Diatomées
Diatomées
(1988) 3 0 9 : 1-69 — 1—
INITIATION A LA SYSTÉMATIQUE
DES DIATOMÉES D'EAU DOUCE
Pour l'utilisation pratique d'un indice diatomique générique
A. RUMEAU, M. COSTE
SOMMAIRE
INTRODUCTION
LEXIQUE ILLUSTRE D E S TERMES UTILISES 3
LES DIATOMEES: CARACTERES GENERAUX 9
- Morphologie générale 9
- Reproduction 9
MATERIEL ET METHODES 10
- Le microscope 10
- Petit matériel 10
- de récolte 10
- de préparation et montage 11
- produits chimiques 11
T E C H N I Q U E S D'ETUDE:
- Echantillonnage 11
- Conservation des échantillons 12
- Nettoyage 12
I-INTRODUCTION
L'étude d e s algues d'eau d o u c e reste encore d e nos jours l'apanage des spécialistes mais
l a c o n n a i s s a n c e d e ces o r g a n i s m e s m i c r o s c o p i q u e s n'est p a s r é s e r v é e a u x scientifiques o u aux
b o t a n i s t e s ; il suffit p o u r s'en c o n v a i n c r e d e c o n s u l t e r les o u v r a g e s et l e s c o l l e c t i o n s du
laboratoire d e Cryptogamie du M u s é u m National d'Histoire Naturelle à Paris pour mesurer
l'ampleur d e s travaux réalisés par d e simples collectionneurs, des amateurs de microscopie ou de
m i c r o p h o t o g r a p h i e qui o n t c o n t r i b u é p o u r u n e large part à l'essor d e c e t t e discipline.
L ' a l g o l o g i e a t o u j o u r s fait u n e p l a c e particulière a u x d i a t o m é e s , a l g u e s b r u n e s à t h è q u e
s i l i c e u s e d o n t l ' i d e n t i f i c a t i o n e s t r a r e m e n t i m m é d i a t e m a i s n é c e s s i t e u n e p r é p a r a t i o n p r é a l a b l e afin
d'observer l ' o r n e m e n t a t i o n d é l i c a t e d u squelette. B e a u c o u p d ' a l g o l o g u e s y voient un
i n c o n v é n i e n t m a j e u r c a r l a r e c o n n a i s s a n c e d e ces a l g u e s i m p l i q u e d e s o p é r a t i o n s j u g é e s à t o r t
f a s t i d i e u s e s ( n e t t o y a g e e t m o n t a g e ) a l o r s q u e d ' a u t r e s y v o i e n t d e s a v a n t a g e s é v i d e n t s liés à l e u r
c o n s e r v a t i o n o u à leur p e r s i s t a n c e d a n s d e s conditions d é f a v o r a b l e s ( a s s è c h e m e n t ) . D a n s les
s é d i m e n t s lacustres, elles constituent les témoins précieux d'un p a s s é récent ou parfois plus
a n c i e n à l ' é c h e l l e g é o l o g i q u e . L a p a l é o b o t a n i q u e et l a p a l é o c l i m a t o l o g i e l e s u t i l i s e n t f r é q u e m m e n t
e n a s s o c i a t i o n a v e c les p o l l e n s ( p a l y n o l o g i e ) pour r e c o n s t i t u e r les c o n d i t i o n s c l i m a t i q u e s et les
c a r a c t é r i s t i q u e s h y d r o l o g i q u e s d e s m i l i e u x à différentes é p o q u e s .
U n a u t r e a t o u t m a j e u r est l e u r a p t i t u d e à c o l o n i s e r t o u s les m i l i e u x a q u a t i q u e s m ê m e les
p l u s h o s t i l e s et l e u r utilisation d a n s le d i a g n o s t i c d e s pollutions est déjà très a n c i e n n e p u i s q u e d è s
1 9 0 8 K O L K W I T Z & M A R S S O N o n t p r o p o s é u n e liste d e d i a t o m é e s indicatrices d a n s leur
s y s t è m e d e s S a p r o b i e s . L e u r possibilité d'intégration d e s c o n d i t i o n s d u m i l i e u est très variable et
e n r e l a t i o n d i r e c t e a v e c l a p é r e n n i t é d e s e s p è c e s . C e r t a i n s t a x o n s p e u v e n t e n effet s e r e p r o d u i r e
t o u t e s les h e u r e s d'autres, g é n é r a l e m e n t p l u s v o l u m i n e u x ( d o n c p l u s silicifïés) après plusieurs
s e m a i n e s o u plusieurs mois. L e s recherches récentes menées conjointement dans divers pays
a i n s i q u e p l u s i e u r s e x e r c i c e s d ' i n t e r c a l i b r a t i o n réalisés a u sein d e la C o m m u n a u t é e u r o p é e n n e
p e r m e t t e n t d ' e n v i s a g e r la m i s e e n p r a t i q u e p r o c h a i n e d e m é t h o d e s s t a n d a r d i s é e s a p p l i c a b l e s aux
grands cours d'eau.
L e p r é s e n t t r a v a i l e s t u n e i n t r o d u c t i o n à l ' é t u d e d e s D i a t o m é e s d ' e a u d o u c e . Il n ' a d ' a u t r e
p r é t e n t i o n q u e d'initier les techniciens d e s services d'études à la r e c o n n a i s s a n c e d e s principales
f o r m e s d e d i a t o m é e s s u s c e p t i b l e s d'être r e n c o n t r é e s d a n s les m i l i e u x l a c u s t r e s et p o t a m i q u e s en
p r o p o s a n t u n e c l é d e d é t e r m i n a t i o n a u g e n r e e t u n e p e r s p e c t i v e d ' u t i l i s a t i o n p o u r le d i a g n o s t i c d e
la qualité d e s e a u x courantes.
