UNIVERSITE MOHAMMED V DE RABAT

FACULTE DE MEDECINE ET DE
PHARMACIE

Biochimie
Métabolique
3ème Année de Pharmacie
S5
Pr. Tellal Saida

2020 - 2021
 COURS DE BIOCHIMIE METABOLIQUE
Troisième année de Pharmacie (NR)

METABOLISME DES ACIDES AMINES

Pr Saida TELLAL
 Objectifs

• Savoir décrire l’absorption intestinale et le transport

sanguin et cellulaire des acides aminés
• Maitriser les processus généraux de dégradation des acides
aminés
• Connaitre les principales pathologies du métabolisme des
acides aminés
• Connaitre les principaux métabolismes particuliers
impliquant les acides aminés
• Maitriser les grandes lignes de biosynthèse des acides
aminés non indispensables
I- INTRODUCTION - GENERALITES
 Métabolisme
Protéines Polysaccharides Lipides
ADP + Pi ADP + Pi ADP + Pi
ATP ATP ATP
Acides aminés Hexoses
Acides gras
ADP + Pi Pentoses
ADP + Pi ADP + Pi
ATP ADP + Pi
ATP
ATP
Pyruvate ATP
Urée
Acétyl-CoA ADP + Pi
Cycle de O2
ATP
L’urée
Chaîne de transport
e- des électrons
Cycle de Phosphorylation
l’acide citrique oxydative
CO2

ATP
-Importance capitale: précurseurs de biomolécules diverses
Ex: purines
pyrimidines
collagène et myosine: importance structurale
enzymes et hormones: importance métabolique
anticorps: défense immunitaire
Albumine: transport de diverses molécules
AA: seule source d’azote de l’organisme
1- AA communs: dans toutes les structures protéiques
20 AA: acides α aminés
- Les 3 premières lettres: ex Leucine: Leu
Valine: Val

Exception: Trp: Typtophane

Gln: glutamine
Asn: Asparagine
Ile: Isoleucine
2 groupes:

- AA indispensables:
His, Lys, Met, Phe, Trp, Thr, Val, Ile, Leu, , Arg

(Arg, His: essentiels uniquement chez l’enfant)

(Tyr: essentiel chez les phénylcétonuriques)

- AA non indispensables:
2- AA particuliers

Présence dans certaines protéïnes particulières

Ex:
- OH pro: collagène

- acide gamma carboxyglutamique

Présent dans les prot de la coagulation (prothrombine)

Carboxylation vit K dépendante
II- ORIGINE ALIMENTAIRE DES AA
Apport des AA essentiels exclusivement par l’alimentation

- Protéines animales: œufs, viande, poissons, volailles, laitage

- Protéines végétales: légumineuses, céréales
Digestion intraluminale et entérocytaire

libération des AA absorption intestinale

Transport sanguin des AA aux cellules

(digestion intraluminale: succession des étapes de la digestion qui surviennent dans la lumière
digestive, par opposition à la digestion entérocytaire, qui se déroule au contact ou à l’intérieur de
l’entérocyte.
 Protéines tissulaires

Protéines alimentaires

Glucides Acides aminés Dérivés azotés

non-protéiques

Transamination

Azote aminé Corps

(dans le glutamate) cétoniques

Acétyl-CoA

Cycle
NH3 de
l ’acide
Urée
citrique
2CO2 9
A- Besoins:

Protéines: 10 -15% de la ration calorique

Besoins: 0,5 à 0,7 g/Kg/jour (A)

Augmentation des besoins: enfant

femme enceinte…
B- Digestion des protéines:

Par hydrolyse enzymatique: protéases

- Estomac: pepsine (endopeptidase, digestion de 15% des prot ingérées)

- digestion surtout dans l’intestin: intraluminale

hydrolyse des protéines en AA et peptides par des exopeptidases et des
endopeptidases sécrétées sous forme de proenzymes inactives
( activation dans l’intestin)

-pancréas: rôle primordial

Trypsinogène trypsine = endopeptidase

Chymotrypsinogène chymtrypsine = endopeptidase

Exopeptidases: action sur les extrémités des peptides

 Hexopeptidases:
- Carboxypeptidases: libèrent l’AA C-terminal
A: concerne plusieurs AA
B: libère la Lys et l’Arg
les cellules du pancréas renferment les procarboxypeptidases inactifs:
activation par la trypsine

-Aminopeptidases: libèrent l’AA N-terminal

Existe une Leucine aminopeptidase: action sur la Leu

La muqueuse intestinale produit des aminopeptidases qui hydrolysent les

oligopeptides et libèrent séquentiellement, à partir de l’extrémité N-terminale,
des acides aminés libres.
On trouve dans la muqueuse intestinale des dipeptidases et des tripeptidases
spécifiques des dipeptides et des tripeptides
 Endopeptidase
aminopeptidase carboxypeptidase

O O O

H2N-CH-C-NH-CH…NH-CH-C-NH-CH…NH-CH-C-NH-CH-COOH

R1 R2 R3 R4 R5 R6

O
H2N-CH-C-NH-CH-COOH

R R’

dipeptidase
Résultat: protéines transformées en peptides sous action des
endopeptidases
Puis en AA sous action d’endo et exopeptidases
C- Absorption intestinale :

A la fin de la digestion par les différentes enzymes de la digestion, les acides

aminés et les dipeptides sont absorbés au niveau de l’intestin grêle. Les
dipeptides sont hydrolysés en acides aminés dans le cytosol des cellules
intestinales. Les acides aminés sont excrétés dans la veine porte et acheminés
vers le foie. Ils y sont métabolisés ou libérés dans la circulation générale.

