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SpermaScore Universel

Utilisation du compteur différentiel de spermatozoïdes

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Utilisation du compteur différentiel de spermatozoïdes

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SPERMASCORE UNIVERSEL

Mode d’emploi

1- Partie commune

2- Mode Kruger Essentiel

3- Mode Kruger Etendu

4- Partie mode David

Compteur et logiciel protégés par copyright.


Jean-Pierre Duval
28/03/2012

1
Table des matières
SPERMASCORE UNIVERSEL...................................................................................................................... 1
Introduction......................................................................................................................................... 4
Caractéristiques communes ................................................................................................................ 4
La clé USB ............................................................................................................................................ 4
Pile de sauvegarde........................................................................................................................... 5
CONFIGURATION A LA PREMIERE UTILISATION .................................................................................. 5
Le mode de travail ........................................................................................................................... 5
Le type d’identification.................................................................................................................... 5
CONFIGURATION SPECIFIQUE AUX MODE KRUGER Etendu et Essentiel ............................................ 6
CONFIGURATION SPECIFIQUE AU MODE DAVID................................................................................. 6
COMMUN AUX TROIS MODES ............................................................................................................. 6
Démarrage ....................................................................................................................................... 6
LE MENU 1 ....................................................................................................................................... 7
UTILISATION EN MODE KRUGER ESSENTIEL ............................................................................................ 8
Autres caractéristiques.................................................................................................................... 8
Configuration ....................................................................................................................................... 9
Aide.................................................................................................................................................. 9
Configuration des touches : ............................................................................................................ 9
Transfert des abréviations................................................................................................................. 10
Utilisation du fichier Excel® ............................................................................................................ 10
Explications : .................................................................................................................................. 11
MENU 2 du Mode Kruger Essentiel ................................................................................................... 11
Suppr-1 .......................................................................................................................................... 11
Tot +50........................................................................................................................................... 12
Retour ............................................................................................................................................ 12
Enreg/menu ................................................................................................................................... 12
Quitter ........................................................................................................................................... 12
La présentation des résultats ............................................................................................................ 13
Remerciements ................................................................................................................................. 14
Documentations ................................................................................................................................ 14
Références ......................................................................................................................................... 14
Mise à jour ......................................................................................................................................... 14
UTILISATION EN MODE KRUGER ETENDU ............................................................................................. 15
Configuration ..................................................................................................................................... 16
Aide................................................................................................................................................ 16
Configuration des touches : .......................................................................................................... 16
Transfert des abréviations................................................................................................................. 17
Utilisation du fichier Excel® ........................................................................................................... 18
Explications : .................................................................................................................................. 18
Utilisation du compteur SpermaSCORE K.......................................................................................... 19
MENU 2 ............................................................................................................................................. 19
Pourcentage .................................................................................................................................. 19
Suppr-1 .......................................................................................................................................... 19
Tot +50........................................................................................................................................... 19
Retour ............................................................................................................................................ 19
Enreg/menu ................................................................................................................................... 19
Quitter ........................................................................................................................................... 19
La présentation des résultats ............................................................................................................ 20
Remerciements ................................................................................................................................. 20
Documentations ................................................................................................................................ 20

Spermascore universel V9.1 page| 2


JP Duval 14.10.2014
Références ......................................................................................................................................... 21
Mise à jour ......................................................................................................................................... 21
UTILISATION EN MODE DAVID .............................................................................................................. 22
Utilisation du fichier Excel® ........................................................................................................... 23
Explications : .................................................................................................................................. 24
Utilisation du compteur Spermascore D ........................................................................................... 24
MENU 2 ............................................................................................................................................. 24
Reprise ........................................................................................................................................... 24
Suppr-1 .......................................................................................................................................... 24
Tot +50........................................................................................................................................... 24
Enreg/menu ................................................................................................................................... 24
Quitter ........................................................................................................................................... 24
La présentation des résultats ............................................................................................................ 25
Remerciements ................................................................................................................................. 25
Documentations ................................................................................................................................ 25
Mise à jour ......................................................................................................................................... 26

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JP Duval 14.10.2014
Introduction
Les directives OMS de 2010 (fichier joint sur la clé USB) préconisent d’établir le spermocytogramme
selon la grille de Kruger & coll.
Ceci entraîne une modification des habitudes du laboratoire.
En France, nous utilisons principalement la grille de David et Coll.
SpermaScore est un outil conçu pour réaliser les spermocytogrammes selon Kruger et coll. mais
aussi selon David & coll. En effet il nous a semblé utile pour le laboratoire de pouvoir disposer d’un
outil mixte. Le choix se fait dans l’onglet « PARAM ». Chaque mode de comptage est associé à une clé
USB particulière : il n’est pas possible de faire du Kruger avec la clé David et inversement.
Comme tous nos compteurs, il ne propose aucun diagnostic.

