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Méthodologie en Épidémiologie et Biostatistiques

Ce document présente les principes méthodologiques de l'épidémiologie. Il décrit les indicateurs épidémiologiques comme la mortalité, la morbidité, la prévalence et l'incidence. Il explique également la démarche épidémiologique comprenant les études descriptives, analytiques et les essais interventionnels.
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Méthodologie en Épidémiologie et Biostatistiques

Ce document présente les principes méthodologiques de l'épidémiologie. Il décrit les indicateurs épidémiologiques comme la mortalité, la morbidité, la prévalence et l'incidence. Il explique également la démarche épidémiologique comprenant les études descriptives, analytiques et les essais interventionnels.
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METHODOLOGIE

EPIDEMIOLOGIE

Dr Jacqueline DUFFOUR
I/EPIDEMIOLOGIE: Généralités
 I-1  L’Epidémiologie

 Définition: distribution temporelle et spatiale des états de santé des


populations

 Historique:
 Mesure  de  l’importance  des  épidémies  (maladies  infectieuses)  XIX  et  début  
XXème siècle
 Elargissement du champ de compétences à partir des années 50 avec
apparition des maladies de civilisation (cancers, maladies C°V) 1ère étude
Doll et Hill: tabac et cancer

 Classification
 Selon la procédure: observationnelle ou expérimentale
 Selon la finalité: descriptive, étiologique, évaluative
 Selon la chronologie:
 Transversale ou longitudinale
 Rétrospective ou prospective
 Selon la méthodologie
 Cas/témoins, Cohortes exposés/non exposés
 Essais thérapeutiques, randomisés ou non
 A  quoi  sert  l’épidémiologie  ?

 Analyse des besoins de santé de la population


Outil  de  diagnostic  et  d’évaluation  en  santé  publique

 Surveillance de la population. Veille & alerte sanitaire

 Histoire naturelle de la maladie. Facteurs pronostiques

 Recherche des causes des affections. Observation «


organisée »

 Évaluation des interventions


I- 2 La DEMARCHE EPIDEMIOLOGIQUE

 1-Enquête descriptive
 Observation  d’un  phénomène
 2 indicateurs: fréquence et mortalité
 et  d’un  phénomène  concomitant  (étude  écologique)

 Formulation  d’une  hypothèse

 2-Enquêtes étiologiques:
 On  cherche  à  vérifier  l’hypothèse
 2 étapes:
 1- Cas/témoins
 2- Exposés/non exposés
 mise en évidence des facteurs de risque

 3- Essais interventionnels:
 Evaluation des mesures de prévention par le facteur
de risque (si celui-ci est protecteur)
1/Enquêtes Descriptives
 Objectif principal: distribution des variables

 Objectifs annexes:
 populations ou sous groupes atteints
 répartition dans le temps et espace des atteintes ...

 Observation  d’un  phénomène


 2 indicateurs: fréquence et mortalité

 et  d’un  phénomène  concomitant  (étude  


écologique)

 Formulation  d’une  hypothèse

 EXEMPLE:  Importance  du  cancer  de  l’œsophage  dans  


une  région,  région  où  la  consommation  d’alcool  est  
forte
2/Enquêtes Analytiques ou étiologiques

Objectif principal:
 Recherche de  causes  ou  d’expositions à un facteur de risque par
comparaison de 2 groupes

 II/ Groupe de malades/groupe de non malades = Cas/Témoins


 Ex:  des  malades  atteints  de  cancers  de  l’œsophage  comparés  à  des  
gens  bien  portants  (concernant  l’exposition  à  l’alcool)

 Si cette étude montre une différence entre les cas et les témoins
concernant le risque: on poursuit la recherche

 III/Groupe de personnes exposées au facteur de risque


supposé/ groupe de personnes non exposées
 Ex: des personnes présentant un alcoolisme +++(exposés) comparés
à un groupe non exposé (concernant le nombre de cancers de
l’oesophage)

 Objectifs annexes:
 vérification des hypothèses des études descriptives

 études des liens de causalité


3/ Essais interventionnels
 Objectif principal:
 Recherche et vérification par comparaison de 2
groupes de  l’efficacité  d’un  facteur  de  protection

