Définition
Vi
Nicotinamide
pro-enzyme = zymogène :pepsinogène =pepsine
Une enzyme est caractérisé par un nom complexe ou nom commun
Numéro spécifique EC avec 4 chiffre
Classe /Type de liaison/type de sous liaison/numéro d’ordre
TPP = groupement aldéhyque
Phosphate pyridoxal : catabolisme AA
Coenzyme A: transfert des coupemeny acylés
L’affinité : Capacité d'une enzyme de former un complexe avec un substrat.
Composé riche en énergie :composé comportant une ou plusieurs liaisons chimique à haut potentiel
énergétique comme ATP ou les nucléosides phosphates
Delta G : représente la part d’énergie utilisable intégralement transformable en travail
Delta H : variation enthalpie
Delta S : variation entropie libre (ph7)
Entropie : mesure le degrés de désordre d’un système. Toute réaction chimique qui tend a diminuer
l’odre est avantager sur le plan énergétique
Une réaction endergonique : est une réaction chimique qui nécessite un apport d’énergie
pour se réaliser.
Une réaction exergonique : est une réaction chimique spontanée dont le travail est fourni
durant sa propre réalisation sans apport énergétique extérieur.
Delta inf à zero
ATP : est une molécule constituée d'adénine liée à un ribose qui, lui, est attaché à une chaîne de trois
groupements phosphate unis les uns aux autres par deux liaisons pyrophosphates à haut potentiel
énergétique.
Couplage énergétique : association de 2 réactions enzymatiques, l'une exergonique, l'autre
endergonique, grâce à laquelle l'énergie libérée par la première peut être directement transmise à la
seconde au lieu d'être perdue sous forme de chaleur
Il faut que la réaction exergonique soit sup à celle endergonique
Enzyme :
-sont des protéines fabriquée par les cellules des êtres vivants.
-Elles sont capables de fonctionner en dehors des cellules vivantes.
-Elles permet la transformation d’un substrat en produit
-certaine enzymes nécessite une coenezyme pour leur activité
ATP :principal donneur immédiatd’énergie
-30kj par liaison
Une apoenzyme : est une partie protéique d'une enzyme, qui doit être activée par une coenzyme ou
un cofacteur. Associé à un substrat, elle devient une holoenzyme
Biotactalyseur : est une sp chimique qui :
Augmente la vitesse de récation chimique
Agit à faible doe
Ne modifie pas le sens de la réaction
Ne modifie pas la constante d’équilibre
Diminue l’energie d’activation
L'énergie d'activation : est la quantité d'énergie minimale requise pour amorcer une réaction
chimique
L’enrichissement : activité totale (U)/quantité totale de protéineIUmg
(tendance à augmenter)
Rendement : à tendance à diminuer au cours du temps,mesure l’activité enzymatique s’exprime en
UA
Site actif : sur une enzyme où il reconnait le substart et transformation du substrat en produit
Site de fixation : site de reconnaissance du substrat
Site catalytique : site de transformation d'un substrat préalablement fixé en produit
Structure primaire : c’est la séquence en acides aminés
Structure secondaire : est composé de l’hélice alphat et du feuillet plissé beta
Structure terciaire : représente par l’organisation spatiale de la protéine
Structure quarternaire : chaine polypeptidique
K1 : constante de vitesse d’association ES
K-1 :constante de vitesse de dissociation ES
K2 : constante de vitesse de transformation de subtrat en produit
K-2 : constante de vitesse de transformation de produit en substrat
vitesse initiale : C’est la vitesse de disparition du substrat ou d’apparition du produit P
pente de la tengeante à l’origine
s’exprime parla formule : vi = Vmax /S/Km*S
km :est une constante de machaleis manten, qui représente la concentration de S pour laquelle la E
est à moitié saturée. S’exprime en mmol/l-1
concentration en substrat pour laquelle Vi = Vmax /2
mesure l’affinité de l’enzyme pour son substrat
Ki : représente la concentration en inhibiteur pour laquelle la moitié des sites enzymatiques sont
occupés
Effecteur : Toute substance ou facteur qui peut avoir une influence sur l’activité enzymatique, On
distingue :les activateurs = qui augmente la vitesse de la réaction / les inhibiteurs = qui réduisent la
vitesse de réaction (inhibiteur pas transformé par l’enzyme)
Vm : La quantité maximale de produit formé par unité de temps et par une certaine quantité en
enzyme/ représente l’activité enzymatique exprimé en UI
Zymogène : est une enzyme inactive, pour devenir active elle doit changer de conformation
Pepsinogène============pepsine
Inhibiteur compétitif :l’inhibiteur s’attache au même site que le subtrat. L’inhibiteur présente une
analogie structurale avec le substrat
Inhibiteur compétitif : le substrat et inhibiteur n’ont pas le même site de fixation. L’enzyme peut se
mettre sur l’enzyme complètement libre ou complexé par le subtrat
Inhibiteur incompétitif : la fixation de l’inhibiteur diminue l’activité de l’enzyme et favorise la
stabilité ES
Ka : constante d’équilibre d’association
Kd : Constante d’équilibre de dissociation
L’activité spécifique (enrichissement) : d’une enzyme est la quantité de produit formé par unité de
temps par mg de protéine
kcat: constante catalytique (en sec-1):nombre de molécules de substrat transformées en produit par
seconde et par molécule d’Enzyme
Katal (kat) : quantité d’enzyme qui catalysent la transformation 1 mole de substrat par seconde
UI (unité international) : est la quantité d’enzyme qui catalysent la transformation d’une micromole
de substrat par minute dans des connditions optimales
Substrats : Molécule qui, après s'être liée au site actif d'une enzyme, est transformée en un ou
plusieurs produits.
Ph optimum : est le ph où l’activité enzymatique est à son maximum
Enzyme allostérique :
o Oligomère
o Catalysent pls substrat
o Participe à la régulation des voix métabolique
o Régule la voix métabolique en changeant de conformation
o Vi /s n’estpas une hyperbole comme les enzyme michaelienne mais mais une sigmoïde
Effet coopératif : fixation d’un premier ligand facilité la fixation suivante (= augmente l’affinité d’un
autre site)
Coenzyme/cofacteur : est une molécule non protéique qui est nécessaire au fonctionnement de
certaines enzymes. Peuvent intervenir dans diverse réaction de même type
P : concentration en protéine
L :concentration en ligang libre
PL : concentration complexe protéine/ligand
Po :cencentration totale en protéine
∆G’O: enthalpie libre standard (pH = 7)
Groupe catalytique : chaine latéral des AA du site actif
Info en plus :
La position du site actif est conditionné par la structure tridimensionnelle de l’enzyme
Les AA sont rapprochés grâce à la conformation de l’enzyme
Enzyme dénaturé pas d’activité catalytique
o L’affinité se mesure en Kd
o Complexee réversible L /P
o Complémentarité
P0 =PL+P
Quand PL =Po = saturation
Quand L =KD semie saturation
Pls axe de symétrie
Sans substrat 2 état à l’équilibre
Loi du tout ou rien transition concerté
Conservation de la symétrie chaque protomère a un site de fixation
Un état à l’équilibre
Transition conformationele
Sans subsrtat qu’un état à l’équilibre
Négatif posituf direct
Met en jeu la structure terciaire
La glycolyse : est l’ensemble des réactions s’effectuant dans le cytoplasme qui oxydent le glucose en
pyruvate avec formation ATP et de NADH
La glycogénolyse, dégradation du glycogène dans les tissus (foie avec sécrétion du glucose dans
le sang)