AA : absorption intestinale par mécanisme actif: il y a des transporteurs

spécifiques d’1 AA ou d’1 groupe d’AA ( au moins 7 transporteurs spécifiques)
Anomalies de l’absorption intest des AA:

Cert maladies héréditaires du métabolisme

Exemple:
- Maladie des couches bleues: malabsorption du Trp
transformation par les bactéries intestinales du Trp non absorbé en
indole oxydation au contact de l’air: couleur bleue des couches
D- Transport sanguin des AA:
- AA=petites molécules circulant sous forme libre dans le sang et le milieu
extracellulaire
- Passage dans la circulation puis le foie ( les 3/4 des AA sont métabolisés
dans le foie) . 1/4 capté par les tissus extra-hépatiques en fonction des
besoins

- Foie = organe principal du catabolisme azoté des AA sauf AA ramifiés: Val,

Leu, Ile (captés principalement par muscle)

- Rein: métabolise la Gln (maintien de l’EAB)

réabsorbe 90% des AA filtrés
E- Transport cellulaire des AA:
- nombreux systèmes spécifiques de transport actif membranaire
L’insuline active l’entrée des AA dans les cellules en période alimentaire

- système général de transport: réaction des AA avec le glutathion

Alton Meister a montré que le glutathion participait au cycle γ-glutamyl, qui
permet l'entrée ATP-dépendante des acides aminés dans les cellules.

.
 . fixation du groupement
gamma glutamyl sur l’AA
(gamma Glutamyl
transpeptidase) qui franchit la
membrane cellulaire

. libération de l’AA dans

cytosol: gamma glutamyl-AA
→ glutamate + AA

. Poursuite du cycle pour

régénérer le glutathion à partir
du Glu
Glu + cys + ATP →
gamma glutamyl-cystéine

. régénération du glutathion en
présence du glycocolle
- Nécessité de systèmes de transport pour entrer dans des organites
intracellulaires/ mitochondrie

Anomalies du transport cellulaire:

- cystinurie- lysinurie: maladie héréditaire la plus fréquente du transport des AA
due à un défaut de réabsorption tubulaire rénale de Cys
et AA basiques: Arg, Lys, Ornithine
anomalie similaire au niveau de la bordure en brosse
malnutrition protéique retard de croissance, ostéoporose,
hépatomégalie …
Cystinose: plus rare

défaut de transport de la cystine qui reste dans les lysosomes des

cellules rénales principalement

décès par insuffisance rénale aiguë

(Lysosomes: organites cellulaire

sont des sacs à enzymes. Il y a beaucoup d'hydrolases qui agissent de façon optimale
à pH 5 ; ex : protéinases, lipases, glucosidases.)

Syndrome du triple H: défaut de transporteurs d’ornithine et citrulline dans

mitochondries hépatiques
maladie très grave
début en période néonatale
III- PROCESSUS GENERAUX DE
DEGRADATION DES AA
Contrairement aux monomères des glucides et des lipides: AA en excès non
Stockés

- première dégradation: enlève le groupement -aminé

.soit par transamination
.soit par oxydation

Récupération de l’ion ammonium et recyclage pour former un autre

acide aminé ou éliminé.
- Le squelette carboné obtenu après le départ du groupement aminé peut :

. être récupéré pour synthétiser l’acide aminé correspondant

. servir de précurseur à la synthèse des glucides ( AA glycoformateurs)

. être converti en acétyl-CoA pour la synthèse des acides gras

(AA cétogènes)
A- Catabolisme de l’azote des AA

-Commence dans les tissus où a lieu la protéolyse: intestin, muscles et dans le foie

-s’achève dans foie: uréogénése

dans rein: ammoniogénése
1- TRANSAMINATION

1-1 – LES AMINOTRANSFÉRASES

- La transamination = la réaction générale du métabolisme des acides aminés

car elle intervient aussi bien dans leur catabolisme que dans leur synthèse

- c'est le processus qui conduit à un échange du groupement -aminé entre

un acide aminé et un -cétoacide

- Enzymes: aminotransférases ou transaminases (cytosoliques)

* Aspartate aminotransférase et Alanine aminotransférase

- réaction réversible
1-2- Phosphate de pyridoxal:
- le phosphate de pyridoxal = coenzymes de transfert de groupement

. groupement prosthétique (fortement lié à l’apoenzyme)

. dérive de la vitamine B6 = pyridoxine (vit hydrosoluble)

. intervient dans 3 types de réactions dans le métabolisme des AA

- transamination
- décarboxylation
- départ de radicaux

- Dans les réactions de transamination orientées vers la dégradation des

acides aminés, l’accepteur du groupement -aminé est toujours l’-

cétoglutarate formation d’un glutamate

 O R
OH
HO-P- OC H2

OH

N CH3

Noyau pyrimidique

R = CH2-NH2 → phosphate de pyridoxamine

R = CHO → phosphate de pyridoxal

Schéma général de la réaction catalysée par une aminotransférase.
1-3 MECANISME DE LA TRANSAMINATION

-Le pyridoxal phosphate est lié au reste lysine de l'apoenzyme des

aminotransférases par une liaison covalente sous forme de base de SCHIFF
(liaison imine) en l'absence de substrat.

-La formation du complexe enzyme-substat se traduit par la rupture de la

liaison avec la lysine et sa reformation avec l’-amine de l'acide aminé

-Après déplacement de la double liaison et l’hydrolyse du complexe, le

groupement -aminé est transféré sur le coenzyme pour former la
pyridoxamine phosphate et la libération du squelette carboné de l’acide aminé
dégradé.

-En présence de l’-cétoglutarate les trois étapes se déroulent en sens inverse

et conduisent à la formation du glutamate.
1-3 MECANISME DE LA TRANSAMINATION

-Le pyridoxal phosphate est lié au reste lysine de l'apoenzyme des

aminotransférases par une liaison covalente sous forme de base de SCHIFF
(liaison imine) en l'absence de substrat.

-La formation du complexe enzyme-substat se traduit par la rupture de la

liaison avec la lysine et sa reformation avec l’-amine de l'acide aminé

-Après déplacement de la double liaison et l’hydrolyse du complexe, le

groupement -aminé est transféré sur le coenzyme pour former la
pyridoxamine phosphate et la libération du squelette carboné de l’acide aminé
dégradé.

