UPMC Master P&A/SDUEE
UE MNI (4P009)
Méthodes Numériques et Informatiques – B
Introduction à l’environnement Unix
[Link]@[Link]
[Link]@[Link]
2014–2015 Albert Hertzog
TABLE DES MATIÈRES MNI – Unix TABLE DES MATIÈRES
Table des matières
1 Introduction au système UNIX 16
1.1 Système d’exploitation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16
1.2 Historique d’unix . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17
1.3 Principales caractéristiques du système UNIX . . . . . . . . . . . . 18
1.4 L’interpréteur de commandes ou shell . . . . . . . . . . . . . . . . . 18
1.5 Compte utilisateur . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
1.6 Sessions unix . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
2 Le shell : introduction 22
2.1 Syntaxe de la ligne de commandes . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22
2.2 Exemples de commandes élémentaires d’affichage . . . . . . . . . . 22
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 1 2014-2015
TABLE DES MATIÈRES MNI – Unix TABLE DES MATIÈRES
2.3 Caractères spéciaux pour le shell (I) . . . . . . . . . . . . . . . . . 23
2.4 Documentation en ligne . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26
3 Hiérarchie des fichiers unix 28
3.1 Arborescence . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28
3.2 Chemins d’accès (path) d’un fichier . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30
3.3 Raccourcis pour les répertoires d’accueil . . . . . . . . . . . . . . . 35
3.4 Visualisation d’une branche avec tree . . . . . . . . . . . . . . . 35
4 Commandes de base 37
4.1 Commandes de gestion de fichiers . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37
4.1.1 Affichage de liste de noms de fichiers avec ls . . . . . . . . 37
4.1.2 Copie de fichiers avec cp . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39
4.1.3 Déplacement et renommage de fichiers avec mv . . . . . . . 40
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 2 2014-2015
TABLE DES MATIÈRES MNI – Unix TABLE DES MATIÈRES
4.1.4 Suppression de fichiers avec rm . . . . . . . . . . . . . . . 41
4.1.5 Compression de fichiers avec gzip ou bzip2 . . . . . . . 42
4.2 Commandes de gestion de répertoires . . . . . . . . . . . . . . . . 43
4.2.1 Affichage du répertoire courant avec pwd . . . . . . . . . . . 43
4.2.2 Changement de répertoire courant avec cd . . . . . . . . . . 43
4.2.3 Création de répertoire avec mkdir . . . . . . . . . . . . . . 43
4.2.4 Suppression de répertoire (vide) avec rmdir . . . . . . . . 44
5 Commandes pour fichiers textes 45
5.1 Fichiers binaires et fichiers texte, codage . . . . . . . . . . . . . . . 45
5.2 Codage des fichiers textes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45
5.2.1 Transcodage de fichiers textes avec recode ou iconv . . . 46
5.3 Accès au contenu des fichiers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 3 2014-2015
TABLE DES MATIÈRES MNI – Unix TABLE DES MATIÈRES
5.3.1 Identification des fichiers avec file . . . . . . . . . . . . . 48
5.3.2 Comptage des mots d’un fichier texte avec wc . . . . . . . . 49
5.3.3 Affichage du contenu de fichiers texte avec cat . . . . . . . 51
5.3.4 Affichage paginé du contenu d’un fichier texte avec more/less 52
5.3.5 Début et fin d’un fichier texte avec head et tail . . . . . . 53
5.3.6 Repliement des lignes d’un fichier texte avec fold . . . . . . 53
5.3.7 Affichage de texte avec echo . . . . . . . . . . . . . . . . 53
5.3.8 Affichage des différences entre deux fichiers texte avec diff . 54
5.3.9 Affichage de la partie texte d’un fichier binaire avec strings 54
5.3.10 Affichage d’un fichier binaire avec od . . . . . . . . . . . . . 54
6 Environnement réseau 55
6.1 Courrier électronique . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 4 2014-2015
TABLE DES MATIÈRES MNI – Unix TABLE DES MATIÈRES
6.2 Connexion à distance via slogin . . . . . . . . . . . . . . . . . 55
6.3 Transfert de fichiers à distance . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 57
6.4 Explorateurs et téléchargement . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58
7 Commandes avancées de gestion des fichiers 59
7.1 Découpage de fichiers avec split et csplit . . . . . . . . . . . 59
7.2 Recherche de fichiers dans une arborescence avec find . . . . . . 60
7.3 Archivage d’arborescence avec tar . . . . . . . . . . . . . . . . . 66
7.4 Copies et synchronisation de fichiers avec rsync . . . . . . . . . . 71
8 Droits d’accès aux fichiers 73
8.1 Affichage des droits d’accès avec ls -l . . . . . . . . . . . . . 73
8.2 Changement des droits d’accès avec chmod . . . . . . . . . . . . 75
8.3 Signification des droits sur les répertoires . . . . . . . . . . . . . . . 76
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 5 2014-2015
TABLE DES MATIÈRES MNI – Unix TABLE DES MATIÈRES
9 Édition de fichiers textes 77
9.1 Les éditeurs sous unix et leurs modes . . . . . . . . . . . . . . . . 77
9.1.1 Éditeurs sous unix . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77
9.1.2 Les modes des éditeurs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 78
9.2 Principes de l’éditeur vi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 79
9.3 Principales requêtes de l’éditeur vi . . . . . . . . . . . . . . . . . 81
9.4 Requêtes ex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84
9.4.1 Requêtes ex élémentaires . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84
9.4.2 Adressage des commandes ex . . . . . . . . . . . . . . . . 84
9.4.3 Autres commandes ex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85
9.4.4 Exemples de commandes ex . . . . . . . . . . . . . . . . . 86
9.5 Configuration de vi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 87
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 6 2014-2015
TABLE DES MATIÈRES MNI – Unix TABLE DES MATIÈRES
10 Redirections et tubes 89
10.1 Flux standard . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89
10.2 Redirections . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91
10.2.1 Redirection de sortie vers un fichier (> et >>) . . . . . . . . . 92
10.2.2 Redirection de l’entrée depuis un fichier (<) . . . . . . . . . . 94
10.3 Tubes ou pipes (|) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 95
10.4 Compléments . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 98
10.4.1 Redirection de la sortie d’erreurs vers un fichier (2> et 2>>) . 98
10.4.2 Redirection de l’erreur standard vers la sortie standard (2>&1) 100
10.4.3 Les fichiers spéciaux : exemple /dev/null . . . . . . . . 101
10.4.4 Duplication de flux : tee . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 103
10.4.5 Notion de document joint (<<) . . . . . . . . . . . . . . . . 104
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 7 2014-2015
TABLE DES MATIÈRES MNI – Unix TABLE DES MATIÈRES
11 Filtres élémentaires 106
11.1 Définition . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 106
11.2 Classement avec sort . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 106
11.3 Transcription avec tr . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109
11.4 Autres filtres élémentaires . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110
12 Expressions régulières ou rationnelles 111
12.1 Signification des caractères spéciaux . . . . . . . . . . . . . . . . . 111
12.2 Ancres . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 113
12.3 Ensembles de caractères . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114
13 Le filtre grep 117
14 Le filtre sed 119
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 8 2014-2015
TABLE DES MATIÈRES MNI – Unix TABLE DES MATIÈRES
15 Le filtre awk 121
15.1 Structure des données pour awk . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121
15.2 Structure d’un programme awk . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122
15.3 Exemples de programmes awk . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 124
15.4 Mise en garde sur les caractères non-imprimables . . . . . . . . . . 125
16 Gestion des processus 128
16.1 Généralités : la commande ps . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128
16.2 Caractères de contrôle et signaux . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132
16.3 Commandes kill et killall . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133
16.4 Processus en arrière plan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133
16.5 Compléments . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 134
16.5.1 Processus détaché . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 134
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 9 2014-2015
TABLE DES MATIÈRES MNI – Unix TABLE DES MATIÈRES
16.5.2 Groupement de commandes . . . . . . . . . . . . . . . . . 135
17 Code de retour 136
17.1 Code de retour . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136
17.2 Inversion du statut de retour . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 137
17.3 Combinaison de commandes && . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 138
17.4 Combinaison de commandes || . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 138
18 La commande test 139
18.1 Comparaisons arithmétiques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140
18.2 Comparaisons de chaînes de caractères . . . . . . . . . . . . . . . 141
18.3 Tests sur les fichiers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142
18.4 Combinaisons de conditions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 10 2014-2015
TABLE DES MATIÈRES MNI – Unix TABLE DES MATIÈRES
19 Variables shell 145
19.1 Affectation et référence . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 145
19.2 Saisie interactive d’une liste de variables . . . . . . . . . . . . . . . 147
19.3 Portée des variables ordinaires du shell . . . . . . . . . . . . . . . . 148
19.4 Extension de la portée d’une variable : variables d’environnement . . . 148
19.5 Variables de localisation (langue, ...) . . . . . . . . . . . . . . . . . 151
19.6 Complément : valeur par défaut d’une variable . . . . . . . . . . . . 152
20 Caractères interprétés par le shell 153
20.1 Substitution de commande . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153
20.2 Métacaractères du shell . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154
20.3 La commande expr . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 158
20.3.1 Opérateurs arithmétiques sur les entiers . . . . . . . . . . . . 158
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 11 2014-2015
TABLE DES MATIÈRES MNI – Unix TABLE DES MATIÈRES
20.4 Autres opérateurs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 160
21 Shell-scripts 162
21.1 Fichiers de commandes ou shell-scripts . . . . . . . . . . . . . . . 162
21.2 Les paramètres des scripts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 163
21.3 La commande interne shift . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 168
21.4 Distinction entre $* et $@ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170
21.5 Compléments sur la commande set . . . . . . . . . . . . . . . . . 170
22 Structures de contrôle en shell (sh) 173
22.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 173
22.2 Conditions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 174
22.2.1 Structure if ... fi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 174
22.2.2 Structures if imbriquées : elif . . . . . . . . . . . . . . . 176
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 12 2014-2015
TABLE DES MATIÈRES MNI – Unix TABLE DES MATIÈRES
22.2.3 Énumération de motifs (cas) : case ... esac . . . . . . . . . 178
22.3 Les structures itératives . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 181
22.3.1 La structure for ... do ... done . . . . . . . . . . 181
22.3.2 La structure until ... do ... done (jusqu’à ce que) 185
22.3.3 La structure while ... do ... done (tant que) . . . 187
22.4 Compléments : branchements . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 189
22.4.1 La commande exit . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 189
22.4.2 La commande break . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 189
22.4.3 La commande continue . . . . . . . . . . . . . . . . . . 192
22.4.4 La commande trap . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 193
22.4.5 Redirections et boucles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 196
23 Exemple commenté d’un script 198
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 13 2014-2015
TABLE DES MATIÈRES MNI – Unix TABLE DES MATIÈRES
23.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 198
23.2 Le cœur de script . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 198
23.3 Version minimale du script . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 200
23.4 Version élémentaire du script . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 202
23.5 Version plus robuste du script . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 205
23.6 Limitations . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 209
24 Compléments sur le shell 210
24.1 Commandes internes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 210
24.2 Exécution dans le shell courant . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 210
24.3 Autres commandes internes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 210
24.3.1 La commande eval . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 210
24.3.2 La commande exec . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 212
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 14 2014-2015
TABLE DES MATIÈRES MNI – Unix TABLE DES MATIÈRES
24.3.3 La commande getopts . . . . . . . . . . . . . . . . . . 212
24.4 Divers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 213
24.4.1 Fonctions en shell . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 213
24.4.2 Alias du shell . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 213
24.4.3 Identifier une commande type . . . . . . . . . . . . . . . . 214
24.4.4 Affichage d’une progression arithmétique seq . . . . . . . . 214
24.4.5 Récursivité . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 215
24.4.6 Fichiers d’initialisation du shell . . . . . . . . . . . . . . . . 215
25 Autres outils 217
25.1 Automatisation des tâches avec la commande make . . . . . . . . . 217
25.2 L’outil perl . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 219
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 15 2014-2015
1 INTRODUCTION AU SYSTÈME UNIX MNI – Unix
1 Introduction au système UNIX
1.1 Système d’exploitation
— ensemble de programmes d’un ordinateur servant d’interface entre le matériel
et les logiciels applicatifs
— abrégé S.E. (en anglais operating system O.S.)
— exemples : MS-DOS, Windows (XP, ..., 7, 8), famille Unix (linux, Mac-OS, ...)
Linux aujourd’hui dominant dans le calcul intensif :
plus de 97% des calculateurs du TOP 500
[Link]
N.-B. : machine virtuelle = application qui émule un système d’exploitation physique
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 16 2014-2015
1 INTRODUCTION AU SYSTÈME UNIX MNI – Unix 1.2 Historique d’unix
1.2 Historique d’unix
— depuis les années 1970,
rôle essentiel des milieux universitaires dans la diffusion d’unix
— grande diffusion assurée grâce à la portabilité du langage C
(moins de 10 % du noyau écrit en assembleur)
— plusieurs branches de développement (BSD et System V)
mais normalisation POSIX (Portable Operating System Interface)
— système ouvert : implémentations sur diverses architectures
du téléphone portable au super-calculateur
– propriétaires (aix, hp-ux, solaris, os-X, ...)
– libres (linux depuis 1991, net-bsd, free-bsd, ...) : linux est (presque) un unix !
plusieurs distributions linux : debian, ubuntu, mint,
Red-Hat, mandriva puis mageia, scientific-linux, CentOS, Fedora, ...
⇒ quelques différences dans les commandes (ex. : ps, impression lpr/lp, ...)
mais surtout au niveau administration (gestion des packages par ex.)
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 17 2014-2015
1 INTRODUCTION AU SYSTÈME UNIX MNI – Unix 1.3 Principales caractéristiques du système UNIX
1.3 Principales caractéristiques du système UNIX
— interactif (mais traitement batch possible)
— multi-tâches (concurrentes et indépendantes)
— multi-utilisateurs (dont l’administrateur ou root)
⇒ système d’identification et droits d’accès aux fichiers
— documentation en ligne (man, info, ...)
— intégration dans le réseau
– partage de ressources (fichiers, authentification, ...)
– applications réparties
— chaînage des processus par les tubes (pipes)
⇒ assemblage d’outils élémentaires pour accomplir des tâches complexes
— l’ interpréteur de commandes (shell) intègre un langage de programmation
⇒ programmes interprétés en shell = shell-scripts
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 18 2014-2015
1 INTRODUCTION AU SYSTÈME UNIX MNI – Unix 1.4 L’interpréteur de commandes ou shell
1.4 L’interpréteur de commandes ou shell
Le shell est l’interface utilisateur du système d’exploitation.
Deux familles (liées aux 2 branches d’unix) avec deux syntaxes différentes
(en particulier dans la programmation) et des fichiers de configuration différents :
versions libres fichiers d’initialisation
sh, ksh (Korn) pdksh .profile .kshrc
bash (linux) .[bash_]profile .bashrc
csh tcsh (ancien mac-os-X) .login .[t]cshrc
compatible avec zsh .zprofile .zlogin .zshrc
les deux syntaxes
sh : shell historique de Bourne
bash : Bourne Again SHell
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 19 2014-2015
1 INTRODUCTION AU SYSTÈME UNIX MNI – Unix 1.5 Compte utilisateur
1.5 Compte utilisateur
— identifiant (ou login) (unique)
— mot de passe (ou password) confidentiel
— un groupe parmi ceux définis sur la machine
— un répertoire d’accueil personnel (ou home directory ) où stocker ses fichiers
— un « interpréteur de commandes » (ou shell) :
sh, ksh, bash, csh, tcsh ou zsh.
L’ensemble de ces informations est stocké dans un fichier système
mot de passe crypté (souvent dans /etc/passwd)
⇒ l’administrateur ne peut pas retrouver un mot de passe oublié
Ressources limitées, par exemple par quota sur le disque
⇒ problème de connexion en mode graphique si quota atteint.
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 20 2014-2015
1 INTRODUCTION AU SYSTÈME UNIX MNI – Unix 1.6 Sessions unix
1.6 Sessions unix
— deux types de sessions de travail :
– mode texte (console, accès distant (slogin), ...) : ligne de commande
– mode graphique (multi-fenêtres) : icônes et menus pour lancer les applications
(dont les consoles konsole et xterm par exemple)
gestionnaires de fenêtres : fvwm, kde, gnome, icewm, lxde...
— point commun
– identification (login)
– authentification (password)
Sous linux, en cas de problème en mode graphique,
passage en mode texte par frappe simultanée de
Ctrl Alt F1 ( 6 consoles de F1 à F6).
Retour en mode graphique par Ctrl Alt F7 ou Ctrl Alt F8 (Mandriva 2010)
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 21 2014-2015
2 LE SHELL : INTRODUCTION MNI – Unix
2 Le shell : introduction
Le shell est un programme qui interprète les commandes saisies dans un terminal.
2.1 Syntaxe de la ligne de commandes
Le shell découpe la ligne de commande en mots séparés par des blancs
plus généralement par l’IFS (Input Field Seperator )
(1) premier mot = la commande action
(2) mots suivants = les paramètres les objets
(rôle déterminé par leur position dans la ligne de commande)
(3) paramètres optionnels introduits par « - » les modalités
cp -p fich1 fich2
(1) commande (3) option (2) paramètre 1 (2) paramètre 2
copie en gardant la date source cible
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 22 2014-2015
2 LE SHELL : INTRODUCTION MNI – Unix 2.2 Exemples de commandes élémentaires d’affichage
2.2 Exemples de commandes élémentaires d’affichage
commande affichage
date de la date
whoami du login
hostname du nom de la machine
who de la liste des utilisateurs connectés
echo "chaine de caracteres" de la chaîne saisie
id du numéro d’utilisateur
uname du nom du système d’exploitation
Le shell
— distingue les majuscules (rares) des minuscules
— interprète certains caractères dits spéciaux
par exemple les blancs (les éviter dans les noms de fichiers)
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 23 2014-2015
2 LE SHELL : INTRODUCTION MNI – Unix 2.3 Caractères spéciaux pour le shell (I)
2.3 Caractères spéciaux pour le shell (I)
— Caractères de contrôle du terminal (affichage par stty -a)
^C interruption du processus en cours
^Z suspension du processus en cours (reprise possible)
^? ou ^H effacement du dernier caractère (choix par stty erase ^?)
