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Chimie Organique : Isomérie et Stéréochimie

Ce document présente les concepts clés de la stéréochimie, notamment les différents types d'isomérie (plane et spatiale) ainsi que les notions de stéréoisomères de conformation et de configuration. Il décrit également les principales représentations utilisées pour représenter les molécules dans l'espace, telles que les projections de Newman et de Fischer.

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Chimie Organique : Isomérie et Stéréochimie

Ce document présente les concepts clés de la stéréochimie, notamment les différents types d'isomérie (plane et spatiale) ainsi que les notions de stéréoisomères de conformation et de configuration. Il décrit également les principales représentations utilisées pour représenter les molécules dans l'espace, telles que les projections de Newman et de Fischer.

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Licence Génie des procédés industriels et

Digitalisation

M 14: Module de Chimie


Organique & polymères
Présenté par :
ENNAWAOUI AMINE

Tel & WhatsApp : 0662263041 Email: [Link]@[Link]


PLAN DE COURS

1 Introduction

Nomenclature en chimie
2
organique

3 Stéréochimie

4 Polymères

2
Stéréochimie

1. Isomérie plane ou isomérie de constitution


1.1. Isomérie de chaîne
1.2. Isomérie de position
1.3. Isomérie de fonctions
1.4. Isomérie d’insaturations

2. Stéréoisomérie
2.1. Stéréoisomérie de conformation
2.2. Stéréoisomérie de configuration
2.2.1. Enantiomères
2.2.2. Diastéréoisomères
3
Stéréochimie

Deux composés sont dits isomères s’ils ont la même formule brute mais une structure différente:

✓ soit par leur formule développée (isomérie de constitution)


✓ soit par leur représentation dans l’espace (stéréoisomèrie)

Il est à noter que ces isomères auront des propriétés chimiques et physiques différentes. Ex: C5H10O2

butanoate de méthyle éthanoate de propyle


Odeur de pomme Odeur de poire 4
Stéréochimie

1. ISOMÉRIE PLANE ou ISOMÉRIE de CONSTITUTION


1.1. Isomérie de chaîne ou squelette

▪ Modification des ramifications de la chaîne principale C4H10

1.2. Isomérie de position

▪ Position des insaturations C6H12

▪ Position des ramifications C6H14

▪ Position des fonctions sur une chaîne linéaire C5H10O

▪ Position des fonctions sur un noyau aromatique C7H8O


5
Stéréochimie

1.3. Isomérie de fonctions


▪ Modification d’une fonction (principale ou secondaire)

Aldéhydes et cétone C3H6O

Alcool et phénol C7H8O

1.4. Isomérie d’insaturations


▪ Modification d’une d’insaturation
Alcène et cycloalcane C3H6

6
Stéréochimie

2. STÉRÉOISOMÈRES:
Lorsqu'on considère une molécule dans l'espace à trois dimensions, de nouveaux cas d'isomérie peuvent
apparaître. On parle alors d'isomérie spatiale ou de stéréoisomérie.
On appelle stéréoisomères, des isomères qui ont la même formule développée plane mais qui diffèrent par
l'arrangement spatial (disposition géométrique) de leurs atomes.
Il existe différentes manières de représenter les stéréoisomères dans l’espace:
[Link]ésentation perspective (ou perspective cavalière) : La représentation en perspective est essentiellement utilisée
pour des molécules cycliques

2. Représentation projective ou convention de Cram :Elle consiste à représenter une liaison par convention :
Liaison dans le plan du papier :
Liaison en avant du plan du papier :
7
Liaison en arrière du plan du papier
Stéréochimie

3. Projection de Newman :
✓ Dans la représentation de Newman, la molécule est regardée dans l’axe d’une liaison simple C-C entre deux
atomes de carbone voisins. Les liaisons issues des deux atomes sont projetées sur un plan perpendiculaire à l’axe
de la liaison étudiée :
✓ Les liaisons de l’atome le plus proche (de l’observateur) sont représentées par des segments partant du même
point, formant des angles de 120°.
✓ Le second carbone (le plus éloigné de l’observateur), éclipsé par le premier, est représenté par un cercle. Les
liaisons de cet atome sont représentées par des segments s’arrêtant à la périphérie du cercle.

