Bactériologie appliquée Dr.
RIANE
I Introduction
L’urine est normalement stérile. Seul l’urètre distal est colonisé par
une flore périnéale.
Infection urinaire : Multiplication de micro-organismes dans l’arbre urinaire
s’accompagnant d’une réaction inflammatoire avec afflux de leucocytes dans
l’urine = leucocyturie.
•Siège de l’infection dans différents organes de l’arbre urinaire
2. La bactériurie = colonisation urinaire : est la présence d’un micro-
organisme dans les urines.
La bactériurie peut être accompagnée ou non de symptômes cliniques.
-La bactériurie asymptomatique est définie par une bactériurie
significative supérieure à 100 000 germes / ml avec ou sans leucocyturie
chez un enfant asymptomatique.
Diagnostic bactériologique d’une infection urinaire: ECBU 1
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II Définition
1 Cystite
La cystite ou IU basse est une infection localisée à la vessie, le plus souvent
d’origine bactérienne, bénigne, d’origine ascendante. Les signes comportent :
dysurie, pollakiurie, envies impérieuses, douleurs hypogastriques, fuites
urinaires, hématurie macroscopique. La fièvre est absente, il n’y a ni douleur
lombaire ni syndrome inflammatoire biologique.
2 Pyélonéphrite
La PNA ou IU haute est une infection urinaire bactérienne avec atteinte du
parenchyme rénal; il s’agit d’une néphrite interstitielle microbienne,
potentiellement grave, atteignant le parenchyme par voie ascendante, à partir de
la vessie puis l’uretère, puis le bassinet.
Infections urinaires simples: Ce sont des IU survenant chez des patients sans
facteur de risque de complication.
Infections urinaires à risque de complication : Ce sont des IU survenant chez
des patients ayant au moins un facteur de risque pouvant rendre l’infection plus
grave et le traitement plus complexe
Infections urinaires graves: Ce sont les PNA et les IU masculines associées à :
- un sepsis grave,
- un choc septique,
- une indication de drainage chirurgical ou interventionnel (risque
d'aggravation du sepsis en péri-opératoire).
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III Facteurs de risque
Toute anomalie organique ou fonctionnelle de l'arbre urinaire (résidu
vésical, reflux, lithiase, tumeur, acte récent).
Sexe masculin, du fait de la fréquence des anomalies anatomiques ou
fonctionnelles sous-jacentes.
Grossesse.
Sujet âgé : patient > 65 ans avec ≥ 3 critères de Fried, ou patient > 75 ans.
Immunodépression grave
Insuffisance rénale chronique sévère
IV Les conditions favorisantes:
A: les facteurs physiologiques:
les rapports sexuels.
la grossesse:
- pH élevé.
- stase physiologique due à: (facteurs mécaniques et hormonaux).
habitudes vestimentaires
hygiène corporelle insuffisante
B: les facteurs pathologiques:
Causes urologiques : L’ IU: - complique une uropathie connue - révèle une
anomalie ignorée (malformations, instrumentation)
Causes gynécologiques : affections gynécologiques
Perturbations digestives : Constipation -- « colite spasmodique » sélection
d'une flore pathogène et sa diffusion périnéale.
Maladies générales : diabète -- déficit immunitaire.
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V Germes responsables
L’[Link] est responsable de près de 70% des IU chez l’enfant. Enterococcus sp
est en cause dans 10% des cas, Proteus mirabilis, et Klebsiella pneumoniae dans
7-8% des cas. Les infections à Pseudomonas aeruginosa et Staphylococcus aureus
surviennent dans des contextes particuliers, uropathie sous-jacente ou
antibiothérapie préalable. Les infections à Staphylocoque coagulase négative
correspondent en règle à des cystites chez l’adolescente.
Diagnostic biologique
• Bandelettes urinaires
Methode de dépistage ou screening
• ECBU
Aspect
Leucocyturie
Culture
Antibiogramme
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La bandelette urinaire: détecte la présence:
- d’estérase leucocytaire (leucocyturie)
- et de nitrite (bactériurie).
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Ce test négatif élimine l’ IU dans plus de 97% des cas, évitant ainsi un
grand nombre d’ECBU inutiles.
Les limites de ce test doivent être connues.
-Les bandelettes réactives peuvent être faussement négatives dans les
circonstances suivantes :
1. I. U à faible inoculum bactérien (< 104 cfu/ml)
2. germes dépourvus de nitrite-réductase : Pseudomonas, Acinetobacter,
Cocci à Gram positif (staphylocoque, entérocoque)
3. Séjour trop court dans la vessie (pollakiurie, incontinence)
4. Urines trop diluées (diurèse abondante)
5. La leucocyturie peut être absente chez le diabétique.
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