MICROBIOLOGIE GENERALE

Niveau 2, Biologie
Professeur Martin Luther KOANGA MOGTOMO
Professeur Rosalie Annie NGONO NGANE
Professeur Laurette EKOUE - NGO NKOT
Mme Rébecca Madeleine EBELLE ETAME

0
BIO 214 : MICROBIOLOGIE GENERALE
(CM : 25H, TD : 10H, TP : 10H, TPE : 05H)

VIROLOGIE Pr Martin Luther KOANGA MOGTOMO (MC)

PARASITOLGIE Pr Rosalie Annie NGONO NGANE (Pr)
BACTERIOLOGIE Pr Laurette EKOUE- NGO NKOTT (MC)
MYCOLOGIE Rébecca Madeleine EBELLE ETAME (CC)

Pré requis : Organisation structurale et fonctionnelle de la cellule, Organisation

moléculaire de la cellule

Objectif général : Présenter les différents groupes d’organismes eucaryotes et

procaryotes et de dégager leurs caractères distinctifs, connaitre les agents
antimicrobiens, ainsi que la relation entre les microorganismes et leur
environnement. Maîtriser la structure, la nomenclature, la classification et les
techniques d’étude des microorganismes.

TRAVAUX PRATIQUES

1. Bactériologie, Mycologie
Règles de sécurité
Le matériel de la salle de travaux pratiques de microbiologie et consommables
Technique d’identification et de destruction
Milieu de culture et techniques d’ensemencement des microorganismes
Techniques d’isolement et de dénombrement des bactéries et levures.
2. Parasitologie
Parasitoses du péril fécal : Identification et symptômes.
3. Virologie :
Virus, culture virale et les effets cytopathiques
Le diagnostic virologique.

FICHE DE PROGRESSION
1
PARTIE VIROLOGIE

SEQUENCES THEMES DEVELOPPES DUREE

SEQUENCE 1 I. Généralités sur les virus 2h

SEQUENCE 2 II. Virus et structure 2h

SEQUENCE 3 III. Virus classification et nomenclature 2h

SEQUENCE 4 TD : Microscopie et étude des virus 2h30
SEQUENCE 5 TPE1 : les Mimivirus 2h30
TPE2 : Les Mégavirus
SEQUENCE 6 Travaux Pratique : Etude des virus en laboratoire 2h30
TP1 : Le laboratoire de virologie
TP2 : Virus et culture des virus
TP3 : Le diagnostic virologique

PARTIE PARASITOLOGIE
SEQUENCES THEMES DEVELOPPES DUREE
SEQUENCE 1 I. Définitions 2h
II. Diversité et Spécificité
SEQUENCE 2 III. Types de transmission 2h
IV. Localisation du parasite chez l’hôte
SEQUENCE 3 V. Interaction hôte parasite 2h
VI. Classification des parasites
SEQUENCE 4 VII. Traitement 3h
VIII. Exemple de parasitose et espèces parasitaires associées
IX. Etude de deux cycles directs courts

PARTIE BACTERIOLOGIE
SEQUENCES THEMES DEVELOPPES DUREE
1. Définitions
SEQUENCE 1 : 2. Morphologie et structure de la cellule bactérienne
2.1 Généralités
2.2 Morphologie générale des bactéries CM : 4h

2
 2. 3 Structure de la cellule bactérienne
3. Nutrition bactérienne
3.1 Besoins élémentaires des bactéries
3.2 Besoins énergétiques
3.3 Types nutritionnels ou trophiques
3.4 Besoins spécifiques : facteurs de croissance
4. Croissance des bactéries
4.1 Techniques de mesure de la croissance
SEQUENCE 2 : 4. 2 Croissance en milieu non renouvelé ou croissance
discontinue ou en batch
4.3 Phénomène de diauxie (croissance biphasique ou CM : 4h
croissance double)
4.4 Croissance en milieu renouvelé : croissance continue
4.5 Facteurs influençant la croissance bactérienne
5. Agents antimicrobiens
5.1 Définitions
5.2 Agents physiques
5.3 Agents chimiques
SEQUENCE 3 : 6 Aperçu du rôle des bactéries CM : 4h
6.1 Bactéries et environnement
6.2 Bactéries et santé
6.3 Bactéries et agriculture
6.4 Bactéries et industrie

PARTIE MYCOLOGIE
SEQUENCES THEMES DEVELOPPES DUREE
SEQUENCE 1 I. Morphologie des Champignons 2h
SEQUENCE 2 II. Mode de vie des champignons 2h
SEQUENCE 3 III. Mode de reproduction des champignons 2h

SEQUENCE 4 IV. Classification des champignons 2h

SEQUENCE 5 V. Intérêt des champignons 2h

3
SOURCES DOCUMENTAIRES

PARTIE VIROLOGIE

1. A. Le Faou. Précis de virologie humaine. 2012. Collection : Biosciences et techniques

Éditeur : DOIN

2. Hervé Fleury. Virologie humaine. 2009. 5ème édition Collection : Abrégés connaissances et
pratique. Editeur : ELSEVIER / MASSON

PARTIRE PARASITOLOGIE

1. Cours d’Introduction générale du Dr PHETSOUVANH Rattanaxay. Centre National de

Malaria - Parasitologie – Entomologie. Ventiane -Laos, 2002.
2. Parasitologie- Mycologie DCEM Polycopie de Pr H Pelloux, Dr MP BrenierPinchart, Dr
D Maubon. Université Joseph Fourrier, Scoences Technologie Santé, 2011.
3. Paristologie médicale. Généralités et définitions. Support de cours Université médicale
virtuelle francophone, 2009.
4. Parasitologie- Mycologie DCEM1 Polycopie de Ermanno CANDOLFI, Denis FILISETTI,
Valérie LETSCHER – BRU, Odile VILLARD, Jocelyn WALLER. Université Louis Pasteur
De Strasbourg, Institut De Parasitologie Et De Pathologie Tropicale, 2007.
5. Parasitologie Médicale, Généralités et définitions. Support de cours en ligne de l’Université
Médicale Virtuelle Francophone, 2008-2009.
6. Cours de parasitologie-Mycologie, Institut de parasitologie et pathologie tropicale, Université
Louis Pasteur de Strasbourg
7. Parasitologie médicale cours, WEB 2009
8. Perry J. J., Staley J. T., Lory S., “Microbiologie,’’ Dunod, Paris 2004
9. Sites web de parasitologie
10. Biologie (parasitologie) de troisième Secondaire MINESEC

PARTIE BACTERIOLOGIE
1. Microbiologie. 2013. The French edition copyright, by De Boeck Supérieur. Prescott | Willey |
Sherwood | Woolverton, Traduction de Jacques Coyette et Max

4
PARTIE MYCOLOGIE
Steven D. Harris . (2008). Branching of fungal hyphae: regulation, mechanisms and comparison
with other branching systems. Mycologia 100: 823-832

Alexopoulos, C. J. ; Mims, C. W. et Blackwell, M. (1996). Introductory mycology. In John

Wiley and Sons. 869 pp. University of Georgia, Athens, GA, USA. ISBN : 0471522295

Aaron M. Neiman (2011). Sporulation in the Budding YeastSaccharomyces cerevisiae. Genetics,

Vol. 189, 737–765

Piskur J, et al. (2006) How did Saccharomyces evolve to become a good brewer? Trends Genet
22(4):183-6

Joffin J.N., Leyral G., [Link] Technique. Tome 1 Dictionnaire des

[Link]émie de bordeaux et crdp d’Aquitaine, 171-189.

Santos, J. E. P.; Mena, H.; Huber, J. T.; Tarazon, M., 2005. Effects of source of gossypol and
supplemental iron on plasma gossypol in Holstein steers. J. Dairy Sci., 88 (10): 3563-3574

Tamokou JD, Mbaveng TA, Kuete V. (2017) Antimicrobial activities of African medicinal spices
and vegetables. In: Medicinal Spices and Vegetables from Africa: Therapeutic Potential against
Metabolic, Inflammatory, Infectious and Systemic Diseases, 1st Edition, Elsevier, Chapter 8,
Pp207-23

5
SOMMAIRE
FICHE DE PROGRESSION ............................................................................................................. 1
SOURCES DOCUMENTAIRES ...................................................................................................... 4
SOMMAIRE ...................................................................................................................................... 6
PARTIE I : VIROLOGIE .................................................................................................................. 7
I. GENERALITE SUR LES VIRUS ............................................................................................. 7
I.1 INTRODUCTION ................................................................................................................ 7
I.2. CARACTERISTIQUES DES VIRUS ................................................................................ 8
I.3. INFECTION ET MALADIE VIRALES ........................................................................... 12
I.4. FACTEURS DEFENSIFS ANTIVIRAUX ...................................................................... 12
II. VIRUS ET STRUCTURE ...................................................................................................... 14
II.1. STRUCTURE GENERALE ............................................................................................ 14
III. CLASSIFICATION ET NOMENCLATURE ....................................................................... 16
III.1 CLASSIFICATION DES VIRUS ................................................................................... 16
III.2. NOMENCLATURE DES VIRUS.............................................................................. 17
IV. TECHNIQUES D'ETUDE DES VIRUS ............................................................................... 18
IV.I. LE MICROSCOPE OPTIQUE ....................................................................................... 18
[Link]. LES MICROSCOPES ELECTRONIQUES .................................................................. 20
TRAVAUX PERSONNELS DE L’ETUDIANT ........................................................................ 22
TPE 1 : LES MIMIVIRUS ...................................................................................................... 22
TPE 2 : LA FAMILLE DES MEGAVIRIDAE (Megavirus chilensis) ................................... 24
PARTIE II. PARASITOLOGIE ...................................................................................................... 26
INTRODUCTION ....................................................................................................................... 26
I. DEFINITIONS ......................................................................................................................... 26
II. DIVERSITE ET SPECIFICITE .............................................................................................. 27
III. TYPES DE TRANSMISSION .............................................................................................. 29
IV. LOCALISATION DU PARASITE CHEZ L’HOTE ............................................................ 30
V. INTERACTIONS HOTE-PARASITE ................................................................................... 31
VI. CLASSIFICATION DES PARASITES ................................................................................ 34
VIII. EXEMPLE DE PARASITOSES ET ESPECES PARASITAIRES ASSOCIEES ............. 39
IX. CYCLES ETUDIES (Cycle Direct Court) ............................................................................ 41
PARTIE III. BACTERIOLOGIE .................................................................................................... 44
1. DEFINITIONS ........................................................................................................................ 44
2. MORPHOLOGIE ET STRUCTURE DE LA CELLULE BACTERIENNE .......................... 44
3. NUTRITION BACTERIENNE ............................................................................................... 54
4. CROISSANCE DES BACTERIES ......................................................................................... 56
4. AGENTS ANTIMICROBIENS .............................................................................................. 60
FICHE DE TD ............................................................................................................................. 64
PARTIE IV. MYCOLOGIE ............................................................................................................ 69
INTRODUCTION ....................................................................................................................... 69
III. MODE DE REPRODUCTION ............................................................................................. 73
IV. CLASSIFICATION DES CHAMPIGNONS ........................................................................ 77

6
PARTIE I : VIROLOGIE
Pr KOANGA MOGTOMO MARTIN LUTHER
(Charge horaire: CM 06 h, TD 02h30 h, TP 02h30, TPE 02h30)

Objectifs : A la fin de ce cours, l’étudiant sera capable de connaître :

1. Les généralités sur les virus
2. La structure des virus
3. La classification et la nomenclature des virus

I. GENERALITE SUR LES VIRUS

I.1 INTRODUCTION

L’existence d’agents infectieux particuliers responsables des maladies chez les êtres vivants
(animaux et plantes des différents), a été démontrée au cours du siècle dernier. E effet, à la
différence des microorganismes déjà connus, ces agents infectieux nouveaux, ne sont pas visibles
au microscope optique et moins encore cultivables dans les milieux de nutritifs de cultures
classiques.
En 1881, Louis Pasteur fut le premier à reproduire in vivo la pathologie rabique par injection du
fluide biologique recueilli du tissu nerveux d’animaux morts de rage. L’inoculât était stérile d’un
point de vu microbiologique, par l’absence de microbe visibles au microscope. Il recherchât sans
succès l’agent étiologique de la rage dans le matériel biologique pathogène. En conclusion, son
intuition l’a conduit à conclure que ces agents infectants étaient très petits pour être observés au
microscope.
En 1892, le botaniste Russe, Iwanowski démontre que le filtrat de plantes infectées par la
mosaïque du tabac purifié des microorganismes, était capable de transmettre la même maladie
aux plantes saines.
En 1898, Löffler et Frosch ont reproduis la fièvre aphteuse chez les bovins sains avec le filtrat de
la lymphe aphteuse provenant des bovins malades. Sanarelli démontra que la myxomatose des
lapins pouvait être transmise aux lapins sains avec le filtrat biologiquement stérile.
Enfin, en 1899 Beijerinck confirme les résultats d’Iwanowski. Il donna le nom de contagium
vivum fluidum à l’agent infectant présent dans le filtrat, lequel était capable de traverser des
bougies de filtration et infecter d’autre organisme de manière infini.

7
Le concept d’agent infectant filtrable est acquis et s’affirma au rythme des découvertes de
nouvelles maladies de l’homme, des animaux et des plantes. Avec le temps ce concept fut changé
en virus filtrable et enfin de virus tout simplement.
L’état des connaissances actuelles, permettent de définir les virus comme des entités biologiques,
sans organisation cellulaire, constitués essentiellement d’un seul type d’acide nucléique ADN ou
ARN et qui ne peut se répliquer qu’à l’intérieur d’une cellule vivante. Les virus sont une catégorie
d’agents infectieux, fondamentalement homogènes avec des caractéristiques particulières qui les
différentient des organismes à organisation cellulaire rudimentaire.

I.2. CARACTERISTIQUES DES VIRUS

I.2.1. DIMENSION
Les virus sont si petits qu’ils sont invisibles au microscope optique, seul quelqu’un de grande
taille tels que les virus de la famille des mégaviridae, font exception avec des dimensions proches
de celles des petites bactéries. Il faut également noter que les formes virales observées, sont en
générale des amas de virus ou des virus enveloppés dans du matériel non viral.
Bien qu’ayant en commun la caractéristique d’être extrêmement petit, les virus présentent
cependant, des dimensions très différentes, les plus grands dépassant les limites de la visibilité au
microscope optique (0.2μ) et les plus petits connus à ce jour mesurent (0.02μ). Les principaux
virus des animaux présentent les dimensions suivantes :

Tableau I : Dimensions de certains virus infectant les animaux

NOM DIMENSION
Virus de la variole et vaccina virus mμ 250x300x100
Herpes virus 150
Virus de la rougeole 140
Virus de la rage 70x175
Virus de la grippe 80-120
Adénovirus 70-80
Entérovirus 30
Virus de la fièvre jaune 40-50
Virus de la fièvre aphteuse 23

8
I.2.2. STRUCTURE ET FORME
Les virus ont une organisation structurale simplifiée. Elle est constituée essentiellement de deux
parties :
1. une interne faite d’acide désoxyribonucléique (ADN) ou ribonucléique (ARN).
La partie interne appelée nucleus, est d’une importance fondamentale par sa nature (acide
nucléique) et son contenu (l’information génétique). Le nucleus se présente sous une forme très
dense déterminée par sa nature.
2. une externe de nature protéique (capside).
La partie externe appelée capside recouvre le nucleus, donnant ainsi une stabilité aux virons. La
capside présente diverses formes géométriques ou symétrie, reflétant les différents types
d’organisation des molécules qui la constituent. Cette symétrie est déterminée par le nombre
d’unités morphologiques élémentaires appelés capsomères, lesquels sont distribués
symétriquement pour former la capside. Les capsomères sont constitués d’unités structurales plus
petites, des chaînes polypeptidiques (unité protéique) unique ou multiple. L’étude systématique
de la structure des virus infectant les animaux, a révélé l’existence de trois principales symétries :
cubique, hélicoïde et complexe.
La symétrie cubique est formée des capsomères distribués de manière symétriquement au tour
d’un axe, pour former un polyèdre régulier, généralement un icosaèdre. Certain virus à symétrie
cubique peut présenter une forme sphéroïdale.
La symétrie hélicoïdale est formée par des capsomères organisés pour former une spirale autour
du nucleus, donnant à l’ensemble une forme tubulaire ou sphérique. Un tour de spire complet
est formé par 16 capsomères, qui sont de grosses molécules protéiques allongées, formées de 168
acides aminés. L’espace longitudinal interne de la capside est en partie occupé par l’acide
nucléique sous forme de filament en spiral. Certain virus à symétrie hélicoïdale peut présenter une
forme sphérique ou filamenteuse avec toujours la capside en spirale.
La symétrie complexe est formée par l’association de deux parties, une cubique et l’autre
hélicoïdale. L’ensemble de ces deux parties constitue la capside de la particule virale complète.
Chez certains virus, la capside est recouverte par une enveloppe ou membrane virale toujours
d’origine cellulaire. Elle concoure à la détermination de la forme virale.

I.2.3. COMPOSITION CHIMIQUE

Les préparations virales purifiées de tout contaminant, montrent une composition en éléments
suivants :
- des protéines qui constituent la capside et ;

9
- l’acide nucléique qui forme le génome viral au milieu de la capside encore appelée core viral. La
molécule d’acide nucléique est toujours de l’ADN ou l’ARN compactes dans l’espace du
nucléocapsidique.
L’acide nucléique viral et les protéines virales sont de même nature chimique que ceux trouvés
chez les êtres vivants infectables par un virion. Ils sont cependant spécifiques aux virions,
spécifiant l’information génique qui lui est propre. Chez certains virions, le génome viral
représente 40% du poids sec du virus, alors que d’autres ont un appareil enzymatique spécifiques.

I.2.4. STRUCTURE ANTIGENIQUE

Les virus possèdent une grande variété d’antigènes, représentés par les macromolécules des
composantes structurales des virus que sont : les capsomères ; la capside et l’enveloppe. Dans
l’étude des virus, ces molécules antigéniques ont été déterminantes dans la compréhension de la
biologie des virus, leur classification, le diagnostic sérologique, la prévention et la thérapie
antivirale. Les antigènes viraux solubles peuvent être mis en évidence dans les cellules infectées
avant la formation du virion complet. Ils sont produits en abondance par le virus et libérés
naturellement dans la cellule infectée. Ils ont des dimensions inférieures à celui du virus du quel
ils dérivent. Ils induisent normalement et seulement des anticorps qui précipitent et fixant le
complément, et sont par conséquent des marqueurs pour le diagnostic. Les antigènes viraux sont
intimement liés au virus et produisent uniquement des anticorps neutralisants.

