Dossier scientifique

Sensibilité aux antibiotiques d’Escherichia coli

isolé des infections urinaires communautaires :
étude AFORCOPI-BIO, 2015
Eric Garnotel1,*, Hélène Astier1, Corinne Surcouf1, Jérémy Bayette2, Aurélie Bouige3, Alexandre
Dieudonné4, Jean-Louis Galinier5, Pierre Hance6, Gérard Payro7, Jacques Thierry8, Danny de Mouy9
1 Laboratoire de biologie médicale, HIA Laveran 5 Laboratoire Biolab Avenir, Toulouse, France.
4, boulevard Laveran, CS 50004, 13384 Marseille Cedex 13, France. 6 Laboratoire Labosud Provence, Marseille, France.
2 Laboratoire Unibio-Biomed, Nîmes, France. 7 Laboratoire Cerdibio, Saintes, France.
3 Laboratoire HJ Ducuing, Toulouse, France. 8 Laboratoire Dyomedea, Lyon, France.
4 Laboratoire des Cèdres, Toulouse, France. 9 Réseau AFORCOPI-BIO, Paris, France.
*Auteur correspondant : [email protected] (E. Garnotel).

RÉSUMÉ
Objectifs : Étudier la sensibilité des Escherichia coli isolés des Les taux de sensibilité aux fluoroquinolones continuent de dimi-
urines de médecine de ville dans l’ensemble de la population nuer (Se de la ciprofloxacine : 87,8 %). Les cépholosporines de
(femmes, hommes, enfants). 3e génération gardent une excellente activité. Les antibiotiques
Patients et méthodes : Il s’agit d’une étude multicen- spécifiques du traitement des infections urinaires, fosfomycine (Se:
trique rétrospective sur 121 sites de prélèvements drainés 98,7 %), nitrofuranes (Se : 98,7 %) et mécillinam (Se : 92,4 %), ont
sur 7 grands plateaux techniques répartis dans la moitié sud les meilleurs taux de sensibilité même en présence de souches
de la France. Il est effectué un recueil exhaustif des données produisant une -lactamase à spectre étendu. On observe une
d’antibiogramme des Escherichia coli isolés des urines d’origine diminution de l’activité des antibiotiques avec l’âge des patients.
communautaire durant l’année 2015. Conclusion : La surveillance de la résistance aux antibiotiques
Résultats : Les aminopénicillines (sensibilité (Se) : 51 %) et est essentielle pour guider les recommandations de l’antibio-
l’amoxicilline + acide clavulanique (Se : 69,3 %) ont une activité thérapie probabiliste. Les données collectées en 2015 sont en
insuffisante pour une utilisation en antibiothérapie probabiliste. adéquation avec les recommandations actuelles.

ABSTRACT
Susceptibility of Escherichia coli in community-acquired urinary
tract infections: AFORCOPI-BIO study, 2015
Objectives: To study susceptibility of Escherichia coli isolated in urines from all out-
come patients (women, men and children).
Patients and methods: This multicenter retrospective study is based on 121 sampling
MOTS CLÉS sites with 7 great technical platforms of south France. During 2015, the exhaustive data
◗ épidémiologie from all Escherichia coli antibiotic susceptibility testing isolated from urines of outcome
◗ Escherichia coli patients were collected.
◗ sensibilité Results: The susceptibility of Escherichia coli is too low with aminopenicillins (51 %) and
aux antibiotiques amoxicillin + clavulanic acid (69,3 %) to be used in probabilistic antibiotic treatment.The
susceptibility for fluoroquinolones is always decreasing (susceptibility for ciprofloxacin:
KEY WORDS 87,8%).Third generation cephalosporins show excellent antimicrobial activity.Antibiotics
◗ antibiotic susceptibility used specifically in urinary tract infections, fosfomycin, nitrofurans et mecillinam, have the
◗ epidemiology best antimicrobial activity (98,7 %, 98,7 % and 92,4 % respectively) even in ESBL-producing
◗ Escherichia coli strains. We show a decreased antimicrobial activity with patient age.
Conclusion: Antimicrobial susceptibility surveys of community-acquired infections are
essential for probabilistic antibiotic treatments.The existing guideline is in accordance
© 2017 – Elsevier Masson SAS with our data collected during 2015.
Tous droits réservés.

