MICROBIOLOGIE/1ERE Année PPH

CHAPITRE 4 : MÉTABOLISME ET NUTRITION BACTÉRIENS

INTRODUCTION

Pour assurer sa croissance ou sa survie, une bactérie doit trouver dans son environnement de quoi
satisfaire ses besoins nutritifs

Ces éléments doivent être apportés dans un milieu où règnent des conditions physicochimiques
favorables.

Selon la nature des besoins nutritifs, on définit différentes catégories de bactéries, ce sont les
différents types trophiques.

Définition du métabolisme:

Le métabolisme est l'ensemble des réactions biochimiques mises en jeu par un organisme pour
permettre sa croissance.

Les réactions métaboliques peuvent être classées en deux catégories:

 celles qui produisent de l'énergie: catabolisme.

 celles qui consomment de l'énergie: anabolisme ou biosynthèse.

 Les bactéries se nourrissent à partir des aliments présents dans les milieux de culture et dans des
conditions physico-chimiques bien précises.

 Les besoins nutritifs des bactéries sont de deux types :

 Eléments nutritifs de base= besoins élémentaires = Milieu Minimum (MM)

 eau

 une source d'énergie

 une source de carbone Besoins communs à toutes les bactéries

 une source d'azote

 éléments minéraux

 Besoins spécifiques: facteurs de croissance

Besoins essentiels pour certains types de bactéries

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BESOINS ÉLÉMENTAIRES

1/ Source d'énergie :

Une bactérie, pour qu'elle puisse synthétiser ses constituants et se déplacer, doit dépenser de
l'énergie.

Cette énergie est procurée :

 soit par photosynthèse: le cas des bactéries phototrophes ou photosynthétiques, (L’organe

photosynthétique est le chromatophore)

 soit par oxydation de composés organiques ou minéraux, c’est les chimiotrophes.

NB : L’énergie est stockée dans les liaisons d’ATP.

La source d’électrons:

 Donneur d’électrons est un minéral (SO42-):

 Photolithotrophes (bactéries sulfureuses vertes (chlorobacteriaceae) et les bactéries pourpres

(thiorodaceae))

 Chimiolithotrophes: se sont des bactéries vivant dans le sol ou l’eau, exp nitrobacter oxydant
les nitrites.

 Donneurs d’électrons est un élément organique, groupement alkyle (CH3):

 Photoorganotrophes (bactéries pourpres non sulfureuses: athiorodaceae)

 Chimioorganotrophes : la majorité des bactéries.

TABLEAU RECAPITULATIF: Source d’énergie /donneurs d’électrons/s

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2/ Source de carbone:

Le carbone est l'élément constitutif le plus abondant chez les bactéries (50%).

 Si sa source est le dioxyde de carbone (CO2) les bactéries sont dites autotrophes.

 Si la source de carbone assimilable est un substrat organique, ces bactéries sont qualifiées
d’hétérotrophes (majorité des bactéries).

TABLEAU RECAPITULATIF: Source d’énergie /donneurs d’électrons/source de carbone

3/ Source d’azote:

 La synthèse des protéines et des acides nucléiques nécessite des substances azotées.

 L’azote représente 12% du poids sec des bactéries et 80% de l’air qu’on respire.

 La source de l’azote peut être d’origine minérale ou organique.

 Azote minérale (N2 atmosphérique) ; on distingue:

- des fixateurs libres (exemple : Azotobacter)

- des fixateurs symbiotiques (exemple: symbiose entre les bactéries du genre Rhizobium et les
plantes de la famille des légumineuses).

 Azote organique (protéines, acides aminés: R-NH2)

4/ éléments minéraux

 Le souffre et le phosphore sont particulièrement importants :

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 Le soufre est retrouvé au niveau de deux acides aminés : la méthionine et la cystéine. Il intervient
dans la synthèse des protéines et des vitamines.

 Le phosphore est important dans la synthèse des acides nucléiques et phospholipides des
membranes plasmiques et externes. Sans oublier l’ATP (énergie).