^D fermeture du flux d’entrée (fin de session en shell)
— Aides à l’interactivité
↑ et ↓ permettent de parcourir l’historique des commandes
← et → déplacements pour éditer la ligne de commande
^E ou ^A déplacement en fin (End) ou début de ligne (^B est pris Back )
TAB demande au système de compléter le nom de commande ou de fichier
⇒ évite les fautes de saisie et valide les chemins
TAB TAB affiche les différentes possibilités de complétion
— plus beaucoup d’autres (voir chapitres suivants)
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 24 2014-2015
2 LE SHELL : INTRODUCTION MNI – Unix 2.3 Caractères spéciaux pour le shell (I)
— Générateurs de noms de fichiers (motifs génériques avec caractères jokers)
* une chaîne de caractères quelconque dans le nom d’un fichier
(y compris la chaîne vide)
? un caractère quelconque et un seul dans un nom de fichier
[...] un caractère quelconque pris dans la liste exhaustive entre crochets
[c1 -c2 ] un caractère quelconque entre c1 et c2 dans l’ordre lexicographique
[!...] un caractère quelconque pris hors de la liste
— Mise en facteur par des accolades de chaînes séparées par des virgules
pre{chaine,str,ch3}post (sans espace) se développe en
prechainepost prestrpost prech3post
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 25 2014-2015
2 LE SHELL : INTRODUCTION MNI – Unix 2.3 Caractères spéciaux pour le shell (I)
Exemples de motifs de noms de fichiers
* tous les fichiers du répertoire courant (sauf ceux commençant par .)
*.f90 tous les fichiers dont le nom finit par .f90
*.* tous les fichiers dont le nom comporte un point (au moins)
data?? tous les fichiers dont le nom est data suivi de deux caractères
f.[abc] les fichiers f.a, f.b, et f.c s’ils existent
f.[0-9] les fichiers dont le nom s’écrit f. suivi d’un chiffre
NB. : f.[25-70] (maladroit, mais) les fichiers f.0, f.2, f.5, f.6 et f.7
f.[!0-9] les fichiers dont le nom s’écrit f. suivi d’un caractère qui n’est pas un chiffre
*.[ch] les fichiers source en C et les fichiers d’entête (header )
N.-B. : si aucun fichier ne correspond, le générateur est restitué inchangé avec ses caractères jokers
(sauf avec l’option nullglob fixée par : shopt -s nullglob).
Exemple d’expansion d’accolades
echo bon{jour,soir} affiche la chaîne bonjour bonsoir
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 26 2014-2015
2 LE SHELL : INTRODUCTION MNI – Unix 2.4 Documentation en ligne
2.4 Documentation en ligne
Différents moyens d’accéder à la documentation en ligne d’une commande :
— man cmd : affiche du manuel de la commande cmd
page par page grâce au filtre more ou less
– se déplacer dans le manuel : ↑ ↓, page suivante/précédente
– rechercher un motif : /motif
– sortir du manuel : touche q quit
Préciser parfois la section du manuel (1 = commandes, 3 = bibliothèques)
man 3 printf (⇒ la fonction C)
au lieu de man printf (⇒ section 1 commande)
— cmd --help : affiche un bref aide-mémoire de la commande
— info cmd : système de documentation hypertexte de certaines commandes
Rechercher quelle commande utiliser pour une opération : man -k motclef
Autre source d’information : usage averti d’un moteur de recherche sur le web
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 27 2014-2015
3 HIÉRARCHIE DES FICHIERS UNIX MNI – Unix
3 Hiérarchie des fichiers unix
3.1 Arborescence
L’ensemble des fichiers est structuré sous la forme d’une hiérarchie
— de répertoires (directories, dossiers (folders) sous windows)
— et de fichiers (files)
constituant un arbre unique.
— / est la racine (root) : le répertoire qui contient tous les autres fichiers ;
— ses nœuds sont des sous-répertoires...
— ses feuilles sont les fichiers ordinaires (en général).
— le séparateur de niveaux est la barre oblique / (slash)
NB1 : l’arbre unique d’unix est purement logique ; plusieurs périphériques peuvent
y être « montés », par exemple /media/cdrom, /media/removable
NB2 : sous windows, le séparateur est la contre-oblique \ (antislash)
sous windows, les périphériques sont désignés par une lettre préfixe
suivie de «:», par exemple C:\ ou D:\
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 28 2014-2015
3 HIÉRARCHIE DES FICHIERS UNIX MNI – Unix 3.1 Arborescence
/ racine
bin dev etc home lib tmp usr
ls group_a group_b man
user_a1 user_a2 user_b1 man1 cat1
Légende
répertoire
dir_1 file1 file2 dir_1
fichier ordinaire
F IGURE 1 – Arborescence des fichiers UNIX
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 29 2014-2015
3 HIÉRARCHIE DES FICHIERS UNIX MNI – Unix 3.2 Chemins d’accès (path) d’un fichier
3.2 Chemins d’accès (path) d’un fichier
— le chemin absolu : commence toujours par / et comporte la liste complète
des répertoires traversés depuis la racine,
Exemples : /usr/man/man1/ls.1, /home/group_a/user_a1
— un chemin relatif : comporte la liste des répertoires à parcourir
depuis le répertoire courant jusqu’au fichier ou répertoire choisi.
Il ne commence jamais par / et doit passer par un nœud commun à la branche
de départ (répertoire courant) et la branche d’arrivée.
. répertoire courant ou de travail (working directory )
.. répertoire père (parent directory )
Exemples, partant de /home/group_a/user_a1 :
dir_1, ../, ../user_a2, ../../group_b/user_b1
Des fichiers de même nom ne peuvent exister que dans des répertoires différents
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 30 2014-2015
3 HIÉRARCHIE DES FICHIERS UNIX MNI – Unix 3.2 Chemins d’accès (path) d’un fichier
bin dev etc home lib tmp usr
ls group_a group_b man
cd . user_a1 user_a2 user_b1 man1 cat1
dir_1 file1 file2 dir_1
F IGURE 2 – La commande cd . laisse dans le répertoire courant
/home/group_a/user_a1.
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 31 2014-2015
3 HIÉRARCHIE DES FICHIERS UNIX MNI – Unix 3.2 Chemins d’accès (path) d’un fichier
bin dev etc home lib tmp usr
ls group_a group_b man
cd ..
user_a1 user_a2 user_b1 man1 cat1
dir_1 file1 file2 dir_1
F IGURE 3 – La commande cd .. déplace dans le répertoire père group_a.
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 32 2014-2015
3 HIÉRARCHIE DES FICHIERS UNIX MNI – Unix 3.2 Chemins d’accès (path) d’un fichier
bin dev etc home lib tmp usr
ls group_a group_b man
../ user_a2
user_a1 user_a2 user_b1 man1 cat1
dir_1 file1 file2 dir_1
F IGURE 4 – La commande cd ../user_a2 déplace dans le répertoire
user_a2
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 33 2014-2015
3 HIÉRARCHIE DES FICHIERS UNIX MNI – Unix 3.2 Chemins d’accès (path) d’un fichier
cd ../../group_b/user_b1 /
bin dev etc home lib tmp usr
../ group_b
ls group_a group_b man
../ user_b1
user_a1 user_a2 user_b1 man1 cat1
dir_1 file1 file2 dir_1
F IGURE 5 – La commande cd ../../group_b/user_b1 déplace dans le
répertoire user_b1.
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 34 2014-2015
3 HIÉRARCHIE DES FICHIERS UNIX MNI – Unix 3.3 Raccourcis pour les répertoires d’accueil
3.3 Raccourcis pour les répertoires d’accueil
Chemins en fait absolus :
~user répertoire d’accueil d’un utilisateur quelconque
~ son propre répertoire d’accueil
Exemples :
~/.bash_profile
est le chemin absolu de votre fichier d’initialisation personnel.
~lefrere/M1/Doc/unix/poly-unix/
est le chemin absolu du répertoire du polycopié UNIX,
situé sous le compte de l’utilisateur lefrere.
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 35 2014-2015
3 HIÉRARCHIE DES FICHIERS UNIX MNI – Unix 3.4 Visualisation d’une branche avec tree
3.4 Visualisation d’une branche avec tree
La commande tree permet de L’option -f (full) permet d’afficher le
représenter une branche de la chemin complet à partir du répertoire
hiérarchie de fichiers. donné en argument de la commande.
-] tree . -] tree -f .
. .
|-- fic |-- ./fic
|-- rep1 |-- ./rep1
| |-- fic1 | |-- ./rep1/fic1
| |-- rep1-1 | |-- ./rep1/rep1-1
| | `-- fic1-1 | | `-- ./rep1/rep1-1/fic1-1
| `-- rep1-2 | `-- ./rep1/rep1-2
|-- rep2 |-- ./rep2
| `-- fic2 | `-- ./rep2/fic2
`-- rep3 `-- ./rep3
|-- rep3-1 |-- ./rep3/rep3-1
| `-- fic3-1 | `-- ./rep3/rep3-1/fic3-1
`-- rep3-2 `-- ./rep3/rep3-2
7 directories, 5 files 7 directories, 5 files
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 36 2014-2015
4 COMMANDES DE BASE MNI – Unix
4 Commandes de base
4.1 Commandes de gestion de fichiers
4.1.1 Affichage de liste de noms de fichiers avec ls
ls [-options] [liste_de_fichiers]
-a (all) liste aussi les fichiers cachés (de nom commençant par .)
-l (long) affiche les attributs (droits, taille, date, ...) des fichiers
-R (Recursive) affiche la liste des fichiers contenus dans tous les sous répertoires éventuels
-F (Flag) marque les fichiers répertoires (/), exécutables (*) ou les liens (@)
-t (time) classe la liste par ordre de date des fichiers
-d (directory ) affiche le nom des répertoires mais pas leur contenu
-h (human readable) affiche la taille en utilisant les multiples k (kilo) M (méga) G (giga)
-r (reverse order ) affiche dans l’ordre inverse
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 37 2014-2015
4 COMMANDES DE BASE MNI – Unix 4.1 Commandes de gestion de fichiers
Exemples d’usage de ls
sans objet : par défaut le répertoire courant
ls liste (courte) des fichiers du répertoire courant
ls -l liste des fichiers du répertoire courant avec attributs
ls -al idem avec aussi les fichiers cachés (commençant par .)
cas des répertoires : par défaut le contenu
ls -l rep liste détaillée des fichiers du répertoire rep (contenu)
ls -dl rep nom et attributs du répertoire rep (contenant)
ls -l fic1 fic2 rep liste détaillée des fichiers ordinaires fic1, fic2
et du contenu du répertoire rep
ls -t /tmp liste des fichiers de /tmp par ordre chronologique
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 38 2014-2015
4 COMMANDES DE BASE MNI – Unix 4.1 Commandes de gestion de fichiers
4.1.2 Copie de fichiers avec cp
en anglais copy
— copie avec changement de nom éventuel (deux arguments seulement)
cp [-options] fichier_origine fichier_cible
— copie d’un ou plusieurs fichiers sans changement de nom
vers un même répertoire
cp [-options] liste_de_fichiers répertoire_cible
cp *.c bck/ copie les fichiers source C dans le répertoire bck
Principales options :
-i (interactive) demande de confirmation si fichier_cible existe déjà
-r (recursive) copie d’une branche (si le premier objet est un répertoire)
-p (permissions) sans changer les droits ni la date
Confirmation en cas d’écrasement : répondre y (o si francisé)
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 39 2014-2015
4 COMMANDES DE BASE MNI – Unix 4.1 Commandes de gestion de fichiers
4.1.3 Déplacement et renommage de fichiers avec mv
en anglais move 3 syntaxes
1. mv [-options] fichier_origine fichier_cible
2 objets seulement renommage sauf si chemins d’accès différents
2. mv [-options] liste_de_fichiers répertoire_cible
si le répertoire cible existe il y a déplacement, sinon il est créé
3. mv [-options] répertoire_source répertoire_cible
renommage ou déplacement de branche
Principale option :
-i (interactive) demande de confirmation interactive si écrasement de fichier
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 40 2014-2015
4 COMMANDES DE BASE MNI – Unix 4.1 Commandes de gestion de fichiers
4.1.4 Suppression de fichiers avec rm
en anglais remove
rm [-options] liste_de_fichiers
Principales options :
-i (interactive) demande de confirmation interactive
-r (recursive) destruction d’une branche (puissant mais... dangereux)
-f (force) sans demande de confirmation ni erreur si fichier inexistant
Attention : pas toujours d’alias en rm -i !
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 41 2014-2015
4 COMMANDES DE BASE MNI – Unix 4.1 Commandes de gestion de fichiers
4.1.5 Compression de fichiers avec gzip ou bzip2
Compression et décompression sans perte d’information
Compression → fichier de suffixe .gz
gzip [-options] liste_de_fichiers
Décompression d’un fichier de suffixe .gz
gunzip [-options] liste_de_fichiers
Autre outil, plus efficace : bzip2/bunzip2 (suffixe .bz2)
Format plus récent : lzma (suffixe .lzma)
(commandes unlzma puis xz avec options -z/-d)
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 42 2014-2015
4 COMMANDES DE BASE MNI – Unix 4.2 Commandes de gestion de répertoires
4.2 Commandes de gestion de répertoires
4.2.1 Affichage du répertoire courant avec pwd
pwd (print working directory ) affiche le chemin absolu du répertoire courant
commande interne (builtin) du shell
4.2.2 Changement de répertoire courant avec cd
cd [répertoire] (change directory )
commande interne (builtin) du shell
cd (sans paramètre) retour au répertoire d’accueil ~/.
cd - revient au précédent répertoire (dans le temps)
cd .. revient au répertoire père (dans la hiérarchie)
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 43 2014-2015
4 COMMANDES DE BASE MNI – Unix 4.2 Commandes de gestion de répertoires
4.2.3 Création de répertoire avec mkdir
mkdir répertoire (make directory )
option -p (parent) : crée les répertoires parents si nécessaire
exemple : mkdir -p dir/subdir
4.2.4 Suppression de répertoire (vide) avec rmdir
rmdir répertoire (remove directory )
refus de suppression si le répertoire contient des fichiers
⇒ utiliser rm -R répertoire, mais dangereux !
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 44 2014-2015
5 COMMANDES POUR FICHIERS TEXTES MNI – Unix
5 Commandes traitant le contenu des fichiers texte
5.1 Fichiers binaires et fichiers texte, codage
Un fichier (ordinaire) = lot d’informations, conservé dans une mémoire permanente
(disque, CD, clef USB, ...) et auquel on donne un nom.
Deux aspects du fichier :
bas niveau : suite de bits groupés en octets
haut niveau : représentation de texte, d’image, de code machine,...
selon un certain codage qui permet d’interpréter la suite de bits.
Préférer des suffixes rappelant le type de codage utilisé :
— fichiers texte
.c source C, .f90 source fortran, .txt texte, .html hypertexte, ...
— fichiers binaires
.pdf pour du PDF, .jpg pour une image JPEG
.o pour un objet binaire, .a pour une bibliothèque, ...
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 45 2014-2015
5 COMMANDES POUR FICHIERS TEXTES MNI – Unix 5.2 Codage des fichiers textes
5.2 Codage des fichiers textes
Plusieurs codages pour les caractères :
— ASCII sur 7 bits (128 caractères) => non accentués
— codages sur 1 octet = 8 bits (256 caractères) avec caractères accentués :
– propriétaires : CP852, CP1252 sous windows, MacRoman sous MacOS
– ISO-8859 avec les variantes locales
ISO-8859-1 ou latin1 pour le français par exemple
— évolution en cours vers standard unicode pour représenter toutes les langues :
nécessiterait jusqu’à 4 octets par caractère : UTF-32 !
implémentation UTF-8 : taille variable des caractères : de 1 à 4 octets
– sur-ensemble de l’ASCII (donc sur 1 octet pour les non-accentués)
– les caractères non-ascii de latin1 sur 2 octets
– les codes binaires (sur 1 octet) des caractères accentués de l’ISO-8859-1
sont invalides en UTF-8 !
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 46 2014-2015
5 COMMANDES POUR FICHIERS TEXTES MNI – Unix 5.2 Codage des fichiers textes
5.2.1 Transcodage de fichiers textes avec recode ou iconv
— iconv -f code_initial -t code_final fichier
attention : la conversion s’arrête à la première combinaison invalide
— recode code_initial..code_final fichier
Attention : par défaut recode travaille « en place » (modifie le fichier initial).
recode permet d’enlever les signes diacritiques : convertir vers code flat,
mais transcodage irréversible (option -f)
Exemples de transcodage de l’iso vers utf-8 :
iconv -f ISO-8859-1 -t UTF-8 < [Link] > [Link]
recode 'ISO-8859-1..UTF-8' < [Link] > [Link]
De nombreux éditeurs (vim, emacs...) peuvent faire de la conversion au vol
pour la phase d’édition, puis sauvegarder dans le codage initial.
Mais kedit ouvre les fichiers iso-latin en mode lecture seule !
Attention : ne pas mélanger deux codages dans un fichier (via par ex. copier/coller)
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 47 2014-2015
5 COMMANDES POUR FICHIERS TEXTES MNI – Unix 5.3 Accès au contenu des fichiers
5.3 Accès au contenu des fichiers
5.3.1 Identification des fichiers avec file
file liste_de fichiers
affiche une indication sur la nature du fichier (texte, binaire, ...)
⇒ l’utiliser pour savoir avec quelles commandes manipuler un fichier
[Link]: ELF 64-bit LSB executable, x86-64
carre.f90: ASCII text
carre+invite.c: symbolic link to `carre+invite-utf.c'
carre+invite-iso.c: ISO-8859 C program text
carre+invite-utf.c: UTF-8 Unicode C program text
[Link]: ISO-8859 text
[Link]: UTF-8 Unicode text
[Link]: LaTeX 2e document text
[Link]: PDF document, version 1.5
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 48 2014-2015
5 COMMANDES POUR FICHIERS TEXTES MNI – Unix 5.3 Accès au contenu des fichiers
5.3.2 Comptage des mots d’un fichier texte avec wc
wc [-cmwl] [liste_de fichiers] (wordscount)
Affiche par défaut le nombre de lignes, de mots et d’octets,
sauf si options cumulables pour sélectionner :
-l compte les lignes (lines)
-w compte les mots (words)
-m compte les caractères (multibytes, c est pris !) : utile en UTF-8 seulement
-c compte les octets (characters au sens historique !) comme ls -l
NB : ordre d’affichage fixe lwmc, c’est-à-dire du plus gros au plus petit
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 49 2014-2015
5 COMMANDES POUR FICHIERS TEXTES MNI – Unix 5.3 Accès au contenu des fichiers
N.-B. : wc -m exact seulement si codage du fichier et codage déterminé par les
variables d’environnement locales (LC_ALL) sont cohérents, cas sur fond jaune .
