CM 2 :
Avancée significative est-ce que 5% de différence, est-ce que 1 c'est trop
sélectif.
Comment définir la fiabilité de ce seuil ?
Fait partie des questions qu'on continue à se poser.
Hybride, espèce au sens biologique
Mule et le mulet, rechercher pour le transport de matériel
Anecdotique croisement lion et tigresse.
Phénomène même dans les eaux, poissons papillons, poissons orange.
Combien de temps pour qu'une espèce se forme ?
Mécanisme dynamique dans le temps, pas de réponse absolue
Exemple qui montre la variabilité
Famille de poissons d'eaux douce, Famille de poissons assez recherché
Mulot, ours polaires
Création en peut être moins de 20 000 ans
Platane
Aucune différenciation entre population américaine
Cas des drosophiles matériel de laboratoire
très facile à utiliser, lorsque l'on s'amuse à croiser des souches sauvages et des
souches de laboratoire
Drosophile de laboratoire
Combien d'espèce dans le monde vivant
1 900 000 espèces décrites, nombre total d'espèces (dont 250 000 marines)
Chiffre qui vont surprendre, probablement dépassée.
Trois règnes majeurs
Opistochontes groupe des insectes comprend la proportion la plus importante 75%
Règne des plantae 17%
Les straménopiles 6%
5-10 millions d'espèces
3 à 100 millions, trop fort
Raisonnable
probablement aux alentours de 5-10 millions crise de la biodiversité
On décrit 10 000 nouvelles espèces chaque année. En 2011, près de 18 000 espèces
nouvelles ont été décrites ... !!
Eucaryotes 8 millions 500 000
75 % de la biodiversité terrestre et 90 % de la biodiversité marine ne sont pas
encore répertoriées !
Discussion sur cette article, réaliste ou pas
Caractérisation d'une deuxième espèce : éléphant de savane
éléphant de forêt
Même configuration, pas le même résultat
Pas un objectif mais possibilité de retenir
Connue par les habitants locaux
Calamar géant, récit des chasseurs de baleine
pêche de cachalot
grande marque de ventouse
calamar géant qui vivait dans des grands fonds marins
Quelque animaux morts échoués
Animaux vivant
8 m avec les tentacules
Changement de continent
Grosso modo ressemble à un chat, connue de longues dates. Moins beau
Nouveau unicellulaire, nouveau phyllum chercheur australien, afinement des lames
refiler à des spécialistes.
Api complexe des unicellulaires
phyllum où on retrouve l'agent du paludisme
On trouve de nouvelle espèce
Mont Panier
Au alentours de 90% d'endemisme
Doctorant qui s'intéresse aux fourmis électriques, secteur envahis par la fourmis
électrique
Spécialiste du muséum de Paris
Tête très noir, casque de Dark Vador Lepidogryllus darthvaderi
Espèce vivante, Espèce fossile
Homme fossile
Fait une vingtaine d'année
Homo erectus disparu il y a 10 - 15 millions
Insularité
Moins de ressources disponibles
Milieu continentale, milieu insulaire
Beaucoup de petites espèces
Début des années 90, extrêmement abondante
Moyen technique suffisamment puissant
Moyen de caractériser
Technique génétique moléculaire
Probablement l'organisme photosynthétique le plus abondant
Tel abondance pourrait impliquer pas moins d'un tiers de production marine
------------------------------------------------------------
2 ème sous chapitre
Où sont passées les animaux ? Est-ce toujours facile de différencier un végétal à
un animal ?
Exemple similaire, organisme de petite taille
Trois organismes qui ont été classé, traditionnellement associée au monde végétale
Unicellulaire
1 ère séance de travaux pratiques
Foraminifères plusieurs loges 1 seule cellules
Soleil Héliozoaires avec des espèces de spicules
Squelette à base de silice
Dinobiontes appartient au monde végétale
Flagelle
Typique des végétaux
Typique des animaux
Est-ce toujours facile de distinguer un végétal d'un animal
Organisme de petite taille ?
4 critères
Un végétal est immobile, un animal est mobile
Un végétal est autotrophe, un animal est hétérotrophe
Les végétaux sont osmotrophes, les animaux phagotrophes
Les végétaux possèdent de la cellulose
Mobilité ou immobilité
Un certains nombres d'espèce végétale
Flagelle pour les animaux
Thalle un peu différente
D'autres végétaux qui rampent, se vissent, etc...
