MALADIES MAI 2020

INFECTIEUSES

MÉTHODE

GUIDE POUR L'IDENTIFICATION

ET L'INVESTIGATION DE SITUATIONS
DE CAS GROUPÉS DE COVID-19
Ce guide a été rédigé par Santé publique France.

Il a été coordonné par la direction des régions et a bénéficié des contributions et de l’expérience
de professionnels de santé publique des ARS.

Cette version datée du 25 mai 2020 pourra faire l’objet d’une mise à jour ultérieure (son utilisation
et la capitalisation des expériences conduisant à faire évoluer ou à compléter certaines parties).

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 1
Sommaire
Préambule ...................................................................................................................................... 4

Objectif de ce guide ...................................................................................................................... 5

Situations concernées par ce guide ............................................................................................ 5

Définitions ..................................................................................................................................... 5
Une chaîne de transmission ........................................................................................................ 5
Une situation de cas groupés ou « cluster » ................................................................................ 6

Identification d’une chaine de transmission ou d’une situation de cas groupés .................... 6

Principe général .......................................................................................................................... 6
Origine des signaux ..................................................................................................................... 7
Signalements reçus par l’ARS ................................................................................................. 7
Signaux issus de systèmes de surveillance (détection active) ................................................. 8

Principe général de l’organisation et des actions à mener suite à un signalement ou

détection d’un regroupement de cas.......................................................................................... 9
Principe d’organisation ................................................................................................................ 9
Séquence des actions ............................................................................................................... 10

Préparation et déroulement de l’investigation (cf. fiches actions) ......................................... 11

Investigation active .................................................................................................................... 11
Suivi de l’investigation ............................................................................................................... 12
Analyse de l’évolution de la situation ......................................................................................... 12
Situation de maîtrise du cluster .............................................................................................. 12
Clôture du cluster ................................................................................................................... 12
Situation d’échappement du cluster ....................................................................................... 12
Moyens nécessaires .................................................................................................................. 13
Critères pouvant servir à évaluer le niveau de criticité afin de prioriser les investigations et les
moyens dédiés....................................................................................................................... 13
Estimation des moyens nécessaires à l’investigation ............................................................. 13
Protection des équipes .......................................................................................................... 14
Communication et rétro-information........................................................................................... 14
Remontée d’information lors du constat « d’échappement » du cluster .................................... 14

Informations nécessaires à l’investigation des cas groupés ................................................. 15

Des informations sans caractère identifiant pour les personnes ................................................ 15
Lors du signalement............................................................................................................... 15
Pour le bilan de fin du recueil passif ....................................................................................... 15
Des informations identifiantes pour les personnes..................................................................... 16
Des informations sur les cas .................................................................................................. 16
Des informations sur les contacts .......................................................................................... 16

Indicateurs à calculer pour le suivi épidémiologique des cas groupés au niveau régional
et national .................................................................................................................................... 16

Sécurités et confidentialité des données collectées ............................................................... 17

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 2
ANNEXES .................................................................................................................................... 18

Annexe 1 / Liste des fiches action ............................................................................................. 18

• Investigation cas groupés écoles (tous niveaux) .................................................................. 19

• Investigation cas groupés en EHPAD .................................................................................. 21
• Investigation cas groupés en établissement de soins .......................................................... 23
• Investigation cas groupés en crèche, garderie ..................................................................... 25
• Investigation cas groupés en milieu professionnel* .............................................................. 26
• Investigation cas groupés en milieu familial élargi................................................................ 28
• Investigation cas groupés dans des lieux de vie ou d’hébergement (structures sociales
ou médico-sociales, foyers de travailleurs…) ......................................................................... 30
• Investigation cas groupés lors d’un évènement public ou privé de rassemblements
temporaires de personnes (cérémonies religieuses, festivités…) ........................................... 32
• Investigation cas groupés transport terrestre (train, bus) ..................................................... 33
• Investigation cas groupés transports aériens ....................................................................... 34
• Investigation cas groupés transports maritimes ................................................................... 35
• Investigation cas groupés dans une communauté vulnérable (gens du voyage, migrants
en situation précaire, etc.) ...................................................................................................... 37
• Investigation cas groupés en établissement médicosocial (EMS)
de personnes handicapées .................................................................................................... 39
Investigation cas groupés en établissements pénitentiaires ................................................... 41
• Investigation cas groupés en Structures de l’aide sociale à l’enfance
(centres départementaux de l’enfance, foyers de l’enfance, maisons d'enfants à caractère
social) .................................................................................................................................... 42
• Investigation cas groupés en Structures de soins résidentiels des personnes sans domicile
fixe (Lits halte soins santé et Lits d’accueil médicalisés) ........................................................ 43

Annexe 2 / Élément d’aide au classement du niveau de criticité ................................................ 45

Annexe 3 / Logigramme pour l’enquête autour d’un cas en établissement de santé ................. 46

Annexe 4 / Tableau détaillé des ETP nécessaires par activité et type de cluster ...................... 49

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 3
Préambule
La levée des mesures de confinement liées à l’épidémie de COVID-19 et la reprise des activités de
la vie normale sont accompagnées d’un dispositif de contact-tracing.

Le contact-tracing (CT) a pour objectifs de limiter au maximum la diffusion du virus à partir des
nouveaux cas, de détecter et briser prospectivement les chaînes de transmission le plus rapidement
possible, et de détecter d’éventuels épisodes de cas groupés en vue de leur investigation et leur
contrôle. Les recommandations pour la réalisation des activités de contact-tracing et les éléments
épidémiologiques d’appui à celles-ci sont décrits dans un guide de Santé publique France 1.

Le Minsante N°99 modifié 2 dans sa version du 09/05/20 décrit le dispositif national de contact-
tracing et ses trois niveaux d’organisation 2.

Extrait : « Les ARS sont responsables de la coordination du dispositif de contact-tracing et de la

mise en œuvre du niveau 3 du dispositif. A ce titre, elles sont chargées des missions suivantes en
lien avec les cellules régionales de SpFrance :

• appui méthodologique, de sensibilisation et de formation au contact-tracing pour

les niveaux 1 et 2 en tant que de besoin et appui à la gestion des situations de contact-
tracing « atypique » rencontrés par le niveau 2 (information recueillie par l’agent du niveau
2 inhabituelle ou non couverte par les questionnaires cas et contacts par exemple) ;
• gestion des « situations complexes » : cas dans certaines collectivités et contacts
multiples pour un cas en un même lieu ou dans des mêmes circonstances, sur la base
d’un signalement par le niveau 2 ;
• détection des chaines de transmission et des clusters sur la base des données du
contact-tracing des niveaux 1 et 2 d’une part, et de l’analyse via SI-DEP de la distribution
spatio-temporelle des cas confirmés d’autre part (pouvant mettre en évidence des
regroupements de cas, même si ceux-ci ne se connaissent pas ou ne sont pas liés entre
eux d’après les données du contact-tracing des niveaux 1 et 2) ;
• intervention des équipes mobiles de réponse rapide multidisciplinaires
(investigations épidémiologiques de terrain et campagnes de test spécifiques) au niveau
de clusters identifiés ;
• production des indicateurs quotidiens du suivi du contact-tracing, en lien avec
l’Assurance Maladie. »

Le présent document s’intéresse plus particulièrement au troisième point qui concerne les étapes
de détection et de gestion des chaines de transmission et des situations de cas groupés
(clusters) d’infection à COVID-19, notamment dans les collectivités. Ces étapes sont réalisées par
les Agences régionales de santé (ARS) en lien avec les cellules régionales de Santé publique
France.

Les mesures de gestion autour des cas isolés survenant dans une collectivité ne font pas partie de
ce guide.

1. Guide méthodologique d’investigation des cas et des personnes-contacts, pour la réalisation du contact-tracing, durant la période
suivant le confinement. Santé publique France. Version au 28 avril 2020
2. Stratégie de contact-tracing post-confinement et aux modalités de sa mise en œuvre. Référence : Minsante n° 99 modifié 2 du
09/05/2020.

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 4
Objectif de ce guide
L’objectif de ce guide est de fournir un cadre commun aux professionnels intervenant au niveau 3
du dispositif de contact-tracing, pour :

• l’identification des situations de chaines de transmission ou cas groupés ;

• leur investigation ;
• la proposition de mesures de contrôle spécifiques (fermeture de structures par exemple), en
fonction de types de situations rencontrées ;
• la définition des moyens nécessaires pour chacune de ces étapes.
Ce cadre a vocation à être adapté aux organisations régionales mises en place, et partagé avec les
délégations départementales de l’ARS et les plateformes de l’assurance maladie.

Il est complété de fiches actions en fonction des lieux ou circonstances de survenue des clusters.
Celles-ci pourront évoluer par capitalisation d’expérience et peuvent être utilement adaptées au
contexte de chaque région. De même, en fonction de l’évolution du cluster (diffusion en dehors de
la collectivité par exemple), les investigations doivent être élargies autour de la collectivité afin
d’identifier et rompre toutes les chaines de transmission.

Situations concernées par ce guide

Les situations qui seront prises en charge par le niveau 3, sont :

• les chaines de transmission et les situations de cas groupés dans toute collectivité ou
communauté, incluant les clusters dans des établissements de santé, sociaux ou médico-
sociaux, dans des écoles, en milieu pénitentiaire, en milieu communautaire (augmentation
du nombre de cas dans un village par exemple ou encore les situations présentant un
caractère complexe) ; afin de proposer la mise en œuvre de mesures de contrôle spécifiques
(fermeture de structures par exemple). Les définitions de cas et celles de situations de cas
groupés sont précisées pour chaque type de collectivité dans le Minsante N°99 modifié 2 du
09/05/2020 et reprises dans les fiches action en annexe de ce document ;

• les cas ayant eu des contacts multiples lors d’un rassemblement ou en collectivité
(établissement scolaire, entreprise, établissement médico-social, établissement de santé).

Définitions

Une chaîne de transmission

Une chaîne de transmission est définie par la séquence identifiée d’au moins 3 personnes malades
successivement ([1 puis 2) ou [1 puis 1 puis 1]) dont une au moins est un cas confirmé et pour
lesquelles la chronologie de leurs contacts est cohérente avec une transmission du virus entre elles
(délai entre 2 cas d’environ 4 à 7 jours).

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 5
Une situation de cas groupés ou « cluster »

Un cluster ou épisode de cas groupés est défini par la survenue d’au moins 3 cas confirmés ou
probables, dans une période de 7 jours, et qui appartiennent à une même communauté ou ont
participé à un même rassemblement de personnes, qu’ils se connaissent ou non. Ces situations
incluent de manière non exhaustive des cas groupés familiaux élargis, en milieu professionnel, dans
un lieu d’enseignement, de villégiature ou de détention, ou chez des personnes habitant une
commune de petite taille ou qui ont voyagé ensemble de façon prolongée (ex : croisière, bateau).

Les définitions de cas confirmé, cas probable, cas possible, personne contact à risque, personne
contact à risque négligeable sont détaillés dans d’autres documents de référence (guide du contact-
tracing et Minsante N°99 modifié 2 du 09/05/2020) et mises à jour sur le site de SpFrance.