66 REVUE FRANCOPHONE DES LABORATOIRES • N° 496 • NOVEMBRE 2017

 Dossier scientifique
Mycobactéries
Mycobactéries
recommandations du REMIC édition 2015 (Référen-
Introduction tiel en Microbiologie Médicale 5e édition) s’agissant de
Les infections urinaires sont la première cause d’infec- patients de médecine communautaire [2] : leucocy-
tions en médecine de ville justifiant un traitement anti- turie ≥ 104/mL et bactériurie ≥ 103UFC/mL. Les anti-
biotique. Escherichia coli est la bactérie la plus fréquem- biogrammes sont effectués sur automates Vitex 2TM
ment rencontrée puisqu’elle représente 70 à 95 % des (BioMérieux) ou PhoenixTM (Becton Dickinson). Les
étiologies, suivi des autres entérobactéries (Klebsiella méthodes d’ensemencement et d’identification sont
et Proteus, 10 à 25 %) et de Staphylococcus saprophyticus propres à chaque laboratoire. Outre l’inscription aux
essentiellement chez la femme jeune. L’augmentation de contrôles de qualité externes, tous les laboratoires
la résistance aux antibiotiques est une préoccupation utilisent en contrôle interne : la souche d’Escherichia
constante. Elle est due à la pression de sélection des coli ATCC25922. L’interprétation des résultats suit les
antibiotiques essentiellement sur le microbiote diges- recommandations du CASFM-EUCAST 2014 ou 2015
tif, principal pourvoyeur des bactéries responsables (Comité de l’antibiogramme de la Société française de
d’infections urinaires (IU). Dans le cadre communau- microbiologie-European committee on antimicrobial sus-
taire, le tableau clinique de cystite aigüe ne justifie pas ceptibility testing) [3,4].
en première intention la réalisation d’un examen cyto- Les données sont adressées au laboratoire de biologie
bactériologique des urines (ECBU). Ainsi une antibio- de l’Hôpital d’instruction des armées Laveran à Marseille.
thérapie probabiliste est alors le plus souvent prescrite L’analyse des taux de résistance est effectuée sur les
par le clinicien. Pour cela des recommandations sont résultats interprétés : sensible, intermédiaire et résis-
rédigées périodiquement par la Société de pathologie tant. Les antibiotiques étudiés sont : ampicilline (AM)
infectieuse de langue française dont les dernières à ou amoxicilline (AMX), amoxicilline-acide clavulanique
ce sujet datent de 2015 [1]. Ces recommandations se (AMC), céfixime (CXM), céfotaxime (CTX), ceftriaxone
basent sur l’épidémiologie de la résistance des bacté- (CRO), ceftazidime (CAZ), ertapénème (ERT), imipé-
ries aux antibiotiques. Or si les données de résistances nème (IPM), mécillinam (MEC), acide nalidixique (NA),
provenant des laboratoires hospitaliers sont fréquentes, ofloxacine (OFL), norfloxacine (NOR), ciprofloxacine
celles concernant les infections communautaires sont (CIP), gentamicine (G), cotrimoxazole (SXT), nitrofu-
plus rares et doivent faire appel aux réseaux des labo- ranes (FU) et fosfomycine (FOS). La plupart des anti-
ratoires de ville. Ce travail repose sur une étude menée biotiques sont testés par l’ensemble des laboratoires
par le réseau AFORCOPI-BIO sur les données 2015 de suivant les recommandations du CASFM.
sensibilité aux antibiotiques des Escherichia coli isolés Le phénotype -lactamase à spectre étendu (BLSE) a
dans le cadre d’infections urinaires communautaires. été défini dès qu’une BLSE est présente quel que soit le
degré de production d’une éventuelle céphalosporinase ;
Patients et méthodes le phénotype CASE si une céphalosporinase est hyper-
produite avec atteinte d’au moins une céphalosporine
Le réseau AFORCOPI-BIO (Association de formation de 3e génération et en l’absence de BLSE.
continue en pathologie infectieuse des biologistes) Les analyses statistiques utilisées reposent sur la
est un réseau de laboratoires de ville, fédérés au sein méthode du Chi2 de Pearson.
de l’ONERBA (Observatoire national de l’épidémio-
logie de la résistance bactérienne aux antibiotiques).
Il regroupe 121 sites de prélèvements et 7 importants
Résultats
plateaux techniques drainant ainsi les régions autour Au total, les données de 43 245 antibiogrammes d’Esche-
des villes de Saintes,Toulouse, Nîmes, Marseille et Lyon.
richia coli ont été analysées.
L’étude est rétrospective multicentrique et porte sur
l’année 2015. Chaque laboratoire fournit les données
exhaustives d’antibiogrammes de tous les Escherichia coli
Description de la population
isolés dans les urines. Les doublons généraux sont élimi- Les femmes représentent 84,3 % des souches isolées,
nés. Les échantillons de patients provenant de structures témoin de la fréquence des infections urinaires chez
de soins (hôpitaux, EPAHD) sont exclus de l’étude. la femme. Chez l’homme une symptomatologie uri-
Trois plateaux techniques étaient accrédités pour naire implique systématiquement la réalisation d’un
l’ECBU et les 4 autres en cours de démarche pour une ECBU sous-estimant la proportion des femmes. Les IU
accréditation en 2016. Ainsi les règles de réalisation chez l’homme s’accompagnent presque systémati-
des antibiogrammes pour Escherichia coli suivent les quement d’une prostatite et correspondent donc à

