Biochimie Structurale 2
Simone Granon James Sturgis
sturgis@[Link]
Biochimie Structurale 2.1
James Sturgis
Biochimie Structurale 2
La Biochimie Cellulaire (4+2)
Le mtabolisme Le couplage Structure et Purification Cintique
Les Protines
Les Enzymes
Biochimie Structurale 2.1
James Sturgis
Biochimie Structurale 2 Examen
Biochimie Structurale 2.1
James Sturgis
Biochimie Structurale 1 Rappel
Les molcules de la vie...
Les petits
Glucides Acide Amins Vitamines
- Nuclotides - Acides Gras - et autres
Les grands
Polysaccharides - Acides Nucliques Protines - Lipides
James Sturgis 4
Biochimie Structurale 2.1
Biochimie Structurale 1 Rappel
Les molcules de la vie...
Les petits
Glucides Acide Amins Vitamines
- Nuclotides - Acides Gras - et autres
Les grands
Polysaccharides - Acides Nucliques Protines - Lipides
James Sturgis 5
Biochimie Structurale 2.1
Biochimie Structurale 1 Rappel
Les molcules de la vie...
Les petits
Glucides Acide Amins Vitamines
- Nuclotides - Acides Gras - et autres
Les grands
Polysaccharides - Acides Nucliques Protines - Lipides
James Sturgis 6
Biochimie Structurale 2.1
Biochimie Structurale 1 Rappel
Les molcules de la vie...
Les petits
Glucides Acide Amins Vitamines
- Nuclotides - Acides Gras - et autres
Les grands
Polysaccharides - Acides Nucliques Protines - Lipides
James Sturgis 7
Biochimie Structurale 2.1
Biochimie Structurale 1 Rappel
Les molcules de la vie...
Les petits
Glucides Acide Amins Vitamines
- Nuclotides - Acides Gras - et autres Pyridoxal Vitamine B6
Les grands
Polysaccharides - Acides Nucliques Protines - Lipides
Biochimie Structurale 2.1
James Sturgis
Biochimie Structurale 1 Rappel
Les molcules de la vie...
Les petits
Glucides Acide Amins Vitamines
- Nuclotides - Acides Gras - et autres
Les grands
Polysaccharides - Acides Nucliques Protines - Lipides
James Sturgis 9
Biochimie Structurale 2.1
Biochimie Structurale 2
La dynamique des molcules de la vie....
Les conversions Les cintiques Les catalyseurs
Biochimie Structurale 2.1
James Sturgis
10
Les Conversions biologiques
Sucre (maltose/saccharose ou amidon) + Eau + Levure
Biochimie Structurale 2.1
James Sturgis
11
Les Conversions biologiques
Sucre (maltose/saccharose ou amidon) + Eau + Levure
Biochimie Structurale 2.1
James Sturgis
12
Les Conversions biologiques
Sucre (maltose/saccharose ou amidon) + Eau + Levure
Biochimie Structurale 2.1
James Sturgis
13
La chimie biologique
Sucre (maltose/saccarose ou amidon) + Eau + Levure
Maltose Saccarose Amidon Levure et eau
Biochimie Structurale 2.1
James Sturgis
14
... et si on regardait dans le flacon?
Une production de gas carbonique ... et d'alcool Maltose Saccarose Amidon Levure et eau
CO2 Ethanol
Danger
La chimie organique
James Sturgis 15
Biochimie Structurale 2.1
... et si on regardait dans le flacon?
Les cellules qui se divisent
Les levures qui croissent sur les glucides... Td environ 60 minutes.
[Link]
...mais aussi
Biochimie Structurale 2.1
Philip Meaden Heriot-Watt University Edinburgh, Scotland and The MicrobeLibrary
James Sturgis
16
... et si on regardait dans le flacon?
Une tmperature qui augmente La matrise de ceci est important pour la qualit des vins et des bires...
...mais aussi
Biochimie Structurale 2.1 James Sturgis 17
Une reaction chimique
Glucide + levure -> CO2 + thanol + 2 x levure + chaleur
Biochimie Structurale 2.1 James Sturgis 18
Production de Biomasse
Glucide + levure -> CO2 + thanol + 2 x levure + chaleur
Biochimie Structurale 2.1 James Sturgis 19
Couplage de Ractions
D'une part: Utilisation du glucide comme fioul pour la cellule et production des dchets (Ethanol et Gas carbonique) D'autre part: Production de nouvelles cellules avec l'nergie derive de l'utilisation du fioul.