L e s v o i t u r e s laboratoire d u C O N S E I L S U P E R I E U R d e la P E C H E ont à leur disposition
d e s m é t h o d e s d'appréciation d e la qualité biologique des cours d'eau, basées sur les populations
d ' i n v e r t é b r é s b e n t h i q u e s . D ' u n u s a g e pratique et aisé elles r e n d e n t d ' i r r e m p l a ç a b l e s services
d a n s l e s c o u r s d'eau d e faible à m o y e n n e importance, elles sont en r e v a n c h e inutilisables d a n s les
c o u r s i n f é r i e u r s d e s f l e u v e s e t rivières n a v i g a b l e s , a i n s i q u e d a n s l e s c a n a u x d e n a v i g a t i o n , e t
d ' u n e f a ç o n générale, d a n s les milieux fortement artificialisés. L e s techniques faisant appel à des
g r o u p e s systématiques plus spécialisés peuvent dans certaines conditions combler ces lacunes et
les d i a t o m é e s semblent bien appropriées à ce type d'investigation car elles sont non seulement
o m n i p r é s e n t e s v o i r e d o m i n a n t e s d e s sources aux estuaires et elles sont en outre très faciles à
récolter.
L ' o b s t a c l e s y s t é m a t i q u e f r e i n e e n c o r e leur e m p l o i e n r o u t i n e e t c e t t e m o d e s t e c o n t r i b u t i o n
n e c o n s t i t u e q u ' u n e é t a p e à la d i f f u s i o n de m é t h o d e s t r o p s o u v e n t r é s e r v é e s a u x s e u l s
"diatomistes".
A f i n d e rendre l'utilisation des clefs de détermination p l u s facile, u n lexique illustré des
t e r m e s t e c h n i q u e s e s t p r é s e n t é e n d é b u t du d o c u m e n t et la d e s c r i p t i o n d e c h a q u e t a x o n
s ' a c c o m p a g n e d e s illustrations c o r r e s p o n d a n t e s p l a c é e s sur u n e m ê m e p a g e r e p r é s e n t a n t la
m a j e u r e partie d e s formes susceptibles d'être rencontrées dans les e a u x courantes.
L'identification d e s D i a t o m é e s , m ê m e limitée au g e n r e , p e u t susciter des v o c a t i o n s , et
i n c i t e r c e r t a i n s à travailler a u n i v e a u d e l'espèce, à l'aide n o t a m m e n t d e la seule flore en l a n g u e
française ( G E R M A I N 1981).
L ' a v e n i r dira si, au n i v e a u d'un service t e c h n i q u e tel q u ' u n e D é l é g a t i o n R é g i o n a l e d u
C . S . P , o u d'un S.R.A.E, les c o m p l é m e n t s d'information apportés par u n e identification à
l ' e s p è c e , j u s t i f i e n t u n tel i n v e s t i s s e m e n t . C o m m e p o u r les I n v e r t é b r é s , les m é t h o d e s s'affine-
ront, au fur à m e s u r e d u travail d e s chercheurs dans ce d o m a i n e .
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 3 0 9 : 1-69 — 3 —
CONVEXE
3ull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 309 : 1-69 — 5 —
CONCAVE
FORME ELLIPTIQUE
FORME LINEAIRE
POLE ARRONDI
II - LES D I A T O M E E S , C A R A C T E R E S GENERAUX
Morphologie générale
Les Diatomées encore appelées
D i a t o m o p h y c é e s ou B a c i l l a r i o p h y c é e s par les
Botanistes sont des algues b r u n e s dont les
proliférations sont aisément
r e c o n n a i s s a b l e s à la c o l o r a t i o n b r u n foncé
q u e p r e n d le s u p p o r t c o l o n i s é . E l l e s s o n t
principalement unicellulaires et solitaires
mais peuvent former des colonies rubanées,
étoilées ou filamenteuses.
C h a q u e cellule est c o n s t i t u é e d'un frustule
(fig.l) siliceux et de matière organique
végétale.
L a t a i l l e d e s c e l l u l e s est c o m p r i s e e n t r e
m o i n s d' u n c e n t i è m e d e m m ( 1 0 p.) p o u r les
plus petites et peut atteindre un demi
m i l l i m è t r e d e l o n g e u r ( 5 0 0 u.) p o u r l e s p l u s
grandes.
Le frustule est c o m p o s é de deux valves
s'emboitant l'une dans l'autre, à la façon
d ' u n e b o i t e d e f r o m a g e , le c o u v e r c l e p o r t a n t
le nom d'épi v a l v e et le fond celui
d'hypovalve. C h a q u e v a l v e est prolongée
d'une ou plusieurs ceintures connectives
(fig. 2 ) .
L e s D i a t o m é e s s o n t s c i n d é e s en d e u x o r d r e s
principaux :
- les C e n t r i q u e s ou Centrophycidées
généralement planctoniques présentant un
seul a x e d e s y m é t r i e .
- Les P e n n a l e s ou Pennatophycidées
présentant une symétrie par rapport à un
plan. Chez ces dernières les formes possédant
un raphé prédominent. Ce raphé est
constitué par u n e fente allant d'un pôle à
l ' a u t r e s u i v a n t l ' a x e a p i c a l et i n t e r r o m p u e au
c e n t r e d e la v a l v e .
Reproduction.
E l l e a l i e u le p l u s s o u v e n t par
multiplication végétative chaque cellule
donnant naissance à deux cellules filles
par écartement des deux valves et
r é g é n é r a t i o n d e la v a l v e m a n q u a n t e par
dépôt de silice hydratée. Ce type de
division entraine une diminution
r é g u l i è r e d e la t a i l l e d e s i n d i v i d u s .
La reproduction sexuée intervient
l o r s q u e la t a i l l e m i n i m a l e d e s v a l v e s e s t
atteinte et permet de restituer des
individus de taille normale. Les modalités
de cette reproduction sexuée varient chez
l e s C e n t r i q u e s et l e s P e n n a l e s .
L'auxosporulation ou production
d ' a u x o s p o r e ( o e u f ) e s t la f o r m e la p l u s
fréquemment observée.
Bull. Fr. Pêche Plscic. (1988) 309 : 1-69 - 10 —
III. M A T E R I E L E T M E T H O D E S
- Le microscope.