REVUE FRANCOPHONE DES LABORATOIRES • N° 496 • NOVEMBRE 2017 67

Dossier scientifique

une entité particulière : elles seront étudiées indépen-

Figure 1. Répartition par tranches d’âge des damment des IU de la femme. Dans les deux sexes
Escherichia coli isolés dans les urines on observe une augmentation avec l’âge du nombre
(hommes et femmes cumulés). de souches isolées (figure 1). Chez l’homme cela
traduit la réalité de la fréquence des infections surve-
nant avec l’âge notamment sur obstacle prostatique.
Chez la femme jeune, les infections urinaires simples sont
sous-estimées car traitées sans réalisation d’un ECBU.
Dans notre étude, 1 900 Escherichia coli ont été isolés chez
des enfants de moins de 15 ans, principalement chez des

© Laboratoire de biologie médicale – HIA Laveran - Marseille

filles (81,3 %).
On distingue ainsi trois catégories de populations corres-
pondant à des contextes cliniques différents : enfants de
moins de 15 ans, femmes et hommes de plus de 15 ans.

Sensibilité d’Escherichia coli

aux différents antibiotiques dans
les 3 catégories de la population
Depuis 2015, les résultats pour les aminopénicillines
(tableau 1 et figure 2) peuvent être rendus avec l’am-
picilline ou l’amoxicilline. Le taux de sensibilité à cette
classe d’antibiotique est faible (sensibilité globale des

Figure 2. Taux de sensibilité aux différents antibiotiques sur l’ensemble de la population.

© Laboratoire de biologie médicale – HIA Laveran - Marseille

Tableau 1. Taux de sensibilité aux différents antibiotiques

© Laboratoire de biologie médicale –

chez les hommes, les femmes et les enfants de moins de 15 ans.

HIA Laveran - Marseille

68 REVUE FRANCOPHONE DES LABORATOIRES • N° 496 • NOVEMBRE 2017

 Dossier scientifique
Mycobactéries

Figure 3 . Taux de sensibilité aux différents antibiotiques

en fonction de l’âge dans la population féminine.

