Université A.

Mira de Bejaia Faculté des sciences de la nature et de la vie Département de TCSN

(2ème année LMD) EXAMEN DE BIOCHIMIE Samedi 04 février 2017 (Durée 02h00)

Exercice N° 1 : LES GLUCIDES (3,5 pts)

Soit l’oligoside suivant :

a. Donner la nomenclature précise de cet oligoside.

b. Quel serait le résultat expérimental de la réaction de cet oligoside avec la liqueur de
Fehling? Qu’en déduisez-vous ? Justifiez votre réponse ?
c. Quel est le nom de l’enzyme qui hydrolyse cette molécule au niveau de la flèche indiquée?
d. Si l’on fait agir l’acide périodique (HIO4) sur cet oligoside, combien de molécules seront
consommées?

Exercice 2 : LES LIPDES (4 pts)

Soit un lipide d’un poids moléculaire de 786 présentant les détails suivants :

- Le carbone  (ou carbone 1) du glycérol est estérifié avec un acide gras insaturé à 18 atomes de
carbone. L’action du permanganate de potassium (KMnO4) sur cet acide conduit à la formation
de deux diacides carboxyliques (3C et 9C) et à un monoacide carboxylique à 6 carbones.
- Le carbone  (ou carbone 2) du glycérol est estérifié avec l’acide stéarique.
- Le carbone ’ (carbone 3) du glycérol est estérifié avec une molécule d’acide phosphorique
(H3PO4), laquelle est liée à une molécule de choline.

a- Ecrire la formule développée de ce lipide.

b- Quel est son nom chimique ?
c- A quelle classe appartient ce lipide ?
d- Calculer son indice d’iode.
e- Calculer son indice de saponification.
f- Quelle est l’enzyme qui détachera spécifiquement l’alcool aminé de ce lipide? Préciser
comment s’appelle le reste de la molécule après action de cette enzyme ?
(On donne les PM : I : 127, KOH : 56)

Exercice 3 : LES ACIDES AMINES, PEPTIDES ET PROTEINES (5 pts)

Partie A :

Considérant le peptide suivant : Ala-Leu-Lys-Met-Glu-Arg –Trp-Val-Ser

Indiquez les résultats des traitements suivants sur ce peptide :
a) La trypsine b) La chymotrypsine, c) Le bromure de cyanogène (CNBr)

1
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(2ème année LMD) EXAMEN DE BIOCHIMIE Samedi 04 février 2017 (Durée 02h00)

Partie B :

Dans le but d'étudier la structure d'un peptide P. plusieurs traitements ont été effectués.
- Le peptide P + DNFB + hydrolyse acide donne: DNP-Leu, Lys, Met, Cystine, Ala, DNP-Thr,
Gly et Glu.
- Le peptide P + le β-mercaptoéthanol donne un hexapeptide A et un tétrapeptide B.
- Le peptide A + DNFB et hydrolyse acide donne : Lys, Met, Cys, Ala, DNP-Thr et Gly.
- L'hexapeptide A + Trypsine donne un tripeptide contenant Ala et Thr et un autre tripeptide qui
libère la Gly après action du CNBr.
- Le tétrapeptide B + aminopeptidase permet de libérer la Leu.
- Le tétrapeptide B + chymotrypsine permet de libérer le Glu et un tripeptide.
Donner les séquences des peptides A , B et celle du peptide P.

Exercice N°4 : ENZYMOLOGIE (4,5 pts)

Les résultats suivants décrivent l'effet d'un inhibiteur (I) sur l'activité enzymatique d'une enzyme.

