Module: éco-pédologie 3éme écologie et environnement 1

Chapitre1
Introduction : Définition du sol et objet de la pédologie et de l'écologie
1. 1 Définitions de la Pédologie

La pédologie est la Science du sol qui se préoccupe de l'étude de l'origine, des

constituants, des propriétés et de la classification des sols.

1.2 Définition du sol

Le sol est une formation de surface, à propriétés essentiellement dynamiques, souvent

différencié en couches distinctes, à constituant minéraux et/ou organiques généralement
meubles, résultant de la transformation d'une roche-mère sous l'influence de divers processus
physiques, chimiques et biologiques et différant de cette roche-mère par certains caractères
morphologiques, physiques, chimiques et biologiques.

Le sol est la couche la plus externe, marquée par les êtres vivants, de la croûte
terrestre. Il est le siège d’un échange intense de matière et d’énergie entre l’air, l’eau et les
roches. Le sol, en tant que partie de l’écosystème, occupe une position clé dans les cycles
globaux des matières ” (Société Suisse de Pédologie 1997)

-Le sol, une interface entre la roche mère et la biosphère, il est recouvert de litière,
repose sur le sous-sol constitué par la roche mère. Le sol est constitué d’une succession de
couches parallèles à la surface : les horizons.

Le sol est le support des racines des végétaux et il abrite également de très nombreux
êtres vivants (Bactéries, Champignons, verre de terre…). Le sol est donc une interface entre
la roche mère et la biosphère.

Il est formé d’éléments minéraux (sable, argile, etc…) et d’éléments organiques. Les
éléments organiques qui constituent l’humus sont issus de la dégradation de la matière
organique contenue dans la litière qui est constituée des restes des êtres vivants après leur
mort (feuilles, carapaces d’Insectes…). Une partie de l’humus s’associe aux éléments
minéraux et forme des mottes qui donnent au sol sa perméabilité, sa porosité et sa capacité à
stocker de l’eau. Ces propriétés font du sol un milieu favorable au développement des
végétaux.
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1-3-Profil du sol
Le profil de sol est l'ensemble des horizons d'un sol donné ; chaque horizon étant une couche
repérable et distincte de ce sol. On parle aussi de solum ou des horizons du sol.
Ces horizons sont d'autant plus distincts que le sol est évolué. En effet, la formation et
l'évolution des horizons sous l'influence des facteurs écologiques conduisent à la
différenciation de couches de natures différentes plus ou moins parallèlement à la surface.
L'expression "profil de sol" est aussi utilisée en agronomie pour parler du profil cultural, qui
ne concerne que les sols cultivés.

Fig1 : Profil typique du sol

Horizon 0
C'est l'horizon organique (ou humus) dans lequel les débris végétaux s'accumulent à la
surface du sol.

 OL : Couche de feuilles ou d'aiguilles mortes, encore reconnaissables. Cette couche de

feuilles peut être divisée en deux parties suivant la vitesse de décomposition :
 OLn : feuilles de l'année encore entières ;
 OLv : feuilles vieillies, blanchies par un début de décomposition et commençant à être
fragmentées.
 OF : Couche de fragmentation dans laquelle les débris ne sont plus reconnaissables.
 OH : Couche humifiée, absence de toute structure végétale reconnaissable à l'œil.

Horizon A
L'horizon A, est par définition un horizon contenant à la fois de la matière organique et de la
matière minérale. Dans quelques rares cas, il résulte principalement de la pénétration de la
matière organique dans le sol sous forme de constituants solubles. Mais, en général, il est le
résultat d'un brassage mécanique par les organismes vivant dans le sol (vers, insectes) ou
bien matérialise l'intervention de la charrue dans le cas des sols cultivés.
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Horizon B
C'est un horizon enrichi ou horizon illuvial. Il est enrichi en divers constituants, selon les cas:
argile, fer, matière organique, carbonate de calcium, etc. Dans certains cas plutôt rares, il
s'agit d'apports en provenance du haut du profil ou bien latéraux (ex: carbonate de calcium).
Mais, bien souvent, il s'agit d'un enrichissement plus apparent que réel. Il résulte pour une
part de la transformation in situ des minéraux primaires issus de la roche sous-jacente et
encore présents dans cet horizon B (argilisation des micas, libération et oxydation du fer...),
et d'autre part, il apparait comme résultant d'un contraste lié au fait que l'horizon E sus-jacent
est lui, réellement appauvri.
Au total il est distingué par sa couleur, sa structure, la nature de ses constituants, sa
granulométrie.
Horizon S
C'est un horizon B peu évolué dans lequel on observe des changements de couleur et
l'apparition d'une structure réellement pédologique remplaçant la structure originelle de la
roche. Mais, il n'y a pas enrichissement net en argile ou autres matières.

