Microbiologie
LES ARCHÉES
I. Généralités
A. Introduction
Les archées sont des procaryotes bien que phylogénétiqement parlant, ils sont plus proches des eucaryotes. Les archés sont
trouvés dans des milieux très diverses.
30% de la population microbienne correspond aux archées qui sont particulièrement bien adaptés aux
conditions extrêmes. Ceci n’est donc pas négligeable.
Il y a des virus capables d’infecter des archées, appelés archépages.
Il existe pleins de formes possibles qu’on ne peut pas classer selon leur forme.
B. Phylogénie
La phylogénie des archées évolue en permanence notamment grâce au séquençage des RN-16S et la métagénomique.
Ils vivent dans les milieux les plus extrêmes comme les plus ordinaires, notamment dans les milieux riches en nutriments.
D’après le séquençage de l’ARN-16S et de certaines protéines conservées, on compte 5 phylotyes des
archées ;
• Euryarchaeota (1ère découvertes)
• Crenarchaeota
• Korarchaeota
• Thaumarchaeota
• Aigarchaeota
II. Caractéristiques
A. Groupes physiologiques ou métaboliques
Les archées cultivables peuvent être classé en 6 groupes ;
Selon leur physiologie ;
• Halophiles
• Thermophiles
• Acidophiles
Selon leur métabolisme ;
• Méthanogènes (fabrique du méthane)
• Nitri cateurs
• Oxydent le méthane (utilise le méthane comme source)
Les méthanogènes est le groupe le plus diversi é. Ce sont des anaérobies strictes et sont
retrouvés dans des environnements riches en matière organique.
Ils sont capables, grâce à des enzymes et des coenzymes qui leur sont propres, de faire de la
méthanogénèse.
Ces archées sont responsables des 2/3 du méthane produit sur terre.
B. Archées Gram + et Gram -
Les Gram + sont des exceptions.
Ces archées ont des enveloppes di érentes que celles des bactéries.
Elles ont une paroi appelée pseudomuréine composée d’un NAG, d’un N-acétylalosa-
minuronique, et d’une chaine peptidique.
Chez d’autres archées, ce n’est pas une structure de pseudomuréine mais une structure de
chondroïtine.
C. Les lipides et les membranes
La membrane plasmique est composée de lipides non polaires (7-30%) et les phospholipides n’ont
pas de liaisons ester mais une liaison éther plus stables et plus di cilement dégradante, ce qui permet
une meilleure résistance aux températures et pH extrêmes.
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Chez les archés, le glycérol est branché à des isoprénol qui sont aussi branchés par des liaison éther.
Les membranes vont être stabilisés par des lipides non polaires qui vont s’insérer (7-30%).
D. L’information génétique
Les archées ont la même organisation chromosomique que les bactéries.
L’information génétique est porté par un chromosome circulaire et peuvent contenir des plasmides.
Le mode de réplication est de type eucaryote dans un contexte bactérien.
E. L’appareil de transcription
L’ARN polymérase des archées est à mi-chemin évolutif entre celle des bactéries et celles des eucaryotes.
La structure des promoteurs ressemblent à ceux des eucaryotes. Ainsi, le système de transcription est très proche de celui des
eucaryotes.
La RNAP possède 10 sous-unités. Il n’y a pas de facteur σ comme chez les eucaryotes.
L’ARNp des archées ressemble le plus à celle des eucaryotes.
La rifampycine est active contre les ARNp des bactéries mais pas ceux des eucaryotes
ni des archées, cela permet un renforcement du lien de parenté.
Structure du promoteur ;
• Bactérie : facteur δ permet la reconnaissance des boites -35 et -10
• Eucaryote : 2 protéines reconnaissent une boite -25
• Archées : possède des régulateurs spéci ques des eucaryotes
Opéron chez les archées ;
• Co-transcription + pas d’épissage (pas d’introns)
• Traduction directe
Chez les archées, il y a des boites de régulation qui xe des régulateurs
transcriptionnels qui ressemble plus à ceux des bactéries.
Même s’il y a un système ressemblant à celui des eucaryotes, les bactéries et archées
peuvent avoir des opérons. Donc, il n’y a pas d’épissage car pas d’introns.
F. Les ribosomes
Pour les archées, il y a un ribosome 70S avec une petite sous-unité 30S et une grande sous-unité 50S comme les bactéries.
Mais leur ribosomes sont inhibés par les mêmes antibiotiques que ceux qui inhibent les ribosomes eucaryotes : anisomycine et
toxine diphtérique.
L’avantage des archées est que leur capacités à vivre dans des conditions permettent de découvrir des capacités métaboliques et
enzymatiques qui peuvent avoir des applications en biotechnologies ;
• Haute température : puri cation, solubilité en substrat
• Salinité élevée : milieux non aqueux
La Taq Polymérase utilisée en PCR a été retrouvée chez la bactérie Thermus aquaticus.
Pour les archées, on a aussi découvert une enzyme Pfu Polymérase chez l’archée Pyrococcus furiosis qui produit de l’ADN à très
haute température et qui est très dèles.
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III. Bilan sur les archées
Les archées sont à mi-chemin entre les bactéries et les eucaryotes.
—> Structures cellulaires
Leur morphologies sont identiques aux bactéries mais avec d’autres formes diverses ; carrés, triangulaires, longs laments non
segmentés.
Dans la membrane des archées, on trouve des lipides originaux :
• Les chaines hydrocarbonées sont xées au glycérol par une liaison éther (et non ester), le lipide est donc un alcool gras et non un
acide gras
• Rami cations des chaines par un méthyl ou éventuellement contiennent des cycles à 5C
• Parfois en monocouche, on obtient des tetraethers en 40C
Toutes les combinaison existent au sein des membranes des archées qui conféreront plus ou moins de rigidité à la membrane.
Pour la paroi des archées ;
• Type d’enveloppe le plus commun des archées : couche S
• Pas de peptidoglycane mais chez quelques archées méthanogènes un pseudomuréine constitué d’un NAG et d’un acide N-
acétylalosa-minuronique spéci que des archées. Les AA de la chaine peptidique sont tous en con guration L
• Aucune arche n’a de membrane externe à part Ignicoccus
—> Transcription
• ARN polymérase d’archées : 11-12 sous unités apparentées aux sous unités de l’ARN polymérase II des eucaryotes
• Initiation de a transcription chez les archées nécessite une protéine de liaison à la TAAR box et le facteur de transcription B qui se
lie au BRE comme chez les eucaryotes
• Possibilité d’avoir des opérons
• Pas d’épissage
—> Traduction
• Ribosome 70S comme chez les bactéries mais sensibles aux antibiotiques eucaryotes
—> Réplication
• Plus proche de la réplication des eucaryotes
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