Réalisé par : Yammani Yousra
Le principe de la technique NGS technologie Illumina
La technologie Illumina utilise le séquençage de nouvelle génération (NGS) pour
produire des données de séquençage de l'ADN à haut débit. Le principe de cette
technique est basé sur la séquence de l'ADN par synthèse.
Les étapes :
1.Préparation des librairies:
L'ADN est extrait et fragmenté en de petits
morceaux de quelques centaines de nucléotides.
Des adaptateurs sont ajoutés aux extrémités des
fragments d'ADN pour permettre leur fixation sur
une surface de verre. Cette étape produit ce qu'on
appelle des librairies d'ADN prêtes pour le
séquençage.
2. Amplification clonale:
Les librairies d'ADN sont déposées sur
une lame de verre appelée flowcell. Une
amplification par PCR est effectuée pour
créer des clusters de fragments d'ADN
identiques. Chaque cluster contiendra
environ 1000 copies du même fragment
d'ADN.
3 Séquençage
La technique de séquençage par synthèse
(SBS) d'Illumina utilise des terminateurs de
chaîne réversibles marqués par des
fluorochromes pour déterminer l'ordre des
nucléotides dans les fragments d'ADN.
Plusieurs cycles de SBS sont effectués pour
lire environ 150 nucléotides de chaque
fragment.
4. Analyse des données
Les images numériques générées pendant le
séquençage sont analysées par des logiciels
pour identifier la séquence de nucléotides
dans chaque cluster. Les séquences sont
ensuite alignées pour reconstruire le génome
ou identifier les variants génétiques.