-En présence de l’-cétoglutarate les trois étapes se déroulent en sens inverse

et conduisent à la formation du glutamate.
 H
R-C-COOH
NH2
CH=O
P - OCH2 O-

R C COOH CH3
N+
N
H
CH

POCH2 O-
Imine initiale
+ CH3
NH
 R
H+
Transamination
CO2

R-C-COOH R-C-COOH
H2O
N
H+ N
CH2
CH O-
O-

-
N
N
H

Imine
intermédiaire de
transamination
 R- C-COOH Acide α cétonique
O
+ phosphate de pyridoxamine

2e substrat: acide α cétonique 2

R’- CO-COOH
H
H 2O

R’- C - COOH R’ – C - COOH

N N

H - CH CH
Imine
H 2O
intermédiaire
+
N
R’ – CH – COOH + Phosphate de pyridoxal

NH2 CH=O
Résumé de la transamination:

R-CH-COOH R-CO-COOH

NH2

R’- C-COOH R’-CH-COOH

Aminotransférase
O NH2
GPT = Glutamate pyruvate transaminase (ALAT)
COOH COOH

CH-NH2 C=O

CH3
CH3
Pyruvate
Ala
αCG Glu
COOH COOH

CH2 CH2

CH2
CH2
H-C-NH2
C=O
COOH COOH
GOT: Glutamate oxaloacétate transaminase (ASAT)

COOH COOH

CH-NH2 C=O

CH2
CH2
COOH
COOH
ΑCG Glu
Asp Oxaloacétate
Valeurs réf:

GOT: 10 – 45 U/l (37°C)

GPT: 10 - 45 U/l

ASAT/ALAT > 1
1-4 ANOMALIES DES TRANSAMINASES:

- ALAT et ASAT: cytolyse

- Carence en Vit B6: troubles non spécifiques

- Des mutations peuvent toucher certaines transaminases

Ex: déficit héréditaire en Tyr transaminase hépatique tyrosinémie oculo-

cutanée (tyrosinémie de type II = maladie autosomique récessive)

Accumulation de Tyr sa cristallisation dans les cellules de la

cornée (inflammation, larmoiements, rougeur, douleur)
2- DESAMINATION OXYDATIVE

- La transamination = une réaction de transfert du groupement -aminé

- La désamination oxydative (mitoch) le libère sous forme d’ammoniac libre
avec formation du squelette -cétoacide correspondant
Elle est très active dans le foie et dans les reins.

Deux types d’enzymes interviennent : la glutamate déshydrogénase

l’acide aminé oxydase
 R-CH-COOH R-C-COOH

NH2 NH H2O
X XH2

NH3
R-C-COOH
O
X = NAD+
Exemple: enzyme = Glutamate DHase

Glutamate + H2O + NAD+ ⎯→ -cétoglutarate + NADH,H+ + NH3

COOH COOH
NH3
Glu DHase
Glu C=NH C=O

CH2 H2O CH2

NAD+ NADH,H+ CH2-COOH CH2-COOH

iminoglu αCG
- Action des aminotransférases : transformation de l’AA en acide α cétonique
avec transformation de αCG en Glu

- Puis action de Glu DHase pour regénérer αCG à partir de Glu avec libération

de NH3 Très toxique (bloque le métabolisme énergétique:

interrompt en effet le cycle de l’acide citrique parce qu’il
éloigne un composant important (alpha-cetoglutarate) et
peut être nocif tant pour le système nerveux, que pour les
organes ou les muscles)

Elimination (s/f urée l’uréogénése hépatique: voie majeure: les 4/5 de l’azote excrété)
NH4+: voie mineure = l’ammoniogégése rénale: le 1/5)
2-1-La glutamate déshydrogénase:

- régulation allostérique: inhibée par ATP et GTP mais activée par

ADP et GDP

Le sens dépend des concentrations relatives du glutamate, de l’-

cétoglutarate, de NH3 et du rapport des formes réduites et oxydées des
coenzymes nicotiniques

Après un repas riche en protéines se traduisant par une augmentation du

glutamate, la réaction s’oriente vers la désamination et la formation de
l’ammoniac.
Existe d’autres DHases:
Ex: Glycocolle DHase

COOH COOH
Gly DHase
H-C-NH2 H-C=O HOOC-COOH
H
Ac. Glyoxylique Ac. Oxalique
Gly FAD FADH2 = acide
oxoacétique

Capable de se lier à certains minéraux tels que le

calcium, le fer, le sodium, le potassium ou le magnésium,
La consommation d'aliments à forte dose en acide
oxalique peut provoquer des carences alimentaires.
(betterave, épinards, fraise, thé, haricots verts, cacao,
noix…)
2-2- Oxydases des AA:
voie secondaire
-L-acide aminé oxydase (L-aminoacide oxydase):

enzyme hépatique à FMN comme groupement prosthétique

oxyde les AA en transférant directement les électrons récupérés par le coenzyme

à l’oxygène moléculaire
formation et libération de l’-cétoacide correspondant, de NH3 et la

formation de H2O2 décomposé par les catalases

Réaction globale:

COOH COOH
+ O2 + H2O + NH3 + H2O2
H2N-CH C=O
R
R
L- AA α céto-acide
- D-acide aminé oxydase (D-aminoacide oxydase)

- Activité importante dans foie et rein

- oxyde les D-acides aminés (isomères des L-acides aminés, non rencontrés chez les

animaux) qui proviennent de l’hydrolyse des protéines des végétaux et des

membranes cellulaires des microorganismes.

- Ces D-acides aminés sont oxydés suivant le même principe précédent mais par la

D-acide aminé oxydase à FAD

3- Désamination non oxydative:
Désamination hydrolytique pour certains AA: Ser, Thr

Déshydratation suivie d’une désamination hydrolytique

CH2-CH-COOH Ser déshydratase H2C=C-COOH

OH NH2 NH2
H2O
Ser
H3C-C-COOH
NH3
NH
H3C-C-COOH H2O
O
Thr Thr déshydratase ac cétonique butyrique + NH3
4- Devenir du groupement aminé:
4-1 Ammoniogénèse tissulaire:
production de NH4+ de façon constante
- à partir d’AA
- des bases puriques et pyrimidiques …

NH4+ = toxique
Foie: rôle épurateur
IHC: NH4+ (troubles neurologiques, tremblements…)
(Coma ammoniacal)

Ex: Cirrhose décompensée

VN: NH4+ sg: < 40 µmol/l

4-2 Cycle de la Glutamine:

Formation à partir de Glu: Gln synthétase

Glu + NH3 Gln + H20

COOH

HC-NH2

CH2

H2C-CO-NH2

-Réaction dans toutes les cellules

 4-3- Destinées de la glutamine:

4-3-1- biosynthèse des composés azotés

Bases puriques et pyrimidiques

Les bases azotées: les composants essentiels de l'ADN et de l'ARN.