Exemple :
le texte aceàçéÀÇÉ, soit 9 caractères + fin de ligne, soit 10 caractères dont 6
accentués, codés en ISO-8859-1 ([Link]) ou en UTF-8 ([Link]) :
locale
wc -mc ISO-8859-1 UTF-8
[Link] 10 10 4? 10
[Link] 16 16 10 16
caractères en bleu et octets en rouge
?
: décodage incomplet ⇒ nb. de caractères < nb. d’octets
car 6 caractères latin1 accentués non décodés en UTF-8.
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 50 2014-2015
5 COMMANDES POUR FICHIERS TEXTES MNI – Unix 5.3 Accès au contenu des fichiers
5.3.3 Affichage du contenu de fichiers texte avec cat
cat [liste_de fichiers]
affiche ( concatène ) le contenu des fichiers de la liste
N.B. : pas de contrôle du défilement (voir more ou less)
ex : cat fic1 fic2 fic3 concatène et affiche le contenu des trois fichiers
cat = filtre identité : recopie l’entrée standard (clavier) sur la sortie standard (écran)
cat -n affiche les lignes avec leur numéro en tête, suivi d’une tabulation
Ne pas confondre cat fichier avec echo chaine
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 51 2014-2015
5 COMMANDES POUR FICHIERS TEXTES MNI – Unix 5.3 Accès au contenu des fichiers
5.3.4 Affichage paginé du contenu d’un fichier texte avec more/less
more liste_de fichiers
affiche le contenu des fichiers de la liste (avec contrôle du défilement)
less liste_de fichiers
préférable sous linux (défilement arrière possible)
Requêtes sous le pagineur
Entrée avance d’une ligne
Espace avance d’un écran
/motif recherche la prochaine occurence de motif en avançant
?motif recherche la prochaine occurence de motif en reculant
q quitte l’affichage (nécessaire avec less)
Nombreuses variables d’environnement associées à less :
— Attention aux effets de la variable LESSOPEN : post-traitement du flux !
— Selon le codage des caractères, LESSCHARSET=utf-8 ou iso8859
Rappel : less = pagineur utilisé par la commande man
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 52 2014-2015
5 COMMANDES POUR FICHIERS TEXTES MNI – Unix 5.3 Accès au contenu des fichiers
5.3.5 Début et fin d’un fichier texte avec head et tail
head/tail [options] [liste_de fichiers]
head -n nb fichier affiche les nb premières lignes de fichier
tail -n nb fichier affiche les nb dernières lignes de fichier
tail -n +11 fichier affiche à partir de la ligne 11
5.3.6 Repliement des lignes d’un fichier texte avec fold
fold [options] [liste_de fichiers]
-w width : longueur (80 par défaut)
-s ne coupe pas les mots (repliement sur les espaces)
5.3.7 Affichage de texte avec echo
echo chaîne de caractères
commande interne du shell ou primitive (built-in)
utilisée dans les fichiers de commande pour afficher des messages
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 53 2014-2015
5 COMMANDES POUR FICHIERS TEXTES MNI – Unix 5.3 Accès au contenu des fichiers
5.3.8 Affichage des différences entre deux fichiers texte avec diff
diff fichier_1 fichier_2
option -b ignore les différences portant sur les blancs
option -y affiche en deux colonnes
vimdiff pour éditer 2 fichiers en parallèle (changer de fenêtre : ^W w)
5.3.9 Affichage de la partie texte d’un fichier binaire avec strings
strings [options] fichier
5.3.10 Affichage d’un fichier binaire avec od
od [options] [liste_de fichiers]
octal dump
formats d’affichage introduits par -t
-t d4 pour des entiers sur 4 octets -t f4 pour des flottants sur 4 octets
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 54 2014-2015
6 ENVIRONNEMENT RÉSEAU MNI – Unix
6 Environnement réseau
6.1 Courrier électronique
Commandes de gestion du courrier :
— en mode texte : mail, elm, alpine, mutt
autres outils gérant le courrier : l’éditeur emacs
— en mode graphique : les navigateurs (mozilla-thunderbird, ...).
— à distance : accès à sa boîte aux lettres personnelle via un navigateur (après
authentification) grâce à un service de webmail
Exemple d’adresse électronique :
[Link]@[Link]
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 55 2014-2015
6 ENVIRONNEMENT RÉSEAU MNI – Unix 6.2 Connexion à distance via slogin
6.2 Connexion à distance via slogin
Connexion sur une machine distante grâce à la commande sécurisée slogin.
Authentification sur la machine distante par mot de passe ou échange de clefs.
slogin user@dist_host.domain
slogin etu1@[Link]
ne pas oublier le login, sauf si identique sur la machine locale
Option -X pour autoriser les applications graphiques (fenêtres X11) via ssh
Lancement de commandes sur la machine distante :
ssh user@dist_host.domain dist_cmd
ssh etu1@[Link] ls ~lefrere/M1/Doc
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 56 2014-2015
6 ENVIRONNEMENT RÉSEAU MNI – Unix 6.3 Transfert de fichiers à distance
6.3 Transfert de fichiers à distance via scp et sftp
Copie de fichiers personnels entre deux machines, sans ouvrir de session sur la
machine distante, via scp (fournir le mot de passe à chaque commande)
Syntaxe de cp mais préfixer le chemin d’accès des fichiers distants par
user@dist_host.domain:
scp [user1@]host1:file1 file2 distant vers local
scp file1 [user2@]host2:file2 local vers distant
Session sftp (secure file tranfert protocol) pour plusieurs transferts
sftp user@dist_host.domain
— Après authentification sur le serveur distant,
— navigation distante : cd
— navigation locale : lcd
— importation de fichiers distants : get dist_file,
— exportation de fichiers vers la machine distante : put local_file
— exit ou quit pour terminer la session sftp.
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 57 2014-2015
6 ENVIRONNEMENT RÉSEAU MNI – Unix 6.4 Explorateurs et téléchargement
6.4 Explorateurs et téléchargement
Navigateurs Web (lynx, firefox, opera, konqueror, amaya, ...)
Protocoles : ftp (File Transfer Protocol), http (Hypertext Transport Protocol),
ou https (sécurisé par cryptage).
Ressources localisées grâce à une URL (Universal Resource Locator ).
Exemples d’URL :
file:/home/lefrere/M1/Doc/unix/ sur la machine locale
[Link]
[Link]
en ligne de commande : wget ou curl pour télécharger des fichiers
par exemple :
wget "[Link]
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 58 2014-2015
7 COMMANDES AVANCÉES DE GESTION DES FICHIERS MNI – Unix
7 Commandes avancées de gestion des fichiers
7.1 Découpage de fichiers avec split et csplit
split [-l nb_de_lignes] fichier
Découpage d’un fichier en sous-ensembles de nombre de lignes fixé (1000 par défaut)
split -l 100 [Link] ⇒ xaa, xab, xac, ...xba, ...
csplit fichier '/exp/offset' '{n}'
Découpage offset lignes après la rencontre du motif exp, limité à n + 1 coupures
⇒ xx00, xx01, xx02, ..., xx10, ... par défaut
csplit -f fic -b '%d.f90' complet.f90 '/end *module/+1' '{*}'
Découpage du fichier source fortran complet.f90 par modules
1 ligne après end module, nombre illimité de coupures grâce à '{*}'
préfixe -f fic et suffixe avec format (voir printf) -b '%d.f90'
⇒ fic1.f90, fic2.f90, ...
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 59 2014-2015
7 COMMANDES AVANCÉES DE GESTION DES FICHIERS MNI – Unix 7.2 Recherche de fichiers dans une arborescence avec find
7.2 Recherche de fichiers dans une arborescence avec find
find répertoire critère(s) action
Recherche récursive dans toute la branche sous répertoire
Commande très puissante : critères de sélection nombreux
pouvant être combinés pour former une expression évaluée à vrai ou faux.
-name motif nom selon un motif (à protéger du shell)
-iname motif version de -name ignorant la casse
-size entier[ckM] taille en octets (c), kiloctets (k), mégaoctets (M)
-newer fichier plus récent qu’un fichier
-type T de type donné (f=ordinaire, d=répertoire)
Les actions les plus usitées sont :
-print affiche la liste des fichiers (un par ligne)
-ls affiche la liste des fichiers avec leurs attributs (comme ls -dils)
-exec cmd exécute la commande unix cmd sur les fichiers sélectionnés
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 60 2014-2015
7 COMMANDES AVANCÉES DE GESTION DES FICHIERS MNI – Unix 7.2 Recherche de fichiers dans une arborescence avec find
Légende dir
répertoire
fichier
repA z.c repB
ordinaire
rep1 x.c rep2 toto rep1
rep x.c y.c x.c rep
F IGURE 6 – find . -name x.c -print si dir est le répertoire de travail
⇒ trois fichiers
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 61 2014-2015
7 COMMANDES AVANCÉES DE GESTION DES FICHIERS MNI – Unix 7.2 Recherche de fichiers dans une arborescence avec find
Légende dir
répertoire
fichier
repA z.c repB
ordinaire
rep1 x.c rep2 toto rep1
rep x.c y.c x.c rep
F IGURE 7 – find repA -name x.c -print à partir de repA
⇒ deux fichiers
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 62 2014-2015
7 COMMANDES AVANCÉES DE GESTION DES FICHIERS MNI – Unix 7.2 Recherche de fichiers dans une arborescence avec find
Exemples de recherches avec find
find . -name [Link] -print
affiche la liste des fichiers nommés [Link] sous le répertoire courant
(dans toute la hiérarchie en dessous de ce répertoire)
find . -name "*.c" -print
(le shell ne doit pas interpréter le caractère *)
find /tmp -size +1000c -size -2000c -print
affiche la liste des fichiers de taille entre 1000 et 2000 octets sous /tmp
find . -name [Link] -exec rm {} \; (syntaxe délicate de exec)
recherche les fichiers [Link] et les supprime :
{} désigne le nom de chacun des fichiers trouvés (avec son chemin)
\; indique la fin de la commande à appliquer à chaque fichier.
Ne pas oublier le premier argument de find : le noeud (répertoire) de départ
Ne pas confondre avec ls -R
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 63 2014-2015
7 COMMANDES AVANCÉES DE GESTION DES FICHIERS MNI – Unix 7.2 Recherche de fichiers dans une arborescence avec find
Légende dir
répertoire
fichier
repA z.c repB
ordinaire
rep1 x.c rep2 toto rep1
rep x.c y.c x.c rep
F IGURE 8 – find . -name *.c -print (* interprété par le shell) ⇒ z.c
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 64 2014-2015
7 COMMANDES AVANCÉES DE GESTION DES FICHIERS MNI – Unix 7.2 Recherche de fichiers dans une arborescence avec find
Légende dir
répertoire
fichier
repA z.c repB
ordinaire
rep1 x.c rep2 toto rep1
rep x.c y.c x.c rep
F IGURE 9 – find . -name ’*.c’ -print ⇒ cinq fichiers
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 65 2014-2015
7 COMMANDES AVANCÉES DE GESTION DES FICHIERS MNI – Unix 7.3 Archivage d’arborescence avec tar
7.3 Archivage d’arborescence avec tar
tar options archive [répertoire]
Principales actions possibles (une et une seule) :
-c (create) création de l’archive à partir de l’arborescence
-t (list) liste des fichiers tels qu’ils seront extraits
-x (extract) extraction des fichiers pour restaurer l’arborescence
Autres options combinables :
-v (verbose) affiche des informations complémentaires
-f archive (file) précise le nom du fichier d’archive utilisé (nécessaire)
f - si entrée standard (tar x) ou sortie standard (tar c)
z ou j avec dé/compression (gzip ou bzip2) du fichier .tar
--exclude=motif sauf les fichiers répondant au motif indiqué
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 66 2014-2015
7 COMMANDES AVANCÉES DE GESTION DES FICHIERS MNI – Unix 7.3 Archivage d’arborescence avec tar
/ /
transfert de [Link]
home/ tmp/ home/ tmp/
entre les 2
machines
cd ~/.. gp_a/ gp_b/ [Link] user0/ user1/ cd ~user1/repB/
repA/ repB/ [Link]
ua0/ ua1/ tar −cf /tmp/[Link] ua1
tar −xf ~user1/[Link]
dir1/ dir2/ file1 ua1/
f1_1 d21/ dir1/ dir2/ file1
f1_1 d21/
F IGURE 10 – Transfert de branche via tar : création de l’archive [Link], transfert
de l’archive et extraction sous repB
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 67 2014-2015
7 COMMANDES AVANCÉES DE GESTION DES FICHIERS MNI – Unix 7.3 Archivage d’arborescence avec tar
home/ tmp/
F IGURE 11 – Création
cd ~/.. gp_a/ gp_b/ [Link]
(sous /tmp) de l’ar-
chive [Link] de la
branche de l’utilisateur
ua0/ ua1/ tar −cf /tmp/[Link] ua1
ua1 :
1) cd ~/..
dir1/ dir2/ file1
2) tar -cf /tmp/[Link] ua1
f1_1 d21/
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 68 2014-2015
7 COMMANDES AVANCÉES DE GESTION DES FICHIERS MNI – Unix 7.3 Archivage d’arborescence avec tar
home/ tmp/
user0/ user1/
cd ~user1/repB/
F IGURE 12 – Restauration
repA/ repB/ [Link] de branche à partir de l’ar-
chive :
1) cd ~/repB/
tar −xf ~user1/[Link]
ua1/ 2) tar -xf ~/[Link]
dir1/ dir2/ file1
f1_1 d21/
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 69 2014-2015
7 COMMANDES AVANCÉES DE GESTION DES FICHIERS MNI – Unix 7.3 Archivage d’arborescence avec tar
Exemples d’usage de tar
cd ~/.. ; tar -cvf /tmp/[Link] user
archive toute l’arborescence de l’utilisateur user dans [Link]
(se placer un niveau au-dessus de la branche à archiver)
tar -tf /tmp/[Link]
affiche la liste des fichiers archivés dans [Link]
tar -xvf /tmp/[Link]
restaure toujours l’arborescence dans le répertoire courant (à partir de l’archive)
(se placer au niveau où « greffer » la branche à restaurer)
Remarques : éviter les chemins absolus dans les sauvegardes,
sinon les fichiers seront obligatoirement restaurés au même endroit.
l’option avec argument -f fichier_archive est en fait obligatoire.
Copie de branche via un tube (- désigne entrée/sortie standards) :
tar -cf - . | (cd dest_dir ; tar -xvf - )
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 70 2014-2015
7 COMMANDES AVANCÉES DE GESTION DES FICHIERS MNI – Unix 7.4 Copies et synchronisation de fichiers avec rsync
7.4 Copies et synchronisation de fichiers avec rsync
rsync [options] source [user@host:]dest
rsync [options] [user@host:]source dest
outil de copie plus puissant que scp ⇒ synchronisation de répertoires
— sur une même machine ou à distance
— très rapide car ne transmet que les différences et compression possible
— nombreuses options pour les sauvegardes et les miroirs
-r récursif -v (verbose) prolixe -z (zip) compression avant transfert
-u (update) mise à jour : ne transmet que les fichiers plus récents côté source
-t, -p conserve la date (time), les droits (permissions)
--exclude=motif sauf les fichiers répondant au motif indiqué
-n essai à vide avant d’activer
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 71 2014-2015
7 COMMANDES AVANCÉES DE GESTION DES FICHIERS MNI – Unix 7.4 Copies et synchronisation de fichiers avec rsync
Remarque : rôle des / terminaux
rsync -r rep1 user@host:/tmp crée le répertoire /tmp/rep1/
sur la machine distante et y recopie récursivement le contenu de rep1
rsync -r rep1/ user@host:/tmp recopie récursivement le contenu
de rep1/ dans /tmp/ sur la machine distante sans y créer de niveau rep1
rsync -r rep1 user@host:/tmp est donc équivalent à
rsync -r rep1/ user@host:/tmp/rep1/
Exemple
rsync -rvtpu --exclude='*~' \
user@[Link]:mni/unix/ ~/unix-mni
met à jour (u) récursivement (r) le répertoire local ~/unix-mni à partir du
répertoire ~user/mni/unix/ du serveur en conservant droits (p) et dates (t),
mais sans transférer les fichiers de sauvegarde de suffixe ~ (--exclude)
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 72 2014-2015
8 DROITS D’ACCÈS AUX FICHIERS MNI – Unix
8 Droits d’accès aux fichiers
r read lecture
type propriétaire groupe autres
w write écriture
-/d/l user group others
x execute exécution
- r w x r w x r w x
- droit refusé
8.1 Affichage des droits d’accès avec ls -l
Exemple : ls -l ~lefrere/M1/Config/
drwxr-xr-x 2 lefrere personnel 1024 sep 17 2009 lisp
-rwxr-xr-x 1 lefrere personnel 1076 oct 7 2009 MNI.bash_profile
-rwxr-xr-x 1 lefrere personnel 3101 oct 22 2009 [Link]
lrwxrwxrwx 1 lefrere personnel 15 sep 15 17:40 motd -> motd.16sept2010
-rw-r--r-- 1 lefrere personnel 434 sep 15 21:18 motd.16sept2010
première colonne : d si répertoire l si lien (link ) symbolique (raccourci vers ->)
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 73 2014-2015
8 DROITS D’ACCÈS AUX FICHIERS MNI – Unix 8.1 Affichage des droits d’accès avec ls -l
a
z }| {
portée u g o Les permissions peuvent être aussi re-
symbolique rwxr-xr-x présentées de la valeur exprimée en
binaire 111101101 base huit (octal) des droits d’accès
(r=4, w=2, x=1).
octal 7 5 5
Permission s (setuid bit ou setgid bit) à la place de x sur un fichier exécutable
⇒ droits du propriétaire (effective user ) ou du groupe lors de l’exécution du fichier.
Ex : la commande passwd (changement de mot de passe) doit permettre à
n’importe quel utilisateur authentifié d’écrire dans /etc/passwd, mais on ne
peut pas donner ce droit en permanence.
-rw-r--r-- 1 root root 1091 Jun 30 09:16 /etc/passwd
-r-s--x--x 1 root root 15540 Jun 20 2004 /usr/bin/passwd
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 74 2014-2015
8 DROITS D’ACCÈS AUX FICHIERS MNI – Unix 8.2 Changement des droits d’accès avec chmod
8.2 Changement des droits d’accès avec chmod
chmod mode liste_de_fichiers où mode représente~:
— la portée, u, (user ), g, (group), o, (others) ou a (all).
