Université Abou-Bekr Belkaïd Master2 IM
Faculté de Technologie Intelligence artificielle
Département de Génie Biomédical
TP2 : Segmentation et caractérisation
But ;
Segmentation de la région d’intérêt.
Caractérisation
Travail demandé :
Aborder quelques méthodes de segmentation d'image. La méthode d'Otsu
permet de calculer un ou plusieurs seuils de séparations entre les zones
d'histogrammes,
Effectuez un seuillage pour extraire uniquement la tumeur ?
Vérifier la qualité de la segmentation en représentant le contour de l’image
segmentée sur l'image originale à l’aide de la fonction [c, h]=contour();
set(h,'Color','r','LineWidth',2);
Sur la région obtenue, calculez sa surface, son périmètre, sa compacité et les
coordonnées de son centre de gravité.
a) La surface est le nombre de pixels de l’objet (binaire) multiplié par la résolution.
b) Le périmètre est le nombre des pixels du contour (binaire) multiplié par la
résolution
c) La compacité (« compactness », « irregularity index ») est définie par l’équation
suivante :
p2
Compacité =
4∗π∗s
Avec s : surface de l’objet, p : son périmètre
d) Les coordonnées du centre de gravité sont calculées à partir du masque de
l’objet. Nous pouvons considérer que l’image s’apparente à un ensemble de
points de coordonnées (x, y). Le centre de gravité est alors calculé comme
étant la moyenne des coordonnées en x et la moyenne des coordonnées en y.
∑ 𝑥𝑖
𝑐𝑖 =
𝑠𝑢𝑟𝑓𝑎𝑐𝑒
∑ 𝑦𝑖
𝑐𝑗 =
𝑠𝑢𝑟𝑓𝑎𝑐𝑒
Pour extraire les coordonnées en 𝑥𝑖 et 𝑦𝑖 , en utilisant la commande find.
Pour vous aider à repérer précocement un mélanome, il vous est recommandé
d'appliquer la règle ABCD :
pour Asymétrie
la moitié du naevus ne colle pas avec l'autre moitié. Le paramètre d’asymétrie est un
attribut important pour différencier des objets. Ce paramètre est généralement, évalué
par la comparaison des deux moitiés de l’objet selon l’axe horizontal et vertical.
Pour quantifier ce paramètre deux axes orthogonaux passant pars le centre de
gravité de l’objet sont suffisants pour l’évaluation l’indice de symétrie d’un objet.
Comparer la partie (haut/bas) et la partie (gauche /droite). Pour la
comparaison on calcule le rapport entre l’intersection et l’union
𝐴∩𝐵
𝑟𝑎𝑝𝑝𝑜𝑟𝑡 =
𝐴∪𝐵
Avec : A : est la partie haut/gauche, B : la partie bas/droite
pour Bords irréguliers
les bords peuvent être encochés, mal délimités.
La compacité (« compactness », « irregularity index ») est définie par l’équation
suivante :
p2
Compacité =
4∗π∗s
pour Couleur inhomogène
variant d'une zone à l'autre de la lésion. Pour quantifier ce paramètre, vous
pouvez calculer les paramètres de textures, Energy, homogenity and Entropy ?
pour Diamètre
qui est souvent supérieur à 6 mm ?
Conclusion générale