Deux processus coupls
Biochimie Structurale 2.1
James Sturgis
20
Couplage de Ractions
Catabolisme Utilisation de glucide comme fioul pour la cellule et production des dchets (Ethanol et Gas carbonique) Anabolisme Production de nouvelles cellules avec l'nergie derive de l'utilisation du fioul.
Deux processus coupls Mtabolisme
Biochimie Structurale 2.1
James Sturgis
21
... et si on tue les cellules?
Glucose + levure -> CO2 + thanol + 2 x levure + chaleur Glucose + levure (mort) -> CO2 + thanol + levure (mort) + 2 x chaleur Experience ancienne ( Hans et Eduard Buchner en 1897, pousse plus loin par Harden et Young en 1905 ) Le catabolisme est toujours possible Le mtabolisme est de-regl. Le couplage entre anabolisme et catabolisme conserve l'nergie. Les composants du suc de levure sont capable de faire la chimie.
Biochimie Structurale 2.1 James Sturgis 22
Catalystes Enzymes
Les composants du suc de levure capable de catalyser les ractions chimiques sont les enzymes Ce sont des protines souvent avec des cofacteurs ou co-enzymes.
Certaines protines sont des catalystes impressionants
Biochimie Structurale 2.1 James Sturgis 23
Liens entre Anabolisme et Catbolisme
Catabolisme Petites molcules ATP NAD(P)H Utilisation de fiouls
Anabolisme
Fabrication des molcules de la vie
Biochimie Structurale 2.1
James Sturgis
24
ATP l'argent comptant de la cellule
C'est quoi cette molcule? Pourquoi est-elle si utile? Comment est stocke l'nergie ?
Biochimie Structurale 2.1
James Sturgis
25
ATP l'argent comptant de la cellule
C'est quoi cette molcule? Pourquoi elle est si utile? Comment est stocke l'nergie ?
Biochimie Structurale 2.1
James Sturgis
26
ATP l'argent comptant de la cellule
C'est quoi cette molcule? Pourquoi elle est si utile? Comment est stocke l'nergie ? ADP~P
Biochimie Structurale 2.1
James Sturgis
27
ATP l'argent comptant de la cellule
C'est un vritable argent pour la cellule ADP + H+ + Pi ATP + H2O
G' = -29,2 kJ mol-1
Biochimie Structurale 2.1
James Sturgis
28
Couplage et thermodynamique
Le couplage d'une raction favorable avec une raction dfavorable rend la raction dfavorable possible. A B 1er raction favorable A->B C D
2me raction favorable C->D
Biochimie Structurale 2.1
James Sturgis
29
Couplage et thermodynamique
Le couplage d'une raction favorable avec une raction dfavorable rend la raction dfavorable possible. A B 1er raction favorable A->B D C
2me raction dfavorable D->C
Biochimie Structurale 2.1
James Sturgis
30
Couplage et thermodynamique
Le couplage d'une raction favorable avec une raction dfavorable rend la raction dfavorable possible. A B 1er raction favorable A->B D C
2me raction dfavorable D->C A+D B+C
Les deux ractions couples
Biochimie Structurale 2.1 James Sturgis 31
ATP et couplage
Le couplage d'une raction favorable avec une raction dfavorable rend la raction dfavorable possible. Glucide Ethanol + CO2 ATP 1er raction favorable A->B ADP + Pi
2me raction dfavorable D->C Glucide + ADP +Pi Ethanol + ATP + CO2
Les deux ractions couples
Biochimie Structurale 2.1 James Sturgis 32
ATP et couplage - Catabolisme
Le couplage d'une raction favorable avec une raction dfavorable rend la raction dfavorable possible. Macromolcules Petites molcules 1er raction favorable A->B ADP + Pi ATP 2me raction dfavorable D->C Macromolcules + ADP + Pi Petites molcules + ATP
Les deux ractions couples
Biochimie Structurale 2.1 James Sturgis 33
ATP et couplage - Anabolisme
Le couplage d'une raction favorable avec une raction dfavorable rend la raction dfavorable possible. Petites molcules Macromolcules 1er raction favorable A->B ADP + Pi ATP 2me raction dfavorable D->C Petites molcules + ATP Macromolcules + ADP + Pi
Les deux ractions couples
Biochimie Structurale 2.1 James Sturgis 34
NAD(P)H le pouvoir rducteur
C'est quoi cette molcule? Pourquoi elle est si utile?
Biochimie Structurale 2.1
James Sturgis
35
NAD(P)H le pouvoir rducteur
C'est quoi cette molcule? Pourquoi elle est si utile?
Biochimie Structurale 2.1
James Sturgis
36