1 seconde et des poussières
Diatomées
Avance en ligne droite
Aquarium avec des spirogyres, possibilité de se déplacer
Sens des flèches qui indique le sens des déplacement
Six heures aucun mouvement dans l'aquarium
Effet de mouvement de l'eau
Algue qui se rapproche de la lumière
Cyanobactéries Milieu intertinaux
Marée basse : rayonnement solaire
Migration en profondeur
Eau qui s'infiltre dans les sédiments
Taxons animaux complètement immobile
Coraux (Scléractiniaires, Cnidaires) dans un récif corallien
Autotrophie, hétérotrophie
Carbone minéral Acide carbonique
Nutriments : phosphore, azote
Energie lumineuse
Organisme qui va produire du carbone organique
Hétérotrophie
Carbone organique -C-C-C
Organisme végétaux Les fungi, les oobiontes, certaines bactéries sont capable
d'autotrophie
Espèce d'animaux qui appartiennent au groupe des métazoaires
Facultative
Cleptoplastie = voleur de chloroplaste
Petite taille, Chloroplaste vont réussir à survivre, faire la photosynthèse.
Polysaccharide etcetera ...
Scilliée
Nudibranche même genre qu'un Elysia chlorotica
Photosynthèse obligatoire
Phase larvaire
Stade juvénile
Trouver une algue juvénile
Algue rare
Plus du tout d'algue
Chloroplaste avant, survivre jusqu'à sa mort
Chloroplaste survivre longtemps dans son corps
Alimentation photosynthèse grâce au chloroplaste
Vivre
Photosynthèse obligatoire
Alimentation obligatoire
phagotrophie
Capture active d'éléments nutritives
Animaux Bouche anus
Capture de la particule alimentaire
Excrétion par l'anus
Soit de l'intestin, soit de l'estomac
Nombre de végétaux
Semblant de tube digestif
Groupe entre guillemet végétal
Certe phagotrophe Téguments peut absorber des éléments nutritifs
Avoir des animaux qui sont complètement dépourvue de système digestif
Pas d'anus
Stratégie très particulière, Carcasse où les animaux meurent
Utilisation des matières grasses
Association assez spécifique bactérie
Tube digestif incomplet, parasite des digènes
Cellulose extrêmement discriminant, Embryobiontes
Autres végétaux qui possèdent pas de cellulose
Cellulose, d'autres composés des Agars, des caraghen
On peut continuer à examiner les caractères traditionnellement associés à l'idée de
végétal ou d'animal
On ne peut pas avoir de définition sur le plan strictement scientifique
Tel ou telle groupe
Tel résonance dans nos habitudes
Ces définitions qui viennent d'un collègue pour faire de manière provoquante
Ensemble d'organisme hétérogène, pas très scientifique
Ensemble d'organisme hétérogène, pas faux pas précis pour aller dans le détail
Absence de photosynthèse de paroi
Photosynthèse, chloroplaste, pas de mouvement
Paroi cellulaire chloroplaste noyau
Pas de flagelle ne bouge pas à gauche CYSTODIUM
Organisme qui se déplace DINAMOEBIUM
Phylogénie complètement différent
taxon groupe monophylétique
Typiquement animale
DINAMOEBIUM
Alvéolé Dinobiontes
D'autres représentant d'autre organisme
Hétérotrophe
Espèce mixotrophe
Hétérotrophe
Autotrophie
Nom d'espèce Groupe plus intéressant
Apicomplexe groupe important
Groupe qui comprend les agents du paludisme
Ancêtre photosynthétique
Perte de la capacité de photosynthèse
Apicomplexés
Végétal animal
Carl Von Linné
Le père de la taxonomie
Il avait pas les moyens d'étude que nous avons aujourd'hui
Difficulté à classer certaines espèces
La il s'est tromper La il s'est pas tromper
Ecologue allemand ou autrichien
Arbre phylogénétique
Représentation très imagé
Haeckel
Arbre phylogénétique
Pas un spécialiste de la taxonomie
Cladogramme
Avancée des sciences
Système à cinq
Whittaker
Avancée importante à son époque, il est de nos jours complètement dépassé. il
continue malgré tout d'être parfois présenté (sous cette forme ou une variante)...
Ensemble des procaryotes
Deux coupes majeurs
Archées et les bactéries
Aperçu au fur et à mesure
Bactérie et les archées
Archées et les Eucaryotes
Possiblement les Eucaryotes descendrait du groupe des Archées
Archée Bactérie
Archéo Bactérie
Conscience que ce n'était pas la même chose
Que signifie le terme bactérie
Ancienne bactérie - Année 1960
Système à 3 règnes Système à 5 règnes puis à 7 règnes
Amélioration des techniques puis du matériel
Analyse de physiologie et d'histologie
Aperçu que ce sont des groupes polyphylétiques
Un certain nombre de groupe était proche
Chlorobiontes
Algues brunes
Règnes des straménopiles, un des 10 règnes des Eucaryotes
Plus aucun doute sur cette réalité
Plus de question
Algue verte
Chromobiontes
Arbre du vivant actuelle
3 grands ensembles 3 empires
Au départ mais fait trop guerrier
3 domaines
Au sein des eucaryotes on a 10 règnes.
Eucaryotes vision schématisée
Règne qui nous intéressera par la suite
Ensemble des métazoaires
Pas que les animaux.