Sans inhibiteur Avec inhibiteur

2
[S] x 10 M vi vi
(μmol/min) (μmol/min)
2 5,0 2,50
5 7,14 3,57
7,5 7,87 3,95
10 8,34 4,17
20 9,09 4,54

a) Déterminer Vmax et Km en présence et en absence de l'inhibiteur

b) De quel type d'inhibition s'agit-il? Justifier.
c) Calculer Ki, pour une concentration de l’inhibiteur [I] = 10-6M

[𝐼]
On donne : 𝛼 = 1 +
𝐾𝑖

Exercice N° 5 : MÉTABOLISME (3pts)

a) Quelle est la différence principale entre le catabolisme et l’anabolisme ?

b) Citer les réactions irréversibles de la glycolyse (avec les noms des enzymes).
c) Donner le bilan énergétique de la glycolyse.
Bon courage

2
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(2ème année LMD) EXAMEN DE BIOCHIMIE Samedi 04 février 2017 (Durée 02h00)

Exercice N° 5 : MÉTABOLISME

NOM :………………………………..

PRENOM :…………………………..

Groupe :………..

1 : Concernant la glycolyse : quelle(s) est (sont) la (les) proposition(s) exacte(s)?

a- La dégradation d’une molécule de glucose par la glycolyse aboutit à la formation d’une

molécule de pyruvate.

b- Durant une glycolyse, il y a deux ATP consommés et quatre ATP formés.

c- La phosphofructokinase catalyse une réaction irréversible.

2 : Soit la réaction suivante : Glucose 6 phosphate => Fructose 6 phosphate

Quelle(s) est (sont) la (les) proposition(s) exacte(s)?

a) Cette réaction est irréversible

b) Cette réaction est catalysée par une glucose-6-phospho- isomérase

c) Cette réaction consomme un ATP

d) Cette réaction produit un ATP

3 : Soit la réaction suivante : Fructose 6 phosphate Fructose 1,6 bi-phosphate

Quelle(s) est (sont) la (les) proposition(s) exacte(s)?

a) Cette réaction est réversible

b) Cette réaction est catalysée par la phosphofructokinase

c) Cette réaction consomme un ATP

d) Cette réaction produit un ATP

3
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(2ème année LMD) LE CORRIGÉ DE L’EXAMEN DE BIOCHIMIE Samedi 04 février 2017

(Durée 02h00)
Exercice N° 1 : LES GLUCIDES (3,5 pts)

a- Le nom de l’oligoside est : β-D-galactopyranosyl (13)-β-D-glucopyranosyl (14)-β-D-

2-aminoglucopyranosyl (13)-β-D mannopyranose. (1 pt c.à.d 0.25 par molécule)
b- La réaction de cet oligoside avec la liqueur de Fehling donne une coloration rouge brique
avec un précipité. Ce résultat expérimental indique que l’oligoside est un sucre réducteur,
car il possède un OH du carbone anomérique (ou hémiacétalique) libre. (1.5 pts c.à.d 0.5
par question)
c- L’enzyme qui hydrolyse l’oligoside au niveau de la flèche s’appelle : la β-glucosidase. (0.5
pts)
d- Il y aura 3 molécules d’acide périodique (HIO4) qui seront consommées au cours de la
réaction. (0.5 pts)

Exercice 2 : LES LIPDES (4 pts)

- L’oxydation par le permanganate de potassium provoque la scission de l’acide gras insaturé

lié au carbone  (ou carbone 1) du glycérol en 3 fragments : un monoacide (à 6C) et deux
diacides (à 3C et à 9C) ; d’où il s’agit de l’Acide linoléique (C18 : 2 , 9, 12 ), sa formule est
la suivante :
CH3-(CH2)4-CHCH-CH-CHCH-(CH2)7-COOH ou (C18 : 2 , 9, 12 ).