— suivie de = (définit les droits), + (ajoute un droit), ou - (enlève un droit),
— suivi de la permission r, w, ou x.
Exemple 1 : chmod go-r fichier
supprime les droits de lecture au groupe et aux autres
Exemple 2 : chmod u+w,go-w fichier
donne le droit d’écriture au propriétaire et le supprime au groupe et aux autres
Droits par défaut : la commande interne umask (user mask) affiche ou fixe les
droits par défaut (masque en octal : complément à 7, ou droits symboliques avec -S)
affichage des droits fixation des droits par défaut
umask umask -S umask 027 umask -S u=rwx,g=rx,o=
022 u=rwx,g=rx,o=rx
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 75 2014-2015
8 DROITS D’ACCÈS AUX FICHIERS MNI – Unix 8.3 Signification des droits sur les répertoires
8.3 Signification des droits sur les répertoires
r nécessaire pour afficher la liste des fichiers du répertoire
w permet d’ ajouter, de renommer, de supprimer des fichiers dans le ré-
pertoire (pas nécessaire pour modifier le contenu d’un fichier)
x permet d’agir sur les fichiers du répertoire, à condition de connaître
leurs noms (même si on ne peut pas afficher leur liste) : par exemple
traverser le répertoire, afficher les attributs des fichiers du répertoire
Exemple :
drwx--x--x 42 lefrere personnel 4096 sep 20 18:17 lefrere
peut être traversé par tout le monde pour accéder à lefrere/M1/
mais seul son propriétaire peut lister son contenu ou le modifier
NB : utiliser ls -ld repertoire pour afficher les droits d’un répertoire
(au lieu de ceux des fichiers du répertoire)
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 76 2014-2015
9 ÉDITION DE FICHIERS TEXTES MNI – Unix
9 Édition de fichiers textes
9.1 Les éditeurs sous unix et leurs modes
9.1.1 Éditeurs sous unix
— ligne : ex et ed très robustes (terminal quelconque), mais d’interface rigide
— pleine page : (nécessitent une connaissance du terminal utilisé)
– vi sur-couche de ex, très puissant, présent sur tous les unix,
version vim sous linux, éditeur sensible au langage (C, fortran, latex, ...)
avec mise en valeur de la syntaxe par des couleurs
– emacs encore plus puissant, mais plus gourmand en ressources
— en environnement graphique multifenêtres, avec menus, gestion de la souris, ...
xemacs, gvim, gedit, kwrite...
attention au codage des fichiers texte : ASCII/ISO-8859-1/UTF-8
⇒ transcodage au vol par l’éditeur dans certains cas
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 77 2014-2015
9 ÉDITION DE FICHIERS TEXTES MNI – Unix 9.1 Les éditeurs sous unix et leurs modes
9.1.2 Les modes des éditeurs
Deux modes principaux :
— commande : les caractères saisis sont interprétés comme des ordres
(requêtes)
⇒ immédiatement exécutés
— insertion : les caractères saisis sont directement insérés dans le fichier.
Le mode par défaut est :
— le mode commande sous vi ⇒ déroutant au premier abord
passage en mode insertion par une requête
— le mode insertion sous emacs
requêtes introduites par des caractères de contrôle : Ctrl , Échap
exemple : ^X^C pour terminer l’édition emacs
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 78 2014-2015
9 ÉDITION DE FICHIERS TEXTES MNI – Unix 9.2 Principes de l’éditeur vi
9.2 Principes de l’éditeur vi
i, I (insert)
a, A (append)
vi file o, O (open)
Mode Mode
shell
commande Saisie
ZZ Esc
: vi
w (write)
Mode
q (quit) w file
q! ex r file (read)
F IGURE 13 – Modes de fonctionnement de vi
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 79 2014-2015
9 ÉDITION DE FICHIERS TEXTES MNI – Unix 9.2 Principes de l’éditeur vi
— plusieurs requêtes pour passer en mode saisie :
– a et A (append) ajout,
– i et I (insert) insertion,
– o et O (open) ouverture de ligne.
— une seule méthode pour revenir au mode commande :
touche d’échappement Échap (escape)
Un troisième mode, le mode dialogue est accessible de façon temporaire (affichage
sur la ligne d’état en bas du terminal) depuis le mode commande de vi pour :
— passer des requêtes ex via :
— rechercher de motifs dans le texte (via / ou ?)
Requête activée par Entrée ,
puis retour immédiat en mode commande.
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 80 2014-2015
9 ÉDITION DE FICHIERS TEXTES MNI – Unix 9.3 Principales requêtes de l’éditeur vi
9.3 Principales requêtes de l’éditeur vi
Déplacements
← ↑ ↓ → les quatre flèches
0 première colonne, $ fin de ligne
d’un écran : ^F (forward) en avant, ^B (backward) en arrière
Modifications
rc (replace) remplace un caractère par un (seul) autre
cw (change word) change un mot
~ passe de majuscule à minuscule et réciproquement
Destructions
x détruit le caractère pointé par le curseur
dw (delete word) détruit le mot à droite du curseur
dd détruit la ligne courante
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 81 2014-2015
9 ÉDITION DE FICHIERS TEXTES MNI – Unix 9.3 Principales requêtes de l’éditeur vi
Mise en mémoire
yy (yank ) mise en mémoire d’une ligne
yw (yank word) mise en mémoire du mot à droite du curseur
Restitution de la mémoire tampon
p (paste) restitue après ; P restitue avant
Divers
. réitère la commande précédente
u (undo) annule la précédente commande
% bascule le curseur d’un délimiteur à l’autre dans les paires ()[]{}
J (join) concatène la ligne suivante à la ligne courante
^L raffraîchit l’affichage
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 82 2014-2015
9 ÉDITION DE FICHIERS TEXTES MNI – Unix 9.3 Principales requêtes de l’éditeur vi
Recherche de chaînes de caractères
/motif recherche motif vers l’avant
?motif recherche motif vers l’arrière
n (next) recherche l’occurence suivante
Répétitions de requêtes
La majeure partie des requêtes vi peut être préfixée par un entier
qui indique combien de fois elle est appliquée :
25x détruit 25 caractères
20i+ Échap insère 20 signes +
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 83 2014-2015
9 ÉDITION DE FICHIERS TEXTES MNI – Unix 9.4 Requêtes ex
Auto-complétion des mots pendant la saisie (vim)
En mode saisie, les mots peuvent être complétés automatiquement s’ils existent
déjà dans le texte :
^P (previous) si le mot est présent avant dans le texte
^N (next) si le mot est présent après dans le texte
9.4 Requêtes ex
9.4.1 Requêtes ex élémentaires
:q (quit) sort de vi
:q! force une sortie sans sauvegarde
:w (write) sauvegarde dans le fichier courant
:w fic sauvegarde dans le fichier fic
:r fic (read) ajoute le contenu du fichier fic
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 84 2014-2015
9 ÉDITION DE FICHIERS TEXTES MNI – Unix 9.4 Requêtes ex
9.4.2 Adressage des commandes ex
La portée par défaut d’une commande ex est la ligne courante,
sauf si la requête est précédée d’une adresse (numérique ou paramétrée).
:n1, n2 de la ligne n1 à la ligne n2
:., n . = ligne courante
:n, $ $ = dernière ligne
:n1,+n2 + adressage relatif
:n1,-n2 - adressage relatif
:% l’ensemble des lignes
:/motif1/,/motif2/ motif1 à la pre-
de la première ligne contenant
mière ligne contenant motif2 en partant de la
ligne qui suit la ligne courante
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 85 2014-2015
9 ÉDITION DE FICHIERS TEXTES MNI – Unix 9.4 Requêtes ex
9.4.3 Autres commandes ex
d (delete) détruit des lignes
co (ou t) (copy ) copie des lignes
m (move) déplace des lignes
s/ch1/ch2/ (substitute) substitue une chaîne à une autre
(première occurrence de la ligne)
s/ch1/ch2/g (substitute) substitue une chaîne à une autre
(toutes les occurrrences de la ligne)
g/motif/ (global search) recherche un motif
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 86 2014-2015
9 ÉDITION DE FICHIERS TEXTES MNI – Unix 9.4 Requêtes ex
9.4.4 Exemples de commandes ex
:r toto ajoute le fichier toto après la ligne courante
:.,+10w toto écrit les 11 lignes partant de la ligne courante
dans le fichier toto
:.,$d détruit de la ligne courante à la fin du fichier
:1,5co32 copie les lignes 1 à 5 après la ligne 32
:1,3m$ déplace les trois premières lignes en fin de texte
:g/motif/d recherche toutes les occurrences de motif dans le texte
et détruit les lignes où il est présent
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 87 2014-2015
9 ÉDITION DE FICHIERS TEXTES MNI – Unix 9.5 Configuration de vi
9.5 Configuration de vi
Nombreuses options accessibles par :set
:set nu affiche les numéros des lignes (ou :set number)
:set nonu n’affiche pas les numéros des lignes
:set list affiche ^I pour les tabulations
et marque les fins de ligne par $
:set nolist affiche normalement les tabulations
et ne marque pas les fins de ligne
:set ic ignore la casse (majuscule/minuscule) dans les recherches
:set encoding affiche le codage du texte (latin1, utf-8, ...)
:set all affiche l’état des options en cours
Fichier de configuration où stocker ces options : ~/.exrc
Cas de vim (improved) : fichier de configuration ~/.vimrc
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 88 2014-2015
10 REDIRECTIONS ET TUBES MNI – Unix
10 Redirections et tubes
10.1 Flux standard
Commande UNIX ⇒ trois flux standard de données :
descripteur flux défaut
0 entrée standard le clavier
1 sortie standard l’écran
2 sortie d’erreur standard l’écran
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 89 2014-2015
10 REDIRECTIONS ET TUBES MNI – Unix 10.1 Flux standard
entrée standard 0 1 sortie standard
= clavier par défaut commande = écran par défaut
2
sortie d’erreur
= écran par défaut
F IGURE 14 – Flux standard de données associés à une commande
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 90 2014-2015
10 REDIRECTIONS ET TUBES MNI – Unix 10.2 Redirections
10.2 Redirections
— Au lieu d’une saisie au clavier et d’un affichage à l’écran,
stocker de façon permanente l’information d’entrée ou de sortie
⇒ rediriger les flux standards à partir ou vers des fichiers
— Combiner des commandes de base pour effectuer des traitements complexes
⇒ rediriger les flux standards vers les entrées/sorties d’autres commandes.
(mécanisme des tubes ou pipe-lines )
⇒ grande souplesse du système UNIX
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 91 2014-2015
10 REDIRECTIONS ET TUBES MNI – Unix 10.2 Redirections
10.2.1 Redirection de sortie vers un fichier (> et >>)
syntaxe syntaxe
commande > fichier commande >> fichier
Le fichier résultat est créé. pour ajouter le résultat à la fin du fichier
Exemples :
ls -l > [Link]
date > resultats ls *.f90 > liste_f+c
echo fin >> resultats ls *.c >> liste_f+c
Attention : le shell interprète très tôt les redirections
⇒ ne pas rediriger la sortie vers le fichier d’origine
cat -n fic1 > fic1 efface le contenu du fichier fic1
Solution : cat -n fic1 > tmp ; mv tmp fic1
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 92 2014-2015
10 REDIRECTIONS ET TUBES MNI – Unix 10.2 Redirections
>
>>
entrée standard 0 1
= clavier par défaut commande fichier
2
sortie d’erreur
= écran par défaut
F IGURE 15 – Redirection de la sortie standard
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 93 2014-2015
10 REDIRECTIONS ET TUBES MNI – Unix 10.2 Redirections
10.2.2 Redirection de l’entrée depuis un fichier (<)
syntaxe Exemple : lecture des données d’en-
commande < fichier trée d’un exécutable sur un fichier au
lieu de la saisie au clavier
le fichier doit exister au préalable.
[Link] < entrees
0 1 sortie standard
fichier commande = écran par défaut
2
sortie d’erreur
= écran par défaut
F IGURE 16 – Redirection de l’entrée
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 94 2014-2015
10 REDIRECTIONS ET TUBES MNI – Unix 10.3 Tubes ou pipes (|)
10.3 Tubes ou pipes (|)
>
0 1 0 1
commande_1 fichier commande_2
2 2
TUBE (pipe)
0 1 0 1
commande_1 | commande_2
2 2
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 95 2014-2015
10 REDIRECTIONS ET TUBES MNI – Unix 10.3 Tubes ou pipes (|)
Appliquer deux traitements successifs à un flux de données :
— Méthode séquentielle avec fichier intermédiaire :
commande_1 > fichier => attente éventuelle
commande_2 < fichier
rm fichier
— Traitement à la chaîne en connectant les deux processus par un tube ou
pipe = zone mémoire ⇒ communication synchronisée entre les 2 processus
syntaxe
commande_1 | commande_2
plus rapide que le traitement séquentiel
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 96 2014-2015
10 REDIRECTIONS ET TUBES MNI – Unix 10.3 Tubes ou pipes (|)
Exemple 1 : affichage paginé de la liste des fichiers du répertoire courant
Méthode séquentielle (à éviter) Chaînage avec tube (à préférer)
ls -l > liste
more liste ls -l | more
rm liste
Exemple 2 : affichage de la 12e ligne du fichier toto
Méthode séquentielle (à éviter) Chaînage avec tube (à préférer)
head -n 12 toto > tmp1
tail -n 1 tmp1 head -n 12 toto | tail -n 1
rm tmp1
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 97 2014-2015
10 REDIRECTIONS ET TUBES MNI – Unix 10.3 Tubes ou pipes (|)
Cas de plusieurs redirections
L’ordre des redirections sur la ligne est indifférent (avec une seule commande)
commande < entree > sortie
commande > sortie < entree
Avec un tube, ne pas détourner le flux : pas de redirection sur des fichiers en sortie
de la première commande ni en entrée de la seconde
commande_1 < entree | commande_2 > sortie
commande_1 > sortie | commande_2 < entree
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 98 2014-2015
10 REDIRECTIONS ET TUBES MNI – Unix 10.4 Compléments
10.4 Compléments
10.4.1 Redirection de la sortie d’erreurs vers un fichier (2> et 2>>)
syntaxe syntaxe
commande 2> fichier commande 2>> fichier
Attention : pas d’espace entre 2 et > pour ajouter les erreurs à la fin du fichier.
Exemple : stockage des diagnostics d’une compilation dans un fichier pour éviter le
défilement à l’écran (afin de localiser d’abord la première erreur)
gfortran essai.f90 2> erreurs
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 99 2014-2015
10 REDIRECTIONS ET TUBES MNI – Unix 10.4 Compléments
entrée standard 0 1 sortie standard
= clavier par défaut commande = écran par défaut
2>
2>>
fichier
F IGURE 18 – Redirection de l’erreur
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 100 2014-2015
10 REDIRECTIONS ET TUBES MNI – Unix 10.4 Compléments
10.4.2 Redirection de l’erreur standard vers la sortie standard (2>&1)
Regroupement dans un même flux de la sortie standard et de la sortie d’erreur :
syntaxe
commande 2>&1
Exemple (on suppose que /etc/motd est accessible) :
cat /etc/motd /fichier_inexistant
affiche le mot du jour et un message d'erreur
cat /etc/motd /fichier_inexistant > resultat
affiche un message d'erreur
cat /etc/motd /fichier_inexistant > resultat 2>&1
n'affiche plus rien
N.-B. : la redirection de la sortie standard dans la dernière commande doit précéder
la redirection de l’erreur standard vers le flux de la sortie standard.
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 101 2014-2015
10 REDIRECTIONS ET TUBES MNI – Unix 10.4 Compléments
10.4.3 Les fichiers spéciaux : exemple /dev/null
Répertoire /dev : fichiers spéciaux gérant des flux de données entre le calculateur
et les périphériques (devices) : terminaux, imprimantes, disques, ...
tty affiche le nom du fichier spécial particulier attribué à un terminal
le fichier spécial /dev/tty désigne de façon générique le terminal
attaché à la connexion.
/dev/zero = fichier spécial fournissant un flux de zéros binaires
⇒ utilisé en entrée pour écraser physiquement des informations.
/dev/null = fichier spécial « poubelle » (vide) ou trou noir !
⇒ utilisé pour se débarrasser de certaines sorties inutiles.
commande 2> /dev/null
empêche le flux d’erreur de s’afficher à l’écran.
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 102 2014-2015
10 REDIRECTIONS ET TUBES MNI – Unix 10.4 Compléments
Exemple
find rep -name "nom" -print 2> /dev/null
évite l’affichage des messages d’erreur
quand on tente d’accéder à des fichiers non autorisés.
10.4.4 Duplication de flux : tee
tee duplique le flux de son entrée standard vers le fichier passé en argument et
vers sa sortie standard.
Exemple : tee permet de conserver une trace du résultat intermédiaire d’un tube :
cmd_1 | tee f_intermediaire | cmd_2
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 103 2014-2015
10 REDIRECTIONS ET TUBES MNI – Unix 10.4 Compléments
fichier
0 1 0 1
commande_1 tee fichier commande_2
F IGURE 19 – Duplication d’un flux avec tee
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 104 2014-2015
10 REDIRECTIONS ET TUBES MNI – Unix 10.4 Compléments
10.4.5 Notion de document joint (<<)
Rediriger l’entrée d’une commande habituellement interactive
⇒ lui passer des requêtes depuis un fichier.
Faire suivre la commande par << et un mot délimiteur quelconque (sans espace) ;
⇒ le texte qui suit est redirigé vers l’entrée de la commande,
jusqu’à la première ligne qui commence par le délimiteur.
Utilisé pour « embarquer » des données dans des fichiers de commande
Exemple de document joint (requêtes pour vi)
vi journal > /dev/null <<EOF édition du fichierjournal
:r /etc/motd lecture du fichier /etc/motd
8dd destruction des 8 premières lignes
:w sauvegarde
:q sortie de vi
EOF fin de redirection
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 105 2014-2015
11 FILTRES ÉLÉMENTAIRES MNI – Unix
11 Filtres élémentaires
11.1 Définition
filtre = commande qui lit l’entrée standard , effectue des transformations sur ces
données et affiche le résultat sur la sortie standard .
Exemples de filtres : cat, wc, tail, head, tr, sort, grep, sed, awk...
mais ls, date, vi... ne sont pas des filtres.
Utilisations
— filtre + saisie des données d’entrée au clavier et ^D pour terminer
— filtre < fic lit dans un fichier par redirection d’entrée
— mais beaucoup de filtres (sauf tr) admettent aussi comme paramètres
un nom de fichier ou une liste de fichiers d’entrée :
filtre fic1 fic2 ...
