REPUBLIQUE ALGERIENNE DEMOCRATIQUE ET POPULAIRE

Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique

UNIVERSITE D’ALGER 1
FACULTE DE MEDECINE D’ALGER

1ère année médecine

BIOCHIMIE Structurale et Métabolique

Dr. Linda DOUAIBIA

 Introduction générale
 Le métabolisme correspond à l’ensemble des réactions biochimiques qui se
produisent au sein d’une cellule, et qui permettent la réalisation de multiples
travaux cellulaires.

 Le métabolisme se divise en deux types de voies :

- Anabolisme : correspond aux synthèses.
- Catabolisme : correspond aux dégradations.

 Il existe plusieurs voies du catabolisme cellulaire : la glycolyse , le cycle de

Krebs ,La néoglucogenèse …
 L’étude du métabolisme des glucides s’appuie essentiellement sur celui du
glucose.
 La connaissance des bases biochimiques du métabolisme glucidique permet
de comprendre le mécanisme de nombreuses maladies comme le diabète,
l’intolérance au lactose ou au fructose, la galactosémie, les glycogénoses,… 2
 PARTIE II – METABOLISME DES GLUCIDES

CHAPITRE 1 :
LA GLYCOLYSE

3
 Source du glucose
Alimentation :
Réserves :Glycogène
Polysaccharide : amidon
Disacharide :lactose …
Sang

Perméase
Ex: GLUT

Glucose
Cellule

4
Digestion et absorption des glucides

5
Digestion et absorption des glucides

6
7
Comment les cellules dégradent le
glucose afin de récupérer de
l’énergie directement utilisables ?

8
9
 LA GLYCOLYSE
1. Définition
2. Localisation
3. Intérêts
4. Vue d’ensemble
5. Étapes de la glycolyse
6. Bilan énergétique
7. Régulation
8. Pathologies

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 1. Définition
 La glycolyse = voie d’EMBDEN MEYERHOFF-PARNAS
 La voie du catabolisme oxydatif anaérobie du glucose (C6) en
Pyruvate (C3)

Enlèvement d’atome
d’hydrogène qui sont Elle ne nécessite pas
pris en charge par le d’O2
NAD+

glycolyse dérive de la racine greque gluk : sucrée, et lysis dissolution en d’autre terme il s’agit
de la dégradation du glucose

 Elle concerne aussi bien les eucaryotes que les procaryotes.

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 2. Localisation
 Elle a lieu dans toutes les cellules de l’organisme mais à
des degrés divers.

 Elle est cytosolique.

 Les GR et le cerveau : tissus glucodépendants (n’utilise

que le glucose).

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Cellule

Chaine
respiratoire
Glycolyse

Cytosol TCA

ATP ATP ATP

13
3. Intérêt

14
 4-Vue d’ensemble de la Glycolyse
 La glycolyse est une série de 10 réactions enzymatiques
catalysées par 10 enzymes.

 Elles sont toutes localisées dans le cytosol.

 La glycolyse est divisée en deux grandes phases :

o Une phase d’investissement énergétique avec
utilisation de 2 ATP.
o Une phase de retour sur investissement avec
production d’ATP et de NADH,H+.
15
4-Vue d’ensemble de la Glycolyse

16
5 -Étapes de la Glycolyse

1 . Activation du
Glucose
- Activation du glucose : augmente sa réactivité chimique et
l’empèche de quitter la cellule
- Irréversible , site de régulation de la glycolyse.
- L'hexokinase (HK): enzyme ubiquitaire qui phosphoryle les
hexoses. Dans le foie, elle porte le nom de glucokinase et
elle phosphoryle uniquement le glucose.
- Consomme 1 ATP.
17
5-Étapes de la Glycolyse

2. Isomérisation du
G6P
- Réversible.
- Interconversion du glucose-6-P
(Aldose) en fructose-6-P (Cétose).
- Catalysée par la Phosphohexose
isomérase.
18
5-Étapes de la Glycolyse

3. Formation du
Fructose-1,6-
- Irréversible, étape majeure de la régulation de
biphosphate
la glycolyse.
- Catalysée par la PFK-1 (enzyme allostérique
composée de 4 sous-unités identiques).
- Phosphorylation sur le C1 du F6P en F1,6BP.
- Consomme 1 ATP.
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5-Étapes de la Glycolyse

4. Formation des
trioses phosphates - Réversible.
- Catalysée par la F1,6BP Aldolase.
- Formation de 2 trioses :
- 1 Cétose le Dihydroxyacétone
Phosphate(DHAP).
- 1 Aldose le Glycéraldéhyde-3-Phosphate
(GA3P).
20
5-Étapes de la Glycolyse

