Chapitre
4
Introduc1on
aux
composés
organiques
Les
principaux
éléments
rencontrés
dans
les
composés
organiques.
Atome H C N O
Valence 1 4 3 2
Etats d’hydridation
sp3, sp2, sp sp3, sp2, sp sp3, sp2
possibles
Formules
brutes
et
formules
développées
CH4
C2H6
C3H8
C4H10
H H H H H H H H H H
H C H H C C H H C C C H H C C C C H
H H H H H H H H H H
méthane éthane propane butane
H H H H H H H H H H H
H C C C C C H H C C C C C C H
H H H H H H H H H H H
pentane hexane
C5H12
C6H14
Chaînes
carbonées
ramifiées
Primaire
Tertiaire
Quaternaire Secondaire
Chaînes
carbonées
cycliques
H H
H H H H
H H H H
H C H C
H C H H C C H H C C H
C C
C C H H
H C C H C C H C C H
H H C
H H H H H H
H H
H H
cyclopropane cyclobutane cyclopentane cyclohexane
Représenta1on
simplifiée
Formule
développée
semi
-‐développée
H H H H H simplifiée
CH2 CH2
pentane H C C C C C H CH2
H3C CH3
H H H H H
cyclopropane cyclobutane cyclopentane cyclohexane
Groupements
fonc1onnels
Liaison
du
carbone
avec
un
hétéroatome
:
O,
N,
S,
Halogènes
≠
C
ou
H
Les
molécules
portant
des
groupements
fonc1onnels
sont
plus
réac1ves
Groupement
fonc1onnel
=
No1on
de
réac1vité
chimique
spécifique
famille
chimique
Exemple
:
le
groupement
–OH
Famille
des
alcools
Groupement Fonc1on Groupement Fonc1on
Alcane
C
Cétone
CnH2n+2 O
C C Alcène
Ether
C O C
CnH2n CnH2n+2O
C H
Alcyne
C C
O Aldéhyde
CnH2n-2
O
H
Phénol
Arène
C O H
C X
X
Halogénure O Acide
carboxylique
=
F,
Cl,
Br,
I
C O H C O C
Alcool
O Ester
CnH2n+2O
C S H C O C
Thiol O O Anhydride
d’acide
C N
C N
Amine O Amide
Quelques
exemples
de
composés
organiques.
H3C
CH3 CH3 CH3
H3C
CH3
CH3 CH3 CH3
CH3
Limonène β-carotène
Alcènes
NH2
Arènes
N
O N
H
Naphtalène Pyrène Cytosine
Structure du benzène
• formule moléculaire: C6H6
• molécule plane et cyclique
• 6 liaisons C-C de longueurs égales
• conjugaison étendue à l’ensemble du cycle
• stable et chimiquement inerte
• aromaticité lui confère sa stabilité
(énergie de résonance 125 kJ/mol)
H H
H H H H
H H H H
H H
Hybride de résonance
Structure du benzène
Quelques
exemple
de
composés
organiques.
Alcool
Cholestérol
HO
Phénols
Thiols
:
Exemple
de
la
Kéra8ne
Oxydation S S S
SH SH SH SH SH S S
SH SH SH SH SH Réduction S S S S S
Quelques
exemple
de
composés
organiques.
Halogénoalcanes
Ethers
Le
groupement
carbonyle
:
Aldéhydes
et
cétones
Quelques
exemple
de
composés
organiques.
Esters
et
acides
carboxyliques
Amines
OH
OCH3
OCH3
O
H3C N O
CH3
O
H3CO
OCH3 O
Delphinine (alcaloïde toxique issu
du delphinium ou pieds d'alouette)
La
sensa1on
de
brûlure
:
Protéine
TRPV1
Ca2+
Na+
TRPV1
Chaleur
>
44°C
métabolites
d’acides
linoléiques
oxydés
TRPV1
ac1vé
Capsaïcine
(Piment)
Shogaol
(Gingembre)
Capsazepine
Eléments de nomenclature
Eléments de nomenclature
Groupes radicaux
R
Tableau
de
groupe
fonc8onnel
par
ordre
de
priorité.
Quand
une
molécule
comporte
plus
d'
un
groupement
fonc1onnel,
celui
qui
est
placé
le
plus
haut
dans
le
tableau
suivant
a
la
priorité
la
plus
grande
et
doit
u1liser
le
suffixe,
les
autres
u1lisent
le
préfixe
.
Eléments de nomenclature
:
1) Déterminer la fonction principale :
Priorités des fonctions
La fonction principale donne le suffixe du nom. ol
2 ) Déterminer la plus longue chaine carbonée du composé (elle contient la fonction principale) le
nom de la molécule dérive de l’alcane correspondant. Heptane
3) Numéroter la chaine carbonée de façon à avoir l’indice le plus petit pour la fonction principale.
Heptan-2-ol
4) Classer les radicaux (ramifications) par ordre alphabétique et leur attribuer le bon indice. Ils sont
indiqués en préfixe 5-ethyl-3,3-dimethyl heptan-2-ol
5) Si un deuxième groupement fonctionnel est présent on utilise un préfixe.
O OH OH
3-ethyl-6-hydroxy-5,5-dimethylheptan-2-one 5-ethyl-3,3-dimethylheptan-2-ol
Eléments de nomenclature
:
1) Déterminer la fonction principale :
Priorités des fonctions
La fonction principale donne le suffixe du nom.
