14 a Remic Référentiel en microbiologie médicale cae ea a4/ERIENCE utte contre nfectieuses RT" Vituo™ ID" CPS Elite DEC® CARBA NP DAS BRAHMS. PCT™ TEKS Texe2 Isla 'STANCE’ Référentiel en microbiologie médicale 5** édition 2015 Tome IIRéférentiel en microbiologie médicale TOME I LICENCE D'UTILISATION ET PRECAUTIONS D'USAGE La Socité Frangaise de Mirobclgle décine toute cesponsabils, de quelque nature ete sol pouantrsuitr dune négigence ou dune mauvaise ubisaton de tous prods Instruments, teeniques ou concepts presents dans ce ire. “Tous crits de traduction, adaptation ot de reproduction pr tous procédé résavts pour ous pays. Tole reproduction ou reprbsentaton intarle ou parte, par quelque procade quo co $5 des page pubées dans le present ovrage, fate sane auorsaton de éciteur es che ‘et consttue une conafagen. Seules son alorsbes,¢une pat, es reproductions stitement Teervées&Tusago priv du copie at on destinges une ulation olactve et aie pat los coures chao jusées parla carctere slentiique ou dintamation de ooere Gans laquelle eles sont incrpores(Loidu 1 mars 167, ate 0 et et Coda Penal, are 425. es photocopies payantes peuvent dre réalsées avec accord do éstaur. Sacresser au (Gente tangas deqlotsten du dot de eepi-CFC. 20 rue des Grands Augustine T5006 ana Te" 0144 074770. (© Sect Francaise de Microbiologie La Loidu 1 mars 1857 nts es copies ouroproduction destinges&uneullestion cotectve, Toute représeniton ou reproducionintgrale ou partel fate par quelque procéde que ce Sok sans le consontment do autour ou ss ays cro, eat ice et constve une conbefagon sanctonnée parle aries 425 et sulvants di Code Penal ISBN Socits Francaise de Microbiologie :978-2-87805-032-5 ‘Toute rtéronce & un chp du Rétérentil en micrebclogie méccale se mentionne de la {acon suvata Soci Frangase de Mlceboiogie “Tire cu chaptv. in: REMIC : Soc Francaise de Moblog Ed! 2015: p XXX ana eaten Brenanm SRE itera on toe moa Las éaion du RE paresioiogio, mycale Gémarche nouvelle laumende médical Ce tava amblieux secteur (desis tone dans leur dom toutaulong eager Le premier ome tas ‘alee es dagnost ‘ames aux antnfos Le socond tome eat ot parastos, Cette now dalton loons et parastes, Parastaioge et dele Comme pour es és can confi insta ‘rage, de agen cor La Socits Frangise ‘aes qui ont permis Le Comts Ector Médicale quotione | ‘ows. Los Yemarquoe alt dla Sous FrE lo qustque nate fae ous prot, reservspourtous eet dattrepar, Me Fosue dans Pal arte 425. ur. Sackessr au “Augustin, 75008, ‘tsaton calactve, roakdé que co sot rene contetagon 2s 2 mentionne des 5 prec. NOTE AUX LECTEURS La 5 éelon du REMIC avoulurassombler los principales notions de bactircogie, vlog, axasitologie, mycologi et hygiéno ues la prague médicale. C'est doe intaon une ‘Sémarche nouvelle, vers Tnicté des preblématiques cu mende des agen fecieux posbos ‘sv monde medical Ele dove s'améhorer encore dans les hres eons (ce aval ambitoux so traduit par deux volumes, 114 chapites ot 856 pages. Les auteurs rdactous (esgnés par) ot rotectars, au nombre de 200, sont cans po lou oompe- {ence dane leur domaine. Le Comte Esto! ls remeriachaleureusement pout our aval tout au ong de la genése cece reterentol Le premier tome rata de sujatsgénéraux an microbiolgl, del gisation on bologio med ‘ao et dos diagnostics mcrobicogques, dea sensbats et de a resistance des mere Oe rismes aux ant infectioux des contrast la prvention Le socond tome est ais aux microorganisms spéctiqus : bates, vis, chempignons st parastes, Cotte nouvelle dion romplace deco ft ton de 2010 et aussie REVIR, Pour ls cham- pianons et parasites, ces chaps ont et fas avec le souten de la Soo8té Franqase de Prastoogle el dela Sood Prangaiv de Mycoiogie Mécale, Comme pou es tions précentzs, les membres du Cont do! décarantravor au in confit inlets crectssusceptbies de porter alate aux données pubes dans cot ‘ourage, de fagonconforme aux cbecis de la Soca Francaise de Microbiologie La Soot Frangalse de Microbiologie remerio les indies pour lure ingens comme Clos gu ont permis de rere le coat Je production de ces deuxlives, Le Comis Ector sounate que ls informations de oo rrr! soln ules la pratique médicale quatiione des merobioogites et tn souten pour accretion lure abo {otes. Les remarques oes suggestions ¢amdoraton son ls lonvenuea euprés du sec. Iarat dela Seats Francaise de Ncrobloge, ion codiiomont. “Thomas Bout René Courea ean-tovss Hermann autenes Laced Brite Lamy Patio Laudat Béatres Pangon Helene Piguo-atouseAUTEURS. Te Fringe catZio, Quelle mi GENERALITES 1 2 Les taper de microbe Place de ricrobilo Notens cen mierobh ‘Stat vase Séroogi: Recher sane le it Recherche dane ls ir Le Manag. Conte Automat: charges? LésisLaTion 2. 38 bailar Larectere es perso, piacnosrics 14 18, 16. ctr hermaclts Endocar Dispose (caster,‘SOMMAIRE TOME | 2. Que mloclop 2015-1117. ete syste raven owe is cevenauires 1. Les étapes de anal ae aa Len aps dere 5. 1 bens torcho gunenaten Porters emits) 2 Pace delicate en ‘18 Saran 2520. Infections broncho-pulmonaites 2. Noone itil mbar irocore 1 cn mcene = Ht coeur s 4 Specromve de masa on 22. iectors pasate usm ioe ee wr 4. Stroog ifcions becomes 2. oto ogi ot Secs ss Sioa rae 20 0. Stniogeethveiow an 61 24. Claman meio ue spree 7. Recherche d'anticorps et d'antigénes ee Sees cea oe reer 8 0. Rechte anima et fatgies 78.‘ ccs a Sarees rectors fongasn- 78.27 iets ones ea pea et os 9. Le Management de la qualité. at Phanves. 288 cane 2 Lesonset spars crndee %. Sate . amar dorigine bactérienne. an 29, Cottons coos tae snes 7. (dont liquides de drain et disiyse rrosemes al aero (ont = = 10s 20. tecion one coe LEGISLATION EN BIOLOGIE MEDICALE 285 12. Législation en biologie médicale...113 51. Le pled diabétique infects = vmecetriesenader 3. Meco ralone‘eis st 18. Lavedrce cig ela pret sera son souporwnnes coe iit ‘mh lepwdba, 313 Marble do pronddreee Dimcnosricsmenosiotociques —‘Mubilajedenounadanie 1M. Bact fongtnis- bere top SENSIWITE eTREsIsTANCE bes mono-onoansies 18, Enoain 0 AiKouenrconein 18. Depots reemnctee 25. ates de tomiraten dla (caeterchaore mana. 145 °° Senin ox anos 2720. Mined cearnaton Gola 48, ets gto os sng te Sacro secon Sactenmmere ass Season ra Bn cronion ‘37. Méthodes de détermination de la 44, Mesures dihygitne, de sécurité et de 7 ‘sensibilté aux antifongiques. 341 _s0reté biclogiques au laboratoire .. 385, 7. Perea 28, Métnedologle pourla urvellanee de 45, (Micrbiologe de fnvronnement TANG eset orem seman ras rr, ba cara Sitowtnedoa ser Menara Oe Magy ee cowrnbus eT Preven 4. Gone miata 2. Vance 2a Pnbmanmdacnumproaine a7, ceavucareeipue aia £3. viweem Recherche de bactéries. ‘materel, si aa ant 84, Virus de bers an ——= Came melons wnat 40. Dépistage du portage de prélévements post mortem. 415 = = sem 49. Les maladies & déclaration obligatoire: » 1. Gnmeatendon doen donee,“ mis secu am 7, vinden Seimastas oases sourieae on vp $0. Vales entaes- Rc een gt 42, Samenmiebidogav des rats Soave Shs oLOssane oa Rea, rato. SOMMAIRE Sree TOME Il em WwcRO-OROANMES PECHIOUES- 65 Litre monn nn 827 onesies eee (66, Neisserie gonorrhoeae. 