REPUBLIQUE DU CAMEROUN REPUBLIC OF CAMEROUN

Paix-Travail-Patrie Peace - work - Fatherland

-------------------------------- ------------------------------
UNIVERSITE DE DSCHANG UNIVERSITE OF DSCHANG
Scholae Thesaurus Dschangensis Ibi Scholae Thesaurus Dschangensis Ibi
cordum Cordum
------------------------- --------------------
ECOLE DOCTORALE POSTGRADUATE SCHOOL
-------------- -------------

BP/ P.O. Box 96, Dschang; Tél/Phone (237) 233 45 13 81; Website: http://www.univ-dschang.org; E-mail: [email protected]

PROT
OCOL
E
PROFIL EPIDEMIOLOGIQUE
RECH DU ROTAVIRUS IMPLIQUE DANS LES GASTRO-
ENTERITES CHEZ LES ERCH
ENFANTS DE MOINS DE 0 5 ANS DANS 04 CENTRES
E
HOSPITALIERS DE YOUNDE, CAMEROUN.
THEM
E:
En vue de l’obtention du diplôme de MASTER en BIOLOGIE
CLINIQUE

Rédigée par : NDIZE PIUGIE AULY LAURE

Licence en biochimie option pharmacologie et cosmetique

SUPERVISEUR
CO-SUPERVISEUR
Dr. FOUNOU ZANGUE Raspail Carrel
BSc ; MSc ; Ph.D Microbiologie Médicale
Chargé de Cours (FMSP/UDS)
Dr TCHOUANGUEU Thibau
Assistant, (FMSP/UDS)

ANNEE ACADEMIQUE 2022-2023

PROCES-VERBAL D’EXAMEN DE PROTOCOLE DE RECHERCHE
1. Titre a été reformulé (première de couverture)
2. L’introduction a été référencié (page 1)
3. La justification et l’intérêt de la recherche ont assez été motivés (page 1)
4. Question de la question a été remplacé par question de recherche (page 2)
5. La question de recherche a été mis en adéquation avec le titre (page 2)
6. La correspondance entre l’idée principale de la recherche avec le titre, la
question de recherche, l’hypothèse de recherche et les objectifs de
recherche a été effectué (page 2)
7. Les 04 centres de santés ont été cités (page 21)
8. Les lieux d’etudes ont été pris au hazard donc nous n’avons pas trouver
de raisons valable (page 21).
9. L’objectif specifique a été revu (page 2)
10.Le questionnaire a été bien administré (page 32 et 33)
11.La source de financement et le chronogramme ont été mentionner (page
34 et 35)
12. Le devenir des selles a été mentionné à la page 24.
13. Les bénéfices directs des participants ont été mentionné à la page 25
14.Et la rédaction , plan , forme de notre document a été revu
 DEMANDE DE LA CLAIRANCE ETHIQUE

Yaoundé, 5 Juin 2023

Nom : NDIZE PIUGIE

Prénom : AULY LAURE
Tel : 694254601\ 682235203
Email : [email protected]

A
Monsieur le Président du Comité d’Ethique
Institutionnel de la Recherche pour la Santé Humaine.

Object : Demande d’une clairance éthique

Monsieur le président,

J’ai l’honneur de venir auprès de votre service solliciter l’obtention d’une clairance
éthique pour mes travaux de recherche en vue de la rédaction d’une thèse de master II en
biologie clinique.

En effet, je suis un étudiant en Master II option biologie clinique à la Faculté de

Médecine et des Sciences Pharmaceutiques de l’Université de Dschang. Nous sollicitons cette
clairance afin de mener à bien les différentes étapes de la recherche que nous avons prévu
effectuer suivant notre protocole portant sur « le profil épidémiologique du rota virus

impliqué dans la gastroentérite chez les enfants de moins 5 ans dans 04

centres hospitaliers de Yaoundé, Cameroun (district de la Cité verte,
district de Biyem assi, district d’Efoulan et au Centre Mère et Enfant de la
fondation Chantal Biya) » durant la période allant Février au juin 2023.

Veuillez agréer, monsieur le président l’expression de ma parfaite considération.

NDIZE PIUGIE AULY LAURE

TABLE DES MATIÈRES

NDIZE PIUGIE Auly Laure i

LISTE DES ABREVIATIONS .................................................................................................iv
LISTE DES FIGURES : .......................................................................................................... v
LISTE DES TABLEAUX ........................................................................................................vi
RESUME ..............................................................................................................................vii
ABSTRAT ............................................................................................................................xiii
INTRODUCTION .................................................................................................................1
CHAPITREI : REVUE DE LITTERATURE ....................................................................3
I.1 Description du rotavirus .............................................................................................. 3
I.2 Epidémiologie .............................................................................................................. 3
I.3 Description de structure ............................................................................................... 4
I.4 Cycle de vie d’un virus ................................................................................................ 9
I.4.1 Phase d’adsorption et de pénétration ..................................................................... 10
I.4.2 Phase de multiplication et d’assemblage ............................................................... 10
I.4.3 Phases de libération ................................................................................................ 11
I.5 Pathogénicité ............................................................................................................. 12
I.6 Clinique ..................................................................................................................... 13
I.7 GENERALITES SUR LES GASTROENTERITES .................................................14
I.7.1 Définition ............................................................................................................... 14
I.7.2 Epidémiologie ........................................................................................................ 15
I.7.3 Diagnostic .............................................................................................................. 16
I.7.4 Traitement .............................................................................................................. 17
I.7.5 Traitement des nausées et vomissements ............................................................... 19
I.7.6 Prévention .............................................................................................................. 20
II. CHAPITRE 2 : MATERIEL ET METHODES ................................................ 21
II.1 Type d’étude ..............................................................................................................
21
II.2 Lieu d’étude ...............................................................................................................
21
II.3 Période d’étude ..........................................................................................................
21
II.4 Population d’étude .....................................................................................................
21
II.4.1 Critères d’inclusion ............................................................................................
21

NDIZE PIUGIE Auly Laure ii

 II.4.2 Critères d’exclusion ............................................................................................
21
II.5 Échantillonnage .........................................................................................................
22
II.6 Matériels ............................................................................................................22
II.6.1 Matériels de collecte des échantillons ..........................................................22
II.6.2 Matériels d’analyse moléculaire ....................................................................22

II.7 Méthodologie ......................................................................................................... 23

II.7.1 Stratégie de recrutement des participants ...........................................................
23
II.7.2 Recherche des facteurs de risque .......................................................................
23
II.7.3 Collecte des échantillons ....................................................................................
23
II.7.4 Transport et conservation des échantillons ........................................................
23
II.7.5 Extraction de l’ARN viral ..................................................................................
24
II.7.6 Détection des rotavirus par la PCR conventionnelle ..........................................
24
II.7.7 Révélation des amplicons par électrophorèse sur gel d’agarose ........................
24
II.7.8 Contrôle qualité ..................................................................................................
25
II.8 Analyse des données ..................................................................................................
25
II.9 CONSIDERATION ETHIQUE ................................................................................
25
II.9.1 Risques potentiels ...............................................................................................
25
II.9.2 Bénéfices ............................................................................................................
25
II.9.3 Mesures prises pour la confidentialité des données et le respect de la vie privés
des participants ..............................................................................................................25
NOTICE D‟INFORMATION ..................................................................................................
26
NOTICE OF INFORMATIONS ..............................................................................................
27

NDIZE PIUGIE Auly Laure iii

FORMULAIRE CONSENTEMENT ECLAIRE .....................................................................
29
FICHE TECHNIQUE ..............................................................................................................
31
CHRONOGRAMME ........................................................................................................... 34
BUDGET PREVISIONNEL ................................................................................................. 35
REFERENCES ...................................................................................................................... 36
III. SUMMARY ..................................................................................................................38
III.1 EDUCATION ......................................................................................................... 39
III.2 PROFESSIONAL EXPERIENCE ............................................................................39
III.3 PEER-REVIEWED AND PUBLICATIONS ............................................................
40
III.4 List of last 15 Publications ........................................................................................
42
III.5 EDITORIAL MEMBER/REVIEWER .....................................................................42
III.6 MEMBER OF SOCIETY ..........................................................................................
43
III.7 ................................................................................................................................44

LISTE DES ABREVIATIONS

ARN : Acide Ribo Nucléique

BRATT : Banane,Riz,compote de pomme, Thé et pain grillé

EDTA: Ethane-1,2-diyldinitrilo Tetra Acetic Acid

GEI : Gastro- Entérite-Infantile

OMS : Organisation mondiale de la santé

RT-PCR : Reverse Transcriptase Polymérase Chain Réaction

RVA : Rotavirus de groupe A

NDIZE PIUGIE Auly Laure iv

LISTE DES FIGURES :

Figure 1: Répartition dans le monde du rotavirus .....................................................................4

Figure 2: structure du rotavirus .................................................................................................9
Figure 3: Réplication d‟un rotavirus ......................................................................................12
Figure 4: Localisation d‟une gastroentérite ............................................................................15
Figure 5: Répartition dans le monde d'une gastroentérite.......................................................16

NDIZE PIUGIE Auly Laure v

LISTE DES TABLEAUX

Tableau 1 : Chronogramme des activités ...............................................................................34

Tableau 2 : Budget prévisionnel ..............................................................................................

36

NDIZE PIUGIE Auly Laure vi

RESUME
Moins de 20% de la population Camerounaise à accès à l’eau, disponible au vouloir pour
usage ménager et sanitaire. Cela implique une augmentation de la probabilité de distribution
des maladies oro-fécales telles que le rotavirus. Malgré le déploiement mondial des vaccins
antirotavirus (RotaTeq/Rotarix / ROTAVAC/Rotasiil), la mortalité et la morbidité dues au
rotavirus du groupe A (RVA) restent élevées en Afrique subsaharienne, causant 104
000 décès et 600 000 hospitalisations par an. Au Cameroun, Rotarix™ a été introduit en mars
2014, mais le diagnostic de routine en laboratoire de l'infection à rotavirus n'est pas encore
une pratique courante. Ainsi, des études estimant la prévalence de la RVA après l'introduction
du vaccin sont nécessaires. L’objectif de notre travail est de déterminer la prévalence
moléculaire des gastroentérites dues aux rotavirus. Nous allons mener une étude descriptive à
visé à analytique chez des enfants âgés de moins de 5ans venus consulter les 04 centres
hospitaliers du District de la Cité Verte, District de Biyem Assi, district d’Efoulan et l’Hôpital Mères
et Enfants de la Fondation Chantal Biya. La méthode de RT-PCR sera effectuée pour l’analyse
moléculaire, et les résultats seront révélées par électrophorèse sur gel d’agarose. La présence

NDIZE PIUGIE Auly Laure vii

du génome sera évaluée en fonction des caractéristiques sociodémographiques et facteurs de
risques.

MOTS CLES : Rotavirus, gastro-entérites, enfants de moins de 5ans

ABSTRAT
Less than 20% of Cameroon's population has access to water, which is available for domestic
and sanitary use. This increases the likelihood of the distribution of fecal-oral diseases such as
rotavirus. Despite the worldwide deployment of rotavirus vaccines (RotaTeq/Rotarix /
ROTAVAC/Rotasiil), mortality and morbidity due to group A rotavirus (RVA) remain high in
sub-Saharan Africa, causing 104000 deaths and 600,000 hospitalisations per year. In
Cameroon, Rotarix™ was introduced in March 2014, but routine laboratory diagnosis of
rotavirus infection is not yet common practice. Thus, studies estimating the prevalence of
RVA after the introduction of the vaccine are needed. The aim of our work is to determine the
molecular prevalence of rotavirus gastroenteritis. We are going to carry out a descriptive
study with an analytical aim in children under 5 years of age attending the 04 hospitals of the
Cité Verte District, Biyem Assi District, Efoulan District and the Mothers and Children
Hospital of the Chantal Biya Foundation. The RT-PCR method will be used for molecular

NDIZE PIUGIE Auly Laure viii

analysis, and the results will be revealed by agarose gel electrophoresis. The presence of the
genome will be assessed on the basis of socio-demographic characteristics and risk factors.

KEYWORDS: Rotavirus, gastroenteritis, children under 5 years of age

NDIZE PIUGIE Auly Laure ix

INTRODUCTION

Au Cameroun, 16 enfants par jour décèdent en milieu hospitaliers au Cameroun ceci due au
rotavirus de groupe A(Ghapoutsa et al., 2021). Une gastro-entérite est une inflammation de la
muqueuse de l’estomac, de l’intestin grêle et du gros intestin, qui provoque de la diarrhée et des
vomissements elle peut être causée par un virus, une bactérie ou un parasite. Les gastroentérites
sont la cause de la mort des enfants de 0 à 5 ans dans nos milieux hospitaliers et constituent ainsi
un problème majeur pour l’OMS(Eteme et al., 2020). La plupart des cas sont d’origine
infectieuse, mais une gastro-entérite peut également être secondaire à l’ingestion de médicaments
et de toxiques chimiques (métaux, substances végétales).la contamination peut être d’origine
alimentaire, hydrique, interhumaine ou parfois zoonotique(Hou, Zeng, Matthijnssens, Greenberg,
& Ding, 2021). Le diagnostic est clinique ou par coproculture(Hou et al., 2021). Le traitement est
symptomatique, mais certaines infections bactériennes ou parasitaires nécessitent un traitement
anti-infectieux spécifique.la plupart des épisodes sont autolimités mais provoquent des
symptômes désagréables. La perte d’électrolytes et de liquides n’entraine habituellement qu’un
faible retentissement chez un adulte en bonne santé(Tesson, Belliot, Estienney, Wurtzer, &
Renault, 2019), mais elle peut être grave chez les très jeunes enfants (déshydratation chez
l’enfant), les personnes âgées, les patients immunodéprimés ou qui ont des maladies graves
associées. Dans le monde on estime que 1,6 million de personnes meurent chaque année de
gastro-entérites ; le caractère et la gravité des symptômes des gastro-entérites varient(Tesson et
al., 2019). Des douleurs abdominales et une diarrhée (avec ou sans présence de sang et de
mucus), une sensation de malaise et des myalgies peuvent survenir. Une sensation de malaise et
des myalgies peuvent survenir(Dian et al., 2021). L’abdomen peut être maitrisé et sensible à la
palpation ; dans les cas graves, une défense pariétale est possible. Les anses intestinales
distendues par les gaz peuvent être palpables(Dian et al., 2021). Des vomissements persistants et
la diarrhée peuvent entrainer une perte liquidienne intravasculaire responsable d’une hypotension
et d’une tachycardie. Un choc hypovolémique avec collapsus vasculaire et insuffisance rénale
oligurique peut survenir dans les cas graves. Il est à noter que la plupart des infections néonatales
sont attribuées aux infections bactériennes, effectué en routine dans les hôpitaux au Cameroun, ne
peut déterminer l’infection par RVA et les cas de cette infection ou des coïnfections sont mal
prise en charge. L’intérêt de cette étude est d’établir un profil épidémiologique des
gastroentérites dues aux rotavirus chez les enfants de moins de 05 ans pour la prise en charge.