-Les bases puriques: adénine, guanine

Noyau
purine

Gln
Les bases pyrimidiques: cytosine, thymine, uracile

Gln
4-3-2 - Ammoniogénèse rénale

Libération au niveau du rein, de l'ammoniaque de la Gln (au niveau

des cellules tubulaires)

Rôles: détoxification de l’organisme de l’NH3

maintien de l’EAB
 Sang cellules tubulaires lumière tubulaire

Gln Gln Glutaminase

NH3 NH4+

Glu H+

CO2 CO2 + H2O

Anhydrase
Carbonique
H2CO3
Na+
NaHCO3 H+
HCO3-
Schématiquement

– L’anhydrase carbonique rénale accélère la réaction CO2 + H2O  H+ +

HCO3- dans la cellule tubulaire. L’HCO3- repasse dans le compartiment
interstitiel tandis que l’ion H+ est excrété activement dans l’urine en échange
d’un ion Na+
– Il forme l’ion ammonium à partir de l’ammoniac obtenu par désamination de
la glutamine dans la cellule tubulaire. Dans l’urine NH3 + H+ → NH4+

Ammoniogénèse rénale: 30 à 60 mmol/j

Récaputilatif:

Devenir de NH3 lors du catabolisme des AA:

-L'ammoniac se combine au glutamate pour former de la glutamine
(réaction catalysée par la glutamine synthétase).

-Puis la glutamine, sert de "transporteur" de l'ammoniac jusqu'au foie ou

jusqu'aux reins. Dans chacun de ces organes, la glutaminase libére
l'ammoniac de la glutamine par désamidation.

-Au niveau des reins, l'ammoniac est éliminé dans l'urine sous forme
d'ions ammonium.

-Dans le foie l'ammoniac va être transformé en urée. L'urée est ensuite

véhiculée par la circulation jusqu'aux reins d'où elle est éliminée par
l'urine.
4-4 Uréogénèse = production d’urée (cycle de l’ornithine)
Principale voie d’élimination de l’ammoniac
Synthèse dans le foie et élimination rénale
4-4-1 ETAPES:

- Voie exclusivement hépatocytaire: les hépatocytes sont les seules cellules à

exprimer le gène de l'ornithine-carbamyl transférase, enzyme de l'uréogénèse.

- Les atomes d'Azote utilisés par les hépatocytes proviennent de toutes les cellules
de l'organisme sous forme de :

. glutamine, qui transporte l'ammoniac

. ions ammonium, en très petites quantités, provenant surtout des

désaminations intestinales.

- Le Carbone de l'urée provient des bicarbonates.

une phase mitochondriale
une phase cytosolique

Phase mitochondriale
- SYNTHESE DU CARBAMYLPHOSPHATE

Dans les mitochondries la carbamylphosphate synthétase utilise le CO2, le

NH3 et 2 ATP comme substrats pour former le carbamylphosphate.
Deux liaisons phosphates riches en énergie sont consommées

CO2 +NH3 + 2 ATP ⎯→ H2N-CO-O- + 2 ADP + Pi

 - SYNTHESE DE LA CITRULLINE

le carbamylphosphate formé est rejoint par l’ornithine transportée du cytosol

Sous l'action de l'ornithine carbamyltransférase (transcarbamylase), le

radical carbamyle est transféré sur l'ornithine pour former la citrulline.

L-Ornithine + carbamoylphosphate ⎯→ L-Citrulline + Pi

PHASE CYTOSOLIQUE

- FORMATION DE L'ARGININOSUCCINATE.

La citrulline obtenue est transportée dans le cytosol.

Sous l’action de l'argininosuccinate synthétase, la citrulline se condense

avec l'aspartate pour donner l'argininosuccinate avec consommation de
deux liaisons phosphates riches en énergie d'une molécule d’ATP.

L-Citrulline + L-Aspartate + ATP ⎯→ Argininosuccinate + AMP + PPi

- FORMATION DE L’ARGININE

Elle est catalysée par une arginInosuccinate lyase qui assure le clivage en
L-arginine et en fumarate. Cette réaction intervient aussi dans la synthèse de
l'arginine.

Argininosuccimate ⎯→ L-arginine + fumarate

Le fumarate est transporté dans les mitochondries et repris par le cycle de

Krebs qui l’oxyde en oxaloacétate.

L’oxaloacétate sera transaminé en aspartate par l'aspartate

aminotransférase. Ainsi est créé un lien entre les deux cycles de Krebs et de
l’Urée.
GOT: Glutamate oxaloacétate transaminase (ASAT)

COOH COOH

CH-NH2 C=O

CH2
CH2
COOH
COOH
ΑCG Glu
Asp Oxaloacétate
- HYDROLYSE DE L'ARGININE:

L’hydrolyse de l’arginine termine le cycle. Il se forme de l’urée et de

l’ornithine. La réaction est catalysée par l’arginase

Arginine + H2O ⎯→ urée + ornithine

L’urée est excrétée pour être éliminée dans les urines

L’ornithine est transportée dans les mitochondries pour réinitier le cycle.

4-4-2- Bilan du cycle :

Le bilan brut du cycle s’écrit :

NH3 + CO2 + Aspartate + 3 ATP ⎯→ Urée + Fumarate + 2 ADP + AMP

+ 2 Pi + PPi
Hydrolysé en 2 Pi

Au cours de la formation d'une molécule de l'urée, 4 liaisons riches en énergie ont été
utilisées (2 ATP transformées en 2 ADP+ 2 Pi, ATP transformée en AMP + PPi )
Le fumarate libère de l’énergie en se transformant en oxaloacétate via le
malate: production d’1 NADH,H+ qui correspond à 3 ATP.