 Autres éléments minéraux

 Macroéléments: Le sodium, le potassium, le magnésium et le chlore

 Micro-éléments: Le fer, le manganèse, le molybdène, le vanadium ou le cobalt

TABLEAU RECAPITULATIF: éléments majeurs, leurs sources et leurs fonctions dans la cellule
bactérienne

BESOINS SPÉCIFIQUES

Parmi les bactéries hétérotrophes, on distingue deux catégories:

 Prototrophes : Ce sont les bactéries capables de croitre en milieu minimum

 Auxotrophes : Ce sont des bactéries qui ont besoin de 1 ou plusieurs facteurs de

croissance.

Définition d’un facteur de croissance: c’est un élément indispensable à la croissance de la

bactérie (auxotrophe pour ce facteur). Il doit être présent dans l'environnement car la bactérie est
incapable de le synthétiser.

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Nature des facteurs de croissance : Les facteurs de croissance qui doivent être rajoutés au
milieu de culture, regroupent trois catégories de substances:

• Les acides aminés : synthèse des protéines

•Les bases puriques et pyrimidiques : synthèse des acides nucléiques

• Les vitamines : synthèse des coenzymes ou précurseurs de coenzymes (exemple NAD:

Nicotinamide adénine dinucléotide, transporteur d’électrons).

Propriétés des facteurs de croissance:

Ils ont une action à très faible concentration, par exemple:

 25mg/l dans le cas des acides aminés

 10mg/l pour les bases azotées

 1 à 25µg/l pour les vitamines

LE PHÉNOMÈNE DE SYNTROPHIE

Quelques fois les besoins en facteur de croissance d’une espèce bactérienne peuvent être satisfaits par la
présence dans le milieu d’une autre espèce capable de synthétiser ce facteur: c'est le phénomène de
syntrophie.

Exemple de culture sur la même boite de :

 Haemophilus spp, bactérie auxotrophe pour le facteur V(NAD)

 Staphyloccoque, bactérie productrice de NAD

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Récapitulatif des différents types trophiques

CONDITIONS PHYSICOCHIMIQUES

 Les facteurs environnementaux : L’eau ; La température ; Le pH ; L’oxygène ; la pression

osmotique

Ces facteurs peuvent favoriser, empêcher ou inhiber la nutrition et la croissance bactérienne.

 Chaque bactérie possède des valeurs optimales pour chaque facteur et par conséquent, selon les
valeurs optimales, on définit différentes catégories de bactéries.

L’eau

 Représente 80% des constituants cellulaires

 Elle est utilisée de deux manières par les MO:
 comme solvant des nutriments, permettant ainsi leur transport et leur disponibilité
 comme agent chimique des réactions d’hydrolyse

Température

 Elle influence profondément la multiplication et le métabolisme

 Les différentes espèces ont une température:

* Minimale : à laquelle ils peuvent se développer

* Optimale: c'est la meilleure T° à laquelle ils peuvent se développer

* Maximale: au-delà de laquelle ils ne peuvent pas se développer

 Bactéries psychrophiles (psychro=froid): Température proche de 0°C (optimum à 10-15°C).Exp

pseudomonas et aeromonas

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 Bactéries mésophiles (méso = médian): La température entre20-40°C (T optimale se situe à 30-
37°C)
 Bactéries thermophiles : se développent à des températures 45-65°C exp Bacillus et Clostridium.
 Bactéries thermophiles extrêmes: optimum situé vers 70°C

Diagramme de taux de croissance en fonction de la T° des différents types trophiques

pH

Selon ce paramètre on distingue:

 Bactéries neutrophiles se développent à pH compris entre 6 et 8 (exemple : Escherichia coli),

 Bactéries alcalinophiles ou basophiles se développent à pH alcalin (>8) (exemple : les
vibrions).
 Bactéries acidophiles se développent à pH acide (<6) (exemple : Lactobacillus).

O2

Influence de l’O2 moléculaire (libre): Les bactéries réagissent différemment en présence d’oxygène ;

Bactéries Bactéries Bactéries Bactéries aérobies/

aérobies anaérobies strictes microaérophiles anaérobies
strictes : (En absence d’O2) : (faible quantité facultatives : (En
Pseudomonas Clostridium d’O2) : présence ou
Campylobacter absence d’O2)
[Link]

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La pression osmotique

La pression osmotique d'un milieu traduit la concentration totale des ions et molécules en solution dans
ce milieu.