NDIZE PIUGIE Auly Laure 1

 a) Question de recherche
Quel est le profil épidémiologique des gastroentérites dues à Rotavirus chez les enfants
de moins de cinq ans ?

a) Hypothèse de la recherche
La prévalence des gastroentérites due aux rotavirus serait élevée chez les enfants de moins de cinq
ans

b) Objectifs de la recherche

Objectif générale

Etablir un profil épidémiologique des gastroentérites dues au Rotavirus chez les enfants de moins de cinq ans.

Objectifs spécifiques

• Déterminer le profil épidémiologique des gastroentérites dues au rotavirus chez les enfants manés
pour dans 04 centres hospitaliers de la ville de Yaoundé
• Détecter les génogroupes de rotavirus retrouvés chez ces patients
• Identifier les facteurs de risque de l’infection à Rotavirus dans cette population.

CHAPITREI : REVUE DE LITTERATURE

NDIZE PIUGIE Auly Laure 2

I.1 Description du rotavirus

Le Rotavirus est un genre de virus de la famille des Reoviridae. Le virus a été identifié
en 1973 par Ruth Bishop à Melbourne. Les rotavirus sont la première cause de gastroentérites
graves chez les nourrissons et les jeunes enfants dans le monde ; Ils semblent (chez la souris
au moins) pouvoir infecter les glandes salivaires, la salive devenant alors un agent infectieux ;
avec les norovirus, ils causent des gastro-entérites chez environ 300 millions de nouveau-nés
et jeunes enfants par an. Les rotavirus sont la première cause de diarrhée aiguë sévère du jeune
enfant dans le monde(Ghapoutsa et al., 2021).

I.2 Épidémiologie

L'OMS coordonne un suivi épidémiologique mondial. Presque tous les enfants sont
infectés par un rotavirus au cours des cinq premières années de leur vie. Cette infection peut
rester asymptomatique ou entraîner une gastro-entérite (GEI : gastro-entérite infantile), dont
les rotavirus sont la principale cause. L'infection est souvent asymptomatique chez l'adulte.
Environ 500 000 enfants de moins de 5 ans meurent de diarrhée à rotavirus chaque année, à
plus de 85 % dans les pays à faible revenu d'Afrique et d'Asie. Depuis 2001, l’OMS a mis en
place un réseau de surveillance des rotavirus (réseaux régionaux de sentinelles en milieu
hospitalier dans 35 pays des six régions de l'OMS), qui a montré que près de 40 % des
hospitalisations pour diarrhée de l’enfant de moins de 5 ans dans le monde sont dues à des
rotavirus (souches G1, G2, G3, G4 et G9 le plus souvent, avec une répartition des souches
variant selon les régions), ceci pour 62 584 échantillons de selles analysés. Pour ces mêmes
échantillons (non nécessairement représentatifs de la réalité mondiale), pour 4 936 enfants
testés positifs au rotavirus de 2001 dans les pays suivis, 325 étaient en Afrique, 388 en
Amérique, 323 en Europe, 1 290 en Méditerranée orientale, et 2 610 en Asie du Sud-Est et
Pacifique occidental. Les souches varient selon les pays ou les régions biogéographiques.
Dans les pays industrialisés, les infections à rotavirus représentent 15 à 50 % des cas de
gastro-entérites ; bien que ces infections soient parfois sévères, la mortalité associée à celle-ci
reste faible. En France, près de 300 000 épisodes annuels seraient décomptés chez les enfants
de moins de cinq ans avec une dizaine de décès. Chaque année, 155 000 consultations en
médecine générale, 30 000 recours aux urgences hospitalières et 14 000 hospitalisations sont
dues aux Rotavirus (2). Son coût annuel est estimé à environ 28 millions d'euros. Lors du pic

NDIZE PIUGIE Auly Laure 3

de l'épidémie hivernale 2005–2006, on estime que 1 850 000 personnes ont consulté leur
médecin généraliste en 8 semaines pour une gastro-entérite ; l'incidence a été de 367 cas pour
100 000 habitants (le seuil épidémique étant fixé à 260 cas pour 100 000 habitants).Il s'agit
donc d'un important problème de santé publique. D'autant plus que chaque année, l'épidémie
de gastro-entérite à Rotavirus concorde souvent avec les épidémies de bronchiolite et de
grippe, pouvant mettre en difficulté les systèmes de soins pédiatriques. On rencontre des
gastro-entérites à Rotavirus lors d'épidémies hivernales, mais il existe également des cas
sporadiques tout au long de l’année.

Figure 1: Répartition dans le monde du rotavirus

I.3 Description de structure

Ce sont des virus non enveloppés de structure icosaédrique et à ARN double brin
(bicaténaire). Les progrès récents de la recherche fondamentale et appliquée sur le rotavirus
(RV) sont passés en revue. Ils consistent en la détermination de la structure des particules RV
et des fonctions des protéines structurelles, la classification en génotypes sur la base
d'analyses du génome entier, la description du génome RV et des attributions de protéines
géniques, la description du cycle de réplication virale et des fonctions des protéines non
structurelles codées RV. protéines ainsi que les protéines cellulaires et les organites cellulaires
impliqués, l'état actuel de la génétique du RV et de la génétique inverse, les déterminants

NDIZE PIUGIE Auly Laure 4

moléculaires de la pathogenèse et de la physiopathologie, les réponses immunitaires
humorales et à médiation cellulaire spécifiques au RV, les réponses immunitaires innées et les
corrélats de protection, le diagnostic en laboratoire , le diagnostic différentiel et l'état actuel du
traitement, l'épidémiologie moléculaire et les mécanismes d'évolution des RV, le
développement et l'application universelle des vaccins contre le RV ainsi que les problèmes
découlant des programmes actuels de vaccination universelle contre le RV et des travaux sur
les vaccins alternatifs. La revue conclut en présentant les problèmes nécessitant une
exploration plus approfondie et les perspectives de la recherche fondamentale et
transrationnelle future (3). Les rotavirus, agents responsables de la gastro-entérite chez les
jeunes animaux et l'homme, sont de gros virus icosaédriques à architecture complexe. Le
génome d'ARN double brin (dsRNA) composé de 11 segments, qui codent pour 6 protéines
structurelles et 6 protéines non structurelles, est enfermé dans trois couches de capside
concentriques. En plus de faciliter les interactions spécifiques à l'hôte, la conception de
l'architecture de la capside dans les rotavirus comme dans d'autres virus à ARN devrait
également être propice à l'exigence de transcrire les segments de génome fermés de manière
répétée et simultanée à l'intérieur de la capside. Plusieurs protéines non structurelles facilitent
les processus ultérieurs de réplication et d'emballage du génome. Des études par Cryo
microscopie électronique de virions intacts, de particules de type virus recombinant, de
complexes fonctionnels, ainsi que de récentes études cristallographiques aux rayons X sur des
protéines de rotavirus ont fourni des informations structurelles sur l'architecture de la capside,
l'organisation du génome, l'interaction des anticorps, l'entrée cellulaire, l'ineffectivité
renforcée par la trypsine, transcription et réplication endogènes. Ces études soulignent des
caractéristiques contrastées et des thèmes unificateurs entre le rotavirus et d'autres virus à
ARN dB (4). En microscopie électronique, les virions de 60 à 80 nm de diamètre ont l'aspect
d'une roue, d'où leur nom. Leur capside est formée de trois couches de protéines. Leur génome
est constitué de onze segments codant douze protéines. Sept groupes antigéniques ont été
identifiés. La protéine VP6 de la couche intermédiaire de la capside détermine les
sérogroupes, A à G. Trois d'entre eux (A, B et C) infectent les humains, majoritairement le
groupe A. Les protéines de la couche externe, VP4 et VP7, induisent quant à elles, la
production d'anticorps neutralisants. La couche interne est formée par VP2, et les protéines
VP1 et VP3 sont associées au génome. La voie de transmission est féco-orale directe ou
indirecte, essentiellement interhumaine. Le virus est résistant dans le milieu extérieur pendant
des mois entre 4 °C à 20 °C. La localisation des polypeptides sur la particule virale a été
étudiée par étapes : dégradation du virus avec des agents chélatants et chao tropiques.

NDIZE PIUGIE Auly Laure 5

L'enveloppe protéique externe est constituée de deux polypeptides, VP3 et VP7, qui
correspondent aux antigènes de neutralisation. La coque protéique interne située entre le virus
le noyau et la coque externe de la protéine sont constitués d'un 42 000 daltons polypeptide
appelé VP6, qui définit les sous-groupes antigéniques. Ces sous-groupes peuvent également
être identifiés indirectement, par les mobilités électrophorétiques de l'ARN génomique viral
segments, notamment les segments 10 et 11, qui définissent électrophérotypes dits "courts" et
"longs" correspondant respectivement aux sous-groupes antigéniques I et II. Les polypeptides
restants de poids moléculaire élevé semblent constituer, avec l'ARN génomique, le noyau.
Particules virales similaires au virus à simple coque ont été détectés peu de temps après
l’infection Viral des particules ressemblant à des noyaux ont également été observées au cours
les derniers stades du cycle infectieux. La transcription virale survenant après la pénétration a
été associée à virus à coque unique. La transcription peut également se produire sous
conditions in vitro après activation du virus par choc thermique où après élimination de
l'enveloppe protéique externe par un agent chélatant, procédures qui produisent un virus à
coque unique. Des rapports antérieurs suggéraient que les noyaux viraux obtenus après
incubation de particules à coque unique avec des agents chaotropiques n'ont pas la capacité de
transcrire le génome viral in vitro. Dans la présente communication, nous concentrons notre
intérêt sur relation structurelle entre la coque protéique interne et le noyau viral, une
interaction qui semble faire in vitro retranscription possible. Les rotavirus humains obtenus à
partir de plusieurs les isolats ont été purifiés comme décrit précédemment. L'extérieur la
coque protéique a été retirée du virion complet par incubation avec 10 mM EDTA pendant 30
min à 37°C, laissant un particule virale appelée virus à simple coque qui, après ré isolement,
pourrait transcrire les 11 gènes viraux in vitro. La coque protéique interne peut également être
obtenue à partir de virus purifié à coque unique incubé avec de fortes concentrations d'un
agent chaotropique. Cette dernière procédure rend un noyau viral qui n'a pas la capacité de
transcrire les gènes viraux in vitro. La composition polypeptidique du virus à simple
enveloppe, du noyau viral et du CaCl2 le surnageant a été analysé par électrophorèse sur gel
de dodécylsulfate de sodium polyacrylamide. Les résultats suggèrent que le seul polypeptide
libéré du virus à coque unique après traitement avec CaCl2 était VP6. Étudier l'élimination de
la coque protéique interne, nous avons utilisé CaCl2, qui présente l'avantage de pouvoir être
extrait de la solution en des agents chélatants, tels que l'éthylène glycol-bis (3-aminoéthyl
éther) -acide N, N, N‟, N'tétra acétique (EGTA) ou EDTA. À assurer l'élimination complète
de la coque protéique interne, nous étudié plusieurs conditions. Le virus à coque unique a été
incubé à une température optimale de 37°C à différents moments et avec diverses

NDIZE PIUGIE Auly Laure 6

concentrations de CaCl2 dans un tampon de chlorhydrate de Tris 50 mM (pH 8,0) (tampon
A). L'incubation d'un virus à coquille unique avec 0,5 M de CaCl2 pendant 10 min a inhibé
plus de 90 % de l'activité ARN polymérase associée au virus à coque unique. L'activité
enzymatique a été déterminée directement incuber la particule virale réisolée dans un mélange
réactionnel contenant 160 mM de tampon Tris chlorhydrate (pH 8,5) contenant 10 mM
MgCl2, 80 mM NaCI, 2 mM chacun ATP, CTP, et GTP, 0,24 mM [3H] UTP (activité
spécifique, 40 cpm/pmol) et 0,1 mM de S-adénosyl méthionine. Après 30 minutes à 45°C, la
radioactivité insoluble dans l'acide a été recueillie sur filtres en fibres de verre, mesurés dans
un compteur à scintillation liquide, et exprimée en picomoles de [3H] UMP incorporé.
Particules virales monocoques purifiées traitées avec 0,5 M CaCl2 pendant 10 min à 37°C
différait considérablement de celui à coque unique virus observé au microscope électronique.
Une coloration à l'acide phosphotungstique à 2 % a révélé la présence d’uniquement des
particules icosaédriques d'un diamètre moyen de 40 nm. Les noyaux viraux avaient un
icosaèdre très lisse surface avec un degré de perméabilité à la tâche plus élevé que le virus à
coque unique. Observation de préparations de noyaux identiques colorées avec 3 % de
molybdate d'ammonium (pH 7,0), ont révélé des particules de noyau avec de petites pointes
qui semblaient émergent de la surface du noyau. Les rotavirus, nouveaux membres de la
famille des Reoviridea, sont maintenant connus comme des agents étiologiques majeurs de la
troentérite gazeuse non bactérienne chez une grande variété d'espèces, y compris les humains.
Les particules virales ont une double capside non enveloppée structure et contiennent 11
segments d'ARN double brin. La capside externe a une masse majeure de 35 à 41 kilodaltons
(kDa) composant, VP7, et un composant mineur de 80 à 88 kDa VP3, (pour un examen, voir
la référence 13). Des études employant isolement de divers gènes réassortis et/ou préparation
de réactifs hautement spécifiques tels que les anticorps monoclonaux ont établi que VP7 et
VP3 fonctionnent tous deux de manière indépendante antigènes de neutralisation. Sabara et al.
Ont montré que la VP7 de forme libre de bovins le rotavirus était capable de se lier aux
cellules et que le monoclonal les anticorps dirigés contre VP7 pourraient inhiber la fixation
cellulaire des bovins rotavirus. Par conséquent, il est probable que VP7 soit le rotavirus
protéine d'attachement cellulaire. En revanche, VP3, qui a l'activité de l’hémagglutinine, s'est
avérée être associée avec restriction de croissance in vitro et virulence in vivo. De plus, le
clivage par la trypsine de VP3 améliore l’infectiosité des rotavirus bovins et simiens et est
essentiel pour l'infectivité du rotavirus humain. Néanmoins, le rôle exact de VP3 dans
l'infection à rotavirus est largement inconnu. Auparavant, nous avons montré que le rotavirus
humain (HRV) KUN souche (HRV-KUN) était absolument dépendante de la trypsine pour