© Laboratoire de biologie médicale – HIA Laveran - Marseille

aminopénicillines de 51 %). L’adjonction de l’acide cla- de 3e génération (sensibilité pour la ceftriaxone : 95,7 %,
vulanique ne permet de restaurer la sensibilité que sur 91,3 % et 95,6 % respectivement).
18,3 % des souches (sensibilité pour l’AMC : 69,3 %). Les Enfin, il est apparu intéressant d’étudier le taux de sen-
céphalosporines de 3e génération parentérales gardent sibilité vis-à-vis des antibiotiques recommandés dans
une bonne activité avec des sensibilités de 93 % pour le le traitement des infections urinaires en fonction de
céfotaxime à 91,5 % pour la ceftriaxone. Les souches l’âge des patients (uniquement sur la population fémi-
restent très sensibles à l’ertapénème et à l’imipénème. nine) (figure 3). Il apparaît clairement que si l’activité
La résistance de bas niveau aux quinolones concerne des nitrofuranes, de la fosfomycine et du mécillinam se
presque 20 % des souches. La sensibilité aux fluoroqui- maintient à un haut niveau avec l’âge des patients, des
nolones va de 81,5 % pour l’ofloxacine à 87,8 % pour antibiotiques comme les fluoroquinolones, l’amoxicil-
la ciprofloxacine. line-acide clavulanique et le cotrimoxazole ont une
Les antibiotiques à spécificité urinaire restent parmi les activité qui chute de manière importante chez les sujets
plus efficaces, notamment la fosfomycine et les nitrofu- âgés. La ciprofloxacine avec un taux de sensibilité de
ranes (sensibilité pour les deux molécules de 98,7 %), 94,4 % chez les patients de 15-25 ans passe à 86,2 %
à un moindre degré pour le mécillinam, cependant chez les 66-75 ans puis à 80,5 % chez les 86-95 ans.
moins testé par les laboratoires. Chez les enfants de moins de 15 ans, on note pour la
L’analyse des taux de sensibilité aux antibiotiques dans plupart des antibiotiques les taux de sensibilité les plus
les 3 catégories de population de l’étude (homme, élevés, notamment les fluoroquinolones (Se pour la
femme, enfant) montre des résultats moins favorables CIP : 95,1 %) sauf pour l’amoxicilline-acide clavulanique
dans la population des hommes notamment pour des (Se : 68,7 %) et le cotrimoxazole (Se : 76,6 %).
antibiotiques comme les fluoroquinolones (sensibilité Les Escherichia coli porteurs de BLSE représentent
pour la ciprofloxacine : 88,9 %, 81,8 % et 95,2 % res- 4,73 % des souches. Les études réalisées précédem-
pectivement chez les femmes, hommes et enfants) ou ment dans le cadre du même réseau [5] permettent
encore mais à un moindre degré les céphalosporines de mettre en évidence une progression constante

REVUE FRANCOPHONE DES LABORATOIRES • N° 496 • NOVEMBRE 2017 69

Dossier scientifique

Chez les Escherichia coli producteurs d’une BLSE, les

Figure 4 . Évolution dans le temps de la antibiotiques spécifiques du traitement des infections
proportion de BLSE dans les infections urinaires. urinaires maintiennent leur activité : c’est le cas des
nitrofuranes (Se : 96 %), de la fosfomycine (Se : 92 %) et
à un moindre degré du mécillinam (Se : 81 %). L’activité
des fluoroquinolones devient très limitée (Se pour la
CIP : 32 %) (figure 5).