Identification d’une chaine de transmission

ou d’une situation de cas groupés

Principe général

L’identification d’une chaine de transmission ou de cas groupés de Covid-19 peut se faire selon deux
modalités principales : via le signalement au point focal régional de l’ARS (ou via la plateforme
alerte) ou par les plateformes de l’assurance Maladie qui doivent signaler à l’ARS sans délais les
suspicions de clusters ; par détection lors des enquêtes autour des cas ou de leurs contacts ; ou à
partir de données de surveillance épidémiologique (virologie, passages aux urgences, consultations
SOS médecins…). Pour ces dernières, le délai de remontée et de consolidation des données peut
être de plusieurs jours, ce qui en fait un moyen d’identification des cas groupés moins réactif que le
signalement immédiat.

En premier lieu, il est important d’insister sur l’importance de la formation et de la sensibilisation au

signalement dans un objectif de santé publique. La veille et la culture du signalement à chacun des
niveaux du dispositif de contact-tracing, notamment les niveaux 1 et 2, mais également dans les
collectivités, et la réactivité de signalement constituent le principal levier d’intervention rapide.

Dans ce cadre, le niveau 3 doit mettre en place :

• la formation des équipes des niveaux 1 et 2 à l’identification et signalement des suspicions

de regroupement de cas, ainsi qu’une actualisation régulière des connaissances et des
définitions ;

• une sensibilisation active et régulière des collectivités et professionnels pouvant

identifier des regroupements de cas, dans l’objectif de favoriser la culture du signalement de
santé publique ;

• une organisation dans chaque région permettant de garantir l’exhaustivité du

signalement de ces événements et la qualité du traitement du signal (validation et
évaluation de la menace) dans un cadre collectif et réactif. Le mode de fonctionnement
en plateforme de veille et gestion sanitaire, associant équipes ARS et équipes régionales de
SpFrance est le format qui doit être privilégié, organisation éprouvée s’appuyant sur un
échange et un partage d’information réciproque. Ces principes sont définis a priori et des
concertations régulières permettent la validation des signalements reçus, leur évaluation et
de préciser au cas par cas les modalités d’investigation et de suivi ;

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 6
En second lieu, le niveau 3 organise une analyse et synthèse des informations collectées via les
différentes sources disponibles avec un partage d’information et d’expérience entre les équipes
intervenant pour le niveau 3 mais également le niveau 2, partage d’informations pouvant prendre la
forme de réunions quotidiennes de clôture de journée.

Enfin, une approche cartographique sera mise en place à partir des données des résultats des tests
biologiques issues du système SI-DEP afin d’identifier des zones à plus forte circulation virale
pouvant suggérer l’existence de clusters. Ce dispositif est un outil de surveillance qui ne remplace
pas les deux précédents et ne peut être utilisé seul pour valider des clusters. Il est complémentaire
et doit permettre d’identifier des regroupements temporo-spatiaux au niveau de la population dans
une région et éventuellement en inter régional. Cette analyse vient en complément du travail de
veille réalisé quotidiennement par les niveaux 1 à 3, sans le remplacer.

Origine des signaux

Signalements reçus par l’ARS

Les signalements de suspicion de cas groupés ou d’une chaine de transmission reçus à l’ARS sont
analysés selon les procédures habituelles mises en place au sein des plateformes de veille et
gestion sanitaire des ARS (réception – validation – évaluation de la menace). Les signalements
auront principalement pour origine :

• les particuliers (cas, contacts, autres),

• les professionnels de santé,
• des institutions (mairie, communauté, établissement, associations, entreprises...).

Les signalements de regroupement de cas sont généralement transmis à la plateforme de réception

des signaux de l’ARS par la direction et/ou le service de médecine du travail de l’établissement et/ou
les équipes opérationnelles d’hygiène (EOH) dans le cas d’établissements de santé.

La plateforme assurance maladies mise en place pour le Covid (niveau 2)

Lors de l’identification d’une chaine de transmission ou d’une situation de cas groupés, le

superviseur de la plateforme de l’assurance maladie contacte sans délais les référents désignés par
l’ARS, afin que le signalement puisse être pris en charge par la plateforme de l’ARS (niveau 3).

Extrait du DU MINSANTE N°99 modifié 2 09/05/2020: « La suspicion ou l’identification d’une

chaine de transmission (au moins 3 cas - 1 puis 2 ou 1 puis 1 puis 1 - avec des délais entre deux
cas cohérents avec une transmission du virus) ou d’un cluster (épisode de cas groupés défini
par la survenue d’au moins 3 cas confirmés ou probables TDM+, dans une période de 7 jours,
appartenant à la même communauté ou ayant participé à un même rassemblement de
personnes, qu’elles se connaissent ou non) par le niveau 2 fait également l’objet d’un
signalement au niveau 3 par un appel doublé d’un mail du référent médical territorial de la
plateforme de l’Assurance Maladie à l’ARS (et par l’indication spécifique prévue à cet effet dans
« Contact COVID »). Le signalement doit être réalisé sans délai afin que cette situation fasse
l’objet d’une investigation épidémiologique spécifique de l’ARS en lien avec la Cellule régionale
de Santé publique France, et le cas échéant de la mobilisation d’une équipe de terrain dédiée
pour assurer la prise en charge d’un grand nombre de personnes. Les modalités précises du
contact-tracing pour ces situations sont définies au cas par cas entre le niveau 2 et le niveau 3.

Dans l’objectif d’identification d’éventuels clusters, la situation particulière d’1 cas ayant eu
11 contacts à risque ou plus au sein d’un même lieu (ouvert ou fermé) ou dans des mêmes
circonstances (rassemblement de personnes par exemple, campements, bidonvilles, squats…)
est systématiquement signalée par le niveau 2 à l’ARS par la transmission sans délai par mail

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 7
 d’une fiche navette et l’indication prévue à cet effet dans la base « Contact COVID » (NB : le
nombre de personnes pouvant se rassembler est limité au 11/05 à 10 personnes ). Les
regroupements de personnes inférieurs à 11 doivent toutefois être examinés au niveau 2 avec
attention pour repérer d’éventuelles situations à risque de devenir un cluster.

Les ARS auront également accès à l’ensemble des données du contact-tracing des niveaux 1
et 2 colligées dans la base « Contact COVID » (par extraction de données dans un premier
temps, puis très rapidement par accès direct à la base par login+mdp), leur permettant de réaliser
des analyses complémentaires pour détecter les chaines de transmission et les clusters.

A noter enfin qu’une suspicion de cas groupés ou d’une chaîne de transmission peut être notifiée
directement à l’ARS via la plateforme alerte dans le cadre de ses missions d’alerte, par exemple
par un médecin, un employeur, un directeur d’école ou d’un établissement médico-social, etc.
L’ARS devra s’assurer de l’intégration de ce signalement au dispositif de contact-tracing. »

Les établissements de santé

Les établissements de santé (ES) ont une action de contact-tracing interne, d’analyse du risque et
de contrôle dès le premier cas (patient, soignant, visiteur). Face à la survenue de cas groupés, les
ES déclenchent en interne immédiatement des actions d’identification des sujets contacts,
d’évaluation de leur risque, et des mesures de contrôle (EOH, médecine du travail). Une conduite à
tenir a été élaborée par Santé publique France, les CPIAS, l’APHP et le GERES (Annexe 3).

Le niveau 3 (ARS / cellule régionale SpFrance / CPIAS) en est informé entre autres en raison des
possibilités de conséquences communautaires de tels événements. Les signalements de cas
groupés survenus parmi les soignants ou les cas nosocomiaux sont transmis à l’ARS et au CPIAS
via le portail e-SIN. Par ce portail, le CPIAS est informé en raison des possibilités de conséquences
inter-établissements de santé par les biais des transferts de patients avant la découverte du cluster.

Signaux issus de systèmes de surveillance (détection active)

Détection à partir des données de laboratoires (base SI-DEP)

La surveillance de l’activité diagnostique biologique (virologie RT-PCR) est un des piliers du

dispositif. Il est prévu que ces résultats soient colligés en temps réel à partir de toutes les sources
de diagnostic (publiques et privées) incluant l’identification des personnes prélevées, l’âge, le sexe,
le lieu de diagnostic et la commune de résidence. La base de données SI-DEP, sera directement
accessible aux acteurs de contact-tracing des niveaux 2 et 3 de la région.

Santé publique France aura accès à une base de données « pseudonymisée » à l’échelle de la
commune et proposera une approche cartographique afin d’identifier des zones à plus forte
circulation virale pouvant suggérer l’existence de clusters. Dans un second temps, un travail sera
mené pour étudier la pertinence de mise en place d’une méthode statistique de détection de
regroupement temporo-spatial de cas compte tenu du mode de transmission de la maladie.

Détection à partir des données de contact-tracing (base Contact COVID)

Les ARS auront également accès à l’ensemble des données du contact-tracing des niveaux 1 et 2
colligées dans la base « Contact COVID » développée par l’Assurance maladie et permettant de
réaliser des analyses complémentaires pour détecter les chaines de transmission et les clusters à
partir des données d’investigation collectées lors des interrogatoires des cas et des personnes
contacts à risque par le Niveau 2. Ces données pourront contribuer à identifier des chaines de
transmission ou cluster.

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 8
Détection à partir de la surveillance dans les établissements médico-sociaux (EMS) 3

Un système de surveillance via une application Voozanoo, est en place pour tous les établissements
pour personnes âgées (EHPAD), et tous les autres types d’établissements médico-sociaux
hébergeant des résidents (personnes handicapées, foyers pour enfants, foyers de migrants, foyers
de jeune travailleurs…). L’objectif est d’identifier précocement une circulation virale au sein de ces
établissements de manière très réactive, afin que les ARS (niveau 3) puissent mettre en œuvre les
mesures de contrôle.

Pour les clusters en établissements de santé ou médico-sociaux, l’ARS dispose de tout le concours
des équipes opérationnelles d’hygiène (EOH) des établissements de santé et du Centre d’appui à
la prévention des infections associées aux soins (CPias).

Détection à partir des données de surveillance syndromique (Oscour, SOS médecin)

La surveillance syndromique basée sur les consultations en médecine de ville (SOS médecins) ou
dans les services d’urgences de la région contribue au dispositif épidémiologique de suivi du Covid-
19 par Santé publique France. Une augmentation soudaine et localisée à un établissement ou à des
établissements d’une même zone géographique du recours à la médecine de ville ou aux urgences
peut constituer un signal de cas groupés et nécessite d’être investiguée par le niveau 3 comme
indiqué ci-dessus.