Horizon C
C'est un horizon d'altération de la roche-mère dans lequel la transformation de celle-ci reste
limitée si bien que nombre de ses caractères originels (litage, schistosité, minéraux) sont
encore très visibles. Mais l'évolution minéralogique a déjà commencé ainsi que les pertes de
matière sous forme d'ions solubles.
Horizon R
Roche non altérée située à la base du profil. Elle est qualifiée de roche-mère dans le cas où
elle est bien à l'origine du sol. Dans le cas contraire, celui-ci résulte d'un apport de matériaux
par transfert latéral (ex: coulée boueuse) ou bien a une origine fluviatile ou encore éolienne.

- Le sol est un milieu dynamique qui résulte, en partie, de l’altération de la roche mère. En
effet, sous l’influence de l’eau, certains minéraux qui constituent la roche mère sont
transformés en d’autres minéraux (argile en particulier). Ces réactions d’hydrolyse sont
d’autant plus rapides que la température est élevée.

La nature et l’épaisseur du sol dépendent donc à la fois du climat (précipitations et t°) et de

la nature de la roche mère. Ceci explique l’inégale répartition des sols à la surface de la
planète. Les êtres vivants du sol sont très diversifiés et ils participent à la formation de
l’humus et à la décomposition de la matière organique du sol en matière minérale
(minéralisation). Ils sont également responsables d’un brassage de la matière du sol.
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Le sol est donc un milieu vivant et dynamique qui résulte d’une longue interaction entre les
roches et la biosphère.

Fig.2 : Le sol un milieu dynamique

1.4- Formation du sol

Schématiquement, la formation d'un sol peut se décomposer en trois phases qui se

chevauchent, plus ou moins, dans le temps:

- altération = décomposition de la roche-mère;

- humification = introduction de matières organiques (humus);

- différenciation = migrations et accumulation de certains éléments.

La décomposition de la roche en place (roche-mère géologique) fournit un matériau, plus ou

moins meuble (roche-mère pédologique), colonisé progressivement par une végétation de
plus en plus différenciée. Celle-ci ramène sur le sol une quantité, plus ou moins importante,
de résidus, dont la transformation donne naissance à l'humus.

Certains composés de l'humus, en association avec les mouvements d'eau au sein du sol,
peuvent provoquer des déplacements de substances ( migrations ), amenant l'apparition de
couches superposées, plus ou moins distinctes, certaines appauvries, d'autres enrichies en ces
substances.

Ces couches sont les HORIZONS, dont l'ensemble constitue le PROFIL.

Le déroulement de ces phénomènes est plus ou moins rapide, plus ou moins complet, sous
l'influence de divers facteurs (facteurs pédogénétiques): en un endroit donné, le sol est la
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résultante de l'action combinée des facteurs pedogenetiques: climat, roche-mère,

géomorphologie, organismes vivants, temps.

Formation de sol:

Lors de la formation d'un sol, il faut considérer cinq critères qui influent sur ses propriétés :
la roche à partir de laquelle il se forme, les facteurs d'altération, les organismes vivant dans
le sol, la topographie et le temps.

La roche-mère qui affleure en surface, s'altère au contact de l'eau, du vent ou de la neige et

fournit aux sols des éléments minéraux solides et des sels minéraux dissous dans l'eau.

Les facteurs d'altération - chaleur, eau, glace, neige, vent, glaciers, etc. - jouent beaucoup sur
la vitesse de formation du sol et son épaisseur. Dans les pays tropicaux par exemple, les sols
peuvent atteindre plus de 10 m de hauteur ce qui s'observe rarement en Algérie puisque
l'épaisseur des sols est de 0 à 2 m en milieu tempéré.

Contrairement à ce que l'on pourrait croire, il y a foule dans le sol. Ainsi, vivent environ 7
millions d'invertébrés. Parmi les êtres vivant dans le sol, on trouve notamment, une armée de
microorganismes qui décomposent les résidus végétaux et animaux, recyclés sous forme de
matières organiques pour enrichir le sol.