C ' e s t le m i n i m u m i n d i s p e n s a b l e p o u r é t u d i e r d e si p e t i t s é l é m e n t s , c'est
a u s s i l e m a t é r i e l l e p l u s c h e r . P o u r r é a l i s e r l e s c o m p t a g e s , il e s t n é c e s s a i r e d ' u t i l i s e r
u n m o d è l e b i n o c u l a i r e , é q u i p é d e d e u x o c u l a i r e s d e X 1 0 , et d ' u n r e v o l v e r c o m p o r t a n t
u n o b j e c t i f d e X 1 0 0 à i m m e r s i o n . i l est s o u h a i t a b l e d e s e p r o c u r e r é g a l e m e n t u n
o c u l a i r e d e m e s u r e e t u n m i c r o m è t r e objectif.
A titre o p t i o n n e l , un tube à d e s s i n , u n é q u i p e m e n t à contraste de phase,
p o l a r i s a t i o n et o b j e c t i f s a d a p t é s s o n t les b i e n v e n u s . Il faut s a v o i r q u e l e s m e i l l e u r e s
résolutions en m i c r o s c o p i e p h o t o n i q u e p e u v e n t être o b t e n u e s p a r la combinaison
d ' u n é c l a i r a g e o b l i q u e ( o u à l ' a i d e d'un f o n d n o i r e n p l a ç a n t d e l ' h u i l e à i m m e r s i o n
s u r l e c o n d e n s e u r ) d ' u n o b j e c t i f a p o c h r o m a t i q u e à i r i s d ' o u v e r t u r e au m o i n s é g a l e à
1,40 e t é v e n t u e l l e m e n t d e l a p o l a r i s a t i o n .
- Petit matériel
- de récolte :
U n c o u t e a u ou u n s c a l p e l p o u r l e s
récoltes par grattage de substrat.
U n filet à p l a n c t o n d ' u n e maille
i n f é r i e u r e à 3 0 u.m p o u r l e s e x p r e s -
sions de végétaux.
Piluliers de 7 à 10 m l avec
c a p s u l e s p o l y é t h y l è n e et étiquettes
La construction d'un échantil-
lonneur est facultative (fig.4)
m a i s elle permet la prospection des
p a l p l a n c h e s et celle des végétaux
immergés.
- de préparation et montage:
Une hotte aspirante ou filtrante
D e s t u b e s à e s s a i de 2 2 m m de d i a m è t r e en p y r e x p o u r la c u i s s o n .
D e s l a m e s p o r t e - o b j e t d e 7 6 x 2 6 m m en v e r r e m i n c e (0,8 m m m a x i ) .
D e s l a m e l l e s r o n d e s c o u v r e - o b j e t d e 18 m m d e d i a m è t r e , e n v e r r e e x t r a m i n c e .
U n r é c h a u d d e p r é f é r e n c e é l e c t r i q u e m u n i d ' u n t h e r m o s t a t ( é v i t e r le g a z car l e s
r i s q u e s d ' i n f l a m m a t i o n avec l'alcool et l e s s o l v a n t s ( x y l è n e ) ou a v e c le m i l i e u de
montage sont importants.
L a c o m b i n a i s o n i d é a l e est u n four à s a b l e p o u r la c u i s s o n et d e s p l a q u e s
c h a u f f a n t e s p o u r le s é c h a g e .
Produits chimiques
1 - E a u o x y g é n é e à 110 ou 130 v o l u m e s
2 - S o l v a n t s - X y l è n e ou T o l u è n e etc..
( l ' e m p l o i d ' u n s o l v a n t r é c e n t n o n i n f l a m m a b l e et m o i n s t o x i q u e que le toluène le
L M R S O L est vivement conseillé)
3 - A c i d e n i t r i q u e o u a c i d e s u l f u r i q u e c o n c e n t r é et HC1
4 - R é s i n e à i n d i c e d e réfraction é l e v é ( N a p h r a x )
5 - Huile à immersion
6 - Vernis à ongle ou peinture émail (Ripolin, Valénite e t c . . )
TECHNIQUES D'ETUDE
Echantillonnage
L e s D i a t o m é e s peuvent être récoltées aussi b i e n en pleine eau que sur n'importe
q u e l s u p p o r t d a n s la z o n e d e s u r f a c e o u d a n s d e s z o n e s m i s e s e n e a u même
t e m p o r a i r e m e n t . D a n s le c a d r e d ' u n i n d i c e d i a t o m i q u e , c e sont l e s D i a t o m é e s fixées q u i
seront prélevées prioritairement sur des substrats durs et verticaux.
L ' é c h a n t i l l o n n a g e du sédiment est à proscrire car les formes épipéliques (vivant sur
la v a s e ) qu'il h é b e r g e sont souvent s a p r o p h i l e s et cette c a r a c t é r i s t i q u e est prise en
c o m p t e l o r s d e s e s t i m a t i o n s i n d i c i e l l e s d e la q u a l i t é d e s e a u x .
Pour obtenir une diversité microfloristique maximum, il e s t s o u h a i t a b l e de
prospecter 3 supports différents dans des classes de vitesses différentes (Tableau A :
C l a s s e s d e v i t e s s e s r e t e n u e s p o u r l ' u t i l i s a t i o n d e 1T.B.G i n v e r t é b r é s ) * , et t o u j o u r s d a n s
l e s 2 0 à 3 0 p r e m i e r s c e n t i m è t r e s d e la l a m e d ' e a u .
P o u r c o m p a r e r l e s r é s u l t a t s d ' u n e s t a t i o n s u r l ' a u t r e , il s e r a s o u h a i t a b l e de
p r o s p e c t e r les m ê m e s supports dans les m ê m e s classes de vitesses de courant e n amont
et en aval d'une perturbation à localiser.
L'utilisation de s u p p o r t s a r t i f i c i e l s p e u t ê t r e e n v i s a g é e d a n s les z o n e s s a n s s u p p o r t
n a t u r e l , ou d a n s d e s z o n e s s o u m i s e s à d e s m a r n a g e s i m p o r t a n t s et c h a q u e fois q u ' u n e
surveillance rigoureuse est possible.