NB: La Projection de Newman d'un composé organique permet d'étudier ses différentes conformations (on passe d'un conformère à un
autre par rotation autour d'une liaison simple C-C) 8
Stéréochimie

4. Projection de Fisher:
✓ En projection de Fischer, les liaisons sont représentées par des traits pleins verticaux et horizontaux, selon les
conventions suivantes :
✓ Les traits verticaux représentent les liaisons en arrière du plan de la figure. Les traits horizontaux représentent les
liaisons en avant du plan de la figure. La chaîne carbonée la plus longue est placée verticalement et numérotée de
haut en bas. La chaîne de plus faible indice (le plus souvent associé au carbone le plus oxydé) est placé en haut.

NB: Cette représentation est utilisée, essentiellement en biochimie pour représenter les sucres et les acides aminés.
9
Stéréochimie

✓ Deux types de stéréo-isomères en se basant sur la facilité de leur interconversion :

Isomère de conformation : si on passe de l’un à l’autre par une


simple rotation autour d’une liaison simple (qui nécessite peu
d’énergie <30kcal)

Isomères de configuration : s’il faut rompre une liaison covalente


et en recréer une autre pour passer de l’un à l’autre (qui nécessite
plus d’énergie >30kcal).
10
Stéréochimie

2.1. Isomérie de conformation


Des stéréoisomères de conformation ont la même formule développée, la même formule semi-développée, mais
on peut passer de l’un à l’autre par rotation autour d’une ou de plusieurs liaisons simples

Libre rotation autour des liaisons C-C


Infinité de structures pour cette molécule obtenue par rotation autour de la liaison C-C = conformères.

La conformation d'une molécule est la forme qu'elle prend dans l'espace selon certains critères
(Haworth 1929):
✓ les longueurs des liaisons l,
✓ les angles de flexion φ,
✓ les angles dièdres de rotation (θ) autour des liaisons simples.
Remarques :
- la stéréoisomérie de conformation se rencontre couramment pour des liaisons simples C-C autour des quelles il y a rotation.
- une liaison C=C est « verrouillée », on n’a pas de libre rotation donc pas de stéréoisomères de conformation. 11
La conformation d'une molécule est la forme qu'elle
prend dans l'espace selon certains critères (Haworth
1929):
✓ les longueurs des liaisons l,
✓ les angles de flexion φ,
✓ les angles dièdres de rotation (θ) autour des
liaisons simples.

12
Stéréochimie

▪ On peut représenter les molécules isomères de conformation vues suivant l’axe C-C ou en utilisant une
représentation de Newman.
▪ On trace des diagrammes énergétiques E=f(α), α étant l’angle de rotation autour de la liaison simple C-C.

✓ 1ère règle (prioritaire): les formes décalées sont plus stables que les formes éclipsées : les formes décalées ont

toujours une plus faible énergie que les formes éclipsées.

✓ 2ème règle : parmi des formes décalées ou des formes éclipsées, les formes où les groupements sont face à face

sont défavorables, les formes où les groupements sont les plus éloignés sont favorables ; les formes où les

groupements sont les plus éloignés ont une énergie plus faible que les formes où les groupements sont face à

face.
13
Stéréochimie

Exemple 1: L’éthane C2H6 CH3- CH3 Représentation de Newman

Forme éclipsée
moins stable

Forme décalée
plus stable

14
Stéréochimie

Exemple : Le butane C4H10 CH3- CH2- CH2 –CH3

Isomères de conformation du butane vus pour divers


Energie en fonction de α pour le butane
angles α dans l’axe C-C
Selon les différentes positions des groupements, on parle de conformations. Ces conformations sont comme des clichés de la
molécule à des instants particuliers; les atomes étant en perpétuelle rotation.
Les conformations a, c et e sont appelées conformations éclipsées. Les conformations b, d et f sont appelées conformations
15
décalées.
Stéréochimie

2.2. Isomérie de configuration


Des stéréoisomères de configuration ont la même formule semi-développée mais on ne peut pas passer de l’un à l’autre par
simple rotation autour d’une ou de plusieurs liaisons simples. Ce sont des espèces isolables qui possèdent des propriétés
physico-chimiques différentes. Pour passer d’une configuration à une autre, il faudrait rompre des liaisons, ce qui
demanderait beaucoup d’énergie.
Remarque importante :
✓ Pour passer d’un stéréoisomère de configuration à un autre, on doit rompre des liaisons.
✓ Sur une représentation de Cram, on passera d’un stéréoisomère à un autre en permutant deux groupes d’atomes.