NDIZE PIUGIE Auly Laure 7

multiplication in vitro. Le traitement doux à la trypsine spécifiquement clivée VP3, avec une
perte concomitante de l’activité de l'hémagglutinine qui n'était démontrable qu'en utilisant
d’autres correspondants. Érythrocytes de poulet d'un jour. Par la suite, ils ont trouvé à partir
d'études au microscope électronique que le HRV-KUN infectieux traité à la trypsine a
apparemment pénétré dans les cellules par une pénétration directe à travers la membrane
cellulaire, tandis que le HRV-KUN non traité, bien que non infectieux, a également été pris
dans les cellules par le processus d’endocytose. Là l'indépendance de l'infection HRV-KUN
vis-à-vis de l'endocytose et vésicules à faible pH a été démontrée par la découverte que
L'infection par HRV-KUN était assez résistante à diverses bases faibles lysomotropes et à la
cytochalasine B. En somme, le clivage par la trypsine de VP3 pourrait être nécessaire pour
l'unique processus d'internalisation de HRVKUN après rattachement au cellule cible. D'autre
part, il est possible que le l'attachement virus-cellule ne dépend pas du clivage trypsique de
VP3. Nous avons également décrit des anticorps monoclonaux qui inhibe l'activité de
l'hémagglutinine du HRV KUN non traité, neutralise le HRV-KUN traité à la trypsine et se lie
spécifiquement à VP3 et à l'un de ses fragments clivés par la trypsine. Dans la présente étude,
nous avons d'abord montré que le lysat de Les cellules infectées par HRV-KUN contenaient
une protéine de 35 kDa capable de se lier aux cellules MA104. La liaison du 35-kDa protéine
n'a été inhibée que par un antisérum spécifique du sérotype 2. De plus, un anti-VP7
monoclonal pourrait absorber la protéine de 35 kDa avant le test de liaison, alors qu'un autre
anti-VP7 monoclonal pourrait bloquer les virions HRV-KUN concurrencé la protéine de 35
kDa pour la même surface cellulaire des sites de liaison. A partir de ces résultats et de la taille
de la protéine, nous avons conclu que la protéine de liaison cellulaire de 35 kDa était HRV-
KUN VP7. Deuxièmement, nous avons constaté que l'anti-VP3 les anticorps monoclonaux
n'ont ni inhibé la liaison des 2209.

NDIZE PIUGIE Auly Laure 8

 Figure 2 : structure du rotavirus

I.4 Cycle de vie d’un virus

Le cycle de reproduction des virus est un processus par lequel ils utilisent un organisme
vivant pour se multiplier. Une fois qu'ils réussissent, ils endommagent ce même organisme
pour se multiplier dans un autre corps. Le cycle de reproduction des virus est complexe et
intéressant. Ces particules ne possèdent pas de cellules et ne peuvent donc pas se
reproduire de manière autonome. Pour ce faire, les virus ont besoin d’un hôte, c’est-à-dire
d’un organisme vivant. À l’intérieur de cet organisme, ils sont capables de se répliquer, tandis
qu’à l’extérieur, ils sont susceptibles d’être détruits. Les cycles de reproduction des virus
peuvent être de deux types :

• Lithiques
• Lysogènes
Le cycle de reproduction lytique a lieu lorsque le virus pénètre dans la cellule et y transcrit
immédiatement son matériel génétique. En d’autres termes, il attaque la cellule rapidement et
directement. Dans le cycle lysogène, en revanche, les
Virus s’insèrent dans l’ADN de leur cellule hôte. Ce faisant, ils deviennent très difficiles à
détecter et se multiplient sans qu’on s’en aperçoive. En d’autres termes, ils se camouflent
dans la structure qu’ils infectent. Les étapes sont les suivantes :( N’oubliez pas que les virus
sont des structures composées uniquement d’acides nucléiques et de quelques protéines. Il
s’agit donc de très petites unités. La science ne les classe pas comme des êtres vivants, mais
elle ne les classe pas non plus comme des êtres morts. Malgré cela, ils remplissent deux

NDIZE PIUGIE Auly Laure 9

fonctions typiques des êtres vivants : ils sont en relation les uns avec les autres et ils se
reproduisent, Les virus contiennent une molécule génétique qui est presque toujours
entourée d’une enveloppe faite de protéines et de sucres. Lorsqu’ils atteignent une cellule
de leur hôte, ils entrent dans le noyau et le séquestrent, c’est-à-dire qu’ils le mettent au service
de leur propre intérêt. Puis ils commencent à se multiplier)

I.4.1 Phase d’adsorption et de pénétration

La première phase du cycle de reproduction des virus est l’adsorption ou fixation. Cela
correspond au moment où le virus entre en contact avec l’organisme qu’il va infecter. Cela
se produit généralement de manière aléatoire, par exemple lorsque quelqu’un éternue et qu’il
y a une personne à proximité.
Ensuite, le virus reconnaît les récepteurs de la cellule où il va être hébergé, et lorsqu’il le fait,
il s’attache à la membrane de cette cellule. Puis, commence la deuxième phase du cycle de
reproduction du virus, qui est la pénétration. Elle consiste pour le virus à injecter son
matériel génétique dans la cellule où il est arrivé. Le processus est similaire à ce qui se
passe avec une seringue, mais dans ce cas, ce que le virus injecte, c’est de l’information
génétique. Pour ce faire, il doit briser la membrane cellulaire, ce qu’il fait en libérant une
enzyme.

I.4.2 Phase de multiplication et d’assemblage

Une fois que le micro-organisme a pénétré dans la cellule de son hôte et l’a séquestré,
la phase suivante du cycle de reproduction commence : la multiplication. Elle consiste en la
réplication de son matériel génétique. Le virus cherche à créer les composants nécessaires à
la formation de nouvelles particules virales. Comme il existe différents types de virus, ce
processus se déroule également de différentes manières.
Lorsque le processus de multiplication est terminé, l’assemblage commence. Cela consiste à
prendre les différentes parties et à les assembler en une structure qui forme de nouveaux
virions, ou corps de virus.

NDIZE PIUGIE Auly Laure 10

I.4.3 Phases de libération

La dernière phase est la libération des nouveaux corps viraux, ou virions, à l’extérieur
de la cellule. Ceux-ci font un voyage jusqu’à ce qu’ils trouvent une nouvelle cellule pour les
accueillir, pour répéter tout le cycle de reproduction.

Certains types de virus effectuent ce processus de libération de manière forcée. C’est-

à-dire qu’ils parviennent à sortir en brisant la membrane de la cellule d’où ils étaient
originaires. Si les virus ont une enveloppe lipidique, ils passent alors par un processus appelé
“bourgeonnement”. Dans ce cas, ils prennent une partie de la membrane de la cellule hôte et
se couvrent avec elle.
Comme vous pouvez le voir, dans cette dernière phase, les virus brisent la membrane
cellulaire et cela entraîne la mort de la cellule. Ce processus se répète sans cesse : ils
progressent dans le corps en tuant les cellules, les unes après les autres.
L’organisme active le système immunitaire pour les combattre et les empêcher de faire
d’autres dégâts. S’il n’y parvient pas, il faut recourir à des médicaments pour gagner la
bataille. Et s’ils échouent aussi, de graves maladies et même la mort s’ensuivent.

Figure 3 : Réplication d’un rotavirus

I.5 Pathogénicité

NDIZE PIUGIE Auly Laure 11

 La dose pathogène est estimée à environ 10 à 100 particules virales. Une personne avec
une diarrhée à Rotavirus excrète un grand nombre de virus (108 - 1010 particules/ml de selles12)
pendant environ une dizaine de jours, les doses infectieuses peuvent rapidement être acquises
par les mains contaminées, les objets, les aliments, l'eau). L'excrétion asymptomatique (sans
signe clinique) est possible et peut jouer un rôle dans la persistance de cette maladie. Très
résistants au pH acide de l'estomac et aux enzymes digestives (lipases et protéases), ils
infectent les cellules épithéliales matures de la muqueuse des villosités de l'intestin grêle
(entérocytes). Ils les détruisent partiellement, entraînant un raccourcissement des villosités,
laissant la place à des entérocytes immatures avec une diminution de l'activité enzymatique.
Une protéine non structurelle (NSP4) semblerait jouer un rôle dans la pathogénie du virus et
pourrait agir comme une véritable entérotoxine virale. Les virus sont ainsi « absorbés » par les
cellules épithéliales digestives par endocytose dans une vésicule appelée endosome. Il semble
que les protéines de la couche extérieure (VP7 et VP4) puissent rompre la membrane de
l'endosome, créant ainsi un gradient de concentration en calcium. Cela facilite la
fragmentation de la protéine VP7, ne laissant autour de l'ARN viral que la couche composée
des protéines VP2 et VP6.L'ARN polymérase va permettre la transcription de l'ARNm viral.
Cette action est réalisée de façon plus aisée dans l'enveloppe protéinique du virus car
l'environnement aqueux des cellules hôtes ralentit de façon significative le détachement des
deux brins d'ARN, phase initiale de la synthèse de l'ARNm).Le fait que l'ARN viral reste
entouré, à ce stade, d'une capside est également utile pour déjouer les réponses immunitaires
de l'hôte, réponses déclenchées par la présence d'un double-brin d'ARN. Au cours de
l'infection, le rotavirus va donc produire un ARN messager à la fois pour leur traduction en
protéines, mais également pour la réplication de son génome. La plupart des protéines du
rotavirus vont s'accumuler dans des structures appelées viroplasmes (structures
cytoplasmiques formées au cours de l’infection où l'ARN est répliqué. L’infection est
immunogène, protégeant d'une nouvelle infestation. Des encéphalites peuvent compliquer ces
gastro-entérites. Leur mécanisme est encore discuté.

I.6 Clinique

NDIZE PIUGIE Auly Laure 12

 Les rotavirus entraînent une gastro-entérite. Après une période d'incubation allant de
quelques heures à quelques jours (en général 24 à 72 heures), des selles fréquentes et liquides
apparaissent soudainement. Le virus pouvant atteindre le foie, ces selles peuvent être claires et
accompagnées d'urines foncées. La fièvre, généralement peu élevée, s'accompagne parfois de
vomissements, surtout chez les nourrissons. La guérison complète survient après 4 à 7 jours.
Cependant, une diarrhée sévère sans réhydratation adaptée (en eau et électrolytes par un soluté
de réhydratation orale) peut entraîner le décès. L'association à d'autres pathogènes du système
digestif peut jouer un rôle dans la sévérité de la maladie. Les jeunes enfants, les prématurés,
les personnes âgées et les sujets immunodéprimés sont particulièrement enclins à développer
des symptômes plus sévères.La mise en culture du virus (surtout d'origine humaine) est
difficile car la multiplication du virus nécessite la présence de trypsine qui est incompatible
avec l'utilisation de sérum pour la croissance des cellules.

La recherche d'antigènes viraux se fait le plus souvent par la technique ELISA (de l'anglais «
Enzyme-Linked Immuno- Sorbent Assay »). La technique de référence consiste à rechercher
les particules virales en microscopie électronique mais n'est pas utilisée en pratique routinière
de laboratoire. Le diagnostic sérologique par recherche d'anticorps n'est pas utilisé.

Non utilisée en routine, elle consiste en une amplification des acides nucléiques par RT-PCR.

Facteurs favorisants ou aggravants [modifier | modifier le code]

Ils sont représentés par :

• Une mauvaise hygiène, notamment des mains ;

• La vie en collectivité, qui se combine au premier facteur ;

• L’existence d'une immunodépression.

Traitement :

Il n'existe pas d'agent antiviral spécifique. Le traitement symptomatique vise à éviter la

déshydratation par une réhydratation précoce, le plus souvent orale à l'aide de solutions
glycoélectrolytiques.

Prévention :

• Lavage systématique des mains (après être allé à la selle, après nettoyage des fesses
d'un nourrisson, avant de préparer les aliments, avant de manger) et des surfaces
souillées

NDIZE PIUGIE Auly Laure 13

 • Utilisation de solutions hydroalcooliques.

• Utilisation d'eau bouillie pour reconstituer le lait en poudre

• Eviter également de partager les verres d’eau ou les couverts à table

I.7 GENERALITES SUR LES GASTROENTERITES

I.7.1 Définition
Une gastro-entérite ou gastroentérite est une inflammation du système digestif
pouvant entraîner de la nausée, des vomissements, des crampes abdominales, des flatulences
et de la diarrhée, ainsi que de la déshydratation, de la fièvre et des céphalées (maux de tête).
La gastro-entérite peut être d'origine bactérienne, c'est-à-dire due à la consommation d'eau ou
de nourriture contaminée par des bactéries, telles que les colibacilles présents dans les selles.
Des symptômes de gastro-entérites peuvent aussi être dus à des parasites internes,
protozoaires ou amibes pathogènes, tel qu’Entamoeba histolytica provoquant la dysenterie
amibienne ou amibiase généralement due à des installations sanitaires absentes ou
inadéquates.