533 95. Papillomay Sh anaerobes 451 G7, Neiesora meningitis a9 98. Poa ee 457 69, yoobectorum boreal et sures 97. Viueaert 59. Boda soy oan as ma SA Barta bey seas. 88 68. jaune, 7 oe, Rares 55. oreatons 17. 70, Petuaentbces ppien oo uma 5. Camere, eg coeeoe ame ttn Fest Cuno ‘aT. Teponne pk, & oe 8. Coane te {2972 Teghenme wl sas ee eee apes cates =e ecaesaen 60. Francia terenas. 602 wICRO-ORGANISMES SPECIFIQUES - ae 1 Hamophti nueene 507 RUS 1, Ape Hacer pt i174. Alot AY) sor 404 conan $8. tome, S575. Veep pe VI ttm. copece Bh. tapas 52576. Venez VZV 607 ‘te Domaau sang stow ‘379 ‘bout ot do orate, 985 cnnement ri (eau, a, ‘a7 ves des aude ee AO? edulat an vedes vn AAS tion obiatire obilogiste. 421 Roe du . ser 533 539 ssl et aves 585 559 apparertées 800.) oon 587 78 es U6) SON ‘oirtaues - 97 HSV)... 601 Ween 607 1. 78. 78. oo. 1 2. 6. . 65. 28. fr. 8. 0. 0. *1 v2, 93. 9. os. 6. wr. 99. 99. ‘Gytmégnoves (CMV). ews Epstein-Barr (EBV). Herpesvius humans 6,7 et 8 (HEV, HHT, HH, Eniéroviu Parechovius ‘ies e Mépatte HAY) ‘ies de Matte (HEV). ‘ius de atte B (HBV). ‘us de tépatte Dota (HOV) ius de hatte © (HCV), ‘Vue de lap. ‘Autos vius spats reions. Rouge Rubio Exytvoves 818 Retains ‘Autres vius dos gaste-entéres Papillomavirus humaine (HPV) Polyoavies BV ot ICV. on 619 625 629 635 697 est est 65s, 66a 689 679 91 683, 689) 6a 609 708 m ‘Ves de inmunodéfience Humaine cay Retroveus HTLV Larage et = Lyssavius. 100, Fibres hémoragiqus viaos 101. rbovroses 715; 79 m8 mat 753 MICRO-ORGANISMES SPECIFIQUES - CCHAMPIGNONS 102. Proumoeystose, 103. Aspergioses 106, Condose 105. Cryptococcose 108. Dermatophyoses. 159 783 769 mm 7a MICRO-ORGANISMES SPECIFIQUES - PARASITES. 107, Barone ra 108. Gate, 798 109. Lolhmanises. 129 ‘10, Plume, 0 ‘11, Toxoplasmose, en ANNEXES 112, Conduits @ ton au labratore ‘de miconatogie en cas de isque Dioteronste et de pathogenes, Smergeni. 113. Réglos ombaliage ot de ranspert ‘See matiree biloigues 299 114. Medals de conservation des souches, sums et échariilons Diologiues 4s GLOSSAIREAnaérobie: Elisabeth Nagy” 1. CONTE: Los, boctries = Impliquées dane infecton bac Ge Torgansme {9 coe maroon Infesione'& Clos Source exogtne. Infotions enaert baclres snadret lager 8 stv, Les connaisany snasrobioe sits Intectons ¢0 sont ‘omieres anes, ‘ovale net past 1 cs dinfoton lieu fatoure Santbioiques ee ‘snobobies sicte Ie awroe de cose le co0t cunt Purine on ‘monvent une ugh fos anaerobes at Unnombrecroisa lorsque sone Clrt to car des ties, par exer ‘suru le bacile Gram négat me les groupes bact genre Boctoroises scles enaérobe: a ble. Malye enane compen IPs important & es bactries are ‘mieux connateChapitre I Anaérobies Eisabetn Nagy" 4. CONTEXTE Les bactriee anaérobles peuvent te implquees dans wimperte quel ype ‘infection bactiense. La fore endegdne. 4 Torganisme est fo principal reseNor 4 cos meroorganismes mais certaines Infections 3 Clostxtum peuvent avor une Source exogéne. Le spose de giauts dos Infecionsenatrobies Impaquant lal des bactées anaérebies et serobies vane de igor 8 svi, Los" connaissances aur los bactries ‘naérobis ste at lure ies done las intectons se sont beaucoup ameliores cos omieres antes. Pour aunt a ondance lsctolarestpas on faveurdelout recherche fn cae dinfecton, fit Tinfuonce de Plusiours facteurs, comme ln prescrpon Gantblouques ves efteacos sur ls actos Snaérobies sites lore dinfectone mie, ln dre do eoisanee de eas bacteres, of le codt dune tte recherche Purtant. les onnées lee lus sécentes ‘montent une augmoriaton dla résistance foe anabrbies aux antbiotques nraiant Uinnombrecroieant cece harapeutguss lersq'llo sont rats oo fagon among, Cat te cas des infections & Cosisum siete, par exer. 1.4,__ Evolution de a taxonomie, ‘Aucoursecesvingtdemiérsarnéosetavec Favénement cu sequengage, la taxonomio des bacteres anaérebies a beaucoup vl td nouveaux genes st expoces ont te ‘crt Cate dvaluton taxonamgue touche Suraut le baciles a coce! snared, & Gram négatt, méme s lea concomeé tous Tes. groupes bactérons. Par exemple, Io {gone Bactoroes ne comprond plus que dos Iacilos anadrobes & Gram nega resistant Ala ble. Mal oxte6veluton rapide et une ‘ertaine “complaseation au en découl, Tee Important da connate fe taxonome flee boctries enaérobis ces tn de ‘mew connate lee sesocatone pahoogi cto ins partipe Faméloation dy agrostemierbiologgue, 1.2. importance des bactérlesanaéro- bles dans le lores normates les bectres snaérobles ont une composarto majeure des microfores es dent dans de. nombroux ses ‘anatomiques, 00 eles sont pls nombres. (que les bactéresasrobes, avec un rato de ‘vt & 1000071 Tableau). Les trois principaux sites colonisés par les actos anasobie srctes sont la sphére buccale, le tacus dgesif ot Ia. sphere vaginal. La campostion de la fore varie do mane sgnfcaive colon les sites nator 2. ROLE DES BACTERIES ANAEROBIES DANS LES PROCESSUS INFECTIEUX Bion quo le nombre despices anaérobies présentes dans les foros sot dlove, pou ene les sont impiqubes dans les Infections numaines, Os nombreux agents pathogénes araéreies appartennent aut More endogénes du patient et so compertont en opportunites dans un contexte aver ‘Tres pou de syndromes sont dus & es bactées anaérobios exopenes. Cesta cas des infections & Costcum, par exer les actos anaérobies sont souvent responsabes dinfocione mes, Oans co as [a spoce de grave va de ger 8 es ‘grave (Tableau I). Un portage asymptematique de Costin ici exste cher home et animal, mais responsable de pathologies ‘lent dune dard & le cite. pseude-membraneuse.sévére Pour pus détais, 86 reporter au chapite sc, ani2015 omnes“leat, eqns clone ebecve antroto a hea Gee antes Tabeas infc oo a at oa ee a Tess tampon - cm : 3 [Peptococcus | + + 2 Peers : : g : peers : 5 : a : : : Bete rac ; ; : \Seeramas : : : seo : : [merce 7 3 : i : 5 eet mac? : 7 : 3. RESIS) eames 5 3 : ANTIBI be pal kt seseice : ° a tec aneh ce é : é ‘comague — tren, eu = SS poe rronobecana i Pan ern cou do fo pened Gos ager femora Donita coeur ‘cos tao ton covet fr estan Soctonert Te ttre ag ta Ont mestes anatomiques ‘etn ai een) las “Tableau Infections impiquant réquemment des bacériesanabrobies, RESISTANCE AUX ANTIBIOTIQUES De par leur métaboime respirator, Jes haces anaérebles ont une reasiance Intinséque & de. nombreux antiques: ‘uinlonos et froquiolanes, DDepusle début des années 1870, ncbsore to augmentation constant dea rsistanca de ces bacties a der antbiciques que Fon eroyat toujours effeaces, souls ou fon association. Les bactéos anaérbies acuollment os plus resistant sont Bactorldes rags elles espaces assoclees CCopendent, des resistances émergent également chez les cooe anadrbies 8 (Gram post et chez los bases anabrobios sporués qi élalent auparavantconsdr6s ‘comme rs senses aux antbiovques ant anaérobies. Deco fa, les antbichirapies “mpinquos sont amendos &évoluer. Use combinaitens ta actamines nour botalocamases, les carbapendmes, le. méteidazole, la tebcycine et les Muorequnalones de quateme generation ont consis comme les antbiotguss Tes pus efleaces. Cependant, es roseeux do durellance natonaux et iiematoneux ‘montent une augmentation dea reaistanes 1% des souches de Bacteroides. sont rsitantes aux carbapénimes ot les souches de Boctorides spp. ot do cood 8 Gram post présoriant dos