A une autre échelle, l'urbanisation, les pratiques culturales, etc., ont elles-aussi, un impact sur
l'évolution des sols dans le temps. « Le potentiel biologique d'un sol constitue une fraction
renouvelable à entretenir Sa dégradation entraîne une modification, une perte partielle ou
totale de ses potentialités » 1 .

La topographie entre également en ligne de compte lors de la formation d'un sol. Elle joue
sur l'exposition à l'érosion, l'écoulement de l'eau, le type et la taille de la végétation, etc.

Enfin, l'ingrédient indispensable pour réaliser un sol est le temps. Selon les conditions, il faut
compter plusieurs siècles voire plusieurs milliers d'années pour qu'un sol se forme, en
particulier pour que sa partie minérale se mette en place. C'est ce qui en fait une ressource
non renouvelable qu'il faut considérer comme un capital à préserver. Il suffit de quelques
jours pour que l'érosion la fasse disparaître.
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Chapitre2
Les éléments constitutifs du sol
Tableau 1 : les principeaux constituants du sol (d’après soltner, 1996)

Fig.5 : pédogénése
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2.1Les constituants minéraux

2.1.1La roche mère

La roche-mère constitue le substrat du sol. On étend le concept de roche-mère à tout

matériel lithologique dont les caractères physico-chimiques seront transmis au sol qui le
surmonte et qui se forme à ses dépends. La composition chimique du sol est donc dans les
premiers temps de sa formation strictement conforme à celle du matériel lithologique dont il
est issu

Tableau 2 Les grandes familles de roche mère

Les différents types de roche

Type de roche Définition Texture Exemples

Roche provenant d’un magma Présence de nombreux

s’étant solidifié au moins en minéraux non visibles
Volcaniques Basalte
partie à la surface de la à l’œil nu (texture
Roches lithosphère microlithique)
magmatiques
Tous les minéraux sont
Roche ayant cristallisée au sein Granite,
Plutoniques visibles à l'oeil nu
de la lithosphère. Gabbro
(texture grenue)

Roches formées sans fusion à Micaschistes,

Roches métamorphiques
partir de roches préexistantes Gneiss

Roche résultant de
l’accumulation d’éléments
(fragments minéraux, débris Calcaire,
Roches sédimentaires
coquillers), et/ou de Argilite
précipitation à partir de
solutions.
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2.1.2 Elément minéraux du sol

Rôle des argiles

• les argiles minéralogiques sont des minéraux constitués de feuillets à couches de silice et
d’alumine.
• ont un rôle central dans le sol, par leurs propriétés : électronégatives (fixation des ions, rôle
dans la fertilité) et hydrophiles.

Fig.6 : Structure des argiles

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2.1.3 Phénomènes de décomposition des roches.

2.1.3.1Agents de décomposition

- Chaleur solaire et variations de température;

- Atmosphère: foudre, vent chargé de particules minérales, humidité, oxygène

-Eau: action des glaciers

action des eaux courantes et des vagues littorales,
action d'imbibition (éclatement par le gel),
action dissolvante,
action chimique et physio-chimique ( hydratation, oxydation, réduction );

-Agents biologiques: action physique (élargissement des fentes par racines),action

chimique (attaque des roches par des acides d'origine biologique).

[Link] Vitesse de décomposition

Elle varie avec: le climat, la profondeur, la texture et la composition chimique
de la roche, la préparation mécanique à la décomposition(broyage tectonique).

Les actions physiques conduisent à un morcellement de la roche en fragments

de plus en plus fins (DESAGREATION), tandis que les actions chimiques induisent
des transformations substantielles provoquant l'apparition de composés nouveaux
(ALTERATION).

2.2Les constituants organiques

2.2.1 Fraction organique morte
[Link] Matière organique (MO) fraîche : la litière
* ensemble de MO intacte ou peu transformée
* MO d’origines animale, microbienne ou végétale
* quantité et qualité dépendent du couvert végétal

Tableau 3 Quantité des MO

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Qualité des MO
• litière améliorante: riche en azote et en cellulose, faible en lignine active processus
bactériens, augmente l’énergie disponible (ex : feuillus (frêne, érable), herbacées)

• litière acidifiante: pauvre en azote et riche en lignine inhibe processus bactériens

(tanins, phénols toxiques), baisse l’énergie disponible (ex : pins, bruyères)

• rapport C/N: bon indicateur. Valeurs élevées (25-30) : faible dégradabilité. Valeurs
basses (5-10) : forte dégradabilité.