On distingue deux types de stéréoisomères de configuration :

1. les énantiomères

2. les diastéréoisomères 16
Stéréochimie

2.2.1. Énantiomérie :
A. La chiralité

Un objet qui n’est pas superposable à son image dans un miroir (image spéculaire) est dit chiral. Dans le cas
contraire, il est achiral. (cheir = main en grec, exemple de la main)

Par analogie, si une molécule n’est pas superposable à son image dans un miroir, on dit qu’elle est chirale. La
molécule et son image forme alors un couple d’énantiomères
17
Stéréochimie

B. molécule présentant un carbone asymétrique


Une molécule présentant un carbone asymétrique C* aura forcément 2 énantiomères

C. molécule présentant deux carbones asymétriques


Une molécule présentant deux carbones asymétriques peut présenter deux couples d’énantiomères

Le 2,3,4-trihydroxybutanal présente deux


couples d’énantiomères

➢ Une molécule chirale ne contient donc pas obligatoirement de carbone asymétrique.


18
Stéréochimie
D. Conditions de chiralité:
Une molécule est chirale si elle ne possède pas d’élément de symétrie Sn , c’est-à-dire si elle n’est pas identique à elle-même
après rotation de 2π/n autour d’un axe, suivie d’une symétrie plane par rapport à un plan orthogonal à cet axe (condition
nécessaire et suffisante).
✓ En pratique:
✓ Condition nécessaire mais non suffisante : une molécule chirale ne possède ni plan ni
centre de symétrie (si une molécule possède un plan ou un centre de symétrie alors elle
n’est pas chirale).
✓ Condition suffisante de chiralité (mais non nécessaire) : une molécule possédant un seul
C* est une molécule chirale.

Remarque : si plusieurs C* dans une molécule, elle peut ne pas être chirale

2 carbones asymétriques plan de symétrie Molécule achirale

19
Stéréochimie

E. Mélange racémique

Un mélange racémique est un mélange équimolaire de deux énantiomères

F. Propriétés physiques et chimiques des énantiomères

✓ Des énantiomères ont des propriétés physiques identiques.


✓ Des énantiomères ont des propriétés chimiques identiques tant que le réactif ou le phénomène est achiral.
✓ Des énantiomères n’ont pas les mêmes propriétés biologiques

20
Stéréochimie

E) Règles de Cahn-Ingold-Prelog (C.I.P.)


La façon dont les énantiomères s'organisent dans l'espace permet d'attribuer par convention une configuration dite absolue à chacun d’eux. Ces
configurations sont dites le plus souvent R (rectus) ou S (sinister).
Dans tous les cas, la nature de la configuration adoptée par convention, sur la base d'un classement par rang de priorité des substituants (règles
de Cahn, Ingold et Prelog), est indépendante du pouvoir rotatoire mesuré expérimentalement (un énantiomère de configuration S peut être
lévogyre ou dextrogyre et inversement).

Les règles qui permettent de déterminer l'ordre de priorité des quatre substituants sont les suivantes :
✓ La priorité des atomes diminue avec leur numéro atomique Z (Br>F>C>H).
✓ Pour deux atomes isotopes, la priorité diminue avec la masse (D>H).
✓ Si les atomes directement attachés à un centre chiral sont identiques, on compare alors les atomes de 2ème rang.

Exemple de 2-
chloropropanol

21
Si c'est nécessaire, on considérera les atomes en 3ème, 4ème position…
Stéréochimie

22
Stéréochimie

Les doubles ou triples liaisons sont décomposées en 2 ou 3 liaisons simples.

F) Détermination de la configuration absolue :


Les quatre substituants 1, 2, 3, 4, de l'atome de carbone asymétrique (C*) sont placés par ordre de priorité décroissante: 1 > 2 >
3 > 4.
L'observateur étant placé de façon opposée à la liaison C*-4 :
✓ Si l’ordre de priorité des groupes 1 → 2 → 3 suit la rotation des aiguilles d’une montre, la configuration est R (rectus,
latin, droit).
✓ Si l’ordre de priorité suit la rotation inverse des aiguilles d’une montre, la configuration est S (sinister, latin, gauche).
✓ Le symbole est ajouté sous forme de préfixe au nom de la molécule.

23
Stéréochimie

La détermination des configurations absolues R et S peut se faire directement sur la projection de Fischer.

