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Nutrition Bactérienne et Besoins Essentiels

Ce document décrit les besoins nutritionnels des bactéries, notamment les sources d'énergie, d'électrons, de carbone, d'azote, les éléments minéraux nécessaires et les différents types trophiques. Il contient des informations détaillées sur la nutrition bactérienne.

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Nutrition Bactérienne et Besoins Essentiels

Ce document décrit les besoins nutritionnels des bactéries, notamment les sources d'énergie, d'électrons, de carbone, d'azote, les éléments minéraux nécessaires et les différents types trophiques. Il contient des informations détaillées sur la nutrition bactérienne.

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Université Mohammed V de Rabat

École Supérieure de Technologie

BACTERIOLOGIE 2

NUTRITION BACTERIENNE

Prof. Mounaim Halim EL JALIL

Filière Génie Bio Industriel Année universitaire 2020-2021

2021 MicroGen 2021 1

PLAN :

A. C’est quoi la nutrition (chez les bactéries) ?

B. Quels sont les besoins nutritionnels des bactéries ?

C. Les autres besoins élémentaires : Azote et minéreaux

D. Les besoins essentiels non communs

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1
A. LA NUTRITION CHEZ LES BACTERIES

A.1. Définition :
- Physiologiquement, les bactéries ont besoin de se nourrir pour assurer

leur fonctionnement, leur croissance et leur division, cellulaires.

- Chimiquement, les nutriments permettent à la bactérie de construire les

biomolécules qui constituent ses composantes cellulaires : peptidoglycanes,

glucides, lipides, protéines et acides nucléiques…etc.

- Nutriments = substances organiques (ac. ami., glucides, acides gras, …)

ou inorganiques (phosphates, soufre, nitrates, …).

- Les bactéries produisent des enzymes de digestion qui leurs permettent

d'absorber puis de métaboliser certains constituants alimentaires.


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A.2. Besoins nutritifs bactériens :


La connaissance de ces besoins est nécessaire pour pouvoir
remplir les conditions de culture optimale des groupes de
bactéries recherchés.

Besoins élémentaires Besoins essentiels


communs à toutes les bactéries spécifiques pour certains types

- L’EAU, - Facteurs de croissance


- une source d'énergie,
- une source de carbone,
- une source d’électron
- une source d'N, de P et de S
- et éléments minéraux : (Na, Cl, K, Mg et moins Fe, Ca, Cu…)
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2
B. LES BESOINS NUTRITIONNELS CHEZ LES BACTERIES

B.1. Source d’énergie = Catabolisme

B.2. Source d’électron = Catabolisme

B.3. Source de carbone = Anabolisme

B.4. Source d’azote

B.5. Besoins en éléments minéraux

B.6. Besoins en Facteurs de Croissance


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B.1. Source d’énergie = Synthèse d’ATP


La bactérie a besoin de synthétiser de l’ATP. Pour cela un donneur d’électron minéral
ou organique réduit la NAD+ (nicotinamide adénine diP, accepteur final d’électrons)
donnant la NADH (pouvoir réducteur) activant ainsi l’enzyme ATP-synthétase qui par
phosphorylation de l’ADP (+ Pi) donne une molécule d’ATP (énergie). Le but est
d’assurer le métabolisme, le transfert inter membranaire et la mobilité.

PHYSIQUE = LUMIÈRE CHIMIQUE = OXYDATION

Phototrophes Chimiotrophes

Photosynthèse = Chimiosynthèse =
Utilisation de l’énergie lumineuse Utilisation de l’énergie chimique
pour réduire la matière pour réduire la matière
2021
en matière organique MicroGen 2021
en matière organique 6

3
B.2. Source d’électron = Catabolisme
Une réaction d’oxydo-réduction a besoin d’un donneur et d’un accepteur d’électron :

Selon le type du donneur d’électrons


ou source de pouvoir réducteur on distingue :

Lithotrophe Organotrophe

Le donneur des électrons est de la Le donneur des électrons est de


matière minérale =
la matière organique =
Ces bactéries se développent en milieu
inorganique avec le CO2 comme seule Ces bactéries exigent des composés
source de carbone
2021 MicroGen 2021
organiques pour se reproduire 7

B.3. Source de carbone = Anabolisme

Le carbone est l'élément constitutif le plus abondant chez les bactéries

Selon la source de carbone on distingue :

Autotrophes Hétérotrophes

Exigent un composé inorganique: Exigent des composés


- CO2 (gaz) = Nitrosomonas (sol et eau) organiques pour se reproduire
- CH4 (gaz) = Methylococcus (sol et eau) - Glucose : presque toutes
Ce sont des bactéries méthanogènes - Lactose : Bactéries lactose +
- HCO3- (Ion) = Synechococcus - Amidon : Bactéries amylase +
2021 MicroGen 2021 8

4
Les Types Trophiques des Procaryotes

Source d’énergie Source d’électrons Source de carbone

lumineuse chimique inorganique organique inorganique organique

phototrophe chimiotrophe lithotrophe organotrophe autotrophe hétérotrophe

LE NOMBRE DE TYPES TROPHIQUE = COMPOSITIONS POSSIBLES ?