© Laboratoire de biologie médicale – HIA Laveran - Marseille

Discussion
Les infections urinaires communautaires sont un grand
pourvoyeur de traitements antibiotiques en médecine
de ville. Escherichia coli, bactérie du microbiote intesti-
nal, est soumis à la pression de sélection des antibio-
tiques et représente aussi la première cause d’infection
urinaire. L’évolution des résistances chez cette espèce
bactérienne est un peu le témoin de l’efficacité des
politiques de gestion des antibiotiques en médecine de
Pas de proportionnalité d’échelle de temps entre 2011 et 2015, données
AFORCOPI-BIO.
ville ou hospitalière. Ces politiques font appel notam-
ment à des recommandations pour la prise en charge
et le traitement probabiliste des infections urinaires
de ce mécanisme de résistance en médecine de ville [1]. Ces recommandations ont pour objectif une prise
(figure 4). Leur taux augmente progressivement avec en charge optimale du patient (guérison) mais dans le
l’âge, probablement en rapport avec la fréquentation souci d’une épargne thérapeutique et du respect des
des structures de soins. Cependant il atteint tout de écosystèmes en évitant notamment les antibiotiques
même 2,2 % dans la tranche d’âge de 15 à 35 ans. Les connus pour avoir un impact sélectif sur le microbiote
céphalosporinases hyperproduites (sans mécanisme digestif, tels que les fluoroquinolones, les céphalospo-
BLSE) restent plus anecdotiques bien que leur fré- rines de 3e génération ou le cotrimoxazole. Ainsi pour
quence augmente aussi avec l’âge partageant les mêmes les cystites simples, un antibiotique sera recommandé
mécanismes de sélection que les BLSE. en antibiothérapie probabiliste si le taux de résistance

Figure 5. Taux de sensibilité aux différents antibiotiques des Escherichia coli

producteurs de BLSE dans l’ensemble de la population de l’étude.
© Laboratoire de biologie médicale – HIA Laveran - Marseille