équivaut (presque car on perd ici les noms des fichiers) à :
cat fic1 fic2 ... | filtre
Dans ce cas, le nom de fichier « - » représente l’entrée standard.
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 106 2014-2015
11 FILTRES ÉLÉMENTAIRES MNI – Unix 11.2 Classement avec sort
11.2 Classement avec sort
sort trie , regroupe ou compare toutes les lignes des fichiers passés en paramètre
Par défaut : ordre lexicographique sur tous les champs de la ligne
⇒ sensible aux variables de langue (LANG et LC_...)
Options :
-r (reverse) pour trier selon l’ordre inverse
-f pour ignorer la casse (majuscule/minuscule)
-n (numeric) pour trier selon l’ordre numérique croissant
-u (unique) pour fusionner les lignes ex-æquo
-kdébut[,fin] classement selon les champs (key )
de numéros entre début (et fin)
-tdélim choisit le séparateur de champs délim (blanc par défaut)
-b (blank ) pour ignorer les blancs en tête de champ (cas de blancs multiples)
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 107 2014-2015
11 FILTRES ÉLÉMENTAIRES MNI – Unix 11.2 Classement avec sort
Exemples
sort /etc/passwd classe les lignes du fichier /etc/passwd par
ordre lexicographique
ls -l | sort -k8,8? classe les fichiers par ordre lexicographique
ls -l | sort -k8,8? r classe les fichiers par ordre lexicographique inverse
?
: date et heure sont formatées en seulement deux champs (mandriva, mais pas sappli1 par défaut)
ls -l | sort -k5,5n classe les fichiers par ordre de taille croissante
ls -l | sort -k5,5n -u idem, mais n’affiche qu’un exemplaire pour une
taille donnée (fusion des ex-æquo)
wc -l * | sort -k1,1n classe les fichiers par nombre de lignes croissant
sort -t: -k3,3n /etc/passwd classe les lignes du fichier passwd (séparateur
de champ :) par numéro d’id croissant (champ 3)
sort fic1 | cat pre - post fic1 trié, précédé du fichier
présente le fichier
pre et suivi de post.
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 108 2014-2015
11 FILTRES ÉLÉMENTAIRES MNI – Unix 11.3 Transcription avec tr
11.3 Transcription avec tr
tr jeu1 jeu2 substitue à chaque caractère de l’ensemble fourni
en premier paramètre son correspondant pris dans le deuxième ensemble.
tr '123' 'abc' change les 1 en a, les 2 en b et les 3 en c.
tr -d jeu pour supprimer (delete) les caractères d’un ensemble
tr -s jeu1 jeu2 (squeeze-repeats) pour supprimer les répétitions de
caractères de l’ensemble d’arrivée (après substitution)
Restrictions
Filtre pur : n’admet pas de nom de fichier en paramètre ⇒ redirections.
Attention aux différences selon les systèmes unix (manuel via info tr).
Travaille octet par octet ⇒ pas encore compatible UTF-8
⇒ ne tient pas compte du contexte (ne traite pas des motifs)
⇒ séquentiel sans mémoire (avantage !)
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 109 2014-2015
11 FILTRES ÉLÉMENTAIRES MNI – Unix 11.4 Autres filtres élémentaires
Compléments
Peut utiliser les séquences de contrôle de l’ascii (\r =CR, \n= NL)
tr -d '\r' supprime les « retour chariot » des fins de lignes (issus de windows)
Peut utiliser des intervalles (ascii)
tr a-z A-Z
ou mieux des classes de caractères (avec les accentués selon LC_COLLATE)
tr '[:lower:]' '[:upper:]' (en iso-latin, pas en UTF)
11.4 Autres filtres élémentaires
head / tail affiche les lignes du début (entête) / de la fin du fichier
expand / unexpand -a traduit les tabulations en espaces et inversement
cut sélectionne des colonnes (champs) dans un flux
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 110 2014-2015
12 EXPRESSIONS RÉGULIÈRES OU RATIONNELLES MNI – Unix
12 Expressions régulières ou rationnelles
Recherche de chaînes de caractères qui satisfont à un certain motif (pattern)
⇒ syntaxe particulière pour décrire des motifs génériques :
une expression rationnelle
Expressions rationnelles utilisées par les éditeurs ex, vi et sed, les filtres grep
et awk, ainsi que perl, python, php, JavaScript...
Deux versions exclusives de la syntaxe :
— expressions rationnelles de base BRE : Basic Regular Expressions
(ex, vi, sed, grep)
— expressions rationnelles étendues ERE : Extended Regular Expressions
(awk)
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 111 2014-2015
12 EXPRESSIONS RÉGULIÈRES OU RATIONNELLES MNI – Unix 12.1 Signification des caractères spéciaux
12.1 Signification des caractères spéciaux
. (point) représente un caractère quelconque et un seul
\ (contre-oblique : backslash) sert à protéger le caractère qui le suit
pour empêcher qu’il ne soit interprété
* (étoile) représente un nombre d’occurrences quelconque
(zéro, une ou plusieurs occurrences) du caractère ou
de la sous-expression qui précède
Ne pas confondre ces caractères spéciaux des expressions rationnelles avec les
caractères génériques (wildcards) pour les noms de fichiers, * et ? qui sont, eux,
interprétés par le shell.
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 112 2014-2015
12 EXPRESSIONS RÉGULIÈRES OU RATIONNELLES MNI – Unix 12.2 Ancres
Exemples
a* un nombre quelconque de fois le caractère a (y compris une chaîne vide)
aa* une ou plusieurs fois le caractère a
.* un nombre quelconque de caractères quelconques (y compris une chaîne
vide)
..* au moins un caractère
\.. un point suivi d’un caractère quelconque
\\* un nombre quelconque (y compris zéro) de contre-obliques
12.2 Ancres
Les ancres (anchor ) ne représentent aucune chaîne, mais permettent de spécifier
qu’un motif est situé en début ou en fin de ligne :
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 113 2014-2015
12 EXPRESSIONS RÉGULIÈRES OU RATIONNELLES MNI – Unix 12.2 Ancres
^ (accent circonflexe : caret) spécial en début de motif, représente le début de ligne
$ (dollar) spécial en fin de motif, représente la fin de ligne
^a une ligne commençant par un a
^a.*b$ une ligne commençant par a et finissant par b
^$ une ligne vide
^.*$ une ligne quelconque, y compris vide
^..*$ une ligne non vide
^$.*$$ une ligne commençant et finissant par $ (contenant au moins deux fois $)
seul le dernier $ est spécial
^^.*^$ une ligne commençant et finissant par ^ (contenant au moins deux fois ^)
seul le premier ^ est spécial
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 114 2014-2015
12 EXPRESSIONS RÉGULIÈRES OU RATIONNELLES MNI – Unix 12.3 Ensembles de caractères
12.3 Ensembles de caractères
Un et un seul caractère choisi parmi un ensemble de caractères spécifiés entre
crochets : [ensemble_de_caractères]
À l’intérieur d’un tel ensemble, les caractères spéciaux sont :
- utilisé pour définir des intervalles selon l’ordre lexicographique
(dépend des variables de langue)
^ en tête pour spécifier le complémentaire de l’ensemble
] qui délimite la fin de l’ensemble, sauf s’il est placé en première position
À l’intérieur des ces ensembles peuvent figurer des classes de caractères
[:lower:], [:upper:], [:alpha:], [:digit:], [:alnum:]
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 115 2014-2015
12 EXPRESSIONS RÉGULIÈRES OU RATIONNELLES MNI – Unix 12.3 Ensembles de caractères
Exemples
[a0+] un des trois caractères a, 0 ou +
[a-z] une lettre minuscule
[a-z:;?!] une lettre minuscule ou une ponctuation double
[0-9] un chiffre
[^0-9] n’importe quel caractère qui n’est pas un chiffre
[]-] un crochet fermant ] ou un signe moins -
Exemples avec une classe :
[[:digit:]] au lieu de [0-9]
[-+.[:digit:]] pour un chiffre, un point ou signe + ou -
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 116 2014-2015
13 LE FILTRE GREP MNI – Unix
13 Le filtre grep
grep (global regular expression print)
affiche les lignes qui contiennent un motif passé en paramètre
syntaxe
grep motif [liste_de_fichiers]
où motif est une expression régulière décrivant un motif générique
Principales options :
-i ignore la casse (majuscule/minuscule)
-v inverse la sélection (affiche les lignes sans le motif)
-l affiche la liste des fichiers contenant le motif
-n affiche les lignes contenant le motif précédées de leur numéro
-c (count) affiche les noms des fichiers et le nbre de lignes qui contiennent le motif
-C n affiche n lignes de contexte avant et après
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 117 2014-2015
13 LE FILTRE GREP MNI – Unix
Exemples :
grep lefrere /etc/passwd affiche la ligne de cet utilisateur dans le
fichier de mots de passe
grep '^!' test.f90 affiche les lignes commençant par ! dans
test.f90 (commentaires)
grep '^ *!' test.f90 affiche les lignes dont le premier caractère
non blanc est ! dans test.f90
grep -v '^ *!' test.f90 affiche les lignes qui ne sont pas des com-
mentaires fortran
grep -v '^ *$' test.f90 affiche les lignes qui ne comportent pas
que des blancs
ls -l | grep ^d affiche la liste des sous-répertoires du ré-
pertoire courant avec leurs attributs
N.-B. : protéger les caractères spéciaux de l’interprétation par le shell, ici par des «'»
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 118 2014-2015
14 LE FILTRE SED MNI – Unix
14 Le filtre sed
sed (stream editor ) : éditeur de flux non interactif
filtre qui analyse ligne par ligne le flux d’entrée et le transforme selon des requêtes
suivant une syntaxe similaire à celle de l’éditeur ed.
Deux syntaxes possibles suivant la complexité du traitement :
syntaxe
sed -e 'requête_sed ' [liste_de_fichiers]
Les requêtes comportant des caractères spéciaux sont la plupart du temps
protégées par des apostrophes de l’interprétation par le shell.
syntaxe
sed -f fichier_de_requê[Link] [liste_de_fichiers]
où fichier_de_requê[Link] contient des lignes de requêtes d’édition.
Autre option : -n n’affiche pas les lignes traitées (utiliser la requête p)
La plupart des requêtes sont adressables comme celles de ex.
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 119 2014-2015
14 LE FILTRE SED MNI – Unix
Exemples : (s = substitute)
sed -e 's/ab/AB/' change le premier ab de chaque ligne en AB
sed -e 's/10/20/g' change tous les 10 en 20
sed -e '3,$s/0/1/g' change tous les 0 en 1 à partir de la ligne 3
sed -e 's/00*/(&)/g' entoure de parenthèses tous les groupes de 0
& représente le motif trouvé
sed -e 's/[0-9]/(&)/g' insère des parenthèses autour de tous les chiffres
sed -e '/motif/s/0/1/g' change tous les 0 en 1 dans les lignes
contenant motif
sed -e '3,$y/01/12/' change caractère par caractère (comme tr) les 0
en 1 et les 1 en 2 à partir de la ligne 3
sed -e '/^#/d' détruit les lignes commençant par #
sed -n -e '/^#/p' affiche (print) les lignes commençant par #
-n pour éviter l’affichage par défaut de tout le fichier
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 120 2014-2015
15 LE FILTRE AWK MNI – Unix
15 Le filtre awk
awk : filtre programmable (agit ligne par ligne comme grep)
fonctionnalités de calcul de type tableur , syntaxe proche du langage C
⇒ sensible aux variables de langue (LC_NUMERIC) : virgule décimale ou point
Deux syntaxes, sur la ligne de commande ou dans un fichier :
syntaxe
awk 'instructions_awk' liste_de_fichiers_de_donnees
dans ce cas protéger les instructions de l’interprétation par le shell
syntaxe
awk -f fich_de_programme liste_fichiers_donnees
Autres Options :
-F délim spécifie le séparateur de champs (blancs et tabulations par défaut)
-v variable=valeur passe une valeur à une variable awk
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 121 2014-2015
15 LE FILTRE AWK MNI – Unix 15.1 Structure des données pour awk
15.1 Structure des données pour awk
Pour chaque ligne (record), les données sont découpées en champs (field) selon le
séparateur FS (field separator ) :
— $0 la ligne courante
— NR (number of record ), son numéro d’enregistrement (de ligne)
— NF (number of fields), son nombre de champs
— $1, $2, ... $NF : son premier, deuxième, dernier champ
15.2 Structure d’un programme awk
Suite de couples : sélecteur {action}
⇒ Un sélecteur peut être :
— vide et il est vrai pour toutes les lignes
— une expression régulière étendue (ERE) entre / et /
le sélecteur est vrai si le motif est présent dans la ligne
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 122 2014-2015
15 LE FILTRE AWK MNI – Unix 15.2 Structure d’un programme awk
— une expression logique évaluée pour chaque ligne
— une combinaison logique (via &&, || ou !) de sélecteurs
— un intervalle de lignes sous la forme : sélecteur1, sélecteur2
— BEGIN ou END qui introduisent des actions exécutées
avant ou après la lecture des données
⇒ Une action est une suite d’instructions (affectations de variables, calculs,
opérations sur des chaînes de caractères, ...) exprimées dans une syntaxe
analogue à celle du langage C (structures de contrôle en particulier).
— Constantes chaînes de caractères entre « " ».
— Variables non déclarées et typées seulement lors de leur affectation
— Nombreuses fonctions, notamment numériques (log, cos, int, ...) et
chaînes de caractères (length, tolower, ...) disponibles.
L’action s’applique séquentiellement à toutes les lignes sélectionnées
⇒ pas de boucle explicite sur les lignes
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 123 2014-2015
15 LE FILTRE AWK MNI – Unix 15.3 Exemples de programmes awk
N.-B. : awk mal adapté s’il faut plusieurs lectures des données
(ex. : calcul de pourcentage)
15.3 Exemples de programmes awk
— affichage des lignes ayant la valeur numérique 2004 pour premier champ
$1 == 2004 {print $0} mais protéger du shell si hors fichier
awk '$1 == 2004 {print $0}' fichier
— affichage des lignes ayant la chaîne toto pour deuxième champ
awk '$2 == "toto"' fic ne pas oublier les guillemets pour la chaîne
— affichage des lignes avec leur numéro (équivalent de cat -n)
awk '{print NR, $0}' fichier
— échange des champs 1 et 2 et affichage :
awk '{a=$1 ; $1=$2; $2=a; print $0}' fic
— affichage du nombre de lignes du fichier (équivalent de wc -l)
awk 'END {print NR}' fic
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 124 2014-2015
15 LE FILTRE AWK MNI – Unix 15.3 Exemples de programmes awk
— Calcul de la moyenne du champ 1 :
BEGIN{ n=0; s=0} (initialisation facultative)
{n++ ; s+=$1} (cumul)
END{ print "moyenne = ", s/n} (affichage)
— Calcul de la moyenne des valeurs supérieures à 10 du champ 1 :
BEGIN{ n=0; s=0} (initialisation facultative)
$1 > 10 {n++ ; s+=$1} (cumul conditionnel)
END{ if (n > 0 ) {
print "moyenne = ", s/n (affichage)
}
else {
print "pas de valeurs > 10"
}
}
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 125 2014-2015
15 LE FILTRE AWK MNI – Unix 15.4 Mise en garde sur les caractères non-imprimables
15.4 Mise en garde sur les caractères non-imprimables
Les caractères de contrôle dans les fichiers texte ne sont pas toujours visibles à
l’affichage et l’édition.
extrait de man ascii
Oct Dec Hex Car
010 8 08 BS '\b' (backspace)
011 9 09 HT '\t' (horizontal tab)
012 10 0A LF '\n' (new line)
013 11 0B VT '\v' (vertical tab)
014 12 0C FF '\f' (form feed)
015 13 0D CR '\r' (carriage ret)
⇒ risques d’erreur avec les filtres.
— confusion entre espaces et tabulations : erreur sur motif grep ou sed
\r\n (DOS) : erreur si ajout de caractères en fin de ligne
— fin de ligne avec
awk '{print $0 "texte"}' ⇒ texte entre \r et \n
⇒ texte écrase le début de ligne
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 126 2014-2015
15 LE FILTRE AWK MNI – Unix 15.4 Mise en garde sur les caractères non-imprimables
Comment visualiser ces caractères de contrôle ?
avec cat : cat -A (All) ou cat -vET affiche les retour chariot (^M avec -v),
les fins de ligne ($, avec -E, (End)) et les tabulations (^I avec -T, (Tab)).
sous vi : option :set list ⇒ ^I pour tabulation, $ pour fin de ligne
si vi fic affiche [dos] sur la ligne d’état, fic comporte des \r
vi -b fic (binary ) affiche ^M pour les retour chariot
avec od : od -tc affiche \t pour tabulation, \r retour chariot, \n retour ligne
Rappels : expand transforme les tabulations en espaces
tr comprend les séquences d’échappement comme \t, \r, \n et \b
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 127 2014-2015
16 GESTION DES PROCESSUS MNI – Unix
16 Gestion des processus
16.1 Généralités : la commande ps
Processus = tâche élémentaire identifiée par un numéro unique ou
pid (process identifier ).
Afficher la liste des processus avec la commande ps
⇒ par défaut ceux de l’utilisateur et associés au même terminal
3 syntaxes pour sélectionner les processus et les informations affichées par ps :
System V, BSD, et Posix en cours d’implémentation (contrôler avec man -a).
Principales options :
-e (posix -A) affiche tous les processus de tous les utilisateurs
-U user_list sélectionne les processus appartenant à cette liste
d’utilisateurs ou d’UID (séparés par des virgules sans espace)
-f (full) affiche une liste complète d’informations sur chaque processus
-o sorties (output) permet de choisir les informations affichées
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 128 2014-2015
16 GESTION DES PROCESSUS MNI – Unix 16.1 Généralités : la commande ps
Exemples de sélection des processus
$ ps les processus de l’utilisateur sur
PID TTY TIME CMD le pseudo-terminal courant, affi-
1212592 pts/2 0:00 ps ché par tty : /dev/pts/2
1294516 pts/2 0:01 bash
$ ps -U lefrere les processus de l’utilisateur
PID TTY TIME CMD lefrere sur toutes les
307400 - 0:02 sshd consoles (ici 2 et 6) accédant au
1212590 pts/2 0:00 ps serveur
1294516 pts/2 0:01 bash
1294620 - 0:02 sshd
1294621 pts/6 0:01 bash
N.-B. : la commande ps se voit agir.