En conclusion l’élimination d’un ion ammonium libre et de l’amine de l’aspartate

sous forme d'une molécule d'urée ne consomme qu'une liaison phosphate riche en
énergie.
4-4-3 Anomalies de l’élimination de l’ammoniac
Quand le foie n’assure pas correctement l’élimination de NH3 sous forme
urée
hyperammoniémie + augmentation de Gln

a- Hyperammoniémies secondaires:
IHC: hépatites graves, cirrhose encéphalopathie hépatique

b- Hyperammoniémies primitives:
déficit héréditaire en enzymes de l’uréogénèse
maladies très graves à révélation néonatale:
encéphalopathie métabolique provoquant coma et décès rapide

Déficit en OCT: le moins rare des 5 enzymes de l’uréogénèse

Augmentation de l’urémie:
Insuffisance rénale
Jeûne: accélération de la néoglycogénèse à partir des AA
Augmentation du cortisol: augmente le catabolisme des prot
glucagon: augmente captation des AA par les cellules
hépatiques
Maladies infectieuses: augmentation de la température
hypercatabolisme protéique

Diminution de l’urée:
Anabolisants protéiques
Insuline (inhibe la dégradation des protéines et favorise la captation des
acides aminés)
B- Métabolisme de la copule carbonée des AA
Après élimination de la fonction amine, les squelettes carbonés des AA sont
métabolisés en acides organiques

Ces molécules peuvent conduire selon la situation métabolique à:

-la formation de corps cétoniques dans le foie

-la formation de glucose dans le foie
-La formation d’acides gras dans le foie
-La formation d’énergie par le cycle de Krebs et la CRM
 Catabolisme des AA
Glucose

PEP
Pyruvate
Alanine, Cystéine, Glycine,
Isoleucine Sérine, Thréonine, Tryptophane

Acétyl CoA Acétoacétyl CoA

Lysine,Tryptophane
Oxaloacetate Arginine,
Glutamate,
Asparagine
Glutamine,
Aspartate
Histidine,
Proline
Cycle de
l’acide
Phénylalanine, ∂-cétoglutarate
citrique
Tyrosine

Fumarate Isoleucine,
Méthionine,
Valine
Succinyl
CoA Thréonine
1- AA glucoformateurs:

18 AA (tous sauf Leu et Lys) sont impliqués dans la synthèse de glucose via
le pyruvate ou l’un des 4 métabolites du cycle de Krebs

Oxaloacétate, fumarate, succinyl-CoA, -cétoglutarate

Production de glucose principalement en situation de jeûne lorsque la

protéolyse et la lipolyse sont actives

Oxydation des AG production de grandes quantités de NADH,H+

et acétyl-COA  inhibition de la pyruvate DHase
 Pyruvate
DHase
CH3-CO-COOH + HS-CoA CH3CO-SCOA + CO2

NAD+ NADH,H+
 Pyruvate provenant du métabolisme des AA est obligatoirement
carboxylé en oxaloacétate

Dans le cytosol (navettes du malate/aspartate)

L’oxaloacétate est transporté par les

navettes malate/aspartate :
l'oxaloacétate est transformé
en malate en consommant
un NADH+H+ ou en aspartate, puis
transporté par les navettes, et enfin
retransformé en oxaloacétate dans
le cytosol, où un NADH+H+ est
régénéré.

Glucose
Phosphoglycérate
Phosphoglycérate
 Ala, Cys, Gly, Ser, Thr, Trp: pyruvate

Ala pyruvate enzyme = ALAT

Ser pyruvate 2 voies:

- désamination libèrant NH3

- transamination en hydroxy-pyruvate conduisant au pyruvate via le

2-phosphoglycérate (intermédiaire de la glycolyse)
GPT = Glutamate pyruvate transaminase (ALAT)
COOH COOH

CH-NH2 C=O

CH3
CH3
Pyruvate
Ala
αCG Glu
COOH COOH

CH2 CH2

CH2
CH2
H-C-NH2
C=O
COOH COOH
 Gly converti en Ser pyruvate

Cys pyruvate
2 étapes: transamination puis désulfuration

Thr, après transamination est, déshydratée en -cétobutyrate. Ce dernier est

oxydé en propionyl-CoA qui est carboxylé pour produire du succinyl-CoA.

Trp: plusieurs réactions (y compris désamination) Ala

 Phe et Tyr Fumarate Glucose

Phe = AA essentiel conduit à la tyr (Phe OHase)

La Tyr:
- transamination (Tyr transaminase)
- plusieurs réactions d’oxydations

Fumaryl-acétoacétate: clivage par la fumaryl-acétoacétase

Acétoacétate + fumarate
 CATABOLISME DE LA PHENYLALANINE

PHENYLALANINE
Régulation hormonale
Phénylalanine hydroxylase
par le glucagon:
Phosphorylation AMPc dép.
TYROSINE
Tyrosine aminotransférase
Acide parahydroxyphénylpyruvique

Acide homogentisique

Acide maléylacétoacétique

Acide fumarylacétoacétique
Fumaryl acétoacétate hydrolase
Ac. fumarique Ac. acétoacétique
 La tétrahydrobioptérine est
essentielle:

- Dans la conversion de la
phénylalanine en tyrosine
grâce à l'enzyme
phénylalanine-4-hydroxylase

- La conversion de la tyrosine
en lévodopa grâce à l'enzyme
Enzy. tyrosine hydroxylase
hépatique
-la conversion du tryptophane
en 5-Hydroxytryptophane
grâce à l’enzyme tryptophane
hydroxylase.
VOIE DE CATABOLISME DE LA TYROSINE
 CH2-C-COOH
O

Résumé du catabolisme de la phénylalanine et de la tyrosine

Principale pathologie: LA PHENYLCETONURIE (PCU)

- Maladie relativement fréquente: incidence est de 1

pour 16 000 naissances (50 à 60 cas par an en France)

-transmission autosomique récessive

-Augmentation du taux sanguin de la Phe (normalement compris entre 50

et 60 µmoles/l), il peut dans les jours suivant la naissance, atteindre 1000
-à 1500 µmol/l.
-Elle est liée au déficit d’activité de la phénylalanine hydroxylase
(forme classique ou type I)

Signes cliniques:
signe majeur: développement progressif d’une encéphalopathie pouvant
parfois débuter par des convulsions.

Retard mental, troubles du comportement, psychoses,

épilepsie.
-Les hyperphénylalaninémies dues à un déficit en dihydrobioptérine-
réductase (type 2)

 déficit en tétrahydrobioptérine

Outre l’hyperphénylalaninémie, il y a un déficit de la neurotransmission

monoaminergique par dysfonctionnement d’autres hydroxylases
tétrahydrobioptérines dépendantes:

- tyrosine 3 hydroxylase

- tryptophane 5 hydroxylase

Déficit beaucoup plus rare

transmis sur un mode autosomique récessif

Clinique: retard psychomoteur, anomalies du tonus, convulsions

mouvements anormaux, hypersalivation, difficultés de la déglutition
Traitement: uniquement diététique (type 1)

un apport restreint en phénylalanine dans le cadre d’un régime

strict est nécessaire (acide aminé indispensable).