70 REVUE FRANCOPHONE DES LABORATOIRES • N° 496 • NOVEMBRE 2017

 Dossier scientifique
Mycobactéries
des bactéries responsables est inférieur à 20 %. Étant hyperproduites isolées restent rares. Dans notre
donné les complications possibles, dans les cystites à étude, la proportion du phénotype BLSE est globale-
risque de complication, les pyélonéphrites aigües, les ment de 4,73 % versus 3,8 % (p = 7.10-7) dans l’enquête
cystites gravidiques et les infections masculines, ce taux
Transville de 2012 [8]. Il existe de fortes disparités en
doit être inférieur à 10 % [6]. Les données de résistancefonction de l’âge puisque le taux de 2,71 % pour les
bactérienne sont donc des outils indispensables à la femmes de 15 à 65 ans passe à 5,97 % dans la tranche
conduite de l’antibiothérapie probabiliste. En médecine de 66 à 95 ans. Ces chiffres sont en rapport avec les
de ville, elles ne peuvent reposer que sur des réseaux facteurs d’acquisition des BLSE plus fréquents avec
des laboratoires de ville tels que l’AFORCOPI-BIO, l’âge : antécédents de séjours en milieux de soins,
MEDQUAL ou EPIVILLE. antibiothérapies préalables, pathologies prostatiques.
Depuis 2011, en présence d’une BLSE, le CASFM
Amoxicilline et acide clavulanique recommande de ne plus interpréter les résultats
L’amoxicilline-acide clavulanique présente une des C3G mais de rendre le résultat brut. Dans notre
activité trop faible notamment au regard du seuil étude, parmi les 2 048 BLSE, pour 233 d’entre elles, au
des 20 % exigé. C’est le cas surtout en population moins une C3G a été rendue sensible. Cette nouvelle
pédiatrique probablement en rapport avec l’utili- règle a permis potentiellement l’utilisation d’une C3G
sation plus fréquente de cet antibiotique dans 11 % des cas où une BLSE était isolée. Reste à
dans les infections respiratoires savoir si en pratique ces molécules sont uti-
hautes dans cette tranche d’âge. lisées dans ces circonstances. Rappelons
En ciblant les femmes de 15 à
Les données aussi que ces antibiotiques sont sélec-
65 ans, le taux de sensibilité de résistance tifs pour le microbiote. En définitive
s’est amélioré artificiellement les C3G restent très actives mais, de
bactérienne sont
entre 2003 et 2011 lors des par leur administration parentérale
modifications des critères du
donc des outils et pour l’épargne des antibiotiques,
CASFM 2011, notamment en indispensables à elles ne trouvent leurs indications
présence d’une BLSE, mais la conduite de en probabiliste que dans les pyélo-
reste stable dans notre étude néphrites aigües [1].
(si on cible sur cette popu-
l’antibiothérapie Le céfixime possède une place à
lation) : la sensibilité à l’AMC probabiliste part. C’est la seule C3G orale ayant
est en 2003 [7], 2011 [5] et 2015 une AMM dans les infections urinaires et
respectivement de 65,9 %, 71,1 % et notamment les pyélonéphrites. Son activité
72,5 % (2011-2015, p = 0,57). Dans notre dans notre étude est très bonne (93,4 %). Le pro-
étude issue des données 2015, il est difficile de voir blème est lié à sa pharmocodynamique : les concen-
l’impact de l’augmentation du seuil de sensibilité de trations sériques du céfixime, du fait de son mode
l’AMC pour les Escherichia coli isolés des urines [4] : d’administration, sont considérablement plus faibles
ces changements devraient améliorer les taux de que celles obtenues avec les C3G parentérales.
sensibilité. Mais les recommandations ayant été appli- Le cefixime ne peut donc pas être utilisé dans les
quées dans les laboratoires durant l’année 2015, les pyélonéphrites contrairement aux autres C3G en
données recueillies sont intermédiaires. Par ailleurs, première intention [1].
cette molécule est connue pour avoir un impact sur
la flore digestive. Ainsi, l’association amoxicilline- Quinolones
acide clavulanique ne trouve pas d’indication en pro- L’évolution de l’activité des quinolones reste préoccu-
babiliste dans les recommandations sur les IU mais pante. La résistance à l’acide nalidixique, témoin des
seulement sur documentation dans les quelques cas premières mutations chromosomiques conférant la
où la souche sera sensible. Elle est peu active sur les résistance, est globalement de 19,4 %, proche du seuil
souches productrices de BLSE (Se : 26 %) limitant son de 20 %. Les deux fluoroquinolones recommandées
indication même sur documentation. dans les infections urinaires sont plus actives : sensibilité
de 81,5 % pour l’ofloxacine et 87,8 % pour la cipro-
Céphalosporines de 3e génération floxacine. Les résultats sont un peu meilleurs si on cible
Les céphalosporines de 3e génération (C3G) restent la population des femmes de 15 à 65 ans : sensibilité
actives et les résistances sont essentiellement dues pour l’acide nalidixique, l’ofloxacine et la ciprofloxacine
à la production d’une BLSE. Les céphalosporinases respectivement de 86 %, 86,7 % et 92,7 %. Le taux de