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 129 2014-2015
16 GESTION DES PROCESSUS MNI – Unix 16.1 Généralités : la commande ps
Format de sortie de ps
Principaux champs affichés :
UID PID PPID TTY VSZ CMD
no utilisateur no du processus no du père terminal taille commande
$ ps -f (full)
UID PID PPID C STIME TTY TIME CMD
lefrere 1294516 307400 0 [Link] pts/2 0:01 -bash
lefrere 2027692 1294516 45 [Link] pts/2 0:00 ps -f
En précisant après -o la liste (entre virgules sans espace) des champs à afficher
et éventuellement leur intitulé selon la syntaxe champ[=intitulé] :
$ ps -o uid=ID,tty=term,pid,ppid,vsz,args=commande
ID term PID PPID VSZ commande
40369 pts/2 1294516 307400 1280 -bash
40369 pts/2 2027768 1294516 532 ps -o uid=ID,tty=term,pid,ppid,vsz,args=
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 130 2014-2015
16 GESTION DES PROCESSUS MNI – Unix 16.1 Généralités : la commande ps
option -H ou option longue (GNU) --forest
⇒ affiche la hiérarchie des processus (tous fils de init de pid 1)
ps -Af --forest
UID PID PPID C STIME TTY TIME CMD
jal 1935 1 0 03:45 ? [Link] xterm -ls
jal 1936 1935 0 03:45 pts/6 [Link] \_ -bash
jal 2114 1936 0 03:53 pts/6 [Link] \_ xterm -bg yellow
jal 2115 2114 0 03:53 pts/14 [Link] | \_ bash
jal 2166 2115 0 03:55 pts/14 [Link] | \_ xclock
jal 2167 1936 0 03:55 pts/6 [Link] \_ xclock
jal 2188 1936 0 03:57 pts/6 [Link] \_ ps -Af --forest
Comparer le PPID et le PID du père...
Affichage interactif des processus : commande top (u user pour sélectionner)
(attention : commande puissante mais consomme des ressources !)
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 131 2014-2015
16 GESTION DES PROCESSUS MNI – Unix 16.2 Caractères de contrôle et signaux
16.2 Caractères de contrôle et signaux
Caractères de contrôle (notés ^X pour Ctrl X) interprétés par le shell
⇒ gestion des processus attachés au terminal et des flux d’entrées/sorties.
^? ou ^H erase effacement du dernier caractère
^L clear efface l’écran
^S stop blocage de l’affichage à l’écran
^Q start déblocage de l’affichage à l’écran
^D eof fermeture du flux d’entrée (fin de session en shell)
^C int interruption du processus
^\ quit interruption forcée du processus avec production
d’une image mémoire (fichier core)
^Z susp suspension du processus en cours
stty gère l’affectation des caractères de contrôle à certaines fonctions
stty -a indique leur affectation courante (ex : erase=^?; eof=^D)
Un caractère de contrôle ne peut agir que sur le processus en interaction avec le
terminal auquel il est attaché.
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 132 2014-2015
16 GESTION DES PROCESSUS MNI – Unix 16.3 Commandes kill et killall
16.3 Commandes kill et killall
Intervenir sur un autre processus (ex. : application graphique qui ne répond plus)
⇒ le désigner par son numéro et lui envoyer un signal
kill pid où pid est le numéro du processus
kill envoie par défaut un signal de terminaison = kill -s TERM
si le processus ne s’interrompt pas, kill -s KILL (ou kill -s 9)
killall : envoi à une liste de processus désignés par des noms de commandes
exemple : killall -r '.*mozilla.*' (-r comme regexp)
16.4 Processus en arrière plan
Système UNIX multi-tâche :
— commandes longues non-interactives en arrière-plan (background)
— « garder la main » pour d’autres commandes pendant cette tâche de fond
(asynchrone)
syntaxe
commande &
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 133 2014-2015
16 GESTION DES PROCESSUS MNI – Unix 16.4 Processus en arrière plan
Gestion des processus en arrière-plan :
— jobs affiche la liste des processus en arrière-plan avec leur numéro (6= pid)
— fg (foreground) passe le job courant en premier plan
fg %num_job (passe le job num_job en premier plan)
— bg (background) passe le job courant en arrière-plan
Processus en arrière-plan ⇒ plus d’entrées au clavier
⇒ redirections de l’entrée et de la sortie vers des fichiers
mais arrêté par la fermeture du terminal.
Exemples
— xterm en premier-plan ⇒ on « perd la main » dans la fenêtre initiale.
Dans la nouvelle fenêtre, terminer ce processus par exit ou ^D
⇒ retrouver la main dans la fenêtre initiale.
— xterm & ⇒ conserve la main dans la fenêtre initiale.
Depuis la fenêtre initiale, terminer ce processus xterm
par kill pid ou par fg puis ^C
— si on oublie le &, ^Z pour suspendre le processus, puis bg pour le passer en arrière-plan
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 134 2014-2015
16 GESTION DES PROCESSUS MNI – Unix 16.5 Compléments
16.5 Compléments
16.5.1 Processus détaché
Processus détaché = tâche sans interaction avec un terminal,
⇒ continue après la fin de session interactive
⇒ rediriger tous les flux standards
nohup commande <entrees >sortie 2>erreurs &
Autres modes d’exécution des processus détachés et différés :
— soumission dans une file d’attente ou batch (via qsub par exemple)
⇒ le système gère les priorités d’exécution
— à un instant déterminé par exemple via le service cron :
at date commande
— processus périodiques pour la gestion du système (sauvegardes, ménage, MAJ
des bases de données pour le manuel, ...) : fichier /etc/crontab.
— cas des machines qui ne fonctionnent pas en permanence : utiliser anacron
(/etc/anacrontab)
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 135 2014-2015
16 GESTION DES PROCESSUS MNI – Unix 16.5 Compléments
16.5.2 Groupement de commandes
Plusieurs commandes sur une même ligne ⇒ les séparer par un point-virgule ;
cd ; pwd ; ls
Grouper plusieurs commandes grâce aux parenthèses
⇒ s’exécutent dans un sous-shell, fils du shell interactif.
commande affichage remarque
cd /tmp
(cd /bin ; pwd) /bin ⇒ dans le sous-shell seulement
pwd /tmp retour au précédent
Groupement et redirections :
date ; hostname > memo1 contient le nom du calculateur, la date est affichée
(date ; hostname) > memo2 contient la date et le nom du calculateur
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 136 2014-2015
17 CODE DE RETOUR MNI – Unix
17 Code de retour d’une commande,
commande test
17.1 Code de retour d’une commande ($?)
Toute commande UNIX renvoie en fin d’exécution un code entier : valeur de retour
(cf. exit() dans main en C) ou statut de fin (return status) accessible via $?
Code de sortie = 0 ⇐⇒ la commande s’est bien déroulée.
cd /bin
echo $? affiche 0
cd /introuvable affiche un message d'erreur
echo $? affiche 1
Certains codes de retour non nuls ont une signification particulière
(par ex. 127 pour commande introuvable).
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 137 2014-2015
17 CODE DE RETOUR MNI – Unix 17.2 Inversion du statut de retour
17.2 Inversion du statut de retour (!)
syntaxe
! commande un espace après le !
17.3 Combinaison de commandes (&&)
syntaxe
commande_1 && commande_2
— La première commande est exécutée.
— Si et seulement si elle réussit (code de retour égal à zéro),
la seconde est alors exécutée.
Par exemple, on lance un exécutable seulement si sa production (compilation et
lien) s’est effectuée sans erreur.
gfortran source.f90 && [Link]
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 138 2014-2015
18 LA COMMANDE TEST MNI – Unix 17.4 Combinaison de commandes ||
17.4 Combinaison de commandes (||)
syntaxe
commande_1 || commande_2
— La première commande est exécutée.
— Si et seulement si elle échoue (code de retour différent de zéro),
la seconde est alors exécutée.
Exemple : gestion minimale des erreurs
cp fichier1 fichier2 || echo la copie a échoué
18 La commande test
test permet de comparer des nombres entiers ou des chaînes de caractères et
de tester les propriétés de fichiers.
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 139 2014-2015
18 LA COMMANDE TEST MNI – Unix
commande invocable sous deux formes :
• test expression
• [ expression ] en plaçant simplement la condition entre crochets
Les arguments de test doivent être séparés par un espace
un espace doit séparer la condition à tester des délimiteurs [ et ].
test fournit un code de retour $? (0 si vrai / 1 si faux)
⇒ exploitation à l’aide de structures de contrôle du shell de type
if, while ou until.
Commandes à code de retour fixe
true ⇒ code de retour fixe = 0
false ⇒ code de retour fixe = 1
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 140 2014-2015
18 LA COMMANDE TEST MNI – Unix 18.1 Comparaisons arithmétiques
18.1 Comparaisons arithmétiques
-le 6 lower or equal inférieur ou égal à
-lt < lower than inférieur à
-eq = equal égal à
-ge > greater or equal supérieur ou égal à
-gt > greater than supérieur à
-ne 6= not equal différent de
Exemples
test 3 -gt 2 test 03 -eq 3 test 3 -lt 2
echo $? echo $? echo $?
--> 0 --> 0 --> 1
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 141 2014-2015
18 LA COMMANDE TEST MNI – Unix 18.2 Comparaisons de chaînes de caractères
18.2 Comparaisons de chaînes de caractères
-n s chaîne s de longueur non nulle
-z s chaîne s de longueur nulle
s1 = s2 chaîne s1 et chaîne s2 identiques
s1 != s2 chaîne s1 et chaîne s2 différentes
Exemples
chaînes 6= nombres var1=aaa
[ -z "" ] var2=aaa
echo $? [ 03 = 3 ] [ ${var1} != ${var2} ]
--> 0 echo $? echo $?
--> 1 --> 1
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 142 2014-2015
18 LA COMMANDE TEST MNI – Unix 18.3 Tests sur les fichiers
18.3 Tests sur les fichiers
-r toto read toto est un fichier accessible en lecture
-w toto write toto est un fichier accessible en écriture
-x toto execute toto est un fichier accessible en exécution
-e toto exist le fichier toto existe
-f toto file le fichier toto existe et est un fichier ordinaire
-d toto directory le fichier toto existe et est un répertoire
-s toto size le fichier toto existe et est non vide
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 143 2014-2015
18 LA COMMANDE TEST MNI – Unix 18.4 Combinaisons de conditions
Exemple
test -r /etc/motd test -d /tmp
echo $? echo $?
--> 0 --> 0
test -w /etc/motd test -f /tmp
echo $? echo $?
--> 1 --> 1
18.4 Combinaisons de conditions
Parenthèses ( ) pour grouper des conditions,
Mais protéger les parenthèses par \ ⇒ pas interprétées par le shell
! -o -a
négation ou logique (or ) et logique (and)
Exemple test \( ${a} -ge 2 \) -a \( ${a} -le 5 \)
est vrai si 2 6 a 6 5.
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 144 2014-2015
19 VARIABLES SHELL MNI – Unix
19 Variables shell
Variables de l’interpréteur de commandes :
— non déclarées
— non typées a priori ⇒ chaînes de caractères
19.1 Affectation et référence
— Syntaxe d’ affectation (en shell de type B OURNE) :
syntaxe
variable=valeur (sans espace autour du signe = )
— Référence à la valeur de la variable :
syntaxe
$variable ou, plus précisément ${variable}
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 145 2014-2015
19 VARIABLES SHELL MNI – Unix 19.1 Affectation et référence
La commande interne set (sans argument)
affiche la liste des variables et leurs valeurs.
Exemples
alpha=toto ; b=35 ; c2=3b
echo alpha, b, c2 contiennent ${alpha}, ${b}, ${c2}
⇒ alpha, b, c2 contiennent toto, 35, 3b
set | grep alpha
⇒ alpha=toto
bb=${b}+${b} ; echo b vaut ${b}, bb vaut ${bb}
⇒ b vaut 35, bb vaut 35+35
pas d’arithmétique directement avec le shell ⇒ utiliser expr ou $(())
expr 3 + 12
affichent 15
echo $((3+12))
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 146 2014-2015
19 VARIABLES SHELL MNI – Unix 19.2 Saisie interactive d’une liste de variables
19.2 Saisie interactive d’une liste de variables
commande interne read : lecture au clavier
syntaxe
read liste_de_variables
liste_de_valeurs saisies sur une seule ligne
read aa bb commande lancée
A BB CCC DDDD saisie de l'utilisateur
echo ${aa}
⇒A réponse du shell
echo ${bb}
⇒BB CCC DDDD réponse du shell
Un mot par variable sauf éventuellement la dernière qui stocke la fin de la ligne
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 147 2014-2015
19 VARIABLES SHELL MNI – Unix 19.3 Portée des variables ordinaires du shell
19.3 Portée des variables ordinaires du shell
Par défaut, pas d’héritage des variables normales par les processus fils.
a=bonjour affectation dans le processus père
echo a contient +${a}+
⇒ a contient +bonjour+
bash lancement d’un shell fils
echo a contient +${a}+ variable locale
⇒ a contient ++ pas affecté
a=salut affectation dans le fils
echo a contient +${a}+
⇒ a contient +salut+
exit retour au shell père
echo a contient +${a}+
⇒ a contient +bonjour+ valeur avant appel du shell fils
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 148 2014-2015
19 VARIABLES SHELL MNI –19.4
Unix Extension de la portée d’une variable : variables d’environnement
19.4 Extension de la portée d’une variable : variables
d’environnement
Exportation d’une variable vers les processus fils (shell de type Bourne) :
syntaxe
export variable
En fait copie locale, donc pas d’héritage inverse, du processus fils vers le père.
Variables d’environnement systématiquement héritées par les processus fils.
Liste des variables d’environnement et de leur valeur : env
Variables d’environnement standard :
— SHELL : interpréteur de commandes utilisé (bash, ksh, tcsh, ...)
— TERM : type de terminal utilisé (vt100, xterm, ...)
— HOME : répertoire d’accueil
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 149 2014-2015
19 VARIABLES SHELL MNI –19.4
Unix Extension de la portée d’une variable : variables d’environnement
— USER : identifiant (nom) de l’utilisateur
— PATH : liste des chemins de recherche des commandes séparés par des « : »
Quand on lance une commande ou un exécutable :
— avec / dans le nom, on précise le chemin d’accès explicitement :
par ex. ./[Link]
— sans / dans le nom, la recherche se fait dans tous les répertoires listés dans
PATH en respectant l’ordre, par ex. [Link]
Par exemple, echo $PATH montre que le répertoire courant n’est pas scruté.
/usr/local/bin:/bin:/usr/bin:/usr/X11R6/bin:/home/lefrere/bin
Si on l’ajoute à la fin, il est scruté en dernier :
PATH="${PATH}:." ; echo ${PATH} donne
/usr/local/bin:/bin:/usr/bin:/usr/X11R6/bin:/home/lefrere/bin:.
Ne pas placer le point au début du PATH pour des raisons de sécurité !
Attention : PATH="" ⇒ seules les commandes avec chemin sont trouvées
+ mémoire (cache) des chemins des commandes utilisées gérée par hash
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 150 2014-2015
19 VARIABLES SHELL MNI – Unix 19.5 Variables de localisation (langue, ...)
19.5 Variables de localisation (langue, ...)
— LANG,
— LC_ALL qui résume les suivantes
— LC_CTYPE détermine la classification des caractères ([:lower:] par ex.)
— LC_NUMERIC (détermine le séparateur décimal :
à positionner correctement pour awk),
— LC_COLLATE (qui influe sur l’ordre lexicographique : important pour le
classement avec sort et les expressions régulières avec des intervalles)
— LC_TIME pour la date et l’heure
— LC_PAPER A4 en Europe ou Letter aux États-Unis
— ...
Influent sur de nombreuses commandes (man, wc, awk, sort, ls, ...)
Affichées par la commande locale.
2 minuscules (langue) + _ + 2 majuscules (variante locale) + . + nom du codage
Exemples : C (norme POSIX), fr_FR.ISO-8859-1 ou fr_CA.UTF-8
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 151 2014-2015
19 VARIABLES SHELL MNI – Unix 19.6 Complément : valeur par défaut d’une variable
19.6 Complément : valeur par défaut d’une variable
Substitution avancée de variables : ${variable-valeur} donne
— la valeur de ${variable} si cette variable est définie
— valeur sinon
Exemple : ${TMPDIR-/tmp}
Variante ${variable:-valeur} qui rend la valeur par défaut
aussi lorsque la variable est définie mais vide.
Nombreuses autres constructions de ce type.
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 152 2014-2015
20 CARACTÈRES INTERPRÉTÉS PAR LE SHELL MNI – Unix
20 Caractères interprétés par le shell
20.1 Substitution de commande
Résultat d’une commande (sa sortie standard) → chaîne de caractères
stocké dans une variable ou repris comme argument d’une autre commande.
syntaxe
$(commande)
ou (ancienne syntaxe shell) avec des accents graves (backquotes) `commande`,
moins lisible, en particulier dans le cas d’imbrications.
Ne pas confondre ${variable} et $(commande).
— paramétrage de shell-scripts,
— calculs sur les entiers avec la commande expr,
— manipulation de noms de fichiers et de chemins avec les commandes
basename et dirname
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 153 2014-2015
20 CARACTÈRES INTERPRÉTÉS PAR LE SHELL MNI – Unix 20.1 Substitution de commande
Exemples
qui=$(whoami) ; echo ${qui} affectation de la variable puis affichage
echo je suis $(whoami) utilisation directe
echo la date est $(date)
echo la date est `date` ancienne syntaxe (Bourne shell)
#
s1=$(expr 12 + 2) calcul puis affectation à s1
echo la somme de 12 et 2 est ${s1}
⇒ la somme de 12 et 2 est 14
echo 12+2+1 vaut $(expr $(expr 12 + 2) + 1) imbrication
⇒ 12+2+1 vaut 15
#
sans_suffixe=$(basename [Link] .for) suppression du suffixe
source90=$(basename [Link] .for).f90 changement du suffixe
echo ${sans_suffixe} ${source90}
⇒ source source.f90
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 154 2014-2015
20 CARACTÈRES INTERPRÉTÉS PAR LE SHELL MNI – Unix 20.2 Métacaractères du shell
20.2 Métacaractères du shell
ou TAB espace ou tabulation : séparateur (IFS)
*, ?, [...] constructeurs de noms de fichiers
~ répertoire d’accueil
<, <<, >, >>, | redirections
$ ou ${...} évaluation de variable
$(...) ou `...` substitution de commande
; séparation de commandes
(...) {...} groupement de commandes
|| et && associations de commandes
! non logique
& lancement en arrière plan
# introducteur de commentaire
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 155 2014-2015
20 CARACTÈRES INTERPRÉTÉS PAR LE SHELL MNI – Unix 20.2 Métacaractères du shell
Les caractères de protection
Toujours deux étapes d’interprétation : le shell, puis la commande
1. En premier lieu, le shell interprète la ligne de commande
(espaces, caractères jokers, redirections, variables, ...)