La fabrication de ces
s u p p o r t s est d e la p l u s grande
simplicité. Un morceau de film
plastique forme le support
proprement dit, un morceau de
p o l y s t y r è n e lui est a s s o c i é p o u r le
m a i n t e n i r d a n s la z o n e d e s u r f a c e
qui laisse passer le maximum
d'ensoleillement appelée aussi
" z o n e p h o t i q u e " . C e t e n s e m b l e est
l e s t é d ' u n e p i e r r e et m a i n t e n u à la
berge par une petite ficelle de
n y l o n (fig. 5 ) .
* IBG Norme AFNOR-NFT 90-350 Octobre 1985.
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 309 : 1-69 - 12 —
T o u s c e s m i l i e u x sont r é a l i s é s en c h a u f f a n t d o u c e m e n t et s o u s h o t t e , l a p u r e t é d e s
produits utilisés est déterminante pour l'obtention d ' u n indice de réfraction
élevé. L e s travaux se rapportant a u x techniques de préparation sont p e u
nombreux: HANNA, G.D. (1949), M E L L E R , A.(1985).
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 3 0 9 : 1-69 - 14 —
Comptage
Il s ' e f f e c t u e en f a i s a n t p a r c o u r i r à l ' o b j e c t i f le t r a c é d e la F i g . 8. L e s
cellules sont a l o r s i d e n t i f i é e s et d é n o m b r é e s . E x e m p l e F i g . 9.
E n p r a t i q u e , l e c o m p t a g e de 4 0 0 i n d i v i d u s ( v a l v e s ) suffit p o u r o b t e n i r un
i n v e n t a i r e représentatif de l'échantillon ( S C H O E M A N 1979), C O S T E ( 1 9 7 8 ) , D E S C Y
(1979).
Si t o u t e la p r é p a r a t i o n n ' a p a s été b a l a y é e il est s o u h a i t a b l e de v é r i f i e r au faible
g r o s s i s s e m e n t q u e l e s e s p è c e s l e s p l u s v o l u m i n e u s e s o n t été p r i s e s e n c o m p t e c a r
leur signification écologique est souvent importante.
C e r t a i n s a u t e u r s ( S C H O E M A N 1 9 7 3 ) c o n s i d è r e n t q u e la d i s t i n c t i o n e n t r e
v a l v e e t frustule (2 v a l v e s ) d o i t être faite l o r s d u c o m p t a g e . A l ' u s a g e il a p p a r a i t
q u e les formes v o l u m i n e u s e s se séparent p l u s facilement q u e les petites ce qui
tend à pondérer l'abondance des petites formes mais lorsque l'attaque est
suffisamment violente la présence de frustules entiers est rare et cette
contrainte disparait.
l o r s q u e l ' é c h a n t i l l o n n a g e est r é a l i s é en f a c i è s l e n t i q u e ou d a n s d e s
z o n e s d'accumulation ou de dépôt (sédiment) une observation directe sur matériel
n o n p r é p a r é e s t c o n s e i l l é e afin de p r e n d r e en c o m p t e la p r é s e n c e é v e n t u e l l e d e
valves vides.
L.
S
I
SS Si
•
s
L_
Z s v
i i iA
IDG= 1=1
n
I i=l
V.A,
Cette note peut être aisément t r a n s f o r m é e en note sur 20 en utilisant les formules
suivantes:
- passage d'une Note N variant de 1 à S à une note Q variant de 1 à 10:
Q = N x 2,25 - 1.25
- passage d'une note N variant de 1 à 5 à une note Q variant de 1 à 20:
Q = N x 4,75 - 3.75
Il s e r a i t h a s a r d e u x d e p r é t e n d r e o b t e n i r d e s r é s u l t a t s d ' u n e g r a n d e p r é c i s i o n à
t'aide de cette m é t h o d e n é a n m o i n s u n e t e l l e a p p r o c h e p e u t ê t r e e n v i s a g é e d a n s le
c a d r e d ' é t u d e s r a p i d e s où t o u t e a u t r e p o s s i b i l i t é d ' i n v e s t i g a t i o n p a r a i t i m p o s s i b l e à
r é a l i s e r e n p a r t i c u l i e r p o u r d e s r a i s o n s l i é e s à l ' é c h a n t i l l o n n a g e . U n e x e m p l e d e calcul
d é t a i l l é e s t f o u r n i en a n n e x e .
Il ne fait aucun doute qu'une pratique routinière permettrait d'acquérir
rapidement des informations p r é c i e u s e s sur les l i m i t e s d e c e t y p e d ' a p p r o c h e les
possibilités de vérifications p a r u t i l i s a t i o n d e s e s p è c e s ou d ' a u t r e s i n d i c e s restant
o u v e r t e s aux p l u s m o t i v é s et s u r t o u t a u x p l u s d i s p o n i b l e s .