REVUE FRANCOPHONE DES LABORATOIRES • N° 496 • NOVEMBRE 2017 71

Dossier scientifique

sensibilité de la ciprofloxacine chez la femme de 66 complémentaire. Dans notre étude, les données portent
à 95 ans chute à 83,6 %. Si on se réfère aux données cependant sur presque 50 % des souches. Les taux de
de l’AFORCOPI-BIO de 2003 et 2007 où les taux de résistance retrouvés dans la littérature sont très variables
sensibilité de la ciprofloxacine étaient respectivement mais inférieurs à 15 % [9]. Cette molécule est remboursée
de 94,5 % et 97 %, on observe une augmentation de la depuis 2013 et devrait voir ses prescriptions augmenter
résistance entre 2007 et 2015 (p = 9,3.10-5) [7]. Enfin notamment dans la cystite aigüe simple du fait de son
les fluoroquinolones sont inductrices de résistance par activité.
accumulation des mutations sur les gènes de l’ADN La nitrofurantoïne est un antibiotique connu depuis long-
gyrase et la topoisomérase justifiant une politique temps mais dont les résistances ne se sont pas dévelop-
d’épargne. Il faut noter à leur avantage que ces molécules pées du fait de son utilisation limitée et de son mécanisme
ont une élimination urinaire qui favorise leur activité d’action très particulier (réduction des groupements NO2
dans cette indication. L’ensemble des arguments justifie entrainant une lésion de l’ADN bactérien) évitant ainsi les
dans les recommandations leur positionnement en der- résistances croisées. Il conserve ainsi une excellente acti-
nière intention dans les cystites simples ou à risque de vité même en présence d’une BLSE (Se : 96 %).
complications [1]. Une surveillance de l’évolution des La fosfomycine-trométanol conserve aussi son activité
résistances doit être effectuée car elles restent pour les mêmes raisons (Se en présence d’une
en première ligne (avec les C3G) dans les BLSE : 92 %). Elle est fréquemment prescrite
pyélonéphrites aigües. La ciprofloxacine du fait de sa facilité d’utilisation en mono-
devrait être privilégiée en probabiliste dose et de sa bonne tolérance.
du fait de sa meilleure activité. Les nitrofuranes, Les caractéristiques de ces trois
la fosfomycine antibiotiques en font des traite-
Cotrimoxazole ments probabilistes de première
et le mécillinam ligne dans les cystites simples et
Escherichia coli présente dans
notre étude un taux de sensi-
restent très actifs gravidiques. Leur utilisation peut
même en présence être envisagée en présence d’une
bilité au cotrimoxazole (77,5 %) BLSE [1].
inférieur au taux requis pour d’une BLSE
une antibiothérapie probabi-
liste. Ce taux n’évolue pas dans le Limites de l’étude
temps puisqu’il était à 77,3 % en 2000
(p = 0,93) [7], probablement en rapport avec Les études de résistance bactérienne en
une faible utilisation de cet antibiotique. Les recom- médecine de ville sont toujours très difficiles. Il faut
mandations placent cet antibiotique seulement sur souligner l’action des réseaux de laboratoires sans qui
documentation bactériologique particulièrement dans aucune donnée ne pourrait être collectée.
les cas d’IU masculine où le taux de sensibilité est de Dans notre étude, les circonstances cliniques n’ont
75,2 % dans notre étude. pas été recueillies. Celles-ci rentrent dans la définition
des cas des différents tableaux cliniques d’IU. Les don-
Nitrofuranes, fosfomycine nées présentées dans cette étude sont globales et ne
et mécillinam permettent pas de mettre en évidence d’éventuelles
différences dans les phénotypes de résistance selon les
Dans ce contexte, les molécules à spécificité urinaire tableaux cliniques.
méritent un intérêt particulier. En effet, elles sont parti- Les cystites simples aiguës ne nécessitent pas la réa-
culièrement efficaces : les nitrofuranes et la fosfomycine lisation d’un ECBU en première intention : les bacté-
(sensibilité de 98,7 % pour les deux molécules) et le mécil- ries isolées dans les laboratoires ne sont donc pas le
linam (sensibilité de 92,4 %). Ce sont des antibiotiques qui reflet exact de l’ensemble des infections urinaires avec
ne seraient pas sélectifs pour le microbiote intestinal. Leur probablement une surestimation des résistances plus
activité persiste à un haut taux chez les patients les plus âgés. fréquentes lors d’échecs thérapeutiques, de cystites
Le mécillinam est une  lactamine particulière car agissant récidivantes, d’IU avec facteurs de risque, circonstances
sur certaines PLP (Protéines de liaison à la pénicilline) lui dans lesquelles sont réalisés précisément les ECBU.
permettant de garder son activité avec des souches aux Les patients prélevés dans des établissements de santé
phénotypes touchant les autres  lactamines. Son activité ont été exclus. Cependant la méthodologie ne permet
chez les Escherichia coli producteurs d’une BLSE reste pas d’individualiser les patients hospitalisés récemment
étonnamment élevée (Se de 81 %). Tous les laboratoires ou ayant bénéficié de gestes invasifs notamment sur
ne testent pas cette molécule qui était en 2015 sur liste l’arbre urinaire en hôpital de jour par exemple.