 Deux groupes:
 1 groupe exposé au facteur de protection
 1 autre non

 Ne  peut  être  mise  en  œuvre  que  pour  les  


facteurs supposés protecteurs

 Même principe pour les essais cliniques


I-3 La part des biostatistiques

I-3-1Notion  d’échantillonnage

Les enquêtes épidémiologiques sont le plus souvent réalisées


sur un échantillon de la population cible

 La représentativité de  l’échantillon/population
cible+++
 Échantillonnage par tirage au sort: la meilleure
 A  partir  d’une  liste  exhaustive  de  la  population  cible  
 Problème:  comme  aucune  liste  n’est  complète  (PDV)  risque  
de biais de sélection

 Les indicateurs (incidence, prévalence, Risque relatifs)


calculés sur ces échantillons sont des estimations
 Toujours représentés avec leur intervalle de confiance à 95%
[IC-95%]
 Ex:  prévalence  de  l’insuffisance  rénale  chronique  aux  USA:
 13.1% [IC 95%: 12.0%-14.1%]
La part des biostatistiques
I-3-2  L’usage  des  biostatistiques garantit la
rigueur méthodologique de ces études
 Avant  l’étude: protocole indispensable= véritable cahier
des  charges  des  divers  éléments  de  l’étude:  matériel et
méthodes
 nombre de sujets nécessaires, les fondements et modalités de
l’étude  (mise  en  place,  suivi,  analyse)
 les  aspects  temporels  de  l’étude
 les documents de recueil des données
 Techniques statistiques permettant de réduire la variabilité des
2 groupes à comparer
 Appariements
 Stratification…

 Après  l’étude: tests spécifiques permettant de conclure


(avec  un  certain  degré  d’erreur  consenti)  que  les  2  groupes  
diffèrent ou non significativement
II/ Les outils épidémiologiques

 II-1/MESURE des INDICATEURS de SANTE


 Mortalité
 Morbidité (FREQUENCE d'une ATTEINTE)
 dans  le  cadre  de  tous  les  types  d’enquêtes

 II-2 La Standardisation

 II-3/Mesure  de  l’ASSOCIATION  Atteinte /


Exposition = mesure du RISQUE
II-1 INDICATEURS de SANTE
(Pour  tous  les  types  d’étude)
 II-1-1/ Indicateurs de mortalité

 Taux brut de mortalité:


=  Nombre  de  décès  au  cours  de  l’année  dans  une  
population/population moyenne de cette année x 1000
= 9 pour 1000 environ
Ne  tient  pas  compte  de  l’âge
 Taux spécifiques de mortalité
 Par âge
= Nombre  de  décès  dans  une  tranche  d’âge  pdt  1  an/population  
moyenne  de  tranche  d’âge  cette  année  là  x  1000
 Par sexe
 Par cause
= Nombre de décès due à une cause pendant 1 an/population
moyenne cette année là x 1000
 Taux de létalité par cause
= Nombre de décès due à une cause/nombre de patients atteints
de cette cause x 1000
II-1-2/ Indicateurs de morbidité

= Fréquence d'une Atteinte


 information essentielle
 va de pair avec:
 la taille de la population ou de l'échantillon
 la durée du temps du recueil

 deux grandes catégories de fréquence

 Incidence

 Prévalence
 1/ Prévalence

Nombre de cas de malades pendant une période


donnée

Le taux de prévalence = nombre de cas de malades


/population moyenne pendant cette période

Intérêt: permet d'estimer le risque (probabilité)


d'un individu d'être porteur de l'atteinte à un
moment donné
 2/Incidence
Nombre de nouveaux cas de malades pendant une
période donnée

S’exprime  par  le  nombre  de  nouveaux  cas  de  malades  


/population moyenne pendant cette période

3/Rapport entre les deux


P (prévalence) = I (incidence) x D (durée)
 si l'incidence d'une maladie de longue durée est faible, la
prévalence pourra être forte mais ce ne sera pas péjoratif
( possibilités thérapeutiques)
 si l'incidence d'une maladie de courte durée est forte,
c’est  un  élément  péjoratif  (progression  de  la  maladie)