Bull. Fr. Pêche Plscic. (1988) 309 : 1-69 - 16 —
^^****"-»^ Vites^es^e^^
>i>
v < 5 5< v<25 25< v < 7 5 75 < v < 1 5 0 v>150
Supports
2 3 4 5
Béton A
Dalles - b l o c s B
Granulats C
Briques-tuiles D
Ardoises E
Verre F
Métal (Palplanches) G
M a r n e - argile H
Sédiments fins I
Plastique J
Bouée d e navigation K
Polystyrène L
Bois M
Tissus • C o r d e N
Caoutchouc O
Peinture (support peint) P
L e n t i l l e s d'eau
Q
Autres phanérogames R
Bryophytes S
Algues T
Autre support U
CENTRIQUES
Stephanodiscus 2 X 1 X 7 SI H = 7
ARAPHIDEES
Asterionella 4 X 1 X 3 = 12 — 3
Diatoma 4 X 1 X 117 = 468 117
Fragilaria 4 X 1 X 7 = 28 7
Meridion 5 X 2 X 2 20 = 4
Synedra 3 X 1 X 25 = 75 - 25
MONORAPH1DEES
Achnanthes 5 X 1 X 29 s 145 = 29
Cocconeis 4 X 1 X 3 = 12 3
BIRAPHIDEES
Amphora 3 X 2 X 6 SI 36 = 12
Cymbella 5 X 1 X 17 = 85 3= 17
Gomphonema 3 X 2 X 4 s 24 = 8
Gomphoneis 4 X 2 X 40 — 320 80
Naricula (Orthostichae) 2 X 2 X 2 - 8 = 4
Naricula (Punctatae mutica) 1 X 2 X 1 2 2
Naricula (autres) 3 X 1 X 129 = 387 = 129
Nitzschia (Dissipatae) 4 X 2 X 13 = 104 — 26
Nitzschia (autres) 1 X 1 X 20 = 20 20
Surirella 3 X 3 X 8 = 72 = 24
COSCINODISCALES
filamenteuse
g.Mehsira i a
Ornementation radiale
g. Cychtelta 2a
g. C y closxtphonos 3a
Cellules isolées
g. Siephanodtscus 3b
rarement coloniales
g. Coscinodiscus 3c
g. Thalassiosira 3d
RHE OSOLENIALES
1 soie fine a u x pôles g . Rhizosotenia 1
Cylindriques
Ornementation
sans raphé B IDDLfLPHI A L E S
concentrique
ni p s e u d o r a p h é g . Attheya 5a
g . Chaetoceros 5 b
C E N T R O P H Y C I D E E S
g . Terpànoe 6b
I Verrues saillantes g . Biddulphia 6c
g . liydrosera 6a
• Absent ARAPH1DEES
BRACHYRAPHIDEES
réduit à une virgule aux pôles g. Eunotia
' E N N A T O P H Y C I D E E S
présent sur les d e u x valves I
BIRAPH IDEES
oui | g . Tetracyclic 8a
Cellules avec
Oui côtes saillantes
cloisons internes
non g . Tabellaria 8b
Non
Non
I longs et étroits g . Centromtla 12a
Na
Colonie en étoile
Oui • g . Asteriontlla 13a
de 4 à 8 branches
•
Non
g . Ceratoneis 17a
icourbci
g. Synedra 17b.
m
Non | : Aire longitudinale l
I Colonie rubanéel g.Fragilaria 18a
I droite
I longue i g.Synedra 18b
Cellule isolée
g. Rhoicosphenia 21b
g. Perontopsis 21a
Cellule
héléropolaire
g. Achnanthes 22b
g. Cocconca 22a
I droit | NAVICULACEES
CYMBELLOIDF.S
Isopolairc i l Raphé |
g. Cymbella 43a
• courbe
g. Amphora 43b
Absent • I Forme |
GOMPHONEM ATOrDES
héléropolaire + écusson de fixation I g.Gomphonema 44b
SUR1REI.LACEES
g. Surirelia 55b
g. Cymaiopteura 54a
EPITH EM I AC EES
g. Epithemia 48a
g. Xhopalodia 48b
• NITZSCHIACEES
Non |
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 309 : 1-69 — 21 -
I Oui • g. Masiogloia 26
Chambres marginales
Non
Non
g. Amphiprora 29
Vue connective en 8 I Oui I
g. Plagiotropis
Raphé en S Non
1 Oui| g. Gyrosigma
g. Pleurosigma 31
Non
I Non 1 g. Scoliopleura 32
Raphé encadré
Forme
par 2 côtes
g. Amphipleura
en fuseau g. Frustuiia 35
g. Brebissonia 36
Non
•
Raphé terminé au centre par 2 crochets inversés 1 I Oui l g. Neidium 37
Non
g. Pùwudaria 39
Stries formées de côtes lisses I l Oui|
• g. Pinnuavis 40
Non
Stries finement ponctuées croisées en bordure par 1 ou 2 lignes 1 |Oui • g. Colonels 39b
•
Non
•
g. Stauroneis 41
Interruption des stries de l'aire centrale jusqu'en bordure | • • g. Schizostauron 41b
•
Non
Interruption des stries formant des lignes sinueuses irrégulières au centre 1 I oui 1 g. Anomoeoneis A\c
I • g. Navicuîa 4]d
Non
•
Non
I Raphes sur un m ê m e côté des deux valves I g. Hanizschia 52b
SYSTEMATIQUE
L'ordre
s y s t é m a t i q u e s u i v i e s t c e l u i d e G E R M A I N ( 1 9 8 1 ) m a i s il
e x i s t e d i v e r s e s c l a s s i f i c a t i o n s dont les p l u s r é c e n t e s sont
celles de P A T R I C K & R E I M E R (1975), S I M O N S E N (1979) ,
S I M S ( 1 9 8 1 ) e t R O S S ( 1 9 8 4 ) les t r o i s d e r n i è r e s s'inspirant
d e s résultats d ' o b s e r v a t i o n s en m i c r o s c o p i e électronique.
Le trait placé à côté de chaque figure représente 10
microns.
B. V a l v e s s e m b l a b l e s et u n i e s entre e l l e s .
P r é s e n c e d ' u n r a p h é ou* d ' u n pseudoraphé.
L a f o r m e d e la c e l l u l e s e s t s o u v e n t celle d'un petit n a v i r e
ou d'un bâton. L'ornementation formée de stries souvent
perpendiculaires à l'aire longitudinale, rappelle les barbes
d ' u n e p l u m e , d ' o ù l ' a n c i e n n o m de D I A T O M E E S P E N N E E S .
Sous-classe des P E N N A T O P H Y C I D E E S ou PENNALES
C E N T R O P H Y CIDEES
I. C e l l u l e en f o r m e d e t a m b o u r , plus o u m o i n s a p l a t i e .
L e s c e l l u l e s p e u v e n t être solitaires ou former un cordon
lorsqu'elles sont en colonie.
L'ornementation de la surface valvaire est toujours
radiale.
Ordre des COSCINODIS CALES 1
II. C e l l u l e l o n g u e , c o m p o r t a n t de n o m b r e u s e s c e i n t u r e s ; la
c o u p e transversale peut être circulaire ou ovale.