Cependant, dans plus des deux tiers des cas, elle est causée par des virus comme les rotavirus
(provoquant en particulier la gastro-entérite infantile), les norovirus (dont le virus de
Norwalk), les adénovirus, des calicivirus et des astrovirus. La gastro-entérite est
communément appelée « grippe intestinale » (terme inadéquat mais très répandu), lorsqu’elle
est causée par un virus, et « empoisonnement alimentaire » ou plus justement « intoxication
alimentaire » lorsque causée par une bactérie.

La gastro-entérite peut également révéler une dysenterie des voyageurs, aussi connue sous le
terme de diarrhée du voyageur ou tourista. Celle-ci peut être due à une infection, le plus
souvent par
des bactéries (notamment Salmonella, Aeromonas, Escherichia coli, Campylobacter, Shigella,
Vibrio cholerae (causant le choléra) et Vibrio (non cholérique)). Parfois, l'infection peut
provenir de virus, norovirus (principalement virus de
Norwalk), adénovirus, astrovirus, entérovirus, rotavirus. Plus rarement, la tourista sera causée
par des amibes ou protozoaires parasitaires (Cyclospora, Entamoeba histolytica,
Cryptospridium, Giardia ou autre parasite intestinal).

NDIZE PIUGIE Auly Laure 14

La diarrhée s'accompagne souvent de vomissements et de poussées de fièvre, mais les
symptômes varient en fonction des individus. En effet, certains se contentent de vomir,
d'autres n'ont aucun symptôme, et certains n'ont que la diarrhée. Si elle est trop importante,
elle peut mener à une déshydratation de l'organisme.

Si la diarrhée perdure, elle peut laisser des séquelles sur la paroi intestinale, menant à une
pathologie appelée syndrome de malabsorption.

Figure 4 : Localisation d’une gastroentérite

I.7.2 Epidémiologie
Le rotavirus est la cause la plus courante de diarrhée et de déshydratation chez l'enfant,
en particulier dans les pays développés. Dans le monde, on estime que 125 millions de
diarrhées sont provoquées annuellement par ce virus (soit plus de 1 900 cas pour 100 000
habitants). On estime que chaque année, 800 000 personnes meurent de gastro entérite dans le
monde, dont 500 000 enfants de moins de cinq ans, ce qui représente 25 % des morts par
diarrhées et 6 % des morts de moins de cinq ans.

Aux États-Unis, on estime que le rotavirus touche 80 % des enfants de moins d'un an ; chaque
année, 500 000 enfants doivent faire l'objet de soins médicaux, et 50 000 doivent être
hospitalisés.

NDIZE PIUGIE Auly Laure 15

En France, lors du pic de l'épidémie hivernale 2005–2006, on estime que 1 850 000 personnes
ont consulté leur médecin généraliste en 8 semaines pour une gastro-entérite ; l'incidence a été
de 367 cas pour 100 000 habitants (le seuil épidémique étant fixé à 279 cas pour 100 000
habitants). La surveillance de l'évolution de l'incidence en France est effectuée par le réseau
Sentinelles de l'Inserm qui publie ces données, comme une société de communication
spécialisée qui met aussi ces données à la disposition du public.

Il s'agit donc d'un important problème de santé publique. D'autant que chaque année,
l'épidémie de gastro-entérite à rotavirus concorde souvent avec les épidémies de bronchiolite
et de grippe, pouvant mettre en difficulté les systèmes de soins pédiatriques.

On peut remarquer que les gastro-entérites virales sont en recrudescence pendant l‟hiver,
surtout en Amérique du Nord et en Europe.

Figure 5 : Répartition dans le monde d'une gastroentérite

I.7.3 Diagnostic

Les symptômes habituels de la gastro-entérite sont des nausées, la perte d'appétit,

crampes abdominales et vomissements qui apparaissent brutalement, de la diarrhée, de la
fièvre et des céphalées (maux de tête). Plus rarement, des vertiges et une hypotension peuvent
accompagner les symptômes, sans doute liés à la déshydratation et à la fatigue. Les
symptômes communément associés à la gastro-entérite, c'est-à-dire principalement les
vomissements et la diarrhée, peuvent également être signes d'un empoisonnement (fruits de
mer, champignons toxiques) ou d'infections systémiques (pneumonie, septicémie, etc.). Par un

NDIZE PIUGIE Auly Laure 16

 interrogatoire précis et le contexte clinique, il sera possible d'éliminer ces hypothèses. La
gastro-entérite peut parfois déboucher sur des complications telles que la déshydratation,
pouvant même conduire à une hospitalisation. Les personnes à risque sont les jeunes enfants
et les nourrissons, les personnes âgées, et les personnes ayant un système immunitaire affaibli
par une maladie (VIH par exemple). Les signes de la déshydratation sont une sècheresse de la
peau, de la bouche, des yeux, les parties molles du crâne (chez les nourrissons) enfoncées, des
faiblesses, des crampes, une perte de poids, et des urines moins fréquentes et plus foncées que
d'habitude. Si l'on suspecte une gastro-entérite d'origine bactérienne, il est possible d'effectuer
une analyse des selles au laboratoire (coproculture) à la recherche de la bactérie en cause12.

I.7.4 Traitement
La plupart des gens se rétablissent d'eux-mêmes en un ou deux jours sans traitement
particulier autre que les mesures suivantes :

• Se reposer, au lit idéalement, le temps que la douleur cesse ;

• Ne pas manger durant quelques heures pour permettre au système digestif de
récupérer ;
• Boire autant que possible de petites gorgées d'eau pour un équivalent de 8 à 16
verres par jour minimum. Boire de l'eau augmentera la diarrhée, mais si le patient
reste sans boire, il se déshydrate progressivement. Vous pouvez prendre des
boissons énergétiques destinées aux sportifs (à ne pas confondre avec les boissons
énergisantes), si celles-ci sont isotoniques voire hypotoniques, qu'elles aient des
teneurs modérées en glucides et qu'elles contiennent des quantités suffisantes en
sels minéraux. Éviter l'alcool, qui a l'effet non souhaité d'augmenter les pertes
d'eau et de sels minéraux. Évitez tout produit laitier et les œufs ; idéalement, se
procurer une solution de réhydratation en pharmacie, ou absorber une solution
saline (éventuellement sucrée pour en faciliter l'absorption).
• Une fois les nausées disparues, reprendre progressivement une alimentation solide
en privilégiant certains aliments plus faciles à digérer. Cesser de manger en cas de
malaise.
La gastro-entérite d'origine bactérienne se traite par antibiotique, voire par bacteriophagique
dans les cas graves de dysenterie par germe multirésistant. Outre un éventuel traitement
médicamenteux, boire des préparations liquides riches en sels minéraux pour éviter la
déshydratation ; la réintroduction précoce des aliments, incluant les fibres alimentaires, aide à

NDIZE PIUGIE Auly Laure 17

contrôler plus rapidement les symptômes. Parfois cela ne suffit pas. Manger et boire en petites
quantités : éviter les breuvages excessivement sucrés qui (par phénomène d'osmose)
entretiennent les diarrhées, sans se limiter à la diète BRATT (banane, riz, compote de pomme,
thé, et pain grillé). D'ailleurs, les Centres pour la prévention et le contrôle des maladies
américains déconseillent formellement la diète BRATT. La plupart des gens se rétablissent
d'eux-mêmes en un ou deux jours sans traitement particulier autre que les mesures suivantes :

• Se reposer, au lit idéalement, le temps que la douleur cesse ;

• Ne pas manger durant quelques heures pour permettre au système digestif de
récupérer ;
• Boire autant que possible de petites gorgées d'eau pour un équivalent de 8 à 16
verres par jour minimum. Boire de l'eau augmentera la diarrhée, mais si le patient
reste sans boire, il se déshydrate progressivement. Vous pouvez prendre des
boissons énergétiques destinées aux sportifs (à ne pas confondre avec les boissons
énergisantes), si celles-ci sont isotoniques voire hypotoniques, qu'elles aient des
teneurs modérées en glucides et qu'elles contiennent des quantités suffisantes en
sels minéraux. Éviter l'alcool, qui a l'effet non souhaité d'augmenter les pertes
d'eau et de sels minéraux. Évitez tout produit laitier et les œufs ; idéalement, se
procurer une solution de réhydratation en pharmacie, ou absorber une solution
saline (éventuellement sucrée pour en faciliter l'absorption).
• Une fois les nausées disparues, reprendre progressivement une alimentation solide
en privilégiant certains aliments plus faciles à digérer. Cesser de manger en cas de
malaise.

La gastroentérite d’origine bactérienne se traite par antibiotique, voire la gastroentérite par

Bactério phagique dans les cas graves de dysenterie par germe multirésistant. Outre un
éventuel traitement médicamenteux, boire des préparations liquides riches en sels minéraux
pour éviter la déshydratation ; la réintroduction précoce des aliments, incluant les fibres
alimentaires, aide à contrôler plus rapidement les symptômes. Parfois cela ne suffit pas.
Manger et boire en petites quantités : éviter les breuvages excessivement sucrés qui (par
phénomène d'osmose) entretiennent les diarrhées, sans se limiter à la diète BRATT. D'ailleurs,
les Centres pour la prévention et le contrôle des maladies américains déconseillent
formellement la diète BRATT.

NDIZE PIUGIE Auly Laure 18

I.7.5 Traitement des nausées et vomissements

Sur ordonnance : dompéridone, métoclopramide, alizapride, métopimazine.

Sans ordonnance : diménhydrinate.

Sans ordonnance : charbon végétal non activé ou charbon activé (le charbon de bois est utilisé
pour ses capacités d'adsorption physique par les forces de Van Der Waals, il absorbe les gaz
de différentes provenances, ainsi que les toxines bactériennes, virales et celles du
métabolisme, ce qui lui confère un effet antidiarrhéique).

I.7.5.1 Traitement de la diarrhée

Racécadotril (inhibiteur de l'enképhaline intestinale), lopéramide, diosmectite. Parmi

les nutriments ayant un effet clair sur la diarrhée infantile, le zinc a été étudié initialement
dans les pays en voie de développement, ce qui a débouché sur la recommandation faite par
l'OMS de supplémenter en zinc tout enfant traité pour diarrhée. Le résultat de cette approche
est une baisse de l'utilisation des antibiotiques, une réduction des hospitalisations et une baisse
des épisodes d'infection respiratoire basse chez les sujets traités13. Une supplémentation en
zinc seule n'est pas souhaitable, du fait de son impact potentiel sur l'absorption de cuivre ou de
fer. L'association de micronutriments semble la meilleure approche.

I.7.5.2 Traitement et prévention de la déshydratation

Les liquides et électrolytes perdus de l’organisme doivent absolument être remplacés, si

on veut éviter la déshydratation sévère pouvant causer la mort14. Pour prévenir la
déshydratation, il faut prendre une solution de réhydratation orale. Cette solution sera
absorbée même en présence de vomissements. C'est le meilleur moyen de remplacer l’eau et
les sels perdus, mais cela ne lutte pas contre la diarrhée elle-même. Cela est indispensable
pour les nourrissons et les jeunes enfants qui ont eu plusieurs selles diarrhéiques. Les enfants
allaités doivent continuer à l’être tout en prenant la solution de réhydratation. Les solutions de
réhydratation peuvent se retrouver sous diverses formes. Dans les cas de déshydratation très
sévère, on l'administre en soluté, par voie intraveineuse, en hôpital. On en retrouve également
sous forme de liquides prêts à boire, ou sous forme de poudres en sachets appelés sels de
réhydratation orale, à mélanger à de l'eau saine, eau de source ou eau bouillie, vendues en
pharmacie sans ordonnance médicale.

NDIZE PIUGIE Auly Laure 19

Bien que pas conseillé par rapport à la solution de réhydratation, on peut temporairement
préparer soi-même une alternative à une solution de réhydratation.

• Mélanger un litre d’eau stérile, six cuillères à café de sucre et une cuillère à café de
sel.
• On peut remplacer le sucre par un jus de fruit non sucré, selon la recette suivante :
o 360 ml de jus d'orange non sucré, o 600 ml d'eau stérile
ou eau de source ou eau bouillie refroidie, o 1/2 cuillère à
café de sel.
• Se conserve 12 heures à la température ambiante ou 24 heures au réfrigérateur.

I.7.6 Prévention

La gastro-entérite se transmet en consommant des aliments ou de l'eau contaminés, ainsi que

par contact direct avec les malades. En période à risque (hivernale) ou lorsqu'un membre de la
famille est malade, les actions suivantes permettent de lutter contre la propagation de la
gastro-entérite. Ce sont des gestes simples comme les suivants, qui permettent d'éviter les
épidémies :

• L’hygiène et des surfaces : se laver les mains avant de préparer et de prendre les repas,
particulièrement en période d'épidémie (hivernale). Il faut aussi impérativement se
laver les mains après être allé aux toilettes ou avoir changé un nourrisson.
• Lors de la préparation des repas, appliquer des règles d’hygiène strictes (lavage des
mains, etc.). Les personnes malades ne doivent évidemment pas participer à la
préparation des repas. Éviter également de partager les verres d’eau ou les couverts à
table.

En 2006, deux vaccins antirotavirus ont été mis sur le marché en France. Leur efficacité a été
démontrée contre les souches les plus répandues en Europe et aux États-Unis. Si, en 2006, le
Haut Conseil de la santé publique avait décidé de différer la recommandation pour les
nourrissons de moins de 6 mois en raison du coût du vaccin (environ 150 euros) , il a revu sa
position fin 2013 « sous réserve d’une politique tarifaire conduisant à des ratios coût/efficacité
acceptables pour ces deux vaccins ». Au Canada, depuis 2007, il existe un vaccin pentavalent
oral à virus vivant contre la gastro-entérite à rotavirus. Il s'appelle Rotateq (de l'entreprise
Merck Frost). Il est conçu pour les jeunes enfants. Il est également disponible en France sur

NDIZE PIUGIE Auly Laure 20

 prescription du pédiatre. La première dose doit être donnée avant la 12e semaine de vie de
l'enfant, la 2e deux mois plus tard et la dernière avant que l'enfant ait eu 32 semaines. Ce
vaccin protège à 90 % durant environ 2 ans.