Au-delà de 12 ans on peut relâcher la sévérité du régime et accepter des taux

plasmatiques de l’ordre de 800 µmoles/l

Dans les hyperphénylalaninémies de types 2, si le nouveau-né répond à la

tétrahydrobioptérine :

l’efficacité du traitement est variable et le pronostic global réservé même si

prise en charge précoce.

La jeune femme phénylcétonurique souhaitant avoir un enfant doit

auparavant se replacer sous un régime très strict
-Dépistage systématique à la naissance ( à 3 jours) dans de nombreux pays
(test de Guthrie): test néonatal du buvard

-Repose sur une mesure de la concentration sanguine en phe

-Dans certains pays, le test de Guthrie est associé à d'autres

dépistages néonataux réalisés chez tous les nouveau-nés afin de détecter six
maladies génétiques nécessitant une prise en charge particulière de
l’enfant: hypothyroïdie congénitale, hyperplasie congénitale
des surrénales, galactosémie, déficit en biotinidase, la mucoviscidose et pour
les populations à risque : la drépanocytose
- Déficit en homogentisate oxydase: Alcaptonurie

→ accumulation d’ac homogentisique

Eliminé dans les urines où il est oxydé → coloration noire des urines à
l’air
Pathologie = Alcaptonurie
Maladie bénigne (décrite en 1902, la première affection
héréditaire reliée au déficit d’une enzyme)
-Déficit en fumaryl-acétoacétate hydrolase: LA TYROSINEMIE
HEPATO- RENALE (TYPE I)

Incidence de l’ordre de 1 pour 100 000 à 120 000 naissances

Transmise sur le mode autosomique récessif

responsable d'une atteinte hépatique sévère évoluant vers un

hépatocarcinome, d'une insuffisance tubulaire complexe et
d'une polyneuropathie périphérique aiguë
Le déficit en FAAH → accumulation du fumarylacéto-acétate (FAA),
du maléylacétoacétate (MAA) et de leurs dérivés:
succinylacétoacétate(SAA) et succinylacétone (SA)

maléylacétoacétate

succinylacétoacétate succinylacétone
Le FAA et le MAA: effet toxique au niveau du foie
propriétés mutagènes: responsables probablement du
développement de la néoplasie hépatique

La succinylacétone: responsable de la tubulopathie

(syndrome de FANCONI)

La pathogénie des crises neurologiques de type porphyrique est expliquée

par l'accumulation de l'acide  -aminolévulinique secondaire au blocage de
l'enzyme porphobilinogène synthétase par la succinylacétone (S.A.)

(NB: Les porphyries sont un groupe de troubles de la voie de biosynthèse de l’hème

présentant des symptômes neuroviscéraux, des lésions cutanées ou les deux.)

Succinyacétone (SA) Acide  amino-lévulinique

Traitement :
Essentiellement:

-Régime restreint en Phe et Tyr = la base du traitement de la maladie

-- La transplantation hépatique: alternative thérapeutique efficace aux enfants

tyrosinémiques.
- Déficit en tyrosine aminotransférase (TAT): LA TYROSINEMIE
DE TYPE II

Maladie autosomique récessive

Lésions cutanées apparaissant en général après les lésions cornéennes

Quelques cas de retard mental.
Diagnostic biologique: essentiellement chromatographie des acides
aminés plasmatiques, le taux de la Tyr est très augmenté
Traitement: régime restrictif en Tyr et en Phe
Gln, Glu, Arg, His, Pro α-cétoglutarate Glucose

Glu: transamination α-cétoglutarate

Gln NH3 + Glu

Arg
His Glu

Pro
 Asn, Asp oxaloacétate Glucose

Asparaginase
Asn NH3 + Asp

ASAT

Oxaloacétate
 Val, Ile, Thr, Met Succinyl-CoA Glucose

Aboutissent après nombreuses réactions au propionyl-CoA

Propionyl-CoA
carboxylase
Biotine
ATP
Méthylmalonyl-CoA CO2

Méthylmalonyl-CoA mutase
Vit B12

Succinyl-CoA
- Déficits héréditaires en ces enzymes

 acidémies propioniques et méthylmaloniques

Vomissements
Convulsions
Retard mental
Mort précoce
2- AA cétoformateurs:

Situation de jeûne: protéolyse active

La cétogenèse est, après le cycle de Krebs, la deuxième utilisation la plus importante

de l'acétyl-CoA par les cellules.

Cette voie métabolique devient significative en période de jeûne prolongé ou en cas

de diabète, quand l'organisme ne peut utiliser ses réserves de glucose pour produire

l'ATP.

En effet, dans ces conditions, le cycle de Krebs est ralenti dans le foie car ses

substrats, principalement l'oxaloacétate, sont utilisés par une autre voie, la

néoglucogenèse, de sorte que leur concentration cellulaire diminue.

Ainsi, l'acétyl-CoA issue de la β-oxydation des acides gras ne peut être

condensée sur de l'oxaloacétate par la citrate synthase pour former du

citrate : l'acétyl-CoA rejoint alors la voie de la cétogenèse en tant que substrat

pour former des corps cétoniques, principalement de l'acétylacétate. Celui-ci

est véhiculé par le sang depuis le foie jusqu'aux tissus consommateurs

d'énergie.

Ces derniers peuvent le convertir en deux molécules d'acétyl-CoA.