Pour cela il faut suivre les règles suivantes :


✓ 1er cas: 4 se trouve en position verticale, le sens de rotation 1 → 2 → 3 donne directement la configuration
absolue.
✓ 2ème cas : 4 se trouve en position horizontale, la séquence 1 → 2 → 3 indique l'inverse de la configuration
absolue. 1er cas: 4 en verticale 2eme cas: 4 en horizontale

4 4

3 2
A: Configuration R B: Configuration S A: Configuration S B: Configuration R

24
Stéréochimie

2.2.2. Diastéréoisomèrie:
A. Définitions

Deux diastéréoisomères sont deux molécules stéréoisomères qui ne sont pas des énantiomères (ne sont pas images l’une de l’autre dans un
miroir). Les diastéréoisomères, à la différence des énantiomères, ne possèdent pas les mêmes propriétés physico-chimiques ; ils peuvent
donc être plus facilement séparés par distillation, recristallisation ou chromatographie.

B. Diastéréoisomères de configuration dans le cas de liaisons simples C-C

Diastéréoisomères du 2,3,4-trihydroxybutanal 25
Stéréochimie

C. Diastéréoisomères de configuration Z et E dans le cas d’une liaison double C=C

▪ La présence d'une double liaison C=C (éthylénique), C=N (imine…) ou N=N (diazonium) empêche la rotation des deux atomes l'un par
rapport à l'autre. Par conséquent, si chacun de ces deux atomes porte 2 groupements différents, il peut exister deux configurations distinctes
appelées stéréoisomères géométriques ou diastéréoisomères de type Z/E.

▪ Pour les nommer, on utilise les règles (C.I.P) qui permettent de classer les groupements sur chaque carbone :
✓ Un stéréo (ou diastéréo)isomère Z (de l’allemand zusammen= ensemble) a ses groupements les plus importants du même côté de l’axe
C=C
✓ Un stéréo (ou diastéréo)isomère E (de l’allemand entgegen= opposé) a ses groupements les plus importants de chaque côté de l’axe C=C

a et a’ sont les deux groupements


prioritaires

NB: De manière générale, les configurations Z sont plus rares car les groupements prioritaires (souvent les plus volumineux) sont déstabilisés par leur
26
encombrement stérique.
Stéréochimie

Exemple : L’acide maléïque et l’acide fumarique sont deux diastéréoisomères de configuration Z et E. Ce sont tous deux des diacides
carboxyliques de même formule semi-développée : HOOC - CH = CH – COOH

L’isomère Z est l’acide maléïque et l’isomère E est l’acide fumarique dont les formules développées sont les suivantes :

acide maléïque (isomère Z) acide fumarique (isomère E)

D) Isomérie cyclanique Cis/Trans :

La diastéréoisomérie cis-trans est utilisée dans les composés cycliques qui portent deux substituants R identiques. Elle repose sur la position
relative des deux substituants :
✓ Si les 2 substituants se trouvent du même côté d'un plan défini par le cycle ; il s’agit de l’isomère " Cis".
✓ Si les 2 substituants se trouvent de part et d'autre du plan du cycle ; c’est l’isomère " Trans ".

E. Propriétés physiques et chimiques des diastéréoisomères


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Des diastéréoisomères ont généralement des propriétés physiques, chimiques et biologiques différentes.
Stéréochimie

Exercices d’Isomérie et stéréoisomérie

Configuration des molécules en chimie organique

✓ Isomères de constitution
✓ Identification du carbone asymétrique
✓ Classification selon la règle de C.I.P
✓ Configuration absolue R ou S
✓ Enantiomères & Diastéréoisomères

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Stéréochimie

Exercice N°1: Isomères de constitution


Représenter tous les isomères de constitution de formule moléculaire (ou brute) suivante (calculer le nombre d’insaturation de
chaque molécule) :

a) C5H12 b) C4H10O c) C3H9N

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Stéréochimie

Exercice N°2: Identification du carbone asymétrique


Parmi les molécules suivantes, quelles sont celles qui possèdent un ou plusieurs carbones asymétriques ?

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Stéréochimie

Exercice N°3: Classification selon la règle de C.I.P


Selon la règle séquentielle de Cahn-Ingold-Prelog, quel est l’ordre de priorité des substituants suivants :
a. -OH -OCH3 -CH3 -CH2OH
b. -CN -NHCH3 -CH2NH2 -NH2
c. -COOH -COCH3 -CHO -CONH2
d. -NH2 -SH -OCOCH3 -CCl3

31
Stéréochimie

Exercice N°4: Configuration absolue R ou S


Indiquer le stéréodescripteur de chacun des 5 composés suivants :

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Stéréochimie

Exercice N°5: Enantiomères & Diastéréoisomères


Quelles sont les molécules énantiomères et celles qui sont diastéréoisomères?
1 2 3 1 2 3
F F F
Cl Br Cl Br Br Cl Br Br Br Br
C C C
C C C
Br Cl Cl Br Cl Br Br
F F F Br

33

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