A.
Chromosomes
Un chromosome (du grec ancien : χρώμα, couleur et σώμα, corps, élément)[1] est un
élément microscopique constitué d'une molécule d'ADN et de protéines, les histones et
les protéines non histones. Il porte les gènes, supports de l'information génétique,
transmis des cellules mères aux cellules filles lors des divisions cellulaires.
Dans les cellules eucaryotes, les chromosomes se trouvent dans le noyau. Dans les
cellules procaryotes, qui ne contiennent qu'un seul chromosome circulaire, ce dernier
se trouve dans une région du cytoplasme appelée nucléoïde.
Entre deux divisions, les molécules d'ADN constituant les différents chromosomes
d'une cellule ne sont pas visibles ; ADN, ARN et protéines forment un ensemble non
structuré appelé chromatine. L'ADN se condense progressivement au cours de la
division cellulaire pour prendre lors de la métaphase une apparence caractéristique en
forme de double bâtonnet, lié au centromère en forme de X.
L'ensemble des chromosomes est représenté sur un caryotype, ou carte de
chromosomes, où les chromosomes sont habituellement présentés par paires, en
parallèle avec leur homologue. Le caryotype représente les chromosomes sous leur
forme condensée : les chromatides.
Après la réplication de l'ADN pendant l'interphase du cycle cellulaire, les chromosomes
sont composés de deux chromatides identiques, attachées au niveau du centromère.
Chaque chromatide est formée d'une molécule d'ADN (le nucléofilament) associée à
des protéines, les histones, autour desquelles elle s'enroule pour former
des nucléosomes. Aux extrémités de chaque chromatide se trouvent les télomères,
constitués de séquences répétitives d'ADN, qui assurent une protection des
terminaisons chromosomiques. Les télomères et le centromère ne codent pas
d'information génétique, il s'agit d'ADN non codant.
En microscopie optique, on distingue sur les chromosomes des régions condensées,
formées d'hétérochromatine, et des régions décondensées, formées d'euchromatine. Les
gènes exprimés se localisent principalement au niveau de l'euchromatine.
[Link]érents type d’ARN
Dans la cellule ou in vitro, il existe donc plusieurs types ou catégories d'ARN :
ARNg : ARN génomique (ARN double brin qui constitue le génome de certains
virus).
ARN guide (guide RNA) : petits ARN transcrits de 50 à 70 nucléotides qui jouent un
rôle de matrice d’ARN pour l’ADN-télomérase.
ARNi : ARN interférant (interférence par ARN) ; molécule d’ARN capable de
contrôler l’expression de gènes situés sur des ARN viraux (en se fixant par
complémentarité sur leur séquence nucléotidique). Ce principe est utilisé en biologie
moléculaire pour inhiber l’expression d’un gène de façon spécifique.
ARN messager ou ARNm : il est formé par transcription d'un gène de l'ADN dont il
est la copie. Son rôle consiste à transporter l'information génétique recueillie
du noyau vers le cytoplasmeoù elle sera traduite en protéine par
les ribosomesdu réticulum endoplasmique.
ARN prémessager ou pré-ARN messager ou pré-ARNm : ARN précurseur des
ARNm, subit des modifications post-transcriptionnelles aboutissant à l'obtention de
l'ARNm.
ARNnm : ARN non messagers ; c’est-à-dire des ARN qui ne sont pas traduits en
protéines.
ARN positif : ARN viral à polarité positive qui peut être traduit directement par les
ribosomes de la cellule infectée. Dans le cas des ARN viraux à polarité négative, une
transcriptase virale les transcrit en ARN à polarité positive afin qu’ils puissent être
traduits en protéines.
•ARN de transfert ou ARNt : ils servent à « traduire » les codons de l'ARNm en acides
aminés. Ce sont des molécules qui se placent sur les sites du ribosome où va être lu l'ARN
messager. Un ARNt est un brin court qui a un anticodon sur sa boucle, et un acide
aminéattaché à l'autre extrémité et qui sera transféré à la protéine en formation.