Stade de la classification
Le coin lubriadaire
Certains unicellulaires
Opistochontes
Groupe polyphylétique
Groupe des poissons évoqués hier
Pas de sens établis
Pas de mention des eucaryotes
Algues bleues Pas vraiment bleues
Ptit focus dans ce qu'on appelle les algues
Champignons
Fungi = Champignons
Champignons de façon globale
Champignons Fungi
Terme qui n'a pas de réelle signification
En vert c'est les algues
En jaune c'est les protozoaires
En orange des taxons qui sont revendiqués par les autres
Groupe dans lequel vous avez des groupes
Science d'aujourd'hui n'est pas la science d'hier
Classification des eucaryotes
Le point très du guyadaire
Version 2017 Pas de 5ème édition
Relations phylogénétiques
Métazoaires, entre guillemets des animaux
Arbres phylogénétiques sont-ils fiables ?
Etablis à partir des caractères
Os dans la mâchoire
Gène si on s'intéresse au séquence
Différence au sein de leur gène
Fiabilité dans la phylogénie
Transfert horizontaux de gène
Transfert de gène entre différents eucaryotes
Décrit des évènements pas trop ancien
20 000 ans, groupe auquel on s'intéresse
HGT
Un peu de conditionnelle
Phylogénie à gène particulé
Beaucoup de transfert latéraux
Description des événements très anciens dans la vie
Capacité très ancien
Taxons qui ont évolué très vite
Horloge moléculaire
Difficulté à interpréter les choses
Hypothèse majeur
ring of Life
Cladogramme moins fiable dans d'autres conditions
Arbre linéaire
Dichotomie bien établis
Transferts de gènes au cours de l'évolution
Aboutissement
LUCA
Trois grands domaines : bactéries, archées, eucaryotes
Exemple rapide : transfert de gènes 50 millions d'années
Gène de la phénylalanine
Archée 1 tiers des gènes
Pas beaucoup de gènes
Amibe Entamoeba histolytica
Gène de procaryotes et d'eucaryotes
Amibes
Deuxième espèces qui donne la diarrhée
Origine bactérienne
3 empires du vivant
Cours spécifique
A= Archées
B= Bactéries
E= Eucaryotes
Fin des années 90 Début des années 2000
ancêtre commun des eucaryotes et des bactéries
A l'origine de la vie sur Terre, par simplification évolutive
3ème hypothèse
Bactérie de groupe ancestrale fusion de gène bactérienne
Les hypothèses 3 et 4 sont largement les plus admises.
Que cherche t-on ici ? Simplement à utiliser un terme qui donne une information.
Pas juste pour changer les mots, utiliser des termes qui donnent de l'information
Taxon groupe monophylétique
Zooplancton ---> information écologique
Organismes photosynthétiques --> information fonctionnelle
Organismes photosynthétiques multicellulaires (ou unicellulaires)
---> information morphologique + fonctionnelle
Eucaryotes unicellulaires --> information taxonomique + morphologique
Filière scientifique Mot ont un sens en fonction si il y a quelque chose derrière
Cas particulier des virus
Les virus ne sont pas présents dans l'arbre phylogénétique ; pourquoi ?
ARNr 16s qui est commun aux bactéries, aux eucaryotes et aux archées.
Ainsi, les positions relatives de ces organismes dans l'arbre du vivant peuvent
être étudiées.
Mais les virus n'en ont pas, donc le problème à tout simplement été éludé.
Des techniqures nouvelles verront sans doute le jour faut donc s'attendre à une
complexification des connaissances actuelles.
Question extrêmement triviale
Virus à entité nucléoprotéiques
Totalement inertes à l'extérieur de la cellule
Utilisation des constituants pour se multiplier eux même.
Complètement inerte
Recherche du détail
Parasite ben il meurt, il va vivre.
Mais il y a des cas particulier
Le virus ATV qui est le seul, l'un des seuls exemples actuellement connues des
virus.
Milieu très très particulier, bourgeonne dans la cellule. Processus qui est actif.
Simple réorganisation des constituants.
50 microns, 0,1 microns
Archée sur la photo
Virus qui bourgeonne sur les cotés. Partie basse sur les photos.
1 semaine d'incubation.
Question de base PAS VIVANT au sens biologique du terme ! Deux hypothèses :
Hypothèse de l'échappement
Système auto-répliquant capable d'affecter les cellules
Probablement pluricellulaire !
Hypothèse de la réduction : simplification ultime d'un organisme cellulaire
On ne sait pas si cela peut varier en fonction du type de virus.
Virus géant
Mimivirus, mignon virus
Très gros bien plus gros que certaines bactéries.
Gène commun trois règnes trois domaines du vivant.