II. CHAPITRE 2 : MATERIEL ET METHODES

II.1 Type d’étude

L’étude sera de type transversal descriptive à visé analytique

II.2 Lieu d’étude

Nous allons mener notre étude dans 04 centres hospitaliers (District de la Cité Verte,
District de Biyemassi, District d’Efoulan et l’Hopital Mères et enfants de la Fondation
Chantal Biya) et l’analyse moléculairE sera faites au Centre d’Expertise de Diagnostic
Biologique du Cameroun du Dr FOUNOU (CEDBCAM). Les lieux d’études ont été prix
au hasard.

II.3 Période d’étude

L’étude se tiendra sur une période de six mois allant de Janvier à Juin 2023

II.4 Population d’étude

Notre étude sera menée chez les enfants de moins de cinq ans chez qui ont été diagnostiqué
une maladie diarrhéique et qui ne figurent pas dans les critères d’exclusions.

II.4.1 Critères d’inclusion

Seront inclus dans notre étude tous enfants de moins de cinq ans sans distinction de sexe
présentant les signes et symptômes (surtout la diarrhée) de la gastroentérite et dont les parents
ou tuteurs légaux auront consenti.

II.4.2 Critères d’exclusion Seront

exclus de notre étude :

NDIZE PIUGIE Auly Laure 21

Tout enfants dont les parents ou tuteurs légaux auront décidé de se retirer plus tard de l’étude.
II.5 Échantillonnage
La taille de notre échantillon sera calculée en utilisant la formule de Lorentz ci-dessous : N=

P (1- P) Z²

D²

P= Prévalence de la gastroentérite chez les enfants de moins de cinq ans au Cameroun qui de
34,6% (5)

Z= Intervalle de confiance à 95%. Elle est de 1,96

D= la précision de l’étude avec une marge d’erreur de 5% (0,05)

N= taille de l’échantillon

Après calcul, nous obtenons une taille d’échantillon minimale de 348 échantillons

II.6 Matériels

II.6.1 Matériels de collecte des échantillons

Nous allons collecter les échantillons de selle des enfants de moins de cinq ans. Pour ce fait
nous aurons besoin des pots à selles stériles et des équipements de protection individuels
appropriés (gants stériles, blouse blanche, masque facial etc.)

II.6.2 Matériels d’analyse moléculaire

 EPI appropriés (surblouses, calottes, masque faciale etc.) pour l’accès au laboratoire de
la biologie moléculaire
 Tampon TAE pour la préparation du gel d’agarose
 Kit extraction QUICK-ARN TM Viral Kit
 Embouts, tubes à eppendorf pour le pipetage
 Solution de bromure d’éthidium
 Eau dépourvue de nucléase pour la préparation du milieu réactionnel

NDIZE PIUGIE Auly Laure 22

  Amorces sens et antisens
 Le master mix contenant tous les éléments nécessaires pour la PCR

II.7 Méthodologie

II.7.1 Stratégie de recrutement des participants

Nous allons recruter les participants dans les hôpitaux de district de la Cité Verte, de
Biyem Assi, d’Efoulan de Yaoundé et de l’hopital mères et enfants de la Fondation Chantal
Biya. En effet, nous allons nous servir des questions pour la collecte des données
sociodémographiques (âge, sexe etc.) et des facteurs de risque mais tout ceci après avoir bien
expliquer aux parents ou tuteurs légaux des participants tout ce qu'il faut connaître par rapport
au projet de recherche dans le strict respect des règles d’éthique.

En principe, nous allons distribuer à chaque parent ou tuteur égale du participant la notice
d’information pour qu’ils puissent prendre connaissance de ce qu’il sera question, de l’objectif
de la recherche et s’ils consentent pour que leurs enfants participent, nous allons leurs
distribuer les questionnaires pour répondre aux différentes questions puis procéder à la
collecte des échantillons à l’aide des pots stériles.

II.7.2 Recherche des facteurs de risque

Nous allons rechercher principalement chez ces patients le types d’allaitement (maternel,
artificiel, mixte), la source d’eau consommée (minérale, robinet, puits) et la prise ultérieure du
vaccin contre les rotavirus.

II.7.3 Collecte des échantillons

Une fois le consentement des parents ou tuteurs légaux obtenu et les différentes questions
répondues, nous allons distribuer à chaque parent du participant un pot à selle stérile à usage
unique préalablement étiqueté avec le code d’identification unique attribué à chaque patient. Il
sera demandé au parent ou tuteur légale d’y mettre une assez suffisante de selle dans le pot à
selle.

II.7.4 Transport et conservation des échantillons

NDIZE PIUGIE Auly Laure 23

Directement après le prélèvement, les échantillons seront placés dans une glacière (4-8°C)
pour être acheminer au laboratoire où ils seront conservés à -20°C jusqu’à la fin de la journée
le temps de finir la collecte journalière et en suite les échantillons seront acheminer à l’hôpital
générale de Yaoundé dans la glacière (4-8°C) où ils seront cette fois ci être stockés à -80°C en
aliquotes de 1,5 ml jusqu’au jour de l’analyse où ils seront enfin transporter de Yaoundé à
Dschang (environs 8 heures de temps en voiture) pour l’analyse moléculaire dans la glacière
entre 4-8°C, et où ils seront stokes après l’étude pour une autre recherche

II.7.5 Extraction de l’ARN viral

Au sorti de l’échantillon de la glace, nous allons utiliser une suspension de 10% (v/v) pour
l’extraction de l’ARN en utilisant comme diluant l’eau distillée et l’eau dépourvue des
nucléases et en suivant scrupuleusement les recommandations du fabricant (Quick RNATM
Viral Kit. L’ARN pur extrait sera conservé à -20°C jusqu’à utilisation
(Ghapoutsa et al., 2021).

II.7.6 Détection des rota virus par la PCR conventionnelle

La détection du rota virus sera basée essentiellement sur la recherche et l’amplification du

gène VP6 comme décrit dans l’étude de Ghapoutsa et al en utilisant les amorces sens et
antisens décrit dans le tableau ci-dessous. En ce qui concerne le paramétrage du
thermocycleur et des différents pipetages à effectuer, nous allons suivre les recommandations
du fabricant
Nom Du Nom Séquences Tailles T Reference
gène Amorces amplicons °C

VP6 VP6-F 5′ AGCA GTCCAATTCATNCC - (Ghapoutsa

TGGTGG 3′ v=G ou C N=A
VP6-R 20C et al., 2021)
OU T

II.7.7 Révélation des amplicons par électrophorèse sur gel d’agarose

Les produits d’amplification seront révélés après électrophorèse sur gel d’agarose en utilisant
un marqueur une échelle de poids moléculaire de 100bp. Après coloration au bromure
d’éthidium, la visualisation se fera à l’aide d’une source des ultraviolets.

NDIZE PIUGIE Auly Laure 24

La lecture et la validation des différents résultats obtenus se fera avec l’aide du biologiste, et
le personnel technique.
II.7.8 Contrôle qualité
Nous aurons l’ARN contrôle du rotavirus pour assurer le contrôle qualité de notre
Amplification et de la révélation

II.8 Analyse des données

Les logiciels Microsoft Excel 2019 et Epi info seront utiliser pour l’analyse des données et les
saisis des textes se feront grâce au logiciel Microsoft Word 2019. Le logiciel Epicollect sera
utilisé pour la collecte et l’organisation des données socio démographiques, les facteurs etc.

II.9 CONSIDERATION ETHIQUE

II.9.1 Risques potentiels

L’investigateur principal peut s’infecter lors de l’analyse des échantillons. Le participant

quant à lui pourra se sentir culpabilisé pendant la réponse aux questions, il peut également se
sentir dérangé car sacrifier 3 à 4 minutes de son temps pour l’inter échange avec
l’investigateur et la collecte de l’échantillon.

II.9.2 Bénéfices

Les participants seront majoritairement bénéfiques de cette étude car :

• Ils n’auront rien à débourser financièrement pour cette étude qui leur permettra de
mieux prendre soin d’eux ;
• Cette étude sera aussi bénéfique pour la population de la ville de Dschang dans la
mesure où elle pourra permettre d’avoir des données épidémiologiques et aussi
permettre une meilleure prise en charge des patients souffrant d’une infection urinaire.
• L’investigateur bénéficiera des connaissances acquises lors de son étude.

II.9.3 Mesures prises pour la confidentialité des données et le respect de la vie privés des
participants

NDIZE PIUGIE Auly Laure 25

 Les données seront collectées et analysées de façon anonyme et confidentielle. Seuls les
investigateurs auront accès aux données individuelles, et cela dans le but d’interpréter et de
dégager les résultats finaux. Ces données pourront aussi être utilisées pour une étude
ultérieure.

NOTICE D’INFORMATION

1. Titre de l'étude : Détection des rotavirus impliqués dans les gastroentérites chez les
enfants de moins de cinq ans par PCR conventionnelle.
2. Nom de l’investigatrice : NDIZE PIUGIE AULY LAURE
3. Invitation à participer dans la recherche : Je suis étudiant en master II au département
des sciences biomédicales de la faculté de médecine et des sciences pharmaceutiques de
l’Université de Dschang. Dans le cadre de ma formation en Biologie clinique, et en vue
d’effectuer une recherche académique en rapport avec la rédaction du mémoire, vous êtes
invité à prendre part à une étude donc le thème est donné ci-dessus. Ceci sous la supervision
de Dr FOUNOU.
4. Objectif
Déterminer la prévalence moléculaire des gastroentérites dues aux rotavirus dans la ville de Yaoundé

5.Période d'étude : Février en Juin 2023

6.Population d’étude : Le prélèvement d'échantillons va inclure les patients des deux sexes
<5ans
7.Procédure : des échantillons seront collectés pour tous les participants, après qu’ils aient
accordé un consentement éclairé écrit afin de participer à l'étude. Une analyse biologique sera
effectuée sur ces échantillons. Un questionnaire sera donné à tous patients présentant les signes
ou symptômes d’une gastroentérite. Les résultats seront remis aux patients ayant participé à
l'étude. Ces résultats seront analysés pour en faire ressortir la prévalence.
8.Participation et droit de participer : les personnes concernées sont libres d'accepter ou de
refuser de participer à l'étude. Ils sont également libres de mettre un terme à leur participation à
tout moment.
9.Risque et inconfort : Tous les échantillons doivent être correctement manipulés et garder
stériles.
10.Confidentialité et mesure prise : la confidentialité du participant est assurée par un code
attribué à chaque participant.

NDIZE PIUGIE Auly Laure 26

 11.Avantages financiers : la décision de participer à ce projet est volontaire. Aucune somme
d'argent ne doit être jumelée par les personnes concernées.
12.Adresse utile : pour plus d'informations et en cas de malentendu,

Contactez :

Mlle NDIZE PIUGIE AULY LAURE : chercheur principal.

Tel : 694254601-682235203 ;

Mail : [email protected]
Comité national d’éthique de la recherche pour la santé humaine (CNERSH)
Tel: 690996781;
Mail: [email protected]
Directeur Dr FOUNOU Carrel
Co-directeur: Dr TCHOUANGUEU Thibau

NOTICE OF INFORMATIONS

1. Title of the study: Detection of rotaviruses involved in gastroenteritis in children under

five years of age by conventional PCR.
2. Name of the investigator: NDIZE PIUGIE AULY LAURE
3. Invitation to participate in research: I am a Master II student in the Department of
Biomedical Sciences of the Faculty of Medicine and Pharmaceutical Sciences of the
University of Dschang. As part of my training in Clinical Biology, and in order to
carry out academic research related to the writing of the thesis, you are invited to take
part in a study therefore the theme is given above. This under the supervision of Dr
Founou
4. Objective
To determine the molecular prevalence of gastroenteritis due to rotavirus in the city of
Yaoundé.

5. Study period : February into June 2023

6. Study population: Sample collection will include patients of both sexes <5 years’ old

NDIZE PIUGIE Auly Laure 27

 7. Procedure: Samples will be collected for all participants, after they have given
written informed consent to participate in the study. A biological analysis will be
carried out on these samples. A questionnaire will be given to all patients with signs or
symptoms of gastroenteritis. The results will be given to the patients who participated
in the study. These resut will Be analyzed to highlight théier prévalences.
8. Participation and right to participate: the persons concerned are free to accept or
refuse to participate in the study. They are also free to end their participation at any
time.
9. Risk and Discomfort: All specimens must be properly handled and kept sterile.
10. Confidentiality and action taken: the confidentiality of the participant is ensured by
a code assigned to each participant.
11. Financial Benefits: The decision to participate in this project is voluntary. No sum of
money should be matched by the persons concerned.
12. Useful address: for more information and in case of misunderstanding,

contact:

Miss NDIZE PIUGIE AULY LAURE: principal researcher.

Phone: 694254601-682235203

Email: [email protected]

National Ethics Committee for Human Health Research (CNERSH)

Phone: 690996781;

Email: [email protected]

Director: Dr FOUNOU Carrel

Co-director : Dr TCHOUANGUEU Thibau

NDIZE PIUGIE Auly Laure 28

 FORMULAIRE CONSENTEMENT ECLAIRE

Je soussigné, Mlle/Mme………………………………………………………...déclare
d’accepter librement et de façon éclairée participer à l’étude intitulée : Profil Epidémiologie
des rotavirus impliqués dans les gastroentérites chez les enfants de moins de cinq ans par
PCR conventionnelle dont l’investigateur principale est NDIZE PIUGIE AULY LAURE,
étudiant en master II de Biologie clinique à l’Université de Dschang, sous la direction de,
médecin biologiste, chargé de cour a la faculté de médecine et des sciences pharmaceutique de
l’université de Dschang Dr FOUNOU Carrel et Dr TCHOUANGUEU Thibau enseignant
chercheur a la faculté de médecine et des sciences pharmaceutiques de l’université de
Dschang.

J’ai lu attentivement la notice d’information (ou il m’a été lu et expliquée)

 J’ai bien compris les objectifs de l’étude

 La procédure de recherche était bien décrite et j’ai bien compris ce que l’on attendait
de moi
 Les risques et les bénéfices liés à l’étude m’ont été présentés
 J’ai eu suffisamment de temps pour poser des questions, qui ont obtenu des réponses
satisfaisantes
 J’ai aussi compris que ma participation à cette recherche est volontaire, je suis libre de
participer ou non à cette étude, et de retirer mon consentement à tout moment, sans
représailles
 Je ne m’oppose pas à ce que les résultats de cette étude soient conservés et
éventuellement publiés dans les revues scientifiques, dans la mesure où mon anonymat
est préservé.
Au vu de tout ce qui précède, j’accepte volontairement de participer à cette étude.