[Link] Fraction organique dégradée

Tout d’abord, la litière subit une dégradation microbienne, une partie des MO fraîches se
transforme en composés minéraux simples : c’est la minéralisation nutriments pour les
plantes

Il reste alors des macromolécules organiques héritées, puis humifiées

[Link] Matière organique (MO) héritée

Provient directement des débris organiques surtout cellulose, lignine, protéines, lipides.

[Link] Matière organique (MO) humifiée

• les macromolécules sont synthétisées dans le sol
• c’est le processus d’humification
• les MO humifiées se classent en fonction de leur masse moléculaire et du procédé
d’extraction : acides créniques, acides hymatomélaniques, acides fulviques, acides humiques,
humine…

2.2.3 Matières organiques génératrices d'humus.

Il s'agit, essentiellement (95% ou plus), de substances végétales retombant sur le sol à

partir des plantes (ou y apportées par l’homme), et, accessoirement, d'excréments et de
cadavres d'animaux.

[Link] Agents d'humification.

MICROBES:
Bactéries: dans le tube digestif des animaux,
Champignons: supérieurs ( Basidiomycètes ): rôle important dans la décomposition de la
lignine.
Inférieurs: rôle important en conditions défavorables.

ANIMAUX:
Protozoaires,
Vers inférieurs,
Vers annélidés,
-Enchytréides - activités diverses, importants dans les sols forestiers,
- Lombricides: réalisent le mélange intime de colloïdes minéraux et organiques avec
formation du complexes argilo-humiques, importants pour la structuration du sol.
Mollusques,
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Insectes: larves de Diptères, Collemboles,...,

Acariens: actifs surtout dans les amas denses de matières végétales,
Myriapodes: Chilopodes, Pauropodes, Glomérides,...,
Crustacés: cloportes,
Mammifères: taupes, mulots: actions mécaniques d'ameublissement.

[Link] Facteurs agissant sur l'humification.

- Facteurs externes: climat et microclimat, aération, richesse chimique du sol, etc...;

- Facteurs internes: composition des débris organiques (substances toxiques,...).

[Link] Phases de décomposition-humification.

Très schématiquement, on peut distinguer diverses phases d'humification, s'enchaînant l'une

à l'autre mais avec de nombreuses interférences dans l'espace et dans le temps.

TABLEAU 6 : phase de décomposition et d’humification

PHASE AGENTS ACTIONS, EFFETS

Lessivage Eaux météoriques Dissolution de composés

solubles

Désagrégation Faune Pulvérisation des débris

organiques
Bioréduction Microbes Dégradation de la cellulose, de
Enzymes (tube la lignine, des protéines.
digest.)
Synthèse Microbes Production de "substances
préhumiques".Apparition des
acides humiques et fulviques.
Complexation Lombricides Formation de complexes
organo-minéraux ( humines ).
Minéralisation Microbes Production de CO²; NO3;
SO4; etc...

[Link] Propriétés générales de l'humus.

MORPHOLOGIE.

On peut distinguer, dans les couches organiques et humifères du sol, trois grandes catégories
de matériaux, dont l'importance relative permet de définir diverses couches: les horizons
holorganiques ou litière et les horizons humifères ou hemiorganiques.
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Nous appelons:

DEBRIS: les organes végétaux très peu modifiés, non fragmentés et ne portant d'autres
traces de décomposition que quelques déchirures et des taches plus ou moins colorées ou
décolorées.

RESIDUS: les organes végétaux en voie de transformation, plus ou moins fragmentés,

déchiquetés, décolorés, compactés en couches feutrées mais toujours identifiables à l'œil nu.

SUBSTANCES FINES: les matières très colorées ( brun foncé - noir ) ayant perdu toute
trace, visible à l'œil nu, d'organisation végétale; elle peuvent, suivant les cas, s'accumuler en
surface, en couches distinctes, ou être plus ou moins incorporées au substrat minéral.