Parasiter par d'autres virus
Faisant partie du vivant Depuis deux mille trois
4 ème domaine du vivant classification sommaire
Archée Bactérie
Base des Eucaryotes
Question toujours pas tranchées
Parasitologie
Virus traditionnelle
Virus géant - équipe de Didier Raoult
Faculté de médecine à Marseille
Marseille virus
Nouméa virus
Article dans les nouvelles
Pas était très originale.
Stratégie inédite, rendre perméable le noyau de son hôte. Pas d'autre exemple
Dernier exemple, avant dernier exemple découvert une autre famille de
Pandora virus quercus
Eau douce soit marin
Les virus monde vivant ?
Les entités biologiques ou pas sans doute les plus abondantes
On est recouvert de virus sans qu'on s'en rende compte.
Chromatographie
Différenciation assez sommaire
Etoile moyenne
Point qui sont des virus
1 millilitre d'eau de mer
Il y a des virus partout partout
Facteur 10
Biomasse en carbone
75 millions de tonnes de carbone issue
CM 3
-----1---------
On peut avoir des cas particuliers
Vert Rouge
Présence d'un noyau
------2--------
ADN replié sur soi-même
Double hélice
Caractéristique des eucaryotes
Protéine qui contribue à la compaction de l'ADN
Caractère très discriminant
Présence d'archée
Dinobiontes
Absence d'histone
1 seul chromosome chez les procaryotes
-----3--------
5ème caractéristique
Aux alentours de 3000 gène
Tous les eucaryotes possède 3000 gènes
A titre illustratif
Nombre de gène plutôt faible
Duplication de gène rare ou fréquente
Métabolisme particulier
-------4--------
Transfert latéraux
Inversement discontinus au cours de l'évolution
Vitamine B12 synthèse
Sois les gènes sont présents
Sois les gènes metH
Provient du milieu extérieur
Alimentation des organismes
Eucaryote qui ont des vitamines eucaryotiques
------5-6-7---
Chez les procaryotes ont a une absence des organites
Organelles ---> présent chez les Eucaryotes
Ribosomes que l'on peut trouver procaryotes ou eucaryotes
De type 70S
De type 80S
dans le cytoplasme
Opisthochontes nous sommes des opisthochontes
Flagelle terme qu'on utilise fréquemment
Tube creux
---8---
Undulipodium
structure beaucoup plus complexe
Structure que l'on retrouve chez les bactéries
Undulipodium associée à un cinétosome
Appareil cinétique le moteur qui va faire bouger le flagelle
Même type de motricité
Gamète ou eucaryote unicellulaire
Fluide : air , eau
Spongiaires : éponges
Fluides qui circule dans les reins sont impliqués avec des Undulipodiums
(9+2) doublé de microtubule avec une extension
-----9-----
Deux microtubules centrales, moteur basale
-----10-----
700 microns spectaculaire pour une cellule
----11---
Taille de l'œil de la drosophile
Taille d'un procaryote
-----12------
Supérieur à 20 microns
Algue
Acetabularia acetabulum
-----13------
Particule alimentaire dont va se nourrir l'organisme
Phagocytose de la particule
Point de vue évolutif
Digestion, innovation sur le plan de l'évolution
Notion de phagotrophie
Fondation des eucaryotes
Evolution au fil du temps
Origine des organelles composés
----14-----
Eucaryote primitif
Bactérie ou archée au sein d'une vacuole
Endosymbiose
Archée devenue symbiotique
Membrane nucléaire
Au sein de notre noyau, mélange de l'ADN
Bactérie ou eucaryote ancestral
-----15-----
Formation de structure particulière
Continuité entre la membrane particulaire
50 / 50
90 / 10
balance entre les deux hypothèses
-----16-----
Organelle issue de mécanisme évolutif
Idée pas toute neuve
Idée au 20ème siècle
Basé sur les capacités techniques, ressemblance des chloroplastes
Organelle autoreproductrices, mitochondrie préexistante
Viens d'un chloroplaste qui préexistait
Un seul chloroplaste
Division se fait généralement de manière simultanée
Certain nombre d'expérimentation
----17------
La cellule ne sait pas le reconstituer
La cellule continue à se diviser
Chacune un noyau
ne peut pas être reconstituer
Le noyau ne possède pas la totalité d'information génétique
----18------
Technique des microscopes
ADN et gène et certains autres organelles
Ribosomes de type 70S
Des eucaryotes de type 80S
Chloroplaste + mitochondrie schématisés
Ribosome 70S
Mitochondrie
-----19------
Catégorie des procaryotes
domaine bactérien
Plante mais
Bel et bien des bactéries
----20----
Endosymbiose primaire
Pro-eucaryote : eucaryote ancestral ou primitif
Symbiose qui s'est mise en place à bactérie de l'undulipodium
Récupération d'une partie du matériel génétique
Intégrer dans le matériel génétique eucaryotique
Liaison à une endosymbiose
alpha protéo-bactérie : terme peu partagée par tous le monde
Ses deux endosymbioses
Tendance clairement net
Mitochondrie
Processus assez ancien dans notre planète
Pour le chloroplaste même principe
Partie du matériel génétique
Processus encore en cause assez accepté pour le chloroplaste
Chose bien établis depuis un certain temps
----21-----
Captation potentiel
Tous ce qui est redondant finis par disparaître, redondant ou nouvelle entité
Différente bactérie ou archée
Gène cytochrome B bien connue chez les généticiens
----22----
Mécanisme des endosymbioses
Capture de proie
Digestion pur et simple et l'organisme disparaît
Phagotrophie
Kleptoplastie = vol réalisé par un certain nombre d'espèce
Phase qui concerne certains chloroplastes
--23---
Chloroplaste reste dans l'organisme, captation d'une partie du matériel génétique
----24----
Pas de signification biologique à moins de considérer un mélange un peu générale
Renferme des organismes de type protozoaire.