 La plupart des bactéries sont insensibles aux variations de la pression osmotique car elles sont
protégées par leur paroi rigide.

 Seules les bactéries marines adaptées à une concentration de 35 g/l de NaCl sont sensibles aux
variations de ce paramètre.

 Selon leur sensibilité à la pression osmotique, on distingue :

 les non-halophiles : croissance en milieu de concentration en NaCl < 0,2 M

(entérobactéries, Pseudomonas….)

 les halophiles : 0,2 <NaCl<5,2 M (Pseudomonas marina, Halobacterium salinarium)

 Les halotolérants : NaCl élevée (Staphyloccus)

Bactérie et le corps humain ?

Les bactéries peuvent vivre sous forme libre, ou associées avec d’autres espèces supérieures dans des
relations de parasitisme ou de symbiose.

Bactéries pathogènes : bactéries causent des maladies infectieuses.

Bactéries symbiotiques : vivent en symbiose avec nous, on parle de flore microbienne.

Bactéries opportunistes: certaines bactéries symbiotiques peuvent devenir pathogènes lorsque le

système immunitaire est affaibli.

ABSORPTION DES NUTRIMENTS

On distingue 2 grands types de transport :

Le transport passif et facilité : il se fait dans le sens du gradient de concentration et ne nécessite pas
d’énergie.
Le transport actif : il se fait en sens inverse du gradient de concentration des molécules, ce qui nécessite
l’utilisation d’énergie (généralement fournie sous forme d’ATP)

 Transport passif et facilité

 Il s’agit d’une diffusion passive à travers la membrane plasmique dans le sens du gradient de
concentration et ne nécessite pas d’énergie.
 Il y a passage d’une concentration élevée à une concentration plus faible.

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 Transport Passif: C’est le cas des petites molécules comme le CO2, H2O, O2, qui traversent
sans l’aide d’aucunes protéines.
 Transport facilité: se fait à travers une protéine membranaire « transporteur » (facilitateur)
ca concerne les grosses molécules.

 Le transport actif :

Il s’agit d’un transport en sens inverse du gradient de concentration des molécules donc il utilise de
l’énergie métabolique(ATP)

LA CULTURE BACTÉRIENNE

 La culture des bactéries est réalisée sur des milieux de culture.

 Les milieux de culture sont composés d’un mélange de substrats nutritifs, d’un système tampon,
de sels minéraux et de vitamines. Il est possible d’ajouter d’autres facteurs de croissance

 Ils sont de nature solide, semi-solide ou liquide.

 Selon le type trophique de la bactérie et de ses exigences, il faudra adapter la composition et le pH

Parmi les milieux de culture, on distingue :

● Les milieux d’isolement : permettent le développement de plusieurs espèces bactériennes. Ils sont
solides et d’une composition simple

● Les milieux sélectifs : favorisent artificiellement la croissance d’une espèce au détriment des autres.

● Les milieux d’identification : permettent la mise en évidence d’une ou plusieurs propriétés d’une
bactérie pour l’identifier.

● Les milieux enrichis : sont utilisés pour l'obtention des bactéries dites exigeantes et auxotrophes
(gélose au sang…).

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Exemples de milieux de culture

CROISSANCE BACTÉRIENNE
 Généralement c’est l’accroissement de tous les composants d’un organisme

 Chez les organismes pluricellulaires, il y’a augmentation de taille.

 Chez les bactéries il y’a augmentation du nombre de cellules. Cet accroissement est donc
synonyme d’une multiplication bactérienne.

⋄ La croissance bactérienne est dépendante de la composition de son environnement; Qui lui fournit tous
les substances indispensables et les conditions convenables à son développement

* Ce schéma montre les stratégies

utilisées par la bactérie afin d’assimiler
les molécules biologiques.
* Plusieurs types de bactéries
synthétisent des enzymes digestives qui
leurs permettent d’absorber certains
aliments plus ou moins complexes.

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Elle se fait de façon asexuée selon un mode de division cellulaire appelée fission binaire (ou scissiparité).