Principe général de l’organisation et des actions

à mener suite à un signalement ou détection
d’un regroupement de cas

Principe d’organisation

L’organisation proposée repose sur :

• une instance régionale de coordination et de pilotage. Cette instance bénéficie de l’appui

de la cellule régionale de Santé publique France qui apporte son expertise épidémiologique
aux actions de formation/sensibilisation, à la surveillance, à l’identification des clusters et à
leur investigation, et fait également le lien avec le niveau national de Santé publique France ;

• une déclinaison départementale en coordination avec l’instance régionale, indispensable

pour une plus grande réactivité et une optimisation de la gestion au niveau local ;

• des équipes mobiles d’investigation pré positionnées au niveau départemental. Dans

le cas où l’investigation du cluster à distance s’avère difficile ou compliquée pour guider
efficacement les mesures de gestion (en cas de situation complexe ou en présence d’un
nombre élevé de cas et de contacts, ou en l’absence de réduction de la circulation virale
malgré des mesures de gestion mises en place par exemple), une équipe mobile
d’investigation de cluster est déclenchée par le niveau 3 du dispositif, en lien avec la cellule
régionale de Santé publique France et la déclinaison départementale de l’ARS (DD-ARS
notamment). Elle comprend un médecin ou infirmière de santé publique de l’ARS,
éventuellement renforcés d’autres agents ARS, d’un ou plusieurs épidémiologiste(s) de la
Cellule régionale de Santé publique France si nécessaire et de personnels extérieurs à

3. Le contact-tracing de niveau 3 pour les ESMS notamment les EHPAD ne remet pas en question le dispositif de surveillance sanitaire
dans le cadre du signalement des décès et des cas de COVID-19 via le portail des signalements/Voozano.

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 9
 mobiliser en fonction de la situation auprès des services d’hygiène de la ville, de PMI, de la
médecine scolaire et de l’éducation nationale, de la médecine du travail, des équipes
opérationnelles et mobiles d’hygiène (EOH et EMH), ou d’associations (CLAT par exemple).
Dans certains départements, ces équipes mobiles peuvent être composées d’opérateurs
indépendants agissant à la demande de l’ARS pour son compte le temps de l’investigation.
Ces personnes seront formées à l’investigation épidémiologique de terrain. L’équipe mobile
mène l’investigation en interrogeant les cas et les contacts, elle évalue la situation locale et
les modalités à mettre en œuvre pour contrôler l’extension du cluster. Un dépistage de tous
les cas et les contacts peut être décidé et organisé sur place par des équipes de préleveurs
(laboratoires, hôpitaux, SDIS, professionnels de santé) ou dans un centre dédié Covid ou
dans des laboratoires en fonction de la situation. La stratégie de dépistage est définie par
l’ARS. Les mesures de gestion en dehors des mesures immédiates déjà mises en œuvre
seront complétées par le niveau 3 en fonction des premiers résultats de l’investigation.

Séquence des actions

Les fonctions sont réparties au sein des équipes constituant le niveau 3 du dispositif de contact-
tracing. Les grands principes proposés sont décrits ci-dessous :

• Dès la réception du signal, le niveau 3 en lien avec la délégation départementale (selon

l’organisation choisie) fait une analyse rapide de la situation et valide le signal.

• Les premières mesures de gestion sont mises en place et l’investigation est préparée à
l’aide des fiches actions de ce guide. Ces mesures peuvent inclure des actions de dépistage
élargies d’emblée. Si cela s’avère nécessaire, un protocole d‘investigation spécifique peut
être rédigé.

• La délégation départementale en lien avec l’instance régionale mène l’investigation du

cluster avec l’équipe mobile si un déplacement sur le terrain est nécessaire (cf. fiches
actions).

• Les données des cas et des contacts sont saisies dans l’outil choisi localement par
l’ARS. Cette base de données contenant des informations individuelles à caractère
personnel doit respecter les règles de protection des données personnelles et les critères de
sécurisations des flux et des accès.

• Une analyse épidémiologique est réalisée quotidiennement, ainsi qu’un bilan

hebdomadaire pour accompagner le suivi et évaluer les mesures de gestion, incluant les
indicateurs caractéristiques de chaque cluster (cf. détail plus bas). Les données produites
sont agrégées dans le respect des critères d’anonymat.

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 10
 I FIGURE 1 I

Séquence de réception et traitement des signalements de cas groupés au sein du niveau 3

du dispositif de contact-tracing COVID-19

Préparation et déroulement de l’investigation

(cf. fiches actions)
L’investigation d’un cluster COVID-19 doit être réalisée sans délai, et a pour objectifs opérationnels
la description de la transmission, le repérage de critères de sévérité rendant son impact plus
important ou son contrôle plus difficile, l’identification des options de gestion possibles d’emblée ou
après acquisition d’informations permettant d’envisager de rompre les chaines de transmission. À
défaut de contrôler le cluster, ce qui est possible sous certaines conditions, le freinage de son
expansion reste un objectif important. Un retour vers une circulation communautaire persistante est
possible en cas d’échappement. Dans ces conditions plusieurs phases sont à considérer :

Investigation active

Cette première phase doit être mise en œuvre dans les meilleurs délais et analysée en temps réel,
au vu des délais habituels observés entre la survenue de 2 générations de cas (4 à 7 jours). Elle
doit permettre l’identification d’une ou plusieurs chaînes de transmission avec une estimation du
nombre de générations de cas.

Simultanément à la prise des premières mesures de contrôle, l’investigation, sur place ou à distance,
déléguée partiellement à des opérateurs, a pour but de décrire le contexte de survenue du cluster,
de caractériser les chaines de transmission, leur nombre, leur extension géographique ou

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 11
populationnelle, et d’analyser le risque que ce cluster soit à un stade nécessitant des mesures de
contrôle d’ampleur ou d’échelle géographique supérieures. Les investigations doivent être faîtes
autant que possible à distance pour ne pas exposer inutilement des agents.

Cette phase doit s’accompagner d’une analyse de la pertinence d’un dépistage ciblé ou large ayant
pour but d’identifier les cas peu-symptomatiques voire asymptomatiques contribuant éventuellement
à la transmission.

Cette phase est très consommatrice de ressources. Elle doit permettre une description et une
compréhension la plus complète possible de l’évènement pour mettre en place des mesures
additionnelles de gestion si nécessaire.

Suivi de l’investigation

La phase 2 est une phase de suivi évolutif par recueil passif des informations descriptives de
nouveaux cas éventuels et de résultats d’actions de dépistage.

Le passage à cette phase doit permettre de libérer des ressources pour de nouvelles investigations
de clusters. Un retour en phase 1 ne doit pas être exclu dans certains cas.

Analyse de l’évolution de la situation

L’analyse doit renseigner sur la capacité à contrôler le cluster.

Situation de maîtrise du cluster

• Diminution régulière du nombre de cas confirmés et probables,

• Diminution du nombre de contacts et mesures d’isolement respectées,
• Maitrise des chaines de transmission,
• Efficacité des mesures de gestions pour contenir le cluster.

Dans cette configuration, la probabilité de survenue d’un nouveau cas est fortement diminuée.

Clôture du cluster

Si aucun nouveau cas n’a été rapporté après le délai de 14 jours depuis la date de début des signes
(ou de diagnostic) du dernier cas rattaché au cluster et que la quatorzaine de tous les contacts est
terminée, la levée des mesures contraignantes peut être envisagée. Le signal est clôturé. La
décision de clôture est de la responsabilité de l’ARS après proposition des équipes d’investigation.

Situation d’échappement du cluster

• Pas de diminution du nombre de nouveaux cas confirmés et probables,

• Augmentation du nombre de contacts et difficulté de mise en œuvre de leur isolement
• Persistance de chaines de transmission non identifiées,
• Peu d’efficacité des mesures de gestions pour contenir le cluster.

La poursuite de l’investigation peut mobiliser un nombre de plus en plus important d’enquêteurs sans
pouvoir maitriser l’évolution du cluster. L’issue de cette phase peut être de considérer la reprise
d’une circulation diffuse communautaire nécessitant une surveillance populationnelle et des

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 12
mesures de gestion plus macroscopiques (limitation des déplacements, arrêt de l’activité concernée,
jusqu’au confinement sectorisé).

Moyens nécessaires

Critères pouvant servir à évaluer le niveau de criticité afin de prioriser

les investigations et les moyens dédiés

L’annexe 2 propose des critères pouvant permettre de prioriser les investigations et les moyens
dédiés. En premier lieu le principe est bien de détecter le plus tôt possible tout regroupement de cas
et de mettre en place les premières mesures de contrôle et une investigation. Toutefois, selon les
situations rencontrées, il peut être nécessaire d’organiser les moyens à déployer en fonction du
niveau de criticité du signalement de cas groupés à investiguer. Les critères présentés sont
empiriques et pourront évoluer en fonction des expériences capitalisées.

L’analyse du niveau de criticité doit dans tous les cas être menée de façon collégiale et partagée.
Cette analyse doit pouvoir également être ré évaluée en fonction des premiers éléments recueillis
lors de l’investigation.

La sensibilité médiatique du cluster doit également être évaluée par l’ARS indépendamment des
critères épidémiologiques.

Estimation des moyens nécessaires à l’investigation

Ces estimations sont basées sur les besoins requis par des situations différentes. Elles sont fournies
à titre indicatif et ne recouvrent pas toute l’activité de « gestion de crise ARS » très variable selon
les situations, ni les activités d’opérateurs extérieurs (brigades ou équipes effectuant du recueil de
données sur place, organisation de solutions hôtelières, dépistage élargi…) ou de préfectures en
appui.

Les ETP considérés distinguent les tâches d’investigation, de la gestion des sujets contacts, de
l’organisation générale, selon les paramètres ci-dessous (tableau) pour les missions des
organisations de niveau 3 pour les clusters. Le temps de recueil de données sur le terrain n’est pas
pris en compte, dans la mesure où cette option ne sera pas systématique et où les temps
consommés varient beaucoup selon les situations.

L’estimation des besoins RH pour les activités liées à la détection et investigation des clusters au
sein des plateformes de niveau 3 est aussi basée sur deux scénarios :

• cluster en milieu ou groupe restreint (évènement familial limité ou petite collectivité) : il s'agit
d'un scénario « scénario bas » ;

• cluster en milieu plus « ouvert ou large » : scénario moyen/haut.

Outre la taille, il faut en effet considérer une différence entre ces scénarios pour le nombre de
contacts par cas : 5 pour le premier scénario car ils ont des contacts communs et 10 pour le second
scénario. Le nombre de sujets contacts s’épuise au fur et à mesure de l’investigation.

Néanmoins, il s’agit ici d’estimations qui ne prennent pas en compte les contacts communs entre
plusieurs cas, ce qui aurait pour effet de réduire le nombre de contacts par cas.

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 13
 I TABLEAU 1 I

Paramètres à prendre en compte pour le dimensionnement des moyens

TÂCHE PARAMÈTRES TEMPS

INVESTIGATION Appel d’un cas confirmé 30 minutes
Saisie d’un cas confirmé 5 minutes
Cluster : saisie des questionnaires, analyse et réalisation des bilans 12h au total
Point interne quotidien 30 minutes
GESTION Appel d’un contact 15 minutes
DES CONTACTS
Saisie d’un contact 1 minute
Suivi quotidien d’un contact 5 minutes par jour
ORGANISATION Cas simples : réunions 2h par jour
Cluster : organisation des plateaux d’appel et formation des appelants 4h par cluster
+ réunions

Protection des équipes

Lorsqu’un déplacement sur le terrain est prévu, la préparation de l’investigation doit intégrer une
évaluation des risques individuels pour les agents qui doivent être équipés du matériel nécessaire
(masques chirurgicaux, SHA). Les moyens de transport utilisés doivent également permettre d’éviter
de partager un lieu confiné pendant un temps prolongé (par exemple, pour les trajets en voiture de
longue durée, un nombre minimum d’occupants est préconisé et doit s’accompagner du port du
masque durant le trajet).