-----25------
2 entités
Bicontes
-----26-----
grosse description
Caractère dérivé, structure anatomique dérivée. 2 flagelles ou 2 undulipodiums.
Bicontes contrairement à son groupe frère
Importance écologique : Espèce pratiquant la photosynthèse.
Cas des cilliés ou au cas des radiolaires
PAFC:plus ancien fossile connue
Protiste sur les unicellulaires
----27-----
On a affaire à des unicellulaires, la gamme de taille on a affaire à des microns
soit marin soit d'eau douce.
Humidité des sols, humidité relativement important.
Espèce symbiotique
Parasite
Mode de reproduction essentiellement asexuée
----28---
Apicomplexe ou Apicompléxé
Alvéolé
Taxon basant sur l'identité de l'ARN 18S
Alvéolés ou Alvéolates
Espèce actuellement décrites
15 200 espèces
Les fossiles connues depuis 420 Ma.
Flagellés ou ciliés.
Les apicomplexés et les ciliés
----29-----
réservoir calcique : fluide comportant du calcium
Espèce concernant les plaque thécales
Organisme qui se déplace
----30-----
Forme sporozoïte,(ancien terme sporozoaire)
Le complexe apical est composé d'organelles spécialisées
Microtubules spécifique des organismes.
Notion de moteur.
Singlet de microtubules.
Triplets sont la condition primitive.
6000 espèces pas mal
Espèces parasites soit extracellulaire
Fossile de 420Ma
-----31----
Parasitologue
Alternance de phase n chromosome phase 2n chromosome
Multiplication de noyau instantanée Ce qui change dans cette première étape
Spore de façon schizozoite
Milieu intérieur ou milieu extérieur
poursuivre le cycle du parasite
Vont être à l'origine de la production du gamète
Réduction chromatique
Assez fréquent chez beaucoup d'espèce
Exemple de parasites un deux trois ou quatre ans
Pas forcément chez les apicomplexés
----32-----
Plasmodium Falciparum
Apicoplaste sorte de résidu évolutif
Maladie parasitaire
Oocyste
----33-----
Soit on est parasite soit on est parasité
Parasitation du petit requin
---34----
Parasite des huitres originaire du Japon, mer de Corée.
Protéolyse des tissus.
Relation parasite / espèce parasité effet bénin
Cas de figure particulier, d'autre espèce d'huître
Espèce qui a une importance
Parasite transféré, vraie problème pour les agriculteurs
------35------
Poisson d'eau douce / Poisson d'eau de mer
Mortalité naturel
Espèce élevé
-----36-----
Anthropocentrée
Anthropomorphisme
Vecteur du parasite
Plasmodium à n chromosome
Piqûre Peanut
Peanuts
Cellule du foie
Plasmodium va se multiplier dans les cellules du foie
Contamination des hématies ou les globules rouges
Deuxième étape --> Conséquence majeur
Passe d'une cellule à une autre
Plusieurs cycles au sein des globules rouges
Lors d'une deuxième piqûre récupération du sang
Méiose repasse à une phase de chromosome
Plasmodium falciparum
----37----
Tube digestif Elément de terminologie
Trophozoïtes
Mérozoïtes
Phase d'éclatement des cellules
Infection jusqu'à 25%
Plusieurs milliards de cellule infecté
-----38------
[Link]
moustique porteur
Anophèles gambiae
On est pas susceptible d'être touché en NC
Forme moins grave de paludisme
4 espèces de plasmodium
Autre forme de paludisme
Infection
Sous-estimation
1 million de décès par an
OMS il y a pas si longtemps que ça.
Premier tueur d'homme
----39----
Infection par Toxoplasma
Manipulation
Impasse parasitaire
Le chat ne mange pas l'homme
L'homme ne mange pas les chats; habitude alimentaire dépend
Vecteur potentiel de la toxoplasmose.
Risque de transmission au fœtus.
Lors de la première grossesse.