I.2.5. LA RESISTANCE
Les virus présentent une résistance variée aux agents physique et chimique :
1. La chaleur se présente ainsi, comme un excellent moyen de désinfection des instruments
souillés par des virus. Cependant certains virus sont très résistants à la chaleur par des formes
végétatives comme certaines bactéries. Lorsqu’ils sont exposés à des températures de 55°- 60°
pendant 30-60 mm ils sont détruits. Les virus survivent pendant une très longue période à de très
basse températures (-60° à –70°), ce qui permet de les conservés et de façon optimale sous forme
lyophilisée. Ils supportent par contre mal la glace à une température autour de 0°.
Les virus se comportent diversement en fonction du pH. Certains virus résistent jusqu’à trois
heures à pH2 et à 37°c, d’autres par contre sont très sensibles à une légère acidification et plus
tolérants à l’alcalisation. Cependant, les capacités infectantes des virus sont conservées au tour de
pH 7.
2. Les rayons UV, X et en général toutes les radiations ionisantes inactivent les virus avec des
effets variés selon les doses utilisées.

10
3. Déshydratation : certains virus comme le virus de la variole supporte parfaitement la
dessiccation et après plusieurs mois le virus conserve toujours sa capacité d’infection.
4. Agent chimique : les virus ont une faible résistance aux désinfectants communs. Leurs
comportements sont différents au contact du formaldéhyde, de l’acide phénique, de l’éther et de la
glycérine. Le formaldéhyde à la concentration idéale, inactive certains virus sans en modifiés les
propriétés antigéniques. L’acide phénique peut être utilisé pour extraire l’acide nucléique des
virus infectants. Certains virus sont résistants à l’éther, quand d’autres y sont sensibles. Cette
caractéristique est utilisée comme critère de classification. La glycérine est très intéressante au vu
de la résistance des virus, en solution aqueuse de 50% elle est utilisée pour la conservation du
matériels biologiques pathogènes, tels que les tissus nerveux d’animaux morts de rage, des
fragments de tissus pulmonaire.
Antibiothérapie : Les virus ne sont pas sensibles aux antibiotiques.

I.2.6. POUVOIR PATHOGENE

Les virus ont la propriété d’entrer (infection) dans les cellules vivantes permissives animales, des
plantes et d’autres agents infection pour s’y répliquer. Cette réplication peut avoir des
conséquences délétères parfois irréversibles sur la cellule e infectée. Ce sont des effets
cytopathiques de diverses natures. Ces effets peuvent se circonscrire à la seule cellule infectée
mais parfois s’étendre aux cellules environnantes voir à tout le tissu, avec des conséquences de
gravité variable en fonction du virion infectant. Cette propriété caractéristique des virus est
appelée pouvoir cytopathique. Le spectre du pouvoir pathogène des virus, s’étend à tous les
vivants indépendamment de l’espèce et de son environnement. La pathogenèse est intimement liée
de la relation virus-cellule de l’organisme hôte en relation avec : les voies de pénétration du virus
dans l’organisme ; leur adsorption au niveau des récepteurs spécifiques ; leur réplication, les voies
de diffusion ; les tissus et organes infectés, les effets cytopathiques de la cellule infectée et enfin
l’extension du processus infectieux.
La porte commune d’entrée des virus est constituée par les diverses voies anatomiques. Certains
virus, utilisent un vecteur pour entrer dans son organisme cible. Après la pénétration, les virus
tendent en général d’envahir l’organisme, en atteignant les tissus et organes dont les cellules sont
les cibles spécifiques du virus. Les voies lymphatiques et hématiques sont les principales pour la
diffusion de la virémie dans la plupart des infections virales. Le tropisme spécifique des virus se
décline en : dermotrope, neurotrope, hépatotrope, enterotrope et pneumotrope. Cependant
plusieurs virus peuvent se multiplier dans divers tissus et organes.

11
I.3. INFECTION ET MALADIE VIRALES

La pénétration du virus dans une cellule n’est pas toujours suivie par sa réplication. L’infection
peut être abortive, latente ou productive. Sur la base de cette caractéristique, On distingue les
virus :
- Cytocides, la réplication du virion conduit à la cytolyse des cellules de toutes les cellules
infectées ;
- Sous modérés, la réplication du virion conduit une cytolyse partielle des cellules infectées, qui
peuvent même entrer en division ;
- Modérés, la réplication du virion ne conduit pas à la cytolyse la cellule infectée et n’entrave pas
la physiologie normale cellulaire, qui se caractérise par le fait que les cellules filles sont porteuses
du matériel génétique viral spécifique doté de la continuité génétique dans un état non infectant
appelé provirus.
Cette forme particulière de coexistence entre le virus et la cellule infectée produit au niveau de
l’organisme une infection persistante non apparente car il n’y ’a pas de signes cliniques de
maladie. Ainsi, dans cette forme le virus se comporte au début de l’infection en cytocide, mais la
réaction immunitaire de l’organisme qui, par son action atténue le caractère cytocide, permettant
d’atteindre le stade de l’infection non apparente persistante. La forme la plus élevée de ce type
d’infection, est dite occulte ou masque où en absence de signes cliniques apparents, le diagnostic
est fait par des tests moléculaire caractérisant de façon discriminante le génome viral recherché.
Exemples de quelques maladies virales humaines : la variole, la varicelle, la rage, la
poliomyélite, la fièvre jaune, les différentes formes d’Herpes, l’encéphalite, la méningite, la
grippe, l’Hépatite etc.
Exemples quelques maladies virales animales : la fièvre aphteuse, la peste bovine, le cholera
des porcs, l’anémie et l’encéphalopathie des chevaux, la peste aviaire etc.
Exemples quelques virus de microorganismes, les bactériophages

I.4. FACTEURS DEFENSIFS ANTIVIRAUX

La résistance de l’homme et des animaux à l’infection virale est le résultat de l’immunité

naturelle ou acquise, liée à divers facteurs ayant un caractère défensif. Les plus importants sont
la phagocytose, l’interféron, les anticorps et les inhibiteurs spécifiques.
La phagocytose : activité permanente des macrophages du système réticulo-endothélial et des
monocytes sanguins. Ce sont les premiers lignes de défense et en particuliers ceux du foie qui
s’activent à éliminer le virus du flux sanguin.

12
L’interféron : sa production par l’organisme s’oppose à l’extension de l’infection.
L’immunité acquise : Les anticorps formés à la suite de l’infection virale sont très importants
pour la défense de l’organisme, de par leur pouvoir antiviral. Cette activité antivirale est
mesurable in vitro par la neutralisation de l’infection virale et la transmission de la protection
immune par l’administration du sérum à un animal susceptible. Le pouvoir protecteur des
anticorps est clairement démontré dans plusieurs infections virales à l’exemple des hépatites,
quand on y intervient par administration des gammaglobulines. L’injection du sérum d’un
organisme immune à un organisme naïf, lui confère une immunité spécifique. Il y’a alors une
corrélation entre le taux d’anticorps circulants et l’état immunitaire.
L’activité antivirale des anticorps s’exerce sur le virion libre ou circulant en altérant leur strate
superficielle, empêchant de ce fait dans la plupart des cas l’adsorption du virus au niveau des
récepteurs cellulaires. Dans les cas où le virus échappe à cette action et pénètre dans la cellule, il
est rapidement détruit par les enzymes endocellulaires au quel il est exposé à la suite des
altérations précédentes déterminées par les anticorps spécifiques et les activités complémentaires.
Dans les infections virales qui causent l’altération de la membrane cellulaire, un facteur de
défensif d’une grande importance est constituée par une réponse immune cellulaire de type hyper
sensibilité retardée.
L’activité des anticorps dans l’immunité acquise contre les infections virales, n’exclue pas l’action
des facteurs défensifs déjà mentionnés, qui sont à la base de l’immunité naturelle. Dans
l’ensemble les facteurs cellulaires prennent part activement aux processus de protection.
Enfin, il existe dans le plasma et les autres liquides organiques des substances dites inhibitrices car
elles sont dotées d’une activité antivirale. La participation du système humoral se divise en en
deux catégories :
- Les inhibiteurs stables à la chaleur, résistants jusqu’à une demie heure à 56° tels que les
protéines du mucus et certaines lipoprotéines ;
- Les inhibiteurs instables qui s’altèrent à 56°, ce sont des protéines simples ou complexes.
L’action des inhibiteurs s’exerce hors des cellules sensibles, avant que le virus n’y pénètre. Cette
action se vérifie dans diverses activités antivirales. Dans la plupart des cas, il s’agit des inhibiteurs
de l’hémagglutination virale et dans de rares cas l’activité se manifeste contre l’infection virale.

13
II. VIRUS ET STRUCTURE
II.1. STRUCTURE GENERALE

L’organisation générale est très simple comme représenter dans la figure 1. Elle comprend de
l’intérieur vers l’extérieur : le génome viral, la capside et l’enveloppe

Figure 1 : organisation structurale des virus

II.1.1. Génome
Le génome viral est constitué d’une seule molécule d’ADN ou d’ARN en général. Ce génome est
caractérisé est par :
1. Forme, qui peut être linéaire, circulaire, circulaire fermé, circulaire ouvert, circulaire
asymétrique et fragmenté ;
2. Nombre de brins ou filament, en général deux brins pur l’ADN et un brin pour l’ARN et des
cas particuliers à monobrin d’ADN et double brin d’ARN
3. Polarité, positive ou négative.
Le génome ARN ou ADN sont des acides nucléiques d’origine virale codant pour des protéines
virales spécifiques du virus

II.1.2. Capside ou core viral

La capside virale ou core est l'enveloppe protéique qui protège le génome. Elle est composée de
plusieurs monomères appelés capsomères. L’axe géométrique autour duquel se polymérisent les
capsomères pour forme la capside est appelé symétrie. Il existe trois types de capside déterminé
par leur symétrie :
1. Capside à symétrie icosaédrique ou cubique
Les capsomères se polymérise pour forme une structure géométrique appelé icosaèdre (figure 2).
L'icosaèdre est un polyèdre régulier ayant 3 axes de symétrie, 12 sommets, 20 faces qui sont des
triangles latéraux et 30 arêtes. Les capsomères de l'icosaèdre 2 types :
-les pentons ou pentamères, de la polymérisation de cinq (05) chaînes polypeptidiques

14
-les hexons ou hexamères, de la polymérisation de 6 chaînes polypeptidiques
Tous les virus à symétrie icosaèdrique possèdent 12 pentons (car ils se trouvent sur chaque
sommet de la structure) et un nombre d'hexons variables ex : une capside à 32 capsomères a 12
pentons et 20 hexons.

Figure 2 : structure des virus à symétrie icosaédrique

2. Capside à symétrie hélicoïdale
Les capsomères se polymérisent pour une capside en forme de tube autour de laquelle s’enroule le
génome viral en hélice (figure 3). Le modèle par excellence de ce type de symétrie est le virus de
la mosaïque du tabac.
3. Capside à symétrie mixte
Elle est formée par la combinaison des deux précédentes symétries : la symétrie icosaédrique et la
symétrie hélicoïdale. On trouve ce type de symétrie chez les bactériophages T 4 (figure 4).

Figure 3 : la symétrie hélicoïdale du virus de la mosaïque du tabac

15
Figure 4 : la symétrie mixte du bactériophage T 4

II.1.3 L’enveloppe
Certains virus possèdent une enveloppe externe à la capside. Elle n’est pas d’origine virale. On
distingue trois origines pour cette enveloppe virale :
1. Membrane nucléaire
2. Membrane plasmique cellulaire
3. Système endomembranaire cellulaire

III. CLASSIFICATION ET NOMENCLATURE

Il existe des milliers de virus que l’on trouve dans tous les milieux à savoir terre, eaux et même
air. Ces virus infectent tous type d’organisme vivant dans leur milieu de vie. Pour faciliter leur
étude, il a fallu mettre sur pied un système permettant de les regrouper de manière homogène sur
la base des critères fiables, non variables et applicables à tout objet biologique répondant aux
critères caractéristiques de définition des virus : C’est la classification. De même, l’importance
donner un nom aux virus, permettant de les identifier s’est imposer aux biologistes des virus, c’est
la nomenclature ou taxonomie.

III.1 CLASSIFICATION DES VIRUS

La classification des virus peut se faire les critères suivants :

1. La nature de l'hôte : homme, animaux, insecte, plante, microorganisme….
2. Le tropisme tissulaire. On les désigne comme, virus dermotrope, neurotrope, viscérotrope…

16
3. Le pouvoir pathogène. On les désigne comme virus morbilleux responsable de la rougeole,
virus ourlien responsable des oreillons …
4. Le pouvoir pathogène. A ce jour, il est le plus complexe à mettre en œuvre, parce que certains
virus possèdent un spectre pathologique avec une diffusion à plusieurs organes, appareils ou
systèmes. Ainsi, certains syndromes peuvent être associés à une multiplicité de virus infectieux
différents. Enfin, certains virus de caractérisation récente n’ont démontré aucun pouvoir pathogène
connu.
5. Le mode de transmission. On les désigne comme virus respiratoire, entérique, transmis par des
arthropodes …
La virologie comme discipline biologique a, permis une meilleure définition des virus. Cela a eu
pour conséquence, l'élaboration d'une nouvelle classification fondée uniquement sur des critères
objectifs basée sur les caractéristiques structuraux des virions. Elle est aussi dénommée
classification appelée système L.H.T des chercheurs Lwoff, Horne, et Tournier.
Les quatre critères structuraux sont :
1. La nature de l'acide nucléique, permettant de distinguer des virus à ADN à ARN ;
2. La symétrie de la capside : icosaédrique, hélicoïdale et mixte ;
3. L'absence d'une enveloppe, virus nu ;
4. La présence d'une enveloppe, virus enveloppé.
L'utilisation de sous de critères caractéristiques du génome, de la réplication et du nombre de
capsomère, peuvent permettre une classification biologique plus fine.

III.2. NOMENCLATURE DES VIRUS

Elle consiste à donner un nom à un virus. On distingue ainsi le nom commun et taxonomique.
1. le nom commun. Ce nom très souvent n’est un critère rationnel ou biologique. Les chercheurs
qui caractérisent pour la première fois ont la liberté d’attribuer un nom selon leur imagination et
convenance. Exemple virus d’Ebola.
2. le nom taxonomique
En 1966, le comité international de taxonomie des virus a défini une nomenclature à vocation
universelle suivant les taxons et l’utilisation d’un suffixe (en fin de mot) pour les quatre premiers
et d’un préfixe (en début de mot) pour le dernier, à ajouter au nom du groupe de virus pour
indiquer son taxon :
1. Ordre : virales. Exemple rétrovirales ;
2. Familles : viridae. Exemple rétroviridae ;

17
3. Sous-familles : virinae. Exemple rétrovirinae
4. Genres : virus. Exemple rétrovirus
5. Espèce : virus de. Exemple virus de l’immunodéficience acquise.
Ces noms sont écrits de façon spécifique et normalisée :
- lettre capitale et italique pour les familles : exemple PARAMYXOVIRIDAE
- lettre en italique sans capitale pour les sous-familles et genres.
- pour les espèces noms communs, romain sans capitale exemple la rougeole.

IV. TECHNIQUES D'ETUDE DES VIRUS

L’étude des virus utilise plusieurs techniques et technologies, des plus simples au plus complexe.
Dans la pratique, on utilise les techniques de microscopie optique et électronique avec des
résultats différents, le premier permettant la caractérisation de l’activité virale dans la cellule
infectée et l’ultrastructure pour le second.

IV.I. LE MICROSCOPE OPTIQUE

IV.I.1. DESCRIPTION

Figure 5 : le microscope photonique monoculaire

18
IV.I.2. Utilisation du microscope optique

19
[Link]. LES MICROSCOPES ELECTRONIQUES

La fabrication de ces microscopes a permis la révolution en biologie, cat permettant d’observer et

d’étudier les ultrastructures et infrastructures cellulaires qui étaient jusqu’alors inaccessible. On
distingue deux grands types de microscope électroniques.

[Link].1. LE MICROSCOPE ELECTRONIQUE A TRANSMISSION

Dans le microscope électronique, le faisceau de photons est remplacé par un faisceau d’électrons
émis par un filament et soumis à une différence de potentiel de 60 à 120 KV. Il permet d’obtenir
sur un écran fluorescent, une image de l’objet traversé par le faisceau et d’en réaliser
éventuellement une photographie. Le microscope électronique a un pouvoir séparateur qui peut
atteindre 0.2 nm et un grandissement direct de 106 X, ce qui constitue son principal intérêt en
comparaison à la faible surface des champs observables.

[Link].2. LE MICROSCOPE A BALAYAGE

Le microscope électronique, permet l’étude des surfaces préalablement recouvertes d’une mince
couche métallique, par vaporisation. Son pouvoir séparateur est d’environ 07 nm avec un
grandissement de 105 X.
Le principe de fonctionnement : un faisceau d’électron balaie très régulièrement la surface d’une
préparation. Ces électrons faiblement accélérés de 1 à 20 KV vont être réfléchis par la surface de
la préparation et un détecteur d’électrons secondaires reçoit à chaque instant les électrons réfléchis
par l’échantillon. Ces données sont transmises à un calculateur, permettant la reconstitution de
l’image de la surface de la préparation. Il permet des observations en trois dimensions.

[Link].3. TECHNIQUES PROPRES A LA MICROSCOPIE ELECTRONIQUE

Le microscope électronique a ses techniques propres pour la préparation des échantillons. A cet
effet, des améliorations considérables de la résolution des images sont également imputables à
des techniques particulières à la microscopie électronique.

[Link].3.1 ETALEMENT ET OMBRAGE

1. L’étalement : les méthodes basées sur l’observation de section ne donnent guère de résultats
exploitables lorsque, dans son ensemble la structure à observer se révèle être comparable à une
pelote de ficelle. C’est le cas du noyau dans lequel 220 cm d’ADN sont pelotonnés dans tous les
sens.
Principe de l’étalement : pour ce faire, les cellules isolées sont soumises à l’action de détergents
qui vont disperser tous les systèmes membranaires, entraînant leur disparition. Un récipient très
étroit au fond du quel est déposée une grille de microscopie électronique recouverte d’un film de
carbone, est rempli par un liquide dont la densité est légèrement inférieure à celle de l’ADN. On
20
dépose ensuite le lysat cellulaire sur ce liquide et on effectue une centrifugation. Au terme de la
centrifugation, les débris cellulaires vont se retrouver dans le liquide surnageant et les molécules
d’ADN composant la chromatine vont traverser ce liquide et se retrouver plaquées contre la grille.
Des techniques d’ombrage vont permettre de renforcer les contrastes de la préparation.
2. OMBRAGE : l’utilisation de petites molécules opaques aux électrons, s’est révélée être dans
certains cas une excellente méthode pour préciser les relations pouvant exister entre les espèces
cellulaires d’un épithélium et de la lumière.
Le nitrate de lanthane, molécule opaque, déposé à la surface d’un épithélium est capable de
s’infiltrer entre les éventuels chenaux intercellulaires en relation avec la lumière. Par exemple,
l’ombrage au nitrate de lanthane a permis, de distinguer les jonctions intercellulaires dites
occlusives, des jonctions communicantes de la cellule.