2021 MicroGen 2021


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Les Types Trophiques des Procaryotes


Types majoritaires :
- Photolithoautotrophe = énergie lumineuse + donneur d’électrons H2S (photosynthèse
non oxygénique bactéries sulfureuses) ou H2O (photosynthèse oxygénique des
cyanobactéries qui a donné l’oxygène dans l’atmosphère) + C minéral de CO2 ;
- Photoorganohétérotrophe = énergie lumineuse + donneur d’électrons matière
organique + C organique (Halobacterium ou Archébactéries des milieux très salés)
- Chimiolithoautotrophe = source d’énergie oxydation de H2S + source d’électrons H2S
+ C de CO2 (chimiosynthèse des bactéries des sources chaudes océaniques et des
Nitrosomonas et Nitrobacter des sols et des eaux douces) ;
- Chimioorganohétérotrophe = Chez les Eucaryotes mitochondrie (oxydation complète
de la matière organique) chez les Procaryotes fermentation (oxydation incomplète).
Types minoritaires :
Photolithohétérotrophe, photoorganoautotrophe, chimiolithohétérotrophe,
chimioorganoautotrophe
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5
SCHEMA GENERAL DU METABOLISME D’UNE CELLULE

CHIMIOORGANOHÉTÉROTROPHE

Les intermédiaires sont :


1 = ATP, intermédiaire énergétique
2 = NAD(P)H, coenzyme d'oxydo-réduction
3 = pyruvate, malate, oxaloacétate, acétyl CoA etc. (molécules du métabolisme intermédiaire).
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SCHEMA GENERAL DU METABOLISME D’UNE CELLULE


PHOTOLITHOAUTOROTROPHE (CYANOBACTERIES - AQUATIQUES)

Les intermédiaires sont :


1 = ATP, intermédiaire énergétique
2 = NAD(P)H, coenzyme d'oxydo-réduction
3 201
= pyruvate, malate, oxaloacétate, acétyl CoA etc. (molécules du métabolisme intermédiaire).
12

6
4. Source d’azote
• La synthèse des protéines nécessite des substances azotées .
nodules de Rhizobium
• La source d’azote peut être : sur des racines

* De l'azote moléculaire :

- bactéries vivant en symbiose avec


des légumineuses (Rhizobiom)

- bactéries jouant un rôle dans


la fertilisation des sols. (Azotobacter)
Azotobacter

* Des composés inorganiques (ammoniac, sels d'ammonium, nitrites, nitrates)

 Des sources organiques (groupements amines des composés organiques)


 Dans les milieux de culture l’azote est souvent apporté par les composés
organiques peptones (proteines hydrolysées de viandes, des laits et de
soja) ou par l’azote mineral (sels d’ammonium ou sulfates d’ammonium)
Chez la majorité des bactéries 13

5. Besoins en éléments minéraux


* Souffre (S) :
Nécessaire à la synthèse de certains acides aminés (groupement thiol R-SH de méthionine et
cystéine) utiles pour la fabrication de Coenzymes comme la biotine et la thyamine.

Dans les milieux de culture il est principalement incorporé sous forme de sulfates (sulfate
d’ammonium ou de magnésium ou de fer ou de sulfure réduit H2S) ou de composés souffrés
organiques (méthionine et cystéine).

* Phosphore (P) :
Nécessaire à la synthèse des acides nucléiques (ADN, ARN, ATP), de nombreuses coenzymes. il est
incorporé sous forme de phosphate minéral.

Dans les milieux de culture nous le retrouvons sous forme de phosphate minéral comme les sels de
phosphate (hydrogénophosphate de potassium ou de sodium K2HPO4 – Na2HPO4 et le
Dihydrogénophosphate de potassium ou de sodium KH2PO4 – NaH2PO4). Ils sont utilisés comme
des systèmes tampon pour limiter les variations du pH dans les milieux de culture. 14

7
5. Besoins en éléments minéraux (suite)

* Les éléments Chlorure Cl et Sodium Na :

Sont souvent apportés sous forme de chlorure de sodium (NaCl ou Na+, Cl-) dans les

milieux de culture.

Le NaCl à 5 g/L permet d’ajuster la pression osmotique du milieu de culture.

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6. BESOINS EN FACTEURS DE CROISSANCE

 Les bactéries capables de croitre en présence d'eau, d'une source

d'énergie, d'une source de carbone, d'une source d’azote et

d'éléments minéraux sont qualifiées de PROTOTROPHES.

 Les bactéries nécessitant, en plus, un ou plusieurs facteurs de

croissance qu'elles sont incapables de synthétiser sont dites

AUXOTROPHES pour ce ou ces facteurs de croissance.

Un facteur de croissance est un élément indispensable à la croissance


de la bactérie. Il doit être présent dans l'environnement car la
bactérie est incapable de le synthétiser.
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Nature des facteurs de croissance

Facteurs de croissance Besoins quantitatifs !

 des bases puriques ou pyrimidiques 10 µg/ml

 des acides gras 10 µg/ml

 des acides aminés 10 µg/ml

 des vitamines 1 µg/ml


(coenzymes, précurseurs de coenzymes,
groupements prosthétiques de diverses enzymes)

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Culture de bactéries à besoins spécifiques


* Si une bactérie a besoin d’un facteur de croissance, ce dernier doit être
ajouté aux ingrédients composant le milieu de culture

* Quelques fois les besoins en facteur de croissance d’une espèce


bactérienne peuvent être satisfaits par la présence dans le milieu d’une
autre espèce capable de synthétiser ce facteur : c’est le phénomène de
Syntrophie

Exemple : la culture sur la même boite de :


* Haemophilus spp = bactérie auxotrophe au facteur V (NAD)
* Staphyloccoque = bactérie productrice de grandes quantités de NAD
Donne une culture en satellite de Haemophilus spp
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Exemple de syntrophie

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