------40-----
Capture des proies
Forme assez diverse, photo que vous avez à l'écran
Cilié marin
Capture des proies
Absence de mitochondrie classique
Hydrogénosomes
Mitochondries qui ont évolué
au sein d'une mitochondrie classique
---41---
Micro et macronoyau
Celui qui comporte les chromosomes
Reproduction sexuée de l'organisme
Microscope chez les paramécies
Petit nombre de gènes
Vacuoles pulsatiles
Il y a deux
Excrétion et l'osmorégulation de l'animal du cilié
----42-----
On trouve à peu près 8000 espèces.
On trouve milieu froid milieu chaud.
Tintinides qui vont sécréter une loge qui permet de trouver des fossiles assez
anciens.
Disparition des macronoyaux
-----43-----
Vrai noyau ---> Petit noyau
Future petit future grand s'assemble
----44----
Zygote à deux n chromosomes
Les ciliés sont des organismes aquatiques
Point de vue écologique
Forme dissoute forme particulière
Bactérie ou d'autre ciliés
Paramécie est un prédateur à son échelle, photosynthèse.
Pas complètement achevée ne semble pas être stable, organisme très petit
Réseaux trophiques ou les chaînes alimentaires
Echellons bactériens
Micro zoo planctons
----45----
Développpement des espèces marines
Unicellulaire de grandes tailles
----46----
Quelque espèce
Test glycoprotéique
Forme de carapace
test ou une structure dure
Paroi cellulaire
Forme de calcaire
Loge qui augmente
Filopodes vont sortir du test calcifié.
Vont avoir deux rôles essentiels.
Servir à la flottaison.
Capture de la nourriture
Constitution de globule lipidique
Contribuer à la flottaison
Connaît depuis 500 Ma.
Groupe extrêmement important, très très bon marqueur géologique
Structure des foraminifères.
------47------
loge en bas à droite
Loge ou se trouve la foraminifère
sauf si elle se répartit sur les loges précédentes
-------48-------
Partie axiale et la partie terminale
présente un interét pour les gamètes
Prédateur d'autre unicellulaire
Phytoplancton unicellulaire
Petit ou sous forme larvaire
Capable d'être détritivore
MOP Matière organique particulaire
COD Carbone organique dissous
----49-----
Pas interrogé
----50----
Sert au foraminifère
Survie estimé d'un point de vue expérimental
Foraminifère pendant 1 an
Foraminifère qui vit
Photosynthèse où la lumière pénètre.
-----51-----
Forme observé
Forme de pomme de pin, de grain de blé
Test calcifié
Test de silice
----52----
Filopode qui sorte de la structure
-----53----
Cnidaire par exemple à l'image d'autre groupe constitue un lien trophique
Microzooplancton
Présence de phénomène d'endosymbiose avec des cyanobactéries
Squelette siliceux transfert vertical assez important
Mort des organismes
Constitue une partie importante des sédiments
-----54-----
Symétrie
Espèce d'eau froide
---55-------
Planche assez ancienne
Fin du 19 ème siècle
Capacité d'observer et de reproduire
Structure très fine
SILLICE
Reconnaissance des formes et des détails
---56----
Haptophytes qui sédimentent
Marqueur écologique
Organisme qu'on trouve dans les planctons océaniques
Centrohéliozoaire
----57----
Symétrie radiaire
Filopode et axopode
Représentation qui contient le spicule ressemble au foraminifère
Structure rigoureusement circulaire
Squelette va former une capsule centrale
Composé de type strontium
Partie centrale d'une partie périphérique
Contiennent des liquides ou des corps gras
Gère la flottabilité dans la masse d'eau
Evite de sédimenter dans l'océan
-----58------
Ouvrage ancien ; Actinopode à l'époque
Acondaire
séparé dans des domaines différents
----59-----
Peu de caractère propre
Excavation : forme de sillon forme de cytopharynx
Diversité assez modeste
----60-----
Absence de mitochondries
Perte secondaire
Modification de mitochondries
Hydrogénosome
Présence de bactérie symbiotique
Ribosome presque comparable au procaryotique
Evolution des ribosomes ?
Corps parabasal
Minimum par 4
Grand nombre de flagelle
Regrouper sur une partie dans la partie haute du schéma
Contribue à faciliter l'organisme dans la masse d'eau
Capable de se déplacer
-----61-----
Stockage de
Classe des parabasaliens : conduire à des inflamations aussi bien chez l'Homme que
chez la Femme
Trouver aucun fossile
Forme d'endosymbiose
Chaque espèce symbiotique
Termite ne sait pas faire sans les parabasaliens
Association endosymbiose complété à 3
Pour être efficace
dégradation de la lignine
-----62------
Certaine sont libre d'autre sont parasite
Structure encore différente des hydrogénosomes
Deux noyaux qui sont actif
Giarda lambia : Tourista
Diarrhée des touristes
rarement grave pendant plusieurs jours
-----63----
Maladie parasitaire
5000 à 8000 mort
Kinétoplaste
Essentiellement des parasites
Quelque uns sont des prédateurs
-----64----
Leishmania
Leishmanose glycérale
peut conduire à la mort de l'hote
Chiens domestiques
à l'image du plasmodium
Moustique qui va être le vecteur du parasite
L'OMS 50 à 60 000 morts 40 ?