Nous avons, en suivant les recommandations du Docteur J.M. Plouchart, ajouté un 3ème mode de
comptage : Le Kruger Essentiel.
Celui-ci est particulièrement intuitif, particulièrement rapide et pratique. C’est celui que nous vous
présentons en premier dans ce mode d’emploi.

Ce compteur s’adapte donc à tous et à toutes les habitudes des laboratoires.

Caractéristiques communes

 Le système de sauvegarde : une ou plusieurs clés USB


Chaque jour d’utilisation le compteur crée un répertoire jj-mm-aa
Dans chacun de ces répertoires sont stockés les dossiers patients. Sans aucune limitation.

 Ces dossiers sont ensuite relus sur un PC en utilisant le classeur Excel® fournit avec le
compteur. Ce classeur est « open-source »

 Pour créer les répertoires journaliers, on utilise une horloge intégrée au compteur. Ce qui
permet aussi de dater les fichiers créés.

La clé USB
C’est la grande nouveauté de cette série de compteur : Elle offre la possibilité de stocker une quasi-
infinité de dossiers. Associée au classeur Excel® cela fait un outil puissant au service du laboratoire.
Mais cela présente aussi quelques contraintes :
 N’importe quelle clé USB peut être utilisée mais nous vous conseillons d’utiliser celles que
nous vous fournissons, elles sont préchargées avec un fichier indispensable : [Link] .
C’est un fichier txt tout simple de maximum 30 caractères qui permet au compteur de s’initialiser. Ce
dernier fichier permet aussi à Excel® de reconnaître le chemin d’accès à la clé.
 Les clés des compteurs Kruger Etendu et Essentiel comporte un répertoire « Touches »
 La capacité maximum de la clé ne peut excéder 2Go (notre système d’exploitation ne le
supporte pas)
 Attention de ne pas placer deux clés USB possédant ce fichier « [Link] » simultanément
dans le PC, Excel ouvrirait seulement la clé placée dans le lecteur le plus haut. d\ : ou e\ : etc…

Spermascore universel V9.1 page| 4


JP Duval 14.10.2014
Pile de sauvegarde
Ce compteur est équipé d’une horloge interne sauvegardée par une pile lithium type : CR2032, la
durée de vie est d’environ 5 ans.
Pour la prolonger nous vous recommandons de toujours laisser l’alimentation externe branchée, elle
consomme moins d’un demi-watt. Le compteur, lui peut être éteint par l’interrupteur. Si vous devez
fréquemment remettre à l’heure le compteur, c’est que la pile est en fin de vie. Il faut la changer. Ce
n’est pas très difficile, il faut seulement un peu de soin et respecter les polarités : vous devez voir le +
de la pile.

CONFIGURATION A LA PREMIERE UTILISATION

quel que soit l’écran qui se présente à l’utilisateur quand il reçoit son compteur, il est conseillé de
passer par l’onglet « param » pour configurer :
 Le mode de travail
 Le type d’identification
 Les paramètres de date et heure

Le mode de travail

Le type d’identification

Et enfin les paramètres d’horloge. On utilise trois touches du clavier pour ce réglage, il est très
simple. On l’enregistre par « OK »

Ces trois réglages sont suivis d’un redémarrage compteur pour enregistrer les choix en mémoire
interne. C’est un peu fastidieux, mais on change que très rarement ces trois réglages.

Spermascore universel V9.1 page| 5


JP Duval 14.10.2014
CONFIGURATION SPECIFIQUE AUX MODE KRUGER Etendu et Essentiel
On doit configurer les touches (abréviations, intitulés, classes, positionnement)
Voir cette configuration aux chapitres respectifs.

CONFIGURATION SPECIFIQUE AU MODE DAVID


Il n’y a pas de configuration spécifique au mode David, le compteur, une fois configurer dans ce
mode est prêt à l’emploi.

COMMUN AUX TROIS MODES


Démarrage
Le compteur ne peut pas fonctionner sans sa clé USB. Tous les résultats, le fichier des touches et le
fichier [Link] sont placés dans cette clé.

Message de démarrage si la clé


avec le fichier « [Link] » est
absente

Message d’initialisation quand le


compteur a reconnu une clé
valable.
La date et l’heure s’affiche
également et sont à régler si
nécessaire. Dans le menu
« Param »
Ce paramètre est important car
un répertoire où seront stockés
les fichiers sera créé avec cette
date.