L a plupart sont i n d i v i d u e l l e s , rarement liées ; les pôles
sont souvent prolongés par une soie très fine.(Visible
uniquement par grillage).
Ordre des RHIZOSOLENIALES
1 seul genre G. Rhizosolenia
Rhizosolenia
iull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 3 0 9 : 1-69 — 23 —
— PsïudoJulcu»
i— CeinTur*
D»r»,l d u * . i c U >
Melosira
VM vilv«ir«
R e m a r q u e - SIMONSEN (1979) distingue 2 genres: Melosira qui possède des valves à paroi lisse
(M.varions , M.nummuloides ) et Aulacosira à parois perforées ( ex. A.granulata ) . Le critère de
distinction fondé sur des observations en microscopie électronique n'est pas retenu ici).
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 3 0 9 : 1 - 6 9 - 24 —
1 b Cellule i s o l é e ou a b s e n c e de
s u l c u s dans les formes c o l o n i a l e s
en v u e c o n n e c t i v e . V u e v a l v a i r e
striée radialement 2
2 a Ornementation nettement
d i f f é r e n t e entre la bordure et le
champ central.
g. Cyclotella
Stephanodiscus Cyolotella
2b La bordure de la v a l v e et le champ central ne
sont pas n e t t e m e n t d i f f é r e n c i é s 3
3c Stries r a d i a l e s f o r m é e s d e g r o s s e s aréoles
irrégulièrement alignées.
Forte o n d u l a t i o n de la surface v a l v a i r e et
anneau marginal de p r o c e s s u s labiés.
g. Coscinodiscus
(une e s p è c e d'eau d o u c e C lacustris
transférée r é c e m m e n t dans le genre
Thalassiosira )
Coscinodiscus
3d O r n e m e n t a t i o n plutôt f l o u e de la
p a r t i e c e n t r a l e en v u e valvaire,
mais présence d'un processus
l a b i é u n i q u e sur le bord de la
valve.
g. Thalassiosira Thalassiosira
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 309 : 1-69 — 25 —
Atteya
Chaetoceros
Hydrosera
g. Hydrosera
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 3 0 9 : 1-69 - 26 —
Terpsinoe
Ocelles
Biddulphia
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 309 : 1-69 — 27 —
PENNATOPHYCIDEES
lia Raphé rudimentaire, formant une virgule sur les pôles de la valve, visible
surtout en vue connective.
Ordre des EUNOTIALES ou BRACHYRAPHIDEES 19
lib Cellule avec développement du raphé sur une seule valve, seul un pseudoraphé
est présent sur l'autre valve.
Ordre de ACHNANTHALES ou MONORAPHIDEES 20
7 DIATOMALES OU ARAPHIDEES
Tetracyclus
Tabellaria
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 3 0 9 : 1-69 - 28 —
Diatoma
Meridion
Bull. Fr. Pêche Pisclc. (1988) 309 : 1-69 — 29 —
Centvonella
12b B r a s c o u r t s et é p a i s
g. Fragilaria
Fragilaria
Opephora
Ceratoneis
Synedra ijj
Fraailavia
Bull. Fr. Pêche Pisclc. (1988) 3 0 9 : 1-69 — 31 —
Sunedra
Eunotia
EUNOTIALES OU BRACHYRAPHIDEES
1 9 a Cellule isopolaire g . E u n o t i a
(milieux acides)
1 9 b Cellule hétéropolaire ^ A c ( i n e l l a
a
Aatinel^
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 309 : 1-69 — 33 —
MONORAPHIDEES
21a D e u x r a p h é s c o u r t s , r e p r é s e n t a n t c h a c u n un t i e r s d e
la v a l v e .
P s e u d o r a p h é é t r o i t et p e u v i s i b l e s u r l ' a u t r e v a l v e , e x -
t r é m i t é la p l u s l a r g e n e t t e m e n t c a p i t é e .
( F o r m e i n t e r m é d i a i r e e n t r e l e s B r a c h y r a p h i d é e s et
les Monoraphidées).
g. Peroniopsis
(milieu acide).
Peroniopsis
21b V u e c o n n e c t i v e c o u d é e , se d i s t i n g u e d e Gomphonema en
v u e v a l v a i r e p a r la p r é s e n c e d e c l o i s o n s p o l a i r e s , et c e l l e
d' u n r a p h é r é d u i t s u r l ' u n e d e s v a l v e s .
g. Rhoicosphenia
R e m a r q u e : Ce genre est classé parmi les Naviculacées
(Biraphidées) dans les révisions récentes (SIMONSEN 1979,
KRAMMER & LANGE-BERTALOT 1986). Il est maintenu ici dans
les Monoraphidées dans un souci de conformité avec les flores
Rhoicosphenia
françaises existantes (GERMAIN 1981, BOURRELLY 1981).
Cocconeis
Bull. Fr. Pêche Plscic. (1988) 3 0 9 : 1-69 — 34 -
Cocconeis Achnanthes
kchnanth.es
Bull. Fr. Pêche Plscic. (1988) 309 : 1-69 - 35 -
Cymbelloidées
Gomvhonematoidées
25b Cellule isopolaire, sans é c u s s o n de fixation
S o u s - f a m i l l e des N a v i c u l o i d é e s -26
Mastoaloia
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 309 : 1-69 - 36 —
Amphiprora
D
lagiotropsis
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 309 : 1-69 — 37 —
Frustulia
36b V a l v e o m é e de fortes c ô t e s , plus ou moins
perpendiculaires au raphé. Forme d'eau
saumâtre rare.
g. Brebissonia
Brebissonia
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 3 0 9 : 1-69 — 39 —
38b Stries transversales non c r o i s é e s sur chaque bord par une ou plusieurs lignes
(apparemment absentes) • 40
ba L e s aires l o n g i t u d i n a l e et centrale
forment un large e s p a c e sans
o r n e m e n t a t i o n . L e s stries sont courtes
et p e r p e n d i c u l a i r e s à l'axe l o n g i t u d i n a l .
Brevistriatae
b c C e l l u l e é g a l e m e n t de grande taille
300 à 350 u m .
Le raphé est très s i n u e u x .
