Université Iba Der Thiam de Thiès (UIDT) 2022-2023
Traitement d’image et Representation des données 3D
Application en imagerie médical
TP 3 :
Segmentation 3D
Les TP utilisent le logiciel 3D Slicer version 5.3-2023-07-01 et trois jeux de données
accessibles sur le site
Afin de pouvoir suivre les TP, il est nécessaire d’avoir installé 3D Slicer et les fichiers de
données.
Cas Clinique
• Les méningiomes sont des
tumeurs cérébrales extra-axiales à
croissance lente, issues des
cellules arachnoïdiennes.
• Les traitements possibles
comprennent l'observation, la
chirurgie et la radiothérapie
• Les prédicteurs de grades
tumoraux basés sur l'imagerie ont
le potentiel d'améliorer la prise de
décision clinique
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Objectif Général
Ce TP est une introduction aux
techniques de segmentation d'images
pour la caractérisation des tumeurs à
l'aide de la plateforme 3D Slicer.
Caractéristiques des
données l'imagerie
• Les caractéristiques quantitatives
dérivées des données d'imagerie
peuvent fournir des informations
cliniquement pertinentes pour
prédire le grade de la tumeur et
évaluer la réponse au traitement.
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Matériel didactique
• 3D Slicer version 5.3
• Jeu de données TP 3 - Segmentation
Aperçu des tâches
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Partie 1 : Chargement des
données et mesures du
diamètre de la tumeur
Chargement de données
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Partie 2 : Segmentation de
la tumeur
Segmentation d’image
• La segmentation d'images est le processus d'identification des contours de structures étudiées
dans les données d'imagerie
• La segmentation peut être effectuée manuellement ou à l'aide d'algorithmes de segmentation
automatisés.
Image Segmentation
• Le module Segment Editor de 3D Slicer fournit des outils puissants pour la segmentation
manuelle et semi-automatique.
• Le module prend une image de référence (volume principal) en entrée et produit une image
segmentée (segmentation) en sortie.
Terminologie
Dans ce TP,
- Le Volume principal méningiome est le jeu de données initial d'IRM cérébrale.
- La segmentation du volume de segmentation est un objet de segmentation ayant les mêmes
dimensions et la même origine que le volume principal.
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Le module Segment Editor
Le module Segment Editor
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3ème Partie : Calcul
du volume de la
tumeur
Mesures 3D
Cette section montre comment calculer le
volume de la tumeur segmentée en utilisant le
module Segment Statics
Mesures de la tumeur
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Remerciements
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