[Link].3.2 CRYOFRACTURE ET CRYODECAPAGE

1. La cryofracture implique la fracture dans le microtome sous vide et à basse température (-
100°) d’un échantillon préalablement congelé dans du fréon liquide (- 100°), lui – même refroidi
dans l’azote liquide (- 192°).
On réalise alors une réplique de la face de fracture par vaporisation d’un mélange de métal
platine – carbone qui se dépose en une mince couche, laquelle est ensuite renforcée par un film
de carbone pur. Cette réplique est alors recueillie après élimination de l’échantillon et examinée au
microscope électronique à transmission.
2. Le cryodécapage est une technique de cryofracture suivie d’un prolongement du temps
d’exposition sous vide de la pièce, ce qui permet aux molécules d’eau les plus superficielles de
sublimées, renforçant ainsi le relief de la préparation.

[Link].3.3 LES COLORATIONS NEGATIVES

Ce type de coloration est effectué sur un matériel biologique déposé sur une grille de microscopie
électronique, dont les mailles sont recouvertes par une fine pellicule de carbone laquelle sert alors
de support.
Principe de la coloration négative : Une suspension des particules à observées est déposée sur
une grille de microscopie électronique préalablement préparée. Après séchage de la préparation,
on verse ou on pulvérise une solution d’acide phosphotungstique ou d’acétate d’uranyle. Cette
solution correctement dosée, va remplir alors tous les interstices libres entre les différentes
particules sans les recouvrir. Après évaporation du solvant, ces produits fortement opaques aux
électrons, formeront un fond très dense ne laissant à l’observation que les structures non
recouvertes. Exemple d’application : étude de la structure biologique des virus, bactériophages,
ADN et de l’ARN.

21
TRAVAUX PERSONNELS DE L’ETUDIANT
TPE 1 : LES MIMIVIRUS

LE MIMIVIRUS,
Le Mimivirus (pour mimicking microbe). Ce Mimivirus parait en passe de bouleverser une
nouvelle fois les conceptions que nous pouvons nous faire de la vie et de ses origines.
Qu’est-ce qu’un virus ?
Rappelons d’abord la définition du virus. Rien n’est plus élusif que ce micro-organisme. Il s’agit
de petits éléments d’ADN ou d’ARN enveloppés de protéines, intermédiaires entre la vie et la
non-vie. Ils n’ont pas de membranes, ce ne sont donc pas des cellules, ni même ces cellules
élémentaires que sont les bactéries. Ils ne prennent vie que lorsqu’ils envahissent les cellules afin
de les utiliser pour se reproduire. Ceci en fait les tueurs que l’on connaît : fièvre Ebola, VIH,
grippe, etc. Mais d’innombrables autres virus ne sont pas pathogènes. Nous y reviendrons.
Rappelons que les virus n’étant pas des cellules ne sont pas sensibles aux antibiotiques.
C’est le botaniste hollandaise Martin Beijerinck qui a soupçonné leur existence au début du 20e
siècle en recherchant les causes d’une affection végétale, la Mosaïque du tabac. Les extraits de
feuilles infectés demeuraient virulents après passage par un filtre en porcelaine alors que ce filtre
aurait dû arrêter une bactérie. Mais l’agent de la mosaïque du tabac n’a été identifié qu’en 1935
grâce à l’invention du microscope électronique. Le chimiste Wendell M. Stanley qui obtint pour
cela le prix Nobel, montra que le virus pouvait être effectivement considéré comme intermédiaire
entre un organisme vivant et un composé physico-chimique.
Aujourd’hui, le débat ne s’est pas éclairci. Où se situent les virus, entre les trois branches de
micro-organismes officiellement reconnues : les eucaryotes, multicellulaires disposant de cellules
à noyau, les bactéries monocellulaires avec ou sans noyau et les archea, découvertes par Carl
Woese, bactéries sans noyau qui constitueraient peut-être le tiers de toute la matière vivante
existant sur la Terre. On considérait les virus comme dépendant des organismes sans lesquels ils
ne peuvent se reproduire. Donc ils seraient apparus après ceux-ci et non avant. Mais cette vision
est difficilement compatible avec les effectifs de virus que l’on pense exister sur Terre, sans doute
en majorité dans les océans comme le généticien Craig Venter vient de le montrer en
accomplissant un tour du monde en bateau destiné à prélever et étudier des échantillons de virus
océaniques. Le nombre des virus identifié à ce jour est infime par rapport à ceux qui ne le sont pas.
On estime parfois que mis bout à bout, l’ensemble des particules virales existant sur Terre
formerait une ligne longue de 10 millions d’années-lumière. Le plus grand nombre de ces virus

22
n’apparaît pas menaçant pour les espèces complexes comme la nôtre mais font néanmoins partie
intégralement de leur vie.
Les modes de réplication des virus sont très variés, avec de nombreuses différences dans la façon
d’infecter les cellules hôtes. Les souches de virus à ADN, comme ceux de la variole ou de
l’herpès, peuvent vivre des siècles en dehors d’un hôte, en se reproduisant par division avec un
taux minimum d’erreur. Les virus à ARN se reproduisent vite et en mutant fréquemment. On
estime que ces derniers sont les descendants des formes vivantes existant avant l’apparition de la
double hélice, un monde qui avait été qualifié de "monde de l’ARN". Ils dirigent la copie de leur
génome sans ADN et, de ce fait, plus rapidement mais avec beaucoup plus d’erreurs, ce qui était
un avantage à une époque où la vie n’avait pas encore choisi de s’incarner dans des formes stables.
Aujourd’hui, c’est de nouveau un avantage face aux méthodes de lutte antivirales adoptées par
l’homme. Les virus de la grippe, notamment celui de la grippe aviaire, sont aujourd’hui connus, au
moins de nom, du monde entier. Le virus de HIV également. Mais celui-ci est encore plus
pernicieux. Une fois qu’il s’est introduit dans la cellule de l’hôte, sous forme d’un brin d’ARN, il
y fabrique son propre double brin d’ADN qui s’incorpore à celui de l’hôte et se transmet avec lui.
Il est qualifié pour cette raison de rétrovirus.
Le monde des virus s’est enrichi récemment des viroïdes, fragments d’ARN sans enveloppes
protéiniques qui ne codent pour rien d’apparent. Les viroïdes n’ont pas de gènes et cependant
peuvent provoquer des maladies. D’autres organites, nommés satellites, ne peuvent se reproduire
que dans un virus, lui-même hébergé par un hôte. Mentionnons pour être complet les prions,
protéines complexes dont le rôle, utile ou nuisible à la vie cellulaire, reste encore en partie
mystérieux. On les exclue à ce jour de la catégorie des êtres vivants. Rappelons enfin que
l’ingénierie génétique fabrique aujourd’hui des ARN entièrement « chimériques », en enfilant des
paires de bases pour reconstituer certains virus, existants déjà comme celui de la poliomyélite, ou
inconnus à ce jour dans la nature, mais pouvant potentiellement s’y développer et devenir
dangereux pour l’homme.
Dans le panorama déjà surprenant des virus, la découverte du Mimivirus a eu l’effet d’une petite
bombe, dont les retombées sont encore loin d’être toutes perceptibles. Le Mimivirus est plus
complexe génétiquement, non seulement que les virus mais que beaucoup de bactéries. Cette
découverte oblige à redéfinir le concept plus général de virus. On est aujourd’hui tenté de faire des
virus une branche à part dans l’arbre de la vie. Mais cette branche ne serait pas récente. Elle
pourrait au contraire être l’ancêtre des trois autres. On pourrait alors considérer que les virus
seraient à l’origine même de la vie, origine dont on sait qu’elle demeure encore mystérieuse. Nous
allons examiner rapidement ces diverses perspectives.

23
TPE 2 : LA FAMILLE DES MEGAVIRIDAE (Megavirus chilensis)

Des scientifiques du CNRS viennent d'isoler un virus, encore plus grand et plus complexe que tout
ce qu'on connaissait jusqu'ici. Il a été découvert dans la mer près des côtes chiliennes mais
n'affecterait pas l'homme, d'après les recherches.
C'est la première fois qu'un tel virus est identifié dans l'environnement marin. Des chercheurs
français du Centre national de recherche scientifique (CNRS) ont annoncé une découverte de taille
: dans l'océan, à proximité des côtes du Chili, ceux-ci ont découvert un virus très particulier et qui
a d'ores et déjà battu plusieurs records. En effet, le micro-organisme est le plus gros et le plus
génétiquement complexe des virus connus à ce jour.
Décrit dans la revue Proceedings of the National Academy of Sciences, celui-ci est "chevelu avec
des épis sur la tête" et a été baptisé Megavirus chilensis. Comme son nom l'indique, il est donc
classé dans la famille des Megavirus, un type de micro-organisme dont l'archétype, isolé en 2003,
était jusqu'ici le Mimivirus doté de plus de 1.000 gènes et dépassant largement de nombreuses
bactéries en complexité. Mais ce Mimivirus est désormais détrôné : "Megavirus chilensis est
environ 15% plus gros que son lointain cousin Mimivirus et le dépasse encore en complexité",
explique à l'AFP Jean-Michel Claverie du CNRS dont le laboratoire est à Marseille.
Une nouvelle famille ?
D'après les travaux publiés, la molécule d'ADN du Megavirus comporte 1.259.000 paires de bases
qui commandent la production de 1.120 protéines, soit la plus grande séquence d'ADN jamais
décryptée. Par ailleurs, ce nouveau virus présente 594 gènes en commun avec son congénère. Les
chercheurs ont ainsi émis la possibilité qu'ils soient regroupés en une nouvelle famille, les
Megaviridae, qui inclurait des virus dont le génome est d'une taille supérieure à un million de
paires de bases.
En outre, Megavirus chilensis possède sept des enzymes utilisées par les cellules pour décrypter le
code génétique, soit trois de plus que Mimivirus. Mais si le micro-organisme a pu être
parfaitement décrit au cours de cette étude, pour l'heure, "on ne connaît pas l'hôte naturel de ce
Megavirus, qui n'apparaît pas pathogène pour l'humain", précise le chercheur.

La clé évolutive des virus géants

Cette découverte a également constitué un pas considérable pour les scientifiques quant à la
connaissance de ces virus particuliers. Jean-Michel Claverie explique : "au-delà des chiffres
records qui le caractérisent, l'analyse du génome de Megavirus nous a apporté la clé de l'origine
évolutive des virus géants, et démontré l'hypothèse que nous avions précédemment proposée, (à

24
savoir) qu'ils sont issus du génome d'une cellule ancestrale, peut-être un eucaryote, le type de
cellules que l'on retrouve dans les plantes et les animaux d'aujourd'hui".
Au cours de l'évolution, "les virus auraient commencé très grands à partir d'un génome cellulaire
et comme ce sont des parasites, ont ensuite rapetissé. C'est ce qu'on appelle l'évolution réductive
commune à tous les parasites (bactéries, virus, parasites)", ajoute le chercheur. Autrement dit,
comme les virus sont des parasites, ils n'ont pas hésité à abandonner certaines de ses fonctions
qu'il peut aisément trouver dans les cellules de l'hôte qu'il infecte et détourner à son usage.
Les virus géants eux ne sont pas des voleurs de gènes pris au hasard dans les cellules infectées,
mais des "fossiles vivants" d'organismes cellulaires ancestraux, précise encore le Pr Claverie.
Ainsi, de grands virus actuels tels que celui de la variole ou encore de l'herpès pourraient avoir une
origine commune avec ces megavirus.

25
PARTIE II. PARASITOLOGIE
Pr NGONO NGANE ROSALIE ANNIE
(Charge horaire: CM 06 h, TD 02, 30 h, TP 02,30 h, TPE 02,30 h)

OBJECTIF GENERAL : Définir les paramètres intervenant dans l'interprétation des

particularités épidémiologiques, cliniques, physiopathologiques, diagnostiques et thérapeutiques
des affections humaines parasitaires.

OBJECTIFS SPECIFIQUES :
A la fin de ce cours, l’étudiant devra :
✓ Définir la parasitologie
✓ Connaître les différents types de parasites
✓ Connaitre les différents types de parasitoses
✓ Connaitre les différentes cellules et organes de l’organisme qui interagissent lors de
l’infection parasitaire
✓ Comprendre les bases générales du fonctionnement de deux cycles parasitaires simples

INTRODUCTION
Parasitologie : L'étude morphologique et biologique des parasites et des affections qu'ils
entraînent ainsi que leur diagnostic, leur prophylaxie et leur traitement.
L'étude porte également sur les vecteurs, les hôtes et les réservoirs animaux des parasitoses.

I. DEFINITIONS
Parasite : Être vivant animal ou végétal qui pendant une partie ou la totalité de son existence vit
aux dépens d'un autre organisme appelé hôte.

Hôte : Organisme vivant qui héberge un agent pathogène.

L'hôte est définitif quand il héberge la forme sexuée ou la forme adulte du parasite.
L'hôte est intermédiaire quand il héberge la forme asexuée ou larvaire du parasite.
Il peut être passif quand il abrite la forme infestante (exemple : la limnée pour les distomatoses
(douve ou distome ou vers plats), le bœuf pour les tænias)
Ou actif quand il transporte et inocule la forme infestante du parasite (exemple : l'anophèle pour le
plasmodium, le phlébotome pour les leishmanies).

26
Vecteur : Organisme qui sert d'hôte à un agent pathogène et qui est susceptible de le transmettre à
un autre organisme.

Réservoir : Être vivant chez qui se perpétue le germe pathogène et qui lui permet de se maintenir
dans la nature.

Parasitisme : État de spoliation de matières nutritifs d'un parasite envers son hôte.

Le parasitisme est un contact particulier entre deux êtres vivants : le parasite et son hôte.
De la forme libre indépendante au parasitisme, forme de contact nécessaire et dépendante, divers
intermédiaires sont à distinguer :
- La vie libre : l’organisme peut subvenir par lui-même à ses besoins métaboliques.
- Le saprophytisme : l’organisme se nourrit de matières organiques ou végétales en
décomposition dans le milieu extérieur.
- Le commensalisme : l’organisme se nourrit de matières organiques sur un être vivant (milieu
buccal, intestin) sans entraîner de troubles ou de spoliations chez son hôte.
- La symbiose : les êtres vivent en étroite collaboration dans une association bénéfique aux deux
parties (équilibres des flores intestinales ou vaginales).
- Le parasitisme : l’organisme parasite vit aux dépens d’un hôte qui lui fournit un biotope et/ou
des éléments nutritifs nécessaires à sa survie, cet hôte en pâtissant de façon plus ou moins grave.
- l’opportunisme : les différents stades entre la vie libre et le parasitisme ne sont pas
définitivement déterminés pour un organisme. En cas de perte des défenses immunitaires de
l’hôte, l'organisme peut passer d'un stade saprophyte ou commensale à un stade de parasite. Il
devient opportuniste.
Le prédateur tue sa proie pour s’en nourrir.

Cycle évolutif : Succession d’événements obligatoires permettant le passage d'une génération à

la génération suivante. Il représente l'ensemble des transformations que doit subir un parasite
pour assurer la pérennité de son espèce.

II. DIVERSITE ET SPECIFICITE

II.1. Diversité
La diversité est la règle en parasitologie. De par leur morphologie et leur biologie (mobilité,
reproduction, métabolismes) les parasites sont extrêmement divers, même au sein d’une même
famille à plusieurs titres, entre autres par :

27
 - La morphologie : la taille d’un parasite peut aller de 10 mètres (Taenia : le ver solitaire) à
quelques micromètres (microsporidies, leishmanies, l'agent du paludisme).

- Stades parasitaires : un même parasite (protozoaire, helminthe, micromycète, ectoparasite)

peut prendre chez l’homme, dans le milieu extérieur, ou chez l’hôte intermédiaire, des formes
particulières correspondant à différents stades de son développement. Ils sont macro ou
microscopiques, intra ou extra cellulaires sous forme adulte ou larvaire, les ectoparasites
insectes sous forme d’œuf, de larve (nymphe) ou d’adulte (imago).

- On parlera de parasites, sous formes libres ou intracellulaires (globules sanguins blancs ou

rouges, hépatocytes, entérocytes*), adultes mâles et femelles, œufs, larves, formes de résistance
(kystes), formes asexuées ou formes sexuées (mâle et/ou femelle). Mais un même parasite peut
aussi prendre des formes particulières et fort différentes correspondant à différents stades de
son développement ;

- La durée du parasitisme : les parasites peuvent être permanents (leur existence entière se
déroule chez un ou plusieurs hôtes (Taenia, trichine)), temporaires (partageant leur vie entre
une forme libre dans l’environnement et l’autre parasitaire (douves, anguillules)), ou encore
facultatifs (parasites et myiases).

- Leur localisation : ils ont des localisations préférentielles qui peuvent être intra ou
extracellulaire, sanguine ou lymphatique, tissulaire, cutanée, hépatosplénique, cérébrale,
cardiaque, rénale ou tubaire (intestin, arbre urinaire, bronches).

- Leur locomotion : si certains parasites et tous les champignons n’ont pas de moyens pour se
déplacer par eux-mêmes, ils sont éventuellement transportés par voie aérienne intestinale ou
sanguine ; certains ont même la faculté de ramper, d’avancer grâce à des pseudopodes (ou
rhizopodes), des ventouses, des cils, des flagelles, ou une membrane ondulante.

2. Spécificité d'hôte
Les parasites sont plus ou moins étroitement liés à leur hôte. Certains parasites sont inféodés
exclusivement à un seul hôte et ne peuvent se développer que chez cet hôte (Les parasites
sténoxènes (poux, hématozoaires...)). D'autres au contraire (les euryxènes) ne présentent qu’une
faible spécificité, comme c’est le cas des agents des parasitoses communes à l’homme et aux animaux, les
anthropozoonoses (distomatoses, formes larvaires des taenias : hydatidose).

28
III. TYPES DE TRANSMISSION
1. Transmission orale
Par le milieu extérieur, péril fécal (eaux et aliments contaminés) (Ex de maladie : Amibiase,
giardiase, ascaridiose, cryptosporidiose, microsporidiose, cyclosporose, oxyurose,
hyménolépiase, isosporose, échinococcose alvéolaire, hydatidose, toxocarose, trichocéphalose).
Par contact avec des animaux ou ingestion de produits d'origine animale (Cysticercose,
hydatidose, toxocarose, toxoplasmose).
Par ingestion de viandes mal cuites, d'hôtes intermédiaires animaux ou de support végétaux
(Angiostrongylose, anisakiase, bothriocéphalose, clonorchiase, distomatoses, sarcocystose,
téniase, trichinose).
Par ingestion de vecteur aquatique passif (cyclops) (Dracunculose).