Brevistriatae
Complexae
Majores
Complexae
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 3 0 9 : 1-69 — 41 —
Caloneis
Distantes
Parallelistriatae
Capitatae
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 3 0 9 : 1-69 - 43 -
Divergentes
Pinnuavis
Pleurostauron
4 1 b Stauros en forme de X
g.Schizostauron
Sohizostauron
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 3 0 9 : 1-69 — 45 —
Lyratae
Anomoeoneis
ka C e l l u l e s à e x t r é m i t é s nettement c a p i t é e s . Triple
s y s t è m e de stries, dont deux sont o b l i q u e s et
croisées de façon caractéristique, et une
transversale moins distincte.
Decussatae
Une espèce : N.placenta Decussatae
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 3 0 9 : 1-69 — 46 —
le Stries ponctuées- -m
V a l v e linéaire o u elliptique
; le raphé est porté par une
côte saillante ; l'extrémité
de cette côte s'alargit
parfois aux pôles pour
former un n o d u l e polaire
triangulaire.
Bacillares
Bacillares
mutica
Punctatae
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 309 : 1-69 — 48 —
Microstigmaticae
Minusculae
Gomphocymbella
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 309 : 1-69 — 49 —
43a Surface valvaire à peu près plane, en forme de croissant plus ou moins
prononcée.
Certaines formes peuvent être confondues avec le genre Navicula.
g. Cymbeila
Cymbeila
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 309 : 1-69 - 50 -
Extrémité de la valve
arrondie, pôles non
capités, raphé au bord
ventral de la v a l v e , forme
plutôt marine.
Une e s p è c e d'eau d o u c e .
Oxyamphora
Halamphova Une espèce : A.lineolata
ïïxyamphora
Didymosphenia
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 3 0 9 : 1-69 — 51 —
44b Présence d'un stigma (point) dans l'aire centrale de la valve. Stries
généralement fines.
g. Gomphonema
Gomphonema
Dentiaula
47 a V a l v e f u s i f o r m e , axe
longitudinal droit,
raphé dans la surface
valvaire.
g. Denticula
4 7b V a l v e en forme de
parenthèse 48
48 a Frustule courbe en
vue valvaire mais
droit en v u e c o n n e c -
tive.
En vue valvaire, le
canal raphéen est en
bordure vers les pôles,
'pithemia m a i s en forme de V
p l u s ou m o i n s ouvert
au c e n t r e .
Présence de deux
cloisons perforées
parallèles à la valve.
g. Epithemia
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 309 : 1-69 — 53—
49a Cellule en forme de fuseau ; les deux raphés sont tordus en hélices et croisés.
F o r m e marine ou saumâtre.
g. Cylindrotheca
as
colonie
tn vu* connocNvi
Cyl-indrotheaa
Baailtavia
Rhopalodia
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 3 0 9 : 1-69 - 54 —
52b C e l l u l e c o u r b e avec p ô l e s
c a p i t é s ; les raphés sont
s u p e r p o s é s sur la b o r d u r e
c o n c a v e de la valve.
g. Hantzschia
52c C o u p e t r a n s v e r s a l e d e la
valve losangique. Raphé
v i s i b l e s u r les deux b o r d s
de la v a l v e , à d e s niveaux
différents.
g.Nitzschia
12 sections....r
Hantzschia Nitzschia
Cellule en forme de
fuseau, avec extrémités
très allongées, Striation
rarement visible en
microscopie optique.
Nitzsehiellae
Nitzsehiellae
Hantzsahia
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 309 : 1-69
- 55 -
Obtusae
tb La carène ponctuée suit le bord de la valve sans dépression
au centre.
Sigmoïdeae
Ob tusae
Sigmoidae
Bull. Fr. Pêche P/sclc (1988) 309 : 1-69 — 56 —
Costatae
O.'r-oil
xb La c a r è n e p o n c t u é e est m o i n s
e x c e n t r é e , elle n'atteint p a s le
b o r d d e la v a l v e (caractère
peu visible). §
Triblionellae
Dubiae
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 3 0 9 : 1-69 — 58 —
Lanaeolatae
Bilobatae
Dissipatae
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 3 0 9 : 1-69 — 59 -
Lineare s
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 309 : 1-69 - 60 —
53a C e l l u l e r o n d e , a r q u é e e n f o r m e de s e l l e . L e s a x e s a p i c a u x d e s d e u x v a l v e s se
croisent à angle droit, donnant l'impression de p a r t a g e r la c e l l u l e en quatre
parties égales.
g. Campylodiscus
Campy lodiseus
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 3 0 9 : 1-69 — 61 -
Cymatopleura
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 309 : 1-69 - 62 -
Stenopterobia
Surirella
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 3 0 9 : 1-69 - 64 -
Suvirella
Fr. Pêche Piscic. (1988) 3 0 9 : 1-69 — 65 —
REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES
ANONYMOUS. ( 1 9 7 5 ) - P r o p o s a i s for a s t a n d a r d i z a t i o n o f d i a t o m t c r m i n o l o g y a n d
d i a g n o s e s . Nova Hedwigia, Bcih. 5 3 : 3 2 3 - 3 5 4 .
ARCHIBALD, R.E.M. (1972) - A preliminary key to the fresh and brackish w a t c r
species of the genus Nitzschia in S o u t h Africa. News
Lett.Limnol.Soc.South A/r.l8:33-46; 19:37-55.
A R R I G N O N , J. ( 1 9 7 6 ) - Aménagement écologique et piscicole des eaux douces.
Gauthiers Villars Ed. Paris. 320 p.
B A R B E R , H . G . & E . Y . H A W O R T H . ( 1 9 8 1 ) - A Guide to the morphology of the Diatom
frustule with a key to the British Freskwater Gênera. F . B . A . Sci. P u b l .
4 4 : 112 p .
B O U R R E L L Y P . ( 1 9 6 8 ) - Les Algues d'eau douce Les Algues jaunes et brunes. 2:Boubéc
Ed.438p.