----65----
Pseudociliés
Interstices du sédiment marin
Prédateur de bactérie
Diatomées qui sont des microalgues
Consommateur de diatomées
Absence de photosynthèse
Undulipodium
parallèle et hélicoidale en disposition
Résidu évolutif pas achevé ?
Constat pas l'origine de cette particularité
----66----
Euglénoide
Pas de paroi cellulaire classique
Cytopharynx
Particularité
Forme de bande protéique hélicoidale
Rôle dans le déplacement
Organisme que l'on retrouve dans l'eau de mer
Sont essentiellement des sapotrophes organiques
CM 4 :
-----3-----
Règne des Opistochontes
Métazoaire
Fossile connue
Fossile de trace de méduse qui sont présent de façon sur
Très bien connue par les paléontologues
Métazoaire schématisé par le perroquet
1350000 million
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Ancêtre commun
Pas de photosynthèse
Phénomène de kleptoplastie
1 seul espèce connue
Lanostérol composé à l'origine de tous les stéroides
tyrosyl-tRNA-synthétase
Trouver des gènes différents
Présence de synthèse de chitine
Algues rouges = rhodobiontes
Maladie du sommeil
Mitochondrie chez les Opistochontes ont cette forme de structure
Présente des parentés avec les végétales
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Un seul undulipodium
Arrière
conséquence fonctionnelle
Undulipodium situé à l'avant
Fonctionnalité de traction mais de façon différent d'un point de vue directionnel
Microsporidie
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Choanoflagellés
groupe frère deux branches de l'arbre phylogénétique très proche taxonomiquement
parlant
Organisme unicellulaire
Pourvue d'undulipodium
120 espèces connues
Soit elle vive libre soit elles sont fixés
Pas trouver de fossile
Element calcaire
Susceptible de se fossiliser
Ignore à peu près tout
Structure de ce type d'organisme
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Collerette de microvillosités
Structure assez proche des tentacules
Captation d'un certain nombre de particules
Espèces solitaires
3/4 sont des espèces solitaires
Fixé soit sur une roche soit sur une algue
Dizaine d'individus qui vivent en colonie
Structure qui les lie les uns aux autres
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Notion de groupe frère
A l'origine des métazoaires
Structure cellulaire
Biologie moléculaire
Choanoflagellés d'autre part
Métazoaire à l'origine des choanoflagellés
Dérivent des choanoflagellés mais pas l'inverse
Espèce unicellulaire mais si elles sont coloniales
Reste unicellulaire
Probablement jouer un rôle dans la pluricellularité
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Les métazoaires groupe monophylétique
Caractère partagés
disparu secondairement au cours de l'évolution
Trame fondamentale dans la matrice extracellulaire
Méiose va donner immédiatement des gamètes
Jonction membranaire particulière
Desmosomes
Quelques espèces mixotrophes
Phylogénie au sein des métazoaires
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La classification de façon générale, basé sur un principe sur la complexité
croissante
Base de la classification ne tient pas la route
Certaine logique qui prévalait à l'époque
Avancée dans la génétique
Permis de revenir sur les critères qui faisait foie auparavant basé sur la présence
d'un caractère
Absence d'un caractère---> primitive ou ancestrale
Vision erronnée caractère peuvent disparaître secondairement
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Quel taxon se situe à la base des métazoaires
plusieurs taxons qui peuvent prétendre à la base
l'aspect en rateau
Pas de discrimination de la phylogénie
? et pointillées
Porifère avant Spongiaires terme plus intuitif que porifère
Débat pour savoir si c'était un ensemble monophylétique
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Taxon basal Cténophores
Groupe extérieures
240 espèces qui sont espèces marines, prédateurs
Assez proche des méduses d'un point de vue de l'apparence
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Grand groupe taxonomique
Placozoaires
Au moins une seule espèce décrite
7 autres espèces décrites
Placozoaires car petites plaques
Se déplace très très longtement
ça bouge pas vite
Rampe sur les substrats
Groupe des éponges
En l'espace de 6 ans ont a eu une modification considérable
Les liens de parentés, l'histoire évolutive chamboulé
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Eumétazoaires langue antique les vrais métazoaires Terminologie
Essentiel d'un point de vue de la diversité
Un millions 300 000
Collagène dont on a parler tout à l'heure
Point de vue fonctionnelle
Structure digestive à part entière
Gastrulation => première étape
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Element de terminologie
Diploblastique
Triploblastique
Element important de la classification
Organisme bilatérien
Caractériser au moins au stade embryonnaire
Endoderme Ectoderme
Endo interne
Ecto externe
Deux feuillets séparé par de l'espèce de gelée ce que l'on apelle de la mésoglée
Aspect gélatineux
Pas tout le temps la même structure que l'on peut retrouver chez la méduse
Acellulaire
Feuillet embryonnaire
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Ecto et endoderme
Mésoglée assez étendue