2. Transmission cutanéo-muqueuse
Par l'eau et les sols humides Anguillulose, ankylostomoses, bilharzioses, larva migrans cutanée.
Par le milieu extérieur sec Myiases.
Par contacts humains (malades ou porteurs sains) Maladies sexuellement transmissibles
Trichomonose (Trichomonas vaginalis), parasitoses cutanées ;

3. Transmission vectorielle
3. 1. Par les vecteurs aériens
a. Vecteurs vespéraux et nocturnes
Paludisme : Anopheles
Leishmanioses : Phlébotomes
Filarioses lymphatiques : Moustiques (Culex, Anopheles, Aedes, Mansonia)

b. Vecteurs diurnes
Trypanosomiases : Glossines
Loaose: Chrysops
Onchocercose : Simulies
Mansonelloses: Culicoïdes
3. 2. Par les vecteurs terrestres
Maladie de Chagas (Trypanosomiase américaine) : Punaises
Babésiose : Tiques

29
4. Transmission aérienne : Pneumocystose

5. Transmission sexuelle : Trichomonose (Trichomonas vaginalis)

6. Transmission congénitale : Toxoplasmose, trypanosomiases

7. Transmission par transfusion : Paludisme, trypanosomiases, filarioses, toxoplasmose

8. Transmission par transplantation : Toxoplasmose

IV. LOCALISATION DU PARASITE CHEZ L’HOTE

La localisation du parasite chez l'hôte permet de différencier :
* Les ectoparasites : Vivent à la surface du corps ou dans les cavités naturelles (Poux, puces,
punaises, tiques, sarcopte de la gale…).
* Les endoparasites : Se localisent dans les cavités profondes, les tissus ou le sang de l'hôte.
(Ascaris dans le tube digestif, plasmodies dans le sang, Trichine dans les tissus, Toxoplasme à
l’intérieur des cellules).

A côté de la localisation du parasite, on peut distinguer :

*Le parasitisme accidentel : Il s'agit d'animaux libres qui peuvent être avalés fortuitement et qui
s'élimineront d'eux-mêmes. (Cas des infusoires et des larves de mouches).
*Le parasitisme facultatif : Concerne des organismes qui vivent dans la nature mais ne
deviennent parasites que dans certaines conditions favorables (myiases, champignons…).
*Le parasitisme obligatoire : Concerne les parasites qui ne peuvent vivre qu’aux dépens d'autrui.
Il existe différents types :
*Le parasitisme temporaire : Le parasite quitte l'hôte quand ses besoins nutritifs sont satisfaits.
(Anophèle : vecteur du paludisme)
*Le parasitisme périodique : Le parasite ne vit sur l'hôte qu'une partie de son existence, il n'est
parasite qu'a l'état larvaire (hypodermes) ou qu'a l'état adulte.
*Le parasitisme permanent : Le parasite vit sur l'hôte pendant tout son existence (leishmanies,
ascaris).
*Les parasites erratiques : Ce sont des organismes que l'on retrouve en dehors de leur
localisation habituelle. On dit qu'ils sont dans une "impasse parasitaire". Syndrome de larva
migrans viscérale (toxocarose) ou cutané (larbish), hydatidose, échinococcose alvéolaire,
dirofilarioses, trichinellose, angiostrongilose, gnathostomose.

30
V. INTERACTIONS HOTE-PARASITE
Relation hôte parasite (Variations entre le porteur sain de parasites et le malade). Le conflit plus
ou moins pathogénique entre le parasite et son hôte peut, cliniquement et biologiquement,
s’étendre du portage sain de parasites par l’hôte à la maladie chronique avec des épisodes
cliniques plus ou moins aigus et répétés.
L’équilibre nécessaire à la survie du parasite et de l’hôte est fragile et dépend de facteurs propres
aux parasites et de ceux résultant des défenses de l’hôte. Les parasites sont diversement virulents
et la pathogénicité reste en partie liée à la quantité de parasite et à leur pouvoir de contourner les
défenses que l’hôte va leur opposer. L’hôte parasité en plus d’une réceptivité qui lui est propre va
engager contre son parasite des modes de défense aspécifique commune aux agressions par tous
les pathogènes (réactions inflammatoires, allergiques…), et des réponses spécifiques (réactions
immunes humorales et cellulaires dirigées contre une forme parasitaire ou le parasite dans son
ensemble).

1. Réactions de l'hôte au parasite

1.1. Réactions allergiques
S'observent dans les helminthiases lors d'une ascaridiose, les vers réagissent à la production des
anticorps par des sécrétions allergisantes connues sous le nom d'ascaron qui provoque un prurit et
une fièvre.
Dans l'ankylostomiase, les larves erratiques au niveau du carrefour aéro-digestif provoquent le
syndrome de Loeffler qui se manifeste par une toux et une dyspnée.

1.2. Réactions sanguines humorales

La présence d'un parasite dans l'organisme entraîne la formation d'anticorps dirigés contre les
antigènes parasitaires. Ces réactions vont de l'hypersensibilité jusqu'à l'immunité.

1.3 Réactions pathogènes de l’hôte

Certaines réactions excessives de l’hôte à l’infestation parasitaire peuvent être pathogènes. Il peut
s’agir de processus cellulaires, tissulaires et immunologiques :
*Processus cellulaires : ils mobilisent, macrophages, éosinophiles intervenant par exemple dans
l’anémie comme dans le cas du paludisme de phénomène de séquestration splénique et
splénomégalie. La splénomégalie : Par destruction d'hématies parasitées (paludisme), par
parasitisme du système réticulo-endothélial (leishmaniose), par hypertension portale
(schistosomiase). L'anémie : Conséquence d'une hémolyse (paludisme), d'un saignement

31
(ankylostome), d'une séquestration splénique (leishmaniose), ou d'une carence en vitamine B12
(bothriocéphalose).
* Processus tissulaires : ils s’expriment par les granulomes réactions autour d’un œuf
(bilharzioses) ou d’une larve (toxocarose) modifiant les fonctions tissulaires, évoluant
éventuellement vers des calcifications (vessie et uretères dans la bilharziose urogénitale) ou par
des développements scléro-fibreux excessifs (éléphantiasis des filarioses lymphatiques) et dans
certains cas par une implication dans les phénomènes de cancérisation (bilharziose urinaire et
cancer de la vessie).
* Processus plus directement immunopathologiques : ils impliquent antigènes, anticorps et
complexes immuns circulants participant à la formation de métaplasies réactionnelles
(paragonimose), de granulomes, de phénomènes allergiques et anaphylactiques. Les troubles
immunologiques c’est quand les anticorps produits contre le parasite s'attaquent à l'organisme
hôte (auto-immunité, hypersensibilité et allergie…).
* Facilitation (Favorisation) parasitaire et Echappement (Evitement). Le parasite co-évoluant avec
son hôte s’organise pour assurer sa survie (adaptation) par différents moyens : une très forte
fécondité comme dans le cas des taéniases (T. saginata peut produire plus de 100 millions d’oeufs
par an !), la polyembryonie au stade larvaire souvent (rédies des schistosomes dans le mollusque,
une résistance particulière au milieu extérieur (l’oeuf d’ascaris peut survivre plusieurs années),
une longévité de plusieurs années (plus de dix ans pour P. malariae, l’anguillule, les bilharzies ou
les filaires),et des adaptations métaboliques et immunologiques à leurs hôtes.

2. Conséquences du parasitisme
Parmi les conséquences du parasitisme, on peut citer :

L’action spoliatrice : le parasite vivant aux dépens de son hôte est spoliateur par définition. Les
spoliations souvent mineures s’expriment davantage si les parasites sont nombreux (anémie
ankylostomienne) ou lorsqu’ils détournent à leur profit certaines substances (anémie de Biermer
par spoliation en vitamine B12 dans le cas de la bothriocéphalose). La spoliation sanguine est le
résultat de gaspillage (ankylostomes hématophages broutant la muqueuse duodénale), d’hémolyse
(hématozoaires du paludisme), agénérative centrale (pan cytopénie des leishmanioses viscérales).
La spoliation intestinale est rarement directement en cause (tænias, ascaris). La spoliation : Le
parasite détourne des métabolites pour son propre métabolisme.
- L’action mécanique-traumatique fréquente est fonction de la taille des parasites, de leurs
localisations, et leurs éventuelles migrations ectopiques. Elle peut être microscopique (éclatement

32
de globules blancs pour les leishmanies et de globules rouges dans le cas de l’hématozoaire, des
cellules rétiniennes par le toxoplasme), ou macroscopique bruyante comme l’occlusion
lymphatique (filariose lymphatique), biliaire (douves) ou intestinale par un paquet d’ascaris, la
migration ectopique ou la perforation d’un ver, ou encore la compression par un kyste hydatique,
l’agression duodénale par les ankylostomes.
Les troubles traumatiques : Telles l'obstruction des capillaires, les lésions de la rétine par
rupture de kystes de Toxoplasma, les occlusions intestinales, les granulomes urinaires…
- L’action traumatique bactérifères : tout parasite perforant une muqueuse ou le revêtement
cutané peut constituer une porte d’entrée microbienne (amibes et abcès amibien, filaire de Médine
et perforation au niveau des malléoles).
- L’action irritative : elle peut être réflexe (spasmes intestinaux de l’intestin agressé, diarrhées,
épisodes de toux au passage de formes vermineuses larvaires…) mais elle va surtout à plus long
terme entraîner la formation de granulomes inflammatoires autour des oeufs ou larves parasitaires
(dermatite parasitaire et granulomes inflammatoires des bilharzies et larva migrans ) et/ou des
foyers de scléro-fibrose ( filarioses, bilharzioses), restant suspect dans la genèse de complications
néoplasiques (bilharziose urinaire et cancer de la vessie, opisthorchiose et cancer hépato-biliaire).
- L’action toxique due à l’émission d’excrétion/sécrétion toxiques d’arthropodes dans les plaies
de piqûre ou de produits métabolisés par le parasite et qui auront des actions allergisantes voir
anaphylactiques, histolytique comme les amibes nécrosantes, hémolytique dans le cas du
paludisme ou nécrotique dans quelques parasitoses à tiques. L’action toxique est souvent majorée
à la mort du parasite suite à un traumatisme ou au traitement (fissuration ou rupture d’un kyste
hydatique, lyse sous thérapeutique des microfilaires) avec de fréquents phénomènes allergiques ou
anaphylactiques.
- L’action infectieuse : coexistence entre un parasite et un microbe, est parfois mise à juste titre
en évidence dans le couple bilharzies-salmonelles ou la salmonelle enchâssée dans le schistosome
échappe à la thérapeutique curative complète, elle est plus discutable dans la relation entre
l’appendicite et l’oxyure.
- L’action immunodépressive, allergique voir anaphylactique est celle de tout corps étranger
pénétrant un organisme qui se défend.
- Notion de complexe pathogène : Ces modes d’actions souvent multiples plus ou moins
spécifiques d’un parasite, se mêlent à ceux d’autres agents infectieux parasitaires, bactériens ou
viraux, qui sur un fond de nutrition déficient, définissent des complexes pathogènes
malheureusement interactifs impliqués dans tous les phénomènes morbides et mortels propres aux
pays en voie de développement. (Quelques associations morbides et mortelles : paludisme et

33
rougeole, bilharzioses et salmonelloses, parasitisme et malnutrition, opportunistes parasitaires et
mycosiques et immunodépression rétrovirale ou thérapeutique …).
Les surinfections : Elles interviennent chez un sujet déjà atteint d'une maladie infectieuse.
La prescription d'antibiotiques est la règle si la surinfection est bactérienne.

VI. CLASSIFICATION DES PARASITES

RAPPEL : Nomenclature et systématique (taxonomie) des parasites humains d’abord
morphologique fait maintenant appel à d’autres critères génétiques et immunologiques. Les lois de
la systématique sont simples mais strictes. Depuis Charles Linné tous les animaux et végétaux
sont désignés par deux mots latinisés (binôme linnéen) (le premier : nom de genre, porte une
majuscule, le second sans majuscule est le nom de d’espèce (les deux en italiques ou soulignés)
suivi du nom de l’auteur qui l’a attribué la première fois et de la date de cette attribution. L’espèce
est l’ensemble d’individus dont le croisement, fait au hasard, donne toujours des descendants
indéfiniment féconds entre eux, le genre regroupant des espèces affines.
Ex : Culex pipiens Linné 1758

Figure 1 : Genre et espèce sont issues d’une suite d’étapes

Les naturalistes face à la diversité croissante ont dû créer le sous-genre, avec une majuscule et
entre parenthèses, après le nom de genre, et la sous espèce qui s’écrit sans majuscule après le nom
d’espèce. Ex : Anopheles (Maculipennia) maculipennis atroparvus van Thiel 1927

1. Les phytoparasites
Seuls les champignons microscopiques intéressent la pathologie humaine.
2. Les zooparasites
Appartiennent à trois groupes :
Les protozoaires, les helminthes et les arthropodes.

2. 1. Les protozoaires

34
Êtres vivants unicellulaires eucaryotes souvent mobiles.
Ces organismes font partie du règne des protistes.
Toutes les fonctions nécessaires à la vie sont remplies par cette cellule unique grâce aux
organelles qui remplissent le rôle des tissus et des organes des animaux plus complexes.
La locomotion est assurée par trois types d’organelles : Les pseudopodes, les flagelles et les cils.
Les échanges avec le milieu ambiant se font par diffusion à travers les membranes cellulaires.
Cette diffusion joue un rôle important dans la respiration, l'alimentation, l'excrétion et
l'osmorégulation.
La reproduction des protozoaires peut être :
Asexuée
*Par fission binaire, au cours de laquelle l'individu se sépare littéralement en deux pour produire
deux individus identiques et de même taille.
*Par bourgeonnement au cours duquel une extension de l'organisme se sépare et produit un
nouvel individu
*Par fission multiple où le parent multinucléé se divise en plusieurs cellules de taille semblable.
Ou sexuée
*Par la formation de gamètes mâles et femelles (gamétogénèse)
*Par la conjugaison (chez les ciliés) qui consiste à un échange de matériel génétique.

Les défenses sont assurées par :

*La formation de kystes résistants lorsque les conditions deviennent difficiles.
*Les trichocystes des ciliés, sorte de petits harpons enduits de substances paralysantes, utilisés
pour immobiliser les proies.
*Par la modification continuelle des antigènes du glycocalyx de manière à rendre les anticorps
inopérants (Trypanosoma).

Les protozoaires susceptibles de parasiter l'homme appartiennent à 04 sous-embranchements :

*Sarcomastigophora : Comprend les rhizopodes et flagellés.
*Ciliophora : Renferme les ciliés.
*Apicomplexa : Comprend les sporozoaires. Possèdent une combinaison caractéristique
d'organelles appelée complexe apical.
*Microspora : Comprends-les microsporidies. Selon leur mode de locomotion on distingue 4
classes :
*Classe des Rhizopodes

35
 Cellules présentant des avancées cytoplasmiques dites pseudopodes qui leur permettent de se
déplacer quand ils sont à l'état trophozoïtes. Peuvent être libres, saprophytes ou parasites.
Genres Entamoeba, Dientamoeba, Endolimax, Pseudolimax, Iodamoeba
L'espèce pathogène est Entamoeba histolytica histolytica Amibiase
*Classe des Flagellés : Se déplacent à l'aide d'un ou plusieurs flagelles
Les flagellés pathogènes sont : Flagellés sanguicoles Ordre Kinetoplastida Genre Trypanosoma
et genre Leishmania ; Flagellés intestinaux Ordre Diplomonadida
Giardia intestinalis ; Flagellés génito-urinaires Ordre Trichomonadida Trichomonas vaginalis
*Classe des sporozoaires : Sont peu mobiles car ils ne possèdent pas d'appareil locomoteur,
leur déplacement se fait par flexion, glissement ou ondulation.
Vivent à l'intérieur des cellules de l'hôte.
-Famille Sarcocystiidae Toxoplasma gondii Toxoplasmose
-Famille Plamodiidae Plasmodium sp Paludisme
*Classe des ciliés : Se déplacent grâce à des cils vibratiles
Un seul pathogène occasionnellement rencontré chez l'homme: Balantidium coli

2. 2. Les helminthes ou vers

Les Helminthes sont des invertébrés à corps mou et dépourvus d'appendices. Ceux qui ont une
importance médicale sont classés en deux grands embranchements : les Plathelminthes et les
Némathelminthes.

a. Embranchement des plathelminthes

Du grec platy = plat et helmins = vers.
Vers plats, non recouverts de chitine, pourvus de ventouses.
Ils peuvent être libres (Turbellariés) ou parasites (cas de 85% d'entre eux).
Cet embranchement comprend deux classes :
*Classe des Cestodes
Vers rubanés dont le corps est composé :
- d'un scolex qui porte les organes de fixation (ventouses, crochets, bothridies),
- d'un cou non segmenté qui est une zone de formation des anneaux
- et d'un strobile qui est l'ensemble des segments ou proglottis qui contiennent les organes
génitaux mâles et femelles.
Ils sont hermaphrodites et dépourvus du tube digestif.
Famille des Taeniidae
Tænia saginata, Tænia solium, Echinococcus granulosus, Echinococcus multilocularis.