Spermascore universel V9.1 page| 6


JP Duval 14.10.2014
LE MENU 1

Nouveau :

On rentre l’identité sur 15 chiffres maximum, et


1 au minimum, il peut y avoir des doublons. En
cas de longueur inférieure à 15, les chiffres
manquant sont remplacés par des 0 à gauche.
Pour ce paramètre, il y a possibilité de correction
avec la touche « corrige »

Dans le formatage numéro les chiffres sont


rangés par groupe de trois.

Dans le formatage « numéro de sécurité sociale »


les chiffres sont rangés dans l’ordre préconisé.

Puis « Menu » et enfin on rentre la date de


naissance si ce champ est requis dans les
paramètres.

Lecture:

Permet de relire séquentiellement les


formules du jour. Les formules d’un
jour précédent seront relues dans le
programme Excel.

Param.
Voir en début de ce mode d’emploi.
Astuce : On peut changer la date, momentanément, pour revenir à une date inférieure et ainsi relire
un ancien répertoire avec le compteur.

QUITTER
Pour quitter l’application.
_________________________

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JP Duval 14.10.2014
UTILISATION EN MODE KRUGER ESSENTIEL
Dans le comptage selon Kruger et coll, (comme chez David) si une et une seule anomalie par partie
du spermatozoïde est comptée, il est considéré comme atypique.
On peut compter 4 anomalies par spermatozoïde.
En revanche, on ne peut pas compter plus d’une anomalie par partie : Tête, Base, Flagelle, Reste
cytoplasmique.
Si un spermatozoïde ne présente aucune anomalie, il est considéré comme typique.

Nous utilisons deux des quatre lignes de six touches pour ce programme. La ligne de base étant plus
spécialement réservée aux anomalies.
La ligne au-dessus permet de compter les cellules autres (cellules rondes, leucocytes..) et les
typiques.
Les touches sont reconfigurables à la main de l’utilisateur.

Autres caractéristiques
 Configuration du compteur à partir d’un classeur Excel®

Le tableau Excel du spermaScore K Essentiel :

Tableau 1
Attention : le tableau Excel® utilise un programme qui est considéré comme une macro. Pour
l’utiliser, Il faut autoriser les macros, vous ne risquez rien, votre ordinateur ne vas pas exploser !
Malgré les mises en garde d’Excel®

Spermascore universel V9.1 page| 8


JP Duval 14.10.2014
Configuration
Aide
Le tableau possède des signets d’aide sur certaines cases marquées d’un petit triangle rouge en
haut à droite.

Tableau 2

Configuration des touches :


C’est la première étape, on doit commencer par cette configuration avant d’utiliser le compteur.
1. On rentre le nom des anomalies ou des cellules « à sa main » les touches sont rangées de
bas(touche 1) en haut et de gauche à droite(touche 12)

2. Les abréviations sont à rentrer sur 4 lettres (minuscule ou majuscule)

3. La classe des anomalies est en majuscules A=tête, B=base, C=flagelle, D=reste cytoplasmique
les Typiques ont un attribut de classe « N » qui est utilisé pour le programme.
Si vous les déplacez, n’oubliez pas de redonner cet attribut.

4. Il peut y avoir des touches « non-comptées » par exemple pour compter le nombre de
leucocytes, dans ce cas les cellules doivent avoir « Z » pour la classe.

5. Les touches « vides » sont nommées « xxxx » en majuscule, la classe est « X »

6. La touche ENTR est classée Z1

1
X, Z ou N ne sont pas des classes préconisés par l’OMS, c’est juste un outil pour la programmation.

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JP Duval 14.10.2014
Transfert des abréviations.
1. Quand les modifications sont effectuées il suffit d’effacer le fichier touche de la clé USB pour
le remplacer par le nouveau.
2. Si vous changer la configuration, ne relisez plus les résultats précédents avec la nouvelle
configuration.
Attention ! Si vous changez la configuration des touches, vous risquez de modifier des données.
Exemple : les Base (Anomalies de la base) sont comptés ici en touche( 2) les résultats seront rendus
pour cette touche (2). Si vous modifiez votre clavier sur la feuille Excel® par exemple les REST( reste
cytoplasmique en touche (5) à la place de la touche 4 sans le transmettre à la clé USB, en
relecture, le compteur (4) donnera toujours la valeur trouvée au début de l’exemple.
En d’autres termes le compteur lit des valeurs de touches, pas des spermatozoïdes…
3. Pour éviter cela le compteur renvoie sa configuration au fichier Excel®, ce qui permet de
signaler les anomalies par une fenêtre d’information qui apparaît autant de fois qu’il y a de
différences.
4. le classeur est protégé contre les modifications intempestives. Nous donnons néanmoins le
mot de passe pour le débloquer. (voir plus loin)
5. Eviter de changer la configuration des touches du laboratoire.
6. Le fichier de comptage est toujours vrai, le nom des touches, enregistré à la fin du comptage
est celui qui est associé aux compteurs.