2. Puis, la commande interprète certains caractères spéciaux pour elle.
(expressions régulières pour grep, sed, ...)
Généralement, ne pas exposer ces caractères à l’interprétation par le shell :
⇒ les protéger.
Protections :
\ protection individuelle du caractère suivant (backslash)
'...' protection forte (quote) : aucune interprétation
"..." protection faible (double quote) : substitution de paramètres ou
de commandes ($ interprété)
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 156 2014-2015
20 CARACTÈRES INTERPRÉTÉS PAR LE SHELL MNI – Unix 20.2 Métacaractères du shell
Exemples
— grep '^[0-9][0-9]*' fic
affiche les lignes de fic commençant par un chiffre
— Affectation d’une chaîne comportant des blancs à une variable ou à un
paramètre de commande : (nom de fichier avec des blancs)
v1="avec blanc1" ; v2='avec blanc2' ; v3=avec\ blanc3
echo ${v1}, ${v2}, ${v3}
⇒ avec blanc1, avec blanc2, avec blanc3
— echo ${TERM} \${TERM} "${TERM}" '${TERM}'
⇒ xterm ${TERM} xterm ${TERM}
— find ~lefrere -name '*.f90' -print
Sans protection, le shell remplace *.f90 par la liste des fichiers de suffixe
.f90 dans le répertoire courant avant l’exécution de find.
S’il y en a plus d’un, erreur de syntaxe sur find qui attend un seul paramètre
après name.
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 157 2014-2015
20 CARACTÈRES INTERPRÉTÉS PAR LE SHELL MNI – Unix 20.3 La commande expr
20.3 La commande expr
La commande expr évalue des expressions contenant des opérateurs
arithmétiques sur les entiers ou logiques ou portant sur des chaînes de caractères.
Chaque terme de l’expression à évaluer doit être séparé du suivant par un espace.
Protéger (par des \) les autres métacaractères de l’interprétation par le shell.
Utilisée pour affecter des valeurs à des variables
via une substitution de commande du type
var=$(expr ${var1} + ${var2})
Dans certains shells, syntaxes plus concises, du type c=$(($a+$b))
⇒ arithmétique plus rapide grâce aux commandes intégrées au shell
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 158 2014-2015
20 CARACTÈRES INTERPRÉTÉS PAR LE SHELL MNI – Unix 20.3 La commande expr
20.3.1 Opérateurs arithmétiques sur les entiers
+ somme
- différence (binaire) ou opposé (unaire)
* produit
/ quotient de la division entière
% reste de la division entière
Exemples
expr 3 \* 2 a=3
--> 6 a=$(expr ${a} \* 2)
expr 13 % 5 echo $a
--> 3 --> 6
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 159 2014-2015
20 CARACTÈRES INTERPRÉTÉS PAR LE SHELL MNI – Unix 20.4 Autres opérateurs
var1=3
var2=2 protéger * et ()
var3=$(expr 10 \* \( ${var1} + ${var2} \))
echo ${var3}
--> 50
20.4 Autres opérateurs
La commande expr permet aussi des comparaisons grâce aux opérateurs
binaires <, <=, =, !=, >, >=,
qui utilisent des métacaractères ⇒ à protéger d’une évaluation par le shell.
Résultat de la comparaison : (ne pas confondre avec test)
1 si la condition est réalisée
0 si elle n’est pas réalisée.
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 160 2014-2015
20 CARACTÈRES INTERPRÉTÉS PAR LE SHELL MNI – Unix 20.4 Autres opérateurs
Exemples
Ne pas confondre valeur affichée et statut de retour
expr 2 \> 1 expr 2 \< 1
--> 1 --> 0
echo $? echo $?
--> 0 --> 1
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 161 2014-2015
21 SHELL-SCRIPTS MNI – Unix
21 Shell-scripts
21.1 Fichiers de commandes ou shell-scripts
Fichier texte contenant des commandes, créé avec un éditeur de textes
Trois méthodes d’exécution :
1. bash fichier_de_cmdes éviter
2. puis rendre le script exécutable par chmod +x fichier_de_cmdes
et donner le chemin d’accès du fichier de commandes
./fichier_de_cmdes faire suivre des paramètres éventuels
3. Ajouter dans PATH le chemin d’accès au fichier. Saisir
fichier_de_cmdes
qui est alors une commande recherchée dans l’ordre du PATH
⇒ éviter les noms des commandes existantes sur le système
En pratique, répertoire courant (.) à la fin du PATH,
mais mieux : scripts dans ${HOME}/bin/ et ${HOME}/bin/ dans le PATH
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 162 2014-2015
21 SHELL-SCRIPTS MNI – Unix 21.1 Fichiers de commandes ou shell-scripts
Exemple de shell-script sans paramètre
#!/bin/sh
#
# shell script sans paramètre
echo nous sommes le ; date
echo mon login est $(whoami)
echo "le calculateur est $(hostname)"
# introduit les commentaires... sauf
sur la première ligne commençant par #!
⇒ précise le shell d’interprétation du script.
⇒ assure le portabilité du script
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 163 2014-2015
21 SHELL-SCRIPTS MNI – Unix 21.2 Les paramètres des scripts
21.2 Les paramètres des scripts
Variables positionnées dans la procédure lors du lancement :
$0 nom du fichier de commande (tel que spécifié lors de l’appel)
$1, $2, ... $9 paramètres positionnels (arguments) avec lesquels la procédure a été appelée
le nombre de paramètres peut dépasser 9
⇒ accéder au dixième paramètre via ${10}
$* chaîne formée par l’ensemble des paramètres d’appel "$1 $2 $3 ..."
$# nombre de paramètres positionnels lors de l’appel
$$ numéro du processus lancé (pid)
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 164 2014-2015
21 SHELL-SCRIPTS MNI – Unix 21.2 Les paramètres des scripts
Exemples de procédure avec des paramètres
#!/bin/sh
# fichier [Link]
echo la procédure $0
echo a été appelée avec $# paramètres
echo le premier paramètre est $1
echo la liste des paramètres est $*
echo le numéro du processus lancé est $$
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 165 2014-2015
21 SHELL-SCRIPTS MNI – Unix 21.2 Les paramètres des scripts
#!/bin/sh
# fichier [Link]
# permet de concatener (cf "cat") deux fichiers ($1 et $2)
# dans le fichier $3
# en habillant le résultat avec le nom
# des fichiers initiaux en entete
#
ficin1=$1
ficin2=$2
ficout=$3
echo commande $0 avec les $# parametres $*
echo et le numero de processus $$
echo "début de la concatenation de\
$ficin1 et $ficin2 sur $ficout"
echo '---------------------------------------' > $ficout
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 166 2014-2015
21 SHELL-SCRIPTS MNI – Unix 21.2 Les paramètres des scripts
echo \| $ficin1 \| >> $ficout
echo '---------------------------------------' >> $ficout
cat $ficin1 >> $ficout
echo '---------------------------------------' >> $ficout
echo \| $ficin2 \| >> $ficout
echo '---------------------------------------' >> $ficout
cat $ficin2 >> $ficout
echo termine
exit 0
# fin du fichier [Link]
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 167 2014-2015
21 SHELL-SCRIPTS MNI – Unix 21.3 La commande interne shift
21.3 La commande interne shift
shift permet de décaler d’une position les paramètres positionnels de la
procédure : utiliser après usage du premier ($1) car il est perdu par shift
$1 $2 $3 $4 $5 $6
a b c d e f n
b c d e f n
$1 $2 $3 $4 $5
F IGURE 20 – Décalage des paramètres positionnels par shift
shift suivie d’un entier p décale de p positions les paramètres.
shift utilisée dans une boucle sur les paramètres positionnels
d’une procédure pour se débarrasser des paramètres après leur prise en compte.
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 168 2014-2015
21 SHELL-SCRIPTS MNI – Unix 21.3 La commande interne shift
#!/bin/sh
# fichier [Link]
echo liste des $# paramètres : $*
echo décalage d\'une unité
shift
echo liste des $# paramètres : $*
echo décalage de deux unités
shift 2
echo liste des $# paramètres : $*
exit
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 169 2014-2015
21 SHELL-SCRIPTS MNI – Unix 21.4 Distinction entre $* et $@
[Link] aa b c ddd ee ff donne
liste des 6 paramètres : aa b c ddd ee ff
décalage d'une unité
liste des 5 paramètres : b c ddd ee ff
décalage de deux unités
liste des 3 paramètres : ddd ee ff
21.4 Distinction entre $* et $@
$@ est équivalente à $*, et contient la liste des paramètres positionnels. Mais ces
variables se comportent différemment si elles sont entourées de guillemets :
— "$*" représente la liste des paramètres en un seul mot c’est-à-dire
"$1 $2 $3 ..."
— "$@" représente la liste des paramètres avec un mot par paramètre soit
"$1" "$2" "$3" ....
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 170 2014-2015
21 SHELL-SCRIPTS MNI – Unix 21.5 Compléments sur la commande set
21.5 Compléments sur la commande set
set est une commande interne du shell aux usages multiples :
— set sans paramètre affiche la liste des variables et leur valeur
— set suivie d’une liste de mots affecte chaque mot à un paramètre positionnel
($1, $2, ...)
set aaa bbb "ccc d"
echo $# ⇒ 3
echo $1 ⇒ aaa
echo $2 ⇒ bbb
echo $3 ⇒ ccc d
— set -- pour affecter au premier paramètre une valeur commençant par -
set -- $(ls -al .profile)
echo le fichier $9 comporte $5 octets
— set -o affiche les options en cours du shell
set -o emacs ⇒ édition de la ligne de commande en mode emacs au lieu de vi
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 171 2014-2015
21 SHELL-SCRIPTS MNI – Unix 21.5 Compléments sur la commande set
— set suivie d’une option introduite par - (ou +) permet de positionner des
réglages du shell ; les options suivantes sont utiles dans la phase de mise au
point des procédures :
– set -v (verbose) affiche chaque commande (sans évaluation) avant de
l’exécuter
– set -x (xtrace) affiche chaque commande (précédée du signe +) après
évaluation des substitutions de commandes, $(...) et de variables,
${...} avant de l’exécuter
Plusieurs possibilités lors de la mise au point :
– Placer la commande set -vx en tête du shell-script
– Ajouter ces options à la ligne #!/bin/sh ⇒ #!/bin/sh -vx
– Lancer le script avec sh -vx shell-script
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 172 2014-2015
22 STRUCTURES DE CONTRÔLE EN SHELL (SH) MNI – Unix
22 Structures de contrôle en shell (sh)
22.1 Introduction
le shell = interpréteur de commandes
= langage de programmation
⇒ variables, paramètres des procédures
structures de contrôle
Pas de typage des variables ⇒ condition = code de retour des commandes
Mais souvent, code de retour de la commande test
Mots clefs réservés du shell : if, then, else, fi, elif, for, do, ...
Remarque : syntaxe différente en csh
⇒ préciser le shell dans les scripts par #!/bin/sh pour assurer la portabilité
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 173 2014-2015
22 STRUCTURES DE CONTRÔLE EN SHELL (SH) MNI – Unix 22.2 Conditions
22.2 Conditions
22.2.1 Structure if ... fi
syntaxe
if cmd
then
commande(s) (exécutées si le code de retour de cmd est 0)
else
commande(s) (exécutées si le code de retour de cmd est 6= 0)
fi
Partie else optionnelle.
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 174 2014-2015
22 STRUCTURES DE CONTRÔLE EN SHELL (SH) MNI – Unix 22.2 Conditions
Exemple avec la commande test
#!/bin/sh
if test $# -eq 0
then
echo commande lancée sans paramètre
else
echo commande lancée avec au moins un paramètre
fi
Exemple avec un tube
#!/bin/sh
# indique si l'utilisateur de nom $1 est connecté
if who | grep "^$1 " code de retour = celui de grep
then (grep rend 0 si le motif est trouvé)
echo $1 est connecté
fi
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 175 2014-2015
22 STRUCTURES DE CONTRÔLE EN SHELL (SH) MNI – Unix 22.2 Conditions
22.2.2 Structures if imbriquées : elif
Remplacer else if par elif ⇒ un seul fi (plus d’imbrication)
syntaxe
if ... if ...
then then
... ...
else if ... elif ...
then ⇒ then
... ...
else else
... ...
fi
fi fi (un seul)
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 176 2014-2015
22 STRUCTURES DE CONTRÔLE EN SHELL (SH) MNI – Unix 22.2 Conditions
Exemple de elif
#!/bin/sh
if test $# -eq 0
then
echo Relancer la cmde en ajoutant un paramètre
elif who | grep "^$1 " > /dev/null # sans affichage
then
echo $1 est connecté
else
echo $1 n\'est pas connecté
fi
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 177 2014-2015
22 STRUCTURES DE CONTRÔLE EN SHELL (SH) MNI – Unix 22.2 Conditions
22.2.3 Énumération de motifs (cas) : case ... esac
syntaxe
La valeur de la variable est
case variable in
comparée avec les motifs
motif1) commande(s)
successifs : à la première
;;
coïncidence, les commandes
motif2) commande(s)
associées au motif sont exé-
;;
cutées jusqu’au ;;, qui pro-
...
voque la fin de l’exploration.
esac
Syntaxe des motifs :
* = un nombre quelconque de caractères quelconques
[xyz] = l’un quelconque des caractères énumérés entre les crochets
[x-z] = l’un des caractères entre x et z dans l’ordre lexicographique
motif1|motif2|motif3 = un quelconque des motifs séparés par des |
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 178 2014-2015
22 STRUCTURES DE CONTRÔLE EN SHELL (SH) MNI – Unix 22.2 Conditions
Exemple
#! /bin/sh
echo ecrivez OUI
read reponse
case ${reponse} in
OUI) echo bravo
echo merci infiniment ;;
[Oo][Uu][Ii]) echo merci beaucoup
;;
o*|O*) echo un petit effort ! ;;
n*|N*) echo vous etes contrariant ;;
*) echo ce n\'est pas malin
echo recommencez ;;
esac
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 179 2014-2015
22 STRUCTURES DE CONTRÔLE EN SHELL (SH) MNI – Unix 22.2 Conditions
Remarques
Les motifs peuvent se recouvrir, mais seule la première coïncidence provoque
l’exécution de commandes
⇒ l’ordre des motifs est important.
En C-shell ou langage C, structure switch mais où chacun des motifs en
coïncidence provoque l’exécution de commandes.
Structure switch équivalente à case
...si chaque cas est terminé par breaksw / break;
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 180 2014-2015
22 STRUCTURES DE CONTRÔLE EN SHELL (SH) MNI – Unix 22.3 Les structures itératives
22.3 Les structures itératives
22.3.1 La structure for ... do ... done
syntaxe
for variable [in liste de mots]
do
commande(s)
done
Liste des mots par défaut : les paramètres du script
"$@" ("$1" "$2" "$3" ...)
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 181 2014-2015
22 STRUCTURES DE CONTRÔLE EN SHELL (SH) MNI – Unix 22.3 Les structures itératives
Exemple avec liste explicite
#! /bin/sh
for mot in 1 5 10 2 "la fin"
do
echo mot vaut ${mot}
done
⇒ boucle avec 5 passages
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 182 2014-2015
22 STRUCTURES DE CONTRÔLE EN SHELL (SH) MNI – Unix 22.3 Les structures itératives
Exemple avec liste implicite
soit le script [Link] [Link] 11 2 "3 3" 44
affiche
#! /bin/sh
for param +11+
do +2+
echo +${param}+ +3 3+
done +44+
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 183 2014-2015
22 STRUCTURES DE CONTRÔLE EN SHELL (SH) MNI – Unix 22.3 Les structures itératives
Liste générée par le joker *
#!/bin/sh
for fichier in *.f90
do
echo fichier ${fichier}
done
Procédure à un argument : le motif recherché
#!/bin/sh
motif=$1
for fic in $(grep -l ${motif} *)
do
echo le fichier $fic contient le motif $motif
done
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 184 2014-2015
22 STRUCTURES DE CONTRÔLE EN SHELL (SH) MNI – Unix 22.3 Les structures itératives
22.3.2 La structure until ... do ... done (jusqu’à ce que)
syntaxe
Les commandes entre do et done
until commande
sont exécutées jusqu’à ce que la com-
do
mande qui suit until rende un code
commande(s)
nul.
done
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 185 2014-2015
22 STRUCTURES DE CONTRÔLE EN SHELL (SH) MNI – Unix 22.3 Les structures itératives
Exemple Script qui boucle jusqu’à ce qu’un utilisateur se connecte :
#!/bin/sh
utilisateur=$1
until who | grep "^${utilisateur} " > /dev/null
do
echo ${utilisateur} n\'est pas connecté
sleep 2
done
echo ${utilisateur} est connecté
exit 0
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 186 2014-2015
22 STRUCTURES DE CONTRÔLE EN SHELL (SH) MNI – Unix 22.3 Les structures itératives
22.3.3 La structure while ... do ... done (tant que)
syntaxe
Les commandes entre do et done
while commande
sont exécutées tant que la commande
do
qui suit while rend un code nul.
commande(s)
done
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 187 2014-2015
22 STRUCTURES DE CONTRÔLE EN SHELL (SH) MNI – Unix 22.3 Les structures itératives
Exemple Script qui boucle jusqu’à ce qu’un utilisateur se déconnecte :
#!/bin/sh
utilisateur=$1
while who | grep "^${utilisateur} " > /dev/null
do
echo ${utilisateur} est connecté
sleep 2
done
echo ${utilisateur} n\'est pas connecté
exit 0
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 188 2014-2015
22 STRUCTURES DE CONTRÔLE EN SHELL (SH) MNI – Unix 22.4 Compléments : branchements
22.4 Compléments : branchements
22.4.1 La commande exit
exit [statut_de_fin] arrête l’exécution de la procédure
et rend le statut_de_fin (0 par défaut) à l’appelant.
Utilisé pour arrêter le traitement en cas d’erreur après envoi d’un message
⇒ rendre alors un code 6= 0
...
if [ $# -lt 1 ] # test sur le nb d'arguments
then
echo "il manque les arguments" >&2
# message sur sortie d'erreur
exit 1 # sortie avec code d'erreur
fi
...