36
Famille des Hymenolepididae
Hymenolepsis nana
*Classe des Trématodes
Vers foliacés, non segmentés et pourvus d'un tube digestif.
L'œuf est operculé chez les douves et muni d'un éperon chez les schistosomes.
Ils sont :
- Soit hermaphrodites telles les douves agents des :
*Distomatoses intestinales dues à Fasciolopsis buski, Heterophyes heterophyes,
Capillaria philippinensis.
*Distomatoses hépato-biliaires dues à Fasciola hepatica, Fasciola gigantica,
Dicrocoelium dentriticum, Clonorchis sinensis, Opistorchis felineus.
*Distomatoses pulmonaires dues à Paragonimus sp.
- Soit à sexe séparés telles les schistosomes agents des bilharzioses :
*Schistosoma mansoni agent de la bilharziose intestinale
*Schistosoma haematobium agent de la bilharziose vésicale
*Schistosoma intercalatum agent de la bilharziose rectale
*Schistosoma japonicum agent de la bilharziose artério-veineuse

b. Embranchement des Némathelminthes

Vers cylindriques, non segmentés, recouverts de chitine.
Ils sont tous à sexes séparés.
Le tube digestif est complet.
*Classe des Nématodes
Ils sont classés selon l'absence ou la présence de phasmides.
Les aphasmidiens sont Trichinella spiralis, Trichuris trichiuria et Capillaria sp.
Les autres nématodes sont des phasmidiens.
Ils sont soit ovipares soit vivipares :
*Ovipares : Trichuris trichiuria, Enterobius vermicularis (Oxyurose), Ascaris lombricoïdes
Ancylostoma duodenale, Necator americanus, Strongyloides stercoralis (Anguillulose),
Toxocara canis
*Vivipares : Trichinella spiralis, Wuchereria bancrofti, Brugia malayi,Loa loa, Onchocerca
volvulus, Dracunculus medinensis,Mansonella sp

2.3. Les arthropodes

37
Du grec "arthron" qui signifie articulation et "podos" qui signifie pied.
Ce sont des animaux pluricellulaires dont le corps et les appendices sont formés de segments
articulés.
Ils sont soit des parasites externes soit jouent un rôle de vecteurs.
Ils se subdivisent en six classes dont deux ont un intérêt sur le plan pathologique et
épidémiologique : Les Arachnides et les Insectes

a. Classe des Arachnides

Parasites externes ou ectoparasites avec un corps globuleux formé d'un céphalothorax portant 4
paires de pattes chez l'adulte et d'un abdomen. Renferment plusieurs ordres dont un seul
comprend des parasites de l’homme : Ordre des Acariens
On distingue :
*Les Ixodidés
Ixodes ricinus, Rhipicephalus sanguineus
*Les Argasidés
Les tiques molles : Argas reflexus
*Les Démodecidés
Le demodex : Demodex folliculorum
*Les Sarcoptidés
Le sarcopte de la gale : Sarcoptes scabiei
*Les Trombiculidés
L’aoûtat : Trombicula autumnalis

b. Classe des Insectes

Parasites externes ou ectoparasites avec un corps formé d'une tête, d'un thorax et d'un
abdomen. Ils ont 3 paires de pattes fixées sur le thorax.
Cette classe renferme quatre ordres : Anoploures, Aphaniptères, Hémiptères et Diptères

b1. Ordre des Anoploures

Absence d'ailes, animal aplati dorso-ventralement
Le pou du corps : Pediculus humanus corporis
Le pou de la tête : Pediculus humanus capitis
Le morpion ou pou du pubis : Phtirius pubis

b2. Ordre des Aphaniptères

Absence d'ailes, pattes postérieures développées pour le saut

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 La puce de l'homme : Pulex irritans
La puce chique : Tunga penetrans

b3. Ordre des Hémiptères : Deux paires d'ailes

Les punaises
La punaise des lits : Cimex lectularius
Les réduves : Rhodnius prolixus, Triatoma infestans
Seuls les Triatomidés d'Amérique tropicale transmettent la maladie de Chagas

b4. Ordre des Diptères : Une seule paire d'ailes

On distingue :
*Les Culicidés
Les Anophèles transmettent le paludisme et la filariose de bancroft.
Les Culex transmettent la filariose de bancroft.
Les Aedes transmettent la filariose de bancroft, la dengue et la fièvre jaune.
*Les Psychodidés : Phlébotome qui transmettent les leishmanioses
*Les Simuliidés : Simulium damnosum qui transmettent l'onchocercose
*Les Ceratopogonidés : Les culicoïdes qui transmettent les mansonelloses
*Les Tabanidés : Chrysops qui transmet la loase
*Les Glossinidés : Les glossines qui transmettent la maladie du sommeil.

VII. TRAITEMENT
Les antiparasitaires
Le dépistage et le traitement des malades ont une importance épidémiologique capitale afin de
rendre les malades non contagieux et de réduire le réservoir humain.
Ce traitement doit s'intégrer dans un ensemble de mesures plus vastes: lutte anti-vectorielle, lutte
contre le péril fécal, éducation sanitaire, assainissement etc.…

VIII. EXEMPLE DE PARASITOSES ET ESPECES PARASITAIRES

ASSOCIEES
1. Endoparasites
1.1. Plathelminthes
Classe des Cestodes
ESPECES PARASITAIRES PARASITOSES

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 Tænia saginata Téniase
Tænia solium Téniase
Hymenolepis sp Hyménolépiase
Echinococcus granulosus Hydatidose
Echinococcus multilocularis Échinococcose alvéolaire

Classe des Trématodes

ESPECES PARASITAIRES PARASITOSES
Distomatoses hépato-bilaires Fasciolase
Fasciola hepatica
Fasciola gigantica Fasciolase
Distomatoses pulmonaires Paragonimose
Paragonimus sp
Distomatoses intestinales Fasciolopsiose
Fasciolopsis buski
Schistosomiases ou bilharzioses Schistosomiase vésicale
Schistosoma haematobium
Schistosoma mansoni Schistosomiase intestinale
Schistosoma intercalatum Schistosomiase rectale
Schistosoma japonicum Schistosomiase artério-veineuse

1. 2. Némathelminthes
Classe des nématodes
ESPECES PARASITAIRES PARASITOSES
Ascaris lumbricoides Ascaridiose
Enterobius vermicularis Oxyurose
Ancylostoma duodenale Ankylostomiase
Strongyloides stercoralis Anguillulose
Trichinella spiralis Trichinose
Wuchereria bancrofti Wuchériose
Loa loa Loase
Onchocerca volvulus Onchocercose
Dracunculus medinensis Dracunculose

2. Ectoparasites
ESPECES PARASITAIRES PARASITOSES
Pediculus humanus capitis Poux
Pediculus humanus corporis
Phtirius pubis
Sarcoptes scabiei Gale
Ixodes ricinus Tiques
Ixodes scapularis
Rhipicephalus sanguineus
Thrombicula autumnalis Aoûtats
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 Cimex lectularius Punaises
Triatoma infestans
Ctenocephalides canis
Ctenocephalides felis
Tunga penetrans Puces
Plusieurs espèces Myiases
Limnatis nilotica Sangsues

IX. CYCLES ETUDIES (Cycle Direct Court)

1. Entamoeba histolytica
a) Cycle non pathogène

• Ingestion d’un kyste mûr éclosion donnant 8 amoebules du type minuta qui se multiplient
par division binaire au contact de la muqueuse colique.

• Elimination intermittente et irrégulière, dans le milieu extérieur, de kystes.

b) Cycle pathogène accidentel

• Les formes minuta coliques se transforment en formes histolytica donnant un abcès de la

muqueuse ; elles se multiplient par scissiparité dans les abcès.

• Pas de formation de kystes donc pas de rôle épidémiologiques direct.

• Le retour du parasite à la forme minuta après 3 semaines signalant ainsi la fin de la crise
amibienne.

• Possibilité de métastases sanguines et/ou lymphatiques à partir d’un abcès colique,

conduisant à des localisations extra coliques (foie, poumon, cerveau, …)

• Lors de la localisation extra colique, il n’y a pas de retour à la forme minuta.

41
Figure 2 : Cycles d’Entamoeba histolytica

2. Enterobuis vermicularis

42
Figure 3 : Cycle de Enterobuis vermicularis

• Chez l’Homme (Hôte définitif), les vers adultes sot situés dans la dernière partie de
l’intestin grêle, le caecum et le colon ascendant.

• Après fécondation, les mâles meurent, les femelles migrent vers l’anus qu’elles traversent
la nuit pour pondre à la marge anale (environ 10 000 œufs/femelle pondus en 20 à 60
minutes).

• Les œufs pndus sur la marge anale sont embryonnés (Larve L1), en quelques heures à la
température du corps puis passent à l’étape L2 (vermiforme) puis L3 infestante.

• Contamination par ingestion ou inhalation des œufs infestants.

• Auto infestation orale possible par ingestion d’œufs éliminés lors d’un prurit qui entraine
le grattage et donc les œufs sur les doigts et les ongles.

43
PARTIE III. BACTERIOLOGIE
Pr EKOUE NGO NKOT LAURETTE
(Charge horaire: CM 06 h, TD 02h30 h, TP 02h30, TPE 02h30)

OBJECTIF GENERAL
Ce cours a pour but de familiariser l'étudiant(e) avec la bactériologie générale.

OBJECTIFS SPECIFIQUES
À la fin du cours de Microbiologie Générale l'étudiant(e) devrait être capable de :
- Connaître et maîtriser les l'historique de la microbiologie ;
- Comprendre la morphologie et la structure de la cellule bactérienne ;
- Analyser les fonctions des différentes composantes des bactéries ;
- Connaitre les notions de nutrition bactérienne et leurs applications dans la culture des
bactéries.

1. DEFINITIONS
La bactériologie est l’étude des bactéries, de leur mode de vie, de leur alimentation, de leur
rapport avec le milieu dans lequel elles vivent ou avec les organismes qu’elles parasitent.
Les bactéries sont des micro-organismes unicellulaires, de petite taille. Ce sont des cellules
Procaryote c'est à dire des cellules qui ne possèdent qu'un seul chromosome et qui sont
dépourvues d’un noyau délimité par une membrane nucléaire.

2. MORPHOLOGIE ET STRUCTURE DE LA CELLULE BACTERIENNE

2.1 Généralités
Les bactéries ont été découvertes pour la première fois à la fin du 17ème siècle par A. Van
Leeuwenhoek qui a appelé les bactéries animalcules (animaux minuscules).
Ce n’est qu’au 19ème siècle que l’on découvre leur rôle dans la fermentation (Louis Pasteur) et la
transmission de pathologies avec Robert Koch, qui a donné son nom aux bacilles de Koch (agents
de la tuberculose). Pasteur s’est intéressé à la fermentation mais aussi au moyen de lutter contre
les infections dites « bactériennes ».

44
Ces organismes sont caractérisés par l'existence d'une paroi rigide, qui contient un constituant
spécifique des bactéries, le peptidoglycane. Ils ne possèdent qu’un seul chromosome et sont
dépourvus de membrane nucléaire. Ils sont également dépourvus d’appareil mitotique, de
mitochondries, de réticulum endoplasmique et d’appareil de Golgi. L'ensemble des bactéries
forme le domaine des Eubactéries (Eubacteria).
Pour voir les bactéries, il faut d’abord les colorer puis les observer au microscope. La méthode la
plus utilisée pour colorer les bactéries est la coloration de Gram, introduite par le bactériologiste
danois du même nom. Les bactéries sont réparties en deux groupes principaux, selon leurs
caractéristiques de coloration de Gram : les Gram-négatives et les Gram-positives.

2.2 Morphologie générale des bactéries

La morphologie signifie l’étude de la forme. Lorsqu’on observe les bactéries au microscope
optique, on reconnaît rapidement la forme des cellules, leurs dimensions et, enfin, les
arrangements ou les groupements qu’elles constituent entre elles. Toutes ces informations
définissent la morphologie bactérienne qui a constitué durant de longues années le critère essentiel
de reconnaissance et d’identification.

2.2.1 Dimensions
La taille est de l’ordre du micromètre (allant de 0,2 et 20 μm). Les dimensions des bactéries sont
variables. Les bactéries étant de l’ordre du micromètre sont visibles au microscope photonique
classique.

2.2.2 Forme
Les bactéries sont des organismes unicellulaires de formes variées. La forme des bactéries est un
critère permettant de les classer. Les principales formes sont : la forme sphérique ou coccoïde, la
forme en bâtonnet ou cylindrique et la forme spiralée ou hélicoïdale. Chacune de ces formes est
importante pour décrire la morphologie d’une espèce.
- Les bactéries en forme de petites sphères sont appelées des coques ou cocci.
- Les formes cylindriques ou bâtonnets. On en distingue deux principales : le bâtonnet droit ou
bacille (E. coli, bacille de Koch) et le bâtonnet incurvé en virgule ou vibrion (Vibrio cholerae).
- Les formes hélicoïdales (formes spiralée) sont des spirilles (Spiroplasma). Ces formes spiralées
se rencontrent chez les tréponèmes et les spirochètes.

45
Ces formes sont les plus caractéristiques, mais dans la nature d’autres formes existent : formes
pédonculées propres aux Caulobacter, les formes filamenteuses des bactéries ferrugineuses, les
formes mycéliennes chez les mycobactéries, les actinomycètes.

2.2.3 Groupements
Le groupement ou l’arrangement des bactéries va permettre de faciliter leur identification. Il existe
plusieurs modes d'arrangement cellulaire :
Les cocci, peuvent être isolés, se rassembler en paires (diplocoques : Neisseria gonorrhoeae), en
chaînettes (streptocoques : Streptococcus, Lactococcus), en grappes (staphylocoques), en tétrades,
en groupe de 8 (Sarcina) ou en grappe de raisins (Micrococcus, Staphylococcus).
Les bacilles sont souvent isolés mais retrouvés également en paires (Diplobacillus), en courte
chaîne (Streptobacillus, Lactobacillus), ou en palissade (Corynebacterium), en Y
(Bifidobacterium).

2. 3 Structure de la cellule bactérienne

L’examen de la cellule bactérienne à l’aide des techniques microscopiques modernes révèle
l’existence de deux types de structures : les structures extérieures à la paroi cellulaire (flagelles,
pili, capsule…) et les structures à l’intérieur de la paroi (membrane cytoplasmique, mésosome,
cytoplasme et structures intracytoplasmiques…).
Parmi ces structures, certaines structures sont présentes chez toutes les bactéries, ce sont les
éléments constants : paroi, membrane, cytoplasmique, chromosome, ribosomes) ; d’autres sont
retrouvés seulement chez certaines bactéries : ce sont les éléments inconstants ou facultatifs :
capsule, spore, plasmide, flagelle, fimbriae et pili sexuel, vacuoles à gaz, chromatophores,
inclusions de réserve. Le rôle et la composition chimique de chaque structure seront développés
dans cette partie.

2.3.1 Paroi bactérienne

La paroi se trouve au-dessus de la membrane cytoplasmique et au-dessous de la capsule. Mis à
part les mycoplasmes (groupe bactérien) et quelques archéobactéries, toutes les bactéries
possèdent une paroi cellulaire. C’est une structure rigide caractéristique de la cellule procaryote.
L’épaisseur de la paroi varie de 10 à 35 nm chez la plupart des bactéries.
Les bactéries sont majoritairement divisées en deux groupes selon le type de leur paroi : les Gram
+ et les Gram-. Le type de paroi d’une espèce peut en effet être défini par l’observation des
bactéries au microscope après coloration de Gram qui colore le cytoplasme des bactéries Gram +

46
en violet et celui des bactéries Gram- en rose. La différence de couleur s’explique par une
différence structurelle au niveau de la paroi des bactéries. Les bactéries Gram + ont une paroi très
épaisse et une seule membrane. Les bactéries Gram- ont une paroi globalement plus fine et plus
fragile mais deux membranes lipidiques.
Dans les deux cas, le peptidoglycane est le composant essentiel de la paroi bactérienne. Ce
complexe est un polymère composé de chaînes linéaires de sucres aminés : la N-
acétylglucosamine (NAG) et l’acide N-acétylmuramique (NAM). Ces chaînes sont reliées entre
elles par de courtes chaînes peptidiques. Le peptidoglycane participe à la solidité de la paroi et
donc à la résistance de la bactérie aux changements environnementaux.
Chez les Gram+, le peptidoglycane est épais (20 à 80 nm) et situé à l’extérieur de l’unique
membrane plasmique. Chez les Gram-, il est plus fin (5 à 8 nm) et situé entre les deux membranes
internes et externes.
La membrane plasmique qui est unique chez les Gram+ et double chez les Gram- est composée
d’une bicouche lipidique, tout comme la membrane des eucaryotes.
L’espace situé entre les deux membranes des bactéries Gram- est appelé périplasme. Les deux
membranes sont appelées membranes interne et externe. Des protéines sont insérées sur les deux
membranes des Gram- et celles des Gram+. Ces protéines peuvent avoir des parties exposées vers
le cytoplasme, le périplasme et le milieu extérieur. Elles servent à la communication entre les
bactéries, la détection des conditions environnementales, la prise de nutriments dans le milieu, le
déplacement ou encore la sécrétion des protéines vers l’extérieur. Les bactéries à Gram- possèdent
un pouvoir pathogène plus élevé grâce à la couche externe de lipides toxiques (LPS), qui sont
libérés sous forme d’endotoxines lorsque la cellule meurt. Ces bactéries sont également plus
résistantes, elles sont protégées contre la phagocytose à cause de la couche de lipide chargé
négativement.
La paroi des Gram + est faite de grande quantité d'acides teichoïques (50 % du poids sec de la
paroi). Il y a des acides lipoteichoiques. Ces acides ont pour fonction de maintenir les parois
(fonctions structurales) et sont spécifiques des Gram +. On note la présence possible des protéines
et des polysaccharides.
Les bactéries Gram- possèdent une grande molécule externe appelée lipopolysaccharide (LPS).
Celle-ci est composée d’une partie lipidique qui permet son ancrage dans la membrane externe et
d’une longue chaine de sucres. Cette molécule participe à la stabilisation de la paroi des Gram-.

47
[Link] Rôle de la paroi
- La paroi confère à la cellule sa forme. Si on enlève la paroi, on obtient des cellules sphériques
appelées protoplastes quand il s’agit des bactéries à gram positif, ou des cellules globuleuses
appelées sphéroplastes pour les bactéries à Gram négatif. De nombreux enzymes peuvent détruire
la paroi, ex le lysozyme qui rompt les liaisons β1-4 du peptidoglycane. Beaucoup d’antibiotiques
inhibent sa synthèse. C’est le cas des pénicillines.
- La paroi confère à la bactérie sa forme et sa rigidité grâce à la présence d’un composé
spécifiquement bactérien, le peptidoglycane ou muréine ou mucopeptide ; elle constitue le
squelette externe de la bactérie.
- Elle protège la bactérie. Elle forme une barrière osmotique qui maintient une pression osmotique
intracellulaire Elle généralement très élevée (5 à 25 atmosphères) exercée par la membrane
plasmique.
- Elle est également un passage obligé pour les échanges avec le milieu extérieur.
- Elle joue un rôle déterminant dans la spécificité antigénique des bactéries.
- Elle intervient dans le transport de certaines petites substances.

[Link] Quelques parois bactériennes particulières

Certains groupes bactériens possèdent des parois très différentes de celles des bactéries à Gram
positif et négatif. C’est le cas notamment des Archeobactéries et des Mycobactéries.
Chez les Archeobactéries, la paroi a une structure et une composition très différentes des
Eubactéries. Mais elle peut être colorée par la méthode de Gram et apparaît soit Gram+, soit
Gram- en fonction de la structure de leur paroi : les Gram (+) ont une paroi avec une couche
épaisse et homogène de peptidoglycane mais différent de celui des Eubactéries, on parle de
pseudomuréine, alors que les Gram (-) n’ont pas de membrane externe, ni de peptidoglycane,
mais elles possèdent une couche superficielle de sous-unités protéiques ou lipoprotéiques.
La paroi des mycobactéries est constituée de peptidoglycane. Leur paroi est très riche en acides
gras à très longues chaînes (> à C36) : les cires (acides mycoliques et arabinogalactanes), qui
empêchent de « prendre » la coloration de Gram. Pour rechercher les mycobactéries, on utilise la
coloration différentielle de Ziehl-Neelzen qui utilise des acides forts et de l’éthanol très concentré
auxquels les mycobactéries résistent alors que les autres bactéries sont décolorées ou détruites.
Ces bactéries sont qualifiées de BAAR = bacilles acido-alcoolo-résistants ou ou Ziehl-Neelsen
positif.
Ex: Mycobacterium bovis, Mycobacterium tuberculosis, Mycobacterium leprea.