NB : D’autres mécanismes de division existent chez des bactéries particulières, comme le

bourgeonnement (observé chez les cyanobactéries), et la fragmentation (chez les bactéries filamenteuses).

MÉTHODES DE MESURE DE LA CROISSANCE BACTÉRIENNE:

Il existe différentes techniques pour analyser, suivre et mesurer la croissance bactérienne.

Chacune a des avantages et des inconvénients.

On distingue les méthodes directes et les méthodes indirectes.

Certaines distinguent les cellules vivantes des cellules mortes et d’autres, en sont incapables.

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 Méthodes directes

 Lecture au microscope (numération totale): utilisation d’un hématimètre.

 Dénombrement après culture (numération viable)

 Détermination du poids sec

 Mesure du trouble (turbidimétrie /spectrophotomètre: loi de Beer Lambert)

 Méthodes indirectes; mesure d’un paramètre lié à l’activité métabolique (consommation

d’un substrat, une molécule excrétée….).

CONSTANTES ET EXPRESSION MATHÉMATIQUE DE LA CROISSANCE:

La croissance d’une bactérie placée dans des conditions idéales de culture peut être définie par deux
constantes;

Le Temps de génération : C’est l’intervalle de temps entre deux divisions successives ou celui
nécessaire au doublement de la population.

Le temps de génération est donné par la formule : G = t/n

t = le temps de croissance (connu) ; n= nombre de division

Taux de croissance: on le définie comme étant le nombre de divisions par unité de temps :

µ= 1/G = n/t
COURBE DE CROISSANCE:

La représentation graphique de la croissance s’effectue en coordonnées semi-logarithmique,

Le nombre ou la masse bactérienne étant traduit en nombre logarithmique sur l’ordonnée, le temps en
nombre arithmétique sur l’abscisse.

La croissance d’une bactérie s’étudie en milieu liquide.

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Il existe 5 phases dont l’ensemble constitue la courbe de croissance:

1. Phase de latence : le taux de croissance nul (µ = 0). La durée de cette phase dépend de l’âge des
bactéries et de la composition du milieu. C’est le temps nécessaire à la bactérie pour synthétiser
les enzymes adaptées au nouveau substrat.

2. Croissance exponentielle : le taux de croissance atteint un maximum (µ=max). Cette phase dure
tant que la vitesse de croissance est constante. Le temps de doublement des bactéries est le plus
court. La masse cellulaire est représentée par des cellules viables (mortalité nulle).

3. Phase de ralentissement : la vitesse de croissance régresse. Il y a un épuisement du milieu de

culture et une accumulation des déchets. Il existe un début d’autolyse des bactéries.

4. Phase maximale stationnaire : le taux de croissance devient nul (µ = 0). Les bactéries qui se
multiplient compensent celles qui meurent.

5. Phase de déclin : le taux de croissance est négatif (µ < 0). Toutes les ressources nutritives sont
épuisées. Il y a accumulation de métabolites toxiques.

Temps de génération de quelques bactéries: exemples

EXPRESSION MATHÉMATIQUE DE LA CROISSANCE

On considère une population bactérienne de concentration initiale N0, elle augmente à chaque génération
de la façon suivante :

• Après la 1ère génération : N1 = 2 N0

2
• Après la 2ème génération : N2 = 2 N1 = 2x2 N0 =2 N0
n
• Après n générations : Nn = 2 N0

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Cette équation peut être exprimée en fonction du taux de croissance :(µ = n/t d’où n = µt)
µt
Donc N = 2 No log N= log 2µt+logNo

log N= log 2µtNo logN= µtlog2 + logNo

µ, log2 et logN0 sont des constantes donc l’équation peut s’écrire sous la forme y=a x + b c’est une droite
dont la pente a=µlog2.

TRACÉS DE LA CROISSANCE

EXERCICES D’APPLICATION: calcul de croissance:

• Si vous commencez avec 1 cellule, combien en aurez-vous après 4 générations?

• Combien en auriez-vous si vous commenciez avec 100 cellules?
• Combien en auriez-vous si vous commenciez avec 100 cellules pour 5 générations?
• E. coli a un temps de génération de 20 minutes. Si vous commencez avec 1 cellule d’E. Coli combien en
aurez-vous après 2 heures?

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