resistances au ania0s nme a5‘maondazole, Ent, en dépt de phsiours fees therapeutques, las soucnes do C. tise sont toujours senses fo vito & la ‘aneomyelne et au métonidazle, Ui ealotaoe dee baci anaérobies aux anubiotques peut passer inaperqe, du fat ue: Te taste valuation de ls sensibité ‘aux anibiosques sont rarament mis fen cauvre an releon do. containes Techniques et de cot. + de nomtreuees Infections sont mists ft ‘sont eftescement tates pat Sebriderent ou erainage + Totes dos anibiotques vis-.vis fle Boctvies arias qui sont co. Imeuqutes dane le procossusifoctoux st eta général cu paint pouvent de mane slgnfcaive ot faverablomont Inuer sur eu do infocion + Unéenantiloninadoquat dos constions Pré-anaiiques —napproprées, des Iéthodes¢isentfeaton et vation ela sents longues ot fastiieuses lImfent a detection de Témergence de bactresanaérobies resistant, 4, PRELEVEMENT ET TRANSPORT DES. ECHANTILLONS De i qua u prétévement dépend la bon Isolement dea bactées anagrobies & part ‘fun échanilon mono ou pluimrebion [Céchantiion date pret do la Pore norma saprophy. Un contenant adapte our la rocnerehe et preservation dos bactéies anaérobies “dat Gre utlisé Caspr, le curetage des tissus profonds tls bopsostssulaes sontrocommandes. ls tenentlone sent souvent en potes Aquanitée et dlvent ete, to cas échéant, royds avant leur examen, mieoscopiqe ft Tour moe en cutie. Lee chanions ‘culls aur seoillon sont déconsasés tt dowvant tie ites & doe crconstancos eéelses (gor, par exemple) ‘+ En cas do susie chronique ou ote vonique, le prslevement dot oto ffecud au moyen dune fine agutle Par vie endascoique + Leg" prstevements des voles rospiatores infriowes (abobs, par ‘xempla) sont rales por froscape ‘sate rotate. + Lee pelaverents soue-gingivaux ou canalaes pouvert Be recuoais avec os pontos do papior, tansporés en ‘aosphereanasrebie + Pour la recherche de Clie, 22 referer au chepite dedi Le transport dos échantlons avec recherche de sactnies anaoreies no dot pas ete ‘ere. Toutes les apes do Fanayse dowvent se fate en stmosohire anaérobie, 5. DIAGNOSTIC DES. INFECTIONS ANAEROBIES ‘54. Examene macroscopique st ~__mleroscopique {examen macroscopique do réchantton peutrovleruneforteodeureteresutantce [a précenco facies gras voates, amines t'dHS par exemple. Co type dodeur fet bpiquoment on faveur de. bactares ‘snstrabies. Une fuorescence rouge bigue fivble 1a presence de” Porphyramaras (ou de Provotla pigmentées. Des tstus Inéerouques nore signent is présence de bacles a Gram nbgatt pigments, A nor pal la presence do granules do sulires. Grice & ta coloration de. Gram, Texamen microscpique rovelo la richesse de chantlon en bactéres (sbondance ot ivorsté do. morphotypes.bactérens). I Ssuggere las miloux spciaux @ use. Tout feat enire Tes morphologies visulsees 8 Texamen micscoprue ot ls colonies ‘blondes en cule dott mie en cause Ia ‘qualé du préiverent, de son transport dos ‘luxe culture isoudelanabrbiose Dane quelques eas, examen mcrscopiqus mat €0 fare lo diagnostic. Crest, par ‘example, leas pour la vaginas bacirianne Remarques "Le les doivent tro soigneusement bide avant protvemont orci anie2015 00 Fon vsuatse 1 ft 668 nomex: (Goreporer auch aspect ora post ost en fx Propionbacterin Ls presence de dee ecremtis éehanilon est perngens. 52. Cultures Pour la plupart recommandé ou fon select ck ‘cationnée des: (10%) et deviant Les autres iow * une gélose poles bactoes 4 ‘Bopha + une eos: kanamyeine de mouton Provotela¢ boctles 8G + une gbose inhibee ts facatatt oti contains Ce Les boutons do au moins 14 Dactires.anaée rials (0 dat eat que Incubations sie ‘natrobi, En & ‘de sacs avec 48h dicubator Texposton a fa rmoin 6620 in ot ire conte“enique ou cette ment dot ots ‘une fre aiule ‘es (bets, par par fescone ous-ingvaux ou re rooms avec f transports en > 6. aie, se 4 avec recherche te dot pas ore ‘yee doivnt so be. ‘es NAEROBIES »oplque ot ‘se échanion ete resutant de lates, arines 22 ype dodeur UF do bactcos ee rouge brique Porphyomanes ‘ios. Des tats Ia présence de ments, A noter tiesto wsutire. ‘Gram, Texamen 1 ticbesse de (abondance et 5 action). luca wile Tout ‘ges wsuaodes ot les colonies tte en cause la son ranepor, dos ‘de annerebioee. sr mcroscopiaue fost. Cost, par nose bate 10 Fon visuals la présence de clue calles ot des nombresx morphotypes bactriens (ee poner au chap deci). aspect dramifcaton des baci Gram posit est en favour de Actinomyces 890. Propionbacterum spp. ov BiSéobacterium 9. a présence de bales a Gram posit avec es xromtés carées sans spores dans Fchantlon est en faveur de” Clostrum perengens. 52. Cumuros Pour la plupart des échantions, I est recommandé Sutiser un meu de cure non. slecif de type gélose Brucsta ‘cdtlonnée de sang de cheval ou de mouton (0% edo vain K, Les ates mile 8 ensemencer chert une geese. Bacteroides be-esculne pour la recherche séecive dos bactries du groupe Bacteroides ot Blophie + une gBiose avec une association anamyeine-vancomycin avec du sang ‘fe mouton qué pour la recherche de Prevoela pigment ou on et autres baciles & Gram négati; ‘+ une gilose phénylthy! alcool pour Inhber les bacttres & Gram négatt fecubati tiniber et ¢talement do certains Clostilum, Les boullons doivent dre incubés pendant ‘au moins 14 jours pour la recherche 6 Decree. anaérobies dane lee infections ‘aricalates (se reporter au chapre de). Lidal est que toutes les manipuatins et Incubations lent realisées en chambre ‘natrobie, En cas ullstion de ares ou e sacs avec ginkrateur anabrobiose, ‘couxei ne dewaint pas dre owers avant ‘48h dincubaten. Avec es type de metre, exposition & a des cures dot ee de moins de 20min. La. qualité de Fanarobiose ol eve conte 2u moyen indicators. ‘53. entiation des bactves anosrobies ‘Une étape imperante esl reconnaissance des dférnts,morphotypes de colores, ‘Cite reconnaissance se fat avec une loupe (0 avec un stéréomicrosope. Ans 368 colonies qu semble sma & nl sont ‘ironies & la foupe Docu. Toutes Jes clones ont icentfées, rélelees ur ols gloses qu serontincubses sous ‘naérobiose, CO, et amosphére normale De mame, les colonies benetcient dune coloration de Gram si ideneaon repens surces méthodes saseques. dentition des bactares anséroles repose sol sur des mathodes clasiques, SOI sur ln specvemetie de masse 36 ype MALOL-TOR. La méthode dassiqe comprend Iuiisation Ge 3 daques dantnctques : kanamycine, Vvancomyeine, colstie.” Cote orentaon brésompive est comple part recherche ela mobi a croissance en présence un ‘isque a 20% do il, a reduction inl, Isrechersbe dune ostlaes, dune urease et dune nite reductase, Cats Wentoaton Deut dre avanageusement remplacto par es glories identcaton miniatures Deputs pus de cing ans, a spectrométre do masse MALDL-TOF permet une is bonne ‘cena des bactrias anaéobies Ee ‘2 Tavantage de reide, préise ot pou ‘oateuse, homie achat de Fapparei. En cas. dideifcaton doutouse, lest possibio de recourrau séquangage du gine Se TARN 165, 54. __ Teste do senate Les teste de senate doivent ae ‘fectuts pour les actiies anaérbies ‘inquement importantes Is dent sue lee recommandatons du CASFMEUCAST (se opoter au chapire ci) 55. Autres teats Les tosis séroiogiques riont pas dinést Pur le dlagnoste dune infecton & C. tice, so reporter au chapive desi. om 036 crates 810. 