TABLEAU 6 vitesse d’humification en fonction du type d’humus

Forme Poids de Vitesse

d'humus litière d'humidification
mull 2 - 10t/ha 1 - 2 ans

moder 15 - 50t/ha 5 - 15 ans

mor >50t plus. décennies

[Link] Fonction de l'humus

Fonctions pédogénétiques:

- désagrégation des roches et minéraux

- horizons humiques du profil
- migration des sesquioxydes,

Fonctions physiques:

- thermo-protection superficielle ( mulch )

- structuration et porosité du sol
- protection contre certaines formes d'érosion,

Fonctions nutritives:

- source d'éléments nutritifs libérés au cours de l'humification

- contribution au pouvoir sorbant
- répartition verticale des éléments nutritifs, avec répercussions sur les activités radiculaires
- attaque des réserves minérales du sol,

Fonctions physico-chimiques:

- action sur l'acidité / alcanité

- action sur les phénomènes d'oxydo-réduction.
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2.3 Matière organique vivante (Êtres vivants du sol)

• les organismes du sol sont extrêmement variés en phylogénie, taille, biomasse et nombre…

• ils participent d’une manière ou d’une autre à l’évolution du sol et aux relations plantes/sol

• on distingue d’une façon « artificielle » microflore et faune du sol : la microflore est de

petite taille et manque d’expression morphologique (l’observation directe ne fournit pas ou
peu d’information sur l’identité et la fonction)

Microflore
• la microflore se divise entre bactéries, champignons et algues microscopiques

• leurs fonctions et leurs habitats (niches écologiques) sont incroyablement variés

• les bactéries réalisent par leurs fonctions les modifications des caractères physico-
chimiques du sol et donc des conditions de vie de la plante : entrée d’azote dans le sol,
minéralisation, réduction, oxydation de composés inorganiques, production d’antibiotiques et
vitamines…

• mais leur rôle le plus important est leur contrôle des cycles biogéochimiques (C, N, P, etc.)

• les algues sont très méconnues malgré leur grand nombre et biomasse

• par leur activité photosynthétique, elles colonisent rapidement les surfaces minérales brutes
et accélèrent leur altération par des substances dissolvantes.
• les champignons sont plus uniformes au niveau du métabolisme : des eucaryotes
hétérotrophes aérobies

4.6 Biocénose du sol : pédofaune

• la pédofaune est partiellement méconnue, bien que son impact soit important dans les
transferts de matière et d’énergie : vers de terre, macro et microarthropodes, termites…
• l’abondance et biomasse des organismes invertébrés sont fortes, dépassant souvent celles
des organismes vertébrés (ex : bovins 1800 kg /ha, vers de terre 1500 kg/ha)
• leur impact peut être grand également sur la plante (ex : nématodes)

Tableau 8 : Abondance de la pédofaune en régions tempérées (diverses sources)

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La pédofaune peut être classée en quatre catégories suivant la taille des organismes
son rôle fondamental a trait à la transformation de la matière organique, qu’elle prépare pour
les champignons et les bactéries.

Fig.11 : La faune du sol forestier

La formation d’un sol est associée à l’activité biologique et a l’apport de matières

organiques ; donc il doit absolument inclure une couverture végétale. En cas d’absence de
matières organiques (vivante ou non, transformés ou non), nous assistant a la mort pure et
simple du sol et a la formation (a terme) soit d’une croute minérale, inerte et imperméable
qui ne stocke plus l’eau et augmente la température ambiante de façon considérable, soit de
dunes de sable mobiles au gré du vent ; un désert.

Si, le mécanisme et le dynamisme du sol sont complexes, les principes sont simples.
En effet, hormis le fait qu’il ne se reproduit pas, le sol est similaire à un organisme vivant,
dans la mesure où :
 Il respire par ces échanges gazeux
 Il canalise l’eau, les solutés et les hormones (notamment vers les racines)
 Il digère les minéraux et les matières organiques
 Il stock les nutriments grâce au complexe argilo-humique
 Il vie grâce à tous les organismes vivants qui l’habitent
 Il peut se détoxifier au moins partiellement grâce aux bactéries, champignons, vers
de terre et végétaux
 Il évolue grâce a la pédogenèse
 Il est également très fragile
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2.4 Les complexes colloïdaux

Les colloïdes sont des macromolécules organiques ou minérales qui, placées dans
l'eau, ne forment pas une solution, mais forment une suspension colloïdale.

La formation de cette pseudo solution s'explique par le fait que la taille de ces
macromolécules est plus grande que celle des " vides " offerts dans le maillage des
molécules d'eau, vides qui accueillent les petites molécules dont on dit qu'elles sont dissoutes
dès lors qu'elles sont " cachées " dans ce maillage.

Dans le milieu aqueux, les micelles colloïdales sont animées de mouvements de types
browniens. Ces mouvements sont dus, au moins en partie, au fait que les colloïdes adsorbent
des charges électriques négatives ou positives qui entraînent des mouvements de répulsion
entre les micelles.

Fig. 12 Etat des colloïdes dans le sol