48
2.3.2 Membrane cytoplasmique
Cette membrane ressemble beaucoup à celle des eucaryotes. Elle a une épaisseur de 7,5 nm. Elle
est composée :
- d’une bicouche de phospholipides, mais ne possède toutefois pas de stérol ;
- des protéines : les protéines périphériques et les protéines intrinsèques (transmembranaires)
- des traces de glucides : les glucides sont quantitativement des constituants mineurs et souvent
associés aux lipides (glycolipides) ou aux protéines (glycoprotéines).

La membrane plasmique joue plusieurs rôles :

- la membrane cytoplasmique sépare le cytoplasme de son environnement. Par conséquent, une
déchirure de la membrane provoque une fuite du contenu cellulaire et ainsi la mort de la cellule
(rôle protecteur) ;
- grâce aux protéines, la membrane plasmique contrôle les échanges entre le milieu intérieur et le
milieu extérieur, c’est une barrière perméable et sélective ;
- grâce aux lipides insolubles, la membrane permet l’intégrité du compartiment cellulaire. La
cellule ne se défait pas dans son milieu liquide ;
- grâce aux sucres de surface (antigènes spécifiques à chaque individu), la membrane permet aux
cellules de se reconnaître entre elles et de s'agréger en tissus et aussi de rejeter les cellules
étrangères (immunité) ;
- elle assure également la régulation de la pression osmotique.
Les rôles de la membrane cytoplasmique bactérienne ne sont pas limités aux échanges cellulaires
uniquement. En effet la membrane est impliquée dans la respiration cellulaire, dans la régulation
de la division cellulaire et dans la réplication de l'ADN via le mésosome, dans la biosynthèse du
peptidoglycane. De plus, la membrane est le lieu de fixation des flagelles et de l'initiation de leur
mouvement. Par ailleurs, elle est la cible de certaines substances telles que les détergents et les
antibiotiques.
Les mésosomes sont des invaginations de la membrane plasmique en forme de vésicules, tubes ou
lamelles. Le mésosome est en étroite liaison avec le matériel nucléaire. On pense qu’il joue un rôle
dans sa division et la naissance du septum séparant les deux cellules filles et aussi dans la synthèse
de la paroi. Ils permettent d’augmenter l’activité respiratoire de la cellule.

2.3.3 Cytoplasme
Le cytoplasme se trouve entre la membrane plasmique et le nucléoïde. Il contient :
- les ribosomes qui interviennent dans la synthèse des protéines.

49
- les inclusions cytoplasmiques (substances de réserve): Différentes substances chimiques peuvent
s’accumuler dans le cytoplasme pour former des granules appelés inclusions. Ces substances sont
variables suivant les genres de bactéries. C’est généralement du glycogène, de l’amidon, des
lipides parfois chez certaines bactéries du soufre, du fer ou des phosphates, etc.

- Chromatophores : les bactéries photosynthétiques possèdent les chromatophores. Ce sont

organites spécialisés au niveau desquels s’effectue la photosynthèse. Ces organites jouent chez ces
bactéries le rôle que jouent les chloroplastes chez les plantes vertes. Toutefois, leur structure est
différente de celle des chloroplastes et leurs pigments photosynthétiques sont appelés
bactériochlorophylles (leur composition est différente de celle des pigments chlorophylliens).

- Vacuoles à gaz : elles sont rencontrées chez les cyanobactéries et les bactéries
photosynthétiques. Elles permettent aux bactéries de flotter et de remonter à différentes
profondeurs pour capter le maximum de lumière, d’O2 et de nourriture.

- Pigments (= molécules colorées) : on trouve des bactériochlorophylles (couleur verte) ou des

caroténoïdes (couleur jaune de l’espèce Staphylococcus aureus).

- Matériel nucléaire : le matériel génétique de la bactérie est constitué d’un chromosome unique,
circulaire constitué d’un filament d’ADN bicaténaire en suspension dans le cytoplasme. Le
chromosome bactérien est le support des caractères héréditaires, de l’information génétique.

- Plasmides : Les plasmides sont des molécules d’ADN double brin, extra chromosomiques,
circulaires, contenant des gènes supplémentaires et portant, comme le chromosome bactérien, des
informations génétiques. Ils peuvent soit s’intégrer dans le chromosome (épisomes), soit exister
séparément. Ils sont capables de réplication autonome dans le cytoplasme bactérien. Les plasmides
confèrent à la bactérie qui les possède des caractéristiques spécifiques. On distingue :
- les plasmides de résistance, également appelés facteurs R, qui portent des gènes codant pour
des résistances aux antibiotiques, aux antiseptiques, aux bactriophages et aux métaux lourds ;
- les plasmides métaboliques qui portent des gènes permettant l'utilisation de certains
nutriments ;
- les plasmides de virulence qui portent des gènes codant des facteurs de virulence, ayant un rôle
dans le pouvoir pathogène des bactéries ;
- les plasmides de conjugaison, également appelés facteurs F, qui portent des gènes codants pour
les constituants des pili sexuels.

50
2.3.4 Eléments inconstants
[Link] Capsule
La capsule est une structure externe non constante qui entoure la paroi, sans structure visible au
microscope électronique. Elle est constituée de polysaccharides, parfois de protéines. La capsule
est difficile à observer au microscope optique par les méthodes de coloration usuelles. Pour la
mettre en évidence, la coloration négative est utilisée. La capsule forme alors un halo clair autour
de la bactérie. L’encre de Chine est en fait un colorant négatif, c’est-à-dire qu’il ne colore pas la
capsule, mais les bactéries en possédant apparaissent entourées d’un halo lumineux. La capsule
joue un rôle important dans la défense des bactéries. Elle protège la bactérie de la phagocytose et
la protège contre les agents physiques, chimiques et contre la dessiccation. Elle est antigénique.

[Link] Flagelles
Les flagelles sont des structures rigides, ondulées qui naissent de la membrane cytoplasmique. Ils
sont constitués entièrement de protéines appelées flagellines. Les flagelles assurent la mobilité de
la bactérie. Les flagelles sont extrêmement fins, invisibles au microscope optique sur des cellules
vivantes. La disposition des flagelles peut être différente selon les espèces, ainsi, on distingue chez
les bactéries deux types principaux d’insertion des flagelles :
- Insertion polaire : le ou les flagelles sont insérés à une ou aux deux extrémités de la cellule.
- bactérie est monotriche si l’on ne rencontre qu’un seul flagelle à une de ses extrémités ;
- bactérie amphitriche lorsqu’une touffe de flagelles émerge à chaque pôle ;
- bactérie lophotriche lorsqu’une touffe émerge à un pôle.
- Insertion péritriche : la bactérie porte de nombreux cils insérés sur tout le pourtour de la cellule.

La mobilité permet aux bactéries d’envahir les tissus de l’hôte ce qui permet de considérer les
flagelles comme des facteurs de virulence. L’autre rôle est du chimiotactisme permet à la bactérie
de sentir le milieu environnemental (attractif ou répulsif) et provoque une réponse par un
changement de rotation des flagelles.

[Link] Pili ou fimbriae

Les pili sont des structures de surface plus courts et plus fins que les flagelles qui sont quasi
systématiques chez les Gram- et rares chez les Gram+. Ils sont de nature protéique. Une cellule
peut en contenir plus de 1000. On distingue 2 types de pili qui diffèrent par leur fonction :
- les pili communs : ils sont nombreux autour de la bactérie, courts (de l’ordre de 1µm) et rigides.
Ils sont essentiellement constitués de deux protéines : la piline et l’adhésine. Ils jouent un rôle

51
dans le pouvoir pathogène de la bactérie en permettant une bonne adhésion des bactéries aux
muqueuses. Ils constituent donc un facteur de virulence pour les bactéries pathogènes ;
- les pili sexuels : ils sont plus longs (10 µm environ) et se terminent par un renflement. Bien que
composés également de piline, il y en a généralement qu’un par cellule. Ils sont codés par les
gènes présents sur certains plasmides (plasmides conjugatifs). Les pili sexuels sont produits par les
bactéries porteuses de ces plasmides (bactéries donneuses) et servent à entrer en contact avec
d’autres bactéries (bactéries receveuses). Ils ont un rôle dans la conjugaison bactérienne. Les
bactéries peuvent échanger des gènes de résistance aux antibiotiques et échanger le facteur de
virulence. Les bactéries capables de produire des pili sexuels grâce à la présence du facteur F sont
dites bactéries « mâles » ou « F+ », à l'opposé des autres qui sont dites « femelles » ou « F ».
Les différents modes de transfert génétique sont les suivants :
- la conjugaison chez les bactéries est une sorte de mécanisme sexuel primitif. Elle consiste en un
transfert unidirectionnel de matériel génétique d’une cellule (donneuse) à une autre (receveuse) ;
- la conjugaison qui est le transfert d'un plasmide conjugatif (possède des gènes qui assurent leur
transfert par conjugaison) d'une bactérie donneuse à une bactérie receveuse grâce à un pilus
sexuel ;
- la mobilisation est le transfert d'un plasmide non conjugatif (sont incapables d’effectuer leur
propre transfert) d'une bactérie donneuse à une bactérie receveuse en se mobilisant sur un
plasmide conjugatif. Le transfert est effectué via un pilus sexuel ;
- la transduction est l'introduction d'un matériel génétique à l'intérieur d'une bactérie par
l’intermédiaire d’un bactériophage ;
- la transformation qui est le transfert de gènes dans la cellule par absorption d’ADN nu.

2.3.5 Spores bactériennes

Certaines espèces bactériennes à Gram positif du genre Bacillus, Clostridium et Sporosarcina
ont développé une stratégie de résistance aux conditions sévères de l’environnement. Confrontées
à un stress (manque de nutriments, baisse de température, dessiccation…), ces espèces
développent à l’intérieur du cytoplasme une structure qui englobe le matériel génétique et
l’assèchent complètement. Cette structure est appelée endospore, tant qu’elle est dans la cellule.
Le processus de formation de l’endospore entraîne par la suite l’éclatement du reste de la cellule
et le relargage de l’endospore, qu’on appelle alors simplement spore. Ce phénomène est appelé la
sporulation. Le processus de sporulation est seulement présent chez les bactéries. Ces spores
représentent un véritable danger lors de la stérilisation du matériel à des fins médicales.

52
La spore ne sert qu’à assurer la survie de la bactérie jusqu’à ce que les conditions s’améliorent. A
ce moment, la spore va se gorger d’eau, reprendre son métabolisme et devenir un bacille, donc
retourner à la forme végétative. Le cycle sporal caractérise ces transferts où alternent les phases
végétatives de croissance, le processus de sporulation et la germination.
La situation des endospores dans les cellules ainsi que leur grosseur ne sont pas les mêmes pour
toutes les espèces. Certaines sont centrales : formées au milieu de la cellule. D’autres sont
terminales : formées à l’extrémité de la cellule et d’autres sont subterminales : formées près de
l’extrémité de la cellule.
Le diamètre de la spore peut être plus grand ou plus petit que celui de la cellule végétative. Les
spores peuvent avoir des formes différentes : sphériques, elliptiques ou ovoïdes. La présence
d’une endospore, sa situation dans la cellule, sa grosseur et sa forme sont utiles pour identifier et
caractériser les bactéries.

[Link] Structure de la spore

La spore observée au ME présente une structure complexe résultat des modifications chimiques et
biochimiques. La région cytoplasmique centrale comprend le matériel nucléaire. Les enveloppes
constituées autour de la membrane sporale ont des structures et des compositions variées. On
distingue :
- la paroi sporale contenant le peptidoglycane normal qui deviendra, après germination de la
spore la paroi de la cellule végétative ;
- le cortex : il est formé d’un peptidoglycane inhabituel. Il contient une forte proportion de
dipicolinate de calcium, son autolyse constitue une étape déterminante dans la germination ;
- les tuniques (internes et externes) sont composées de protéines. Imperméables, elles sont
responsables de la résistance aux agents chimiques ;
- l’exosporium enfin, la couche la plus externe est une membrane lipoprotéique. Il n’est pas
essentiel à la survie de la spore.

[Link] Propriétés des spores

- Résistance à la dessiccation et au vieillissement :
Ces phénomènes semblent dus à la faible teneur en eau et au métabolisme ralenti : on parle d’état
de dormance. La faible teneur en eau (les cellules bactériennes végétatives contiennent environ 80
% d'eau, les spores n'en contiennent guère plus de 15 %);
- Thermorésistance

53
La spore résiste en général à des températures de 70-80°C pendant 10 minutes, parfois plus. Cette
propriété est due à la présence de l’acide dipicholinique et à la déshydratation de la spore.
- Résistance aux agents physiques et chimiques
La spore résiste aux rayons U.V et rayons X, aux désinfectants aux attaques des acides, des bases
et aux antibiotiques.
- Synthèse d’antibiotiques
Certaines bactéries synthétisent des antibiotiques au début de la phase de sporulation. Exemple :
Bacillus licheniformis synthétise ainsi la Bacitracine ; Bacillus polymyxa la polymyxine.

3. NUTRITION BACTERIENNE
Pour étudier les microorganismes, il faut les cultiver en culture pure et pour cela il faut connaître
leurs exigences nutritionnelles ainsi que les conditions physiques pH, T °C, pression osmotique.
Pour qu’une bactérie puisse vivre et se reproduire elle doit trouver dans son environnement de
quoi satisfaire ses besoins nutritifs. La nutrition bactérienne est l’analyse des besoins élémentaires,
énergétiques et spécifiques nécessaires au fonctionnement et à la croissance de la bactérie, ainsi
que des facteurs physico-chimiques susceptibles de les influencer.
3.1 Besoins élémentaires des bactéries
3.1.1 Eau
L'eau représente 80 à 90 % du poids cellulaire. Elle joue un rôle fondamental en solubilisant les
nutriments, en assurant leur transport et en assurant les réactions d'hydrolyse. La quantité d’eau
disponible peut être chiffrée. On utilise généralement l’activité de l’eau (Aw) comme moyen
d’expression quantitative de l’eau disponible.
L'activité de l'eau (Aw) correspond à la disponibilité en eau des microorganismes pour participer à
des réactions chimiques : c’est le rapport de la pression partielle en eau d’un milieu et celle de
l’eau pure. L’activité de l’eau est comprise entre 0 et 1. La plupart des bactéries se multiplient bien
quand l’aw est de 0.98.

3.1.2 Macroéléments et oligoéléments

Parmi les besoins courants chez les microorganismes en général et chez les bactéries notamment,
on distingue :
- les macro-éléments comme le carbone, l'oxygène, l'hydrogène, l'azote, le soufre, le phosphore, le
potassium, le calcium, le magnésium et le fer qui sont nécessaires en quantités importantes ;

54
- les oligo-éléments comme le manganèse, le zinc, le cobalt, le molybdate, le nikel et le cuivre,
sont nécessaires en très faibles quantités.

3.2 Besoins énergétiques

Ils couvrent les dépenses engagées dans les processus catabolisme et de biosynthèse. La source
d’énergie peut être la lumière ou souvent l’oxydation d’un substrat oxydable dit « énergétique »
donneur d’électrons :
- si la source d'énergie est la lumière, les bactéries sont dites phototrophes ;
- si la source d'énergie est l’oxydation des molécules diverses : chimiques, organiques ou
minérales), les bactéries sont dites chimiotrophes.
Les bactéries phototrophes font appel à des composés minéraux ou organiques comme sources
d'électrons :
- si la source d'électrons est minérale, les bactéries sont qualifiées de photolithotrophes ;
- si la source d'électrons est organique, les bactéries sont photoorganotrophes.
Les bactéries Chimiotrophes utilisent des composés minéraux ou organiques comme donneurs ou
accepteurs d'électrons :
- si le donneur d’électrons est minéral, la bactérie est dite chimiolithotrophe.
- si le donneur d'électrons est organique, les bactéries sont chimioorganotrophes.
On appelle bactéries paratrophes, les bactéries intracellulaires comme les rickettsies et les
chlamydies qui tirent leur énergie de leur parasitisme obligatoire.

3.3 Types nutritionnels ou trophiques

Le terme type trophique spécifie la manière dont un organisme vivant constitue sa propre matière
organique. Il existe différents types trophiques basés sur le type de nutriments, de la source de
carbone, sources énergétiques, sources du pouvoir réducteur :
- selon les nutriments, on distingue les bactéries prototrophes qui peuvent synthétiser leurs propres
nutriments, et les bactéries auxotrophes qui nécessitent un apport extérieur d'un élément particulier
(facteur de croissance) ;
- selon la source de carbone, on distingue les bactéries autotrophes qui utilisent le CO2 comme seule
source de carbone, et les bactéries hétérotrophes qui nécessitent une matière organique comme le
glucose (alcool, l’acide acétique, l’acide lactique, des sucres divers …). ;
- selon la source d’énergie, on distingue les bactéries phototrophes qui utilisent la lumière comme
source d'énergie, et les bactéries chimiotrophes qui utilisent des composés minéraux ou organiques
comme donneurs ou accepteurs d'électrons ;
- selon la source du pouvoir réducteur, on distingue les bactéries lithotrophes si le donneur d’électrons
est minéral et les bactéries organotrophes si le donneur d'électrons est organique.
55
3.4 Besoins spécifiques : facteurs de croissance
En complément de ces éléments de base, certaines bactéries exigent pour leur développement la
présence des molécules organiques spécifiques qu’elles sont incapables de synthétiser et que l’on
appelle facteur de croissance. En fonction des besoins, on classe les microorganismes en deux
catégories : les prototrophes qui ne nécessitent pas de facteurs de croissance dans le milieu de
culture et les auxotrophes qui exigent en plus, un ou plusieurs facteurs de croissance qu'elles sont
incapables de synthétiser. Ce sont :
- des acides aminés (synthèse des protéines cellulaires), Ex : Glu, Ala, Asn ;
- des bases puriques et pyrimidiques (synthèse des acides nucléiques et de l’ATP), Ex : adénine
pour certains Lactobacillus ; uracile pour certains Streptococcus ;
- des vitamines : Ex nicotinamide pour Proteus ; thiamine pour Staphylococcus aureus.

4. CROISSANCE DES BACTERIES

La croissance bactérienne est l’augmentation du nombre de bactéries suite aux divisions
cellulaires qui par opposition aux organismes supérieurs n’entrainent pas une augmentation de
taille.
La plupart des bactéries se reproduisent par scissiparité : à partir d'une unique cellule, on obtient
deux cellules filles qui vont chacune donner à leur tour deux autres cellules et ainsi de suite.
Lorsqu’une bactérie est mise dans des conditions favorables, elle croit. Cette croissance se
manifeste par une augmentation du nombre de bactéries et non pas de leur taille. La croissance
d’une bactérie placée dans des conditions favorables est définie par deux paramètres :
- le temps de génération (G) comme le temps nécessaire au doublement de la population
bactérienne lors de la phase exponentielle. G = ln2 / μ Ex. [Link]: G= 20 mn.
- le taux de croissance (μ) comme le nombre de divisions par unité de temps. μ= ln2 / G.