L'acétyl-CoA ainsi reconstitué sera oxydé à travers le cycle de Krebs et la

chaîne respiratoire.
Les AA cétoformateurs:

- Ile acétyl-CoA
- Trp et Lys Acétoacétyl-CoA
- Leu HMG-CoA SUBSTRATS DE LA CETOGENESE

- Phe et Tyr acétoacétate = CORPS CETONIQUES

Ile: métabolisme suit celui des autres AA ramifiés: Val, Leu

- transamination dans le muscle ac - cétonique = substrat DHase des

ac - cétonique ramifiés

Ile = cétogène et glucoformateur

Foie:
acétyl-CoA corps cétoniques

Propionyl-CoA glucose
Trp et Lys:

Acétoacétyl-CoA corps cétoniques

Principalement
Trp: acétoacétyl-CoA

Ala

Lys acétoacétyl-CoA
Leu:

HMG-CoA corps cétoniques

Leu = le plus abondant des AA ramifiés

- transamination dans le muscle ac - cétonique

Catabolisation (muscle et foie)

DHase des ac - cétoniques ramifiés

HMG-CoA

Leu et Lys: exclusivement cétogènes

LA LEUCINOSE:

Déficit en DHase des ac - cétoniques à chaine ramifiée

→ élimination urinaire accrue des ces acides (odeur de sucre
caramélisé)

atteinte neurologique (neurotoxicité de Leu et son ac - cétoniques)

- Formes à révélation aigue néonatale: grandes détresse neurologique

- Formes à révélation tardive: troubles digestifs et neurologiques + troubles
du comportement. Possibilité d’évolution vers un coma

Accès .spontanés
.provoqués par des régimes hyperprotidiques

.situations de catabolisme: jeûne, infection…

Phe et tyr:

Acétoacétate
IV- METABOLISMES PARTICULIERS
IMPLIQUANT LES AA
A- Catécholamines

Adrénaline = hormone médullosurrénalienne

Noradrénaline
Dopamine neurotransmetteurs
= noyau catéchol
HO
HO
+ chaîne latérale aminée

CH2-CH-COOH HO
NH2
HO Tyr OHase
+ O2 + THB + Dopa
Tyrosine
NADH, H+

Dopa décarboxylase

= site important
de régulation CH2 - CH2
Dopamine
NH2
 HO
Dopamine  hydroxylase CH - CH2 - NH2

HO OH

Noradrénaline

SAM
Méthyl transférase
SAH

HO
CH - CH2- NH – CH3

OH
HO
Adrénaline
B- Créatine
Molécule indispensable (muscle)
Stockée sous forme de créatine phosphate en attendant son utilisation lors des
efforts physiques pour apporter de l'énergie.

apportée à l’organisme selon trois procédés:

- Apport de créatine alimentaire (créatine contenue dans les muscles, donc

dans la chair des poissons, boeufs, volailles ...)

- Synthèse de la créatine par l’organisme à partir de trois AA: Gly, Arg, Met
(créatine endogène)

synthèse dans les reins, foie, pancréas

- Apport de créatine par la supplémentation ( créatine en poudre, gélules,
liquide) = créatine exogène
 COOH

CH-NH2
NH CH2-COOH
CH2 CH2-COOH
+ C NH
CH2
NH2 NH2
CH2 amidinotransférase
Ac guanidine acétique
NH2 Gly
NH-C
NH transméthylase
SAM
Arg SAH
CH2-COOH
NH
C-N-CH3
NH2

Créatine
 Créatine
H2O
ATP

ADP
CK

HN=C-NH
NH PO3H2
HN=C
CH3-N
CH2-C=O
CH3-N-CH2-COOH
Créatinine
Créatine P
Déchet
Réservoir d’énergie métabolique
pour le muscle
C- Hormones thyroïdiennes
Etapes de synthèse:

- Prise en charge de l’iodure par la glande

- Incorporation de l’iode aux tyrosines de la thyroglobuline
- Association des iodotyrosines
- Libération des hormones à partir de la thyroglobuline

1-1 Captation des iodures circulants par la thyroïde

Origine: - alimentation
- catabolisme périphérique des hormones

Prise en charge par les cellules folliculaires par transport actif contre un gradient de
concentration (pompe à iodures)
1-2- incorporation aux tyrosines de la thyroglobuline
- I- captés: oxydation en Iode (I2) en présence de H2O2 et d’une peroxydase

-- Fixation de l’iode sur des groupements tyrosyles de la thyroglobuline

La TG: glycoprotéine synthétisée dans les cellules follic

125 résidus de tyrosine /molécule

- La fixation d’un atome d’I en position 3

I
3 2 NH2
HO 4 1 CH2 CH Tyrosine
5 6 COOH

→ MIT = monoiodotyrosine
→ DIT = diiodotyrosine
1-3- Association des iodotyrosines
- Processus oxydatif qui libère 1 moléc d’Ala

- Condensation de 2 DIT → T4

I I
3’ NH2
HO O CH2 CH
5’ 1’ COOH

I I
- DIT + MIT → 3, 5, 3’ triiodothyronine = T3

I I

3’ 3 NH2
HO O CH2 CH
5’ 5 COOH
I

- MIT + DIT → 3, 3’, 5’ triiodothyronine = rT3

D- Bases puriques et pyrimidiques:
Dégradation des purines:

Nucléotide
nucléotidase

Nucléoside + Pi

nucléosidase

Base + ribose
(Adénine, Guanine)
Adénase Guanase
NH2
Xanthine
Hypoxanthine Xanthine
oxydase O
HN NH
O
Acide urique
O N
(= déchet métabolique éliminée par voie urinaire) N H
H
- Contrairement aux purines, les pyrimidines ne sont pas synthétisées
sous forme de nucléotides
- Le ribose -5-P est ajouté à la pyrimidine formée
Glutamine

CO2
UMP
Dihydroorotase

Orotate PR
transférase
E- Métabolisme de l’hème de l’hémoglobine

1- synthèse de l’hème
Les érythroblastes synthétisent un noyau porphyrinique
tétrapyrrolique appelé protoporphyrine, avant d’y insérer le fer

‘
• la synthèse de l’héme est mitochondriale (au début, et à la fin) et
cytoplasmique
• les précurseurs sont la glycine et le succinyl-CoA
• la régulation principale se situe sur l’ ALA synthétase
• le fer est incorporé à la dernière étape par l’hème synthétase
ALA
synthétase
 ALA

Déshydratase
Condensation de 4 PBG (mécanismes d’oxydoréduction)

1 molécule d’hème
 Dernière étape: incorporation de l’atome de Fer sur la protoporphyrine
Hème

Porphyries = maladies héréditaires dans lesquelles existe une accumulation de

catabolites intermédiaires dans la synthèse de l’hème présentant des
symptômes neuroviscéraux, des lésions cutanées ou les deux.