1", BIBLIOGRAPHIE 1. 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Anaerobic nfctions; Udo fan Weatmentcoriderations drugs 2010.70 841858. 6 crates amieot8 Nagy E. Matix-assistd laser desorp- {ionization tme-oF-igt mass spec \rometry : 2 new possibly forthe Ke testo and typing of ansarobic bacte- fa. Future Motel 2014. 9: 217-283, Nagy E, Maier T, Utan E, Toros G, Kestrzowa M. SpocesIdeifcaton of lca isolates of Bactrodes by ma Invcassisied laser desorptononization limectight mass, specromety. Cin Merobil inject 209, 1706-802, YVeloo AC, Elgrsma PE, Fedrch AW, Nagy E, van Winksine Al. Tho in- ‘uence of incubation time, sample re paraon and exposure to oxygen on the ‘ually of he MALDI-TOF IS spectrum ‘Stanaerobe bacteria. Cin Midi In {ect 20%4, 20: 1098-1097. Versalove J Eocene: Manual of Cina! Microbiology 10h elton. 211 ‘lum Secton I Anaerobic bacteria. Chapors 47-51 Bartonella s Guillaume Avot? BonottJevinae 4. CONTEX: EPIDEMK CLINIQUI Les Bartoneta eon es hamates, capa es calles thors Pim 6s rent a, plseuss powe Larecherche de Ba fucoure dela mala Ionia) ot es: ctvoniques (2. ¢ endocadte & he ‘unten 8 hence! Palement, de act fans domo xe ‘wanchéos (8. aun ie au cous de tana, 8 hensslse)« ‘cours de atecon omic ha, par © Ge risque pour in ‘eontactavecies ch poneable deiner 8, bactfoems, fe action, ost res ri avec hémolys onda la pas Wi une phase pt eutandes rouge pperuna) : cate « ‘istrbuion are ee aa présence cat rion.Chapitre ‘od asor decor ight mass spec. ably or he or fanaerbie bacte= mie. 9 217-238, ‘an E, Tos G, 2 onteaton of seteroides by mae Seeplonionzaton ‘pectomety. Cin “8: 700-03, PE, Frieden A, sho ALT in ‘im, same re- ss tooxygonon the TOF ME specrum ‘la Mire In {oar rohit Manual of {exon 2011 \naerebebaceri. Bartonella spp. ‘uilloume Arlt” BnoftJauthae 4. CONTEXTES EPIDEMIOLOGIQUE ET CLINIQUE Los Bartonella sont des baci parasites es hémates, capable dese mutipter dens dos cols ethers de calles Par les derentes espéces de Baronet. 1a, plusieurs peuvent infctertHomme dont B olzabothee, 6. grahami, . hensele, 8 oetiorae, 6. quitana, B vaso, B. was: hoonsis. Larectercne de Bartonella spp estetectute ‘aucours dela maladie des gifs du chat (8 Inonsela) ot de syndromes gangionnaies tvoniques (8. quitana_princpaiement, ‘endocardte & hémocultires négatves (6 ‘uitene, & henselae, 8 elzabathae, pine plement), do bactiomie chez les patents ‘sans domioe ie (8. quitan) de eve dos ranchées (6. quinans). anglomatose be cla au course nfecton & HV, (Buin ‘ang, 8. henslse ote pose Népatique au cours de infection & HIV (8. honsla). Lalenotame chronique et fabsence thy. (Gene vostimenia (chez les patents sans omic a, par exemple) sont des facteurs ‘de rique pur infection & 8. quintana. Le ‘contact ave les chats ot urs puces ext roe ponsabledetnfcton 2B. hensoae. boclforms,Tespbce type do co gene bactéron, est responsable une septc’- ime avec hémolyse (have dOreya) cores: pondant la phase dinvasion ague ot su- Wine phase plus laterte avec tumeurs utanéos rougedires ot fables (vores peruana) ; ete espece pathogene a une ‘Satrbuon géographique mite aux Andes, Sib la présence d'un vecsourspécaue de cate gion, PRELEVEMENTS: MICROBIOLOGIQUES Les échatilons fs plus adeptés au de gosto de eo infections sont "un peloveront co sang sans ances fgulant pour sérlogie suit dun deu Sem preivement& quize jours dn {ecvale minimon + un petlaverent sang avec antcos ‘ulant(haprine-EDTA) pour culture +n peteveront do sang avec antes ‘ula (EDTA) pour la Bolagi molecu tre. Les biopsies (peau) ots prevents ‘esas (ves natvos, prothases vat lees, prothtees vasculaes) son ecuels dane un flacon side, Los biopsies cut es powentéte prélovées avoc Un « pu atblonsy» de 8mm 3. TRANSPORT DES. ECHANTILLONS Les ehantilons dostings & a culture sont congelés& - 80°C et rancpoiés en carbo (ace. Les aures échantlons sont anspor {son 24a 46h atempscature aban. Los ‘chanilons pour recherche par arpifoaton ‘génique peuvent sre Tals cu congeles, & eft, dos coupes paratinges peuvent és ‘lsbes 4. EXAMENS BACTERIOLOGIQUES. Sérologie ee La séroogia est a méthode Ia plus utlsse ‘on route. Limmureuorescence inte ‘eta méthode de rtéconce carla sonst {ta spéifcé ost moins bonne on ELISA Des anigénes sempurits de Banal 9p. oblenus parti de clue cota sont is. La sérciog permet de connate les tives digG et dial one2038 crates 87Un tre cigG # 64 est signal; un te (ige > 800 a une valeur pecctve post tive do 80% pour une endocardt I existe une variaton danigénicté de 8. henseise Selon les ouch, Lexistnos de ractons fantigéniquee crosdes ost responsable dun ‘manque’ de spécifcto, notanmment avec Cone etChiamyal, de caranes roussos commorsals, 42. Immune-détection Limmune-détecton do Bartonella spp. est possi sur prlevament tissue fais Ou fue tines: Bopsieeutane ou valve car dave. Linmune-detecton repose sur Tu Seaton danteorps monoconaux ot su dos tochiques dinmuno-Ruorescence ou d= smune-porexydase. 43, mettre, Lisolement per ulus ee pratique wu géose ‘au sang clincubée pendant 4 semaines au moins sous 5% de CO, La chage bacté- fonne est plus eevee chez les pints i= rmunodéprmes. Liselement d Bafonaa sop dans un pre ‘erent toyours une signcaton pathol ‘ie chee rhomne 44... Mentieation En pratique, co sont es outs 6 biloge mo- lectare ql apprtantidntoaton de cort- tude onde sur Famplifeaton genius sive ‘dune anaiyso dos données de sdquengage. a 5. Amplifeation génique... Cet une méthode ciagnostque ue quand fle est applaube & des ganglion, des ag- rmonts de tissu ou de pus. Pusieus cles 4, ouvert re bliss *gbnos giA du gine ‘rev dola séquonce nar genique 165-235. 6. 58 cnn ameaois BIBLIOGRAPHIE Revues 1 “Chery NA, Binz PP, Mago! RG, Hum mmol JB, Haro EM, Bobvend EN, zane E, Dsranonsca TC, Cadena MB, Broischwerd EB, folation of mo- lecular dtecton of Barone hnsslas ‘and Bartonoliavinson bap. bert ‘rom dogs with klepatic cavitary oft- ‘ons. J Velo Med 2008. 23 185- {0 upon M, Savin De Larlause Ad, Brougui P, Drancourt D, Raoult D, De Mascara A, Lacut J. Evaluation of se ‘ological reponse to Bartonella henso- (ae, Batenela quntana and Afi fl antigens in 68 patients wih suspected Catecrtch dase, Scand J Infect Dis {996.28 361-368. Fourie PE, Naina JL, Raoult. Value of miciimmunotuorescence for agnosis and folow-up of Bartonata fendocarais Clin Diagh Lab immune 2002, 9: 796.801 Houpian P, Ratt. 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On ne ison power pe ‘ranemiston 2 OBJEC obec princna tedune coqueat ravertussis rs Fach ot retart (Chez ts sower fants non ou nee episode Je Tous, ‘seodie @ une ‘agnostic dota ¢ (Chaz le enfanis 0 cna amas heBordetella spp. ‘Nicole Guiso™ 4. CONTEXTE Le gene Bordetola comprend 9 espéces ‘ont Bordetla pertussis et Bordetella pa Tapert sot responsable de a coque- Iuehe chez Momme. Ces deux especes ent adaplaes @ homme car sles sont fies 0 Bordetella brorchiseptia. patho- fine de Tsnimal, responsable dinfectons rospraters cne2 le patent immunedeprine. 