Nom, adresse et Fait-le…………………

Signature
Nom, adresse et signature
De l’investigateur Nom, adresse et signature de l’investigateur
Principal :

NDIZE PIUGIE Auly Laure 29

 INFORMED CONSENT FORM

I the undersigned, Miss Mrs................................................................................ declared

to accept freely and in an enlightened way to participate in the study entitled: Detection of
rotaviruses involved in gastroenteritis in children under five by rapid diagnostic test and RT-
PCR. whose principal investigator is NDIZE PIUGIE AULY LAURE, student in master II of
clinical biology at the University of Dschang, under the direction of Dr FOUNOU Carrel
lecturer at the Faculty of Medicine and Pharmaceutical Sciences of the University of Dschang
and Dr TCHOUANGUEU Thibau Lecturer at the Faculty of Medicine and Science
pharmaceuticals from the University of Dschang.
I have carefully read the information notice (or it was read and explained to me)

 I understood the objectives of the study

 The research procedure was well described and I understood what was expected of me
 The risks and benefits of the study have been presented to me
 I had enough time to ask questions, which were answered satisfactorily
 I also understand that my participation in this research is voluntary, I am free to
participate or not in this study, and to withdraw my consent at any time, without
reprisal
 I do not object to the results of this study being kept and possibly published in
scientific journals, insofar as my anonymity is preserved.
In view of all the above, I voluntarily agree to participate in this study.

Name, adressa and signature of the Do It………

investigator
Name, address and signature of the
Participant : Defrom the principal

NDIZE PIUGIE Auly Laure 30

 FICHE TECHNIQUE

QUESTIONNAIRE

Code …………. Date ……/ …… .2022. Tél ……………………………

Nom de l’hôpital :

Bonjour, je suis NDIZE PIUGIE AULY LAURE, étudiante en master II au

département de biologie clinique de l'Université de Dschang. Je fais mon projet de maîtrise
intitulé : << Profil épidémiologique des rotavirus impliqués dans les gastroentérites chez
les enfants de moins de cinq ans par PCR conventionnelle >>. J'aimerai obtenir de vous
des informations dans le but de déterminer la prévalence moléculaire des gastro entérites dues
au rotavirus s afin de contribuer à une meilleure prise en charge de ces infections. Veuillez s’il
vous plait répondre aux questions du questionnaire.

A- Caractères sociodémographiques
1-Sexe : F M
2-Age : <1 1-3 3-5
3-Lieu de résidence :
Urbain Rural
4 -Niveau scolaire de l’enfant :
Crèche prématernelle Maternelle Primaire Nourrisson
5-Niveau d’étude du parent :
Illettré primaire secondaire supérieur
6-Statut matrimonial :
Célibataire Marié Divorcé Veuve
7-Nombre d’enfant dans la maison :

<3 3-5 >5

8-Profession :
Ménagère Fonctionnaire Privé Etudiant Autre

B-Disponibilité du système d’élimination des déchets

9-Habitude d’hygiène quotidienne : Oui Non

NDIZE PIUGIE Auly Laure 31

10-Habitude de se laver les mains : Oui Non

11- Les ongles de vos doigts : Coupé Pas coupé

12- Usage des couches jetables : Oui Non

13-Alimentation diététique
Lait maternelle : Oui Non

Lait artificiel : Oui Non

Jus de fruit naturel : Oui Non

Jus de fruit artificiel : Oui Non

Les yaourts : Oui Non

La bouillie : Oui Non

Les œufs : Oui Non

14- Types d’eau consommée : L’eau de robinet l’eau de forage l’eau minérale l’eau de
puits

C-Renseignements cliniques

15-Symptomatologie

Nausée Vomissement Douleur abdominal Fièvre Diarrhée

Autre

16-Types de diarrhée

Sanguinolente liquidienne Muqueuse Pâteuse

17-Types de gastrenterite : Gastroenterite aigue Gastroenterite febrile Gastroenterite severe

18- Fréquence de la diarrhée

Une fois deux fois >3

19- Fièvre : température ≤ 38ºC ]38ºC-39ºC] ]3 39ºC-40ºC[ > 40

20 -Dernière fois qu’il a eu à prendre un antibiotique

NDIZE PIUGIE Auly Laure 32

< 1 Jours 1-3 Jours 3-7Jours

21-savez vous que le vaccin de la typhoîde existe ? Oui non

20-Vaccination contre la typhoïde Oui Non

22- Si oui lequel ? Parentéral(Typh-I) Parentéral combiné à l’hepatite A (HA-Typh) Oral(Typh-0)

23- Nombre de dose 1 2 3 >3

24 - Savez-vous que le vaccin du rotavirus existe ? Oui Non

25 - Etes-vous vacciner contre le rotavirus ? Oui Non

Si oui lequel ? Rotarix Rotatec Rotaril

26 - Nombre de dose 1 2 3 >3

Tableau 1 : Chronogramme des activités

ACTIVITES PERIODE SUPERVISE

NDIZE PIUGIE Auly Laure 33

 NOV DEC JAN FEV MAR AVR MAI JUN JUL UR

Préparation pour Investigateur et

proposition de encadreur
thème de
recherche,

Rédaction et
présentation de
recherche

Dépôt au Investigateur
clairance
éthique (CNE)

Collecte des Investigateur

données

Collecte et
analyses des
Investigateur
données

Investigateur et
encadreur
Interprétation
des résultats

Rédaction du Investigateur
mémoire

Dépôt du Investigateur
mémoire et
présentation

Rédaction et Investigateur et

NDIZE PIUGIE Auly Laure 34

 publication de encadreur
l’article

BUDGET PREVISIONNEL

Tableau 2 : Budget prévisionnel

DESIGNATION QUANTITE PRIX UNITAIRE (FcFA) TOTAL

 Kit d‟extraction de l’ARN 2 190000

(QIAamp RNA mini spin kit,
Hilden, Germany)
 Le master (Qiagen One step 2 210000
RTPCR) mix contenant tous les
éléments nécessaires pour la PCR

 Amorces sens et anti sens 02 26000

 Eau dépourvue de nucléase pour la 1L 10000

préparation du milieu réactionnel

 Tampon TAE pour la préparation 5L 30000

du gel d’agarose

 Embouts, tubes à eppendorf pour le 100 15000

pipetage

 EPI appropriés (surblouses, calottes, 1 10000

masque faciale etc.) pour l‟accès
au laboratoire de la biologie
moléculaire

 Solution de bromure déthidium 1L 15000

IMPREVUS et transport 50000

BUDGET ESTIMATIF TOTAL 556000FR
NDIZE PIUGIESource de Financement : Revenus Parental
Auly Laure 35
REFERENCES

Uncategorized References
1. Crawford SE, Ramani S, Tate JE, Parashar UD, Svensson L, Hagbom M, et al.
Rotavirus infection. Nat Rev Dis Primers. 2017;3:17083.
2. Fau C, Billaud G, Pinchinat S, Lina B, Kaplon J, Pothier P, et al. [Epidemiology and
burden of rotavirus diarrhea in day care centers in Lyon, France]. Arch Pediatr.
2008;15(7):1183-92.
3. Desselberger U. Rotaviruses. Virus Res. 2014;190:75-96.
4. Jayaram H, Estes MK, Prasad BV. Emerging themes in rotavirus cell entry, genome
organization, transcription and replication. Virus Res. 2004;101(1):67-81.
5. Ghapoutsa RN, Boda M, Gautam R, Ndze VN, Mugyia AE, Etoa FX, et al. Detection
of diarrhoea associated rotavirus and co-infection with diarrhoeagenic pathogens in the
Littoral region of Cameroon using ELISA, RT-PCR and Luminex xTAG GPP assays.
BMC Infect Dis. 2021;21(1):614.

ICTV. International Committee on Taxonomy of Viruses. Taxonomy history. Published on the

Internet https://talk.ictvonline.org/., consulté le 25 janvier 2021
« Vaccination contre le rotavirus (nourrisson) » [archive], sur vaccination-info.be (consulté le
24 mars 2017)
(en) Elizabeth A. Kennedy et Megan T. Baldridge, « Norovirus from the mouths of babes »,
Nature, 29 juin 2022, d41586–022–01731-x (ISSN 0028-0836 et 1476-
4687, DOI 10.1038/d41586-022-01731-x, lire en ligne [archive], consulté le 7 juillet 2022)
U.D. Parashar, C.J. Gibson, J.S. Bresee et R.I. Glass, « Rotavirus and severe childhood
diarrhea », Emerg Infect Dis, vol. 12, 2006, p. 304-306 (DOI 10.3201/eid1202.050006)
U.D. Parashar, E.G. Hummelman, J.S. Bresee, M.A. Miller et R.I. Glass, « Global illness and
deaths caused by rotavirus disease in children », Emerg Infect Dis, vol. 9, mai 2003, p. 565-
572 (DOI 10.3201/eid0905.020562)
OMS, Surveillance des rotavirus dans le monde [archive] ; - 29 avril 2011, vol. 86, 18 (p.
173-176)

NDIZE PIUGIE Auly Laure 36

F. Fourquet, J.C. Desenclos, C. Maurage et S. Baron, « Le poids médico-économique des
gastro-entérites aiguës de l‟enfant : l‟éclairage du programme de médicalisation des systèmes
d‟information (PMSI) », Arch Pediatr, vol. 10, 2003, p. 861
 (en) Référence ICTV : Rotavirus [archive] (consulté le 25 janvier 2021)

CURRICULUM VITAE

Nom : NDIZE PIUGIE

Prénom : auly laure
Date et lieu de naissance : 01/ Novembre/ 1996 à Dschang
Nationalité : Camerounaise
Situation familiale : Célibataire
Tel : 694254601/ 682235203
Email : [email protected]
ANNEES DIPLOMES ETABLISSEMENTS MOYENNES
OBTENUS
2020/2021 Master 1 en Biologie Université de Dschang 12,68
Clinique
2019/2020 Licence 3 en biochimie Université de Dschang 10 ,70
2018/2019 Licence 3 en Biochimie Université de Dschang
2017/ 2018 Licence 2 en Biochimie Université de Dschang 11,05
2016/ 2017 Licence 1 en Biochimie Université de Dschang 10 ,79
2015/ Baccalauréat série D Lycée bilingue de nkambe passable
2016
2014/2015 Probatoire série D Lycée bilingue de nkambe passable
2012-2013 BEPC série anglais Lycée bilingue de nkambe
renforcé
2009-2010 CEP Ecole publique de nkambe

EXPERIENCES PROFESSIONNELLES

 Stage académique effectué à l‟Hôpital de District de Bafang d‟une durée de deux

mois (15 Février au16 Avril 2021)
 Stage académique effectué à l‟Hôpital de Joungolo de Yaoundé d‟une durée d‟un mo)

LANGUES

NDIZE PIUGIE Auly Laure 37

 Français : Lu, écrit et parlé
Anglais : Moyen

LOISIRS

Voyage ; Lecture ; Musique ; Conduite ;

L‟intéressé
CURRICULUM VITAE
Dr RASPAIL CARREL FOUNOU ZANGUE
BSc.; MSc., Ph.D. in Medical Microbiology
Fellow of Young Investigators Awards 2021
Research Coordinator and Senior Lecturer
Faculty of Medicine and Pharmaceutical Sciences
Department of Microbiology-Haematology and Immunology at the University of
Dschang,
Dschang Cameroon
[email protected] or [email protected] https://www.researchgate.net/profile/Raspail-
Carrel-Founou-Zangue
Yaoundé Cameroon, Phone: + 237 675 94 35 67/+ 237 676 54 24 45

III. SUMMARY
Dr Raspail Carrel Founou is a researcher, with strong knowledge of Microbiology and a
lectureships position in Microbiology. He has more than 5 years cumulative experience in
infectious diseases, antimicrobial resistance and the One Health Approach especially emerging
zoonosis and foodborne pathogens. Dr Founou carrying out numerous research projects with
the foremost being focused on Molecular epidemiology of antibiotic resistant ESKAPE
pathogens in hospitalized patients according to WHO global priority list of pathogens.
Furthermore, Dr Founou is a Director of CEDBCAM coupled with the research Institute of
CEDBCAM (CEDBCAM-RI), a Cameroonian researcher institution carrying out numerous
research projects with the foremost being focused on epidemiology of antibiotic resistant of
ESKAPE pathogens in hospitalized patients, foodborne pathogens from farm-tofork and
dynamic cross-transmission of SARS-CoV2 from food animals to humans in Central Africa
including Cameroon, Tchad and Gabon. The results of these projects produced 23 papers
published in the high impact factors. I am innovative, dynamic, motivated, ambitious, diligent
and responsible researcher who can easily emerge as a leader or integrate a team to produce
relevant results. I am a high performer proficient in molecular microbiology, bioinformatics

NDIZE PIUGIE Auly Laure 38

 and statistical analysis packages, combined with intermediate knowledge of programming
with Python as well as junior knowledge on microfluidic technology.

III.1 EDUCATION
PhD, Medical Microbiology (April 2018),
University of KwaZulu-Natal, Durban, South Africa Thesis:
“Molecular Epidemiology of Antibiotic Resistant ESKAPE Pathogens Isolated from Public Sector
Hospitals In uMgungundlovu District, Kwazulu-Natal, South Africa.”