5. Isomérisation des
trioses phosphates
- Réversible
- Isomérisation d’une cétose (DHAP) en une
aldose (G3P)
- Catalysée par la Triose phosphate
isomérase.
21
5-Étapes de la Glycolyse

Phase
d’investissement
énergétique

1 Glucose (C6) → → → → → 2 G3P

2 ATP 2 ADP 22
5-Étapes de la Glycolyse

6. Formation du 1,3-
biphosphoglycérate - Réversible
- Catalysée par la GA3P Déshydrogénase à
coenzyme NAD+.
- Oxydation couplée à la phosphorylation
du GA3P en 1,3BPG, ce qui crée une liaison
anhydride d’acide riche en énergie.
- Formation d’un NADH,H+.
23
5-Étapes de la Glycolyse

7. Formation du 3
phosphoglycérate
- Réversible.
- Catalysée par la Phosphoglycérate Kinase.
- Production d’1 ATP.

24
5-Étapes de la Glycolyse

8. Formation du 2
phosphoglycérate -Réversible.
- Catalysée par la Phosphoglycérate
mutase.
- Isomérisation du 3PG en 2PG par
déplacement intramoléculaire du
phosphate
25
5-Étapes de la Glycolyse

9. Formation du
phosphoenolpyruvate
- Réversible.
- Catalysée par l’énolase ( inhibée par les
fluorures)
- Formation du PEP par déshydratation du 2PG
avec
acquisition d’une liaison à haut potentiel d’énergie
au niveau du C2. 26
5-Étapes de la Glycolyse

10 . Formation du
pyruvate
- Irréversible, étape majeure de la
régulation de la glycolyse.
- Catalysée par la Pyruvate Kinase à
co-facteur Mg2+.
- Production d’1 ATP. 27
 Oxydation des trioses en pyruvate
5-Étapes de la Glycolyse

Phase de retour sur

investissement
énergétique

2 G3P (C3) → → → → → 2 Pyruvate (C3)

4 ATP + 2 NADH,H+ 28
 1. Activation du
Glucose en G6P

2. Clivage du fructose
1,6bisphosphate en 2
Trioses

3. Oxydation des
Trioses en
pyruvate
et production
d’énergie

29
 6. Bilan énergétique

Réaction enzymatique Bilan

1. Hexokinase - 1 ATP
3. Phosphofructokinase - 1 ATP
6. G3P déshydrogénase + 2 NADH,H+
7. Phosphoglycérate kinase + 2 ATP
10. Pyruvate kinase + 2 ATP

TOTAL 2 ATP + 2 NADH,H+

30
6. Bilan énergétique

31
REMARQUE

32
 7. Régulation de la Glycolyse
 La régulation de la glycolyse permet d’adapter la vitesse
d’oxydation du glucose aux besoins de la cellule en :
 ATP (Energie).
 Intermédiaires précurseurs de synthèse.

 Dans la glycolyse, les réactions catalysées par :

Hexokinase(HK)/ Glucokinase (GK), Phosphofructokinase
1 (PFK1), pyruvate kinase (PK) sont irréversibles → sites
de contrôle.

33
7. Régulation de la Glycolyse

34
7. Régulation de la Glycolyse

Sites de contrôle

35
1. Héxokinase

 L’héxokinase est une enzyme ubiquitaire inhibée par

son produit de réaction ( G6P)

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1.Héxokinase / Glucokinase
Héxokinase Glucokinase

Ubiquitaire Foie

Glucose Glucose
↓ ↓
G6P G6P
↓ ↓
Energie Glycogène

Km faible: 0,1mmol/l Km élevée: 10mmol/l

(forte affinité pour le (faible affinité pour le
glucose) glucose)

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2. Phosphofructokinase 1 (PFK1)
Déplétion énergétique

Besoins énergétiques
satisfaits

38
3. Pyruvate kinase

Besoins énergétiques
satisfaits

39
 Hypoglycémie
3. Pyruvate kinase .Contrôle hormonal Glucagon
P
Pyruvate kinase
(moins active)

H2O
ADP
Hyperglycémie Pi
ATP
Insuline Pyruvate kinase
(plus active)

PEP + ADP + H+ →→→ Pyruvate + ATP

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 8-Les pathologies liées à la glycolyse
Anémie hémolytique due à un déficit en pyruvate kinase du globule rouge
GR ne possède pas de
mitochondrie

Définition Dépend exclusivement de

L'anémie hémolytique la glycolyse pour leur
due à un déficit en approvisionnement en ATP
pyruvate kinase (PK)
érythrocytaire est une Déficit en PK Méthode(s) diagnostique(s)
maladie métabolique production, d ATP
caractérisée par une insuffisante La mesure de l'activité
anémie hémolytique enzymatique de la PK ;
chronique non Membrane se déforme L'analyse moléculaire.
sphérocytaire de sévérité
variable. Gr phagocyte par les
macrophage de la rate