2 ) Déterminer la plus longue chaine carbonée du composé (elle contient la fonction principale) le
nom de la molécule dérive de l’alcane correspondant.
3) Numéroter la chaine carbonée de façon à avoir l’indice le plus petit pour la fonction principale.
4) Classer les radicaux (ramifications) par ordre alphabétique et leur attribuer le bon indice. Ils sont
indiqués en préfixe
5) Si un deuxième groupement fonctionnel est présent on utilise un préfixe.
O OH OH
3-ethyl-6-hydroxy-5,5-dimethylheptan-2-one 5-ethyl-3,3-dimethylheptan-2-ol
Isomérie
de
Posi1on
Pentane Isopentane Néopentane
(ou Méthylbutane) (ou 2,2-diméthylpropane)
OH
HO
OH
pentan-1-ol pentan-2-ol pentan-3-ol
bp 137,5°C bp 119,3°C bp 115,6°C
Isomérie
de
fonc1on
Fonc1ons
organiques
différentes
HO O
pentan-1-ol méthyl-tbutyléther
bp 137,5°C bp 55,2°C
mp -79°C mp -109°C
C5 H12O C5 H12O
Stéréoisomérie
H3C CH3 H3C H
but-2-ène C C C C
H H H CH3
isomère Z isomère E
mp -139,3°C mp -105,8°C
H
(E) (Z)
hν
O H
O
11-(E)-Rétinal 11-(Z)-Rétinal
Les règles de Cahn-Ingold-Prelog
Les groupement sont classés par ordre de priorité suivant les règles de CIP :
(1) Par ordre décroissant de numéro atomique Z les atomes liés directement au
carbone
(2) En cas d’atomes de numéro atomique identiques en 1ère position, on compare
les atomes en 2ème position, etc…
(3) Une liaison multiple est considérée comme autant de liaisons simples
(ainsi, dans une liaison double C=C chaque atome de C est considéré
comme lié à 2 C ; dans C=O le carbone est considéré lié à 2 O et l’O à deux C.)
Sous-règles :
a) Un atome R est prioritaire par rapport à un atome S.
b) Un groupe d'atomes R/R est prioritaire par rapport à un groupe d'atomes R/S.
c) Un groupe Z est prioritaire par rapport à un E.
Stéréoisomérie
(Chiralité)
A A
C C
C C
B B
D D
180°
A A
C C
C D
B B
D C
Couple d'énantiomères
Stéréoisomérie
(Chiralité)
a a
On
classe
les
subs8tuant
suivant
les
règles
CIP.
C C
c c
b b
d d
Le
4e
subs8tuant
(d)
est
placé
à
l’arrière.
Sens
direct
(sans
a a
des
aiguilles
d’une
Sens
indirect
montre)
C C
d d
configura8on
R
b b configura8on
S
c c
H OH -OH
Æ
Ordre
de
priorité
pour
C-‐1
?
H -H
1
2
N C* -CH-NHCH3
CH3
CH3
H CH3 -C6H5
4 1 R
1
H O 4
1
C C1
C C N 4
C 3
2
3
C H
C 2
3 2
C-‐1
:
R
Pouvoir
Rotatoire
Mesure
expérimentale
du
sens
du
pouvoir
rotatoire
[α]
(dévia1on
du
plan
de
polarisa1on
de
la
lumière
polarisée).
Dévia8on
vers
la
droite
:
angle
+α a
énan8omère
dextrogyre
noté
(+),
(d)
Dévia8on
vers
la
gauche
:
angle
-‐α
a
énan8omère
lévogyre
noté
(-‐),
(l)
Discrimination des énantiomères par les sites
biologiques
Discrimination des énantiomères par les sites
biologiques
HO ( R) CO2H HO2C (S) OH
NH2 H2N
H H
HO OH
Dopa
sans
effet
biologique
agent
an1-‐parkinsonien
Séda1f
/
an1
nauséeux
Tératogène
Thalidomide
Pour
résumer
:
l’isomérie
Molécules
différentes
possédant
la
même
formule
brute
Ø Isomérie
de
cons8tu8on
:
• Isomérie
de
posi1on
Présence
d’un
groupement
fonc1onnel
ou
d’un
radical
sur
des
posi1ons
différentes
le
long
de
la
chaine
carbonée
:
• Isomérie
de
fonc1on
Présence
de
deux
fonc1ons
différente
correspondant
à
une
même
formule
brute.
Pour
résumer
:
l’isomérie
Molécules
différentes
possédant
la
même
formule
brute
Ø Stéréoisomérie
:
Isomérie
liée
à
la
géométrie
moléculaire
:
• Enan1omères
:
Isomères
chiraux
image
l’un
de
l’autre
dans
un
miroir.
HO ( R) CO2H HO2C (S) OH Tous
les
carbones
NH2 H2N asymétriques
changent
de
H H configura1on
absolue
HO OH
• Diastéréoisomères
Stéréoisomères
qui
ne
sont
pas
des
énan1omères.
Effet
induc1f
:
Exemple
des
acides
carboxyliques
R1 R2 R3 pKA
H H H 4,74
Cl H H 2,86
Cl Cl H 1,26
Cl Cl Cl 0,64
F F F 0,23