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 189 2014-2015
22 STRUCTURES DE CONTRÔLE EN SHELL (SH) MNI – Unix 22.4 Compléments : branchements
22.4.2 La commande break
break ⇒ sortie d’une boucle avant la fin ;
break n sort des n boucles les plus intérieures.
Nécessaire dans les boucles a priori infinies (while true, until false)
insérée dans un bloc conditionnel pour arrêter la boucle
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 190 2014-2015
22 STRUCTURES DE CONTRÔLE EN SHELL (SH) MNI – Unix 22.4 Compléments : branchements
#!/bin/sh
# fichier [Link]
while true # boucle a priori infinie
do
echo "entrer un chiffre (0 pour finir)"
read i
if [ "$i" -eq 0 ]
then
echo '**' sortie de boucle par break
break # sortie de boucle
fi
echo vous avez saisi $i
done
echo "fin du script"
exit 0
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 191 2014-2015
22 STRUCTURES DE CONTRÔLE EN SHELL (SH) MNI – Unix 22.4 Compléments : branchements
22.4.3 La commande continue
continue saute les commandes qui suivent dans la boucle et reprend
l’exécution en début de boucle.
continue n sort des n − 1 boucles les plus intérieures
et reprend au début de la ne boucle.
insérée dans un bloc conditionnel pour court-circuiter la fin de boucle
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 192 2014-2015
22 STRUCTURES DE CONTRÔLE EN SHELL (SH) MNI – Unix 22.4 Compléments : branchements
#!/bin/sh
# fichier [Link]
for fic in *.sh
do
echo "< fichier ${fic} >"
if [ ! -r "${fic}" ]
then
echo "*************************"
echo "fichier ${fic} non lisible"
continue # sauter la commande head
fi
head -4 ${fic}
done
exit 0
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 193 2014-2015
22 STRUCTURES DE CONTRÔLE EN SHELL (SH) MNI – Unix 22.4 Compléments : branchements
22.4.4 La commande trap
trap intercepte les signaux envoyés à un processus en cours d’exécution et
exécute des commandes au lieu des actions habituellement requises par ces
signaux.
syntaxe
trap "action" liste de signaux à intercepter
action vide ⇒ signaux interceptés sans effet sur le processus
action="-" ⇒ restitue l’action normale des signaux
Exemple Suppression des fichiers temporaires avant l’arrêt d’un processus par
l’un des signaux INT KILL TERM.
trap "/bin/rm -f /tmp/fichier_tmp; exit 1" INT KILL TERM
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 194 2014-2015
22 STRUCTURES DE CONTRÔLE EN SHELL (SH) MNI – Unix 22.4 Compléments : branchements
1 #! /bin/sh
2 # fichier [Link]
3 for f in *
4 do
5 echo début de boucle $f
6 trap "echo fin provoquée par signal; \
7 exit 3" INT QUIT
8 echo "fin de boucle $f"
9 done
10 echo "fin de script"
11 exit 0
NB : l’ensemble des commandes déclenchées par trap (lignes 6 et 7) est délimité
par des guillemets ". Les deux commandes sont séparées par un point virgule ;
Il faut par ailleurs protéger le changement de ligne dans la chaîne par \.
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 195 2014-2015
22 STRUCTURES DE CONTRÔLE EN SHELL (SH) MNI – Unix 22.4 Compléments : branchements
22.4.5 Redirections et boucles
redirection (d’entrée ou de sortie) après done
⇒ s’applique à la structure itérative
Exemple
#!/bin/sh
# redirection et structure itérative
# version à conseiller
for i in 1 2 3
do
echo $i
done > resultat # redirection après done
exit 0
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 196 2014-2015
22 STRUCTURES DE CONTRÔLE EN SHELL (SH) MNI – Unix 22.4 Compléments : branchements
Éviter la méthode suivante :
#!/bin/sh
# redirection et structure itérative
# version à déconseiller
# partir d'un fichier vide
cat /dev/null > resultat
for i in 1 2 3
do
echo $i >> resultat # accumuler dans la boucle
done
exit 0
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 197 2014-2015
23 EXEMPLE COMMENTÉ D’UN SCRIPT MNI – Unix
23 Exemple commenté d’un script
23.1 Introduction
Comment passer tous les noms des fichiers d’un répertoire en minuscules ?
(le chemin du répertoire sera passé en argument de la commande)
Principales commandes utilisées :
— Changer le nom d’un fichier
mv FIC1.F90 fic1.f90
— Passer en minuscules (pas de signes diacritiques en UTF8)
tr '[:upper:]' '[:lower:]'
— Faire une boucle sur tous les fichiers du répertoire
for f in *
do
...
done
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 198 2014-2015
23 EXEMPLE COMMENTÉ D’UN SCRIPT MNI – Unix 23.2 Le cœur de script
23.2 Le cœur de script
for NOM in *
do
passer NOM en minuscules avec tr ⇒ nom
mv ${NOM} ${nom}
done
Mais tr est un filtre qui transforme l’entrée standard,
donc il faut afficher le nom initial sur la sortie standard par echo.
echo ${NOM} | tr '[:upper:]' '[:lower:]'
Puis récupérer la sortie standard de ce tube
dans une variable nom grâce à la syntaxe $().
nom=$(echo ${NOM} | tr '[:upper:]' '[:lower:]')
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 199 2014-2015
23 EXEMPLE COMMENTÉ D’UN SCRIPT MNI – Unix 23.3 Version minimale du script
23.3 Version minimale du script
#!/bin/sh
# fichier [Link]
# passage en minuscules des noms des fichiers d'un répertoire
# version minimale
cd $1
for NOM in *
do
# traduction du nom en minuscules
nom=$(echo ${NOM} | tr '[:upper:]' '[:lower:]')
# changement effectif du nom de fichier
mv ${NOM} ${nom} && echo ${NOM} '=>' ${nom}
done
echo "fin"
exit
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 200 2014-2015
23 EXEMPLE COMMENTÉ D’UN SCRIPT MNI – Unix 23.3 Version minimale du script
Problèmes :
— on peut écraser par exemple fic1 en traitant FiC1
⇒ ne pas renommer dans ce cas ... sauf si fic1 est vide.
⇒ vérifier si mv risque d’écrire sur un autre fichier déjà présent et non vide.
if [ "${nom}" != "${NOM}" ]
then # les noms diffèrent effectivement
echo on va essayer de changer ${NOM} en ${nom}
if [ -s "${nom}" ]
then # risque d'écraser un fichier non vide
echo ...
else
mv ${NOM} ${nom}
fi
fi
— que faire s’il ne s’agit pas d’un fichier ordinaire ?
⇒ ne pas renommer dans ce cas (répertoire par exemple)
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 201 2014-2015
23 EXEMPLE COMMENTÉ D’UN SCRIPT MNI – Unix 23.4 Version élémentaire du script
23.4 Version élémentaire du script
#!/bin/sh
# fichier [Link]
# passage en minuscules des noms des fichiers d'un répertoire
# version élémentaire
cd $1
for NOM in *
do
if [ -f "${NOM}" ]
then
# le fichier $NOM existe et est un fichier ordinaire
# traduction du nom en minuscules
nom=$(echo ${NOM} | tr '[:upper:]' '[:lower:]')
if [ "${nom}" != "${NOM}" ]
then
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 202 2014-2015
23 EXEMPLE COMMENTÉ D’UN SCRIPT MNI – Unix 23.4 Version élémentaire du script
# les noms diffèrent effectivement
echo "peut-on changer ${NOM} en ${nom} ?"
if [ -s "${nom}" ]
then # risque d'écraser un fichier non vide
echo ${NOM} devrait écraser ${nom} '=>' non traité >&2
else # changement effectif du nom de fichier
mv ${NOM} ${nom} && echo ${NOM} '=>' ${nom}
fi
fi
else
# le fichier n'existe pas ou n'est pas un fichier ordinaire
echo "${NOM} n'est pas un fichier ordinaire => non traité" >&2
fi
done
echo "fin"
exit
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 203 2014-2015
23 EXEMPLE COMMENTÉ D’UN SCRIPT MNI – Unix 23.4 Version élémentaire du script
Problème plus grave : que se passe-t-il si on ne passe pas d’argument ?
cd $1 ⇒ cd et on modifie les noms dans le répertoire d’accueil !
⇒ Vérifier s’il y a un argument,
sinon on peut choisir de travailler dans le répertoire courant.
S’il y a un argument, s’assurer que la commande cd $1 réussit,
ou plus précisément, arrêter le script si elle échoue.
if ! cd ${repertoire}
then
echo "$repertoire inaccessible" >&2
exit 2
fi
Ajouter quelques éléments de contrôle avec une liste avant et après les
renommages, mais sans déposer de fichier temporaire dans le répertoire de travail.
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 204 2014-2015
23 EXEMPLE COMMENTÉ D’UN SCRIPT MNI – Unix 23.5 Version plus robuste du script
23.5 Version plus robuste du script
#!/bin/sh
# fichier [Link]
# passage en minuscules des noms des fichiers d'un répertoire
# test sur le nombre d'arguments
case $# in
0) repertoire="."
;;
1) repertoire=$1
;;
*) echo erreur nombre d\'arguments
echo "usage: $0 [répertoire]" >&2
exit 1
;;
esac
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 205 2014-2015
23 EXEMPLE COMMENTÉ D’UN SCRIPT MNI – Unix 23.5 Version plus robuste du script
if [ ! -d "${repertoire}" ]
then
echo "${repertoire} n'est pas un répertoire => abandon" >&2
exit 2
fi
if ! cd ${repertoire}
then
echo "répertoire inaccessible => abandon" >&2
exit 2
fi
echo "passage en minuscules du nom des fichiers de $(pwd)"
echo 'Confirmez svp par O/N [N]'
OK=O
read reponse
if [ "${reponse}" != "${OK}" ]
then
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 206 2014-2015
23 EXEMPLE COMMENTÉ D’UN SCRIPT MNI – Unix 23.5 Version plus robuste du script
echo abandon demandé
exit 0
fi
TEMPFILE="/tmp/$(whoami).$$" # fichier temporaire de nom unique
ls -l > ${TEMPFILE} # liste avant modifications
for NOM in *
do
if [ -f "${NOM}" ]
then
# le fichier $NOM existe et est un fichier ordinaire
# traduction du nom en minuscules
nom=$(echo ${NOM} | tr '[:upper:]' '[:lower:]')
if [ "${nom}" != "${NOM}" ]
then # les noms diffèrent effectivement
echo "peut-on changer ${NOM} en ${nom} ?"
if [ -s "${nom}" ]
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 207 2014-2015
23 EXEMPLE COMMENTÉ D’UN SCRIPT MNI – Unix 23.5 Version plus robuste du script
then # risque d'écraser un fichier non vide
echo ${NOM} devrait écraser ${nom} '=>' non traité >&2
else # changement effectif du nom de fichier
mv ${NOM} ${nom} && echo ${NOM} '=>' ${nom}
fi
fi
else
# le fichier n'existe pas ou n'est pas un fichier ordinaire
echo "${NOM} n'est pas un fichier ordinaire => non traité" >&2
fi
done
ls -l > ${TEMPFILE}+ # liste après modifications
echo "Bilan"
diff ${TEMPFILE} ${TEMPFILE}+ # comparaison des listes
/bin/rm ${TEMPFILE} ${TEMPFILE}+ # ménage
exit 0
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 208 2014-2015
23 EXEMPLE COMMENTÉ D’UN SCRIPT MNI – Unix 23.6 Limitations
23.6 Limitations
— Fichiers cachés (commençant par « . ») non traités
⇒ remplacer for NOM in * par
for NOM in $(ls -a) (. et .. éliminés car répertoires)
— Pas d’action en cas de collision de noms,
mais on pourrait demander de saisir un autre nom
— On peut interrompre le déroulement en cours de boucle
⇒ insérer trap '...' INT pour nettoyer les fichiers temporaires
— Cas des noms comportant des caractères spéciaux non étudié
— tr ne traite que les caractères sur un octet,
⇒ aucun caractère accentué en UTF-8 dans les noms n’est traité
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 209 2014-2015
24 COMPLÉMENTS SUR LE SHELL MNI – Unix
24 Compléments sur le shell
24.1 Commandes internes
Certaines commandes intégrées au shell (builtin) ⇒ plus rapides, ne lancent pas
un nouveau processus, permettent d’affecter le shell courant...
cd, echo, pwd, read, set, ...
eval, exec, getopts, ...
Pas de man, sauf celui du shell, mais help cmde_interne
24.2 Exécution dans le shell courant
⇒ hériter des variables
en sh, bash ou ksh
. commande
Exemple : . .profile
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 210 2014-2015
24 COMPLÉMENTS SUR LE SHELL MNI – Unix 24.3 Autres commandes internes
24.3 Autres commandes internes
24.3.1 La commande eval
Dans certaines circonstances, nécessité de faire agir le shell 2 fois sur la ligne de
commande ⇒ double interprétation par le shell.
Cas le plus classique : accès au contenu du contenu d’une variable :
${${variable}} ⇒ utiliser eval
eval valeur=\${${variable}}
protéger le premier $ de la première interprétation par le shell,
sinon erreur de syntaxe
Exemple : affichage du dernier argument positionnel d’un script :
Si le script [Link] contient :
i=$#
echo variable \${${i}}
eval echo valeur \${${i}}
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 211 2014-2015
24 COMPLÉMENTS SUR LE SHELL MNI – Unix 24.3 Autres commandes internes
L’appel [Link] un deux trois
affichera le nom du dernier paramètre puis sa valeur, par exemple :
variable ${3}
valeur trois
24.3.2 La commande exec
exec commande vient remplacer le processus courant par celui de commande
Si exec commande est lancé en interactif, il y a fermeture du shell, donc de la
session à la fin de la commande. ⇒ exec csh pour passer en csh.
exec > fichier (sans commande) en début de script
⇒ redirection de sortie pendant tout le script.
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 212 2014-2015
24 COMPLÉMENTS SUR LE SHELL MNI – Unix 24.4 Divers
24.3.3 La commande getopts
getopts simplifie le découpage (parsing)
des paramètres optionnels passés à un script
24.4 Divers
24.4.1 Fonctions en shell
Fonctions prédéfinies et possibilité d’en définir ⇒ scripts plus modulaires
gfortran2003-mni ()
{
gfortran -Wextra -Wall -fimplicit-none -Wunused \
-ffloat-store -fbounds-check -Wimplicit-interface \
-fexceptions -pedantic -fautomatic -std=f2003 $* ;
}
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 213 2014-2015
24 COMPLÉMENTS SUR LE SHELL MNI – Unix 24.4 Divers
24.4.2 Alias du shell
Notion d’alias scrutés avant les commandes
Choix d’options des commandes existantes, raccourcis pour des commandes,...
alias ls='ls -F' force l’option -F (Flag)
alias rm='rm -i' force l’option de confirmation
alias la='ls -a' pour voir les fichiers cachés
\ls permet de retrouver la commande ls native.
24.4.3 Identifier une commande type
type permet de savoir comment est interprété un identificateur,
avec l’ordre de priorité suivant :
alias, mot-clef, fonction, commande interne, shell-script ou exécutable
type ls affiche ls est un alias vers « ls -F »
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 214 2014-2015
24 COMPLÉMENTS SUR LE SHELL MNI – Unix 24.4 Divers
24.4.4 Affichage d’une progression arithmétique seq
seq [premier [incrément]] dernier
seq affiche la progression arithmétique depuis premier jusqu’à dernier par
pas de incrément ; les paramètres optionnels = 1 par défaut.
Séparateur par défaut = retour ligne sauf option -s :
seq -s' ' 10 2 15 affiche 10 12 14
seq -s'/' 2 5 affiche 2/3/4/5
seq -s'-' 5 affiche 1-2-3-4-5
24.4.5 Récursivité
Un script peut s’appeler lui-même, tant que le nombre de processus lancés ne
dépasse pas la limite fixée par l’administrateur (voir ulimit).
Méthode récursive élégante, mais souvent peu performante.
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 215 2014-2015
24 COMPLÉMENTS SUR LE SHELL MNI – Unix 24.4 Divers
24.4.6 Fichiers d’initialisation du shell
En ksh et bash (différent avec csh et tcsh)
— /etc/profile pour tous au login
— ${HOME}/.profile ou ${HOME}/.bash_profile
personnels au login
— éventuellement le fichier défini par la variable ENV
${HOME}/.kshrc ou ${HOME}/.bashrc
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 216 2014-2015
25 AUTRES OUTILS MNI – Unix
25 Autres outils
25.1 Automatisation des tâches avec la commande make
Outil de gestion des dépendances entre des fichiers sur la base de leur date de
modification et de règles de dépendances.
Application la plus classique : reconstituer un programme exécutable à partir des
fichiers sources en ne recompilant que ceux qui ont été modifiés.
— cible (target) : fichier à produire
— règle de production (rule) : liste des commandes à exécuter pour produire une
cible (compilation pour les fichiers objets, édition de lien pour l’exécutable)
— dépendances : ensemble des fichiers nécessaires à la production d’une cible
Le fichier makefile liste les cibles, décrit les dépendances et les règles.
Il est construit à partir de l’arbre des dépendances.
make cible
lance la production de la cible en exploitant le fichier makefile
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 217 2014-2015
25 AUTRES OUTILS MNI – Unix 25.1 Automatisation des tâches avec la commande make
Exemple élémentaire de makefile pour du C
# première cible = celle par défaut
[Link] : float1d.o main.o
Arbre des dépendances
gcc float1d.o main.o
# cibles des objets
[Link]
float1d.o : float1d.c float1d.h
édition de lien
gcc -c float1d.c
float1d.o main.o
main.o : main.c float1d.h
compilation seule gcc -c main.c
# suppression des fichiers reconstructibles
float1d.c float1d.h main.c clean:
/bin/rm -f [Link] *.o
N.-B : une tabulation en début de ligne pour les règles de production
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 218 2014-2015
25 AUTRES OUTILS MNI – Unix 25.2 L’outil perl
25.2 L’outil perl
PERL = Practical Extraction and Report Language
— sous un même outil :
– manipulation des chaînes de caractères avec expressions rationnelles
(comme avec sed),
– listes, tableaux et tableaux associatifs,
– structures de contrôle (comme en [C]-shell),
– opérateurs arithmétiques et logiques (comme sous awk),
– fonctions, ...
— bibliothèques très riches (CPAN : Comprehensive Perl Archive Network)
— outil du domaine public porté sur plusieurs systèmes d’exploitation
[Link]
UPMC M1 P&A/SDUEE : MNI (4P009) 219 2014-2015