8. bronhisopes et Bartels holmes la tirence de 6 pertussis et 8. parapetus- ‘35, peuvent re responssbles de baci Ines ches Thome. Ui tenamission de 6. perussle et 8. pa rapertusis est stictementitrhurmaine et fat par abrsol lors de a tux chez une personne infecie. Linfcton due & B. per tsi put Br és sere, surtout chez Tos novrasons de moins de 8 mois etl per- Sonnes fagis6es (lemme encase, per- onnes Agbes),Confairement& ce qui alt ‘beer avant voducion de la vaccne ton In coqueluche rest plus une madam fant, Pomme peut te ints & imports quale. 8 pees est pus oignée des wis auras ‘spaces. Ele est prnspaiement sage ane Imocutires Je pation asplenques.etou ‘répanooylares. Cependant, ele peut sus ‘re lol ou déecte lors dinfectona res Piratowes, On ne cont on reser, ni'son powor pathogine ni son pow de tranemseon, 2. OBJECTIFS LLobjct principal est de raiser ie cagnos- tedune coquoluche a B. pertussis ou B pe ‘apertussie lore une tux persistant chez Taito et rata. (Chez fos noweaux nts ot les Jeunes en fanls non ou incomplétement vaciné, fut pode de tour, quel que sot sa dus ‘sssocie & une apnée dot fare évoquer I Sagnoste dela coqueluche (Chez les enfants vacinés, les adolescents chaptre BY tes shits, une tox de plus de 7 jours ‘ol enn ia rechorne de cos baci 3. METHODES 24,__Prlavement 3.1.4. Powrfampiietn génaue. Le plevement fe plus spprop est =p ration neso-pharyngée @ Taide dun cathéor fone place au bout dune seringue de 10 ri Le volume de sécréton recall dt ere fe ordre de 500 LLempio de mileu de anspor, de type Aamios avec ou sans chart, interes pos ‘voce resulta ela POR, 2 deat, Temples dun écouvlon sur tige ‘exe eat posable. scowl dot impe- ratvement te en dacon alginate est i Sieur def Taq polymérase) a ige monte fest insérbe dans la nine paiement au palais ot poussée doucement aust an que possible dane lo nasopharynx postu {oir ste 3 CNR), La PCR ost nutes tour paronysique est prévente depuis plus Se toi somainos, 2.4.2. Pourla cue Ls mes échanilons (aspiration, &oifaut ‘Soul sont recuis pura ctr. La culture pout re mise en cowe durant les tos premitros smaines dei tux, mais la proba cTsclorent décro rapidement ‘pre la promire semaine, Sa senile et flovéo chez la reuvoauin (60 8 70%) Ele fest pus fable chez Taccesoent el acute hoz ule cagnostc st eps souvent r= tarde, Ue cituraeat nue la toux paronstique fest prasente depuis plus de tis semaines (8 51 fe patent rexoit uno antbithranie ‘apie depuis ours ou plus. our la recherche par cut, a durée de ‘anspor des échenilons est critque. Un miles de anspor protégeat la baci est focommandé ice tomes dot excécor 2 & ‘empratre embante Letomps de anspor onic 016 crate otne dl pas excéder 4. Ine faut pas Geo "Wlonnerla gorge ou recuali los achat 32. Amplification génique. En raison de sa sensbilté ot doa rapide ‘exbouton, Tampteaton génaque est un ‘iagnoste de cho pour a eoquluche. Oi teres fomats de PCR an temps rl sont ‘ujourthul dsponbes. La POR en temps Feat est plus sana que la culture pour le Gétecion de 8 paussi, 8 parapartisis ot holmes uraut dans le phases aries de nfecton ou aprés une entbohérepie. A Tinta de aout, la sons dof PCR der avoc i credo os. Le plupart des laberatores.utisnt com. mmo bles do la PCR on lomps rol Ios sbquenens dinsertons1S407 et IS00%. La technique fon sur la géteton de 18483 pose des pobiomes en terme de spite ar ole pout dtecterB. hamesi, 8. pare ‘pertussis et B.brontiseptea. De méme, is PCR fondée sur 181001 permet a detation {4 8. porepertese mole pare aussi de brorchiseptcs. Ca sont onc des dagros- tes de presence de Bordetla, lest ¬or {quo ladetocton do Bote a pour Tins- tantjamais 6 observa chez des enfants de moins de 10 ans on France, bien aul ait ‘te dans aos pays Larégion promotes du gine codantiatxine eB. pertusai (pbe-P) ext Une ate cle our une PCR en temps rel spsciique de ‘pertussis. ampliicaon de coi region ost Spbatique canon présena chez 8. paraper tussi et & olmest, mals ae ost vera ls ‘moms sensible qu la POR détoctant 15481 a sensi de Tamplieaton génique est ‘ova pendants 23 promires comainos fe tous 33. Miloux de ctr et factors —leuengant a cular La cule pomet disci ot aidentir agent responeabie mals aussi de. deter miner so sensbilé aux antiques. Des Souenes rsistates aux macrolides ont 6 Ieoles en Chine, une seule en France Lorsque Ios mieux de cuture sont dspo- nies, a echerene de Bordetta spp. st ‘ectube par ensemencement de. mieux ‘contenant 10% 15% de sang de cheval ov {8 moulon (Regen-Lowe = céphalenne 40 aim), Borst Gengou, par exemple). Le ‘ubstluion de la cephalonne par de Foxe line (0,25 pain ou do la meting (25 Haim) pemet a evlssance de B. holmes. Ua conservation de ces mieux west que de ‘semaines Les miloux de cure sont ino bis ju 8 jours a onion 35°. Los foes sont envoyes au Canto National Reference de la coqueluche et ates bor ‘eteloses pour Wena, typage st at Dogremme La sboogle de la coquliche presente di ‘érens neorvdrgnts qui ont conduit & eon ‘bandon une. absence ce tests commerciaux vices + unos mauvaisespéciet-Incapects ‘ateencer ancorpsvaccnaux tan {eos infectoux: + la rocnerche danteomps antperusis sera de plus en pus resins du fat {o faugmonation dol couverture vac- ‘ale. 4, INTERPRETATION La sents de I PCR ost rb bonne chez les nowvoaux nés ts jeunes enfants. Chaz lee adoisoonts ets actos, alle depend i ‘ll entre debut al tou a opel tment ant que de a charge Dacione, {a senso 6 a etur var auvant rage Feta inmun du patient: ele est a pus Serbo cries nouriseone non vaccinés on ‘debut do maladie ot la plus basse chaz es adolosconts ot adutes présertant une tox ‘puis plus de vais semanes. 2 cure et la PCR sont les lagnoses iologiques & prvi. sont tous los deux remboursds Ceauiy a tou de fare on praquolers dune ‘comment, ce qui aval jamais 68 cbserve suspicion do coqulucho est inqué Sansa ‘vant en Europe. Figue 1 2 -crapne 5 ame a0is Figure 1. Dagnost BIBLIOGRAPE 4. Guiso N. Coc enfant ot 2 son SAS, 6 inecteuses, 2 Hegere N. ‘whooping c Ta poruses, ‘301-1403.520g de cheval ou + tphaoxne ($0 par example). La Drie par Foxe Pia mle (25 ce de 8 holes lous rest que de (scutre sont. ‘on 35°C. aU Cento Nationa! the et toe bor. lon, ypage et ent che présente a. ‘ont cond & 200 sts commerciaux ‘eit incapacie oxps ant-penusss > Tesvene du fat ‘a cower vac TION st bs bonne chez Ines enfants. Chez tes, ele dopond du tour tf preeve- rebacteenne. ‘ara suivant ge leet a los ‘is non vaceings on Us basse chez les {eenlant une fou tls agnostics Ts sont tous es pratquelor tune ‘stinlqué dane Figure 1. Dlagnosti Bloque en pratiave oH Points forts © Le dlagnoste bactériolgique de la eagudice repose sur la PCR et a tlre mises en core durante 23 semaines suvant ie début lataux = La senablté de Famplfcaton o& 4 rique est sevée pendant los 2 8 9 promires semaines de oux ~ a séroogie est abandonnée en ra son do son incapacté &distnguer des antcorps vaccnaux de ceux produits 5 lors une ntti, ~ Dans locas dune tux de pus de 3 maines, fo diagnostic sora lit & coluds cas eocandaves, BIBLIOGRAPHIE 41. GuitoN. Coqueluce du nourssen, de enfant dead. n- lsevir Mis ‘200 SAS, 6, ENC, Pécatiealdies infecteuses, 2014 2. Hegerio N, Guiso N. Epidemiology of ‘whooping cough & typing of Borde Ta ports. Fue Nécrobiol 2013. 