MSc, cum laude Clinical Biology (August 2014),

Higher Institute of Medical Technology/FMSP Douala, Cameroon
Dissertation: Prevalence and antibiotic resistance patterns of Escherichia coli isolated in the
urinary tract infection at the Laquintinie Hospital, Cameroon.
BSc, cum laude, Biomedical Sciences (October
2011), Higher Institute of Medical Technology/FMSP
Douala, Cameroon

III.2 PROFESSIONAL EXPERIENCE

 2022: Senior Lecturer in Microbiology, Faculty of Medicine and Pharmaceutical
Sciences, Department of Microbiology-Haematology and Immunology.
 2020-to date: Research Coordinator within the Department of Microbiology,
Haematology and Immunology, Faculty of Medicine and Pharmaceutical Sciences.
Dschang, Cameroon.
 2020-to 2021: Coordinator of Microbiology Unit, Faculty of Medicine and
Pharmaceutical Sciences, Department of Microbiology-Haematology and Immunology.
 2020-2021: Assistant Lecturer in Microbiology (21 Masters, 2019-2021)
 University of Dschang, Faculty of Medicine and Pharmaceutical Sciences
(Cosupervisor, 7 Masters)
 Higher Institute of Medical Technology of Yaoundé (co-supervisor, 13 Masters). ▪
Catholic University of Central Africa (Supervisor, 01 Master).
 2019-2021: Jury member’s and co-Supervisor
- Higher Institute of Medical Technology of Yaoundé (Supervisor of 05 master
students).
- Catholic University of Central Africa (Supervisor, 01 master student).
- University of Dschang (07 Master students)
 2017-to date: General Director at the Research Institute of Centre of Expertise and
Biological Diagnostic of Cameroon (CEDBCAM-RI)
 2015-to date: General Director at Centre of Expertise and Biological Diagnostic of
Cameroon
(CEDBCAM)
 January 2015-2016: Lecturer at KTN Training Institute

NDIZE PIUGIE Auly Laure 39

  Responsibilities and achievements
- Co-Supervisor of Three Bachelors
- Manage the design of their study
 2014-2016: Laboratory coordinator at the Military Hospital of Yaoundé, Cameroon
 2011-2013: Intern at the Global Viral-Johns Hopkins School of Hygiene and Public
Health,
Yaoundé, Cameroon
III.3 PEER-REVIEWED AND PUBLICATIONS
As of 11/03/2022 (Google Scholar)
H-Index : 12 (Google Scholar 06/12/22) III.4 List of last 15 Publications

1. Zemtsa RJ, Noubom M, Founou LL, Dimani BD, Koudoum PL, Mbossi AD, Kouanfack
C, Founou RC. Multidrug-Resistant and Extended-Spectrum β-Lactamase (ESBL) -
Producing Enterobacterales Isolated from Carriage Samples among HIV Infected Women
in Yaoundé, Cameroon. Pathogens 2022, 11, 504.
https://doi.org/10.3390/pathogens11050504.
2. Founou RC‡, Ariel J Blocker, Michel Noubom, Cedrice Tsayem, Siméon P Choukem,
Maarten Van Dongen & Luria L Founou‡. 2021. The COVID-19 Pandemic: Threat on
Antimicrobial Resistance Containment. Future Sci OA 0(0)FSO736.
doi.org/10.2144/fsoa-2021-0012.
3. Founou LL, Founou RC, Essack SY. 2021. Antimicrobial Resistance in the Food Chain:
More than a Food Safety Issue. Future Sci. OA 7(5): FSO692. doi: 10.2144/fsoa-
20200189.
4. Foloum AK, Founou LL, Karang S, Maled Y, Tsayem C, Kuete M, Noubom M, Founou
RC. 2021. Methicillin Resistant Staphylococci (MRS) isolated in Clinical Samples: A
Three-Years Retrospective Study Analysis. Future Sci. OA.doi:
10.7196/SAMJ.2020.v110i10.15182.
5. Founou RC, Founou LL, Allam M, Ismail A, Essack SY. 2020. Methicillin Resistant
Staphylococcus haemolyticus ST25 Isolated from Carriage Samples in uMgungundlovu
District, South Africa. S Afr Med J, 110(10):959-960. doi:
10.7196/SAMJ.2020.v110i10.15182.
6. Founou RC, Founou LL, Allam M, Ismail A, Essack SY. 2020. First Report of a Clinical
Multi-Drug Resistant Pseudomonas aeruginosa ST532 Isolate Harbouring
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(22) :145-146. doi: 10.1016/j.jgar.2020.05.012.
7. Founou LL, Founou RC, Allam M, Ismail A, Essack SY. 2019. Extended-spectrum
betalactamase-producing Klebsiella pneumoniae isolated from an abattoir worker in
Cameroon, S Afr Med J, 109(11):820-821. doi:10.7196/SAMJ.2019.v109i11.14378.
8. Founou RC, Founou LL, Allam M, Ismail A, Essack SY. 2019. Whole Genome
Sequencing of Extended
Spectrum β-lactamase (ESBL)-producing Klebsiella pneumoniae Isolated from
Hospitalized Patients in KwaZulu-Natal, South Africa. Sci Rep, 9(1): 6266. doi
10.1038/s41598-019-42672-2.
9. Founou LL, Founou RC, Ntshobeni N, Govinden U, Bester LA, Chenia HY, Djoko CF,
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NDIZE PIUGIE Auly Laure 40

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10. Founou RC, Founou LL, Essack SY. 2018. Extended spectrum beta-lactamase mediated
resistance in carriage and clinical gram-negative ESKAPE bacteria: a comparative study
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11. Founou RC, Founou LL, Allam M, Ismail A, Essack SY. 2018. Genomic characterisation
of Klebsiella michiganensis co-producing OXA-181 and NDM-1 carbapenemases isolated
from a cancer patient in uMgungundlovu District, KwaZulu-Natal Province, South Africa.
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12. Founou LL, Founou RC Allam M, Ismail A, Essack SY. 2018. Genome Sequencing of
Extended-Spectrum βLactamase (ESBL)-Producing Klebsiella pneumoniae Isolated from
Pigs and Abattoir Workers in Cameroon. Front Microbiol, 9(188). doi
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13. Founou LL, Founou RC, Essack SY, Djoko CF. 2018. Mannitol-fermenting
methicillinresistant staphylococci (MRS) in pig abattoirs in Cameroon and South Africa:
A serious food safety threat. Int J Food Microbiol, 285: 50-60. doi
10.1016/j.ijfoodmicro.2018.07.006.
14. Founou LL, Founou RC, Allam M, Ismail A, Essack SY. 2018. Draft genome sequences
of extended spectrum β-lactamase-producing Enterobacter aerogenes isolated from swine
and human. J Global Antimicrob Resist, 14:70-71, doi:
https://doi.org/10.1016/j.jgar.2018.06.006.
15. Founou RC, Founou LL, Allam M, Ismail A, Essack SY. 2018. Genomic characterisation
of Staphylococcus aureus ST121 isolated from hospitalised patients in South Africa. S Afr
Med J, 108(12), 1007-1008. doi:10.7196/SAMJ.2018.v108i12.13713.
16. Founou RC, Founou LL, Essack SY. 2017. Clinical and economic impact of antibiotic
resistance in developing countries: A systematic review and meta-analysis. Plos One,
12(12). doi 10.1371/journal.pone.0189621.
LAST WORKSHOPS/SEMINARS/SYMPOSIUM

 Attend a Conference as Member of scientific committee and organizer: International

Day of Microbiology organized by the Cameroon Society Of Microbiology (November
26-28th, 2021).
 Attend Seminar 1 as a speaker and moderator: Risk communication and community
engagement in university of Dschang funded by USAID and OHCEA/AFROHUN
Cameroon.
Activity CRN_COVID-19.8, project OHW-NG (MAY 2020).
 Attended a Seminar 1: << Initiation to University pedagogy >> under the High
Patronage of Mr. Le Rector of the University of Dschang. Taken from 12-13 October 2020
at the University of Dschang. (October 2020).
 Attended a Seminar 2: Evaluation of Teachings at the Faculty of Medicine and
Pharmaceutical Sciences, carried out on July 1, 2020 at the University of Dschang (July
2020).
 Attended a workshop on „„Development of A One Health Approach" curricula in
University Institutions of Cameroon "Under the High Patronage of His Excellency the
Minister of Higher

NDIZE PIUGIE Auly Laure 41

Education. Taken July 22, 2020 at the National Polytechnic School of Yaoundé‟‟ (July
2020).
 Attended a workshop on Theme << COVID-19 Risk Communication and Community
Engagement Training of Trainer (RCCE-ToT) Program >>. Under the coordination of
AFROHUN Cameroon (One Health Workforce – Next Generation Project) et USAID).
Online.
 Attended a workshop on Next Generation Sequencing and Bioinformatics analysis led by
the National Institute of Communicable Diseases, South Africa (August 2017)
 Attended an “Antimicrobial Resistance Symposium” led by the University of
KwaZuluNatal and the University of Tromso (April 2017).
 Attended a workshop on RT-PCR (QuantStudio 3 & 5) led by ThermoFisher Scientific
(February 2017).
 Attended a workshop on “Next Generation Sequencing (Ion Torrent), and Real-time PCR
(QuantStudio 3 & 5)” led by ThermoFisher Scientific (October 2016).
 Attended a seminar concerning the quality control of CTA/UPEC in Cameroon and
biological advices of HIV people‟s (PVVIH) coordinator: Centre Pasteur of Yaounde
Cameroon (CPC) (February 2014).
III.5 EDITORIAL MEMBER/REVIEWER
 Serve as Guest Editor and member of the scientific journal „‘Pathogens’’
 Serve as Editorial Board member of the Scientific Journal „„Frontiers in Tropical
Diseases, Section Antimicrobial Resistance, (2020 to date).
 Serve as Editorial Board member of the Scientific Journal “Biolab-Actu” ASCATEB,
(2013to date).
 DISTINCTION AND GRANTS AWARDERS College of Health Sciences Bursary for
full-time postgraduate research students, UKZN, 2015, 2016, 2017.
 Academic Excellence Prize for best students granted by the President of Republic of
Cameroon, 2011, 2012, 2013, 2014.
III.6 MEMBER OF SOCIETY
 Cameroonian Society of Microbiology (CSM), 2020 to date.
 European Society of Clinical Microbiology (ESCMID), 2019 to date.
 British Society of Antimicrobial Chemotherapy (BSAC), 2020 to date. III.7
 Young Investigator Awards of Institute of biomeriux France 20212022
 American Society of Microbiology (ASM), 2020 to date.  AMR Insights, 2019 to date.
 Member, International Students Association, UKZN, South Africa, 2016- to date ➢
Cameroon Society of Biosciences (CSB), 2021 to date.
 Member of the Cameroonian Association of Technician Biologist (ASCATEB),
Cameroon, 2013- to date

Name and Surname: Dr. TCHOUANGUEU Thibau Flaurant (PhD)

Date and place of birth: 11/01/1987 at Njisse-Foumban, Cameroon

NDIZE PIUGIE Auly Laure 42

Lecturer at the Department of Microbiology hematology Immunology, Faculty of
Medicine and Pharmaceutical Science, University of Dschang. P.O. Box: 96 Dschang.
Cameroon Telephone: +237 671-863-677/+237-690-225-577
Email: [email protected] or [email protected]

EDUCATION
June 2020:
Obtained a PhD in Clinical Biochemistry/Immunology at the Department of Biochemistry of the
University of Dschang, with research been undertaking at the Chantal BIYA International
Reference Centre for research on HIV/AIDS prevention and management (CIRCB) in the
Vaccinology and Biobanking Department, Yaoundé – Cameroon.

October 2010 - May 2012:

Master II in Biochemistry, Specialty, Pharmacology and Clinical Biochemistry, Department of
Biochemistry, Faculty of Science, University of Dschang, Cameroon.
October 2006 – September 2009:
Bachelor in Biochemistry, Faculty of Science, University of Dschang, Cameroon.

SKILLS

✓ Peripheral blood mononuclear cells (PBMC) extraction from whole blood.

✓ Cytometry Bead Array system for quantifying cells‟ component production.

✓ Immunophenotyping of immune cells using flow cytometry, ✓ Enzyme linked immunosorbent

assay (ELISA) techniques technique.

✓ Polymerase Chain Reaction (PCR) techniques.

✓ Plasmid digestion and insert ligation

✓ Bacteria transformation for plasmids production.

✓ In vtro protein expression and gene cloning.

✓ Protein purification through using Flag-tag associated western blot system and other systems.

NDIZE PIUGIE Auly Laure 43

✓ Plants components extraction and fragmentation,

✓ Multiple antioxidant studies on natural and synthetic components.

✓ Pharmacological study design in-vitro and in-vivo on rats, mice and guinea pigs.

✓ Bacterial and fungal cell culture for assessment of plants extracts and fractions, plants derived
components and synthetic products in solid media and microtitration plates. ✓ Can supervise
project done on the field and organize laboratory work undertaken by many teams.

TEACHING SKILLS IN FRENCH- AND ENGLISH-SPEAKING MEDICAL TRAININGS

✓ COURSES:
• Molecular Biology
• Virology
• Research Methodology
• Immunology
• Microbiology
• Biochemistry ✓ INSTITUTIONS:

• The University Institute of Estuary INSAM Bafoussam

• CESTAM (Centre des Enseignement Spécialisées des Techniques
d‟Analyses
Médicales)

• Fondation FOSACO

RELEVANT EXPERIENCE ON RESEARCH PROJECTS

September – October: Laboratory associate for the Nationwide study of Seroprevalence of

Covid-19 in Cameroon by Epicentre/ Medecins Sans Frontières.

Tasks: - Field investigation in households as laboratory technician for sample collection from
participants who consent to the study as dried blood spots (DBS).

- DBS samples extraction from filtered paper and sera preparation for further

- Undertook assessment of Covid-19 specific antibody levels in samples all samples.

May – August 2021: Data collector at IQVIA/ASLM for the Mapping of Antimicrobial resistance
(AMR) and antimicrobial use (AMU) in the West, East and Southern Africa (MAAP) in
Cameroon by the Fleming Fund Regional Grant.

NDIZE PIUGIE Auly Laure 44

Tasks: Collected data from numeric sources and/or registers from sites such as laboratories for
the assessment of AMR and Pharmacy for the assessment of AMU.

March – June 2021: National consultancy at National Institute of Statistics (NIS) in Cameroon
for the National Survey on Access to Energy (ENACE), including Water and Sanitation
Component.

Tasks: - Contributed in the selection of kits used for testing microbiological and physicochemical
parameters of drinking water

- Participated in the draft of the electronic data collection questionnaires

- Intervened in the training of trainers and field supervisors, then of data collectors within three
different training centers across the country, on drinking water quality as well as the protocol
for testing various quality parameters.

- Nationwide supervision of all teams on the field, directly in households on the ability of data
collectors to fully undertake microbiological and physico-chemical quality tests of drinking
water.