Utilisation du fichier Excel®


Chaque jour d’utilisation du compteur, celui-ci crée un répertoire « jj-mm-aa » sur la clé USB voir
tableau 1.
Le tableur va rechercher la clé et les répertoires en cliquant sur la date voulue, puis en cliquant sur le
fichier patient on ouvre la feuille de résultats :

Tableau 3
Pour revenir à la feuille des fichiers cliquer sur Clavier en bas à gauche.

Ce classeur Excel® est un exemple d’utilisation, il peut être utilisé tel que ou modifié par votre service
informatique. Le code est protégé par le même mot de passe. Les données transmises sont indiquées
à la fin de ce mode d’emploi.
Nous vous conseillons d’en faire une sauvegarde avant toutes modifications.
De même pour les fichiers placés dans la clé USB.

Spermascore universel V9.1 page| 10


JP Duval 14.10.2014
Explications :
Le comptage selon Kruger et coll. est bien décrit sur le site :
[Link]
Nous nous sommes inspirés de cette note pour concevoir notre compteur et rédiger cette notice.

Le calcul de l’index de tératozoospermie (TZI) est calculé comme suit :


Tzi=∑ (des anomalies par catégorie)/Total des cellules présentant au moins une anomalie
Sachant qu’un spermatozoïde peut présenter de 1 à 4 anomalies.

Les anomalies sont classées en 4 classes :


- Anomalies de la tête A ou (H pour Head defects)
- Anomalies de la pièce intermédiaire B ou (M pour Neck et Midpiece defects)
- Anomalies de la pièce principale (flagelle) C ou (P pour Principal piece defects)
- Présence de Reste cytoplasmique D ou (C pour Excess residual Cytoplasm)
Une seule anomalie suffit pour considérer que le spermatozoïde est atypique. Si on tente
d’enregistrer deux ou plusieurs anomalies de la même classe pour un spermatozoïde, ce comptage
sera refusé.

Les pourcentages d’anomalies sont calculés par rapport au total des spermatozoïdes comptés.

MENU 2 du Mode Kruger Essentiel


Le menu est déroulant, on repasse de
QUITTER à suppr-1
Attention QUITTER ne veut pas dire
revenir au comptage. Pour revenir au
comptage il faut passer par une des 3
options
-1, +50 ou Retour. Voir ci-dessous.

Le total correspond au total des spermatozoïdes comptés.


Puis les valeurs absolues des typiques et atypiques, les pourcentages et enfin le TZI.
Ces chiffres sont mis à jour au fur et à mesure du comptage.
Les classes d’anomalies sont exprimées en pourcentage. Mais le total peut dépasser 100 car à un
même spermatozoïde peut correspondre plusieurs anomalies.

Suppr-1
Pour supprimer les 5 dernières cellules comptées dans l’ordre Dernier-Entré Premier-Sorti. En
choisissant cette option on supprime la dernière cellule entrée puis on revient au comptage.
Dans le cas d’anomalies portant sur plusieurs classes, toutes les classes affectées sont supprimées :
Exemple on a tapé pour un spermatozoïde :
tete+base+rest puis Enter
Les touches Tete+base+rest s’incrémentent toutes de 1
On tape menu puis « suppr-1 » , Tete+base+rest décrémentent de 1

Spermascore universel V9.1 page| 11


JP Duval 14.10.2014
Tot +50
Augmente le total à compter de 50 cellules. En fin de comptage, il est toujours possible de rajouter
50 cellules. Maximum 999.

Retour
Revient au comptage directement.

Enreg/menu
Pour Enregistrer la formule en cours même si le total ne fait pas 100 ou le total décidé. Attention on
ne peut pas revenir en arrière après un enregistrement les variables de comptages sont détruites, on
peut seulement le relire, soit dans le compteur le jour même soit avec le classeur Excel.

Quitter
Attention quand on quitte, c’est définitif on ne peut pas revenir en arrière, il faut éteindre le
compteur pour redémarrer. On perd toutes les données non enregistrées.
_________________________

Spermascore universel V9.1 page| 12


JP Duval 14.10.2014
La présentation des résultats
La taille des fichiers est d’environ 1Ko soit 1 million de dossiers pour une clé USB de 1Go
Le codage des fichiers est extrêmement simple, chaque champ est de longueur fixe et séparé par un
«;»