En retour d’investigation, un débriefing doit permettre de juger d’expositions potentielles devant

conduire le cas échéant à une quatorzaine de personnels de l’équipe d’investigation.

Communication et rétro-information

La communication doit être discutée en fonction de la situation rencontrée. L’objectif principal étant
d’informer la population dans un objectif de prévention du risque. L’équipe en charge de
l’investigation doit être protégée des demandes de communication qui doivent être assurée par un
niveau de coordination.

La rétro-information a pour objectif la sensibilisation des populations et acteurs impliqués dans un

objectif de renforcement du signalement et des mesures de contrôle. Elle doit également intégrer
une évaluation de l’efficacité des mesures de contrôle.

Remontée d’information lors du constat « d’échappement »

du cluster

Le constat « d’échappement du cluster », c’est-à-dire de non efficacité des mesures de contrôle doit
être signalé sans délais au niveau régional (CRAPS) et national selon les procédures habituelles de
remontées des alertes.

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 14
Informations nécessaires à l’investigation
des cas groupés
Les informations ci-dessous sont nécessaires à la conduite des investigations et à l’évaluation de la
situation épidémiologique. Elles doivent être recueillies par les équipes d’investigation et partagées,
dans une logique métier, au sein du niveau 3 et de la plateforme de veille sanitaire de l’ARS, comme
cela est le cas pour tout type d’investigation de cas groupés de maladies infectieuses.

Des informations sans caractère identifiant pour les personnes

Lors du signalement
• Localisation (nom de la collectivité éventuelle concernée et adresse, code postal)
• Nature de la collectivité (type d’institution le cas échéant, effectif)
• Facteurs de vulnérabilité associés à cette collectivité : conditions de vie, précarité sociale,
promiscuité…
• Type de cluster (milieu scolaire, familial, familial élargi, autre collectivité, transport,
géographique…)
• Date de signalement du cluster à l’ARS
• Origine du signalement
• Date de validation du signal
• Lien du cluster avec des cas d’une autre région
• Date début d’investigation
• Structure en charge de l’investigation
• Indicateurs de sévérité/complexité
• Délai entre la date des signes (DDS) du premier cas et le signalement/identification du
cluster
• Nombre de cas (confirmés ou probables / possibles)
• Dont nombre de formes sévères (hospitalisation)
• Dont nombre de décès

Pour le bilan de fin du recueil passif

• Nombre total de cas (confirmés, probables)
o Dont nombre de formes sévères,
 Dont nombre de décès
• Nombre total de contacts
o Dont nombre de contacts isolés
o Dont nombre de contacts avec des signes cliniques
• Date des signes du dernier cas connu
• Nombre de chaînes de transmission identifiées
• Nombre de génération de cas
• Evolution
o Cluster maîtrisé
o Diffusion communautaire
o Investigation encore en cours
o Cluster clôturé
• Mesures de contrôle et dates de mise en œuvre
o Fermeture collectivité
o Dépistage élargi
o Confinement localisé
o Autres

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 15
Des informations identifiantes pour les personnes

Des informations sur les cas

• Les cas et leurs caractéristiques individuelles (âge, sexe, date des signes, signes cliniques,
testé et résultats de tests)
• Le lien entre les cas pour identifier les chaines de transmission

Des informations sur les contacts

• Les contacts à risque (coordonnées, date du dernier contact, isolé, dépisté et résultat)
• Les liens avec les contacts pour identifier les chaines de transmission lorsqu’un contact est
diagnostiqué positif

Indicateurs à calculer pour le suivi

épidémiologique des cas groupés au niveau
régional et national
1. Nombre de clusters validés (nombre total et nombre sur les 7 derniers jours) - Niveau
régional et départemental
2. Nombre de clusters validés par type de collectivités (cf. annexe 1)
3. Nombre de cas / hospitalisations / décès (Total et par classes)
Caractéristiques N %
Nombre de cas confirmés ou probables
< 5 cas
5 à 9 cas
≥ 10 cas
dont nombre d'hospitalisations
< 5 hospitalisations
5 à 9 hospitalisations
≥ 10 hospitalisations
dont nombre de décès
0 décès
Au moins un décès

4. Indicateur d’évolution
Evolution N %
En cours d'investigation
Maîtrisé (suivi des contacts en cours et absence
de nouveaux cas 7 jours après le dernier cas)
Diffusion communautaire
Clôturé (absence de nouveau cas 14 j après la date
de début des signes ou de diagnostic du dernier cas confirmé
ou probable ET la fin de la quatorzaine de tous les contacts)

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 16
 5. Niveau de criticité (potentielle de transmission et impact) (cf. annexe 2)
Criticité N %
Limitée
Modérée
Elevée

Sécurités et confidentialité
des données collectées
Les ARS sont responsables de la sécurité des outils de transmission et systèmes d’information de
collecte et de partage de données à caractère personnel nécessaires aux équipes d’investigation.
Elles s’assurent que ces outils de partages, de collectes et de transmissions respectent les principes
du RGPD.

Les ARS s’assurent de l’information préalable des personnes concernées et mettent à disposition
des équipes d’investigation les éléments nécessaires à l’information des personnes à enquêter.
Santé publique France est responsable des éventuels traitements de données à caractère personnel
qu’elle met en œuvre sur ses serveurs à partir des données transmises et mises à disposition par
l’ARS.

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 17
ANNEXES

Annexe 1 / Fiches action

1. Investigation cas groupés écoles (tous niveaux)
2. Investigation cas groupés en EHPAD
3. Investigation cas groupés en établissement de soins
4. Investigation cas groupés en crèche, garderie
5. Investigation cas groupés en milieu professionnel*
6. Investigation cas groupés en milieu familial élargi
7. Investigation cas groupés dans des lieux de vie ou d’hébergement
(structures sociales ou médico-sociales, foyers de travailleurs…)
8. Investigation cas groupés lors d’un évènement public ou privé de
rassemblements temporaires de personnes (cérémonies religieuses,
festivités…)
9. Investigation cas groupés transport terrestre (train, bus)
10. Investigation cas groupés transports aériens
11. Investigation cas groupés transports maritimes
12. Investigation cas groupés dans une communauté vulnérable (gens du
voyage, migrants en situation précaire, etc.)
13. Investigation cas groupés en établissement médicosocial (EMS) de
personnes handicapées
14. Investigation cas groupés en établissements pénitentiaires
15. Investigation cas groupés en Structures de l’aide sociale à l’enfance
(centres départementaux de l’enfance, foyers de l’enfance, maisons
d'enfants à caractère social)
16. Investigation cas groupés en Structures de soins résidentiels des
personnes sans domicile fixe (Lits halte soins santé et Lits d’accueil
médicalisés)

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 18
Investigation cas groupés écoles (tous niveaux)

Modalités de signalement à l’ARS

• Passif : signalement par école, plateforme AM, parents élèves, etc.
• Actif : identification lors du contact-tracing d’un cas

Définition de cas
Un cluster ou épisode de cas groupés dans une école est défini par la survenue d’au moins 3
cas (enfant ou adulte) confirmés ou probables dans une période de 7 jours, et qui
appartiennent à une même école.

Critères de complexité
• Nombre de cas initiaux > 3, délai long entre DDS du 1er cas et la détection du cluster,
vitesse de survenue des nouveaux cas (+3 cas en 48h), plus de 3 générations
vraisemblables de cas, plus de 3 chaînes de transmission, ou absence de chaîne de
transmission expliquant le cluster
• Mesures barrières difficile à appliquer selon l’âge, risque d’activités croisées en dehors
des classes et de l’école.

Options de gestion immédiates

Fermeture des classes des cas et des contacts à risque + signalement sans délai de tout
nouveau cas (mise en place d’une surveillance)

Délai de mise en œuvre de l’investigation

Dès le signalement

Critères d’arrêt de l’investigation active (passage en recueil passif)

• Contrôle vraisemblable du cluster (absence de nouveau cas sur une période de 7 jours)
• Multiples générations de cas et/ou chaînes de transmission (n>4), cluster difficile à
maitriser
• Circulation communautaire établie, on passe à des mesures contraignantes

Acteurs de l’investigation
Éducation Nationale, services de santé scolaires, services communaux, conseil
départemental, Région, ARS, SpFrance

Informations à collecter
• Infos cas (ID, DDS, âge, classe, Date diagnostic),
• Infos contacts (ID, classe),
• infos école (nb d’élèves, nb de classes par niveau, lieux de rassemblement possibles
hors classe dans l’école, lieux de rassemblement hors de l’école…).

Modalités de collecte
À distance en lien avec tous les partenaires, la médecine scolaire et la direction de
l’établissement étant plus particulièrement impliqués dans le recueil des cas et de contacts.
Une investigation sur place est décidée par ARS-SPFRANCE si impossibilité de collecte à
distance ou si situation complexe d’emblée (Equipe mobile d’intervention rapide et/ou équipe
d’investigation).

Modalités de suivi
Appel quotidien des parents des contacts et appel quotidien de l’établissement. Suivi des lieux
de rassemblement hors école identifiés ainsi que des clusters familiaux.

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 19
Stratégie de dépistage
Cas et contacts (selon situation, envisager dépistage élargi en lien avec l’ARS)

Critères de clôture (réouverture possible des écoles/classe)

• Pas de nouveaux cas durant au moins 14 jours après le début des signes ou le
diagnostic du dernier cas confirmé ou probable et la fin de la quatorzaine des contacts.
• Pas de détection de circulation communautaire autre que des cas intrafamiliaux liés
aux cas du cluster initial

Documents connexes
• Covid19-Protocole sanitaire réouverture d’écoles
• Covid19-Protocole sanitaire réouverture collèges et lycées
• https://www.education.gouv.fr/coronavirus-covid-19-reouverture-des-ecoles-colleges-
et-lycees-303546

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 20
Investigation cas groupés en EHPAD

Modalités de signalement à l’ARS

• Passif : signalement direct par établissement (directeur, cadre de santé, medCo, etc.)
ou EOH/ Cpias.
• Actif : Veille quotidienne du SI VoozEHPAD/ESMS Covid19

Définition de cas
Un cluster ou épisode de cas groupés dans un EHPAD est défini par la survenue d’au moins
3 cas (résident ou personnel y compris les intervenants extérieurs) confirmés ou probables,
dans une période de 7 jours.

Critères de complexité
Nombre de cas initiaux > 3, Signalement ou mises à jour tardifs dans le SI, plus de 3 chaînes
de transmission, type de professionnel confirmé (si extérieur à établissement ou travaillant
dans sites multiples. Mesures barrières difficiles à appliquer pour certains EHPAD

Options de gestion immédiates

• Isolement en chambre, arrêt des activités et des visites, arrêt des intervenants
extérieurs
• Vérifications de la mise en œuvre des règles sanitaires et des mesures de protections
individuelles pour les personnels et les résidents
• Evaluations des besoins en matériel de protection

Délai de mise en œuvre de l’investigation

Dès le signalement

Critères d’arrêt de l’investigation active (passage en recueil passif)

• Contrôle vraisemblable du cluster (absence de nouveau cas sur une période d’au
moins 7 jours)
• Identification des chaînes de transmission
• Si cluster difficile à contrôler surveillance passive et mises en œuvre de mesures par
ARS et Cpias

Acteurs de l’investigation
ARS, Cpias, EOH, SpFrance, médecin coordinateur, direction EHPAD

Informations à collecter
• Infos cas : ID, DDS, âge (si personnel), statut, date diagnostic,
• Infos contacts (ID, cercles de vie/loisir et de travail),
• Mesures mises en place, moyens nécessaires à l’établissement : RH, matériels
(EPI…)…
Pour les intervenants extérieurs collecter les noms des autres structures fréquentées.