Anémie hémolytique
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 Cytosol
Cellule

Chaine
respiratoire
Glycolyse
TCA

? NADH ATP

? Pyruvate ATP ATP

Chapitre 2 : Devenir du Pyruvate et NADH

42
 1-Devenir du NADH,H+

 La poursuite de la glycolyse exige la réoxydation du NADH,H+ en

NAD+:
- En anaérobiose : dans le cytosol (voir fermentation
lactique ou alcoolique).
- En aérobiose : dans la mitochondrie, le NADH,H+ est
réoxydé par la chaine respiratoire et les oxydation
phosphorylantes avec production d’ATP.
43
 1-Devenir du NADH,H+

La reoxydation du NADH,H+ par la chaine respiratoire et les

oxydation phosphorylantes avec production d’ATP.
44
 1-Devenir du NADH,H+
a. Fermentation lactique
Lorsque la cellule ne dispose pas de mitochondries (cas des
hématies), ou est privée d’oxygène (anaérobiose), Le Pyruvate est
réduit en lactate par la lactate déshydrogénase (LDH) ce qui permet
de réoxyder le NADH,H+ en NAD+ (régénération du NAD+)

En
Anaérobie

LDH

45
 1-Devenir du NADH,H+
b. Fermentation alcoolique
La fermentation alcoolique se rencontre dans les levures
Le Pyruvate est décarboxylé en acétaldéhyde par la Pyruvate
décarboxylase. L’acetaldehyde est réduit en alcool ou éthanol
par l’alcool déshydrogénase avec réoxydation du NADH,H+
formé dans la glycolyse et régénération de NAD+.
En
Anaérobie

46
 1-Devenir du NADH,H+
 Le NADH,H+ cytosolique ne pouvant traverser la membrane
externe mitochondriale, ses équivalents réducteurs sont pris en
charge par 2 navettes qui les font passer du compartiment
cytosolique vers le compartiment mitochondriale.
- La navette du glycérol 3 phosphate : dans les muscles et le
cerveau.
- La navette malate – aspartate : dans le coeur, le foie et les
reins.
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 Cytosol
Cellule
Glucose
Chaine
respiratoire
NADH

Pyruvate

Devenir du NADH
48
 1-Devenir du NADH,H+
a. La navette du glycérol 3 phosphate

G3PDH c G3PDH m

- 1 NADH,H+ → 1FADH2
→ 2ATP
- Energétiquement
moins avantageuse.
- plus rapide
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 1-Devenir du NADH,H+
b. La navette Malate – Aspartate

MDH c MDH m

- 1 NADH,H+ → 1NADH,H+ → 3ATP

- Energétiquement plus avantageuse.
- Moins rapide
50
 2-Devenir du Pyruvate
Le pyruvate est le substrat :

 En anaérobiose, de la fermentation lactique

ou alcoolique (chez certaines levures).
 En aérobiose de la décarboxylation Anaérobi Anaérobi
oxydative en acétyl Co-A qui : e Aérobie e

- ou bien est le substrat des voies

anaboliques (ex synthèse des acides gras)
- ou bien entre dans le cycle de
l’acide citrique (cycle de Krebs).

51
2- Devenir du Pyruvate

Acetyl CoA

52
 2-Devenir du Pyruvate
Formation de l’Acétyl-CoA : En aérobie
 Le pyruvate entre dans la mitochondrie grâce à une perméase
 La réaction de décarboxylation oxydative du pyruvate en
acétylCoA est catalysée par la pyruvate déshydrogénase;
complexe multienzymatique :

3 enzymes: - E1 : Pyruvate déshydrogénase (décarboxylase)

- E2 : Dihydrolipoyl transacétylase
- E3 : Dihydrolipoyl déshydrogénase

5 co-enzymes: - Thiamine pyrophosphate (TPP) (vitamine B1) : coenz de E1

- Coenzyme A (CoA) (vitamine B5) : coenzyme de E2
- Lipoate: coenzyme de E2
- FAD (vitamine B2) et NAD (vitamine PP) : coenzymes de E3
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 Formation de l’Acétyl-CoA
Cytosol
Cellule

Pyruvate Acétyl - CoA

E1 E2 E2

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Formation de l’Acétyl-CoA
 Le pyruvate entre dans la mitochondrie grâce à une perméase
 La réaction de décarboxylation oxydative du pyruvate en
acétylCoA est catalysée par la pyruvate déshydrogénase;
complexe multienzymatique :

 3 enzymes
 5 co-enzymes

55
Formation de l’Acétyl-CoA

56