9
L’événement dépendant
La durée de séjour • Les résultats de
Les événements l’analyse
indépendants : L’âge, le
sexe, l’immuno- dépression, multivariée sont
le cathétérisme vasculaire, représentés par le
l’ISO, le diabète, la
préscription d’antibiotique tableau suivant.
avant la survenue de
l'infection et le type de la
chirurgie. Question 9: Quelles
Le type de l’analyse sont les variables
multivariée : Régression
linéaire multiple. associées à la durée
moyenne de séjour en
analyse multivariée?.
107
Pr [Link]---Methodo 19/02/2020
Réponse Conclusion
Conclusion Conclusion
108