Lors du premier enregistrement du jour, le compteur crée un répertoire jj-mm-aa


Dans lequel on retrouve :
1. Un fichier « [Link] » qui indique le nombre de dossiers lus sous la forme : 003
2. Autant de fichier que de patient nommé « [Link] » ou n va de 1 à 255 (si nécessaire de 1 à
65535 nous consulter.) . A un autre jour correspond un autre répertoire, un autre fichier
« [Link] » et autant de fichier « [Link] ».
3. Ces fichiers « [Link] » étant constitué de :
4. L’identifiant sur 22 signes (compte tenu des blancs séparateur) + « ; »
5. Suivi sans espaces par le contenu de 19 compteurs formatés sur 3 digits « 0 » et séparés
par des « ; »
6. Le compteur 1 est le nombre des spermatozoïdes comptés
7. Le compteur 2 est le compteur des anomalies.
8. Le compteur 3 est le nombre de cellules à compter
9. Les compteurs 4 à 8 sont les compteurs des classes A,B,C,D et N(typiques)
10. Les compteurs 9 à 13 reprennent les compteurs des touches 1 à 5
11. Les compteurs 14 à 19 reprennent les compteurs des touches 6 à 12
12. Il peut sembler y avoir des redites mais cela permet de configurer le compteur suivant les
choix du laboratoire.
13. Puis toujours sans séparation autres que des « ; » La liste des abréviations des cellules qui se
compose de 4 lettres.
14. Et enfin le cas échéant si paramétré dans « param » la date de naissance + « ; »
Au total un fichier de résultat est une ligne composée de 156 signes ASCII
Les abréviations ont été mis à la ligne pour la clarté de la lecture, Il n’y pas de CRLF dans les
comptages.

000 000 000 000 123; 50; 37;100; 11; 10; 12; 11; 13; 11; 10; 12; 11; 0; 1; 5; 0; 0; 0; 13;
Tete;Base;Flag;Rest;xxxx;ENTR;Leuc;Cell;xxxx;xxxx;xxxx;TYPI;03/04/1950 ;

On peut dire que ce comptage 000 000 000 000 123 a donné :

50 cellules comptées, 37 anomalies, 100 cellules à comptées


11 anomalies de la tête H (ou A)
10 anomalies de la pièce intermédiaire M( ou B)
12 anomalies de la pièce principale P (flagelle) (ou C)
11 anomalies Reste cytoplasmique C (ou D)
13 formes typiques
1 leucocyte
2 cellules rondes

Mot de passe du fichier .xls


sper

Spermascore universel V9.1 page| 13


JP Duval 14.10.2014
Remerciements
Nous tenons à remercier le Docteur J.M. Plouchart pour l’aide apporté dans ce projet.

Documentations
Déjà cité le site : [Link]

Références
Kruger et coll. 1986
Menkveld et coll. 1990
Coetzee et coll. 1998

Le document de l’OMS : Examination and processing of human semen. Edition 2010


Analyse Page 67 et suivantes
TZI Page 115 et suivantes

Mise à jour
V9.0
 Mise en place de l’identification suivant le numéro de sécurité sociale, et le cas échéant la
date de naissance. (4 choix possibles)
 Ajout des champs typiques et atypiques en valeurs absolues dans le cartouche de lecture.
 Correction du classeur Excel (on ne pouvait pas lire plus de 25 dossiers. passé à 250)
V9.1
 espace plutôt que 0 pour ID et numéro de version sur la page d’accueil

Spermascore universel V9.1 page| 14


JP Duval 14.10.2014
UTILISATION EN MODE KRUGER ETENDU
Avant toutes utilisations du compteur, il faut le configurer à partir du classeur Excel® ci-dessous
Ce classeur est fourni avec la clé USB.

Le tableau Excel des spermaScore K :

Tableau 1
Attention : le tableau Excel® utilise un programme qui est considéré comme une macro. Pour
l’utiliser, Il faut autoriser les macros, vous ne risquez rien, votre ordinateur ne vas pas exploser !
Malgré les mises en garde d’Excel®

Spermascore universel V9.1 page| 15


JP Duval 14.10.2014
Configuration
Aide
Le tableau possède des signets d’aide sur certaines cases marquées d’un petit triangle rouge en
haut à droite.

Tableau 2

Configuration des touches :


C’est la première étape, on doit commencer par cette configuration avant d’utiliser le compteur.
1. On rentre le nom des cellules « à sa main » les touches sont rangées de bas(1) en haut et de
gauche à droite(24)
2. Puis, on rentre la classe et la lettre-clé
3. Il peut y avoir des touches « non-comptées » par exemple pour compter le nombre de
leucocytes. Ces cellules doivent avoir « Z » pour la Classe et « x » pour la lettre-clé.
Le total de ces touches est renvoyé au classeur, mais il ne rentre pas dans les totaux.
4. Les typiques doivent avoir « N » comme classe et « x » comme lettre –clé
5. ENTER qui est une touche inamovible à aussi une Classe Z et une lettre clé « x »
6. Les abréviations sont à rentrer sur 4 lettres (minuscule ou majuscule)

N, Z et x ne sont pas des références OMS, ces lettres sont utilisées à des fins de programmations.