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Symétrique qui va la partager en symétrie similaire
Cellule qui n'ont pas de symétrie
Structure en forme de sphère
Organisation à peu près symétrique
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Symétrie radiaire
Symétrie dite altérée
Symétrie d'ordre 5 pentaradiaire
Cnidaires
Symétrie d'ordre 6
Symétrie d'ordre 8
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Symétrie bilatérale
Lorsque l'on a les structures de l'organisme organisé selon un axe avant arrière
Existe un seul et unique plan
Symétrie bilatérale
Très importante
Métazoaires non bilatériens
Symétrie bilatérale ne peut exister que au stade embryonnaire
Pas l'impression qu'il y a une symétrie bilatérale
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Plan parasagittal plan bilatérale
Plan frontal plan perdiculaire au plan sagittal
Description morphoanatomique
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PAFC Plus ancien fossile connue
Les adultes sont sessile ne bouge pas
Elles ont des capacités de se déplacer
Filtreurs actifs
Espèce qui sont des carnivores
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Eponge de synthèse chimique
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Lame basale
Cellule totipotente
Dédifférenciation pour changer de fonction
Pinacocytes Cellules sexuelles
Espèces très petites
Plongeurs qui rentre à l'intérieur
Structures caractéristiques
Formation d'un système aquifère
Squelette plus ou moins développée
Fibre de collagène
Spicule
Pièce minérale dur voir très dur
Calcium ou carbonate de calcium
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Ectoderme Endoderme
EXOPINACODERME
Mésohyle
Cellule musculaire
Canall inhalant
Pore inhalant
Deuxième étape dans la circulation de l'eau
Moteur du système
Cellule de l'ectoderme
Oscule : canaux exhalant
Spicule
Trame de fibre de collagène
Element caractéristique : choanocyte
Différente cellule qui sont des choanocytes
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Undulipodium
Flagelle de l'ensemble des choanocytes dans la chambre choanocytaire permet la
filtration
Bactériophage
Corps du choanocyte
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Canaux exhalants
Filtration de leur propre volume
Quelque chose de très rapide
Filtre en permanence
Bactérie pauvre
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Chambre choanocytaire
Condition de la capacité intrinsèque à filtrer le volume
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Complexification croissante
Chambre choanocytaire
Atrium
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Collagène de composition organique
Diactines Triactines
Tétraactines
Structure pas mise au hasard
Constitue la base des espèces fossiles
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Remplis d"éponge elle même
Facilitation
Cellule totipotente possibilité de différenciation de choanocytes
Au moins chez certaines espèces
Pas besoin d'attendre un partenaire sexuelle
Reproduction asexuée
Fragment d'éponge
Eponge de toilette
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4 classes qui sont peut être des phylums
La grande majorité des éponges
8000 m de profondeur
Peuvent ne pas être pourvue de spicule
Spicule silliceux et non pas calcaires
Eponge de verre : vraiment très élaboré
Homoscléromorphes : Absence de spongine; pas de spicules
pas d'élément squelettiique
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7400 espèces
Crabe ou crustacés
N'apporte rien à l'éponge
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Eponge carnivore
Demosponge
30 ou 35 ans
Système aquifère
Modalité de s'almenter
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Eponge carnivore
microcrevette zooplanctoniquee
Pas des tentacules d'une anémone de mer
Filament qui pendouille dans la masse d'eau
Pas des animaux qui digère très vite
Filament qui pendouille
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Milieu oligotrophe : pauvre en matière nutritive
Pas de phytoplancton
Que des petits carnivoress
Valeur nutritive très importante
Découverte il y a une trentaine d'année à Marseille
Pas représentatif de l'ensemble des éponges
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Veritable construction
Spicule à 6 pointes
Absence de noyau dans les choanocytes
Espèce de grotte sous marine
Diversité plus faible que le groupe précédent
Eau de surface
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Squelette d'une éponge
Forme une espèce de couvercle
Abris pour elle
Le couvercle se ferme
Elle utilise des débris, elle vive bien
Bien emprisonné
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Eponge calcaire
Spicules
peut avoir des structures sous forme de plaques
Diversité assez faible
Faible profondeur
Assez peu de variation de forme
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Groupe problématique en terme de classification
1/3 des espèces endémiques à la méditérannnée
Grotte vraiment obscure
Larve particulière
Présente des bactéries symbiotiques
Pas ou peu de spicules
Eumétazoaire ont des lames basales
Ont des lames basales homoscléromorphes
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