 Ces 2 indicateurs sont complémentaires


Fréquence d'une Atteinte
Fréquence d'une Atteinte
 INCIDENCE

2 notions:

 Incidence Cumulative (IC): proportion


d'individus atteints en une période donnée
(définition précédente)

 Taux d'Incidence (TI): nombre de


nouveaux cas atteints au cours d'une
période donnée divisé par la durée totale
d'observation individus-temps
 INCIDENCE

 Formule de l'Incidence Cumulée

nbre de nouveaux cas atteints


IC = pdt une période donnée
population totale

 Formule du Taux d'Incidence


nbre de nouveaux cas atteints pendant une période donnée
TI = somme durées d'observation des individus avant atteinte
 INCIDENCE
 intérêt Taux d'Incidence
 mesure à un instant donné la vitesse
d'apparition de l'atteinte
 exemple: 5 individus
 A suivi 1 an pas atteint, perdu de vue
au bout de 1 an
 B suivi 3 ans atteint au bout des 3 ans
 C suivi 5 ans pas atteint
 D suivi 4 ans pas atteint
 E suivi 2,5 ans atteint au bout des 2,5 ans

TI = 2 cas/15,5 individus-année = 12,9/100


individus-année
II-2 STANDARDISATION

 Les indicateurs de mortalité ou


morbidité  s’expriment  par  taux

 La comparaison de ces taux bruts peut


conduire  à  des  erreurs  d’interprétation

  Nécessité de standardiser ces taux


par âge, sexe, catégorie socio-
professionnelle…/  à  une  population  
type
STANDARDISATION

Groupes Px Tx P’x T’x


d’âge répartition population Taux de Mortalité Répartition population Taux de Mortalité
Limousin (%) Limousin (0/00) France(%) France(0/00)

0-24 ans 31,5 1,2 36,4 1,15

25-54 ans 38,5 2,5 40,6 2,6

>55ans 30 34,5 23 34

Taux Brut de la Mortalité dans le Limousin:


T= Px X Tx = (31,5X1,2)+(38,5X2,5)+(30X34,5) = 11,54‰
100
Taux Brut de Mortalité en France:
T’=    P’x  X  T’x  =  (36,4X1,15)+(40,6X2,6)+(23X34) = 9,29‰
100
Conclusion apparente: la mortalité est plus importante dans le Limousin
Utilisons la  structure  d’âge  de  la  France et appliquons-la au Limousin:
T’’=    P’xXTx  =  (36,4X1,2)+(40,6X2,5)+(23X34,5) = 9,27‰
100
II-3/ ASSOCIATION ATTEINTE/EXPOSTION
Mesure du risque (seulement dans les études
étiologiques)

 II-3-1/Notion de risque et facteur de risque

 II-3-2/les indicateurs de risque: RR et OR

 II-3-3/ les facteurs de confusion

 II-3-4/Recherche de la causalité
II-3-1 Notion de RISQUE et Facteur de
Risque
 Le risque est  la  probabilité  de  survenue  d’un  
évènement  (décès,  maladie…)

 Cette probabilité n’est  pas  la  même  pour  tous  les  


individus  d’une  population

 Elle  varie  en  fonction  d’un  certain  nombre  de  facteurs  


(endogènes,  environnementaux,  comportementaux…)

 Ces facteurs sont appelés: facteurs de risque


 Un facteur F est un facteur de risque pour une
maladie  M  si  l’exposition  au  facteur  F  modifie  la  
probabilité  d’apparition  (l’incidence)  de  la  maladie  M
II-3-2 Les Indicateurs de Risque
Pour  vérifier  l’hypothèse  d’une  relation  
entre  l’exposition  à  un  facteur  de  
risque et la survenue de la maladie