Spermascore universel V9.1 page| 16


JP Duval 14.10.2014
Transfert des abréviations.
7. Quand les modifications sont effectuées il suffit d’effacer le fichier touche de la clé USB pour
le remplacer par le nouveau.
8. Si vous changer la configuration, ne relisez plus les résultats précédents avec la nouvelle
configuration.
Attention ! Si vous changez la configuration des touches, vous risquez de modifier des données.
Exemple : les Basy (base coudée) sont comptés ici en touche( 2) les résultats seront rendus pour
cette touche (2). Si vous modifiez votre clavier sur la feuille Excel® par exemple les Rcyt( reste
cytoplasmique en touche (5) sans le transmettre à la clé USB, en relecture, le compteur (2)
donnera toujours la valeur trouvée au début de l’exemple.
En d’autres termes le compteur lit des valeurs de touches, pas des cellules…
9. Pour éviter cela le compteur renvoie sa configuration au fichier Excel®, ce qui permet de
signaler les anomalies par une fenêtre d’information qui apparaît autant de fois qu’il y a de
différences. Voir tableau 3 et exemple en fin de documentation.
10. Il est possible de protéger le classeur contre les modifications intempestives.

Après les alarmes, il est toujours possible de lire le résultat. Le résultat est correct sur la clé, il suffit
de corriger le classeur pour relire correctement. Voir un exemple de résultat sur la clé en annexe.
Tableau 3

Spermascore universel V9.1 page| 17


JP Duval 14.10.2014
Utilisation du fichier Excel®
Chaque jour d’utilisation du compteur, celui-ci crée un répertoire « jj-mm-aa » sur la clé USB voir
tableau 1.
Le tableur va rechercher la clé et les répertoires en cliquant sur la date voulue, puis en cliquant sur le
fichier patient on ouvre la feuille de résultats :

Tableau 3
Pour revenir à la feuille des fichiers cliquer sur Clavier en bas à gauche.

Ce classeur Excel® est un exemple d’utilisation, il peut être utilisé tel que ou modifié par votre service
informatique. Les données transmises sont indiquées à la fin de ce mode d’emploi.
Nous vous conseillons d’en faire une sauvegarde avant toutes modifications.
De même pour les fichiers placés dans la clé USB.

Explications :
Le comptage selon Kruger et coll. est bien décrit sur le site :
[Link]
Nous nous sommes inspirés de cette note pour concevoir notre compteur et rédiger cette notice.

Le calcul de l’index de tératozoospermie (TZI) est calculé comme suit :


Tzi=∑ (des anomalies par catégorie)/Total des cellules présentant au moins une anomalie
Sachant qu’un spermatozoïde peut présenter de 1 à 4 anomalies.

Les anomalies sont classées en 4 classes :


- Anomalies de la tête A ou (H pour Head defects)
- Anomalies de la pièce intermédiaire B ou (M pour Neck et Midpiece defects)
- Anomalies de la pièce principale (flagelle) C ou (P pour Principal piece defects)
- Présence de Reste cytoplasmique D ou (C pour Excess residual Cytoplasm)
Une seule anomalie suffit pour considérer que le spermatozoïde est atypique. Si on tente
d’enregistrer deux ou plusieurs anomalies de la même classe pour un spermatozoïde, ce comptage
sera refusé.

Spermascore universel V9.1 page| 18


JP Duval 14.10.2014
Utilisation du compteur SpermaSCORE K

MENU 2
Pourcentage

Les classes sont exprimées en pourcentage. Il suffit de taper Menu pour revenir au comptage.

Suppr-1
Pour supprimer les 5 dernières cellules comptées dans l’ordre Dernier-Entré Premier-Sorti. En
choisissant cette option on supprime la dernière cellule entrée puis on revient au comptage.

Tot +50
Augmente le total à compter de 50 cellules. En fin de comptage, il est toujours possible de rajouter
50 cellules. Maximum 999.

Retour
Revient au comptage directement.

Enreg/menu
Pour Enregistrer la formule en cours même si le total ne fait pas 100 ou le total décidé. Attention on
ne peut pas revenir en arrière après un enregistrement les variables de comptages sont détruites, on
peut seulement le relire, soit dans le compteur le jour même soit avec le classeur Excel.