Modalités de collecte
À distance le plus souvent ou sur place en lien avec EOH de l’établissement de référence. Le
Cpias peut conduire une investigation si difficultés majeures de recueil d’infos et
d’organisation. Les cas familiaux en lien avec le cluster sont détectés.

Modalités de suivi
Le suivi du cluster se fait via les bilans quotidiens saisis par l’EHPAD dans le SI. Un contact
téléphonique régulier des gestionnaires ARS avec les établissements permet d’intervenir
rapidement si des incohérences ou une augmentation de cas sont identifiés.
Stratégie de dépistage

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 21
Cas et contacts : tous les résidents dans l’EHPAD et les professionnels (ou par secteur selon
la structure de l’établissement) + contacts à risque extérieurs à l’EHPAD.

Critères de clôture
• Pas de nouveau cas durant au moins 14 jours après le début des signes ou le
diagnostic du dernier cas probable ou confirmé parmi les résidents et le personnel au
sein de l’EHPAD et la fin de la quatorzaine des contacts.
• Pas de diffusion communautaire autre que des cas intrafamiliaux liés aux cas du cluster
initial.

Documents connexes
• https://solidarites-sante.gouv.fr/IMG/pdf/deconfinement-etablissements-hebergeant-
personnes_agees-covid-19.pdf
• https://solidarites-sante.gouv.fr/IMG/pdf/covid-
19__distribution_masque_sortie_confinement_esms.pdf
• https://solidarites-sante.gouv.fr/IMG/pdf/deconfinement-lignes-directrices-offre-soins-
covid-19.pdf

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 22
Investigation cas groupés en établissement de soins

Modalités de signalement à l’ARS

• Passif : signalement via le laboratoire (résultat positif), (patient sorti à DOM ou transféré
dans une autre structure)
• Actif : signalement via e-SIN

Définition de cas
Un cluster ou épisode de cas groupés dans un établissement de soins est défini par la
survenue d’au moins 3 cas (patients, soignants ou visiteurs) confirmés ou probables ayant eu
un contact rapproché au cours de l’hospitalisation. Les personnes concernées peuvent ne pas
appartenir au même service mais doivent avoir fréquenté le même établissement à la même
période (au moins 1 jour).

Critères de complexité
Fréquence des gestes à risques dans le contexte hospitalier, multiplication des intervenants
(consultations, examens,), mobilité des cas (retour à domicile, transfert...).

Options de gestion immédiates

• Regroupement des cas dans une unité en isolement, de préférence spécialisée
COVID-19
• Signalement des transferts auprès des établissements d’accueil

Délai de mise en œuvre de l’investigation

Dès le signalement

Critères d’arrêt de l’investigation active (passage en recueil passif)

Contrôle vraisemblable du cluster (absence de nouveau cas sur une période suffisante) au
sein de l’établissement.

Acteurs de l’investigation
EOH, Cpias, ARS, SpFrance

Informations à collecter
• Infos cas et contacts (ID, test effectué ou non, mode de contact, etc.),
• Recherche des transferts et retour à domicile.
L’investigation des cas et des contacts est réalisée sur place par l’EOH en lien avec l’ARS et
SpFrance.

Modalités de collecte
À distance ou sur place (si impossibilité de collecte à distance ou si situation complexe
d’emblée) en relais des EOH

Modalités de suivi
Appel quotidien des contacts et appel quotidien de l’établissement et/ou mise à jour sur e-sin

Stratégie de dépistage
Cas et contacts

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 23
Critères de clôture
• Pas de nouveau cas durant au moins 14 jours après le début des signes ou le
diagnostic du dernier cas probable ou confirmé parmi les patients et le personnel au
sein de l’ES et la fin de la quatorzaine des contacts.
• Pas de diffusion communautaire autre que des cas intrafamiliaux liés aux cas du
cluster initial.

En complément, voir logigramme « enquête autour d’un cas en établissement de santé ».

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 24
Investigation cas groupés en crèche, garderie

Modalités de signalement à l’ARS

• Passif : Signalement par Directrice de la crèche, service de PMI, Pédiatre référent ou
laboratoire référent de la crèche le plus souvent sur la plateforme de réception des
signaux ou niveau 2 de la plateforme AM
• Actif : à partir de données de la base ContactCovid.

Définition de cas
Au moins 3 cas confirmés ou probables dans la crèche parmi le personnel y compris ceux de
la cuisine et/ou parmi les enfants, dans une période de 7 jours.

Critères de complexité
Nombre de cas > 3. Déclaration tardive après la date de DDS du premier cas. Survenue de
plusieurs cas en 48h. Plusieurs sections touchées dans la crèche. Mesures barrières difficiles
à appliquer pour les plus grands.

Options de gestion immédiate

Fermeture de la structure pour désinfection. Vérification du protocole des mesures barrières,
désinfection et distanciation du personnel. Isolements des cas et des contacts.

Délai de mise en œuvre de l’investigation

Dès le signalement

Critères d’arrêt de l’investigation active (passage en recueil passif)

• Contrôle vraisemblable du cluster (absence de nouveau cas sur une période de 7 jours)
• Multiples générations de cas et/ou chaînes de transmission (n>4) cluster non
maitrisable
• Circulation communautaire établie

Acteurs de l’investigation
ARS, Cellule régionale si nécessaire, PMI, Conseil départemental, directrice de
l’établissement, pédiatre référent, laboratoire référent pour centraliser les prélèvements.

Informations à collecter
• Infos cas (ID, DDS, âge, section, date diagnostic),
• Infos contacts (ID, âge, section).
• Infos concernant la crèche (Nombre de personnel et d’enfants par section, identification
des lieux d’échanges entre sections, salle de jeu, prise des repas…).

Modalités de collecte
A distance ou sur place (beaucoup de cas, nécessité de revoir les protocoles sanitaires et
organisation)

Modalités de suivi
Déclaration quotidienne de la directrice de la crèche de tout nouveau cas possible ou confirmé
par téléphone ou par mail.

Stratégie de dépistage
Dépistage rapide du personnel. Si PCR négative, refaire un test à J7. Si symptômes
respiratoires et PCR négative faire un scanner thoracique pour vérifier l’absence de
pneumonie caractéristique.
Pas de dépistage pour les enfants asymptomatiques et discuter du dépistage des enfants
symptomatiques avec pédiatre et infectiologue de référence.

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 25
Investigation cas groupés en milieu professionnel*
* À l’exception des milieux professionnels déjà inclus dans une autre fiche (professionnels en milieu
scolaire, en milieu hospitalier, en EHPAD, en crèche…).

Modalités de signalement à l’ARS

• Passif : signalement par un service de santé au travail – SST- (médecin, infirmier…) –
Importance de sensibiliser en amont les SST au signalement (rappel du signalement
de suspicion de tout type de cas groupés, comme c’est le cas dans le cadre du Gast)
• Actif : identification lors du contact-tracing d’un cas

Définition de cas
Un cluster ou épisode de cas groupés dans une entreprise est défini par la survenue d’au
moins 3 cas confirmés ou probables, dans une période de 7 jours.

Critères de complexité
Nombre de cas initiaux > 3, délai long entre DDS du 1er cas et la détection du cluster, vitesse
de survenue des nouveaux cas (+3 cas en 48h), plus de 3 générations vraisemblables de cas,
plus de 3 chaînes de transmission, ou absence de chaîne de transmission expliquant le cluster.
Mesures barrières (distanciation sociale, gestions des flux, mise en œuvre nettoyage des
surfaces) difficiles à appliquer selon la typologie de l’entreprise ou la situation du type d’emploi.

Options de gestion immédiates

• Prendre contact avec le SST
• Mise en télétravail ou éviction des cas et des contacts (Arrêt travail) a minima
• Mise en télétravail ou éviction de l’ensemble du personnel du service (si cas dans
le même service, si échanges / interactions importantes entre les personnels du
service, avec difficulté d’application de mesures barrière)
• Mise en télétravail ou éviction de l’ensemble du personnel de l’entreprise (si
beaucoup d’échange / de contacts entre les personnels dans l’entreprise, avec
difficulté d’application de mesures barrière)

Délai de mise en œuvre de l’investigation

Dès le signalement

Critères d’arrêt de l’investigation active (passage en recueil passif)

• Contrôle vraisemblable du cluster (absence de nouveau cas sur une période de
7 jours).
• Multiples générations de cas et/ou chaînes de transmission (n>4) cluster non
maitrisable.
• Circulation communautaire établie.

Acteurs de l’investigation
Service de santé au travail, service de prévention, ARS, SpFrance, direction de l’entreprise,
information de l’inspection médicale de la Direccte si nécessaire.

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 26
Informations à collecter
• Infos cas (ID, DDS, âge, service, date diagnostic),
• Infos contacts (ID, service),
• infos sur l’entreprise (nb de personnes dans le service, nb de personnes dans
l’entreprise, lieux de rassemblement possibles : réunions, salles de pause, cantine,
vestiaire…),
• infos sur d’éventuelles entreprises sous-traitantes. L’investigation des cas se fait en
étroite collaboration avec le service de santé au travail.
• L’investigation recense également les contacts familiaux et hors entreprise.

Modalités de collecte
À distance ou sur place (si impossibilité de collecte à distance ou si situation
complexe d’emblée). Les modalités d’investigation sont à évaluer par l’ARS et SpFrance en
lien avec le SST.

Modalités de suivi
Appel quotidien des contacts et appel quotidien du SST de l’entreprise

Stratégie de dépistage
Cas et contacts en lien avec la médecine du travail. Un dépistage d’une unité ou d’un service
peut être décidé en accord avec les différents acteurs.

Critères de clôture :
• Pas de nouveau cas durant au moins 14 jours après le début des signes ou le
diagnostic du dernier cas probable ou confirmé au sein de l’entreprise et la fin de la
quatorzaine des contacts.
• Pas de diffusion communautaire autre que des cas intrafamiliaux liés aux cas du
cluster initial.

Documents connexes
Protocole national de déconfinement des entreprises :
https://travail-emploi.gouv.fr/IMG/pdf/protocole-national-de-deconfinement.pdf

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 27
Investigation cas groupés en milieu familial élargi

Modalités de signalement à l’ARS

• Passif : signalement par médecin Niveau 1, plateforme AM Niveau 2.
• Actif : identification lors du contact-tracing d’un cas

Définition de cas
Cluster dépassant le cadre d’un foyer familial unique, avec chaîne de transmission
vraisemblable entre plusieurs domiciles familiaux en raison de fréquent contacts et/ou
d’événements familiaux collectifs. Survenue d’au moins 3 cas confirmés ou probables dans
une période de 7 jours.