ARNt-aminoacyl : ARN de transfert (ARNt) chargé, c’est-à-dire un ARNt portant son
acide aminé.
ARNtm: essentiels pour la plupart des bactéries, ces ARN ont une fonction hybride
entre celle d'un ARNt et un ARNm. Ils servent à libérer les ribosomes bloqués lors de
la traduction d'ARNm accidentellement tronqués, en aiguillant la lecture sur eux-
mêmes (fonction ARNm) et en chargeant les ribosomes manquants de codons
suivants (fonction ARNt forcée afin de permettre la translocation traductionnelle). La
courte séquence peptidique codée par la fonction ARNm est fusionnée à la protéine
naissante mais incomplète et constitue un signal cible des protéases intracellulaires
([Link]. ANDENYALAA chez E. coli). Ainsi non seulement les ribosomes sont libérés
du blocage accidentel et peuvent être réutilisés, mais les protéines et l'ARN
incomplets sont aussi détruits et également recyclés.
ARN ribosomique ou ARNr : il représente 80 % de l'ARN total d'une cellule.
Associé à des protéines, il forme le ribosome qui constitue la tête de lecture de
l'information génétique transcrite par l'ARN messager.
ARNt isoaccepteurs : différents ARN de transfert capables de porter le même acide
aminé.
ARN antisens (aRNA) : ARN complémentaire d'une portion d'un autre ARN et
inhibant sa fonction. Les ARN antisens peuvent être des éléments naturels de
régulation (exemple : les ARN MIC). Ils peuvent être également obtenus par génie
génétique.
ARN MIC : classe particulière d'ARN antisens, complémentaire de l'extrémité 5' d'un
ARNm et inhibant sa fonction. Les ARN MIC sont des éléments naturels de
régulation.
ARN monocistronique : ARN ne comportant qu'une seule information génétique.
Un cistron est une région du génome qui ne porte qu'une seule information génétique
transcrite en ARN. Ce terme vient de l'emploi du test" cis-trans" utilisé, en génétique
classique, pour mettre les cistrons en évidence chez les bactéries. Pour un ARNm, un
cistron correspond à un seul polypeptide.
ARN polycistronique : ARN messager contenant plusieurs cistrons, et donc codant
plusieurs chaînes polypeptidiques distinctes.
ARN nucléaire de grande taille ou ARN nucléaire hétérogène : ARN nucléaire
résultant d'une transcription par la polymérase II. Ces ARN sont hétérogènes en taille
et peu stables.
ARN recombinant : molécule d'ARN composée de fragments d'origines distinctes
réunis in vitropar une ARN ligase.
ARN satellite : ARN qui peut accompagner certains virus. L'ARN satellite,
encapsidé, est spécifique de chaque virus, et ne peut se répliquer sans lui.
petits ARN nucléaires ou ARNsn : ARN de la machinerie
d'épissage ou splicéosome. Ils sont associés à des protéines au sein de particules
ribonucléoprotéiques appelées snRNP ou parfois "snurps".
petits ARN nucléolaires ou snoARN : ARN guides participant à l'incorporation de
modifications chimiques dans d'autres ARN. Les deux principales modifications sont
la méthylation de la position 2' du ribose et la pseudouridylation (transformation de
l'uridine en pseudouridine).
aptamères : ARN artificiels sélectionnés "in vitro" pour une propriété particulière de
fixation d'un ligand ou de catalyse enzymatique.
ARNnc (ARN de non-codage; voir aussi "ARNnm", ci-dessus). La plupart des ARN
ne code pas une protéine (97 % selon Mattick[1]). Certains de ces ARNnc ont des
rôles de régulateur de processus métaboliques (voir ci-dessus). Une grande partie peut
simplement être sans signification, mais elle pourrait également servir d'autres rôles
tels que les codages postulés des éléments d'action; (voir après) :