Oxydation par KMnO4

CH3-(CH2)4-CHCH-CH-CHCH-(CH2)7-COOH

CH3-(CH2)4-COOH HOOC-CH2-COOH HOOC-(CH2)7-COOH

monoacide (à 6C) diacide (à 3C) diacide (à 9C)

- L’Acide stéarique est un acide gras saturé à 18 atomes de carbone, sa formule est la
suivante : CH3-(CH2)16-COOH ou (C18: 0)

a- La formule développée du lipide (1.5 pts)

b- Le nom du lipide est : (0.5 pts)

1-linoléyl -2- stéaryl -phosphatidylcholine ou α- linoléyl -β- stéaryl –phosphatidylcholine

c- Ce lipide appartient à la classe des glycérophospholipides ou phospholipides (0.5 pts)

NB : si l’étudiant répond « Lipides complexes » la note attribuée sera uniquement de 0.25
pts)
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(2ème année LMD) LE CORRIGÉ DE L’EXAMEN DE BIOCHIMIE Samedi 04 février 2017

(Durée 02h00)

d- Indice d’iode du lipide (Ii) correspond à la masse de I2 (en grammes) nécessaire pour
saturer les doubles liaisons contenues dans 100 g de matière grasse ou de lipide.

Calcul de la masse molaire du lipide

(PM)lipide = PMglycérol + [Link]éique + PMAc. Stéarique + PMAc. Phosphorique + PMcholine – 4 x
PMH2O
= 92 + 280 + 284 + 98 + 104 – 72 = 786g
Ii = (PM I2 x Δ x100)/PMlipide (0.25 pts)
Ii = 254 x 2 x 100/786
Ii = 64,63 (0.25 pts)
e- indice de saponification du lipide (Is) est défini comme étant la masse de KOH (en mg)
nécessaire à la saponification de 1g de corps gras ou de lipide.
Is = (PMKOH x Nombre d’AG x 1000)/PMlipide (0.25 pts)
Is = 56 x 2 x 1000/786
Is= 142,49 (0.25 pts)
f- L’enzyme qui détachera spécifiquement la choline de ce lipide est la phospholipase D.
(0.25 pts)
Le reste de la molécule après action de cette enzyme s’appelle : 1-linoléyl-2-stéaryl-
phosphatidylglycérol (0.25 pts)

Exercice 3 : ACIDES AMINES, PEPTIDES ET PROTEINES (5 pts)

Partie A : Soit le peptide suivant: Ala-Leu-Lys-Met-Glu-Arg –Trp-Val-Ser
Les fragments générés suite à la digestion avec:
a) la trypsine b) la pepsine c) le bromure de cyanogène (CNBr) sont :

a- La trypsine : est une spécifique, catalyse l’hydrolyse de la liaison peptidique dans lesquelles
les fonctions carboxyles sont fournies par la lysine ou l’arginine, sauf si l’acide aminé à
droite = proline. Donc, les fragments issus de l’action de la trypsine sont :

Ala-Leu-Lys-Met-Glu-Arg –Trp-Val-Ser (0.25 pts)

1- Ala-Leu-Lys
2- Met-Glu- Arg
3- Trp-Val-Ser

b- La chymotrypsine : est une spécifique, elle permet la coupure du côté C-terminal des 3
acides aromatiques (phénylalanine, tryptophane et tyrosine), sauf si l’acide aminé à droite
= proline. Donc, les fragments issus de l’action de la chymotrypsine sont :

Ala-Leu-Lys-Met-Glu-Arg –Trp-Val-Ser (0.25 pts)

1- Ala-Leu-Lys-Met-Glu-Arg –Trp
2- Val-Ser
c- Le CNBr coupe l’extrémité C-terminal de la méthionine, qui le transforme en reste
homoseryl lactone.
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(2ème année LMD) LE CORRIGÉ DE L’EXAMEN DE BIOCHIMIE Samedi 04 février 2017

(Durée 02h00)
Ala-Leu-Lys-Met-Glu-Arg –Trp-Val-Ser (0.25 pts)
1- Ala-Leu-Lys-Met
2- Glu- Arg -Trp-Val-Ser