Critères de complexité
Nombre de cas initiaux > 3, délai long entre DDS du 1er cas et la détection du cluster, vitesse
de survenue des nouveaux cas (+3 cas en 48h), plus de 3 générations vraisemblables de cas,
plus de 3 chaînes de transmission, ou absence de chaîne de transmission expliquant le cluster
Les foyers peuvent être regroupés à une échelle géographique limitée ou dispersés sur une
ou plusieurs communes / quartiers. Cela ne signe pas forcément une diffusion communautaire
large.

Options de gestion immédiates

• Mesures proposées dans le cadre familial habituel, incluant les mesures barrières,
l’isolement des sujets confirmés, le dépistage de l’ensemble des sujets contacts
familiaux, voire les solutions d’hébergement selon les critères habituels.
• Dans le cas de groupes familiaux ayant un mode de vie communautaire, se reporter à
la fiche action dédiée.

Délai de mise en œuvre de l’investigation

Dès le signalement

Critères d’arrêt de l’investigation active (passage en recueil passif)

Contrôle vraisemblable du cluster (absence de nouveau cas sur une période suffisante)

Acteurs de l’investigation
ARS et Santé publique France

Informations à collecter
• Infos cas (ID, DDS, âge, Date diagnostic),
• Centralisation des informations sur les contacts des différents foyers familiaux.

Modalités de collecte
À distance sauf exception L’ARS et SpFrance peuvent décider de l’envoi d’une équipe mobile
d’intervention sur site.

Modalités de suivi
Appel quotidien des contacts

Stratégie de dépistage
Concerne les cas et tous les contacts (a priori exhaustif sur le groupe familial élargi)

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 28
Critères de clôture
• Pas de nouveaux cas durant au moins 14 jours après le début des signes ou du
diagnostic du dernier cas et de la fin de quatorzaine des contacts.
• Pas de détection de cas, de chaîne de transmission ou de cluster impliquant des
contacts hors de ce cercle familial élargi.
• pas de détection de circulation communautaire

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 29
Investigation cas groupés dans des lieux de vie ou d’hébergement
(structures sociales ou médico-sociales, foyers de travailleurs…)

Modalités de signalement à l’ARS

• Passif : signalement direct à l’ARS par la structure, une association
• Actif : situation identifiée lors du CT, veille quotidienne sur le SI VoozEHPAD/EMS
Covid19

Définition de cas
Un cluster ou épisode de cas groupés est défini par la survenue d’au moins 3 cas confirmés
ou probables, résidant ou exerçant dans la structure (salarié, bénévole, intervenant extérieur,
etc.), dans une période de 7 jours.

Critères de complexité
• Personnes étrangères, besoin d’interprétariat
• Promiscuité, conditions d’hygiène parfois précaires
• Hébergement d’urgence : présence ponctuelle pouvant rendre compliqué le suivi des
personnes
• Un foyer de JT regroupe des jeunes actifs ou en insertion professionnelle, ce qui
suppose des contacts extérieurs
• Structure ouverte : intervenants extérieurs, bénévoles, associatifs pour animer des
ateliers collectifs et réaliser un accompagnement individuel
• Pas nécessairement de présence médicale en continu (structure non médicalisée)

Options de gestion immédiates

• Isolement souhaitable du ou des cas confirmé(s) dans un lieu dédié
• Recensement des personnes contact à risque dans et en dehors de la structure pour
mise en quatorzaine et réalisation d’un test de dépistage
• Interruption des activités collectives, nettoyage/désinfection des parties communes
• Quantité suffisante d’équipements de protection pour la mise en œuvre des gestes
barrière

Délai de mise en œuvre de l’investigation

Dès le signalement

Critères d’arrêt de l’investigation active (passage en recueil passif)

Contrôle vraisemblable du cluster (absence de nouveau cas sur une période de 7 jours) au
sein de l’établissement.

Acteurs de l’investigation
ARS / Santé publique France en lien étroit avec la direction de la structure, les associations
intervenantes (MSF, etc.).

Informations à collecter
S’appuyer sur les questionnaires d’investigation des cas et des sujets contacts

Modalités de collecte
À distance ou sur place (si impossibilité de collecte à distance ou si situation complexe
d’emblée) en relais avec la structure et les associations

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 30
Modalités de suivi
Appel quotidien de la structure pour faire un point détaillé sur l’évolution de la situation ou
fiches quotidienne de suivi

Stratégie de dépistage
Cas et contacts à risque. Le dépistage du personnel peut être envisagé en lien avec l’ARS.

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 31
Investigation cas groupés lors d’un évènement public ou privé
de rassemblements temporaires de personnes (cérémonies religieuses,
festivités…)

Modalités de signalement à l’ARS

• Passif : signalement spontané par un participant ou l’organisateur de l’évènement
• Actif : lors du CT, le cas déclare avoir participé à un évènement ayant réuni 11
personnes ou plus dans un même lieu (rassemblement, fête, réunion, congrès, etc.).

Définition de cas
Survenue d’au moins 3 cas confirmés ou probables sur une période de 7 jours, parmi les
participants à un même rassemblement.

Critères de complexité
• Évènement susceptible de réunir des personnes de différentes régions
• Grand nombre de participants
• Absence de liste des participants

Options de gestion immédiates

• Mettre fin au rassemblement s’il est toujours en cours (ex : séminaire de plusieurs
jours)
• S’assurer de la prise en charge et de l’isolement des cas confirmés
• Identifier l’organisateur pour recenser l’ensemble des personnes ayant participé à
l’évènement et mener une évaluation individuelle de leur exposition
• Pour les personnes identifiées comme ayant eu un contact à risque : mesure de
quatorzaine (si asymptomatique) ou d’isolement strict (si symptomatique) et dépistage
systématique

Délai de mise en œuvre de l’investigation

Dès le signalement

Critères d’arrêt de l’investigation active (passage en recueil passif)

Contrôle vraisemblable du cluster (absence de nouveau cas sur une période suffisante)

Acteurs de l’investigation
ARS / Santé publique France, organisateur

Informations à collecter
Au moyen des questionnaires, investigation des cas, de tous les participants (type de
contact++) pour ne retenir que les personnes contact à risque.

Modalités de collecte
À distance le plus souvent si évènement terminé et en inter-régional si les participants sont
dispersés dans plusieurs régions. Une investigation sur place peut être utile pour évaluer les
modes de transmissions.

Modalités de suivi
Appel quotidien des cas et des personnes contact

Stratégie de dépistage
Pour les sujets contact à risque : réalisation d’un test de dépistage par RT-PCR 7 jours après
le dernier contact avec un cas confirmé, et sans délai en cas d’apparition de symptômes. Si le
test RT-PCR est négatif à J+7 du dernier contact, la quatorzaine peut être allégée sous
conditions.

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 32
Investigation cas groupés transport terrestre (train, bus)

Modalités de signalement à l’ARS

• Passif : Signalement à la plateforme de l’ARS, par le Centre crise sanitaire (CCS) ou
CORRUSS ou par le niveau 1 ou 2 de la plateforme AM
• Actif : se fait en lien avec le CCS ou CORRUSS car souvent plusieurs régions
impactées.
Définition de cas
Survenue dans une période de 7 jours d’au moins 3 cas confirmés ou probables ayant voyagé
dans le même train ou bus.

Critères de complexité
Nombre de cas initiaux > 3, délai entre DDS du 1er cas et la détection du cluster avec cas
dispersés dans différentes régions ou pays, vitesse de survenue des nouveaux cas (+3 cas en 48h).
Si les cas sont diagnostiqués à bord; confinement/isolement temporaire à bord du train ou du
bus avec gestion complexe du débarquement des cas confirmés et contacts.

Options de gestion immédiate

Confinement si cas à bord et information du CCS ou CORRUSS, dans la mesure du possible.
Sinon prise en charge des cas et contacts pour leur isolement et dépistage.

Délai de mise en œuvre de l’investigation

Dès le signalement

Critères d’arrêt de l’investigation active (passage en recueil passif)

Investigation des cas dépend de la possibilité d’obtenir la liste des passagers pour les trains
et les bus, les attributions de siège sont indicatives car possibilité de changement à bord.

Acteurs de l’investigation
ARS, CORRUSS, Préfecture, SNCF, compagnies de bus.

Informations à collecter :
Outre les infos cliniques et coordonnées précises des cas, recueillir date, horaires du trajet, n°
de train, compagnie opérant le voyage, numéro de siège, déplacements pendant le trajet. Les
personnes contacts sont celles occupant les 2 sièges voisins sur tous les côtés. Evaluer le
niveau de risque en fonction de la durée d’exposition et de portage d’EPI.

Modalités de collecte :
À distance le plus souvent ou sur place, à évaluer à évaluer avec la compagnie opérant le
voyage (si impossibilité de collecte à distance ou si situation complexe d’emblée).

Modalités de suivi :
Le suivi se fait jusqu’au départ des passagers en lien avec le CCS, la préfecture et les corps
consulaires pour les passagers étrangers. Le suivi se fait en lien avec le CORRUSS si
signalement après le débarquement.

Stratégie de dépistage :
Dépistage des contacts à risque symptomatiques et asymptomatiques. Dépistage du
personnel symptomatique et des chauffeurs de bus. Un dépistage de tout le personnel à bord
du train peut être décidé en lien avec la médecine du travail de la SNCF.

Critères de clôture
Sont fixés par les différents acteurs locaux impliqués dans la gestion du cluster.

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 33
Investigation cas groupés transports aériens

Modalités de signalement à l’ARS

• Passif : Signalement à la plateforme de l’ARS, par le Centre crise sanitaire (CCS) ou
CORRUSS, dans le cadre du règlement sanitaire international, ou par le niveau1 ou 2
de la plateforme AM
• Actif : se fait en lien avec le CCS ou CORRUSS car souvent plusieurs régions
impactées.
Définition de cas
Survenue dans une période de 7jours d’au moins 3 cas confirmés ou probables ayant voyagé
dans le même avion.

Critères de complexité
Nombre de cas initiaux > 3, délai entre DDS du 1er cas et la détection du cluster avec cas
dispersés dans différentes régions ou pays, vitesse de survenue des nouveaux cas (+3 cas en 48h).
Si les cas sont diagnostiqués à bord; gestion complexe du débarquement des cas confirmés
et contacts.

Options de gestion immédiate

Prise en charge et isolement des cas confirmés et contacts si cas à bord et information du
CCS ou CORRUSS.

Délai de mise en œuvre de l’investigation

Dès le signalement

Critères d’arrêt de l’investigation active (passage en recueil passif)

Investigation des cas dépend de la possibilité d’obtenir la liste des passagers en se basant
sur les fiches de traçabilité.

Acteurs de l’investigation
ARS, CORRUSS ou CCS, personnes en charge du RSI, Préfecture, aéroport.

Informations à collecter
Outre les infos cliniques et coordonnées précises des cas, recueillir date, horaires du trajet,
N° de vol, compagnie opérant le voyage, numéro de siège, déplacements pendant le trajet.
Les personnes contacts sont celles occupant les 2 sièges voisins sur tous les côtés. Evaluer
le niveau de risque en fonction de la durée d’exposition et le portage d’EPI

Modalités de collecte
À distance le plus souvent ou sur place, à évaluer avec la compagnie opérant le voyage (si
impossibilité de collecte à distance ou si situation complexe d’emblée).

