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TP2 Visualisation 3D

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Université Iba Der Thiam de Thiès (UIDT) 2022-2023

Traitement d’image et Representation des données 3D


Application en imagerie médical

TP 2 :
Visualisation 3D

Les TP utilisent le logiciel 3D Slicer version 5.3-2023-07-01 et trois jeux de données


accessibles sur le site
Afin de pouvoir suivre les TP, il est nécessaire d’avoir installé 3D Slicer et les fichiers de
données.

Dr. I. GUEYE 1
Université Iba Der Thiam de Thiès (UIDT) 2022-2023

Objectif Général

Ce tutoriel est une introduction à la visualisation d’images


DICOM et de modèles 3D dans 3D Slicer.

Objectifs d’apprentissage
A l’issu de ce tutoriel, vous serez en mesure de :
● réaliser un rendu de volume de TDM
● charger et visualiser des modèles 3D surfaciques reconstruits à partir de données d’IRM

Logiciel et jeu de données du tutoriel

3D Slicer version 5.3.2023-07-01 TP 2 : Visualisation 3D

Jeu de données du TP
● Le répertoire Atelier 2 contient deux sous-répertoires :
○ Scene_3D
○ TDM

Dr. I. GUEYE 2
Université Iba Der Thiam de Thiès (UIDT) 2022-2023

Partie 1 Le Rendu
Volumique

Charger un volume DICOM

Dr. I. GUEYE 3
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Charger un volume DICOM

Module Rendu des Volumes

Dr. I. GUEYE 4
Université Iba Der Thiam de Thiès (UIDT) 2022-2023

Le Rendu Volumique

● Les techniques de Rendu


Volumique permettent la visualisation
3D de jeux de données
● Le module Rendu des volumes de
Slicer permet une visualisation 3D
interactive des images DICOM.

Dr. I. GUEYE 5
Université Iba Der Thiam de Thiès (UIDT) 2022-2023

Partie 3 Chargement et
visualisation de modèles
3D surfaciques

Tutoriel sur les données

Le jeu de données Scene3D contient des


modèles 3D de l'atlas cérébral
développé par le département de
radiologie du Brigham and Women's
Hospital, Harvard Medical School (NIH
P41 RR013218, NIH R01 MH05074).

Scène dans Slicer


● Slicer stocke toutes les données chargées dans un fichier appelé scène.
● Chaque jeu de données, tel qu'un volume d'images, un modèle de surface ou un ensemble de
points, est représenté par un nœud dans une scène Slicer.
● Tous les modules Slicer opèrent sur les données stockées dans une scène Slicer.

Dr. I. GUEYE 6
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Charger une scène

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Dr. I. GUEYE 7
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Dr. I. GUEYE 8

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