4.1 Techniques de mesure de la croissance

Ces techniques sont fondées sur l’évolution du nombre de micro-organismes ou de leur masse par
unité de volume ou de poids. Parmi elles : le dénombrement direct des bactéries, la mesure de la
biomasse, l’utilisation des marqueurs chimiques.

4. 2 Croissance en milieu non renouvelé ou croissance discontinue ou en batch

Une culture en "batch" ou discontinue est la culture des micro-organismes dans un système fermé
(milieu liquide ou solide contenant une quantité définie en nutriments). En milieu non renouvelé,
la courbe théorique d'une croissance fait apparaître différentes phases caractéristiques : [Link]

56
phase de latence ; 2. une phase d’accélération ; 3. une phase exponentielle ; 4. une phase de
ralentissement ; 5. une phase stationnaire ; 6. une phase de déclin.

Figure1 : Courbe de la croissance bactérienne en milieu liquide non renouvelé.

4.2.1. Phase de latence

Durant cette phase, les bactéries se préparent à la croissance, c’est une phase d’adaptation des
bactéries au nouveau milieu nutritif (accoutumance des bactéries à leur environnement). C’est le
temps nécessaire à la bactérie pour préparer la machinerie enzymatique nécessaire à la dégradation
de nouveaux substrats. Le taux de croissance est nul (µ = 0).

4.2.2 Phase d’accélération

Elle correspond à la phase de mise en route de la croissance active, donc du démarrage de la
culture. Les synthèses enzymatiques sont à leur maximum. Le taux de croissance augmente.

4.2.3 Phase exponentielle

Durant cette phase, le taux de croissance est maximal et constant. Les bactéries se multiplient sans
entrave. La mortalité est nulle. C’est pendant cette phase que l’on peut déterminer les paramètres μ
et G de la croissance. Le temps de doublement des bactéries est le plus court.

4.2.4 La phase de ralentissement ou de décélération

Durant cette phase, le milieu devient de moins en moins favorable à la croissance. La vitesse de
croissance régresse progressivement à cause de la diminution de la disponibilité en nutriments et

57
l’accumulation des déchets. Le temps de génération s’allonge. Il y a un début d’autolyse des
bactéries.

4.2.5 Phase stationnaire

Durant cette phase, la croissance s’arrête. Les nouvelles générations équilibrent les vieilles
bactéries qui se lysent. La vitesse de croissance est nulle (µ = 0). Les conditions de culture
commencent à devenir défavorables.

4.2.6 Phase de déclin

Elle correspond à une période où les bactéries ne se divisent plus. Les conditions deviennent
sérieusement défavorables. Toutes les ressources nutritives sont épuisées. Il y a accumulation de
métabolites toxiques, réduction d’oxygène, mort des bactéries. Le taux de croissance décroit (µ <
0) du fait de la lyse des bactéries. Il y a existence possible de formes de résistance (spores) pour
les souches qui sporulent.
Parfois, les substances libérées par la lyse des bactéries peuvent être utilisées par quelques
bactéries survivantes qui peuvent amorcer de faibles « sursauts de croissance » : c’est la croissance
cryptique. Elle correspond au redémarrage de la croissance dû à quelques bactéries encore
vivantes qui se servent des bactéries lysées comme substrat.

4.3 Phénomène de diauxie (croissance biphasique ou croissance double)

Dans un milieu synthétique contenant un mélange de deux substrats carbonés, on peut observer
une courbe anormale diphasique comme si deux phases exponentielles se succédaient séparées par
une phase de latence. Ce phénomène a été décrit par Monod sous le nom de diauxie.
Cette forme de croissance, appelée croissance diauxique, correspond à l’utilisation successive et
non simultanée, de 2 sources de carbone, ex : le glucose et le lactose. Exemple : [Link], cultivé sur
milieu contenant deux sucres comme le glucose et le lactose utilise en priorité le glucose car il est
métabolisé par des enzymes constitutives; quand le glucose est épuisé, la bactérie synthétise des
enzymes inductibles pour dégrader le lactose.

4.4 Croissance en milieu renouvelé : croissance continue

On appelle culture continue, une culture des micro-organismes réalisée dans un système ouvert.
Dans ce système, il ya approvisionnement constant en nutriments. De plus, les déchets sont retirés
à un rythme constant. La culture dans un système ouvert permet le maintien de la croissance des
cellules dans la phase exponentielle.

58
4.5 Facteurs influençant la croissance bactérienne
Plusieurs facteurs environnementaux vont conditionner la croissance bactérienne.
4.5.1 Facteurs physiques
Ils interviennent de façon primordiale dans l’obtention d’une culture optimale. En effet, les
nutriments doivent être apportés à la bactérie dans les conditions d’environnement qui lui
conviennent, sinon, ils peuvent l’inhiber.
[Link] Température
Selon le comportement de la bactérie vis à vis de la température, on distingue :
- les bactéries hyperthermophiles peuvent croître à des températures > à 80°C. Ex. : Archaea.
- les bactéries thermophiles poussent de 45 à 70 °C, avec un optimum à 50 °C (Clostridium).
- les bactéries mésophiles dont la croissance est possible de 20 °C à 45 °C (optimum aux alentours
de 37 et 40 °C). Ex. : Staphylococcus.
- les bactéries psychrophiles poussant de 4 à 20 °C (optimum : 10 °C). Ex. : Listeria ;
- les bactéries cryrophiles; poussant de -5 à +3 °C (optimum : 0 °C). Ex. : Listeria ;
- les bactéries psychrotropes se développant à des températures de -5 à 35°C (optimum : 20-
25°C), Ex. : Pseudomonas.
Les bactéries d’intérêt médical sont mésophiles. Les bactéries psychrophiles sont impliquées dans
la contamination des produits laitiers.

3.2 Pression osmotique

Selon leur sensibilité à la pression osmotique, on distingue :
- les bactéries non-halophiles qui ne supportent pas la salinité ;
- les bactéries halotolérantes tolèrent la salinité ;
- les bactéries halophiles modérées acceptent des concentrations modérées de sels mais non
obligatoires pour leur croissance
- les bactéries halophiles extrêmes qui peuvent croître que dans des milieux à forte concentration
de NaCl.

3.3 Pression mécanique

En fonction de la pression, on distingue des bactéries baro- non tolérantes, des barotolérantes et
des bactéries barophiles qui présentent une croissance plus rapide à des pressions élevées.

3.4 pH

59
En fonction du pH, on distingue :
- les neutrophiles ayant un pH optimal de croissance aux alentours de 7. Bacillus subtilis, E. coli.
- les alcalinophiles (basophiles) ayant un pH optimal de croissance à des pH alcalins (>8).
- Les acidophiles ayant un pH optimal de croissance à des pH acides. Ex. : Lactobacillus.

3.5 Oxygène moléculaire

Selon l’exigence de la bactérie en oxygène, on distingue :
- les bactéries aérobies strictes (O2 obligatoire) ne se développent qu'en présence d'air.
- les bactéries micro-aérophiles (O2 obligatoire, mais à de petites pressions) se développant
uniquement lorsque la teneur en oxygène moléculaire est réduite ;
- les bactéries aéro-anaérobies ou anaérobies facultatives (O2 facultatif) dont la croissance
n’est pas affectée par la concentration en oxygène moléculaire ;
- les bactéries anaérobies strictes (absence stricte d’O2 obligatoire) ne se développant qu’en
absence d’oxygène qui est le plus souvent toxique.

4. AGENTS ANTIMICROBIENS
4.1 Définitions
Les agents antimicrobiens désignent toutes substances ou procédés qui inhibent ou tuent les
micro-organismes. Le suffixe -cide est attribué aux agents qui tuent (ex : bactéricides, fongicides,
et virucides), tandis que le suffixe -statique est accordé aux gents qui inhibent la croissance (ex:
bactériostatiques et fongistatiques...etc.).
Stérilisation : Opération au résultat durable visant à détruire tous micro-organismes (cellules
vivantes, spores viables et entités acellulaires). La stérilisation peut se faire :
- par la chaleur sèche par chauffage direct des objets (anse, pince) dans la flamme du bec Bunsen
après trois ou quatre passages lents, ou en utilisant des stérilisateurs à air chaud (fours Pasteur) :
Ils sont utilisés pour la verrerie, porcelaine et instruments métalliques Le matériel est emballé dans
du papier aluminium, les récipients et tubes à col doivent être bouchés avec du coton. Les spores
sont détruites en chaleur sèche par un chauffage de : 4 heures à 140 °C ; 2 heures 30 à 160°C ; 30
min à 180°C.
- par la chaleur humide : l'appareil utilisé est l'autoclave à 120°C pendant 20 min. La température
de 120°C est très supérieure à la température normale d'ébullition de l'eau, en chauffant en
surpression, c'est à dire en vase clos. Toutes les bactéries y compris les spores sont tuées. Cette
technique est utilisée pour les milieux de culture, matériel en caoutchouc, la verrerie, les
instruments de prélèvement et la stérilisation du matériel après son utilisation.

60
Désinfection : Opération au résultat momentané visant à détruire ou inhiber les micro-organismes
et/ou d'inhiber l'activité des virus présents sur une surface inerte.
Antisepsie : Opération au résultat momentané visant à détruire ou inhiber les micro-organismes
et/ou d'inhiber l'activité des virus présents sur des tissus vivants, selon leur seuil de tolérance.
Asepsie : Ensemble des mesures empêchant tout apport exogène de micro-organismes. La
stérilisation et la désinfection sont des moyens pour réaliser l’asepsie.
4.2 Agents physiques
Ils existent plusieurs agents physiques qui permettent l'élimination efficace des micro-organismes.
Les agents couramment utilisés dans les laboratoires, les industries et centres de santé sont : la
température, les radiations, la pression, la centrifugation, la filtration.
4.2.1 Température
Deux types de température sont utilisés pour la stérilisation des matériaux, produits et milieux de
culture :
- Le premier type est la chaleur sèche qui nécessite des températures plus élevées et des temps
d’exposition plus longs (ex four Pasteur : 180° pendant 30 mn utilisé pour la stérilisation de la
verrerie).

- Le deuxième type est la chaleur humide qui tue facilement les différents types de micro-
organismes (virus, bactéries, champignons (ex : l'autoclave : 120° pendant 15 à 20 mn).

Les applications de la chaleur humide en industrie sont les suivantes :

- la pasteurisation : procédé pour la conservation des aliments par lequel un aliment est chauffé à
une température inférieure à 100 °C pendant une période de temps définie (30s) avant d'être
refroidi brusquement (10°C). Les températures de pasteurisation varient entre 70 °C et 85 °C. La
pasteurisation permet simplement la diminution du nombre de micro-organismes en détruisant les
germes pathogènes et réduisant la flore banale ;
- la tyndallisation : série de chauffages brefs à des températures de 70°-100°C à intervalles
réguliers dans un bain marie thermostaté, afin de laisser aux formes résistantes la possibilité de
germer pour les tuer au chauffage suivant. Son utilisation est très limitée aux substances
thermolabiles non filtrables (émulsion de jaune d'œuf, vaccins).

4.2.2 Radiations
C'est la lumière U.V qui est le plus souvent utilisée (lampes germicides) pour la stérilisation des
surfaces et de l'air ambiant, dans des locaux ou des hottes, servant aux manipulations en
atmosphère stérile (hottes à flux laminaire). L'irradiation précède et suit la manipulation.
4.2.3 Pression
Les ultrapressions sont capables de détruire les microorganismes. Le traitement d’aliments à 4 000
bars permet de réduire sensiblement leur teneur en microorganismes. L’augmentation de la

61
pression osmotique est un procédé ancestral pour la conservation des aliments (ex : utilisation des
concentrations élevée en NaCl ou en sucres).

4.2.4 Centrifugation
Dans un milieu liquide, les micro-organismes sont éliminés par centrifugation et le surnagent
contenant les métabolites d'intérêt est récupéré.
4.2.5 Filtration
Pour les substances notamment celles qui sont thermosensibles, la filtration est une excellente
méthode pour réduire la population microbienne. La filtration est une technique qui consiste à
faire passer un liquide à travers un filtre ; les microorganismes sont retenus par le filtre.

4.3 Agents chimiques

Ils visent la destruction d'espèces bactériennes déterminées au sein d'une flore microbienne.
4.3.1 Antiseptiques
Les antiseptiques sont des substances chimiques capables de détruire les microorganismes ou
d’arrêter leur croissance. Ils sont utilisés sur des tissus vivants. Ex. : teinture d'iode, mercryl
laurylé, permanganate de K.

4.3.2 Désinfectants
Les désinfectants sont des substances chimiques utilisés sur des supports inertes : sol, objets
inanimés, matériel plastique permettant d’éliminer ou de tuer les microorganismes portés par les
milieux inertes contaminés. Ils peuvent être sous forme : vapeur (formol, oxyde d’éthylène) ;
liquide (sulfate de cuivre, de fer, eau de Javel, permanganate de K) ; solide (chaux vive).

4.3.3 Antibiotiques
Ce sont des substances d'origine naturelle ou obtenues par synthèse chimique. Ils agissent à des
concentrations faibles (ordre du mg) et sont spécifiques. Les antibiotiques bactériostatiques qui
stoppent la multiplication des bactéries sans les détruire et les antibiotiques bactéricides qui tuent
les bactéries. Les antibiotiques sont fongicides ou virucides lorsqu’ils détruisent les champignons
ou les virus dans des conditions d’emploi définies.

5 Aperçu du rôle des bactéries

Les bactéries jouent un rôle immense dans l’équilibre des milieux naturels qu’elles colonisent. De
plus, les bactéries interagissent directement ou indirectement avec l’Homme et ses activités.

5.1 Bactéries et environnement

62
Les bactéries influencent l'évolution des grands cycles biologiques tels que le cycle du carbone, le
cycle de l'azote et le cycle du soufre dans les sols, les océans et les eaux douces. Elles jouent un rôle
dans la transformation de la matière, le nettoyage de l’environnement par l’assimilation des déchets.

5.2 Bactéries et santé

Les bactéries jouent un rôle dans la dégradation des nutriments complexes non dégradés par l'homme
comme la cellulose, elles renforcent l’immunité et influencent la physiologie. Cependant, ces bactéries
sont à l’origine de nombreuses maladies parfois mortelles.

5.3 Bactéries et agriculture

Les bactéries spécifiques peuvent fixer l’azote en symbiose avec les légumineuses. De plus, les
bactéries contribuent efficacement à la nutrition des plantes via les cycles du carbone, de l'azote et du
soufre. Cet avantage permet à l'homme de réduire les besoins en fertilisants polluants et couteux
(engrais). Aujourd'hui, les bactéries appelées les rhizobia, sont vendues en tant que produit commercial
ajouté aux semences des légumineuses pour améliorer les rendements.

5.4 Bactéries et industrie

L'homme a su exploiter les bactéries dans les différentes activités industrielles notamment dans
l'industrie agro-alimentaire, dans la production de l'énergie et dans l'industrie biotechnologique.

63
FICHE DE TD
Exercice 1
1. Définitions
Définir les termes et expressions suivants : microbiologie, pasteurisation, tyndallisation,
capsule, lophotriche, culture pure, temps de génération, diauxie, autoclave, temps de génération,
milieu sélectif, psychrophile, mucopeptide, bactérie, bactérie Gram-, bactérie Gram+,
chimiolithotrophe, chimioorganotrophe, phototrophe, endospore, spore, postulat, facteur de
croissance, paratrophe, syntrophie, activité de l’eau.
2. Enumérer quelques découvertes et invention ayant marquées l’histoire de la microbiologie
3. Enoncez les postulats de Koch
4. Illustrez les principales formes et arrangements rencontrés chez les bactéries
5. Quels sont les principaux éléments constitutifs d’une cellule bactérienne ?
6. Composition chimique des parois bactérienne
7. Enumérez les rôles des éléments constants retrouvés chez les bactéries
8. Variantes de plasmides et caractéristiques respectives
9. Situation des endospores dans la cellule bactérienne
10. Classification des bactéries en fonction du type trophique
11. Courbe de croissance bactérienne en milieu non renouvelé et description des phases
12. Schéma du cycle sporal et de la spore.
13. Propriétés des spores.
14. Typologie et rôles des plasmides
15. Schéma annoté d’une bactérie typique

Exercice 2 :
I. QCM
1. Parmi ces propositions, une seule est fausse, laquelle ?
a. Le peptidoglycane est le principal constituant de la paroi des bactéries Gram (+)
b. La capsule est un élément inconstant de la bactérie
c. L’ADN bactérien est circulaire et monocaténaire
d. Les plasmides sont localisés dans le cytoplasme bactérien
e. La piline et l’adhésine sont les constituants essentiels des pili communs
2. Quel(s) est (sont) l’(les) élément (s) constant (s) chez les bactéries ?
a. La paroi

64
 b. Les fimbriae
c. Le flagelle
d. Le peptidoglycane
e. La membrane nucléaire
f. Le glycocalyx
3. Répondre par vrai ou faux en justifiant
a. Les acides teichoïques sont les constituant de la paroi des Gram (-)
b. L’appareil photosynthétique est essentiel chez les bactéries
c. Au moins un plasmide est présent chez toutes les bactéries
d. La pasteurisation ne permet pas de détruire les spores bactériennes
e. Les mycoplasmes sont des bactéries dépourvues de membrane cytoplasmique
f. Les chromatophores sont des constituants de certaines bactéries ; ils sont responsables
de la photosynthèse
g. Une bactérie dépourvue de sa paroi devient un protoplaste
h. L’espace périplasmique est le lieu de localisation du mucopeptide
4. Qui suis-je ?
a. Une enzyme entrainant la lyse de la paroi bactérienne
b. Un constituant de la paroi des bactéries constitué de sucres aminés
c. Un appareil permettant d’observer l’ultrastructure des bactéries
d. Un élément des mycobactéries les rendant insensible à la coloration de Gram.
e. Invagination de la membrane plasmique en forme de vésicule
f. Plasmides intégrés dans le génome bactérien
5. Vrai ou faux ?
a. Les bactéries sont des êtres ubiquistes
b. Chez les bactéries Gram- le périplasme est situé entre deux membranes
c. BAAR signifie Bacille Acido Alcoolo Réel
d. Les pili ne permettent que la conjugaison bactérienne
e. Tous les plasmides portent des gènes de virulence
6. Préciser les termes exacts correspondant aux définitions suivantes
a) Bactérie qui exige la présence de vitamines pour se développer
b) Transfert d’une culture pure sur un milieu neuf
c) Disponibilité de l’eau dans un produit
d) Phénomène observé quand deux sources particulières de carbones sont présentes dans le
milieu de culture.