Quitter
Attention quand on quitte, c’est définitif on ne peut pas revenir en arrière, il faut éteindre le
compteur pour redémarrer. On perd toutes les données non enregistrées.
_________________________

Spermascore universel V9.1 page| 19


JP Duval 14.10.2014
La présentation des résultats
La taille des fichiers est d’environ 1Ko soit 1 million de dossiers pour une clé USB de 1Go
Le codage des fichiers est extrêmement simple, chaque champ est de longueur fixe et séparé par un
«;»

Lors du premier enregistrement du jour, le compteur crée un répertoire jj-mm-aa


Dans lequel on retrouve :
1. Un fichier « [Link] » qui indique le nombre de dossiers lus sous la forme : 003
2. Autant de fichier que de patient nommé « [Link] » ou n va de 1 à 255 (si nécessaire de 1 à
65535 nous consulter.) . A un autre jour correspond un autre répertoire, un autre fichier
« [Link] » et autant de fichier « [Link] ».
Ces fichiers « [Link] » étant constitué de :
3. L’identifiant sur 22 signes (compte tenu des blancs séparateur) + « ; »
Suivi sans espaces par le contenu des 32 compteurs formatés « 0 » et séparés par des « ; »
4. Les compteurs 1 à 24 sont les compteurs des touches.
5. Le compteur 25 est le compteur du nombre de cellules comptées
6. Le compteur 26 est le compteur des anomalies.
7. Le compteur 27 est le nombre de cellules à compter
8. Les compteurs 28 à 32 sont les compteurs des classes
9. puis toujours sans séparation autres que des « ; » La liste des abréviations des cellules qui se
compose de 4 lettres
10. Et enfin, le cas échéant, la date de naissance+ « ; »
Au total un fichier de résultat est une ligne composée de 268 ou 281 signes ASCII
Les abréviations ont été mis à la ligne pour la clarté de la lecture, Il n’y pas de CRLF dans les
comptages.

000 000 000 000 123; 1; 2; 3; 4; 5; 0; 1; 2; 3; 3; 2; 1; 3; 2; 1; 2; 3; 4; 4; 3; 2; 4; 5; 6; 51;


50;100; 24; 10; 11; 5; 1;
Bcou;Basy;Bepa;Bgre;Rcyt;ENTR;Cour;Angu;LoAn;Enro;LEnr;TYPI;Allo;Pyri;MicS;MicA;Amo1;Amo2;A
mo3;Vacu;AcRe;Fiso;Leuc;autr;

On peut dire que ce comptage 000 000 000 000 123 a donné :
Bcou=1, Basy=2, Bepa=3,…..51 cellules comptées, 50 anomalies, 100 cellules à comptées
24 anomalies de la tête H (ou A)
10 anomalies de la pièce intermédiaire M( ou B)
11 anomalies de la pièce principale P (flagelle) (ou C)
5 anomalies Reste cytoplasmique C (ou D)
1 cellule normale.

Remerciements
Le document de l’OMS : Examination and processing of human semen. Edition 2010
Nous tenons à remercier le Docteur J.M. Plouchart pour l’aide apporté dans ce projet.
Le Professeur Jouannet pour la mise au point du premier compteur selon David.

Documentations
Déjà cité le site : [Link]

Spermascore universel V9.1 page| 20


JP Duval 14.10.2014
Références
Kruger et coll. 1986
Menkveld et coll. 1990
Coetzee et coll. 1998

Le document de l’OMS : Examination and processing of human semen. Edition 2010


Analyse Page 67 et suivantes
TZI Page 115 et suivantes

Mot de passe du fichier .xls


sper

Mise à jour
V9.1
Mise en place de l’identification suivant le numéro de sécurité sociale, et le cas échéant la date de
naissance.

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JP Duval 14.10.2014
UTILISATION EN MODE DAVID
Le tableau Excel des Spermascore D:

Tableau 1
Attention : le tableau Excel® utilise un programme qui est considéré comme une macro. Pour
l’utiliser, Il faut autoriser les macros, vous ne risquez rien, votre ordinateur ne vas pas exploser !
Malgré les mises en garde d’Excel®

Spermascore universel V9.1 page| 22


JP Duval 14.10.2014
Utilisation du fichier Excel®
Chaque jour d’utilisation du compteur, celui-ci crée un répertoire « jj-mm-aa » sur la clé USB voir
tableau 1.
Le tableur va rechercher la clé et les répertoires en cliquant sur la date voulue, puis en cliquant sur le
fichier patient on ouvre la feuille de résultats :

Tableau 2
Pour revenir à la feuille des fichiers cliquer sur Clavier en bas à gauche.

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JP Duval 14.10.2014
Explications :
Les valeurs sont extraites de la clé USB et rangées dans les cases comme indiqué ci-dessus. Il n’est
pas possible de changer la configuration des touches sur ce compteur. Le Spermascore K (Kruger) le
permet. Les autres éléments ne s’additionnent pas au total de cellules comptées.