- Drafted stepwise rapports of activities as well as participated in the draft of the general
rapport of the survey.

April to May 2020: Laboratory personnel in the laboratory unit of the Rapid Intervention and
Investigation Team of the n-COVID-19 riposte under the supervision of the Department of
Disease, Epidemics and Pandemics Control of the Ministry of Public Health.

Tasks: -Preparation of the sampling equipments before and after descents on the site
- From the collection, packaging and delivery of samples to the CPC
- Transmitting to the secretariat of the RIIT lab the summary sheet of the data collected in the
different sites visited.

- Preparing the virological transport media at the Yaoundé CPC.

- Training the staff on sampling techniques
- To ensure the secretariat,
- Data management from the various field trips by laboratory teams

- Writing daily reports

- Monitoring of the stock management tool for picking inputs
- Inventory management of sample collection equipment
- From the renewal of cold accumulators to everyday life

NDIZE PIUGIE Auly Laure 45

• Since 2014: Principal investigator of Study of hepatitis B vaccine response in children after
HIV-1 vertical exposure in the context of PMTCT application. Final Year PhD project done at the
Laboratory of Vaccinology and Biobanking, Chantal Biya International Reference Centre for
research on prevention and management of HIV/AIDS (CIRCB).

Tasks: - Participated in the project design

- Coordination of field and laboratory works
- Established contact with health centers and their works (Psycho-social assistants,
nurses, laboratory services)

- Recruited participants
- Directed and did the major part of laboratory work
- Managed all the data
- Drafted the final report

• Since 2014: Supervisor of research studies undertaken by Medical Laboratory Scientist in

various medical institutes of the city of Yaounde

Tasks: - Propose the topic to the students

- Monitor the proposal writing

- Create connections with medical laboratories to be proposed to their institutions

- Daily monitoring of data and samples collection as well as biological analysis done
on these samples

- Analyze data as per specific objectives of the proposal

- Review drafts of their end of course dissertation

- Participate in jury of defense

- Ensure article writing important “important take-home” messages.

• January-February 2019: Laboratory officer and data manager of the External Quality
Control of the 5th national Demographic and Health Survey of HIV in Cameroon done in CIRCB.
Tasks: - Received and registered samples from the main laboratory - Sample management and re-
encoding.

- Followed-up of the assays done for each of the tests in list of the proposed algorithm
- Managed and interpreted each outcoming results and final conclusion for each
assayed sample.

NDIZE PIUGIE Auly Laure 46

 - Provided reports whenever requested and a final one.

• February 2016: Field supervisor of the project Impact of ICT use in the prevention, screening
and management of HIV, hepatitis and STIs amongst youth in schools and colleges In
Cameroon: A Situational Analysis

Tasks: - Created contact with schools‟ principal and regional delegates in charge of secondary schools
for administrative authorizations.
- Ensured that the health technical surveyors had all their all the material they supplied,
and were comfortably working.

- Supervised the surveyor‟s work and was in charged to solve any misunderstandings
on the field.

• January 2015: Laboratory supervisor of the project HIV impact study on Health system in
Cameroon.

Tasks: - Organized and controlled the point of care materials supplied to be used on the
field.

- Worked in collaboration with the field supervisor for any inconvenience concerning
the work of health technical surveyor.

- Received, registered and stored suitable samples from the field for confirmatory tests
of HIV, HBV, HCV and syphilis at the main laboratory.

- Followed-up of the assays done for each of the tests in list of the algorithm
- Managed and interpreted each outcoming results and final conclusion for each
infection.

- Provided reports whenever requested and a final one.

SEMINARS AND CONFERENCES

2016: The CIRCB Annual Grant Writing Worshop, CIRCB, Yaounde

2016: 10th International Workshop on HIV Treatment, Pathogenesis, and Prevention Research in
Resource Limited Settings (INTEREST) at the Hilton Hotel, Yaounde

2016: The 6th workshop on “Management of HIV/AIDS” theme: Integrating viral monitoring and
drug resistance drug resistance testing into routine clinical practice, at CIRCB Yaounde.

NDIZE PIUGIE Auly Laure 47

2016: First National Forum on the Prevention of Mother-to-Child Transmission and the
management of HIV in children and adolescents, Yaoundé.

2014: Participation at the international training Workshop on Novel Strategies for Developing
vaccines against HIV/AIDS and other infectious Diseases, Yaounde.

2014 : Participation at «2ème journées scientifiques du Centre Pasteur du Cameroun ». Yaounde.

2014: Participation at the 3th conference of the African Epidemiological Association and the 1st
Conference of the Cameroon Society of epidemiology, Yaoundé

SCIENTIFIC PUBLICATIONS

1. LF Sama, M Noubom, C Kenne, TF Tchouangueu, OB Ngouateu, AD Atsamo, O Karimo,

CB Tume, (2021). Group B Streptococcus colonisation, prevalence, associated risk factors
and antimicrobial susceptibility pattern among pregnant women attending antenatal care at
Dschang District Hospital, West Region of Cameroon: A hospital-based cross-sectional
study. Int J Clin Pract. e14683.

2. SB Tchuandom, A Lissom, GHM Ateba, TF Tchouangueu, C Tchakounte, AR Ayuk, EP

Atabonkeng, AI Ngong, G Nchinda3, JR Kuiate (2020). Dengue virus serological markers
among potential blood donors: an evidence of asymptomatic dengue virus transmission in
Cameroon. PAMJ; 36:185

3. LF Sama, M Noubom, RJ Nguekam, S Dabou, TF Tchouangueu and CB Tume (2021).

Chlamydia trachomatis IgM and IgG antibodies and associated risk factors of among
positive and negative HIV women attending consultation at the MbouoBanjoun
Presbyterian Hospital West Region of Cameroon. Ras Microb Inf Dis.

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4. CS Sake, Tchadji JC, G Ambada, LN Ngu, A Lissom, TF Tchouangueu, L Djukouo, FX

Etoa, G Nchinda (2021). Natural Killer Cells Phenotype in

Antiretroviral Naïve HIV-1 Infected People Living in Cameroon. Int J Sc Bas Appl
Res; 60(1):83-103
5. C Tchakounte, TF Tchouangueu, MN Ngoufack, LG Yatchou, ST Bonsi, et al. (2020).
Risky Behaviors among HIV Serodiscordant and Seroconcordant Couples in
YaoundeCameroon. Int J Virol AIDS 7:062.

NDIZE PIUGIE Auly Laure 48

6. TF Tchouangueu, LB Kouitcheu, A Lissom, LN Ngu, SB Tchuandom, JC Tchadji, L
Djukouo, CS Sake, AA Ngoh, HF Ouambo, G Ambada, A Gutiérrez, CO Esimone, CG
Park, AB Waffo and GW Nchinda, (2019). Antibody Responses Specific to Hepatitis B

Virus Vaccine in Children Exposed In-Utero to Antiretroviral Therapy. J Clin Exp

Immunol, 4(4): 1-11

7. Tchouangueu TF, Lissom A, Ngu LN, Priso GDN, Tchadji JC, Ngane CSS, (…) GW
Nchinda, (2018) Vertically Acquired HIV Infection in Children Modulates Hepatitis B
Surface Antigen Specifc IgG Subclass Distribution After Early Childhood Vaccination
Against Hepatitis B Virus Infection. Ann Clin Exp Immunol. 2(1):1002.

8. SB Tchuandom, JC Tchadji, TF Tchouangueu, MZ Biloa, EP Atabonkeng, MIM Fumba,

ES Massom, G Nchinda and JR Kuiate (2019). A cross-sectional study of acute dengue
infection in paediatric clinics in Cameroon. BMC Public Health 19:958

9. A Lissom, FH Ouambo, R Megnekou, MI Okeke, LN Ngu, PM Netongo, AA Ngoh, CA

Sanders, S Bawage, TF Tchouangueu, CJ Tchadji (…) GW Nchinda, (2019) Comparative
Analysis of IgG Responses to Recombinant Qβ Phage Displayed MSP3 and UB05 in Dual
HIV-Malaria Infected Adults Living in areas differing in Malaria Transmission Intensities.
J Clin Exp Immunol, 4(1): 2-10

10. SB Tchuandom, TF Tchouangueu, CA Nkondjio, A Lissom, JON Djang, EP

Atabonkeng, A Kechia, G Nchinda and JR Kuiate (2018). Seroprevalence of dengue virus
among children presenting with febrile illness in some public health facilities in Cameroon.
Pan African Medical Journal. 31:177-187

11. GD Njambe Priso, A Lissom, LN. Ngu, NN. Nji, JC Tchadji, TF Tchouangueu, GE
Ambada (…) GW Nchinda, (2018). Filaria specific antibody response profiling in plasma
from anti-retroviral naïve Loa loa microfilaraemic HIV-1 infected people. BMC Infectious
Diseases. 18:160 (1-11).

12. Alain Bopda Waffo, Loveline N. Ngu, Rana L. Singleton, Timothy Egbo, Josué L. Simo,
Carrie A. Sanders,Georgia E Ambada, Nadesh N. Nji, Apeh A. Ngoh, Qiana L. Matthews,
Boakai K. Robertson, Thibau F. Tchouangueu, (…) GW Nchinda, (2017) Surface
Engineering of Recombinant RNA Coliphage Qβ to Display gp41 Membrane Proximal
External-Region Epitopes from HIV-1. Journal of Clinical & Experimental Immunology.

2(1) 1 - 15).

13. LN. Ngu, NN. Nji, GE. Ambada, B Sagnia, CN Sake, JC Tchadji, GD Njambe Priso, A
Lissom, TF Tchouangueu, DM Tebit (…) GW Nchinda, (2017). In vivo targeting of

NDIZE PIUGIE Auly Laure 49

 protein antigens to dendritic cells using anti-DEC-205 single chain antibody improves HIV
Gag specific CD4 T cell responses protecting from airway challenge with recombinant
vaccinia-gag virus, Immunity, Inflammation and Disease. :55-67

14. B Sagnia, FM Ghomsi, A Gutierrez, S Sosso, R Kamgaing, AJ Nanfack, N Nji, G Ambada,

A Lissom, TF Tchouangueu, LN Ndengkoh, I Domkam, G Nchinda and A Ndjolo (2020).
Performance of the BD FACSPresto near to patient analyzer in comparison with
representative conventional CD4 instruments in Cameroon BMC: AIDS Research and
Therapy, 17:53-60

15. C Tchakounté, CN Nkenfou, TF Tchouangueu, NM Ngoufack, SB Tchuandom, OD

Ngono, JR Kuiate, A Ndjolo (2020). HIV Serodiscordance among Couples in Cameroon:
Effects on Sexual and Reproductive Health. International Journal of Maternal and Child
Health and AIDS; 9: (3)330-33

16. Kouitcheu MLB, Eyoum BB, Tchouangueu TF, Nguepi E & Leundji H (2017)
Treatment of Helicobacter pylori infected mice with Bryophyllum pinnatum, a medicinal
plant with antioxidant and antimicrobial properties, reduces bacterial load, Pharmaceutical
Biology, 55:1, 603-610,

17. Kouitcheu MLB, Tchouangueu TF and Talla E (2017). Antimicrobial, Antioxidant and
Protective Effect of Methanol Extract of Trichilia emetica (Meliaceae) Stem and Root Bark
against Free Radical-induced Oxidative Haemolysis EJMP 19(1): 1-14.1

18. GN. Ambada, CE. Ntsama, NN. Nji, LN. Ngu, CN. Sake, A Lissom, TF. Tchouangueu, et
al. (2017) Phenotypic characterization of regulatory T cells from antiretroviralnaive HIV-1-
infected people. Immunology, 151, 405–416.

19. CS Sake, L Ngu, G Ambada, JP Chedjou, N Nji, JC Tchadji, A Lissom, TF Tchouangueu

et al., (2017) The Effect of Antiretroviral Naïve HIV-1 Infection on the Ability of NK Cells
to Produce IFN-γ upon Exposure to P. falciparumInfected Erythrocytes, Biomed

Hub; 2:467386
20. LN. Ngu, NN. Nji, G Ambada, AA. Ngoh, GD. Njambe Priso, JC. Tchadji, A Lissom, SH.
Magagoum, CN. Sake, TF. Tchouangueu, GO Chukwuma (…) GW Godwin,

(2017). Dendritic cell targeted HIV-1 gag protein vaccine provides help to a recombinant
Newcastle disease virus vectored vaccine including mobilization of protective CD8+ T
cells. Immunity, Inflammation and Disease. 1-13.

21. Kouitcheu MLB, Tchouangueu TF and Kouam J (2017), Screening of some

NDIZE PIUGIE Auly Laure 50

 Cameroonian Medicinal Plants against Bacterial and Yeasts involved in Gastrointestinal
Disorders International. Journal of Biology; 9(3): 56-64.

22. G Ndzengue, L Ngu, C Sake, A Lissom, J Tchadji, TF Tchouangueu, et al. (2016). HIV1
Infected People (Treg) Cells in Antiretroviral Naïve Characterisation of Regulatory T
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23. MLB. Kouitcheu, TF. Tchouangueu, E. Talla, J. Kouam. (2015) Evaluation of antioxidant
activity and protective effect of Cassia arereh (caesalpiniaceae) extracts against free radical
induced oxidative haemolysis. Int J Pharm; 5(4): 1026-1036

REFERENCE

Prof KUIATE Jules-roger, Professor in Biochemistry. Department of Biochemistry, Faculty of

Science, University of Dschang; P.O. Box: 67 Dschang West Region. Telephone: +237 674-

258-857. Email: [email protected]

Dr NCHINDA Godwin Wapimewah, PhD. Heard of Department of Vaccinology and

Biobanking, CIRCB. P.O. Box: 3077 Yaounde Centre Region. Telephone: +237 676-523-909.
Email: [email protected]

Done on 12/09/2021 By Dr TCHOUANGUEU Thibau F

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Littoral region of Cameroon using ELISA, RT-PCR and Luminex xTAG GPP assays. BMC Infect Dis,
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pathogenic enteric viruses. Environ Int, 123, 114-123. doi:10.1016/j.envint.2018.11.058

NDIZE PIUGIE Auly Laure 52