Partie B : Dans le but d'étudier la structure d'un peptide P. plusieurs traitements ont été effectués.
 Le peptide P + DNFB + hydrolyse acide donne: DNP-Leu, Lys, Met, Cystine, Ala, DNP-Thr,
Gly et Glu. :
On remarque deux DNP-acide aminé : donc il y a 2 acides aminés N-terminaux.
Présence d'une cystine : donc Cys-Cys liées par un pont disulfure.
NB : l’hydrolyse acide détruit le Tryptophane. Donc sa présence éventuelle peut être cachée
par ce traitement.
 Le peptide P + le β-mercaptoéthanol donne un hexapeptide A et un tétrapeptide B. Donc le
petide P est composé de deux chaines péptidiques : un hexapeptide A (6 aa) et un
tétrapeptide B (4aa). l'ensemble est 10 aa. Tenons compte du premier traitement on déduit la
présence du Trp.
 Le peptide A + DNFB hydrolyse acide donne : Lys, Met, Cys, Ala, DNP-Thr et Gly. Donc le
Thr est l'aa N-terminal. donc A : Thr-aa2-aa3-aa4-aa5-aa6
 L'hexapeptide A + Trypsine donne un tripeptide contenant Ala et Thr : Donc Thr-aa2-aa3 =
Thr-Ala-Lys sachant que la trypsine coupe après la lys. et un autre tripeptide qui libère la Gly
après action du CNBr. Donc aa4-aa5-aa6 = Cys-Met-Gly sachant que le CNBr coupe après la
Met.
Donc A : Thr-Ala-Lys- Cys-Met-Gly (1.5 pts)
 Le tétrapeptide B + aminopeptidase permet de libérer la Leu. Donc la Leu est l'aa N-terminal.
donc B : Leu-aa2-aa3-aa4
 Le tétrapeptide B +chymotrypsine permet de libérer le Glu et un tripetide. Donc donc B :
Leu-aa2-Trp-Glu. On déduit que aa2 = Cys
Donc B : Leu-Cys-Trp-Glu (1.5 pts)

La séquence du peptide P est: (1.25 pts)

Exercice N°4 : ENZYMOLOGIE (4.5 pts)

On trace à l’aide de la représentation de Lineweaver-Burk 1/vi en fonction de 1/[S] (1 pt)
Avec inhibiteur
1/vi

0,3
1 Sans inhibiteur

0,2
1

0,1

1/[S]
- 0,5 - 0,3 - 0,1
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(2ème année LMD) LE CORRIGÉ DE L’EXAMEN DE BIOCHIMIE Samedi 04 février 2017

(Durée 02h00)

Après extrapolation, les droites obtenues se coupent sur l’axe de 1/[S] en un point = -1/Km.
a) Détermination de Vmax et Km en présence et en absence de l’inhibiteur

En absence de I : En présence de I :
Km = 2 . 10-2M (0.5 pts) Km = 2 . 10-2M (0.5 pts)
Vmax= 10 μmol/min (0.5 pts) Vmax= 5 μmol/min (0.5 pts)

b) Type d’inhibition : inhibition non compétitive. (0.5 pts)

Car l’inhibiteur ne modifie pas l’affinité du substrat pour l’enzyme (0.5 pts)
c) Le calcul de Ki : La droite obtenue en présence de l’inhibiteur se coupe sur l’axe des 1/vi
en un point d’ordonnée 1/V’max = 1/Vmax (1 + [I]/Ki)

 0,2= 0,1 (1 + 10-6/Ki)  Ki = 10-6M (0.5 pts)

Exercice N° 5 : MÉTABOLISME (3pts)

a) La différence principale entre le catabolisme et l’anabolisme est :

Le catabolisme produit de l’énergie alors que l’anabolisme consomme de l’énergie (1pt)
b) Les réactions irréversibles de la glycolyse sont :
Glucose  glucose-6-phosphate (Hexokinase) (0.5 pts)
Fructose-6-phosphate  Fructose-1,6 diphosphate (Phosphofructokinase) (0.5 pts)
Phosphoenolpyruvate  pyruvate (pyruvate kinase) (0.5 pts)

c) Le bilan énergétique de la glycolyse est :

Glucose + 2ADP + 2Pi + 2NAD+  2 Pyruvate + 2ATP +2 NADH,H+ + 2H2O

Le bilan énergétique net est 2ATP +2 NADH,H+ (0.5 pts)