8 ‘tt403, Hegerie N. et Guiso N. Bordetella Dpetussis and pertacondefcnt cl fea Isolates : lessons for pertussis vaccinos. Expert Review of Vaccines 2014, pnwmw.ncm nh goss pubmed24058187 {Guso N and Hogere N. Other Borde {olin lessons for nd from porussis ‘vaccines. Expert Review of Vaccines 20%4, tp nbinin ih gow ‘oned26034059 (Guiso N. Pertussis vacclnton ond whecphg cough. And now what? Expert Review of Vaccines 2014, hpi, ‘enim nh. gowpubmed25020131 Riemann Mt, Wsing von Konig CH, (Car V, Guiso N. Nucleic Aci aro caton fasts for ciagnosis of Bordeteta Infections. J Cin Mico! 2005. 43 4025-4029, Ande , Cao V, Namkpo €, Wendel boo AN, Van Fie A. Guiso N: Compa ison of seriogial ad rea:tme POR assays to dagnose Bordetella parussis infection in 2007. 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En Europe les pi ‘Spalos espéces pahogéres peur Thome SontB. azll 8. bavaronas, 6, burgdor Ssenau stricto (ss). B. gar et B. spleinan tanais qvaux Etats-Unis, la souo ospéce pathogbne est B.burgdover ss. Tres autres pbcas, bisa, 8 staniae and B. va- lasana, ont 616 rapportes comme patho- (genes, copandat, os données sont ctl Femenianeedotques et our valeur pathogé- que est encore iscatde Us" tranemiesion de oss proche & "Homme 56 produ par paar ¢artropode hamatophage, [aque cure du gene odes, Inodes neras on Europe ocidntao. La ré- Parton gsogrphique da cai Infection ast Sins superpsatie cate de ses vecteurs (Coe demiescolnisent néoessarement deo otopes hunsées ce qu condone teu fone scleonnare et leur eaten go (raphique ls sont absents des Botopes roy Sees comme le pourtour médteranéen ans (que des zones data aurdessus do 1 500 Iaves, rious, vecteur de le boross fe Lyne en Europe, présenie une dsb ton geographique qu send du Nora vers te Sus ene es lthudes 65 °N (Iande) et 29H (gud de tal), ans qu'en Alique du Nord (Tui, Algée, Maoe) et de TOvest vers TEst de Europe depuis Te Portugal Jusau'en Russe Eni le abut du cirps tt in de Fa tome, lestiques effectuent un repas eanguin neessaire a eur veloppement pendant ie ‘quel elles peuvent acnubri les bactres & urge, ec tous ts states de tur ‘eveloppement lave, nymphe ou acute, La Uansmission vans-ovarenne est excapin- nel. Le reserva est pingpalement const {us parts pots mamafres, les Oe, lee conve En Europe, fncdonce de la bordliose de [jme augments globalement selon un ra ‘ont Sud Nord ot Ouest Ext. Ele et max ‘male dans Es do Europe en Sioveni, plus 446220 cas pour 100 000 habia. Eo ost ‘galemontdlovbo aux Pays Bas, Suisse et ‘Ati (> 100 eas pour 100 000 aban) {inccence en Alemagne et en Repubiue “Teneque atin enon 40 eas pour 100.000 hablarts. Ele est plus fable en Espagne, Portugal t Royaume-Unl(de 2810 eas pour 100 000 habits) En France, ls donngos renee montent une inedenes moyenne fe 42 cas pour 100 000 habs. Line ‘dence est sabia do 2009 8 2072, (1 8 eas pour 100 000 hati) En fonction dos régions tangases, inadonce moyen ost ‘arial 184 ons pour 100000 habitants en Umousi, 157 pour 100 000 habants on A soe, 0 en Nord-Pas-de-Calas el en Bout omne. Vincdence augments de Juin & Oo tobre, période dace maximal des tques, ss pie de tron de ge de as ont tenia Set 1Uane etS0 et 7O.ane, Le sexo est procte de 4 ‘ots pg de aus ete pe Ba burpdare a até este en Europe tue sou 5 Gest Sovoppent ure Icon ave oO ot secre 35 signe clique. Cate donnée est imporans & pence an compte pou alsaton et Miterpetaton des resutats sé rologiques En cat infection active, risa naturete dela raise 6vlue en trois phases, locale ‘to, dlsseminge pésace et ave. Le dt moyen de Tepptiton des signs dntecton4 Bort upart sr prbcoe est 628 +10 jours, infection in fale loraiage se vadut dane ps co 90% es cas, par un Ste migrant (EM). I ‘Sagt dune lesion ungue Je pus souvent {cu multiple dane mains de 10% dos cas fen Europa). dvolaion cantuge, centre parla pire do tquo. EM no dot pas dre Confer avec la eacton éyhmateuse l- alo qui appara on quelques houes, due 8 1a pig ete mm pet dure phsiours semaines 3 plusours mois et ain un Ganéte de’ pluseurs zaines de. cent- ‘motes va 'amonder, mime on Fabsance eaten, mais es sprechétes peuvent pesister plus longkemps dans le derme. A e sla, Tanthiotérapi réduit fremont 1 due de Tevluon da TEM, prevent las compaicaton et peut logue e devaloppe- ‘ment dela reponse humoral sf ratemont fat précoce En absence de alten, environ 10% des EM évoluont en Europe vers une infcton ssominge. La phase disséminbe proce 69 infection survant en quolques semaines quelques mo inatoment, les patients fxésentnt une bacteémie Fanstore non ‘etetale, asymplomatque ou pave! symo- tomatque eyndrome pseudorappal modé- 1) a suede aquele peuvent se dve- Topper dverses manifestations slo a loos [eaten tosuiare des speochatos. En Europe, ls manestatons neuroogiquos sont prédominantes_(méningoaieloné- ‘its, prajses facials chez enfant autos manifostatons powvent te obsor- woos: thumatolgiques (mono- ou oigo-ar thls réicvaries dos roses arteulatons) principalement, mais auss cutesy Bhocyome born), cariaques ou oct laes. Des artvaigis dituses peuvent re sbservées rimporte que stade de a male fo les sont alors assecéos acautres ma hitestatons evocatices. loos, os ava (es cuss sont inautiantes pour pose le ‘agnostic de borélese do Lyme. En Tabsenee de tratemant infecton peut ‘evolu vrs ls chaniot ot dos mantel tions tardves neurlogaues cuts acro rata chronique avophiante) ou rhums- ‘ologiques pawent ere ebsorvées, 2. OBJECTIFS I convient de connate stuatonsnéces- ‘tant la relation tate pour confer ne infection .burgdoia Tableau 3. PRELEVEMENTS Les prlbvement réalser sont fonction du sage cinique do la male: ST Au sade inital atime migrant lorsque lain et pique, clgnos- te est purement cingue.Aucun pre ‘vement rest neste pour contre ledlagnoste. En eas de sion atypique, tun ais dermatlogque et souhataio ‘ot uno rechorche draco par PCR ou par cuture sur biopsle cutange pout tire realicee + Aursade dséming, les prléverents ot anaiyoos realise vant en fone: ton des sgnes cinaves, © Newroborrlses = priivemonts do ‘sérum (600 Lau minimum) ou wn {ube sec de sang (9 m.) et de LCR (600 pL a 1 mL) protoves to méme Jour et ransporés on 24 a 48 h 3 ti temperate ent + 2 et °C, pour une sérogie spéctique ft recherche st Besoin dune sy these invainéeale fantcors spo ‘iques. En eas do noureborloss ‘igus précoce (15 promiors ours) ‘ten fabsence de detection ant ‘carpe dans Te LOR. une rechorcne ‘rece du pathogene par PCR spe ‘flue peut ere ndquée (500 9 rnimum, acheming 8 4°C on 24% ‘ou congee 80°C), + Arteta do Lyme : pétéverent de ‘sérum (600 pau minimum) ou un {ube sec do sang Sm) pour sério- fl spootique. La recherche AON ‘Se & bureorten si par PCR spb ‘flue sur prelavemeat de. base farculae ot de teu synovial est indiqute s le tableau cinigue west as typique (600 pL do qude art- ‘ular au minim, aoheminé 8 ons temperate entra? 