 II-3-2-1 -Le Risque Relatif

 II-3-2-2-l’ODDS  RATIO

 II-3-2-3-L’excès  de  Risque

 II-3-2-4-La fraction de Risque


attribuable
II-3-2-1-Le risque relatif

 C’est  le  rapport  des  incidences


de la
maladie chez les exposés/ non exposés
 IE / InE

 Le risque = 1  le facteur est sans


influence
 Le risque est >1  le facteur  l’incidence  
de la maladie
 Le risque est <1  le facteur  l’incidence  
de la maladie
atteinte
oui non

oui a b a+b = nb exposés


exposition

non c d c+d = nb non exposés

a+c b+d a+b+c+d


= = =
nb atteints nb non atteints nb total individus
I exposés
RR =
I non exposés

IC exposés a / (a + b)
RR = =
IC non exposés c / (c + d)

RR  ne  s’utilise  que  dans  les  études  de  


cohorte exposées/ non exposées
EXEMPLE
 Etude d’une  cohorte  de  travailleurs  exposés  à  un  
contaminant / une population non exposée

lymphomes
oui non

60 1940 2000= nb exposés


oui

Exposition
à un contaminant
20 1980
non 2000= nb non exposés

80 3920
4000
= =
=
nb atteints nb non atteints
nb total individus
EXEMPLE
 Etude d’une  cohorte  de  travailleurs  exposés  à  un  
contaminant / une population non exposée

lymphomes
oui non

60 1940 2000= nb exposés


oui

Exposition
à un contaminant
20 1980
non 2000= nb non exposés

80 3920
4000
= =
=
nb atteints nb non atteints
nb total individus
IC exposés a / (a + b)
RR = =
IC non exposés c / (c + d)

I exposés: 60/2000 = 3/100

I non exposés: 20 / 2000 = 1/100

RR = 3/100: 1/100 = 3

 Le RR doit être présenté avec un intervalle de confiance (IC) à


95%
 Si  l’IC95%  ne  contient  pas  le  1,  l’association  facteur  –maladie est
significative
 Si  l’IC95%  contient  le  1,  l’association  facteur  –maladie  n’est  pas  
significative
Enquêtes de cohorte exposés / non exposés

Atteinte?
oui non

oui a b a+b = nb exposés


exposition

non c d c+d = nb non exposés

a+c b+d a+b+c+d


= = =
nb atteints nb non atteints nb total individus
Enquêtes Cas / Témoins

atteinte
oui non

oui a b a+b = nb exposés


Exposition?

non c d c+d = nb non exposés

a+c b+d a+b+c+d


= = =
nb atteints nb non atteints nb total individus
II-3-2-2-l’ODDS  RATIO  (OR)
 OR = Odds de la maladie chez les exposés/odds
de la maladie chez les non exposés

 L’odds  de  la  maladie  chez  les  exposés=    


est  la  probabilité  d’être  malade/probabilité  de  ne  
pas être malade chez les exposés

 = a/a+b/b/a+b

 L’odds  chez  les  non  exposés

 = c/c+d/d/c+d

 On démontre que:
 OR = a/c/b/d = ad/bc
 Quand la maladie est rare RR = OR
 Interprétation  de  l’OR
 OR = 1  le facteur est sans influence

 OR >1  le facteur  l’incidence  de  la  


maladie

 OR <1  le facteur  l’incidence  de  la  


maladie

 L’OR  doit  être  présenté  avec  un  intervalle  de  confiance  


(IC) à 95%
 Si  l’IC95%  ne  contient  pas  le  1,  l’association  facteur  –
maladie est significative
 Si  l’IC95%  contient  le  1,  l’association  facteur  –maladie  n’est  
pas significative
 OR  ne  s’utilise  que  dans  les  études  Cas/Témoins
 Intervalle de confiance
II-3-2-2-3- L’excès  de  risque

Excès de risque ou R Attribuable = IE – InE


 Exprime  l’augmentation  de  l’incidence  de  la  maladie  attribuable  à  la  
présence  du  facteur  d’exposition

 Fournit une estimation du nombre de cas qui pourraient être évités


si  l’exposition  était  supprimée  chez  les  exposés
II-3-2-2-4- Fraction de risque attribuable
 FRA= PF (RR-1)/PFRR + (1- PF)

où PF est  la  fréquence  d’exposition  au  facteur  de  risque  dans  


la population

 Exemple
 RR du tabac pour cancer du poumon: 14
 Fréquence du tabagisme dans la population: 0.30