Toutes les porphyries proviennent d’un déficit partiel d’une des enzymes de la
biosynthèse de l’hème et, excepté pour la porphyrie cutanée tardive, sont pour
la plupart des maladies héréditaires de transmission autosomique dominante.
2- Catabolisme de l’hème

120 j: lyse des GR Hb

Oxydation puis libération du Fe

Biliverdinogloine

Biliverdine Globine

Bilirubine (liposoluble)
Glucuroconjugaison
liée à Alb (foie)
 Bilirubine conjuguée (hydrosoluble, passe dans la bile)

Stercobilinogène et urobilinogène (intestin)

Stercobiline et urobiline

Pathologie:
-Augmentation de bilirubine ictère
- Hyperhémolyse augmentation de BNC
- ictère du NN
F- Tryptophane
acide aminé indispensable. Il est glucoformateur et cétoformateur
 Conversion du tryptophane en NAD+ :

NAD+ dérive de Vit PP (preventing pellagra) = Vitamine B3

-Le déficit dans la voie du métabolisme du tryptophane qui conduit à la synthèse
d'acide nicotinique entraîne la pellagre ( signes digestifs (stomatite, glossite,
diarrhées), signes neuropsychiques (agitation, confusion), signes cutanéo-
muqueux (erythèmes des parties exposées au soleil)…

-La maladie de Hartnup : maladie héréditaire du métabolisme du tryptophane

le déficit touche le transport de l'acide aminé au niveau du tubule rénal, qui
réabsorbe normalement le tryptophane dans la circulation.
Il en résulte une augmentation de la concentration en tryptophane dans les urines
et une diminution dans le sang, où le tryptophane est moins disponible pour la
synthèse de niacine.

Le tableau clinique associe des rashs cutanés rouges épisodiques au niveau des
parties découvertes, dont l'aspect est identique à ceux de la pellagre classique ;
pensée et comportement peuvent également être anormaux.
Outre le transport rénal anormal, il semble également exister une absorption
retardée et anormale du tryptophane alimentaire dans le tractus intestinal.

Les symptômes de type pellagre peuvent être traités par la supplémentation en

niacine
Biosynthèse de la sérotonine :

Sérotonine = neurotransmetteur des cellules de l’intestin, des mastocytes (allergies) et

dans les plaquettes sanguines.

stimule la contraction des muscles lisses et le processus inflammatoire après une

blessure…
La mélatonine ou N-acétyl-5-méthoxytryptamine:

- souvent dénommée hormone du sommeil

- elle régule de nombreuses sécrétions hormonales

- synthétisée à partir de la sérotonine

- elle est sécrétée par la glande pinéale (dans le cerveau) en réponse à l'absence de
lumière.
V - BIOSYNTHESE DES AA NON INDISPENSABLES
Ala, Asp, Glu, gln, Ser, Asn, Gly, pro, Tyr, Cys

Ala, Asp, Glu:

Pyruvate Oxaloacétate CG (ac  cétoniques)

Reçoivent NH2 généralement du Glu sous action des aminotransférases

( ALAt , ASAT)

Glu formé par les réactions inverses

 -Glu provient aussi de Gln
- Asp Asn

Ser:
Transamination avec Glu

P-OH-pyruvate

3-P-glycérate
Gln et Asn:
Asn
Gln synthétase
synthétase (Azote apporté par la Gln)

Asp
Glu

Gly: provient surtout de la conversion de Ser

Ser
transhydroxyméhase
Ser + THF Gly + H2O + THF(CH2OH)
Gly provient aussi de NH3 et CO2

Gly
synthétase
NH3 + CO2+NADH,H+ Gly
+ THF(CH2) + THF
Pro: Inhibiteur
allostérique
Pyrroline carboxylate
Pro de la
réductase carboxylate
CH2-CH2 synthétase
CH2-CH2
CH CH-COOH
CH CH COOH NAD+ N
NADH,H+
O
NH2 Acide pyrrolique carboxylique

Glutamate ADP + Pi
semialdéhyde ATP

Pyrroline carboxylate synthétase

NAD+

NADH,H+
Glu
Tyr:

Synthètisée par hydroxylation irréversible de Phe (AA essentiel)

Phe OHase
Phe + O2 + THB Tyr + H2O + DHB

THB régénéré à partir du DHB par le NADPH,H+

 Cys:

Synthèse à partir de Met (AA essentiel)

-Déméthylation de Met en Homocystéine (Hcy)

-Condensation de Hcy et Ser en cysthationine ( enzyme = cystathionine synthase)
-Hydrolyse de la cysthationine en Cys et a-cétobutyrate qui conduit au propionyl-CoA

Met (utilisé comme donneur de fonction CH3 dans de nombreuses réaction) doit être
régénéré à partir de l’Hcy par l’homocystéine- méthyl- transférase en présence de
Vitamine B12 et CH3-THF

Cys décarboxylée et oxydée produit la Taurine

Synthèse de la S-adénosylméthionine et de la cystéine:

-un groupement adénosyle

(adénosine + ribose) de l'ATP est
transféré à l'atome de soufre de la
méthionine
-S-adénosylméthionine est le principal
donneur de groupe méthyle dans la
cellule
-ce groupe méthyle est ensuite
transféré à un accepteur de groupe
méthyle (X) tel que la phosphatidyl
éthanolamine pour former la S-
adénosylhomocystéine
-celle-ci est hydrolysée pour former
l'homocystéine avec relarguage de
l'adénosine
-la cystéine est formée (conjointement
à l'a-cétobutyrate) par condensation
de la sérine avec l'homocystéine
-Déficit en Cystathionine- synthase:
- à l’état homozygote: accumulation importante d’Hcy dans le sang et

les urines (homocystinurie)

Signes cliniques: anomalies cardiaques et osseuses
retard mental et convulsions

- à l’état hétérozygote: l’augmentation d’Hcy dans le sang est un

facteur de risque cardiovasculaire

-Déficit en homocystéine-méthyl transférase

(Méthionine synthase, ou 5-méthyltétrahydrofolate-homocystéine
méthyltransférase
-Carence en vitamine B12 ou en folates:
également responsables d’hyperhomocystéinémie