65
 e) Technique permettant d’évaluer la concentration cellulaire au moyen d’un
spectrophotomètre.
7. Quelles sont les techniques de base de la microbiologie
8. Principales caractéristiques des bactéries
9. Donner trois rôles essentiels de la paroi
10. La paroi est l’élément essentiel de classification des bactéries en deux groupes. Lesquels ?
expliquer la différence entre ces deux groupes permettant leur classification.
11. Quels sont les types trophiques possibles pour une bactérie ?
12. Citer et définir les paramètres cinétiques de la croissance
13. Citer trois paramètres ayant une influence sur la croissance bactérienne
14. Préciser le mode de reproduction des bactéries
15. La courbe de croissance d’une bactérie en milieu non renouvelé, montre plusieurs phases
distinctes. Citer et expliquer ces phases du comportement d’une bactérie en culture.
16. On étudie les besoins nutritifs d’une culture pure de Salmonella sur deux milieux (M1 et M2)
et avec différentes conditions de culture. On obtient après 48h d’incubation les résultats
suivants :
Milieux M1 M1 M1 M2 M2 M2
Température d’incubation (°C) 4 37 60 4 37 60
Présence d’une culture - - - - + -
M1 = milieu minimum contenant uniquement des substances minérales (incubation en présence de
dioxyde de carbone)
M2 = M1 + glucose à 1g/l.
a) Quel est le rôle du glucose dans M2 ?
b) Donner les types trophiques pouvant se développer sur M1 et M2
c) Analyser les résultats de cette expérience
17. La même souche de Salmonella est ensuite mise en culture sur le milieu M2 avec additifs à 37
°C. on obtient après 48h d’incubation les résultats suivants

M2 + NaCl M2 + NaCl M2 + acide éthanoïque

Concentration en additif 9 50 15
(g/L)
Présence d’une culture + - -
a) Préciser l’action des additifs sur le développement bactérien
b) Sachant que Salmonella peut être responsable d’intoxications alimentaires, quelles sont
d’après les expériences précédentes les meilleures conditions pour éviter le développement
de cette bactérie dans les aliments ?

66
 18. On observe le comportement des bactéries dans divers milieux en présence ou pas d’O2

Campylobacter Pseudomonas Clostridium

Milieu avec O2 - + -
Milieu sans O2 - - +
Milieu avec O2 réduit + - -
- Que pouvez-vous dire concernant le mode respiratoire de ces bactéries ?

Exercice 3 :
Afin de connaitre le mode respiratoire de 5 bactéries distinctes, Vous les avez ensemencés dans 5
tubes à essai contenant le même milieu de culture. Quelle conclusion pouvez-vous tirer des
résultats ci-dessous ?

A B C D E

Exercice 4 :
Un étudiant a préparé deux milieux de culture pour l’isolement des bactéries, le premier milieu
contient de l’hydrolysat de caséine et de la vitamine A et le second du glucose et des minéraux. Il
se pose maintenant la question de la méthode de stérilisation à utiliser. Quelle est selon vous la
méthode indiquée ?
Exercice 5 :
Les étudiants de Biologie de la Faculté des Sciences ont réalisé des expériences dont les résultats
sont présentés dans le tableau ci-dessous :
Nature du besoin Bactérie A Bactérie B Bactérie C
CO2 + minéraux - - -
Glucose + minéraux - +++ -
Glucose + minéraux + vitamines - +++ -
CO2 + minéraux + vitamines +++ - -
Glucose + minéraux + toxines produites par A - - +++
Glucose + minéraux + vitamines + NaCl (10%) - ++ -
Glucose + minéraux + vitamines + NaCl (80%) - - -
+ : faible trouble - : aucun trouble

67
 1) Indiquez en justifiant le type trophique de chacune de ces bactéries.
2) Comment expliquer la croissance de la bactérie C ?
3) Quel serait le rôle du NaCl ?
4) Sachant que la bactérie B entraine la putréfaction des aliments, au regard de ce tableau
quelle technique peut-on utiliser pour conserver nos aliments plus longtemps ?

Exercice 6 :
On place une bactérie dans un milieu de culture approprié, au bout de 30mn, un compteur de
cellules nous indique la présence de 8 cellules bactériennes dans le milieu.
Après avoir défini les expressions temps de génération et taux de croissance, donnez leurs valeurs
dans le cadre de cet exercice.

68
PARTIE IV. MYCOLOGIE
Mme. EBELLE ETAME Rebecca Madeleine
(Charge horaire: CM 06 h, TD 02h30 h, TP 02h30, TPE 02h30)

Objectif Général
Donner aux étudiants la capacité de connaître les champignons notamment, les champignons
microscopiques, leurs structures, leur mode de vie, leur mode de reproduction et de nutrition, leur
intérêt.

OBJECTIFS SPECIFIQUES :
A la fin de ce cours, l’étudiant devra :
✓ Définir la Mycologie
✓ Connaître les différents types de Mycètes
✓ Connaitre les différentes cellules et organes de reproduction des champignons
✓ Connaitre la Classification et l’intérêt des champignons

INTRODUCTION
Les champignons ou mycophytes sont des thallophytes (groupe polyphylétique d'organismes non
mobiles décrites comme « plantes inférieures » non vascularisées, sans feuille, ni tige, ni racine,
possédant un corps indifférencié, ou un appareil végétatif nommé : thalle), qui inclut les
champignons (ou mycètes), les algues, les lichens, et parfois les mousses et hépatiques à thalles, et
de temps en temps les bactéries (notamment les cyanobactéries considérées comme des algues
bleues). Les individus de cette famille sont parfois mentionnés comme des « plantes thalloïdes »
qui se distinguent des algues par l’absence de chlorophylle, et même de toute ébauche de plaste.
Ce sont des hétérotrophes c'est-à-dire être vivants qui doivent pour vivre consommer des
molécules organiques déjà élaborées.
Leurs cellules sont entourées de parois qui ne sont pas
constituées de cellulose comme chez les végétaux, mais de chitine (polymère d’un dérivé aminé de
glucose, constituant également l’exosquelette des insectes).
Les champignons se distinguent des plantes et des algues par l’absence de chloroplastes et des
animaux par la présence de parois cellulaire.
Ces organismes nécessitent beaucoup d’eau pour
accomplir leur cycle biologique et ils ne vivent donc que sur des milieux terrestres très humides ou
en parasitant d’autres êtres vivants.

69
Les premiers champignons seraient apparus au précambrien, il y a 600 millions d’années.

I. MORPHOLOGIE
L’organisation cellulaire des champignons est appelée le thalle. Chez les champignons
microscopiques, le thalle peut être :
➢ Unicellulaire dans ce cas ces champignons sont appelés levures,
➢ Filamenteux ce sont les moisissures.
Certaines levures sont toutefois capables de former des structures filamenteuses
(pseudomycélium) dans certaines conditions (figure 1). Ex : Levure de bière (Saccharomyces
cerevisiae).
Les levures ont une taille généralement comprise entre 10 et 50 μm. Leur forme peut être
sphérique, ovoïde, allongée, cylindrique... Leur thalle est dit lévuriforme.

Les moisissures quant à elles sont pluricellulaires et leurs filaments, plus ou moins ramifiés, sont
appelés hyphes. L’ensemble des hyphes constituent le mycélium.

En fonction du groupe de champignon filamenteux, le thalle peut être cloisonné ou pas. Ainsi :
➢ Chez les Phycomycètes trichomycètes, et zygomycètes, les cellules ne sont pas séparées
par des cloisons transversales et dans ce cas le thalle est dit coenocytique (ou «
siphonné ») ; ces champignons sont appelés siphomycètes
➢ Chez les ascomycètes et basidiomycètes, le thalle est cloisonné (ou « septé »). Dans ce
cas, des perforations assurent la communication entre les cellules (figure 2). Ces
champignons sont appelés Septomycètes

70
Figure 2 : Les hyphes

Le thalle de la très grande majorité des espèces, est constitué par l’enchevêtrement de nombreux
filaments très fins et ramifiés forme un mycélium.
Le mycélium peut être continu. On l’appelle
siphon et contient de très nombreux noyaux. Sa structure est plurinucléée ou cénocytique. Les
champignons qui possèdent des siphons sont des siphomycètes (Trichomycètes, phycomycètes et
zygomycètes).
Le mycélium peut être cloisonné, on l’appelle hyphes qui sont constitués de
cellules ou d’articles plurinucléés. Les cloisons transverses appelées septums sont percées par des
pores permettant les échanges. Les champignons qui possèdent des hyphes sont des Septomycètes
(ascomycètes et basidiomycètes). Le mycélium peut être dissocié, Il se morcelle : cas des
champignons à thalle unicellulaires comme les levures Ex : Levure de bière (Saccharomyces
cerevisiae).

La membrane plasmique : La membrane plasmique des champignons est riche en ergostérol et

est protégée par une paroi rigide et épaisse (figure 3) constituée principalement de polyosides
(dont la chitine, polymère de N-acétyl glucosamine).

71
Figure 3 : structure de la membrane des levures

Cytoplasme : Le cytoplasme des champignons a un pH égal à 5. Il contient de nombreuses

enzymes, des réserves (glycogène) et des organites dont le réticulum endoplasmique (ER),
l’appareil de Golgi (G) les mitochondries (M), les vacuoles (Va) et des ribosomes (figure 4). Le
noyau (N) contient plusieurs chromosomes par exemple la levure Saccharomyces cerevisiae
compte 17 chromosomes.

Figure 4 : Schema de Saccharomyces cerevisiae

72
II MODE DE VIE HETEROTROPHE DES CHAMPIGNONS
Les champignons sont des hétérotrophes qui mènent plusieurs modes de vie :
➢ Saprophytes : c’est à dire se nourrissent de matières organiques mortes (les arbres morts, les
débris végétaux, les cadavres d’animaux et les excréments). Ce sont donc des détritivores qui
dégradent toutes sortes de substrats et jouent un rôle essentiel dans la nature, notamment dans
l’élaboration de l’humus et des sols. Ex : Mucor du pain, Penicillium que l’on retrouve dans
les veinures d’un fromage et qui apparaissent en bleu ou sous forme de croûte blanchâtre sur
le camembert.
➢ Parasites : S’accroissent aux dépens d’autres cellules vivantes. Ils sont pathogènes et peuvent
causer des dégâts considérables notamment :
▪ Aux plantes cultivées. Ex : le Mildiou de la vigne (Plasmopora viticola : Phycomycètes),
la Hernie de chou au niveau du collet (excroissance) Mixomycètes.
▪ A l’homme chez qui ils causent diverses affections mycosiques telles que : teignes,
muguet, mycétomes.
▪ Symbiotiques (Lichens) : dans ce mode de vie il y a établissement avec d’autres êtres
vivants d’un équilibre à bénéfices réciproques. Ex : Lichens : ils sont les premiers à avoir
colonisés le milieu terrestre. C’est une association permanente et stable établie entre un
champignon (septomycètes) et une algue (cyanobactérie ou algue verte unicellulaire «
chlorelle »). Les champignons qui menent ce mode de vie sont parfois des bio-indicateurs
de la pollution atmosphérique.

III. MODE DE REPRODUCTION

Les champignons présentent deux modes de reproduction qui peuvent cohexistés chez un même
individu. Il s’agit de la reproduction végétative ou assexuée et de la reproduction sexuée.

III.1. Multiplication végétative

Chez la majorité des champignons la reproduction assexuée se fait sans que les gamètes
fusionnent. Ce mode de reproduction peut se faire des plusieurs manières en fonction du type de
champignon. On note:
➢ Le bourgeonnement qui est le mode de reproductions assexué le plus fréquent. Il c’est une
division inégale du cytoplasme qui Après une mitose, donne une cellule fille qui est plus
petite que la cellule mère. La cellule fille se détache et laisse une cicatrice visible au

73
 microscope électronique à balayage. La localisation du bourgeonnement varie selon les
espèces. Elle peut être polaire, latéral ;
➢ La fission : c’est une division qui aboutit à deux cellules identique (Figure 5)

Figure 5 : Illustration de la fission binaire et du bourgeonnement chez les levures (Abedon, 1997)

➢ La fragmentation : C’est une forme de reproduction asexuée où un nouvel organisme se

développe à partir d'un fragment d’hyphe parental. Ce mode de reproduction est retrouvé chez
la moisissure. Son mécanisme est représenté dans le schema suivant :
Après fragmentation du protoplasme en plusieurs parties (a, b), il se forme des parois autour
des prospores (c) puis la maturation s'arrête et les parois disparaissent. Le protoplasme devient
moins dense(d) et les prospores fusionnent (e) pour donner une nouvelle cellule végétative (f)
puis le bourgeonnement commence (g). (Figure 6:)

74
Figure 6 : Illustration des différentes étapes de la fission et de la sporulation chez
Saccharomyces paradoxus (Solomon, 2007)

➢ La sporulation : c’est la forme de reproduction asexuée la plus importante chez les

champignons. Elle se fait à travers les spores asexuées, formées au cours de la phase asexuée
du cycle de vie des champignons (phase anamorphe). Suite à une mitose, ces spores se
transforment en cellules reproductives appelées mitospores qui, après dispersion, se
développent en de nouveaux organismes.

III. 2. La reproduction sexuée

Cette forme de reproduction nécessite la présence des deux noyaux haploïdes capable de
s’accoupler ou d’un seul noyau diploïde. Dans le cas où l’on part de deux noyaux haploïdes, ceux-
ci devrons d’abord fusionner pour donner un noyau diploïde qui va par la suite subir une méiose.
La reproduction sexuée est basée sur une succession de 3 événements : La plasmogamie, La
caryogamie et La méiose qui sera suivi d’une mitose. En effet au cours de la fusion des gamètes
mâles et femelles, il y a d’abord la fusion des membranes cellulaires suivi de la fusion l’un à
l’autre des cytoplasmes ce qui rapproche les deux noyaux pour leur fusion qui est retardée c’est la

75
Plasmogamie. Cette situation crée un nouveau stade cellulaire qui diffère des cellules normales
haploïdes ou diploïde car au sein d’une même cellule coexistent deux noyaux dont l’un mâle et
l’autre femelle, dans le cytoplasme. La cellule résultante est appelée dicaryon et cette étape est
qualifiée de dicaryotiques.
La phase caryogamie va correspondre à la fusion des deux noyaux qui va donner un zygote. Ce
zygote peut se diviser par une méiose pour produire des spores ou il peut se diviser par mitose
pour produire un nouvel individu (Figure 7).
Il faut noter que chez les champignons inferieures, la caryogamie survient immédiatement après la
plasmogamie.

Figure 7 : Illustration de la reproduction sexuée chez les ascomycètes (Florimont, 2009)

76
IV. CLASSIFICATION DES CHAMPIGNONS
La classification des champignons selon Alexopoulos est généralement basée sur les
caractéristiques de leurs structures de reproduction qui permettent de distinguer quatre classes de
champignons :

IV.1. Zygomycètes
Les champignons de ce groupe ont la particularité de croître rapidement. Ils possèdent des cellules
non mobiles et des hyphes non septés. Les zygomycètes peuvent se reproduire sexuellement et
asexuellement. La reproduction sexuée aboutit à la production de zygospores spores immobiles à
parois épaisses. La reproduction asexuée aboutit quant à elle à des spores (chlamydoconidies,
sporangiospores) contenues dans un sporange issu de sporangiophores simples ou branchés. Le
Rhizoporus stolonifer est une espèce courante qui appartient à ce groupe.

IV.2. Hyphomycètes
Tous les champignons connus de ce groupe se reproduisent de façon asexuée par des conidies. Les
hyphes sont septés et présentent des pores simples. Cette classe contient la majorité des
champignons d'importance médicale tels que les dermatophytes.

IV.3. Ascomycètes
Les ascomycètes possèdent des hyphes septés présentant de simples pores qui permettent une
migration cytoplasmique et nucléaire. La reproduction sexuée aboutit à la formation d'ascospores
endogènes dans un ascus, contrairement à la reproduction asexuée qui aboutit à des conidies. On
retrouve dans ce groupe des champignons tels que Pneumocystis jirovecii

IV.4. Basidiomycètes
Les basidiomycètes possèdent des hyphes septés à pores complexes appelés dolipores, permettant
une migration cytoplasmique. Ils produisent sexuellement des spores exogènes appelées
basidiospores. On retrouve dans ce groupe des champignons tels que Ustilago maydis, les espèces
commensales de l'Homme du genre Malassezia et le pathogène opportuniste de l'Homme
Cryptococcus neoformans.

77
V. IMPORTANCE DES CHAMPIGNONS

V.1. Intérêt des champignons

Les champignons sont d'un grand intérêt pour l'homme dans plusieurs domaines d'activité :

➢ En industrie agroalimentaire, certains champignons, à l'instar de la levure

Saccharomyces cereviceae, sont utilisés en fromagerie et en pâtisserie, mais également
dans la production de boissons alcooliques par fermentation.
➢ En écologie, les champignons saprophytes participent au maintien de l'équilibre
écologique en libérant dans l'environnement, à partir de la matière qu'ils décomposent, du
carbone et des sels minéraux.
➢ En biotechnologie, les champignons tels que Ashbya gossypii, sont exploités dans la
production de vitamines A, B ou D.
➢ En pharmacie, plusieurs espèces de champignons sont utilisées pour la synthèse de
médicaments. Le polysaccharide K, produit chimique dérivé de Trametes versicolor, est
utilisé comme adjuvant dans le traitement du cancer.
➢ En agriculture, les champignons à l'instar de Beauveria bassiana sont utilisés dans la lutte
biologique. Ce champignon permet de lutter contre le doryphore dans la culture des
pommes de terre ou contre une chenille responsable de la pyrale du maïs.

V.2. Méfaits des champignons

Les champignons envahissent occasionnellement l'air que nous respirons par l'intermédiaire de
leurs spores disséminées par le vent. Ces spores sont responsables de certaines allergies et

78
maladies graves. L'aspergillose pulmonaire par exemple, est une maladie de l'appareil respiratoire,
causée par inhalation des spores de moisissures du genre Aspergillus.
Plusieurs champignons produisent des composés biologiquement actifs, parmi lesquels des
mycotoxines. A titre indicatif, les espèces d'Aspergillus, notamment Aspergillus favus, produisent
des aflatoxines, toxines du foie qui croissent dans ou sur les graines d'arachides. La consommation
de ces graines contaminées conduit à une aspergillose hépatique récurrente dans le tiers-monde.
Certains champignons peuvent causer des maladies graves voir fatales si elles ne sont pas traitées.
Les levures du genre Candida, sont responsables du muguet chez les nouveaux nés caractérisé par
un dépôt blanchâtre sur la langue.
Les champignons s'attaquent également aux plantes et constituent un obstacle considérable pour
l'agriculture. Parmi ces champignons phytopathogènes, on peut citer Phytophthora infestans,
responsable du mildou des solanacées.

79