 FRA= 0.30 x (14-1)/0.30 x 14 + (1-0.30) = 80%


 CCl: la proportion de risque de décès par cancer du poumon
attribuable au tabac est de 80%

 Si la fréquence du tabagisme avait été de 10%


 FRA= 0.10 x (14-1)/0.10 x 14 + (1-0.10) = 56.5%
II-3-3/ les facteurs de confusion

liaison causale ?
Exposition Atteinte

Facteur
de
Confusion
Facteurs de Confusion
 DEFINITION
 confusion:
 Si  E  est  un  facteur  d’exposition  
potentiel à une maladie M, un tiers
facteur est un facteur de confusion si

 Il explique totalement ou partiellement


un effet apparent de E sur M

 Il masque totalement ou partiellement


une association réelle entre E et M
Facteurs de Confusion
 Exemple
 évaluation des édulcorants (E) sur le cancer de
la vessie (CV)
 E Augmentation CV

 CV plus fréquent chez les fumeurs que chez les


non fumeurs
 Les édulcorants sont-ils responsables à eux
seuls du CV?

 Ou  bien  l’augmentation  des  CV  constatée  chez  


les  consommateurs  d’édulcorants  se  fait-elle
par  l’intermédiaire  du  tabac?  
 (les buveurs de thé et café fument)
 MORTALITE  par  cancer  de  la  vessie  (‰  par  an)

Consommation Consommation de tabac ( paquets/j)


d’édulcorants/j       0 1à2 >2 ensemble

 0 4 9 15 6
 1 à 10 6 10 13 8
 > 10 5 9 16 12

 ensemble 4 10 15
 MORTALITE  par  cancer  de  la  vessie  (‰  par  an)

Consommation Consommation de tabac ( paquets/j)


d’édulcorants/j       0 1à2 >2 ensemble

 0 4 9 15 6
 1 à 10 6 10 13 8
 > 10 5 9 16 12

 ensemble 4 10 15
Facteurs de Confusion

 Conséquences
 utiliser des méthodes pour limiter la
confusion
 lors de la phase préparatoire
 Randomisation  (dans  les  essais  d’intervention  ou  
thérapeutiques uniquement)
 Restriction de la population à certaines
catégories
 Appariement sur les facteurs de confusion déjà
connus (âge exemple:

 Exemple: Étude édulcorants – cancer de la


vessie
 facteurs de confusion: âge, sexe, tabagisme
 une femme de 65 ans, grosse fumeuse atteinte
sera appariée à une femme de même âge et
habitudes non atteinte
Facteurs de Confusion
 Analyse stratifiée
 type : méthode de contrôle de la confusion lors de
la phase d'analyse

 = évaluation de l'association dans les catégories


ou classes où la variable de confusion est répartie
de manière homogène

 la valeur globale de l'association peut être calculée


par "moyenne pondérée" des associations
partielles (méthodes de Mantel-Haenszel)

 exemple: si le sexe est un éventuel facteur de


confusion, l'association sera calculée séparément
pour les hommes et les femmes
Facteurs de Confusion
 Analyse multivariée

 1-Estréalisée après l’analyse  univariée de


l’association  Facteurs  ou  variable-Maladie
(chaque variable étant prise individuellement)

 2-Sicette analyse met en évidence des


variables  ou  le risque significativement

 3-on entre ces variables dans « le modèle de


Cox » (analyse des variables simultanément)
qui permet de confirmer la significativité (et
donc la mise en cause) des facteurs apparus
lors de la 1ère analyse
Facteurs de Confusion

 Analyse univariée
Facteurs de Confusion

 Analyse multivariée
II-3-4/Recherche de la causalité
 Nécessité de certaines conditions
 Existence  d’un  lien  statistique  entre  le  facteur  et  la  
maladie

 Cohérence chronologique

 Constance  et  reproductibilité  de  l’association  dans  


d’autres  études  et  populations  

 Force  de  l’association  statistique  (RR  élevé)

 Relation dose-effet

 Une intervention visant à supprimer le facteur de risque


doit faire  l’incidence  de  la  maladie

 Cohérence avec les connaissances expérimentales

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