C E M A G R E F . (1984) - Opération Seine Rivière propre.Evaluation de la qualité
hydrobiologique : Poissons-Diatomées. Rapport Agence Seine
N o r m a n d i e C o n s e i l . R é g i o n a l Ile d e F r a n c e . 3 5 p . + a n n e x e s .
C E M A G R E F . ( 1 9 8 2 ) - Etude des méthodes biologiques d'appréciation quantitative de la
qualité des eaux. Rapport Q.E.Lyon-A.F.Bassin Rhône-Méditeranée-
Corse :218 p.
C H O L N O K Y , B.J. ( 1 9 6 8 ) - Die Okologie des Diatomeen In Binnengewassern. Cramer
Ed.:699 p.
C O M P E R E , P. ( 1 9 8 2 ) - T a x o n o m i c Revision of the D i a t o m G e n u s Pleurosira
(Eupodiscaceae). Bacillaria 5:165-190.
COSTE, M. (1976) - Contribution à l'écologie des diatomées benthiques et
p é r i p h y t i q u e s d e l a S e i n e : D i s t r i b u t i o n l o n g i t u d i n a l e et i n f l u e n c e d e s
p o l l u t i o n s . Soc.Hydrotech.Fr. X I V ( 9 ) : 1-7
C O S T E , M . ( 1 9 7 8 ) - Sur l'utilisation des diatomées benthiques pour l'appréciation de
la qualité biologique des eaux courantes. T h è s e U n i v . B e s a n ç o n : 150 p.
C O S T E , M . & J . L . V E R R E L . ( 1 9 7 8 ) - I n c i d e n c e s d u r é c h a u f f e m e n t d e s e a u x d e S e i n e sur
la composition de la microflore diatomique benthique.
Cah.Hydrobiol. Montereau. 6:27-44.
C O S T E , M. & M . R I C A R D . (1980) - Observation en microscopie photonique de quelques
Nitzschia n o u v e l l e s o u i n t é r e s s a n t e s d o n t la s t r i a t i o n e s t à la l i m i t e
d u p o u v o i r d e r é s o l u t i o n . Cryptogamie Algologie 1(3): 187-212.
D E S C Y , J.P. (1979). A new appraoch to water quality estimation using diatoms. Nova
Hedwigia. 64:305-323.
D E S C Y , J.P. (1980) - Utilisation des algues benthiques c o m m e indicateurs biologiques
d e la q u a l i t é d e s e a u x c o u r a n t e s . / n PESSON:La pollution des eaux
continentales. Gauthiers-Villars Ed.Paris.: 169-194.
F A B R I , R. & L . L E C L E R C Q ( 1 9 8 1 ) - L ' é t u d e d e s D i a t o m é e s . G é n é r a l i t é s et clef p r a t i q u e
p o u r la d é t e r m i n a t i o n des p r i n c i p a u x g e n r e s o b s e r v é s en eau d o u c e .
Probio. Revue. 4(l):23-42.
F A B R I , R. & L . L E C L E R C Q ( 1 9 8 4 ) - Etude écologique des rivières du nord du massif
Ardennais (Belgique).Flore et végétation de Diatomées et physico-
chimie des eaux. Robertville. Stat.Sci. Hautes Fagnes 1:379 p . , 2 : 3 2 9
p.,3:200 p.
G A S S E , F . ( 1 9 7 0 ) - U l t r a s t r u c t u r e et o r g a n i s a t i o n c o l o n i a l e d e l a d i a t o m é e Fragilaria
construens (Ehr.) G r u n . révélée p a r le m i c r o s c o p e é l e c t r o n i q u e à
b a l a y a g e . C.R.Acad.Sci.Ser.D., 271:1975-1977.
GERMAIN H., (1981 ) - Flore des Diatomées eaux douces et saumâtres Boubée. Ed. Paris. 444 p .
H U S T E D T , F . ( 1 9 2 7 - 1 9 6 6 ) . D i e K i e s e l a l g e n . In: Kryptogamen-Flora von Deutschland,
Ôsterreich und des Schweiz. VII (L.Rabenhorst ed.).Akademische
Verlagsgesellschaft, Leipzig, 1-320.
H U S T E D T , F . ( 1 9 3 0 ) - B a c i l l a r i o p h y t a . In Die Siisswasserflora Mitteleuropas. 10. 468
P-
KRAMMER, K. & H . L A N G E - B E R T A L O T . ( 1 9 8 6 ) - B a c i l l a r i o p h y c e a e l . T e i l : N a v i c u l a c e a e .
In A.PASCHER Sufiwasserflora von Mitteleuropa Band 2 / 1 . G . F I S C H E R
Verlag. 8 7 6 pp.+206 pl.
Bull. Fr. Pêche Piscic. (1988) 3 0 9 : 1-69 — 66 —
VERNEAUX, J. ( 1 9 8 4 ) - M é t h o d e s b i o l o g i q u e s et p r o b l è m e s d e la d é t e r m i n a t i o n d e s
q u a l i t é s des e a u x c o u r a n t e s . Bull. Ecol. 1 5 ( l ) : 4 7 - 5 5 .
WILLIAMS, D . M . & F . E . R O U N D . ( 1 9 8 6 ) - R e v i s i o n of t h e g e n u s Synedra Ehrenberg.
Diatom Research. 1(2): 313-339.
WILLIAMS, D . M . & F . E . R O U N D . ( 1 9 8 7 ) - R e v i s i o n o f t h e g e n u s Fragilaria. Diatom
Research 2(2):267-288.
WILLIAMS, D . M . ( 1 9 8 6 ) - C o m p a r a t i v e m o r p h o l o g y o f s o m e s p e c i e s o f Synedra Ehrenb. .
w i t h a n e w d é f i n i t i o n of t h e g e n u s . Diatom Research 1 ( 1 ): 131 - 1 5 2 .
WILLIAMS, D . M . ( 1 9 8 7 ) - O b s e r v a t i o n s on t h e g e n u s Tetracyclus Ralfs
(Bacillariophyta).I.Valve and girdle structure of the extant species. Br.
Phycol. J. 2 2 : 3 8 3 - 3 9 9 .