Les pics d'épidémies
mis en équations
Jocelyne Erhel
Inria et IRMAR, Rennes
Illustrations Sacha Berna, école Duperré, Paris
Epidémie de grippe en 2019
réseau Sentinelles
INSERM/Sorbonne Université
Chaque hiver, la grippe saisonnière passe par un pic d’épidémie.
01/03/2019 [Link], Inria 2
Contamination
Je vais bien.
Je suis malade. Et toi,
Et toi, soigne-toi bien.
comment vas-tu ?
01/03/2019 [Link], Inria © S. Berna 3
Maladie
Je suis tombé
malade
comme toi.
01/03/2019 [Link], Inria © S. Berna 4
Guérison et maladie
Je suis guéri Je suis
encore malade
01/03/2019 [Link], Inria © S. Berna 5
Rétablissement
Nous somme
guéris
tous les deux.
01/03/2019 [Link], Inria © S. Berna 6
Modèle SIR
Dans une population, à chaque
instant, il y a des gens malades
(Infectés), des gens en bonne santé
(Sains), des gens guéris (Rétablis).
La population peut être divisée en
trois catégories ou compartiments:
S: les Sains ou Susceptibles
I: les Infectés
R: les Rétablis
On suppose ici que les Rétablis
ne peuvent plus être infectés.
01/03/2019 © S. Berna [Link], Inria 7
La dynamique du modèle SIR
10%
Au début (t=0), il y a quelques personnes Infectées, les autres sont Saines.
01/03/2019 [Link], Inria 8
La dynamique du modèle SIR
54%
Plus tard (t=7,98), plusieurs personnes Saines ont été Infectées, pendant que
des personnes qui avaient été infectées sont Rétablies.
01/03/2019 [Link], Inria 9
La dynamique du modèle SIR
32%
Encore plus tard (t=19,73), le nombre de personnes Infectées a diminué,
le pic d’épidémie est passé.
01/03/2019 [Link], Inria 10
La dynamique du modèle SIR
6%
Vers la fin (t=40,97), la plupart des gens sont Rétablis. L’épidémie est terminée.
01/03/2019 [Link], Inria 11
Flux entre compartiments
M G
© S. Berna
A chaque instant t, des personnes changent d’état:
Les quantités S,I,R varient au cours du temps.
Un flux M de personnes Saines tombent malades,
tandis qu’un flux G de personnes Infectées guérissent.
Ces flux instantanés correspondent aux variations des quantités S,I,R.
S(t) varie d’une quantité –M(t) autrement dit S’(t) = -
M(t)
I(t) varie d’une quantité M(t) - G(t)
I’(t) = M(t) - G(t)
R(t) varie d’une quantité G
R’(t) = G(t)
01/03/2019 [Link], Inria 12
La population totale P ne varie pas
Le taux d’incidence
Plus il y a de personnes infectées, plus il y a de personnes saines, et plus il y a de
nouveaux malades. La contamination dépend d’un taux d’incidence .
M(t) = I(t) S(t)
© S. Berna
01/03/2019 [Link], Inria 13
La durée moyenne de la maladie
Plus il y a de personnes infectées, et plus il y a de guéris. Une personne infectée reste
malade pendant une durée en moyenne.
G(t) = I(t)
© S. Berna
01/03/2019 [Link], Inria 14
Le modèle SIR en action
On doit résoudre le système différentiel
S’(t) = - I(t) S(t)
I’(t) = I(t) S(t) - I(t)
R’(t) = I(t)
Au début, il y a quelques Infectés, pas de Rétablis, une population totale P=1
I(0) > 0, R(0) = 0, S(0) = P – I(0).
On résout (de façon approchée) grâce à un algorithme.
Applet sur le site interstices
01/03/2019 [Link], Inria 15
Croissance et décroissance
Modèle SIR
S’(t) = - I(t) S(t)
I’(t) = I(t) S(t) - I(t)
R’(t) = I(t)
Conditions initiales: S(0)+I(0)+R(0) = 1, S(0) 0, I(0) 0, R(0) 0
Il existe une solution unique continue et dérivable qui vérifie pour t >0
S(t) > 0, I(t) > 0, R(t) > 0
On a S’(t) < 0 donc S décroît. Par contre, R’(t) > 0 et R croît.
I’(t) = I(t) ( S(t) - I(t) (S(t) - )
donc I’(t) est du signe de S(t) -
01/03/2019 [Link], Inria 16
Taux de propagation de base
Taux de propagation de base : r =
I’(t) = I(t) (S(t) - donc I’(t) est du signe de S(t) -
S(t) S(0) car S est décroissante : on étudie le signe de S(0) - avec 0 < S(0) < 1
01/03/2019 [Link], Inria 17
La maladie du ver de Guinée
[Link]
La dracunculose est une maladie tropicale due à un parasite.
Au Mali, on l’appelait la maladie des greniers vides.
En 1976, 10 millions de personnes étaient infectées.
En 2017, seulement 30 personnes étaient infectées.
Le cycle du parasite de la dracunculose
01/03/2019 [Link], Inria 19
Un modèle du ver de Guinée
Système différentiel
S’(t) = - -
P’(t) = - -
C’(t) = - -
V’(t) = - V V(t)
Avec les conditions pour t=0.
Les mathématiques pour éradiquer une maladie, par Robert Smith,
Accromath, numéro 8.1, 2013.
01/03/2019 [Link], Inria 20
Taux de propagation de base
R0 (, V) =
R0 (, V) = c
Seuil critique R0 = 1
Objectif: R0 < 1
01/03/2019 [Link], Inria 21
Comment éradiquer la maladie
R0 (, V) =
Les mathématiques pour éradiquer une maladie, par Robert Smith, Accromath, numéro 8.1, 2013.
01/03/2019 [Link], Inria 22
Eradication de la maladie
[Link]
En diminuant , on a fortement diminué le nombre de malades.
Pour cela, les gens ont appris à ne pas mettre les pieds infectés dans l’eau.
01/03/2019 [Link], Inria 23
Conclusion
• Un modèle mathématique permet de
représenter une épidémie, pour faire des
prévisions et limiter la contagion.
• Vacciner a pour but de diminuer le nombre de
personnes Susceptibles.
• Appliquer des règles d’hygiène a pour but de
diminuer le taux de propagation de base.
01/03/2019 [Link], Inria 24
Références bibliographiques
• Réseau Sentinelles
• Article dans Interstices :
modéliser la propagation d’une épidémie, par
François Rechenmann
• Article dans Accromath:
Les mathématiques pour éradiquer une
maladie, par Robert Smith
• Document Wikipedia: Dracunculose
• Fiche AC-Créteil: modèle SIR
01/03/2019 [Link], Inria 25