72 REVUE FRANCOPHONE DES LABORATOIRES • N° 496 • NOVEMBRE 2017

 Dossier scientifique
Mycobactéries
Conclusion Points à retenir
La maîtrise de la résistance aux antibiotiques passe par
◗tL’amoxicilline-acide clavulanique n’a pas de place dans
une bonne utilisation des traitements anti-infectieux. Les
recommandations en infectiologie ont besoin des don- le traitement probabiliste des IU du fait de sa faible
activité et de son caractère sélectif sur le microbiote
nées sur les résistances bactériennes. Si les études sont
digestif.
fréquentes en milieu hospitalier, elles sont plus rares en
◗tLes céphalosporines de 3e génération restent très
médecine de ville où les laboratoires privés ont un rôle
actives et sont indiquées dans les pyélonéphrites.
primordial de sentinelle. Le regroupement actuel des ◗tLa résistance aux fluoroquinolones augmente et doit être
structures donne naissance à des plateaux techniques surveillée.
de grande ampleur et à des sources de données biolo- ◗tLes antibiotiques à spécificité urinaire, tels que les ni-
giques de valeur. Leur fédération au sein de réseaux est trofuranes et la fosfomycine, ont un taux de sensibilité
un moyen de les exploiter et les valoriser. QQ supérieur à 92% même en présence d’un BLSE. Le mécilli-
nam est également très actif. Ces trois antibiotiques sont
de première intention dans les cystites simples.
Liens d’intérêts : les auteurs déclarent ne pas avoir de liens ◗tLe taux d’Escherichia coli producteurs de BLSE progresse
d’intérêts avec le contenu de cet article. dans les IU de ville.

Références infections urinaires communautaires : étude AFORCOPI-BIO 2011.

RICAI 2012.
[1] Diagnostic et antibiothérapie des infections urinaires bactériennes com- [6] Fried LP, Tangen CM, Walston J, et al. Cardiovascular Health Study
munautaires de l’adulte, Société de pathologie infectieuse de langue fran- Collaborative Research Group. Frailty in older adults: evidence for a phe-
çaise, 2015. www.infectiologie.com/UserFiles/File/spilf/recos/infections- notype. J Gerontol A Biol Sci Med Sci. 2001 Mar;56(3):M146-56.
urinaires-spilf-argumentaire.pdf [7] De Mouy D, Fabre R, Cavallo JD, et al. Le réseau AFORCOPI-
[2] Référentiel en Microbiologie Médicale, 2015, 5e édition, Société BIO. Community-acquired urinary tract infections in 15 to 65 years old
Française de Microbiologie female patients in France. Susceptibility of E. coli according to history:
[3] Comité de l’antibiogramme de la Société française de microbio- AFORCOPI-BIO network 2003]. Med Mal Infect. 2007 Sep;37(9):594-8.
logie, recommandations 2014 http://www.sfm-microbiologie.org/User Epub 2007 Jan 26. French.
Files/files/casfm/CASFM_EUCAST_2014_V2_0.pdf [8] Caillon J, Gueudet T, Merens A. Enquête transville 2012 ONERBA,
[4] Comité de l’antibiogramme de la Société française de microbio- Communication orale, RICAI 2013
logie, recommandations 2015 http://www.sfm-microbiologie.org/User [9] Neuzillet Y, Naber KG, Schito G, et al. French results of the ARESC
Files/files/casfm/CASFM_EUCAST_V1_2015.pdf study: clinical aspects and epidemiology of antimicrobial resistance in
[5] De Mouy D, Janvier F, Mérens A, et al. Sensibilité d’Escherichia female patients with cystitis. Implications for empiric therapy. Med Mal
coli aux quinolones et aux céphalosporines de 3e génération dans les Infect. 2012 Feb;42(2):66-75.

REVUE FRANCOPHONE DES LABORATOIRES • N° 496 • NOVEMBRE 2017 73