Modalités de suivi
Le suivi du cluster se fait jusqu’au départ des passagers en lien avec le CCS, la préfecture et
les corps consulaires pour les passagers étrangers. Le suivi se fait en lien avec le CORRUSS
si signalement après le débarquement.

Stratégie de dépistage
Dépistage des contacts à risque symptomatiques et asymptomatiques. Dépistage du
personnel symptomatique. Un dépistage de tout le personnel peut être décidé en lien avec les
responsables sanitaires de l’aéroport.

Critères de clôture
Sont fixés par les différents acteurs locaux impliqués dans la gestion du cluster.

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 34
Investigation cas groupés transports maritimes

Modalités de signalement à l’ARS

• Passif : Signalement à la plateforme de l’ARS, par le Centre crise sanitaire (CCS) ou
CORRUSS, dans le cadre du règlement sanitaire international, ou par le niveau1 ou 2
de la plateforme AM
• Actif : se fait en lien avec la VSS, le représentant RSI de l’ARS sur analyse des
déclarations maritimes de santé (DMS) et annexes (historique des débarquements de
passagers malades en lien avec l’agent maritime). Contact avec le point focal national
si nécessaire pour retrouver des cas confirmés débarqués lors des escales
précédentes.
Définition de cas
Survenue dans une période de 7 jours, d’au moins 3 cas confirmés ou probables à bord du
bateau.

Critères de complexité
Nombre de cas initiaux > 3, délai entre DDS du 1er cas et la détection du cluster avec cas
dispersés dans différentes régions ou pays, vitesse de survenue des nouveaux cas (+3 cas en 48h).
Si les cas sont diagnostiqués à bord; confinement/isolement à bord du bateau. Gestion
complexe du débarquement des cas confirmés et recherche des contacts.

Options de gestion immédiate

Confinement si cas à bord et information du CCS ou CORRUSS

Délai de mise en œuvre de l’investigation

Dès le signalement

Critères d’arrêt de l’investigation active (passage en recueil passif)

Investigation des cas dépend de la possibilité d’obtenir la liste des passagers en lien avec le
CCS et le préfet maritime. L’agent maritime est facilitateur.

Acteurs de l’investigation
ARS, CORRUSS, personnes en charge du RSI, Préfecture, Préfet maritime, Capitainerie du
port, agents maritimes.

Informations à collecter
Outre les infos cliniques et coordonnées précises des cas, recueillir date d’apparition des cas,
Nom du bateau, compagnie opérant le voyage, numéro de cabine, déplacements pendant le
trajet. Liste des passagers et équipage avec nationalités et N° de cabine fournie par l’agent
maritime. Les personnes contacts sont celles qui ont eu des contacts à risques pendant le
voyage. Evaluer le niveau de risque en fonction de la durée d’exposition et le portage d’EPI

Modalités de collecte
À distance le plus souvent ou sur place, à évaluer avec la compagnie opérant le voyage (si
impossibilité de collecte à distance ou si situation complexe d’emblée).

Modalités de suivi
Le suivi se fait jusqu’au départ des passagers en lien avec le CCS, la préfecture et les corps
consulaires pour les passagers étrangers.

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 35
Stratégie de dépistage
Dépistage du personnel et passagers symptomatiques. Dépistage des contacts à risque. Un
dépistage de tout le personnel peut être décidé par l’ARS en lien avec le médecin de bord du
bateau.

Critères de clôture
Sont fixés par les différents acteurs locaux impliqués dans la gestion du cluster.

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 36
Investigation cas groupés dans une communauté vulnérable
(gens du voyage, migrants en situation précaire, etc.)
Modalités de signalement à l’ARS
• Passif : médecin niveau 1 ou hospitalier, plate-forme Assurance maladie, association
ou acteur local (travailleurs sociaux, collectivité)…
• Actif : identification lors du CT d’un cas

Définition de cas
Survenue d’au moins 3 cas confirmés ou probables, parmi les personnes de la communauté
sur une période de 7 jours.

Critères de complexité
• Barrière de la langue (interprétariat)
• Personnes en situation irrégulière (risque d’être perdu de vue)
• Mesures barrières difficile à appliquer, promiscuité, surpopulation des logements,
absence d’accès simple à l’eau et aux sanitaires.

Options de gestion immédiates

• Mise en place d’une équipe pluridisciplinaire incluant des acteurs habituels identifiés
par la communauté et s’impliquant dans la médiation
• Inclusion des représentants de la communauté dans la gestion de l’évènement
• Protection du reste de la communauté en cas de survenue limitée à un premier groupe
familial même élargi (cas des grandes communautés).
• Proposition systématique et rapide d’une solution d’hébergement pour les cas
confirmés
• Dépistage sur place préférentiel éventuellement élargi (équipe mobile) et recueil
épidémiologique
• Quatorzaine sur place ou dans le cadre d’une solution d’hébergement des sujets
contacts. En cas de confinement sur place sécuriser l’autonomie alimentaire durant la
période de quatorzaine.
• Renforcement des mesures d’hygiène et d’accès aux produits d’hygiène incluant
l’accès à l’eau.

Délai de mise en œuvre de l’investigation

Dès le signalement

Critères d’arrêt de l’investigation active (passage en recueil passif)

Importance du taux d’attaque cumulé, du nombre de générations de cas et de chaînes de
transmission : surveillance à l’échelle de la communauté

Acteurs de l’investigation :
Associatifs (sanitaires et sociaux, aide alimentaire), médiateurs, MSF, MDM, centres de santé,
équipes mobiles d’intervention rapide incluant fonctions repérage, dépistage, évaluation
médicale, recueil épidémiologique simple.

Informations à collecter
Infos foyers et composition des foyers dont effectifs cas possibles et asymptomatiques, Infos
cas (ID, DDS, âge, DDD), Infos contacts (ID, collectivités concernées, écoles, etc.). Aperçu
spatial des lieux concernés (campement, habitat précaire ou spontané)

Modalités de collecte
Sur place en général par équipe mobile rapide d’intervention en lien avec les acteurs locaux.

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 37
Modalités de suivi
Maintien d’une présence sanitaire incluant une offre de dépistage sur place pluri-
hebdomadaire et permettant évaluation et recueil de données simplifiées.

Stratégie de dépistage
Cas et contacts (et selon situation, envisager dépistage élargi)

Critères de clôture
Pas de nouveau cas durant au moins 14 jours après le début des signes ou le diagnostic du
dernier cas probable ou confirmé au sein de la communauté et la fin de la quatorzaine des
contacts.

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 38
Investigation cas groupés en établissement médicosocial (EMS)
de personnes handicapées

Modalités de signalement
• Passif : signalement par établissement auprès de l’ARS
• Actif : veille quotidienne de SI VoozEHPAD/ESMS Covid19

Définition de cas
Un cluster ou épisode de cas groupés dans un établissement médicosocial pour personnes
handicapées est défini par la survenue d’au moins 3 cas (résidents, soignants ou visiteurs)
confirmés ou probables sur une période de 7 jours. Les personnes concernées peuvent ne
pas être hébergés dans les mêmes locaux mais ils doivent avoir fréquenté le même
établissement à la même période (au moins 1 jour).

Critères de complexité
Fréquence des gestes à risques dans le contexte d’une prise en charge de soins et d’aide à
la vie courante, multiplication des intervenants, possibilités d’allées et venues avec le domicile
pour certains patients.
Si une école est intégrée ou associée à l’établissement : appliquer la fiche N°1 en
complémentaire

Options de gestion immédiates

• Regroupement des cas dans une unité en isolement, dédiée COVID-19 pour ceux dont
l’hospitalisation n’est pas indispensable ; transfert vers les unités hospitalières COVID-
19 pour les autres.
• Les possibilités de regroupement doivent tenir compte des soins de rééducation
indispensables à maintenir.
• Les retours à domicile autorisés sont suspendus.
• Signalement sans délai de tout nouveau cas (mise en place d’une surveillance)

Délai de mise en œuvre de l’investigation

Dès le signalement.

Critères d’arrêt de l’investigation active (passage en recueil passif)

Contrôle vraisemblable du cluster (absence de nouveau cas sur une période suffisante) au
sein de l’établissement.

Acteurs de l’investigation
Direction de la structure, correspondants en hygiène, EOH relais (si convention avec un ES),
SpFrance, ARS

Informations à collecter
Infos cas (ID, DDS, dates retours à domicile, dates prises en charge), locaux
hébergement/rééducation fréquentés. Infos contacts (ID, cercles de vie/loisir et de travail).Pour
les intervenants extérieurs collecter les noms des autres structures fréquentées.

Modalités de collecte
À distance ou sur place (si impossibilité de collecte à distance ou si situation complexe
d’emblée) en relais des EOH lorsqu’une convention existe avec un ES.

Modalités de suivi
Appel quotidien des contacts et appel quotidien de l’établissement et/ou mise à jour sur
VoozEHPAD/ESMS Covid19

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 39
Stratégie de dépistage
Cas et contacts, Un dépistage élargi peut être envisagé par l’ARS et SpFrance en lien avec la
structure en cas de difficultés à déterminer les contacts des cas et le niveau de risque du
contact.

Critères de maitrise du risque

• Pas de nouveaux cas parmi les contacts durant au moins 14 jours après le début des
signes ou diagnostic du derniers cas et la fin de la quatorzaine des contacts.
• Pas d’autres cas dans des structures reliées à l’établissement
• Pas de cas communautaires

Documents connexes
• https://solidarites-sante.gouv.fr/IMG/pdf/deconfinement-lignes-directrices-offre-soins-
covid-19.pdf
• https://solidarites-sante.gouv.fr/IMG/pdf/deconfinement-consignes-essms-covid-
19.pdf
• https://solidarites-sante.gouv.fr/IMG/pdf/reprise-activite-externats-medico-sociaux.pdf
• https://solidarites-sante.gouv.fr/IMG/pdf/covid-
19__distribution_masque_sortie_confinement_esms.pdf

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 40
Investigation cas groupés en établissements pénitentiaires

Modalités de signalement
• Passif : Signalement à la plateforme des signaux de l’ARS, au référent « soins en
détention » de l’ARS au siège ou en DD.
• Actif : Identification lors d’un contact-tracing. Dans tous les cas, la VSS doit être
informée.

Définition de cas
Un cluster ou épisode de cas groupés dans un établissement pénitentiaire est défini par la
survenue d’au moins 3 cas (personne incarcéré ou personnel) confirmés (RT-PCR positive)
ou probables (scanner informatif), dans une période de 7 jours.

Critères de complexité
• Milieu clos marqué par la surpopulation carcérale au sein des maisons d’arrêt et la
promiscuité.
• Interactions nombreuses avec le milieu extérieur : personnels pénitentiaires ;
personnels soignants ; Education nationale ; milieu du travail en détention ; parloirs…
• Risque de tension au sein de l’établissement pénitentiaire.

Options de gestion immédiates

• Isolement des détenus Covid + en cellule individuelle et quatorzaine pour les contacts.
• Hospitalisation des cas confirmés selon doctrine régionale.
• Nettoyage désinfection des parties communes utilisées par les détenus Covid +.