2°C et BC an ‘zarou congelé 880°C). es 05+ aries La mise enévdone catre ou par POR. {sou synovial) ov (CCR. thud ate vail (auour de ‘synovi, t 20% Ceutre ndcosst at des prélevene tla vechercne ur ‘umicroazope 3 fe phase. Le di 36 ‘Se habituelemente Soren ses une fas _arate brani 54 stuatons ndoss- ‘5 pout eontimer fist (Teles irs er sot fonction du Sethéme migrant, ‘pique le diagnos” Iauo.Aucun pr se pour confer otosion atpige, Ge est eounaiadle redia par PCR ou Sele cand. pout les preevements be vation on fone rolovenents do 4 minimum) ou un (Gm) st de LOR proloves to méme fenmaane wots + 20 et loge spdcaue besoin dune syn fe dantcors sp6- 40 neurborrlos 'S premiers jours) le detection dant JR, une recherone ‘ne par POR spe esque (500 pl av ing 4°C on 24 6 ©), ‘xleverent do 4 nim) ou an (mL) pour sécio- "recherche AON SL par POR 96. vement do que issu synovial est feau cinq rest 1 do ieuide art mvachemne une rece eC en a0"). Tableau | Recommandatons pour le diagnest bilegque en fonction ds formes cniqus oe Se = ree ee SS cus =e. —— = eee =| See ewer ee — Se =| = = ss — ‘nr at err Se rere neon Nant “TeSjnnae nthe ong poco bre a tana plc ngun co pasar ‘Ataintes cutanées (acrodermatte 4, METHODES vonique trophonts, hymphocy- tome bomen, lion erynama: touso alypque on Fabeonce daute cause): punch biopsie de peau (28 ‘41mm de Gamote apres anoshésic locale) pour cultire en aboratore Spécaoe (8 achomingr en 26 848% én mille de anspor BSK a tomb. Fature emblanto au CNR dos Bore. fa) evou PCR spécinque (congeise 220°), La mise on evidence de 8 burgdofe at. ‘ure ou par PCR & part de lope (pe tissu synovial) ou de (CCR, tnuide ariuiae) est de sonsbte re cian Ls _démarche sérlopique_recommande pour le dagnostic dels beetose do Lyme ‘ompont en France comme dans de nom bree pays Europe, doux tops. Un premior tes de dépistage, pus souvent par ELISA, pus, so résuat est post ou ‘outoux, un test do entation par rm no-empreinte sur fo méma échanilon afin ‘Cavgmener a spécfcte de la séoogie Lintocion par &burpdortsindt une Tqudes Biclogques ment valle (autour de 60% pour Ia peau et ia nécessare ‘synoviae, © 20% pour le LCR), Lcultur nacesste fensamenoementinmé- Sat dos prélovements sur mlleu spatiqus ‘tla recherche dune crisance bacerianns ‘au micosoope a fond nor ou a coneast co ‘hase. Le dia de reponse do la culture ast ‘Se habitalement do somsines car 8 burg ‘over sl eat une bacrie a crssance ee 4 ponse immune humoral spéctque gu ‘intneiia au cour du tne sana rae ‘ila phase dlsséminde précooe,# peut ote analyser deux préléverents fealsés a 3 ou 4 tomaines dineral Pour les tests de dpstago par ELISA ot = Jct ie @ ia ecture vuole ds bandos. tors la phase précoce de nfcton, la tétecton par immune-empreint ¢anteorps fe ype igh igas contol protine desu fee OspC et a fapstno fa suspecter une Infection debutant. Lore des phases secon ates ot taives, oo test permet de metre ten evidence un prof antares de ype Ia ‘éigds conte de multpes sragenes do B Durpdoror sf Ces méthoses immuno pron, dot la speiiots est suporoure 8 ‘ole de ELISA ne dovent ro ulises que our confmer les série ce depisiagos postves ou doutouses. En cas de négatve 16 des tests ELISA. est & dre en absence ‘Fanta en quantié detectable avec un test ELISA bon conduit, mest ps ule de ‘aber un test dimmuno-empromt. Geb lement, Ins feciques dimmuno-empreins ‘ont fa méme senate quo TELISA. En re: ‘anche, en cas de mansion disséminge proce, un sul sérlopque & 3 semaines pout eve ube, 5. _ INTERPRETATION La sérooge pour le dlagnaste do Ia bor ralose de Lyme est uno aide majeure, en ‘association avec les arguments anamnos- Tues, cngues ot Blgiques dvocaeurs, se rissa de ete sbologle dovent tu ours interprets n forcon du contests Cinque et éidémisigique et ne 95%). Ee rete postve plus longtemps que ia SAW. Co tst {st tbs ube en zone Senden mais pr ‘Sone ts mamos ites que 2 SAD (ae. tions costes) e ne peel ps dab un tive serotoique 42.3. La méthode gimmunctuorscence indrecte et ELISA La méthode dimmunotorescence indrecte rest pas slandariste. Elo pormet coper- ‘ant de tire le gt tes IgG separément Des tres de 80 en lt et £00 on IgG sont habtustementconlesrés comme sess de postive an zone non andémave, mals cos ‘Souls powentverer dun laboratore @ un ‘uve. Un profi pariculercorespendant aun {aux ts Slo on IgG ot abo ou negation IgM sobsore chez ls paints présoniant tne infection chronique & Brcela (tar rent au cours des becomes Nepabque ou Spidniues). Comme les autres metodes, les reactions sroogiques crosses sont & Tenigine do faux posts, en parculer pout ‘Yentercalica ©: 9 La ménode ELISA est cottous et manque ‘galoment do spécict. Ele ct reserv6o atx onguties séroépidémiologques. pout Tesquetes un grand nombre scantons de seu sont testes, 5. INTERPRETATION 5..___ Diagnostic formel de bevellose Lislement une soucne de Buco, tune hrmocuture ou da tout ae preevement, fst une confmatenformala du lagnostc {de bruce, La détorminaion de Tespsce ot du bivar ect rbalséo parla CNR. Son intr est clagnostque,idéminiogique (réservr probable, mode de transmission) ‘st pronoetque car 8 meiosis wx spon Sable dos fom ls plus graves de bre 5.2. Intért du diagnostic sérologique stmodaltes salagnoste secogque de labruceose a ‘intr que sila care vt pas rete ‘ume on défaut, par exemple on phase aig ou chronique ola malaco Los testsstrlogiques divent re combing e lus Souvent un EAT et une SAW, en particule angles pays ob ndence da brucalose fest fale. En cas ds post, Ia conte: ‘lon est éiabte parle CNR. des Braco ‘serlogiques st toujours ciffo ot no pout 'efare quan foncion du contest nique et episemitegque LEAT ef la SAW devinnent habtualerent posts 2 44 semaines aprile début dos ‘Sines cinigues. Linmmunaivorescence in fecte déteco des IgM a ce siade, pus dos Ig6-118 2 semaines plus tas. Une sérclo- ie négative nsimine pas formalemont Io Siagnstc de buestose I peut sgl dun alot pole en phase précoce deta ma ‘io, ela reptilon des tess 3 84 semaines ‘pl tard monte une seroconversion ou une ‘ugmentaion ‘slvioalve un fociour # Ges tres sclogques. Habiuolment, 16s tives dos antoorpe ategront un maximum (sau 5 120 ou pls) 2 83 meis apes te ut dos signas criques, pus ciminuent progressivement. En pase chronique, on pout observer a persistance des Ig spe ‘fiques par technique. dimmunotuores ‘once, alors que la SAW eat negave. Par ‘allours, cerns patents ent une reponse humocie fae ore négatve male p= ‘eure semaines dévohaon de la malade, ‘ors meme quune souche de. Brucafa ot islée La limite majoure du clagnostic s6- rolgiqu ost son mangue de spect. Du {ait des nombrevees reactions s6oigiquee ois ot de la possi de persistance Drolongée des antcorps apres infection, la ‘Secouverte dun tire sérloique signet Sur un sérum iol ne sult pas & confer Ue brucelose, Une seroconversion ou une rultpleation par .0u pl des tes S80. ‘hq sur dx sacums proves & au meine ‘deve semaines interval est plus spec ‘iqu, male esa imine pas fermetement tune réaction séologique coisée en paca ler avec nterocaiice © = 9. La VPP da Alagnosic sérlogque est ts abe on zone how endémique, en pariculor on France 0 Te nombre de yersiniosos est supéiur&co- 74cm ome2015 Iu des brucaloses. Les tone striogiques elvan done toujours to intorpréts avec: ‘des données cng ‘epidomiloiquos. La notion dun voyage réconton zane don ‘trie ou d'un risque professionnel (echni- ‘en de labora) est esse, mas a ‘contamination peut pars remoter & pl Sure ml, BIBLIOGRAPHIE Barut L,Feriano D, Meletio R, Bor rata V, Braeoo ©, Brgnone C, ef a Hepatic bucalioma. 