Ce classeur Excel® est un exemple d’utilisation, il peut être utilisé tel que ou modifié par votre service
informatique. Les données transmises sont indiquées à la fin de ce mode d’emploi.
Nous vous conseillons d’en faire une sauvegarde avant toutes modifications.
De même pour les fichiers placés dans la clé USB.

Utilisation du compteur Spermascore D


Le compteur ne peut pas fonctionner sans sa clé USB. Tous les résultats et le fichier [Link] sont
placés dans cette clé.

MENU 2
On constate que le numéro
d’identification, sur 15 chiffres, contient
des séparateurs pour plus de lisibilité.
Le menu est déroulant, on repasse de
QUITTER à reprise.
Attention QUITTER ne veut pas dire revenir
au comptage. Pour revenir au comptage il
faut passer par une des trois options :
Reprise, Suppr-1, +50.
Voir ci-dessous.

Reprise
Revient au comptage directement.

Suppr-1
Pour supprimer les 5 dernières cellules comptées dans l’ordre Dernier-Entré Premier-Sorti. En
choisissant cette option on supprime la dernière cellule entrée puis on revient au comptage.

Tot +50
Augmente le total à compter de 50 cellules. En fin de comptage, il est toujours possible de rajouter
50 cellules. Maximum 250.

Enreg/menu
Pour Enregistrer la formule en cours même si le total ne fait pas 100 ou le total décidé. Attention on
ne peut pas revenir en arrière après un enregistrement les variables de comptages sont détruites, on
peut seulement le relire, soit dans le compteur le jour même soit avec le classeur Excel.

Quitter
Attention quand on quitte, c’est définitif on ne peut pas revenir en arrière, il faut éteindre le
compteur pour redémarrer. On perd les données qui ne sont pas encore enregistrées.
_________________________

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La présentation des résultats
La taille des fichiers est d’environ 1Ko soit 1 million de dossiers pour une clé USB de 1Go
Le codage des fichiers est extrêmement simple, chaque champ est de longueur fixe et séparé par un
«;»

Lors du premier enregistrement du jour, le compteur crée un répertoire jj-mm-aa


Dans lequel on retrouve :
 Un fichier « [Link] » qui indique le nombre de dossiers lus sous la forme :
003
 Autant de fichiers que de patients nommés « [Link] » ou n va de 1 à 255 (si nécessaire de 1 à
65535 nous consulter.)
Suivi sans espaces par le contenu des compteurs formatés sur trois digits « 0» et séparés par
des « ; »:
1. Les compteurs 1 à 6 sont les compteurs des touches non comptées dans le total. Ligne 4 en
Haut.
Ensuite les enregistrements suivants se décomposent comme suit :
2. Les 5 compteurs des anomalies simples de la ligne 1 (en bas) en partant du bas et de gauche
à droite.
3. Un 0 correspondant à la touche ENTR
4. Les 5 compteurs des anomalies simples de la ligne 2
5. Un 0 correspondant à la touche non utilisée (elle peut être affectée, nous consulter)
6. Les 5 compteurs des anomalies simples de la ligne 3
7. Les 5 compteurs des anomalies associées de ligne 1
8. Un 0 correspondant à la touche ENTER
9. Les 5 compteurs des anomalies associées de la ligne 2
10. Un 0 correspondant à la touche non utilisée
11. Les 5 compteurs des anomalies associées de la ligne 3
12. L’IAM formaté sur 4 digits
13. Les spermatozoïdes normaux
14. Les atypiques
15. Le nombre de spermatozoïdes comptés
16. Et enfin, le cas échéant, la date de naissance+ « ; »

17. Au total un fichier de résultat est une ligne composée de maximum 210 signes ASCII( suivant
la présence ou non de la date de naissance)

123 456 789 012 345; 1; 2; 3; 4; 5; 6; 5; 6; 8; 15; 17; 0; 6; 8; 5; 4; 3; 0; 1; 2; 3; 4; 5; 4; 6;


8; 14; 10; 0; 6; 7; 5; 4; 3; 0; 1; 2; 3; 3; 1;2.36; 6; 39; 45;

Remerciements
Nous tenons à remercier le Professeur Jouannet à l’origine de ces compteurs.

Documentations
[Link]

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Mot de passe du fichier .xls
Le cas échéant le mot de passe est : sper

Mise à jour
V9.0
Mise en place de l’identification suivant le numéro de sécurité sociale, et le cas échéant la date de
naissance.
V9.1
Correction d’identification des clés USB

Fichiers de test
Des fichiers de test sont inclus dans les clés USB, ils peuvent être supprimé, il ne serve que pour les
essais et l’entraînement.

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JP Duval 14.10.2014

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