Délai de mise en œuvre de l’investigation

Dès le signalement

Critères d’arrêt de l’investigation active (passage en recueil passif)

• Contrôle vraisemblable du cluster (absence de nouveau cas sur une période d’au
moins 7 jours)
• Identification des chaînes de transmission.

Acteurs de l’investigation
Médecin coordonnateur et cadre de l’USMP ; direction de l’établissement pénitentiaire ;
référent soins en détention siège/DD ; ARS-VSS et SpFrance.

Informations à collecter :
• Infos cas (ID, DDS, âge, date d’entrée dans l’établissement pénitentiaire ; si moins de
14 jours entrant venant de liberté ou transfert ; Date diagnostic, facteurs de risque)
• Infos contacts détenus (ID, cellule, parties communes fréquentées dont douches,
activités communes ; salles d’attente dont USMP ; parloirs ; auxiliaires)
• Infos personnels (le personnel soignant et le personnel pénitentiaire en contact avec
les détenus portent un masque et sont protégés).
• Les mesures de sécurité au parloir (masque ; distance physique ; plexiglass) sont
normalement protectrices pour le détenu et le visiteur.

Modalités de collecte :
Médecin coordonnateur de l’USMP et direction de l’établissement pénitentiaire.

Modalités de suivi
Contact quotidien entre l’administration pénitentiaire et le référent soins en détention de l’ARS
(siège ou DD – à déterminer lors de la réception du signal)

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 41
Investigation cas groupés en Structures de l’aide sociale à l’enfance
(centres départementaux de l’enfance, foyers de l’enfance, maisons
d'enfants à caractère social)

Modalités de signalement
• Passif : signalement direct par établissement (directeur, infirmière, médecin référent),
conseil départemental
• Actif : Veille quotidienne du SI VoozEHPAD/ESMS Covid19

Définition de cas
Survenue d’au moins 3 cas (enfant ou personnel) confirmés ou probables au sein de la
structure, dans une période de 7 jours.

Critères de complexité
Nombre de cas initiaux > 3, Signalement ou mises à jour tardifs dans le SI, plus de 3 chaînes
de transmission, type de professionnel confirmé (si extérieur à établissement ou travaillant
dans sites multiples).

Options de gestion immédiates

• Isolement en chambre, arrêt des activités et des visites, arrêt des intervenants
extérieurs
• Vérifications de la mise en œuvre des règles sanitaires et des mesures de protections
individuelles pour les personnels et les résidents.
• Evaluations des besoins en matériel de protection.

Délai de mise en œuvre de l’investigation

Dès signalement

Critères d’arrêt de l’investigation active (passage en recueil passif)

• Contrôle vraisemblable du cluster (absence de nouveau cas sur une période d’au
moins 7 jours)
• Identification des chaînes de transmission

Acteurs de l’investigation
Conseil départemental, directeur établissement, ARS, CR de SpFrance

Informations à collecter
Infos cas (ID, DDS, âge, chambre, étage, Date diagnostic), Infos contacts (ID, chambre,
étage), infos Structure (nb d’enfants, nb personnels, lieux de rassemblement etc.)

Modalités de collecte
A distance le plus souvent via le signalement dans le SI VoozEHPAD/ESMS Covid19.

Modalités de suivi
Suivi via les fiches de bilans quotidiens du SI et contact de l’établissement si incohérences ou
augmentation rapide des cas

Stratégie de dépistage
Dépistage des cas et des contacts

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 42
Investigation cas groupés en Structures de soins résidentiels
des personnes sans domicile fixe (Lits halte soins santé et Lits d’accueil
médicalisés)

Modalités de signalement à l’ARS

• Passif : signalement direct à l’ARS par la structure, une association
• Actif : situation identifiée lors du CT, veille quotidienne sur le SI VoozEHPAD/EMS
Covid19

Définition de cas
Un cluster ou épisode de cas groupés est défini par la survenue d’au moins 3 cas confirmés
ou probables, résidant ou exerçant dans la structure (salarié, bénévole, intervenant extérieur,
etc.), dans une période de 7 jours.

Critères de complexité
• Personnes étrangères, besoin d’interprétariat
• Personnes vulnérables avec comorbidités liées au parcours de vie
• Intervenants extérieurs, bénévoles, associatifs pour activités non médicales

Options de gestion immédiates

• Isolement souhaitable des cas confirmé(s) dans un lieu dédié Covid 19 au sein de la
structure. SI impossibilité transférer les cas dans un centre d’hébergement Covid
• Recensement des personnes contact à risque dans et en dehors de la structure pour
mise en quatorzaine et réalisation d’un test de dépistage
• Interruption des visites, nettoyage/désinfection des parties communes
• Quantité suffisante d’équipements de protection pour la mise en œuvre des gestes
barrière

Délai de mise en œuvre de l’investigation

Dès le signalement

Critères d’arrêt de l’investigation active (passage en recueil passif)

Contrôle vraisemblable du cluster (absence de nouveau cas sur une période de 7 jours) au
sein de l’établissement.

Acteurs de l’investigation
ARS / Santé publique France en lien étroit avec la direction de la structure, les associations
intervenantes (MSF, etc.)

Informations à collecter
S’appuyer sur les questionnaires d’investigation des cas et des sujets contacts

Modalités de collecte
À distance ou sur place (si impossibilité de collecte à distance ou si situation complexe
d’emblée) en relais avec la structure et le médecin coordonnateur

Modalités de suivi
Appel quotidien de la structure pour faire un point détaillé sur l’évolution de la situation ou
fiches quotidienne de suivi

Stratégie de dépistage
Cas et contacts à risque. Le dépistage du personnel peut être envisagé en lien avec l’ARS.

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 43
Critères de clôture
• Pas de nouveaux cas durant au moins 14 jours après le début des signes ou du
diagnostic du derniers cas et la fin de la quatorzaine des contacts.
• Pas de circulation communautaire.
https://solidarites-sante.gouv.fr/IMG/pdf/employeurs-responssables-lhss-lam-covid-19.pdf

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 44
Annexe 2 / Élément d’aide au classement du niveau de criticité
Critères épidémiologiques A B C
Nombre de cas confirmés ou probable <5 5à9 >9
Ratio nombre de cas/taille collectivité <5% 10% 15%
La collectivité présente un facteur de vulnérabilité Aucun Médicale Sociale et médicale
Critères de sévérité des cas Ni hosp ni DC <5 hosp sans DC >5 hosp et/ou DC*
Génération (délai DDS ou date dépistage à défaut-date <7j 8- 14j >14
du signal)
Risque d’essaimage à distance Faible* Modérée* Élevée*
* Faible : les personnes exposées à la transmission ne se sont pas déplacées à distance du lieu d’exposition ; modérée : au moins
une personne exposée à la transmission s’est déplacée à distance (en dehors du département); élevée : >4 personnes exposées
à la transmission se sont déplacées en dehors du département.

Remarque : l'absence ou l'imprécision de données sur un des critères ne doit pas empêcher l'évaluation de la criticité.

Niveau de criticité épidémiologique

Au moins 1C Élevée
Au moins 1B sans C Modérée
Que des A Limitée
* Pour les EHPAD, la catégorie C est attribuée sans considération du nombre de cas, ni du nombre d'hospitalisations ou de décès.

L’existence d’un risque médiatique peut être mentionnée indépendamment de la criticité

épidémiologique. Son appréciation relève de la responsabilité de l’ARS.

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 45
Annexe 3 / Logigramme pour l’enquête autour d’un cas
en établissement de santé

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 46
Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 47
Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 48
 Annexe 4 / Tableau détaillé des ETP nécessaires par activité
et type de cluster
CAS CONFIRMÉS AVEC 10 CONTACTS PAR CAS Heures ETP ETP ETP ETP ETP ETP ETP saisie
épidémio contact suivi organisation saisie cas contacts
• Appel : 30 min / cas et 5 cas / 50 contacts 23,8 3,0 0,5 1,6 0,5 0,3 0,05 0,1
15 min / contact
• Suivi quotidien 10 cas / 100 contacts 44,2 5,5 0,8 3,1 1,0 0,3 0,1 0,2
des contacts :
5 min/contact
• Orga / temps 20 cas / 200 contacts 85,0 10,6 1,4 6,3 2,1 0,3 0,2 0,4
incompressible : 2h

Saisie : 5 min/cas confirmé et 1 min/contact

10 contacts/cas
1 ETP = 8h

CAS CONFIRMÉS AVEC 20 CONTACTS PAR CAS Heures ETP ETP ETP ETP ETP ETP ETP saisie
épidémio contact suivi organisation saisie cas contacts
• 30 min pour 5 cas / 100 contacts 41,3 5,2 0,5 3,1 1,0 0,3 0,05 0,2
1 confirmé et
15 min pour les contacts
• 5 min pour 10 cas / 200 contacts 79,2 9,9 0,8 6,3 2,1 0,3 0,1 0,4
le suivi quotidien d'un
contact
• 2 h de temps 20 cas / 400 contacts 155,0 19,4 1,4 12,5 4,2 0,3 0,2 0,8
incompressible
organisationnel

20 contacts par cas

1 ETP = 8h

CLUSTER dans un contexte relativement restreint Heures ETP ETP ETP ETP ETP ETP ETP saisie
épidémio contact suivi organisation saisie cas contacts
• Cluster 5 cas / 25 contacts 17,3 3,5 1,8 0,8 0,3 0,5 0,05 0,05
avec peu de
déplacement / milieu
restreint
• 5 contacts / cas 10 cas / 50 contacts 24,6 4,9 2,1 1,6 0,5 0,5 0,1 0,1
20 cas / 100 contacts 39,2 7,8 2,8 3,1 1,0 0,5 0,2 0,2

CLUSTER dans un contexte « très ouvert » Heures ETP ETP ETP ETP ETP ETP ETP saisie
épidémio contact suivi organisation saisie cas contacts
• Cluster où les personnes 5 cas / 50 contacts 22,8 4,6 1,8 1,6 0,5 0,5 0,05 0,1
se sont beaucoup déplacées
• 10 contacts/cas 10 cas / 100 contacts 35,5 7,1 2,1 3,1 1,0 0,5 0,1 0,2
20 cas / 200 contacts 61,0 12,2 2,8 6,3 2,1 0,5 0,2 0,4

ÉCOLE Heures ETP ETP ETP ETP ETP ETP ETP saisie
épidémio contact suivi organisation saisie cas contacts
Détection d'un cas dans une 1 cas / 200 contacts 73,9 9,2 0,2 6,3 2,1 0,3 0,01 0,4
école
5 cas / 200 contacts 76,3 9,5 0,5 6,3 2,1 0,3 0,05 0,4
10 cas / 300 contacts 114,2 14,3 0,8 9,4 3,1 0,3 0,1 0,6

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 49
Citation suggérée : Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19.
Saint-Maurice : Santé publique France. Version du 25 mai 2020, 50 p. Disponible à partir de l’URL : www.santepubliquefrance.fr

ISSN : 2647-4816 / ISBN-NET 979-10-289-0635-1 / RÉALISÉ PAR LA DIRECTION

DE LA COMMUNICATION, SANTÉ PUBLIQUE FRANCE / DÉPÔT LÉGAL : MAI 2020

Santé publique France / Guide pour l’identification et l’investigation de situations de cas groupés de COVID-19 / p. 50