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CONTEXTE Campylobacter ot Arcobacer ot 60s ba- Gos 8 Gram nga adapts & lave dans le mucus du tbe aigestt ae homme et dos ‘samaux. ls son.&forgine dinfectons nies finales humaine, I exist 45 expéoes va ‘es do Campycbsctor,ceraines eluant es sous sspecos. Lire du provessu dabaltago, les carcasses {e volale sont contaminées par Camoy- Taboctor prverts a nivead caceal. Loe {oureas dela contamination humaine sont Imps Ele peut avo lou par ingestion de ‘iande de voaleiauflsarnment cute mas, lous soavet, ela sunient par contamina. tion ctsée aliments qu sorent mangés ‘rus. Le respect de ragies Chyiéne de base ‘dane la préparation desropas est un élmont scent pour proven cos contariratons troisbes. a consommation do vane bovine Eensonée pu cut a és rouvée comme facteur de isque en France. Cera cas ‘infections humsines ont sgaloment et r= lide on Europe 2 une eignacapene. Pars, lela ou eau sontles vehicles ce aco nation, La_conaminaion a réeenors ‘eau qui échappe ensue au vateront habtet pout ee 2 rorigne dépicérios de grande emplou Enfr, fos anaux de com- agri, notamment ls hots oes ani Feuvagos (moveties), peuvent. également [over un re direct ov inet dans cotains 35 cinfectonshumaines. Campylabecter colonise is ube digest et pout due & Tenge dune ciarhee ivasve ful se mantest surtout au niveau cotave. Sgt da la premiere cause bactrionne r- fecton nfctnao dan les pave dove-pp6e ‘lovant les salmoneloses, Cate infection out guérespertanément. La pathopine de at infection est mal Jie ‘Campylobacter peut passer dans ia crus tion generate mals est raement @ forging de bacurimie,sout Cetus qu rsa 20 powolrbacericide du sérum. Cate demise spice ost auss @ Forge de locatsations Seoandaies sepiquessutut chez des me lades ayant une pathologe sous jaconte. La moral asocée aux infections ivasives 8 Cote est non négigeabie. Les infections & Campyfobactr powontin- te des pathologies postneciouses do ‘ype immunciogique comme Tarte réac- tlonele tle syndrome do Gulla Bar, (Ce demior syndrome essenteioment 0 & cetans sérogroupes de C elunl, qu suc ‘ent Jans 1 83 cas pour 1009 infections. ‘st paricuibromont grav et peut ents es séquoes nevloniues 2. OBJECTIFS La détecton des. Campylobacter sp. fait abe des bacines recherche sytémat- ‘quement au cours des dares infoctouses 4o plus de 48 hau méme tre que la détec- tion do Salmonotes car la fréquence des CCampylocter spp., a Tongine dinfecton Intestinal, exctde Gales dae Seimonelee dane nove pays. Elle est done Indquée notamment dans le cas de arte sigue sbvére (hmoragiqe, synéromo dysensrique) ou rebole (peri tant pus do tis ous), aux ages extrdmes dea vie, en ca8 de erin ral, au retour ‘fun voyage en pays topical et en cas de ‘oxinfocton amen caleciv. 3. PRELEVEMENTS: Ls recherche des Campylobacter spp. st la plus sowent rialsse parr do elles fou dhémocutues, Dautres prelvemants ‘went éventualement permetre la cure e ces bactries(iqude bislonques, Bo sos) do mane forute ou orentbe par examen microscopiq. rani015 ‘spree 47756 coneycsosrep. 4, METHODES MIGROBIOLOGIQUES 441.1. Coprecature Duiait ein agit des Campylobacter spp. les soles dent eve achemanées en moins {ie 2h eulaboratora ou conserves cans un Ill de wansport de type Cay Bar mod fo avec da Tagar (16%) & uno lempsrature ‘compres enre #2°C at + 6°C. Lem parla posta re conven pas. {culture ext efecto sur un mie riche, bic ot gu azworbe les radeaux onyg6: és res toxques: miu au sang (Skirow, Buta par exemple) ova charbon (Karma: I par exemple). Des mileux commeriaux xstnt,chomogénes ou non. Bion quo los Campyicbacor ermotoéants sent une ompéreture optimal do cute 3 42°C, lest rcommande dinober les botes ‘emviron 26°C. Con est exromement i: portant ear, une part, eat template n'a as de consequence négative surlacuture fle C. fount eC. cal (es 2 principales es- Pose loles) et aut art el permet a ute de . fet, de Arcobactret dares lespices de Campyabectr plus rare, {ncubation ost ratio impératvoront on simosphire miro-abrobie et les gbloses foivent ere incubées Inmédatementaprés fensemencamont Les cultures sont obser. ‘os apres 24, dB et 72h incubation. Us cute des Campylopecte se adult par 4s peties colonies lisse, sant, couvent ftalses ou en nappe.Lidentifestion au n- veau du genre Campylobacter se fat. cure Sur aspect des colonies, ela morphologic incur ou spraiée au merescope et su la présence dune oxysase, Eeaieaton rea do espten eu fe réaobe smperent par qulau senoypines "tyaayse, de Thppute, onsite ls fling euture 8 25°C, par fxomple. Cependant, oes tests ont ordi do leur int depuis la genéralsaton dans les laboratores de. Tidenicaton ‘bactérenne bar specrométie de masto de typo MAL: DL-TOF. Lisenfieation MALDI-TOF est pa ticuldrementperormante pou ideniiation des Campylobacter t permet didentiier des ‘genes ot espdces dfclement accuses Bar dos tests cidenticationconventionels, notamment : Campylobacter far, Campy- lopactor upsalnsis, les Campyobactors anaérobies» (Campylobacter ureoyicus notamment), los Acobactrs et les Helo. bce enrrhépaiques dont pour certains la patogénie est proche des Campyfobac- ters (notamment Holobacter pullorum, He: loobactor cnaed). Lconictionsystima- tue par spacrométie de masse, méthode rapide et peu codtauss, de puseurs colonies (y compris daepectaypique) poussant sur los roux blects augment e tux dea tection, 44.2, Recherche dana es sles par méthode mole ou immuno-enzymatique La recherche pt amplieation génique n'est pas encore réalsée on routine. extraction {60 TADN ne pose on général pas do pro- biome carla charge bactérianne en Can pylabacter spp. est imporant, @ candion ‘uber un Kk fxracton adapt & Fen naton ciahibtours de PCR souvent présents ‘dans les sales. La POR on temps rol ost plus sensible qo acute et permet obto- rir dos résultats rapes. Des trousses sont ‘commerciaisées pour ls recherche dan es sles Dee tts ELISA et des tots mmuno-enay- matques rapes tont maintenant comme: Class pour ia dbtecton do Campyfobactr 9p. dans ls el, Los tots ELISA capo ible sur fe marché ont une bonne condor ‘dance avec la PCR en temps rte, sont us senses que la cute tut en ayant tne bonne spc. Leu inconvénion et ‘Fe ite & Ia seule rcherene 86 C. i et C. col et non des auras Campyibac- for spp. t dee bactéries spparenies Les tests apldes immuno-enaymatques ont une moins tonne splat (20% de tess post 1s lsclément- Des evaluations compiémen- tes sont nécessates Asi, es tests EL ‘6 rocornmand ‘Campyibacterers (ne Wansplantin 413. Hémootun prelovemen LLutisaton de facar Ges sytomos ect Is eoossance becte lorer ts dttetion pylbacter spp. La rmeroscopique vo Campyiecterspp. ‘mosphere mica Be mime, lob pt Sout, vascular, Incubas en aims Pr cont, i nest chorchor syiémat tes prleveronts pk ‘malt Msclomont¢ 2 pe de prleve Faromentimptiqué roots. En detors des 6p fection systimigue Vernent surtout ch fu tages. tes 90 Important (18% 42,___ Méthode in Le stroagnoste + athlon postin 4 sycome. de C {ate par ELISA ou ‘au complément. Sent pnts) centres specials, 5. INTERPR La mise on évider dana les sles dan tion itasinale do En dehors do pall ‘exist pas de ot prlbacter. Ube espboos les ot tres danas soo (65%), © cot (107